estimation des paramètres génétiques pour la dysplasie de la hanche dans une population de...

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Estimation des Estimation des paramètres génétiques paramètres génétiques pour la dysplasie de pour la dysplasie de la hanche dans une la hanche dans une population de Terre- population de Terre- Neuve Neuve Gérard-Frippiat Aurore Girardier Sophie Graff Sophie Groupes 23-24

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Page 1: Estimation des paramètres génétiques pour la dysplasie de la hanche dans une population de Terre-Neuve Gérard-Frippiat Aurore Girardier Sophie Graff Sophie

Estimation des Estimation des paramètres génétiques paramètres génétiques pour la dysplasie de la pour la dysplasie de la

hanche dans une hanche dans une population de Terre-population de Terre-

NeuveNeuve

Gérard-Frippiat AuroreGirardier SophieGraff Sophie Groupes 23-24

Page 2: Estimation des paramètres génétiques pour la dysplasie de la hanche dans une population de Terre-Neuve Gérard-Frippiat Aurore Girardier Sophie Graff Sophie

Etude rétrospective sur 1372 Etude rétrospective sur 1372 chiens radiographiés entre 1965 et chiens radiographiés entre 1965 et 19961996

But:But: estimer les effets génétiques estimer les effets génétiques et non génétiques de la dysplasie et non génétiques de la dysplasie de la hanchede la hanche

Effets maternelsEffets maternels

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Méthode de l’étudeMéthode de l’étude

Analyses préliminaires: Analyses préliminaires: effets fixes (expert,sexe,chenil)effets fixes (expert,sexe,chenil)

Statistique: régression linéaire Statistique: régression linéaire

maximum de vraissemblancemaximum de vraissemblance choix du modèle animalchoix du modèle animal

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RésultatsRésultats

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Composants de la Composants de la variance et paramètres variance et paramètres

génétiquesgénétiques Pourquoi avoir choisi le modèle 2 ?Pourquoi avoir choisi le modèle 2 ?

Effets fixes par rapport au modèle Effets fixes par rapport au modèle 2 :2 :

fréquence plus grande chez les fréquence plus grande chez les femellesfemelles

différences chez les expertsdifférences chez les experts échelles de gradation différenteséchelles de gradation différentes

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Modèles:Modèles:

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Echelles de gradation:Echelles de gradation:

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DiscussionDiscussion Différence de prévalence de la Différence de prévalence de la

dysplasie de la hanche entre les paysdysplasie de la hanche entre les pays 1973: mise en place des tests de 1973: mise en place des tests de

dépistagesdépistages Jusqu’en 1981: aucun effet sur le Jusqu’en 1981: aucun effet sur le

choix des sélectionneurschoix des sélectionneurs Après 1981: seuls les animaux de Après 1981: seuls les animaux de

grades A,B,C sont admis à la grades A,B,C sont admis à la reproductionreproduction

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Etude de l’héritabilité:Etude de l’héritabilité:

Dans notre étude: 28% (fort car > Dans notre étude: 28% (fort car > 10%)10%)

Causes de variation de l’héritabilité:Causes de variation de l’héritabilité: 1.Méthode:1.Méthode: RemlReml Analyse demi-frère/demi-sœurAnalyse demi-frère/demi-sœur Avec ou sans modèle animalAvec ou sans modèle animal Régression parent/enfantRégression parent/enfant

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2.Effet de l’échantillon2.Effet de l’échantillon

3.Insuffisance de correction de 3.Insuffisance de correction de l’erreur systématiquel’erreur systématique

4.Mélange des effets 4.Mélange des effets environnemental et maternelenvironnemental et maternel

5.On n’a pas encore défini si la 5.On n’a pas encore défini si la dysplasie de la hanche est un trait: dysplasie de la hanche est un trait: binaire,ordinal ou quantitatifbinaire,ordinal ou quantitatif

Page 12: Estimation des paramètres génétiques pour la dysplasie de la hanche dans une population de Terre-Neuve Gérard-Frippiat Aurore Girardier Sophie Graff Sophie

Effet maternel:Effet maternel:

Correspond aux effets Correspond aux effets environnementaux du point de vue environnementaux du point de vue des chiots des chiots

effets génétiques et effets génétiques et environnementaux que la mère environnementaux que la mère donne à ses petitsdonne à ses petits

En résumé: l’effet environnement En résumé: l’effet environnement maternel permanent explique 10% maternel permanent explique 10% de la variance phénotypique de la variance phénotypique observéeobservée

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Effets fixes:Effets fixes:

SexeSexe

ExpertsExperts

Echelles de gradationEchelles de gradation

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ConclusionConclusion

Peu d’amélioration de la dysplasie Peu d’amélioration de la dysplasie de la hanche ces 10 dernières de la hanche ces 10 dernières annéesannées

manque de rigueur dans la manque de rigueur dans la politique de détectionpolitique de détection

d’autres critères que la d’autres critères que la dysplasie de la hanche sont utilisés dysplasie de la hanche sont utilisés pour la sélectionpour la sélection

Page 15: Estimation des paramètres génétiques pour la dysplasie de la hanche dans une population de Terre-Neuve Gérard-Frippiat Aurore Girardier Sophie Graff Sophie

Progrès génétique positifProgrès génétique positif

breeding value fiablebreeding value fiable

échantillonage plus échantillonage plus représentatifreprésentatif