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Rapport annuel d'activité, année 2015
Laboratoire National de Référence
Insectes, acariens phytoparasites et auxiliaires sur toutes matrices
Nom du responsable du LNR
Philippe REYNAUD
Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les
noms des unités associées au LNR
Unité entomologie et plantes invasives
Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en œuvre, le cas échéant précisez les
noms des laboratoires associés au LNR
Laboratoire de la Santé des Végétaux
Nombre de laboratoires agréés et/ou reconnus dans le réseau
0
Précisez la catégorisation du danger (en SA) sinon la justification de l'existence du
LNR (SA, SV et SSA)
Le mandat de LNR est précisé dans l’arrêté du 18 décembre 2014 modifiant l’arrêté du 29
décembre 2009 désignant les laboratoires nationaux de référence dans le domaine de la
santé publique vétérinaire et phytosanitaire.
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Les faits marquants de l'année
L’équipe s’est investie en 2015 dans la technique du barcoding au travers d’une
participation au ring test Euphresco barcoding ainsi que dans la réalisation d’un stage
barcoding de longue durée à l’Université de Guelph (Ontario, Canada) pour son ingénieur
en charge de cette technique.
Elle participe activement à des appuis scientifiques et techniques par le biais de
participations à des GT Anses (GT Rastrococcus invadens et GT Ophraella communa). Elle
a aussi réalisée des investigations épidémiologiques à la demande de la tutelle sur Xylella
fastidiosa en Corse.
L’équipe est très présente au niveau national et international. Elle a pris part, par exemple,
au séminaire diagnostic RFSV (Paris), à la réunion du panel entomologie OEPP (Rome), ou
à une mission de récolte du coléoptère Epitrix en Californie (USA) via le projet Euphresco.
Elle est intervenue à la Testa- EPPO Conference on diagnostics for plant pests (Angers). En
tant que LNR sur les auxiliaires naturels, elle est intervenue au Workshop on the Evaluation
and Regulation of the use of Biological Control Agents in the EPPO Region – Budapest
(Hongrie)
Enfin, elle s’investit particulièrement sur l’épidémiosurveillance en étant membre du CAPE :
Comité d’Animation et de Programmation en Epidémiologie
1. Méthodes développées ou révisées
Nombre de méthodes développées ou révisées proposées à l’autorité compétente
0
Nombre de méthodes développées ou révisées qui sont susceptibles d’être prêtes
pour être proposées à l’autorité compétente au cours de l’année 2016
0
2. Matériels biologiques ou chimiques, échantillons et souches
d'intérêt
Information disponible auprès du LNR
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3. Activités d'analyse
3.1. Analyses officielles de première intention
Nombre d'analyses officielles de première intention réalisées dans l'année (de
biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...)
723
Détaillez ici par type d'analyse de première intention
Dans le détail, 28 pour identification de Bemisia tabaci et 24 Trialeurodes vaporarium, 1
pour identification de Diabrotica virgifera virgifera et 670 pour identification autres
arthropodes. Le laboratoire existe depuis 19 ans. Depuis 2010, le nombre d’analyses est en
diminution et cette tendance se confirme en 2015. Cette décroissance s’explique par une
diminution du nombre d’échantillons envoyés par certains SRAL. Les causes de cette
diminution ne sont pas précisément connues, mais pourraient correspondre à une baisse de
la quantité de végétaux ou produits végétaux importés et donc contrôlés par le SIVEP en
France ces dernières années (peut être un effet de la crise économique) conjuguées à une
absence de crise phytosanitaire en cours impliquant des arthropodes. La tendance pourrait
s’inverser à partir de 2016, avec la crise Xylella qui implique des vecteurs Hemiptera.
3.2. Analyses officielles de confirmation
Nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées dans l'année (de
biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...)
0
Détaillez ici par type d'analyse de confirmation
En l’absence de laboratoires agréés, l’unité ne réalise pas d’analyses de confirmation et
assure la totalité des analyses officielles françaises.
Taux de confirmations par type d'analyse (= nombre de résultats confirmés / nombre
d'analyses officielles de seconde intention réalisées)
Sans objet
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3.3. Autres analyses
Nombre estimé d'autres analyses (non officielles) réalisées dans l'année en lien avec
le mandat de LNR
1052
Détaillez ici par type d'autres analyses
Tendance à la baisse sur cinq années. Explication multi factorielle : éloignement progressif,
suite au passage à l’Anses du laboratoire, de ses partenaires historiques demandeurs de
diagnostics généraux (les SRAL et instituts techniques), augmentation des tâches
administratives au dépend des activités analytiques, diminution de l’activité traditionnelle de
faunistique générale au profit d’activités de recherche ciblées sur des espèces ou groupes
d’espèces restreints.
4. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence
et de réactifs biologiques
Le LNR produit-il et fournit-il des réactifs ?
Non
Le LNR fournit-il des matériaux de référence ?
Non
Le LNR réalise-t-il des contrôles de réactifs commerciaux ?
Non
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5. Activités d'expertise scientifique et technique
5.1. Demandes d’expertise scientifique et technique du ministère
(chargé de l’agriculture, santé, etc…) ou d’instances
communautaires et internationales qui concernent votre domaine
de compétence
Nombre de rapports d'EST rendus dans l'année
3
Détaillez ici les demandes d'EST et les noms des mandataires
Trois EST ont été réalisées en 2015, une à la demande du FERA et 2 à la demande de
l’unité ERB du LSV. Elles portaient sur :
• La répartion en France de Dryocosmus kuriphilus
• Le risque de transmission de Xylella fastidiosa sur Clémentine de Corse par un insecte
vecteur Philaenus spumarius
• La présence de certaines cochenilles Coccoidea dans les DOM
Plusieurs notes d’alerte ou de signalement ont été émises en 2015 dans le cadre de
l’activité de veille du laboratoire. Elles ont concerné :
• Toumeyella parvicornis : Nouvelle cochenille invasive préjudiciable aux Pinus spp.
présente en Italie
• Aceria kuko : Confirmation de la présence de Aceria kuko (acarien) en France
• Dacus frontalis : présence Dacus frontalis en Tunisie. Elle se développe sur de
nombreuses plantes d’intérêt agronomique de la famille des Cucurbitaceae.
• Zaprionus indianus : 1ère détection en Guyane
• Scrobipalposis solanivora : Premier signalement de Scrobipalposis en Europe occidentale
(Espagne)
Le laboratoire apporte régulièrement son expertise pour l’examen de documents régionaux
ou internationaux (OEPP/IPPC).
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5.2. Autres expertises
Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise (internes:
CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de commissions de
normalisation (Afnor...). Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est
consacré.
Le laboratoire participe des activités d’expertise en tant que membre des Groupes de
Travail «Rastrococcus invadens» et « Ophraella communa » en lien avec le CES Anses en
santé des végétaux (2+5 jours), en tant que membre du Panel OEPP sur le diagnostic en
entomologie (3 jours en 2015).
Le laboratoire a également participé à une mission d’investigation épidémiologique en Corse
suite à la crise phytosanitaire Xylella (7 jours).
Le laboratoire participe à des instances nationales comme par exemple le GT DGAL Epiphyt
(application de gestion de données d’épidémiosurveillance), GT Anses « Vecteurs » ou
CAPE (Comité d’Animation et de Programmation en Epidémiologie).
L’équipe entomologie (conjointement avec l’équipe plantes invasives) participe au GdR
Invasions biologiques. Ce Groupement de Recherche porte sur les thématiques de biologie
des invasions. Il regroupe environ 40 participants qui souhaitent se fédérer autour de ce
domaine de recherche. Notre participation vise à favoriser notre insertion dans les réseaux
de recherche sur ce thème porteur. Le rôle principal des GdR est en effet de susciter des
rencontres entre les scientifiques qui sont intéressés par un thème en plein développement,
afin de multiplier les liens entre membres de ces communautés et de faciliter l’intégration
des jeunes, doctorants ou jeunes docteurs.
Des audits de confinement sont réalisés pour le compte de la DGAL. Nous donnons un avis
sur le niveau de confinement après visite sur place pour que les centres de recherche
demandeurs puissent obtenir leur agrément préfectoral au titre de la directive 2008/61/CE.
Deux audits ont été réalisés en 2015.
Des audits documentaires dans le cadre de la loi du 30 janvier 2012 relatif aux conditions
d’autorisation d’entrée sur le territoire de macro-organismes sont réalisés pour le compte de
la DGAL. Nous donnons un avis sur la capacité du demandeur à accueillir des macro-
organismes dans leurs structures. Quatre audits documentaires ont été réalisés en 2015.
5.3. Dossiers de demande d'agrément
Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année
0
7
5.4. Activités de conseil aux professionnels
Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré
Les membres du laboratoire participent à deux grand types d’actions de formation: i) des
formations générales à l’entomologie organisées par le CIRAD, L’INFOMA, le SIVEP, la
DGAL ; ii) des formations à la demande liées aux spécialités taxonomique des agents
(Tephritidae, mouches des cultures, cochenille). En 2015, les agents du laboratoire ont
formés une cinquantaine de personnes au travers de 5 actions de formation, représentant
environ 10 jours de travail.
6. Animation du réseau de laboratoires agréés ou reconnus
6.1. Organisation d'EILA
Précisez ici le nombre d'EILA organisés par le LNR au cours de l’année
0
Nom (s) et nombre(s) d'EILA que vous prévoyez d'organiser au cours de l’année 2016
0
Précisez le nombre d'EIL (hors EILA - dont EILV en lien avec méthodes en cours de
validation telles que précisées dans le paragraphe 1) organisés par le LNR au cours
de l’année
0
Détaillez ici le nombre de laboratoires ayant participé pour chaque EIL (hors EILA)
Précisez le nombre d'EIL (hors EILA) que vous prévoyez d'organiser au cours de
l’année 2016
0
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6.2. Formation, organisation d'ateliers, accueil de stagiaires
Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires agréés
du réseau, organisées dans l'année
1
Détaillez ici ces activités et indiquez le nombre de participants par journée
journée d’échange LNR/laboratoires agréés (38 participants)
Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux
méthodes utilisées pour les contrôles officiels, organisées dans l'année
0
Détaillez ici ces activités et indiquez la durée moyenne des sessions et le nombre de
participants par session
6.3. EILA auxquels le LNR a participé dans l'année
Détaillez les EILA auxquels le LNR a participé dans l'année, dans le cadre : National;
UE ( EILA organisé par le LRUE); International
- National : néant
- UE (EILA organisé par le LRUE) : néant
- International : néant
7. Participation aux activités de surveillance
7.1 PS/PC
Existe-t-il un ou plusieurs PS/PC élaboré(s) par l'autorité sanitaire dans le champ du
LNR?
Oui. Le laboratoire intervient dans le cadre de 10 plans de contrôle et surveillance.
NS : DGAL/SDQPV/N2005-8138 : TYLCV et Bemisia tabaci
NS : DGAL/SDQPV/N2005-8189 : Plan de surveillance phytosanitaire des pépinières et
jardineries vis-à-vis de la teigne du bananier (Opogona sacchari)
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NS : DGAL/SDQPV/N2009-8051 : Plan de contrôle phytosanitaire de la pomme de terre
destinée à la plantation ; Conditions de délivrance du Passeport Phytosanitaire Européen
(PPE)
NS : DGAL/SDQPV/N2011-8141 : Mise en œuvre de l'arrêté national du 22 novembre 2010
relatif à la lutte contre du cynips du châtaignier (Dryocosmus kuriphilus)
NS : DGAL/SDQPV/N2011-8148 : Plan de surveillance Rhagoletis completa Cresson et
mesures de lutte pour l'été 2011 dans le Sud-Est de la France (territoires couverts par la
DRAAF/SRAL Rhône alpes et zones de production en continuité avec le bassin Rhône Alpin
et gérés par la DRAAF/SRAL Rhône Alpes)
NS : DGAL/SDQPV/N2011-8149 : Plan de surveillance Rhagoletis completa Cresson 2011
et mesures de lutte (toutes régions sauf Rhône Alpes et zones de production en continuité
avec le bassin Rhône Alpin)
NS : DGAL/SDQPV/N2012-8071 : Mise en œuvre du dispositif expérimental concernant
l'injection dans le cadre de la lutte obligatoire contre le charançon rouge du palmier.
NS : DGAL/SDQPV/N2012-04002 : Surveillance des pommes de terre autre que pommes
de terre de semence vis-à-vis d’Epitrix sp.
NS : DGAL/SDQPV/N2013-8086 du 15 mai 2013 Réseau de surveillance biologique du
territoire dans le cadre de l'axe 5 du plan Ecophyto pour l'année 2013
NS : DGAL/SDQPV/N2014-XXXX du XX XX 2014 Plan annuel de surveillance relatif aux
escargots aquatiques du genre Pomacea en France.
7.2 Activités de surveillance hors PS/PC
7.2.1 Dispositif(s) hors PS/PC
Indiquer si le LNR est intégré à un (ou des) dispositif(s) de surveillance (hors PS/PC) ?
Oui
En dehors du dispositif PS/PC de la DGAl préciser si le LNR est intégré à un autre
dispositif (Résapath, Salmonella, Resabeille, ...)
Surveillance biologique du territoire (SBT)
7.2.2 Gestionnaire du dispositif
Indiquer qui est le gestionnaire de ce dispositif de surveillance
DGAL / SDQPV
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7.2.3 unités intégrées dans le dispositif
Préciser si d'autres unités/entités de l'agence sont intégrées dans ce dispositif à vos
cotés
Non
7.2.4 Les partenaires et acteurs de ce dispositif de surveillance
Sont acteurs ou partenaires de ce dispositif (plusieurs réponses possibles) :
Un réseau d'acteurs professionnels
7.2.5 Modalités de surveillance
Préciser si ce dispositif repose (plusieurs réponses possibles) :
Sur des modalités de surveillance programmées (active)
8. Activités de recherche en lien avec l’activité de référence
8.1. Recherches méthodologiques pour la référence
Détaillez ici les recherches méthodologiques que vous avez réalisées dans l'année :
objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre d'appels à
projets...
Protocole OEPP PM7/124(1) Spodoptera littoralis, Spodoptera litura, Spodoptera frugiperda,
Spodoptera eridania, publié à la fin de l’année 2015 (Bulletin OEPP/EPPO bulletin 45(3),
410-444) ;
Protocole OEPP PM 7/36(1) Diabrotica virgifera virgifera (Coleoptera : Chrysomelidae) mis à
jour en 2015, doit être publié en 2016.
Projet EUPHRESCO EPITRIX Méthode de détection et étude du cycle biologique d’Epitrix :
l’équipe entomologie a obtenu les résultats suivants : Mise au point d’une clé d’identification
morphologique des espèces d’Epitrix se développant sur pomme de terre en y incorporant
les espèces natives d’Europe de l’ouest pouvant se rencontrer lors des plans de
surveillance et de contrôle. Les espèces présentes dans l’est du Bassin méditerranéen
seront également prises ne compte. Ce travail permettra de mettre à jour la méthode
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d’indentification morphologique (OEPP) existante. Création d’une collection de référence
des espèces d’Epitrix (natives et non-natives dont les espèces préjudiciables à la pomme de
terre), collection qui sera disponible pour les ONPVs de l’UE.
8.2. Recherches associées
Détaillez ici les recherches associées auxquelles vous avez participé dans l'année:
participations à des études cliniques, études d'incidences, modèles d'infections
expérimentales, études toxicologiques, essais vaccinaux...
BIOTHRIPIDAE Mise au point d’un kit de détection des Thysanoptera nuisibles aux cultures
ornementales ou de quarantaine : le laboratoire a été financée par l’INRA de Sophia
Antipolis pour caractériser morphologiquement la faune thysanoptérologique des Agro-
Ecosystèmes étudiés par l’INRA et mettre en œuvre les techniques de laboratoire
nécessaires pour lever les éventuels verrous taxonomiques concernant des espèces ou des
formes cryptiques. Certaines espèces rarement capturées ont été identifiées lors de l’étude.
9. Relations avec le CNR
Existence d'un CNR
Non
10. Autres mandats
Le LNR détient-il d'autres mandats de référence dans le même domaine de
compétences
Non
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Annexes
PUBLICATIONS DESTINÉES AUX PROFESSIONNELS
Germain, J. F., Laplace, D., Devarieux, A., Boavida, C., Gachet, E., Goergen, G., et al. (2015). Rastrococcus invadens Williams découvre l'Amérique. Phytoma.
Martinez, M., Germain, J. F., & Streito, J. C. (2015). Touristes involontaires et inattendus:
les insectes exogènes ravageurs. Jardins de France, 633, 9-11.
PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES INTERNATIONALES
Baker, R., Eyre, D., Brunel, S., Dupin, M., Reynaud, P., & Jarosik, V. (2015). Mapping Endangered Areas for Pest Risk Analysis In R.C.Venette (Ed.), Pest risk modelling and mapping for invasive alien species (pp. 18-34): CABI.
Bout, A., Ziegler, M., Disdier, M., Reynaud, P., Robert, F., Crochard, D., et al. (2015). Improving knowledge on thrips diversity and ecology in French greenhouses: inputs of barcoding approaches for a better pest management. Acta Horticulturae, 1104, 395-400.
Germain, J. F., Laplace, D., Devarieux, A., & Boavida, C. (2015a). First records of the mealybug Rastrococcus invadens Williams (Hemiptera: Pseudococcidae) in French Guiana and the Americas. Zootaxa, 3905(3), 447-450.
Germain, J. F., Matile-Ferrero, D., Kaydan, B., Malausa, T., & Williams, D. J. (2015c). A new species of Dysmicoccus damaging lavender in French Provence (Hemiptera, Sternorrhyncha, Pseudococcidae). Zootaxa, 3980 (4), 575-583.
Halima-Kamel, M. B., Germain, J. F., & Mdellel, L. (2015). First records of two mealybugs, Maconellicoccus hirsutus (Green) and Phenacoccus peruvianus Granara de Willink, in Tunisia and the North of Africa. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 45(1), 139-143.
Telfer, A. C., Young, M. R., Quinn, J., Perez, K., Sobel, C. N., Sones, J. E., Mouttet, R.et al. (2015). Biodiversity inventories in high gear: DNA barcoding facilitates a rapid biotic survey of a temperate nature reserve. Biodiversity Data Journal(3), e6313, doi:10.3897/BDJ.3.e6313.
COMMUNICATIONS NATIONALES
Balmès, V. (2015). Les mouches: un défi pour la production fruitière. Salon des techniques bio et alternatives, Bourg lès Valence, France, 2015/09/23/
Bout, A., Marchand, A., Disdier, M., Crochard, D., Ziegler, M., Reynaud, P., et al. (2015). Approches de type DNA-Barcoding sur les populations de thrips au sein des cultures ornementales sous serre Angers, France. , 2015
COMMUNICATIONS INTERNATIONALES
Balmès, V., & Mouttet, R. (2015). Quick identification on commonly intercepted Tephritidae in Europe : How does molecular identification help the morphology? OEPP conference on diagnostics for plant pests, Angers France, 2015/01/12/
Martin, P., Ryckwaert, P., Tayeh, C., Reynaud, P., Quilici, S., De Meyer, M., et al. (2015). Risk ranking of importation pathways using fruit flies hierarchy - Reunion Island case study. Paper presented at the XVIII. International Plant Protection Congress, Berlin, Germany,
CONFÉRENCES SUR INVITATION
Reynaud, P. (2014). Invasive Thysanoptera in Qatar : is there a risk for plants or human health ? Doha, Qatar, Friends of the Environment Centre. 1st Congress of Insects in Qatar.