Paul Payette, Merck Frosst, janvier 2004

Génomique et protéomique

Paul Payette, Merck Frosst, janvier 2004

1980 19

81 1982 19

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89 1990 19

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95

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1998 19

99

2000

PD

B

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spro

t

Gen

bank

0

5,000,000

10,000,000

15,000,000

20,000,000

25,000,000

30,000,000

Nombre

Année

Bases de données Août 2003

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Bases de données - Proteines

0

20,000

40,000

60,000

80,000

100,000

120,000

140,000

Nom

bre PDB

Swissprot

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Bioinformatique, génomique, protéomique… ique, ique, ique!

– BIOINFORMATIQUECollecte, organisation et analyse de grandes quantités de données biologiques, à l’aide de réseaux d’ordinateurs et de bases de données. Les technologies et les outils logiciels des bases de données permettent aux chercheurs de recueillir, de stocker et d’extraire un volume sans cesse croissant de données sur les séquences géniques et protéiniques.

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Définitions…

• GÉNOMIQUEScience qui se propose d’étudier la structure, le fonctionnement et l’évolution des génomes.

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• PROTÉOMIQUELa protéomique est l’étude de toutes les protéines fabriquées par un organisme : son protéome. Les chercheurs en protéomique étudient la structure et la fonction des protéines, de même que leurs interactions.

Définitions …

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Liens intéressants

• Reseau bioinformatique canadien– http://cbrmain.cbr.nrc.ca:8080/cbr/servlet/ListCLAppsServlet?type=2&lang=fra)

• Génome Québec– http://www.genomequebec.com/index.asp

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Génomique

• MICRO-PUCES À ADN (gene chip)– Puces d’ADN; supports miniaturisés qui

portent sur une surface réduite de grandes quantités de « sondes » capables de «happer» dans un milieu biologique des fragments d’ADN homologues (complémentaires).

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Génomique: Résultats micro-puces

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Gel de protéines 2D - Protéomique

Poids moléculaire

Point isoélectrique

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Exemple d’expérience in silico

• Analyse fonctionnelle de l’oestrogène sulfotransférase

(Dossier réalisé par Cédric Dubois et par Nicolas Novalis, École supérieure d’ingénieurs de Luminy, France)