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Structure et Dynamique des Lipides. Master de Chimie, (Chimie Moléculaire du Vivant), Université Bordeaux 1 Erick Dufourc, UMR5248 CBMN, CNRS-UBx-BxINP, +33 5 4000 6818, [email protected] Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 1

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Structure et Dynamique des Lipides.

Master de Chimie, (Chimie Moléculaire du Vivant), Université Bordeaux 1

Erick Dufourc, UMR5248 CBMN, CNRS-UBx-BxINP, (+33 5 4000 6818, : [email protected]

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 1

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Structure et Dynamique des Lipides.

Master de Chimie, (Chimie Moléculaire du Vivant), Université Bordeaux 1

Introduction: les membranes

A.  Classes de lipides

B.  Extraction, purification et caractérisation des lipides membranaires

C.  Structures cristallines D.  Hydratation des lipides

E.  Dynamique des lipides

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 2

Page 3: Structure et Dynamique des Lipides - cbmn.u-bordeaux.fr et... · Structure et Dynamique des Lipides. Master de Chimie, (Chimie Moléculaire du Vivant), Université Bordeaux 1

Les membranes biologiques

cellule

mitochondrie

Réticulum sarcoplasmique et Golgi

Virus HIV

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Les membranes biologiques

Membrane plasmique et réseau d’actine

Double couche de lipides

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 4

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A. Classes de lipides

1.  Glycérolipides (dérivés du glycérol)

2.  Sphingolipides (dérivés de la sphingosine)

3.  Stéroïdes (dérivés du cholestérol)

4.  Autres

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 5

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A. Classes de lipides

A1. Les glycérolipides (dérivés du squelette glycérol)

a) Glycérophospholipides

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

Base = H2C

CH2

N+

CH3

CH3

CH3choline H2C

CH2

N+

H

H

Hethanolamine H2C

CHC

H

H

OHHO

glycérol

H

H2C

CHN+

H

H

HC

O O-sérine

HOOH

OH

OH

OH

inositol

Ø  1,2–diacyl-sn-glycerol-3-phospho-base

chaînes de 12 à 24 carbones

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 6

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A. Classes de lipides

Glycérophospholipide particulier :

Ø  diphosphatidylglycérol (cardiolopide)

O

O

CH2

CH

H2CO

O

OP O-

O

O

O

O

CH2

CH

H2CO

O

OP

O-O

CH2

CH

H2C

OH

O

Présent dans les mitochondries

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 7

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A. Classes de lipides

Nomenclature IUPAC :

•  1,2-diacyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

ou aussi :

•  1,2-diacylphosphatidylcholine

•  phosphatidylcholine (PC)

abréviations :

PA = phosphatic acid

PC = phosphatidylcholine

PE = phosphatidylethanolamine

PS = phosphatidylsérine

PG = phosphatidylglycérol

PI = phosphatidylinositol

CL = cardiolipine

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A. Classes de lipides

Ø  1,2–dialkyl-sn-glycerol-3-phospho-base (liens éther, archébactéries)

OCH2

CH (R)

H2C O

O

PO-

O

baseO

Ø  1-alkenyl-2–acyl-sn-glycerol-3-phospho-base (plasmogène, myéline, RS cardiaque)

O CH2

CH (R)1

H2C O

O

O PO-

O

O base

Vinyl-éther

Ø  1-acyl-sn-glycerol-3-phospho-base (lysolipides)

O

O

CH2

CH1

(R)

H2C O

HO

PO-

O

O baseHydrolyse de la fonction ester, lyso PC, lyso PE, …

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A. Classes de lipides

Ø  1,2–diacyl-sn-glycerol-3 –sucre

Ø  1,2–diacyl-sn-glycerol-3 –sucre-sucre

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

CH2OH

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

O

HOOH

OH

CH2OH

O

Monogalactosyldiglycéride (MGDG)

Galactose (Gal)

Digalactosyldiglycéride (DGDG)

Algues, bactéries (peu chez les animaux)

b) Glycéroglycolipides

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A. Classes de lipides

A2. Les sphingolipides (dérivés du squelette sphingosine)

a) Céramides (N-acyl sphingosine)

Ø  sphingosine

(R)

(S)

OH

CH2OH

NH2C15

(R)

(S)

OH

CH2OH

NH

O

Longueur et insaturations variables

Contenus dans la peau

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A. Classes de lipides

b) Sphingophospholipides (N-acyl sphingosine)

Longueur et insaturations variables

Sphingomyéline (base = choline), retrouvé dans les globule rouges

(R)

(S)

OH

NH

O

baseO

PO

O

O-

Ø  céramide-1-phospho-base

Base = •  Choline

•  Éthanolamine •  Inositol

•  Glycérol

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A. Classes de lipides

b) Sphingoglycolipides

Longueur et insaturations variables

Ø  céramide-1-sucre

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

Cérébrosides (retrouvés dans le cerveau)

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A. Classes de lipides

c) sphingoglycolipides (cérébrosides)

Longueur et insaturations variables

Présents à la surface des cellules : reconnaissance, groupes sanguins (avec protéines glycosilées)

Ø  céramide-1-sucres

sucres = •  glucose (Glc)

•  galactose (Gal)

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

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A. Classes de lipides

A3. Les stéroïdes

a) Dérivés du cholestérol (animaux)

HO

A B

C D

HO

A B

C D

Ø  sulfate de cholestérol

O-O3S

Ø  esters de cholestérol

O

O

Peau, spermatozoïdes

Ex: palmitate de cholestérol (transport du cholestérol)

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A. Classes de lipides

b) Phytostérols (végétaux)

Principaux squelettes Cholestane

Ergostane

Stigmastane

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A. Classes de lipides

c) Hopanoïdes (bactéries) (OH)

OH

(OH)

A3. Autres

a) Acides gras et alcools

En général de 12 à 24 atomes de carbone

Handbook of phospholipids, Cevc, Dekker, 1993

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A. Classes de lipides

b) Diacylglycérols

O

O

CH2

CH (S)

H2C OH

O

O

Hydrolyse des phospho et glycolipides

c) Lipides des archébactéries (sédiments pétroles, volcans)

R O CH2

CH

H2C X

R OOH2C

HC

CH2X

O Liens éther

R =

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B. Extraction, purification des lipides

B1. Extraction

Membranes + 20 volumes MeOH/CHCl3 (1:2)

Filtration centrifugation

Extrait lipidique (lipides solubilisés)

Séparation de phases: Phase méthanolique :

Sphingolipides acides Sphingoglycolipides

Phase chloroformique :

Phospholipides Stérols

Lipides non membranaires (mono, di, triglycérides,

acides gras)

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B. Extraction, purification des lipides

B2. Purification

LE TG

AG DG

C MG

PL

Rf 1

0

Rf 1

LN PE PI PS PC

SPH LPL

0

Rf 1

G7 G6 G5 G4 G3 G2 G1

0

1 2 3

Plaque de verre

Gel de silice

Front d’élution

Dépot

Chromatographie : colonne (alumine, silice), plaque (couche mince) –TLC-, liquide haute performance –HPLC-

1. Heptane/éther/acide acétique (60/40/2) : lipides polaires/non polaires

2. Méthanol/acide acétique/eau (60/50/14) : phospholipides

3. Propanol/eau (7/3) : gangliosides

Eluants

Migration : capillarité Révélation : UV, Iode, PO4, NH2 Séparation : affinité gel solvant

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B. Extraction, purification des lipides

B2. Purification

HPLC : colonne de silice ou greffée C18, C6, etc

Temps de rétention Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

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B. Extraction, purification des lipides

B2. Purification

Caractérisation des chaînes hydrocarbonées : GPC (lipides hydrolysés, acides gras méthylés -volatils-)

Temps de rétention

I C12:0

C14:0

C16:0

C18:1

C18:2

La quantité d’acides gras dans un mélange est proportionnelle à la surface d’un pic

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B. Extraction, purification des lipides

B2. Composition lipidique des membranes

En % Myéline Érythrocyte Mitochondrie Microsome E. coli

Cholestérol 25 25 5 6 0

Pl totaux 32 56 95 94 100

Dont PE 14 20 28 17 80

PS 7 11 0 0 0

PC 11 23 48 64 0

PI 0 2 8 11 0

PG 0 0 1 2 15

diPG 0 0 11 0 5

SP totaux 32 18 0 0 0

autres 11 1 0 0 0

Certaines membranes ne contiennent qu’une classe de lipides ex: E. coli Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

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B. Extraction, purification des lipides

Composition en acides gras dans les phosphocholines (PC)

Membrane 14:0 16:0 16:1 18:0 18:1 18:2 20:1 20:4

Cerveau humain (mat. Blanche)

1,3 34,3 1,0 13,4 45,2 0,4 1,1 1,3

Cerveau humain (mat. grise)

2,9 45,0 3,1 9,3 31,4 0,4 0,7 4,1

Cerveau rat 0,3 45,0 1,4 13,8 32,3 0,4 5,1

Cerveau poulet 0,7 51,0 16,5 26,3 0,7 3,9

Erythrocytes h. 31,2 11,8 18,9 22,8 0,5 6,7

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B. Extraction, purification des lipides

Composition en acides gras dans les phosphoéthalamines (PE)

Membrane 14:0 16:0 16:1 18:0 18:1 18:2 20:1 20:4

Cerveau humain (mat. Blanche)

5,9 0,4 30,4 8,7 0,5 0,5 13,4

Cerveau humain (mat. grise)

6,2 1,1 13,8 43,2 0,5 6,0 7,9

Cerveau rat 0,3 8,3 0,8 28,5 13,2 0,2 0,2 13,2

Cerveau poulet 1,6 17,9 1,1 28,5 12,4 0,4 12,6

Erythrocytes h. 12,9 11,5 11,5 18,1 7,1 0,7 23,7

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 25

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C. Structures cristallines

Méthodes

•  Glycérolipides (dérivés du glycérol)

•  Sphingolipides (dérivés de la sphingosine)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 26

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C. Structures cristallines

Méthodes

Croissance des cristaux

Diffraction des RX

Reconstruction 3D

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 27

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

a) Glycérophospholipides

Ø  DMPC ou 1,2–dimyristoyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

Système cristallin : monoclinique

β = 97° c = 55,4 Å

a = 8,72 Å

b = 8,92 Å

4 molécules par maille

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 28

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Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Structure en bicouche dans le cristal

P

N

Liaisons hydrogène

Dipoles P->N

29

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  DMPC

Épaisseur Bicouche = 54,9 Å Épaisseur zone polaire = 10,4 Å

Aire moléculaire = 38,9 Å

Tilt des chaînes = 12°

Section 2 chaînes = 38 Å2

Chaîne sn-2 coudée

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 30

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  DLPE ou 1,2–dilauroyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

Système cristallin : monoclinique

β = 92° c = 9,95 Å

a = 47,7 Å

b = 7,87 Å

4 molécules par maille

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 31

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  DLPE ou 1,2–dilauroyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

P

N

Épaisseur Bicouche = 47,7 Å Épaisseur zone polaire = 7,9 Å

Aire moléculaire = 38,6 Å

Tilt des chaînes = 0°

Section 1 chaîne = 19,3 Å2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 32

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  Lyso PC ou 1-lauroyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

O

O

CH2

CH1

(R)

H2C O

HO

PO-

O

O base

Système cristallin : monoclinique

β = 99,7° c = 10,94 Å

a = 24,82 Å

b = 9,53 Å

4 molécules par maille

interdigitation

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 33

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  Lyso PC ou 1-lauroyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

Liaisons hydrogène

Épaisseur Bicouche = 24,5 Å Épaisseur zone polaire = 7,3 Å

Aire moléculaire = 52,1 Å2

Tilt des chaînes = 41°

Section 1 chaîne = 19,7 Å2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 34

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  Lyso PE ou 1-lauroyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

Système cristallin : monoclinique

β = 99,7° c = 10,94 Å

a = 24,82 Å

b = 9,53 Å

4 molécules par maille

Dipoles P-N à plat

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 35

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  Lyso PE ou 1-lauroyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

Réseau de liaisons hydrogène N -> O

Épaisseur Bicouche = 37,1 Å Épaisseur zone polaire = 7,1 Å

Aire moléculaire = 34,8 Å2

Tilt des chaînes = 57,5°

Section 1 chaîne = 18,7 Å2

Projection sur a-b

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 36

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

base = H

Ø  DMPA ou 1,2 dimyristoyl-sn-glycerol-3-phosphatidic acid

Système cristallin : monoclinique

β = 114,19° c = 43,98 Å

a = 5,44 Å

b = 7,95 Å

2 molécules par maille

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 37

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  DMPA ou 1,2 dimyristoyl-sn-glycerol-3-phosphatidic acid

Chaîne sn-1 coudée

Structure en chevron

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 38

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C. Structures cristallines

C1. Les glycérolipides

Ø  DMPA ou 1,2 dimyristoyl-sn-glycerol-3-phosphatidic acid

P

Na

Épaisseur Bicouche = 40,1 Å Épaisseur zone polaire = - Å

Aire moléculaire = 43,2 Å2

Tilt des chaînes = 31°

Section 1 chaîne = 18,6 Å2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 39

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C. Structures cristallines

C.1 Les glycérolipides

Ø  1,2–diacyl-sn-glycerol-3 –sucre

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

CH2OH

Monogalactosyldiglycéride (MGDG)

Galactose (Gal)

Pas de structure cristalline connue

a) Glycéroglycolipides

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 40

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C. Structures cristallines

C.2 Les sphingolipides

Pas de structure cristalline connue

a) Céramides (N-acyl sphingosine)

(R)

(S)

OH

CH2OH

NH

O

b) Sphingophospholipides (N-acyl sphingosine)

(R)

(S)

OH

NH

O

baseO

PO

O

O-

Ø  céramide-1-phospho-base

Pas de structure cristalline connue

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 41

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C. Structures cristallines

C.2 Les sphingolipides

c) Sphingoglycolipides (cérébrosides)

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

Système cristallin : monoclinique

β = 99° c = 46,46 Å

a = 11,2 Å

b = 9,26 Å

4 molécules par maille

Ø  β-D-galactosyl-N-(2-D-hydroxyoctadecanoyl)-D-dihydrosphingosine

Galactosyl ceramide (Cer-Gal)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 42

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C. Structures cristallines

C.2 Les sphingolipides

c) Sphingoglycolipides (cérébrosides)

Épaisseur Bicouche = 45,9 Å Épaisseur zone polaire = - Å

Aire moléculaire = 51,9 Å2

Tilt des chaînes = 49°

Section 1 chaîne = 19,1 Å2

liaisons hydrogène

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 43

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C. Structures cristallines

C.2 Les sphingolipides

d) Glycosphingosine

Ø  1-O-(β-O-glucopyranosyl)-D-ribo-3,4-dihydroxy-2-aminoctadecane

(R)

(S)

OH

CH2OH

NH2

sucre

Système cristallin : orthorhombique

c = 49,71 Å a = 11,36 Å

b = 5,26 Å

4 molécules par maille

Épaisseur Bicouche = 24,9 Å Épaisseur zone polaire = - Å

Aire moléculaire = 59,8 Å2

Tilt des chaînes = 48°

Section 1 chaîne = 19,8 Å2

Bicouche interdigitée

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 44

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C. Structures cristallines

Résumé

Empilement cristallin = bicouches parfois interdigitées

Épaisseur Bicouche = 40 à 60 Å; 25 Å si interdigitation Épaisseur zone polaire = 10 Å

Aire moléculaire = 40-50 Å2 (Glycerophospho); 50-60 Å2 (Spingoglyco)

Tilt des chaînes = 0 à 60°

Section 1 chaîne = 19 Å2

Réseau de liaisons hydrogène

Système cristallin : monoclinique, orthorhombique

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 45

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D. Hydratation des lipides

D1. Diagrammes de phase

D2. Lipides en excès d’eau

D3. Mélange de lipides en excès d’eau

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 46

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D. Hydratation des lipides

D1. Diagrammes de phase (binaires : lipides + eau)

a) Phases

Lipides + eau Lyotropes (polymorphisme = f(conc))

Thermotropes (polymorphisme = f(T))

Règle de Gibbs : nombre de degrés de liberté F = C – P + 2

C = nombre de composants P = nombre de phases

F = C – P + 1 Ou à pression constante :

Régime d’hydratation limité, C=2 ü  1 phase, F=2 (concentration, température) ü  2 phases, F=1 (concentration ou température

ü  3 phases, F =0 (concentration et température fixées)

Excès d’eau, C=1 (concentration fixée : limite d’hydratation)

ü  1 phase, F=1 (température) ü  2 phases, F=0 (température fixée)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 47

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D. Hydratation des lipides

b) Techniques de détermination de la nature des Phases

Ø  Diffraction des rayons X ou des neutrons Bragg θλ sin d 2 lk,h,=

Grands angles : ordre à courte distance (3-5 Å), e.g., empilement de chaînes

Petits angles : ordre à longue distance (période > 10 Å), e.g., symétrie du réseau

Type de réseau : •  micellaire (solution)

•  Périodique 1D (lamellaire),

•  Périodique 2D (hexagonal)

•  Périodique 3D

dhsk /=

)( hkkhashk −+= 2222

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 48

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D. Hydratation des lipides

b) Techniques de détermination de la nature des Phases

Ø  Diffraction des rayons X sur un empilement lamellaire

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 49

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D. Hydratation des lipides

b) Techniques de détermination de la nature des Phases

Ø  RMN des solides du phosphore-31 (dispersion de phospholipides)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 50

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D. Hydratation des lipides

b) Techniques de détermination de la nature des Phases

Ø  cryofracture et microscopie électronique

Création d’une réplique d’un échantillon clivé à basse température

Phase lamellaire

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 51

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D. Hydratation des lipides

c) Nomenclature des phases (lLuzzati, 1968)

L Réseau mono dimensionnel, lamellaire

P Réseau bi dimensionnel, oblique ou centré (ondulé)

H Réseau bi dimensionnel, hexagonal

HI Réseau bi dimensionnel, hexagonal normal, huile dans eau

HII Réseau bi dimensionnel, hexagonal inverse, eau dans huile

R Rhomboédrique

Q cubique

C Tridimensionnel, cristallin

LC Lamellaire cristallin

Ordre à longue distance

α Chaînes désordonnées, fluide

β Chaînes partiellement ordonnées, gel

β’ Chaînes partiellement ordonnées, tiltées, gel

δ Partiellement ordonné (hélicoïdal), gel

Ordre à courte distance

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 52

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D. Hydratation des lipides d) Glycérophospholipides + eau

Ø  DMPC, 1,2–dimyristoyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

252 =lipide

OH

nn

172 =lipide

OH

nn

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 53

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D. Hydratation des lipides

d) Glycérophospholipides + eau

Ø  DPPC 1,2–dipalmitoyl-sn-glycerol-3-phosphocholine

92 =lipide

OH

nn

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 54

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D. Hydratation des lipides

d) Glycérophospholipides + eau

Ø  DLPE 1,2–didodécyl-rac-glycerol-3-phosphoéthanolamine

152 =lipide

OH

nn

TH ~ 120°C

80°C

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 55

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D. Hydratation des lipides

d) Glycérophospholipides + eau

Ø  DHPE 1,2–dihexadécyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

52 =lipide

OH

nn

TH ~ 90°C

15°C

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 56

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D. Hydratation des lipides

d) Glycérophospholipides + eau

Ø  DAPE 1,2–diarachinoyl-sn-glycerol-3-phosphoéthanolamine

TH ~ 90°C

10°C

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

57

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D. Hydratation des lipides

d) Glycérophospholipides + eau

Ø  Lyso PC O

O

CH2

CH1

(R)

H2C O

HO

PO-

O

O base

micelles

72 =lipide

OH

nn272 =

lipide

OH

nn

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 58

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D. Hydratation des lipides

e) Glycéroglycolipides + eau

Ø  MGDG O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

CH2OH

1,2-dioleoyl-3-α-D-glucosyl-sn-glycerol

(Cubique inversé)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 59

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D. Hydratation des lipides

d) Glycéroglycolipides + eau

Ø  DGDG

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

O

HOOH

OH

CH2OH

O

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 60

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D. Hydratation des lipides

f) Sphingolipides + eau

Ø  Spingophospholipides (R)

(S)

OH

NH

O

baseO

PO

O

O-

502 =lipide

OH

nn

Transition gel-fluide à

Tphisio

352 =lipide

OH

nnLα

Lβ’

Sphingomyéline, cerveau

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 61

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D. Hydratation des lipides

f) Sphingolipides + eau

Ø  Spingoglycolipides (Galcer)

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

252 =lipide

OH

nnLα

Lβ’

Lα+ H2O

Transition gel-fluide à

haute température

Cérébroside de cerveau de boeuf

Longueur et insaturations variables

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 62

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D. Hydratation des lipides

D2. Lipides en excès d’eau

a) CMC (concentration micellaire critique)

Définition : nM Mn

micelles

Séparation de phase : monomères + micelles

La concentration en monomères est indépendante de la concentration totale : CMC

Énergie libre de formation des micelles : ΔG = RT Ln (CMC) CMC exprimée en mol.L-1 ou en fraction

molaire Ø  Diacylglycerophosphocholines

- Ln

(CM

C)

10

5

nb de carbones (chaînes acyles) 6 10 16

DPPC (4,6 10-10 mol.L-1)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 63

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D. Hydratation des lipides

D2. Lipides en excès d’eau

Ø  Lyso PC, PE -

Ln(C

MC)

10

5

nb de carbones (chaînes acyles) 6 10 16 22

10-5 mol.L-1)

Ø  Glycosphingolipides

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

Chaînes en C18-C22

CMC ~ 10-7 à 10-8 mol.L-1)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 64

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D. Hydratation des lipides

D2. Lipides en excès d’eau

b) Phases en excès d’eau (C > CMC)

Ø  Glycérophospholipides

Ø  Glycéroglycolipides

Ø  Sphingophospholipides

PC, PS séquence Lβ’ -- Pβ’ -- Lα PE séquence Lβ’ -- Lα -- HΙΙ Lysos micelles ∀ T

MGDG HII ∀ T (-10°C et 50°C)

DGDG Lα ∀ T (-10°C et 80°C)

séquence Lβ’ -- Lα

Ø  Sphingoglycolipides séquence Lβ’ -- Lα

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 65

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D. Hydratation des lipides

D2. Lipides en excès d’eau

c) Concept de forme (excès d’eau)

Explication de l’origine des différentes organisations lipidiques (Israelashvilli)

Ø  Volume de la zone hydrophobe vs. Volume de la zone hydrophile

L

(PC,PS)

HI, II

(Lysos,DGDG)

HII, III

(PE,PG)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 66

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D. Hydratation des lipides

c) Concept de forme (excès d’eau)

Ø  paramètres influençant la nature des phases

L

(insaturations)

HI, II HII, III

(cholestérol)

(température)

(hydratation)

Ø  compensation de formes

HI HII +

L

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 67

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D. Hydratation des lipides

c) Concept de forme (excès d’eau)

Ø  organisations lipidiques au sein d’une membrane biologique

HI, II

HII, III ?

L

Fusion de cellules

poumons

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 68

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases (excès d’eau)

Ø  Définition

t

tt S

HTΔ

Δ=

Lβ (gel) Lα (fluide)

ordre désordreordre désordre

Tm

Th

hexagonal

En général : ΔHH << ΔHL

ΔSH << ΔSL

Th > Tm

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 69

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases, (excès d’eau)

v  Températures de transition gel-fluide, Tm

Tm

40

10

nb de carbones (chaînes acyles) 12 16 22

70

Gel

Fluide

PC, PE, MGDG

Ø  influence de la longueur des chaînes

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 70

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence du nombre de doubles liaisons Tm

20

00

nb de doubles liaisons en cis et en trans 0 2 4

40

Gel

Fluide PC

(18:0) (18:n) sn-1 sn-2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 71

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence de la position de la double liaison Tm

20

00

Position de la double liaison 2 10 18

40

Gel

Fluide

PC

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 72

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence de la position de la chaîne

1-(10:0)-2- (18:0) PC 10 PC

(n:0) (m:0) sn-1 sn-2

1-(18:0)-2- (10:0) PC 18.6

1-(14:0)-2- (18:0) PC 39.5 1-(18:0)-2- (14:0) PC 30.5

1-(16:0)-2- (18:0) PC 49 1-(18:0)-2- (16:0) PC 44

1-(12:0)-2- (22:0) PC 37.5 1-(22:0)-2- (12:0) PC 43

Tm °C

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 73

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence de la longueur de l’une des chaînes Tm

20

00

n, chaîne sn-2 10 16 22

40

Gel

Fluide

PC

(16:0) (n:0) sn-1 sn-2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 74

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence du pH, ex DMPA Tm

20

pH 2 5 8

40

Gel

Fluide

pKa1 pKa2

PO4H2 PO4- H, liens H PO4

2-, répulsions

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 75

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence de la nature de la tête polaire Tm

40

Nature de la tête polaire PA PE PG

50

Fluide

30

20 Gel

PS PC

tête

(14:0) (14:0) sn-1 sn-2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 76

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O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

CH2OH

D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence du nombre de sucres sur la tête polaire

Tm

Nombre de sucres sur la tête polaire 1

70

Fluide

50

Gel

2

n

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 77

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

v  Températures de transition Lα-HII, Th Th

100

80

nb de carbones (chaînes acyles) 12 16 22

120

HII

PE

Ø  influence de la longueur des chaînes

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 78

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence du nombre de doubles liaisons Th

50

0

nb de doubles liaisons en cis et en trans 0 2 4

100

PE

(18) (18)

HII

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 79

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D. Hydratation des lipides

d) Températures de transition de phases

Ø  influence de la force ionique Th

90

80

[NaCl, M] 0 2 4

100

HII

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 80

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D. Hydratation des lipides

e) Hydratation des interfaces

Ø  Aire par tête polaire en phase Lα (excès d’eau) H2C

CH2

N+

CH3

CH3

CH3choline

H2C

CH2

N+

CH3

CH3

CH3choline

H2C

CH2

N+

H

H

Hethanolamine

H2C

CH2

N+

H

H

HethanolaminePC = 70 Å2 PE = 57 Å2

DGDG = 80 Å2

PC + Chol (1:1) = 100 Å2

PE + Chol (1:1) = 70 Å2

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

OP

O-O

baseO

HO

A B

C D

HO

A B

C DO

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

O

HOOH

OH

CH2OH

O

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 81

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D. Hydratation des lipides

e) Hydratation des interfaces

Ø  Variation de l’aire de la tête avec la température (excès d’eau)

S (Å

2 )

Température °C Tp

70

50

Tm

PC

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 82

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D. Hydratation des lipides

e) Hydratation des interfaces

Ø  Variation de l’aire de la tête avec la température (excès d’eau)

S (Å

2 )

Température °C Tm

70

40

Th

PE

50

60

ordre désordreordre désordre

déshydratation

83

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels (excès d’eau), mesure SAXS

Ø  Glycérophosphocholines (DPPC)

(Å)

Température °C 30

20

10

Tm

30

50

40

60

10 20 60

dl

dl

d

d

dw

dw

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 84

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels (excès d’eau), mesure SAXS

Ø  Effet de la longueur de chaîne en phase fluide T=Tm + 5°C (PC)

(Å)

Nombre de carbones 14

20

10

16

30

50

40

60

12 18

dl

d

dw

PC

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 85

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels (excès d’eau), mesure SAXS

Ø  Glycérophosphatidyléthanolamines (DLPE)

(Å)

20

10

30

50

40

dl

d

dw

Température °C 60 80 20 40 100 120

dl

d

dw

dl

dw d32a =

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 86

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D. Hydratation des lipides

(Å)

Nombre de carbones 14

20

10

16

30

50

40

60

12 18

dl

d

dw

PE

dl

d

dw

f) Paramètres dimensionnels (excès d’eau), mesure SAXS

Ø  Effet de la longueur de chaîne en phase fluide T=Tm + 5°C (PE)

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 87

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels (excès d’eau), mesure SAXS

Ø  Effet de la longueur de chaîne en phase HII T=Th + 5°C (PE)

(Å)

Nombre de carbones 14 16

20

60

40

80

12 18

dl

a

dw

PE

dl

dw d32a =

20

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 88

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels

Ø  Glycérophospholipides (PS, PA, PG)

H2C

CHN+

H

H

HC

O O-

H2C

CHC

H

H

OHHO

(Å)

Teneur en eau en % (H20/Lip) 40 50

40

80

60

100

30

dl

d

dw

20

Comportement gonflant

DMPS.NH4+

Phase Lβ’

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 89

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dl

d

dw

dl

dw d32a =

D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels

Ø  Glycéroglycolipides en excès d’eau

(Å)

Température °C 20

20

60

40 dl

a

dw

0

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

CH2OH

(Å)

20

20

60

40 dl

d

dw

0

Phase HΙΙ Phase Lα

Température °C

O

O

CH2

CH (R)

H2C O

O

O O

HOOH

OH

O

HOOH

OH

CH2OH

O

MGDG DGDG

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 90

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D. Hydratation des lipides

f) Paramètres dimensionnels

Ø  Glycosphingolipides (GalCer) en excès d’eau

(Å)

Température °C 50 70

50

60

30 90

d

d

Cn C24:0

C16:0

LC Lα

(R)

(S)

OH

NH

O

sucre

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 91

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D. Hydratation des lipides

D3. Mélanges de lipides en excès d’eau

a) Systèmes binaires en excès d’eau

F = C – P + 1 A pression atmosphérique

ü  Existence d’1 phase, P=1, sur une gamme de composition et/ou température variables F=2

Excès d’eau, C=2

ü  Existence de 2 phases, P=2, sur une gamme de composition ou de température définies par les limites du diagramme, F=1

ü  Existence de 3 phases, P=3, pour une composition et une température fixées (point singulier) F=0

Eutectique Péritectique Monotectique Formation de composés « complexes »

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 92

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D. Hydratation des lipides a) Systèmes binaires en excès d’eau

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 93

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/DPPC C14/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

isomorphe

F+G

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 94

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/DSPC C14/C18

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

isomorphe

F+G

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 95

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/DAPC C14/C20

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

isomorphe

F+G

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 96

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/DBPC C14/C22

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

isomorphe

F+G

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 97

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/DSPC C14/C18

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

F+G

Ø  DSPC/DBPC C18/C22

Ø  différence des longueurs de chaîne

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

F+G

20°C

25°C

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 98

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DPPC/DPPE C16/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

F+G isomorphe

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 99

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  D0PC/DPPE C16/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

F+G Monotectique, péritectique ?

2° phase Lα

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 100

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DEPC/DPPE C20:1/C16

Lα, Fluide

Lc, Lβ‘, Gel

F+G Monotectique

2° phase Lα

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 101

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides en excès d’eau

Ø  DEPC/DPPE C16/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

péritectique

2° phase Gel

F+G

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 102

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides/Sphigophospholipides en excès d’eau

Ø  DMPC/SPM C14/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

F+G

Analogue à PC/PC

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 103

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides/Sphigoglycolipides en excès d’eau

Ø  GalCer/DPPC C14/C16

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

Phase cristalline

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 104

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D. Hydratation des lipides

a) Mélanges de glycérophospholipides/cholestérol en excès d’eau

Ø  DPPC/Chol

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

Phase β : intermédiaire entre

fluide et gel :

liquide ordonné

HO

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 105

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E.1. Les mouvements a)  Isotropes

b)  Anisotropes

c)  Hydrodynamique

E.2 Mesure de la dynamique

a)  Mouvements intramoléculaires

b)  Mouvements moléculaires

c)  Mouvements collectifs

E.3 Quelques Exemples

E.4. Notions de fluidité membranaire

E. Dynamique des lipides

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 106

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0 20 40 60 80 100-0.1

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

0.5

0.6

0.7

0.8

0.9

1.0

τ

G(τ)

0 20 40 60 80 100-0.1

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

0.5

0.6

0.7

0.8

0.9

1.0

τ

G(τ)

E.1. Les mouvements

Les mouvements isotropes Ø  Molécules en solution Ø  Colloïdes de faible taille (< 1000Å)

Equation de Stokes (diffusion isotrope) :

383

61

RTkD B

c πητ==

Viscosité η

2R

Fonction d’auto-corrélation

τc = temps de corrélation du mouvement considéré

ceG ττ

τ−

=)(

E. Dynamique des lipides

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 107

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E. Dynamique

E1. Les mouvements

Les mouvements anisotropes (direction privilégiée de mouvement)

Intramoléculaire τc ∼ 10-12-10-9 s

Rotations,

isomérisations gauche-trans,

fluctuations locales

Moléculaire τc ∼ 10-9-10-6 s

Rotations, balancement,

diffusion anisotrope

Collectifs τc ∼ 10-6-10-1 s

Modes hydrodynamiques de déformation, twist,

splay, etc.

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 108

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E. Dynamique

a) Mouvements intramoléculaires

R

R’

RR’

RR’

trans gauche + gauche -

E

Angle de rotation

Rotations autour de liaisons, vibrations

Temps caractéristique, ps

JJ D6

1=τ

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 109

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E. Dynamique

Mouvements locaux dans une phase cristal liquide

C DC DC DC D

ZD

énergie d’une configuration i

i

iidisp

ii AEEE γ++= int

ZTk

Eep B

i

i

−=

Probabilité d’existence d’une configuration donnée

Énergie potentielle (isomérisation)

Attraction entre chaînes (champ moyen)

Répulsions stériques

γ = pression latérale A = surface de la configuration i

Z = fonction de partition

JJ D6

1=τ

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 110

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E. Dynamique

Le concept de paramètre d’ordre (Saupe, 1964), phases de cristaux liquides

CH

H

βi

ZD Zk

k

ZD ZD : Axe moléculaire

Zk : Axe local, ⊥ plan H-C-H

Conformère i

Cas à symétrie axiale : orientation d’un axe Z par rapport à un autre axe Z

21β3cosS i

2

izz,−

=k

ii

k p izz,zz S S ∑=Paramètre d’ordre (local) de la position k

Chaîne rigide, ordonnée

1Szz =k

Ptrans = 1 Pj = 0

Chaîne « liquide », désordonnée

0Szz =k

équiprobabilité Pj = Pi

Intérêt :

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

111

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E. Dynamique

Diffusion latérale dans le plan de la bicouche

Equation de diffusion à deux dimensions

τc P 1DP D

tP

2

22

⎥⎦

⎤⎢⎣

∂+

∂=∇=

rrrLL

P(r,t) = probabilité, au temps t qu’une molécule soit à une distance r de l’origine

DL = coefficient de diffusion Latérale (m2s-1)

b) Mouvements moléculaires

Analogie avec le libre parcours moyen <r> d’une particule :

cL

rD

τ4

2

=t = 0

t = τc

r

RTkD B

πη8=(cas isotrope, particule sphérique : )

Lipides : Fréquence νj, distance λ

2

41

λν jLD =

Valeurs types : DL = 10-11 à 10-12 m2s-1

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 112

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E. Dynamique

Diffusion transverse

Flip-flop

b) Mouvements moléculaires

Bicouches étendues : γin = ½ , kin = kout = k/2

out

in

[Lout] [Lin] kin

kout

kin = γin k kout = (1-γin) k γin = nin/ (nin+ nout)

γin

t t½

0,5 t½ = 1/ (Ln2 k)

Valeurs typiques : t½ = heures, jours

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 113

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E. Dynamique

Diffusion rotationnelle anisotrope

ZN ZN : Axe directeur, ⊥ couche

2

2

//2

22 PDPθcot

θPsinθ

θsinθ1D

tP

ϕϕ ∂

∂+⎥⎦

⎤⎢⎣

∂+⎟⎠

⎞⎜⎝

⎛∂

∂=

∂⊥

Équation de rotation diffusion anisotrope :

ZD : Axe de diffusion moléculaire rotation

oscillation Z N

X N

Y N

θ

ϕ

P(θ,ϕ,t) = probabilité, au temps t d’avoir une orientation de la molécule définie par θ et ϕ

D// = coefficient de diffusion // à l’axe de diffusion moléculaire

D⊥ = coefficient de diffusion ⊥ à l’axe de diffusion moléculaire

Temps de corrélation de rotation anisotrope

//// D6

1=τ

⊥⊥ = D6

b) Mouvements moléculaires

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 114

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E. Dynamique

Paramètre d’ordre moléculaire

ZN

⎟⎟⎠

⎞⎜⎜⎝

⎛ −=

213

2θλθ

cos)(U

θ

λ = amplitude du potentiel

ZD Rotation restreinte de ZD dans un potentiel d’orientation de la forme :

13cosS 221

zz −= θ

Paramètre d’ordre moléculaire :

( )( )

( )

∫ −

0

TkθU-

π

0

TkθU-

2

21

dθ sinθe

dθ sinθe 1θ3cos

B

B

Intérêt : Pas d’oscillation

1Szz =

Oscillations sur (0-π) équiprobables

0Szz =

b) Mouvements moléculaires

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 115

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E. Dynamique

Mouvements collectifs dans une phase cristal liquide Z0

ξ

Fluctuations ξ(q)

ZN Déformation d’une couche (film)

Hydrodynamique : analyse des déformations en une large distribution de modes q activés thermiquement (de Gennes, 1974) dl

22ll

B2

Kqλ dTk(q)ξ =

K = constante d’élasticité de la couche Q = vecteur d’onde du mode q

λl = longueur de cohérence (µm)

η = viscosité

λl

Temps de corrélation : 2Kqητ(q) =

c) Mouvements collectifs

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 116

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E. Dynamique

Quelsques modes de déformation c) Mouvements collectifs

Module d’élasticité de courbure, kc (Κ)

ΚModule d’élasticité de courbure gaussienne,

Courbure sphérique Courbure gaussienne

Etirement

Module élastique d’étirement, kS

Module élastique de compression,

Compression

Β

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 117

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E. Dynamique

Caractérisation de la dynamique des lipides à différentes échelles

Intramoléculaires (rotations, vibrations)

qques Å, akj

kzz

kc E,p,S(ps),τ

Moléculaires (rotations, oscillations, translation flip-flop)

qques 10 Å, aLzz E ,D , t,S (ns), τ(ns),τ21//⊥

Film lipidique (modes hydrodynamiques de déformation)

qques µm, ηµ k(k s),-s(τ SC ),,,, ΒΚKq

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 118

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E. Dynamique

E2. Mesure de la dynamique

a) Mouvements Intramoléculaires

Ø  Spectroscopies infrarouge et Raman

Modes d’élongation (stretching) C-H ou C-D

2800 2900 3000

2930

2880

2800 2900 3000

2930 2880

Gel Fluide

cm-1 cm-1

2880

2930

hh

Le déplacement des bandes est proportionnel au nb d’isomères gauche (g±) par chaîne lipidique

Raman

2800 2900 3000

2850

2920 Gel

cm-1

Fluide

∝ nb d’isomères gauche (g±) par chaîne lipidique

IR

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 119

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E. Dynamique

Ø  Résonance paramagnétique électronique

O

O

H2C

CH

CH2

O

O

O

P

O

O-O

N+

N

O

Radical nitroxide

Interaction entre le spin électronique (s = ½) de l’électron célibataire et le spin nucléaire de l’azote -14 (I = 1)

Domaine des micro-ondes, ν = 1010 Hz, éclatement hyperfin, ΔH

Pour des raisons historiques, le spectre est représenté en mode dérivée

B0

B0

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 120

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E. Dynamique

ü  Exemple: spectre RPE d’un lipide marqué (N-0°) dans une phase lamellaire

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

Isotrope

molzz

intrazz S SΔH∝

L’éclatement hyperfin permet d’accéder aux paramètres d’ordre des chaînes

O

O

H2C

CH

CH2

O

O

O

P

O

O-O

N+

N

O

O

O

H2C

CH

CH2

O

O

O

P

O

O-O

N+

O

O

H2C

CH

CH2

O

O

O

P

O

O-O

N+

Inconvénient = sondes encombrantes, peu précises en phase gel

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 121

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E. Dynamique

Ø  RMN des Solides 13C, 31P, 2H, 14N, …

Lα, Fluide

Lβ‘, Gel

molzz

intrazz S SΔ ∝σ

-10 0 10 Frequency (kHz)

Lc

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

C

H2C

CH2

CH2

O

O

PO

O-O

H2C

H2C N+

H3CCH3

CH3

H

H

Anisotropie de blindage électronique Spectres

Dispersions de lipides dans l’eau

Δσ

Accès au paramètre d’ordre de la tête

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 122

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E. Dynamique

Ø  RMN des Solides 13C, 31P, 2H, 14N, …

3

molzz

intrazz S SΔr

D∝

Couplage spin-spin direct (dipolaire), 13C-13C, 13C-1H, (1H-1H) Spectres

Dispersions de lipides dans l’eau

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

CC

H2C

CH2

CH2

O

O

P

O

O-O

H2C

H2C N+

H3CCH3

CH3

H

HH

H

-15 -10 -5 0 5 10 15 Frequency (kHz)

Echantillon orienté dans B0 ΔD

Accès aux paramètres d’ordres des segments C-C, C-H, aux distances

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 123

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E. Dynamique

Ø  RMN des Solides 13C, 31P, 2H, 14N, …

molzz

intrazz S SΔ ∝Q

Interaction magnétique la plus facile à utiliser, C-D

Couplage électrique quadrupolaire, 2H, 14N, … Spectres

Dispersions de lipides dans l’eau

-90 -60 -30 0 30 60 90 Frequency (kHz)

Echantillon orienté dans B0 ΔQ

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

C

C

H2C

CH2

CH2

O

O

P

O

O-O

H2C

H2C N+H3C

CH3

CH3

DDH

H

Accès aux paramètres d’ordres des segments C-D

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 124

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E. Dynamique

Ø  RMN des Solides 13C, 31P, 2H, 14N, …

Temps de relaxation magnétique nucléaire

xL yL

zL M0

xL yL

zL M0 Mz(t)

t

)e - (1 M (t)M 1ZTt -0z =

équilibre perturbation

Retour à l’équilibre

0 20 40 60 80 100-0.1

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

0.5

0.6

0.7

0.8

0.9

1.0

τ

G(τ) G(τ)= exp(-τ/τc)

τc = temps de corrélation du mouvement considéré

∫+∞

∞−

τω− ττ=ω d e GJ 0i0 )()(

220

01

1 12

c

cZ JT

τωτ

ω+

=∝− )(

Temps de relaxation longitudianal « spin-réseau », T1Z

G(τ), fonction d’autocorrélation liquide

solide

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 125

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Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

10-12 10-11 10-10 10-9 10-8 10-7 10-6 10-5 10-410-2

10-1

100

101

102

103

104

105

106

E. Dynamique

Ø  RMN des Solides 13C, 31P, 2H, 14N, …

Temps de relaxation magnétique nucléaire

Mesure de T1Z pour plusieurs températures ou ω0

τc (s)

T1Z (s) ω0/2π = 500 MHz ω0/2π = 100 MHz

ω0/2π = 1000 MHz

ω0/2π = 10 MHz

107 Hz < ω0/2π < 109 Hz

Avec T1 (min) : τc = 1/ω0

10-8 s < τc < 10-10 s

v  ω0 τc << 1, mouvements rapides, 10-10s < τc < 10-12 s

v  ω0 τc >> 1, mouvements lents, 10-6 s < τc < 10-8 s [10-6 s , 10-12 s] 126

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E. Dynamique

b) Mouvements Moléculaires

Ø  Diffusion latérale

DL

FRAP (Réapparition de la fluorescence après photoblanchiement)

N+

N+

Sondes de fluorescence, DPH, TMA-DPH, NBD-PC,

NBD-PE

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

NHO

O

P

O

O-O

H2C

H2C N+

H3CCH3

CH3

N

O NNO2

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

C

C

H2C

CH2

CH2

O

O

P

O

O-O

H2CCH2

NH

H

HH

H

N

O

N

NO2

équilibre Photoblanchiement (laser)

Bicouches ou monocouches sur balance de Langmuir (observation au microscope)

LDt e BA −−

F

t

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 127

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E. Dynamique

b) Mouvements Moléculaires

Ø  Diffusion latérale

LDt e−

F

t

Marqueurs de fluorescence chargés

cathode anode cathode anode E = 0 E ≠ 0

E = 0

E ≠ 0 E = 0

Fonctions en

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 128

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E. Dynamique

b) Mouvements Moléculaires

Ø  Diffusion transverse

t

RPE

Utilisation de marqueurs de spin H3C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C O

O

CH2

CH

H2CO

H3CCH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C CH2

OO

P O

O

O-CH2

CH2

N+

CH3

H3C N O°

CH3H3C

CH3H3C

Incorporation du marqueur de spin

Signal de RPE

Addition d’un agent réducteur (ascorbate)

Flip-flop Réduction ultérieure Si

gnal

RPE

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 129

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E. Dynamique

b) Mouvements Moléculaires

Ø  Diffusion rotationnelle isotrope

RMN ou RPE (voir mouvements intramoléculaires)

rotation

oscillation Z N

X N

Y N

θ

ϕ

Accès à τ//, τ⊥, Ea, molzz

intrazz S S

Dans le cas de molécules rigides, on peut séparer et intrazzS

molzzS

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 130

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E. Dynamique

b) Mouvements Moléculaires

Ø  Diffusion rotationnelle isotrope Fluorescence fluorophores rigides

N+

Lumière naturelle

Avant excitation

excitation

Photo sélection (ps)

Lumière polarisée

Milieu anisotrope

liquide

I// > I⊥

I// = I⊥

Anisotropie ou polarisation de fluorescence

+

−=

IIIIr2//

//

+

−=

IIIIP

//

//

t (ns)

r

r∞

r0 0,4

0,0

//)()( τt

errrtr−

∞∞ −+= 0

2)( molzzSr ∝∞

τ// = temps de corrélation de rotation du fluorophore,

doit être plus petit que le temps de vie de l’état

excité

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 131

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E. Dynamique

c) Mouvements collectifs

50 µm

Ø  Fluctuations thermiques de vésicules (liposomes) géantes

Observation au microscope optique

Fluctuations du rayon moyen dans le plan équatorial

2)(tumn

),()(

pkTktu m

nC

Bmn σλ

12=

Tensions de membrane Pression hydrostatique

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 132

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E. Dynamique

c) Mouvements collectifs

Ø  RMN et DRX (expérience de dilution/gonflement)

Z0

ξ

ZN

dl

λl

d CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

H2C

CH2

O

O

H2C

CH

CH2

O

CH3

H2C

CH2

H2C

CH2

C

C

H2C

CH2

CH2

O

O

P

O

O-O

H2C

H2C N+H3C

CH3

CH3

DDH

H

Lipide marqué au deutérium

-90 -60 -30 0 30 60 90 Frequency (kHz)

ΔQ RMN

DRX

molzz

intrazz

collzz S S SΔ ∝Q

( )22

2collzz 1

1cos 2

13SuΔ+

=−

= ξξ ;cos

Constants lors de la dilution

d

ΔQ

( ) ⎟⎟⎠

⎞⎜⎜⎝

⎛⎟⎠

⎞⎜⎝

⎛=Δ

dkLn

kdfu C

C

2

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 133

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Labeled carbon position

0

20

40

60

80

100

120

140

2 9 14γ β α g3 g2 g1

1 / T

1z (H

z)

Labeled carbon position

0

20

40

60

80

100

120

140

2 9 14γ β α g3 g2 g1

1 / T

1z (H

z)

Ø  (Lα)

E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

E2. Quelques exemples

intrazzS Fluide

0.3

0.6

//

1.0

0.9

0.8

0.0

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 134

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E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

intrazzSØ  (Lα)

0.5

0.0

Température Tm

1.0

Gel

Fluide intrazzS

4

13

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 135

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E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

Ø  Ordre dans la bicouche en phase Lα, Lβ’, HII, HI

0.5

0.0

# Carbone des chaînes 2

1.0

intrazzS

4

13

4 6 8 10 12 14 16

Lβ’

HI

HII

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 136

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E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

Ø  Probabilités de conformères trans-gauche en phase Lα

0.5

0.0

# Carbone des chaînes 2

1.0

kip

4 6 8 10 12 14 16

trans

gauche

2.0

0.0

Température

4.0

Tm

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 137

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E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

Ø  τc, Ea (kJ mol-1)

1/Tm

10-10

3 3.5 4 x103 K-1

10-8

10-6

10-4

10-2

Lα Lβ’ Pβ’

1/Tm

10-12

3 3.5 4 x103 K-1

10-11

10-10

10-4

10-2 4

13

τc (s) τc (s) tête chaînes

12

50

45

20

8

8 15

15

Lα Lβ’ Pβ’

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 138

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E. Dynamique

c) Mouvements intramoléculaires

Ø  Effet du cholestérol τc, Ea (kJ mol-1),

1/Tm

10-12

3 3.5 4 x103 K-1

10-11

10-10

10-4

10-2

τc (s) chaînes

Lα Lβ’ Pβ’

0.5

0.0

Température Tm

1.0

4

13

+ Chol

- Chol

intrazzS

intrazzS

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 139

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E. Dynamique

c) Mouvements moléculaires Ø  Diffusion transverse

Température (°C) 30 20 50 40

t½(h)

20

1

10

Vésicules phospholipidiques, t½ = 1 - 1000 heures, Ea ~ 8-150 kJ mol-1

DMPC

Effet de la longueur de chaîne : n ↑, t½ ↑

Nature de la tête, PE/PC : t½ ~ 1900 h

out

in

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 140

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E. Dynamique

c) Mouvements moléculaires Ø  Diffusion transverse

Temps d’incubation avant réduction du NO° (h) 2.5 0

Sign

al R

PE n

on r

édui

t

100 %

0

50 %

Membrane du Globule rouge

O

O

H2C

CH

CH2

O

O

O

P

O

O-O

N+

N

O

5

PS

PE

PC SM

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 141

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E. Dynamique

c) Mouvements moléculaires

Ø  Diffusion Latérale

SM PC PE

30

10

20

Température (°C) Tm

DL x

10-

12 m

2 s-1

100

0.01

1

Peu d’influence de la longueur de chaîne

Nature de la tête (Lα)

DL x

10-

12 m

2 s-1

Température

Vitesse de saut d’un lipide à l’autre

10 ns

1 µs

0.1 ms

+ Cholestérol

τc

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 142

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Température

0.5

0.0

Tm

1.0

molzzS

Lα Lβ’ Pβ’

+ 30% cholestérol

E. Dynamique

c) Mouvements moléculaires

Ø  Diffusion rotationnelle

1/Tm

10-9

3 3.5 4 x103 K-1

τc (s)

Lα Lβ’ Pβ’

10-6

10-3

rotation

oscillation

τ//

τ⊥

+ 30% chol

60

90

35

Ea en kJ mol-1

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 143

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1.5

1.0

2.0

E. Dynamique

c) Mouvements collectifs

Ø  Longueur des chaînes k C

x10

-19 J

400 500 600 Å2 (d2)

kC ~ d2

DLPC DMPC DPPC Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

144

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1.5

1.0

2.0

E. Dynamique

c) Mouvements collectifs

Ø  température, cholestérol

k C x

10-1

9 J

Tm Tm+5°C

3.0

1.0

5.0

k C x

10-1

9 J

0 20 40 % cholestérol température

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 145

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E. Dynamique

E.4 Notions de fluidité membranaire

Fluidité : ensemble des phénomènes dynamiques se produisant aussi bien à l’échelle de l’Å que du micron (intra-, moléculaire, collectif)

Ø  Rôle de la fluidité membranaire :

Assurer un fonctionnement cellulaire correct Barrière sélective

v  diffusion d’ions et de molécules

o  dans le plan de la membrane

o  à travers la membrane

v  déformation de la membrane

o  passage de cellules dans les capillaires

v  fusion (endocytose, exocytose)

v  stabilisation de récepteurs à la surface de canaux membranaires

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 146

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E. Dynamique

Fluidité membranaire adéquate

Ø  Réactions membranaires

DL

La vitesse de réaction est contrôlée par la diffusion latérale des protéines

Dépend de DL des lipides

Ø  Transport

1/T x 10-3

Lβ’

0.1

1

10

100

Vite

sse

de t

rans

port

Ex: transport actif de b-galactoside à travers la membrane

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 147

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E. Dynamique

Régulation de la fluidité membranaire

Perturbations extérieures (température, diète, pH, …)

Compensations (molécules régulatrices, synthèse de double liaisons dans les acides gras, cholestérol, …)

Fluidité optimale CONSTANTE

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 148

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E. Dynamique

Hétérogénéité de la fluidité membranaire

Les radeaux lipidiques

Image en microscopie de fluorescence d’îlots dans une membrane

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010 149

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E. Dynamique

The role of phytosterols in plant adaptation to temperature

Beck, J. G., Mathieu, D., Loudet, C., Buchoux, S., and Dufourc, E. J. (2007) Plant sterols in "rafts": a better way to regulate membrane thermal shocks., FASEB J 21, 1714-1723.

Erick J. Dufourc, CNRS, janvier 2010

0 10 20 30 40 50 60

40

60

80

100

120

140

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0,8

0,9

M1 [k

Hz]

[T] °C

|2*<

S CD> ch

ain|

so

ld

lo

so

ld

lo

2

34

5

101

HO 67

89

19

H

14

1312

11

15

16

17

20

2122

2324

25

27

26

H

18

H

H

HO

CH3

H

H3C

CH3

CH3

H

CH3

H

H

CH3

Cholesterol

Sitosterol

50 kHz

150