microbiologie 2ème année snv.pdf

146
Pr. BEKKI Doctorat d’état en Microbiologie Université des Sciences de NICE. France Directeur Labo de Recherche et responsable de plusieurs projets de recherche JEAI SYMED-IRD Porteur du L3 HCFAUR Master Biotechnologie Doctorat LMD

Upload: alina-brais

Post on 16-Jan-2016

64 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Pr. BEKKI

• Doctorat d’état en

Microbiologie

• Université des

Sciences de NICE.

France

• Directeur Labo de

Recherche et

responsable de

plusieurs projets de

recherche

• JEAI SYMED-IRD

• Porteur du L3 HCFAUR

• Master Biotechnologie

• Doctorat LMD

Page 2: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

SYMED PNR-CNEPRU

Masters ouvrant droit à l’inscription au concours

par ordre de priorité:

MASTER SNV

* Rhizobiologie

*Microbiologie ou équivalent

Page 4: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

PROGRAMME

• Chapitre I : Le monde microbien

• Historique

• Place de microorganismes dans le monde

vivant

• Caractéristiques générales de la cellule

procaryote

• Chapitre II

• Techniques d’observation de la cellule

bactérienne

• La morphologie cellulaire

• La paroi

• Composition chimique

• Structure moléculaire

• Fonctions

• Coloration de Gram

• La membrane plasmique

• 4.1. Composition chimique

• Structure

• Fonctions

• Le cytoplasme

• 5.1. Les ribosomes

• 5.2. Les substances de réserve

• Le chromosome

• 6.1. Morphologie

• 6.2. Composition

• 6.3. Réplication chimique

• 6.4. Structure

• Les plasmides

• 7.1. Structure

• Réplication

• Propriétés

• Pilli

• Structure

• Fonction

• La capsule

• Morphologie

• Composition chimique

• Fonctions

• Les cils et flagelles

• Mise en évidence

• Structure

• Fonctions

• La spore

• 11.1. Morphologie

• 11.2. Structure

• 11.3. Phénomènes de sporulation

• 11.4. Propriétés

• 11.5. Germination

Page 5: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

CHAPITRE I: Le Monde

Microbien

• Historique

• Place des Microorganismes

dans le monde vivant

• Caractéristique de la cellule

procaryote

Page 6: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

1-1- Définition

Microbiologie

• domaine d’études

s’intéressant aux organismes

de taille microscopique, en

particulier aux bactéries,

protozoaires, virus et certains

champignons (levures) et

algues unicellulaires de petite

taille.

Page 7: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Définition suite

• La microbiologie englobe

l ’ e n s e m b l e d e s

disciplines biologiques

q u i c o n c e r n e n t c e s

m i c r o - o r g a n i s m e s :

bactériologie, mycologie,

virologie et parasitologie.

Page 8: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Définition suite

• étudie non seulement la

morphologie des micro-

organismes, mais également

leur mode de vie, leur

métabolisme, leur structure

moléculaire, leurs éventuelles

propriétés pathogènes et leurs

caractéristiques antigéniques

(propres à susciter une réponse

du système immunitaire).

Page 9: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

1-2-HISTORIQUE

• EMPIRIQUE

Utilisation des microbes sans

les connaître

(conservation des aliments,

production de fromage,

boissons)

Page 10: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• DECOUVERTE DU

MICROSCOPE

Antonie Van Leeuwenhoek en

1674)

Page 11: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Naturaliste hollandais,

fabricant de

microscopes

• Né à Delft, aux

Pays-Bas, Atonie Van

Leeuwenhoek ne

bénéficia pas d'un

enseignement

scientifique particulier.

Placé comme apprenti

chez un drapier

d'Amsterdam après

quelques années

d'étude dans un

collège, il s'installa en

1649 comme maître

drapier dans sa ville

natale.

Page 12: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• C’est en exerçant son métier qu’il

chercha à améliorer le pouvoir

grossissant des loupes. Le

comptage des fils par unité de

surface est en effet indispensable

pour déterminer la qualité du drap.

Il inventa donc, à ses heures

perdues, une petite lentille

biconvexe (dont il garda d'ailleurs

le secret, de sorte que, jusqu'au

développement du microscope

composé au XIXe siècle, personne

ne put concurrencer ses travaux)

Page 13: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• en insérant la lentille

entre deux plaques

d’argent ou de cuivre

percées d’un très

petit orifice. L’objet à

étudier est maintenu

à la distance focale

au sommet d’une tige

dont on peut régler la

hauteur par un

système de vis. À

travers cet appareil,

il pouvait voir les

objets sur des têtes

d'épingle, les

agrandissant de 50 à

300 fois (un

grossissement

dépassant nettement

celui d'appareils plus

anciens).

Page 14: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• La curiosité de van Leeuwenhoek

était illimitée. Grâce à son invention, il

explora le monde de l'infiniment petit,

en examinant tout ce qui lui tombait

sous la main. Il en fit des descriptions

d'une très grande précision.

• En 1668, il confirma et étoffa la

découverte de l'anatomiste italien

Marcello Malpighi sur les capillaires,

démontrant comment les globules

rouges circulent à travers les

capillaires de l'oreille du lapin ou de la

patte de grenouille.

Page 15: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• En 1674, il fit le premier la

description anatomique des

globules rouges du sang.

• Puis il observa la présence de

micro-organismes tels que les

protozoaires et les bactéries dans

l'eau stagnante et dans la salive

humaine.

• En 1677, il décrivit l'anatomie du

spermatozoïde, sans se douter de

sa fonction

Page 16: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• L'invention de van Leeuwenhoek

lui valut rapidement une

réputation telle que beaucoup de

ses compatriotes et les étrangers

les plus haut placés (notamment

le tsar Pierre le Grand de passage

à Delft) lui demandent la faveur

d’être admis à regarder dans

l’appareil les merveilles du monde

inconnu des infiniment petits. En

reconnaissance de ses

découvertes, il fut nommé

membre de la Royal Society de

Londres.

Page 17: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• EPOQUE PASTORIENNE

Page 18: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Né le 27 décembre 1822, Louis

Pasteur fréquente l’école puis le

collège d’Arbois. Elève doué, il

s’installe en octobre 1838 dans

une pension du Quartier Latin

qui prépare à l’entrée à l’Ecole

Normale. Mais le jeune homme

supporte difficilement cette

nouvelle vie et rentre à Arbois

pour poursuivre ses études au

collège royal de Besançon

Page 19: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Pasteur s ’ instal le de

nouveau à Paris et est

r e ç u q u a t r i è m e a u

c o n c o u r s d e l ’ É c o l e

Normale Supérieure en

1843. Il passe alors ses

d imanche après -mid i

avec le préparateur du

célèbre chimiste Jean-

B a p t i s t e D u m a s .

Page 20: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Il soutiendra d’ailleurs

deux thèses en 1847,

l ’ une en ch im ie e t

l ’autre en physique.

Ses recherches se

portent alors sur la

p o l a r i s a t i o n d e l a

l u m i è r e p a r l e s

c r i s t a u x .

Page 21: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Il découvre que certains

cristaux de structures

identiques ne dévient

pas la lumière de la

même façon. Certains la

dévient vers la droite,

d’autres vers la gauche.

Pasteur vient de mettre

en évidence l’isomérie.

Page 22: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• f a i t u n e d é c o u v e r t e

capitale : les levures sont

des êtres vivants à part

entière responsables de

la fermentation et non

des sous-produits de

c e l l e - c i , c o m m e d e

nombreux chimistes le

c r o i e n t .

Page 23: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• M a i s d e p u i s 1 8 5 8 ,

Pasteur est en bute aux

p a r t i s a n s d e l a

génération spontanée et

plus particulièrement à

Félix Archimède Pouchet

Page 24: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Félix Archimède Pouchet

communique une note à l’Académie

des Sciences en décembre 1858 sur

des

• proto-organismes nés spontanément

dans l’air.

• Pasteur lui réplique aussitôt qu’il

a tort

Page 25: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Le 7 avril 1864, Pasteur

donne une conférence à

l a S o r b o n n e . S e s

expériences conquièrent

le public, la commission

d’experts et les médias.

Pouchet est vaincu et

avec lui la thèse de la

génération spontanée.

Page 26: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Les problèmes de

contamination seront

rapidement réglés par l’équipe

de Pasteur qui met au point

• le filtre Chamberland (un filtre

en porcelaine qui retient les

germes de l’eau),

• l’autoclave et le flambage des

vases

Page 27: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• En Allemagne, Robert

Koch prouve par ses

expériences qu’un type

donné de microbe

provoque un certain type

de maladie. La

découverte du

staphylocoque par

Pasteur suivra

Page 28: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Staphylocoque au

microscope après

coloration

Page 29: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Staphylocoque

Page 30: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

charbon des moutons,

choléra des poules, rage

des chiens

• Pasteur s’intéresse plus aux

maladies qu’il peut cultiver sur

des organes : charbon des

moutons, choléra des poules,

rage des chiens.

Page 31: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Découverte du vaccin

• En été 1879, Pasteur et ses

collaborateurs, Roux et Duclaux,

découvrent que les cultures

vieillies du microbe du choléra

injectées aux poules ne

déclenchent pas la maladie. De

plus, elles résistent à de

nouvelles infections.

Page 32: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Première vaccinnation

• Le 5 mai 1881, un

troupeau de moutons

est vacciné. Le 2

juin, les résultats

sont là : un véritable

succès.

Page 33: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

La maladie de la rage

• infection aiguë du système

nerveux central de l’homme et

des animaux, provoquée par un

virus qui pénètre dans

l’organisme sain à la suite de la

morsure ou du léchage d’une

plaie par un animal contaminé.

Page 34: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

VIRUS de la Rage

Page 35: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Pasteur a débuté ses

recherches sur la rage en 1880,

suite à la mort d’un enfant à

l’hôpital Sainte-Eugénie. Mais

alors que l’étude de la virulence

de la maladie avance

Page 36: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Le 6 juin 1885, Pasteur reçoit

la visite de Marie-Angélique

Meister dont le fils Joseph a

été mordu par un chien

soupçonné de porter la rage. Il

commence les injections et

trois mois plus tard, l’enfant

sauvé, Pasteur présente ses

travaux à l’Académie des

Sciences qui lui offre un

accueil enthousiaste

Page 37: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

•Le 1er mars 1886,

sur 350 personnes

vaccinées, une

seule est décédée.

Page 38: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• L’Institut Pasteur naît en

1888. Outil de recherche,

de formation et de soins,

l’établissement s’exporte

rapidement en Australie

et au Viêt-nam. Pasteur

restera à la tête de

l’Institut jusqu’à sa mort,

le 28 septembre 1895

Page 39: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 40: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Pasteur a obéi toute sa vie à

l’idéal le plus pur, à un idéal

supérieur de science. L’avenir le

rangera dans la radieuse lignée

des apôtres du bien et de la

vérité. " C’est avec ces mots que

P o i n c a r é a c c o m p a g n e l a

dépoui l le mortel le de Louis

Pasteur, en 1895. La France

pleure alors un de ses plus

g r a n d s s c i e n t i f i q u e s .

Page 41: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

CHAPITRE I: Le Monde

Microbien

• Place des Microorganismes

dans le monde vivant

• Caractéristique de la cellule

procaryote

Page 42: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

1-3-Place des Microorganismes

dans le monde vivant

Page 43: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

1-3-Caractéristique de la

cellule procaryote

Cellule

Procaryote

Cellule

Eucaryote

Page 44: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Organisation génétique

Cellule procaryote

Cellule eucaryote

Membrane nucléaire Absente Présente

Nombre de chromosomes Généralement 1 > 1

Chromosome circulaire Oui* Non

Histones Absentes Présente

Nucléole Absent Présent

Echange génétique Transfert unidirectionnel Fusion de gamètes

Premier acide aminé initiant la synthèse d'une chaîne polypeptidique

Méthionine ou N-formylméthionine

Méthionine

Page 45: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structures cellulaires

Procaryote Eucaryote

Réticulum endoplasmique

Absent Présent

Appareil de Golgi Absent Présent

Lysosomes Absents Présents

Mitochondries Absentes Présente

Chloroplastes Absents Présents chez les plantes

Microtubules Absents** Présents

Page 46: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structures cellulaires (suite)

Procaryote Eucaryote

Présence de stérols dans les membranes

Non*** Oui

Endospores Parfois présente Absentes

Taille des ribosomes

70 S 80 S (sauf mitochondries et chloroplastes)

Localisation des ribosomes

Dispersés dans le cytoplasme

Liés au réticulum

endoplasmique

Page 47: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

CHAPITRE II

• 2-1-Techniques d’observation

• 2-2- La morphologie cellulaire

• 2-3- Constituants de la cellule

bactérienne

Page 48: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

microscopie optique

(G x 1000 -1500 fois)

. microscopie électronique

(G x >10.000 fois)

Page 49: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-2- La morphologie cellulaire

• En reconnaît la morphologie des

bactéries par observation

microscopique

• Morphologie = dimensions

(taille), Forme, arrangement ou

groupement

Page 50: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-2-1- Taille

• La taille des bactéries se situe

entre les virus et les

protozoaire.

cad

Les plus grandes bactéries ont la

taille d’un protozoaire

Page 51: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Figure

Page 52: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 53: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-2-2- La Forme

• Les formes des bactéries sont

très variable. Il existe 3 classe

principales

• A- La forme sphérique ou cocoïde

= les cocci

• B- La forme cylindrique =

Batonnet

• C- La forme spirale ou hélicoïdale

Page 54: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 55: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Forme Cylindrique (en Bâtonnet - Bacille)

Page 56: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Forme sphérique

Page 57: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Forme en spirale (spirille) et autres formes

Steptomyces Mycobactérie

Page 58: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 59: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-3- Constituants de

la cellule

bactérienne

Page 60: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Morphologie d’une cellule bactérienne

Page 61: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-3- Constituants de la

cellule bactérienne

• 2-3-1- Les

constituants

obligatoires

Page 62: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 63: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

A- La paroi

Enveloppe rigide qui (20% PS de

la cellule), elle confère à la

cellule sa forme, lui donne sa

résistance et entoure une autre

enveloppe plus mince, la

membrane cytoplasmique.

Page 64: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

A1- Composition chimique

• La paroi est

formé d’un

polymère

appelé, Le

Peptidoglycane

ou Mucopeptide

ou

Mucocomplexe

(figure 3)

Page 65: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 66: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Paroi des Gram+ et Gram-

Il existe une différence

entre la composition de

la paroi des gram+ et

Gram- comme le montre

le tableau 3, Figure 4 et 5

Page 67: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Tableau 3 : Composition chimique de

la paroi des bactéries Gram+ et Gram-

Les éléments Bactérie

Gram+

Bactérie Gram-

Osamines ++ +

Acides Amininés 24 à 35% 50%

Nombre A. aminés 4 à 10 16 à 17

Acides teichoique +++ -

Oses (sucres) 20 à 60% 20 à 60%

Lipides 1 à 2.5 % 10 à 22 %

Page 68: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure des paroi Gram+

20 à 80 nm

Page 69: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure des paroi Gram-

2 à 7 nm

7à 8 nm

Page 70: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure des paroi Gram+ et

Gram- (

GRAM+ GRAM-

Page 71: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 72: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 73: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 74: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

A3- Coloration de Gram

• La coloration de Gram mise au point en

1884, s'effectue en trois temps.

• . Dans un premier temps, les bactéries

sont colorées en violet par un colorant

basique tel que le violet de gentiane puis

par une solution de lugol (mordançage).

• . Dans un deuxième temps, qualifié de

temps de différenciation, les bactéries

sont soumises à l'action de l'alcool ou d'un

mélange alcool + acétone. Les bactéries

se répartissent en deux catégories : celles

qui conservent la coloration violette et qui

sont qualifiées de bactéries à Gram positif

et celles qui sont décolorées et qui sont

appellées bactéries à Gram négatif.

Page 75: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Coloration de Gram suite

• . Dans un troisième temps, afin de mieux visualiser

les bactéries décolorées, on procède à un traitement

par la fuchsine ou par la safranine. Les bactéries à

Gram positif apparaissent alors violettes et les

bactéries à Gram négatif se recolorent en rouge ou

en orange.

• . Le mécanisme de cette coloration est connu. Le

violet de gentiane se fixe sur des composants

cytoplasmiques et après ce temps de coloration,

toutes les bactéries sont violettes. Chez les

bactéries à Gram négatif, la paroi, riche en lipides,

laisse passer l'alcool (ou le mélange alcool +

acétone) qui décolore le cytoplasme alors que, chez

les bactéries à Gram positif, la paroi constitue une

barrière (A. Teichoique) imperméable à l'alcool et le

cytoplasme demeure coloré en violet.

Page 76: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Coloration de Gram

Page 77: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 78: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Gram+ Gram-

Page 79: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Autre techniques de déférencier le

Gram+ et Gram- (KOH)(Figure 6)

Page 80: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Technique de bandlette

de L-Ala-nitroalanine (figure 7)

Page 81: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Pourquoi cette différence de

couleur (Voir tableau)

Les éléments Bactérie

Gram+

Bactérie Gram-

Osamines ++ +

Acides Amininés 24 à 35% 50%

Nombre A. aminés 4 à 10 16 à 17

Acides teichoique +++ -

Oses (sucres) 20 à 60% 20 à 60%

Lipides 1 à 2.5 % 10 à 22 %

Page 82: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Composition Chimique

de la Paroi

Les éléments Bactérie

Gram+

Bactérie Gram-

Osamines ++ +

Acides Amininés 24 à 35% 50%

Nombre A. aminés 4 à 10 16 à 17

Acides teichoique +++ -

Oses (sucres) 20 à 60% 20 à 60%

Lipides 1 à 2.5 % 10 à 22 %

Page 83: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

N-Acetylglucosamine

CH2OH

OH

NH-CO-CH3

OH

HO

N-

Acetylglucosamine

Page 84: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

N-Acetyl muramique

CH2OH

OH

NH-CO-

CH3

HO

Acide N-acetylmuramique

H3C-CH-COOH

Page 85: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

CH

2O

H

O

H

NH-

CO-

CH3

O

H

H

O

N-

Acetylgluc

osamine

CH2OH

OH

NH-CO-

CH3

HO

Acide N-acetylmuramique

H3C-CH-COOH

O H

Page 86: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

La Galatosamine

• Présente chez certaines

espèces

• seulement

• et en faible

• proportion

Page 87: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Acide muramique=Muréine

Page 88: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 89: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 90: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 91: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 92: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

A2- Rôle de la paroi

• Elle assure la forme de la

cellule

• Résistance à la pression interne

de la cellule

• Siege de la fixation des

bactériophages

Page 93: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

LES ACIDES AMINES

• D- et L- ALANINE

• A. GLUTAMIQUE

• L- LYSINE

Page 94: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

ACIDES TECHOIQUES

Absent chez les gram-

Polymères de:

• POLYRIBITOL-PHOSPHATE

ou

• POLYGLYCEROL-PHOSPHATE

Page 95: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 96: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Oses (Sucres)

• Glucose

• Galactose

• Mannose

• Fructose

• Certains sont spécifiques

(ex. Rhamnose chez les streptocoques du

groupe A)

Page 97: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-3- Constituants de la

cellule bactérienne

• 2-3-1- Les

constituants

obligatoires

(constants)

Page 98: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

B- Membrane cytoplasmique

Page 99: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

B- Membrane cytoplasmique

• Elle entoure le

cytoplasme. Elle est

constituée d'une double

couche d'unités de

phospholipides (30-40 %)

et de 60-70 % protéines

qui lui sont associées

• (figure 8 a et b).

Page 100: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Figure 8 a: structure de la

membrane cytoplasmique

Page 101: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Figure 8 b: structure de la

membrane cytoplasmique

Page 102: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• La membrane cytoplasmique

des bactéries se distingue

de celle des cellules

eucaryotes par l'absence de

stérols. Elle est caractérisée

par son extrême fluidité qui

est liée au déplacement et à

la rotation des groupements

lipidiques.

Page 103: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

La membrane cytoplasmique

(suite)

• Certaines de ces protéines

jouent un rôle dans la synthèse

du peptidoglycane et sont

appelées protéines de liaison

aux pénicillines (PLP) ou

penicillin-binding-proteins (PBP)

car elles sont également la

cible d'action des bêta-

lactamines, famille

d'antibiotiques à laquelle

appartient la pénicilline.

Page 104: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 105: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

C- Le cytoplasme

• Le cytoplasme est contenu dans une

membrane cytoplasmique.

Le cytoplasme des cellules bactériennes

est un hydrogel colloïdal comprenant une

phase dispersante (sels minéraux et

composés solubles de nature

lipoprotéique) et une phase dispersée

formée de nucléoprotéines et de lipides.

Son pH est compris entre 7 et 7.2.

Le cytoplasme contient des ribosomes, des

acides ribonucléiques, des substances de

réserves et quelques organites spécialisés.

Page 106: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 107: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Parmi les substances de réserves, l'amidon

et plus souvent le glycogène, l'acide

β hydroxybutirique, des polyphosphates

organiques, du soufre, du fer, etc.

Les bactéries photosynthétiques

possèdent des chromatophores. Ces

organites jouent chez ces bactéries le rôle

que jouent les chloroplastes chez les

plantes vertes. Toutefois, l'ultrastructure

et la nature des pigments de ces organites

en sont différents.

Page 108: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Certaines bactéries (cyanobactéries,

bactéries pourpres et bactéries

vertes) possèdent des vacuoles à

gaz. Ces bactéries sont

photosynthétiques. Ces vacuoles à

gaz sont utilisées par ces bactéries

pour se sustenter (s’alimenter) à

différentes profondeurs dans les

masses d'eau qu'elles fréquentent.

Page 109: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 110: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

D- L'appareil nucléaire

• L'appareil nucléaire

bactérien n'est pas

entouré d'une membrane,

contrairement au noyau

de la cellule eucaryote.

il n'y ait qu'un

chromosome. La cellule

serait donc haploïde.

le chromosome bactérien

(E. coli) est circulaire et

comprend 5 106 paires de

bases échelonnées le

long d'une double hélice.

Page 111: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

L'appareil nucléaire (suite)

• La molécule

d'ADN des

bactéries est de

grande taille.

Déroulée, elle

atteindrait plus

d'un millimètre

de longueur

(figure 9).

Page 112: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 113: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

D- L'appareil nucléaire (suite)

• L'appareil nucléaire est en

relation avec les invaginations de

la membrane plasmique appelées

mésosome. Il semble que c'est

au niveau du mésosome que

soient concentrées les sites

enzymatiques qui permettent à

l'ADN d'exprimer ses différentes

fonctions (ADN polymérases,

ADN ligases, déroulases,

gyrases, etc.)

Page 114: Microbiologie 2ème année SNV.pdf
Page 115: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

E- Les plasmides

• Les plasmides sont des

éléments génétiques

extrachromosomiques

capables d'autoréplication.

Les plasmides sont des petits

fragments d'ADN, environ cent

fois moins volumineux que

l'ADN chromosomique.

Page 116: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les plasmides (suite)

• Parmi leurs propriétés, l'une

d'elle, très importante, est de

conférer aux bactéries des

résistances aux antibiotiques

ou aux métaux lourds (sels

mercuriels, de cadmium, de

bismuth ou de plomb,

composants fréquents des

antiseptiques).

Page 117: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les plasmides (suite)

• Les plasmides sont aussi

responsables de la synthèse

des bactériocines (colicines,

vibriocines, pyocines, etc.).

Ces substances de nature

protéique ont un pouvoir

bactéricide puissant.

Page 118: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

2-3- Constituants de la cellule

bactérienne

• 2-3-2- Les constituants faculatifs

Page 119: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

A- La capsule

• de nombreuses

bactéries

élaborent des

substances

organiques

visqueuses qui

entourent leur

paroi d'une couche

plus ou moins

compacte. Toutes

les bactéries ne

produisent pas de

capsule.

Page 120: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

La capsule (suite)

• Au sein d'une espèce,

certaines souches en

produisent, d'autres pas.

L'élaboration de la capsule

est influencée par certaines

conditions du milieu. Les

glucides jouent un rôle

important dans la présence

ou non de la capsule.

Page 121: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Le rôle de la capsule

• La capsule joue un rôle

important dans la défense des

bactéries, d'abord contre la

dessiccation, mais aussi contre

les prédateurs (protozoaires) ou

les parasites

• (les bactériophages sont

incapables de se fixer sur une

bactérie capsulée).

Page 122: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Le rôle de la capsule (suite)

• La capsule empêche les

bactéries d'être

phagocytées dans

l'organisme, elle joue un rôle

pathogénique. Ainsi, les

pneumocoques capsulés se

révèlent pathogènes, alors

que les pneumocoques non

capsulés ne le sont pas.

Page 123: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

B- Les cils et les flagelle

• Les bactéries

mobiles se

déplacent soit par

glissement

(cyanobactéries),

soit par rotation

autour d'un axe

central

(spirochètes), soit

au moyen de cils

ou de flagelles.

Page 124: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les cils et les flagelle (suite)

• Les cils et les flagelles confèrent

une certaine mobilité aux

bactéries qui peuvent se déplacer

dans les milieux liquides ou à la

surface des géloses. Certaines

espèces peuvent même envahir

les milieux de culture, masquant

par là même les autres colonies.

C'est le cas des Proteus ou des

Pseudomonas.

Page 125: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• La mobilité pour les bactéries

n'a d'intérêt que pour se nourrir

(s'approcher des substances

nutritives) ou pour fuir les

prédateurs ou les molécules

toxiques (antibiotiques,

antiseptiques, etc.).

• Ces comportements relèvent de

chimiotactismes. Les bactéries

sentent donc leur

environnement grâce à des

récepteurs chimiques

(pariétaux ou membranaires ?).

Page 126: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les différents types d’insertion

• Il existe quatre grands types

d'insertion des cils ou des

flagelles sur les bactéries :

insertion polaire : monotriche,

lophotriche, amphitriche et

insertion péritriche (figure 10). Le

point d'insertion des cils et des

flagelles se situe dans le

cytoplasme, au contact de la

membrane plasmique.

Page 127: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Figure 10

Page 128: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

C- pili ou fimbriae

Page 129: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Les bactéries Gram négatif, surtout,

possèdent, à leur surface, des

appendices filiformes très courts,

rigides et cassants. Ces pili ou

fimbriae confèrent aux bactéries

l’adhésion (agglutination) (pili

commun). Certains de ces pili,

renflés, appelés pili sexuels,

joueraient un rôle dans l'échange

d'ADN entre deux bactéries quand

elles rentrent en conjugaison

Page 130: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

D- Les spores bactériennes

• Certaines bactéries ont la

propriété de former de petites

unités sphériques douées

d'une extraordinaire

résistance. Ces unités sont

appelées spores ou

endospores, car elles se

forment à l'intérieur de la

cellule bactérienne.

Page 131: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure d’une Spore

bactérienne

• La spore (figure 11) est constituée

par un cytoplasme de texture

homogène, pauvre en ARN, en

enzymes et en eau mais contenant

une quantité d'ADN proche de celle

de la cellule végétative.

• La membrane cytoplasmique,

analogue à celle de la cellule

végétative, est entourée de la paroi

sporale et du cortex.

Page 132: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure de la spore (suite)

• Le cortex, très transparent aux

électrons, contient la quasi totalité

d'un constituant spécifique des

spores, l'acide dipicolinique sous

forme de dipicolinate de calcium.

Appliqué contre le cortex on trouve

la ou les tuniques (appelées alors

intine ou tunique interne et exine

ou tunique externe) formées de

protéines riches en ponts

disulfures puis, éventuellement,

l'exosporium.

Page 133: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Structure d’une Spore (fig.11)

Page 134: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Propriétés des spores

• Les spores sont en effet douées

d'une longévité et d'une résistance

importante. La longévité est difficile

à apprécier mais elle pourrait

atteindre plusieurs milliers d'années

pour certaines espèces de Bacillus.

La thermorésistance est très

variable selon les espèces et même

selon les souches, selon l'âge des

cultures et selon les conditions de

culture. Quelques valeurs de la

thermorésistance des spores sont

données dans le tableau 4.

Page 135: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Tableau 4: thermorésistance

des spores

Espèces

Temps en minutes

pour détruire 90%

des spores chauffées à 120 °C

Clostridium tetani 5

Bacillus subtilis 5 à 10

Clostridium thermosaccharolyticum 4 à 5

Bacillus stearothermophilus 4 à 5

Desulfotomaculum nigrificans 2 à 3

Bacillus coagulans 0,1

Clostridium sporogenes 0,1 à 0,5

Clostridium botulinum A ou B 0,1 à 0,2

Bacillus anthracis 1 à 6

Page 136: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

•Les spores résistent

également aux

radiations, aux

pressions, aux

antibiotiques, aux

antiseptiques et aux

désinfectants.

Page 137: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

formation et germination des

spores

Page 138: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Formation de la Spore

• La transformation de la forme

végétative en spore est la

sporulation :

• . Temps : jusqu’à 10 heures à

37°C pour Bacillus megaterium .

Page 139: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Sporulation quand?

• déclenchée par des

modifications de

l'environnement tel

épuisement en matières

nutritives.

Page 140: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les étapes de la

sporulation

• La sporulation est un

processus complexe qui

peut être divisé en 7

étapes suivantes:

Page 141: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Étape 1: Formation du filament

axial de matériel nucléaire

• Étape 2: Invagination de la

membrane cellulaire isolant une

partie de ADN et constituant le

Septum de la préspore

phase 1 et 2 durent 4 h

Page 142: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Étape 3: après 5.5 h

• La membrane continue a se

développer et entoure la spore

et formation d’une seconde

enveloppe

• Étape 4 : après 6.5 h

• Formation du cortex et

accumulation du calcium et de

l’acide dipocolinique

Page 143: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Étape 5: après 8 h

• Formation des protéines de la

tunique autour du cortex.

• Étape 6: Maturité de la spore

• Étape 7: Libération de la spore

duréé totale de la 10.5h

Page 144: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Germination de la spore

• La transformation des spores

dormantes en cellule

végétative (germination) est

aussi complexe que la

sporulation.

• Elle se déroule en trois

étapes

Page 145: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

Les étapes de la germination

des spores

• Étape 1: Activation

Cette étapes est essentielle pour la

préparation de la germination. Elle peut

être provoquée par un chauffage.

Étape 2: Germination

Gonflement de la spores, rupture de la

tunique et augmentation de l’activité

métabolique de la spore.

Étape 3: Croissance: Le protoplaste de la

spore synthétise de nouveaux composé

et naissance de la bactérie active

Page 146: Microbiologie 2ème année SNV.pdf

• Le contenu de ce cours est sur

le site du labo:

• www.lbrap.sitew.com

• Cours microbiologie