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B. Jans, Dr. O. Denis & BICS IPH/EPI REPORTS Nr. 2010 066 Numéro de dépôt : D/2010/2505/71 Surveillance de Staphylococcus aureus résistant à la Méticilline (MRSA) dans les hôpitaux chroniques belges : Année 2009

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B. Jans, Dr. O. Denis & BICS

IPH/EPI REPORTS Nr. 2010 – 066

Numéro de dépôt : D/2010/2505/71

Surveillance de Staphylococcus aureus résistant à la Méticilline (MRSA)

dans les hôpitaux chroniques belges :

Année 2009

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Institut Scientifique de Santé Publique

D.O. Santé Publique et Surveillance

14, rue Juliette Wytsman 1050 Bruxelles – Belgique Tel : 02/642.57.36 Fax : 02/642.54.10 E-mail : [email protected] www.wiv-isp.be www.nsih.be Jans Béatrice, Dr. O. Denis & BICS. Epidémiologie, décembre 2010; Bruxelles (Belgique) IPH/EPI REPORTS N° 2010 – 66 Numéro de dépôt: D/2010/2505/71

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

1

TABLE DES MATIERES

TABLE DES MATIERES 1

LISTE DES TABLEAUX ET DES FIGURES 2

1. PARTICIPATION 3

2. TAUX DE RESISTANCE 4

3. PROPORTION ET INCIDENCE DE MRSA PRESENT A L’ADMISSION 5

4. MRSA ACQUIS A L'HOPITAL 6

4.1. Incidence de MRSA acquis à l’hôpital 6

4.2. Proportion de MRSA nosocomial à l’hôpital 7

4.3. Proportion de MRSA nosocomial par type de service 7

4.4. Proportion de MRSA nosocomial par type d’échantillon clinique 7

5. DEPISTAGE DE MRSA 8

5.1. Nombre de cas de n- MRSA détectés par prélèvement de dépistage 8

5.2. Indications et frequence du dépistage de MRSA 8 5.2.1. Fréquence de dépistage de MRSA à l’admission 8 5.2.2. Fréquence de dépistage de MRSA en cours d’hospitalisation 9

6. CONCLUSIONS 9

7. EVOLUTION DES TAUX ET INCIDENCES 11

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

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LISTE DES TABLEAUX ET DES FIGURES Figure 1 : Répartition des souches de MRSA : proportion de MRSA présent à l’admission selon les contacts antérieurs avec des institutions de soins 5 Figure 2 : Evolution du taux de résistance moyen : 2007 - 2009 11 Figure 3 : Evolution des medianes des résistances : 2007 - 2009 11 Figure 4 : Evolution de l’incidence moyenne globale de MRSA nosocomial (/ 1000 journées d’hosp.): 2007 - 2009 12 Figure 5 : Evolution des médianes des incidences de n-MRSA : 2007 - 2009 12 Figure 6 : Evolution de la proportion de MRSA acquis à l'hôpital (échantillons cliniques uniquement): 2007 - 2009 12 Tableau 1 : Proportion de MRSA (Type D uniquement) par région et par taille de l’hôpital, année 2009 4 Tableau 2 : Taux d'incidence et densité d’incidence de MRSA nosocomial (échantillons cliniques uniquement) par région et par taille de l’hôpital, année 2009 6 Tableau 3 : Proportion de patients admis avec un dépistage de MRSA à l’admission, année 2009 8 Tableau 4 : Proportion de patients admis avec un dépistage de MRSA en cours d’hospitalisation, année 2009 9

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

3

1. PARTICIPATION Pour l’année 2009, 15 institutions de soins de type chronique ont envoyé des données de surveillance de MRSA. Ces institutions ont été classées parmi les hôpitaux avec un profil chronique :

- soit parce qu’officiellement ils sont reconnus comme hôpitaux chroniques (comptent exclusivement des lits du type Sp, avec ou sans lits G),

- soit parce qu’officiellement classés parmi les hôpitaux aigus (ou faisant partie d’une fusion classée parmi les aigus), mais dans la réalité ayant une durée de séjour de plus de 16 jours en moyenne. Ce sont souvent des sites faisant partie d’une fusion, dans lesquels les lits chroniques de l’ensemble ont été regroupés.

Pendant cette période, la durée moyenne de séjour atteignait 29.8 jours dans ces institutions (médiane des durées de séjour dans les 15 institutions : 52 jours). Huit de ces institutions chroniques se situaient en Flandre, six en Wallonie et une à Bruxelles. Dix hôpitaux chroniques comptaient moins de 200 lits et cinq appartenaient aux hôpitaux de taille moyenne (entre 200 et 399 lits). Ils totalisaient 2329 lits, c.a.d. 155 lits en moyenne par institution (min. 44, max. 235 lits). Toutes ces institutions ont envoyé des données du type D

1 (chaque patient n’est compté qu’une seule fois par

période d’hospitalisation).

1•Type A: Chaque prélèvement positif est compté (dépistages et doublons inclus)

•Type B: Chaque prélèvement clinique positif est compté (dépistages exclus, doublons inclus) •Type C: Chaque site d’infection n’est compté qu’une fois par période d’hospitalisation •Type D: Chaque patient n’est compté qu’une seule fois par période d’hospitalisation.

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

4

2. TAUX DE RESISTANCE En 2009, au total 281 souches de MRSA ont été isolées (moyenne : 18.7 souches de MRSA par hôpital; ce nombre variait de 2 à 57 souches). La proportion de MRSA parmi l’ensemble des souches de S. aureus (taux de résistance moyen

2) atteignait 39.5%.

La moyenne des taux de résistance

3 des hôpitaux participants s'élevait à 43.3% (médiane : 38.0%).

Elle était plus élevée dans les institutions en Flandre (47.5%) comparée à celle dans les hôpitaux chroniques en Wallonie (38.7%) (n.s.). Le taux de résistance était également plus élevé dans les petits hôpitaux (49.5%) comparé aux hôpitaux chroniques de taille moyenne (31%, n.s.). Tableau 1 : Proportion de MRSA (Type D uniquement) par région et par taille de l’hôpital, année 2009

MRSA/ S. aureus (%)

hôpitaux

Valeurs

absolues

Taux de

résistance moyen

2

(%)

Distribution des proportions

Moyenne des t. de résist

3.

25% 50% médiane

75% Min/Max

Taux de résistance, par région Belgique

15

281/711

39.5

43.3

22.0

38.0

63.0

11.0 – 100.0

Flandre

8

160/319

43.4

47.5

32.5

39.5

59.5

17.0 – 100.0

Wallonie

6

111/366

30.4

38.7

15.0

34.5

64.0

11.0 – 73.0

Bruxelles

1

10/26

38.5

Taux de résistance, par taille de l’institution < 200 lits

10

187/353

53.0

49.5

34.0

42.5

63.0

17.0 – 100.0

200 – 399 lits

5

94/358

26.3

31.0

15.0

22.0

43.0

11.0 – 64.0

2 Le taux de résistance moyen = Σ 1A x 100/ Σ 1B

3 La moyenne des taux de résistance = Σ des taux de résistance/ nombre d'hôpitaux

Rubriques et calcul : (1A* 100)/ 1B Conditions : Type D uniquement Réponse pour les indicateurs 1A et 1B

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5

3. PROPORTION ET INCIDENCE DE MRSA PRESENT A L’ADMISSION Six hôpitaux avaient correctement rempli toutes les rubriques nécessaires (la rubrique 2 : de A à L) à calculer la proportion et l’incidence de MRSA en fonction de l’origine du patient. Ces 6 institutions totalisaient 106 souches de MRSA dont 12 (11.3%) provenaient de porteurs connus. Les 94 souches (88.7%) restantes étaient isolées à l’admission de patients pour lesquels le portage n’était pas connu dans les antécédents (10 souches à partir d’échantillons cliniques et 84 à partir de prélèvements de dépistage) . - Parmi les 106 souches détectées à l’admission (figure 1), 59 (55.7%) la source la plus importante était constituée par des patients transférés d’un hôpital aigu, 6 (5.7%) par des patients transférés d’une MR/MRS, 6 (5.7%) par des patients ayant eu des contacts avec les deux types d’institutions de soins durant l’année écoulée, 12 souches (11.3%) provenaient de porteurs connus. Les souches dites ‘communautaires’ (sans contacts antérieurs avec des institutions de soins) représentaient 5% (5 souches) de l’ensemble des MRSA trouvés à l’admission. Pour 18 souches (17%) les contacts avec les établissements de soins n’étaient pas connus. Figure 1 : Répartition des souches de MRSA : proportion de MRSA présent à l’admission selon les contacts antérieurs avec des institutions de soins

L’incidence de MRSA à l’admission atteint 27 cas par 1000 admissions ou 0.60 cas par 1000 journées d’hospitalisation.

Portage connu11%

Contact/transfert d'un hôpital

56%

Contact/transfert d'une MR/MRS

6%

Contact/transfert Hôpital + MR/MRS

6%

Contacts inconnus17%

Communautaire5%

% MRSA+ à l'admission: répartition en fonction des contacts antérieurs avec des établissements de soins

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6

4. MRSA ACQUIS A L'HOPITAL

4.1. Incidence de MRSA acquis à l’hôpital

L’incidence des nouveaux cas de MRSA a été calculée en prenant le nombre de nouveaux cas d’acquisition nosocomiale en provenance d'échantillons cliniques (rubrique 3A) et les dénominateurs correspondants (7A, 7B): 15 répondants ont fourni toutes les données permettant ce calcul. Ces hôpitaux totalisaient 108 souches nosocomiales à partir d’échantillons cliniques (rubrique 3A). L’incidence moyenne globale

4 était de 0.20 nouveaux cas pour 1000 journées d’hospitalisation ou 6.0 nouveaux

cas par 1000 patients admis (médiane : 7 pour 1000 admissions). La moyenne des incidences n’était pas significativement différente, ni par région, ni par taille d’hôpital. Tableau 2 : Taux d'incidence et densité d’incidence de MRSA nosocomial (échantillons cliniques uniquement) par région et par taille de l’hôpital, année 2009

Incidence de MRSA nosocomial (échantillons cliniques)

hôpitaux

Valeurs

absolues

Incidence moyenne

Distribution des incidences

Moyenne des incid.

25% 50% médiane

75% Min/Max

Par 1000 jrs. d'hospitalisat.

15

108/531568

0.20

0.23

0.08

0.21

0.39

0.0 – 0.66

Par 1000 admissions

15

108/17863

6.0

11.7

4.0

7.0

15.0

0.0 – 36.0

Incidence de n-MRSA /1000 journées d’hospitalisation, par REGION Flandre

8

54/271410

0.20

0.26

0.10

0.20

0.39

0.0 – 0.66

Wallonie

6

47/231047

0.20

0.20

0.00

0.15

0.39

0.0 – 0.49

Bruxelles

1

7/29111

0.24

Incidence de n-MRSA/1000 journées d’hospitalisation, par TAILLE DE L’HOPITAL < 200 lits

10

64/329745

0.19

0.24

0.08

0.22

0.26

0.0 -0.66

200 – 399 lits

5

44/201823

0.22

0.23

0.09

0.16

0.39

0.0 -0.49

4 L'incidence moyenne globale = Σ 3A x 1000/ Σ 7A ou Σ 7B

Rubriques et calcul: 3A * 1000/ dénominateur Dénominateur : 7A et/ou 7B Conditions : Réponse pour 3A et 7A, 7B

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

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4.2. Proportion de MRSA nosocomial à l’hôpital

Au total, 108 souches de MRSA (3A, nosocomial uniquement) ont été isolées chez des nouveaux patients hospitalisés (3A) pour un total de 281 MRSA, nosocomial et autre, décrits dans les échantillons cliniques (1A) parmi 15 hôpitaux chroniques ayant correctement rempli ces deux volets. La proportion de cas de MRSA, acquis à l’hôpital était donc de 38.4% en moyenne.

4.3. Proportion de MRSA nosocomial par type de service

Pour le calcul de cet indicateur, la proportion de MRSA acquis à l’hôpital (échantillons cliniques et de dépistage) est calculée en tenant compte du service ou le prélèvement a été réalisé. Il faut cependant interpréter cet indicateur avec prudence car le lieu de prélèvement n’est pas nécessairement le lieu d’acquisition du MRSA. Neuf hôpitaux ont fourni les données nécessaires et valides pour le calcul de la proportion de MRSA nosocomial, reparti par type de service, parmi l’ensemble des souches de MRSA pour l’hôpital. Ces 9 hôpitaux totalisaient 88 souches de MRSA nosocomial en provenance de prélèvements cliniques et de dépistage. 9.1% des souches de n-MRSA étaient prélevées dans des services hospitaliers aigus (C, D) et 90.9% dans des services subaigus ou chroniques (G, Sp).

4.4. Proportion de MRSA nosocomial par type d’échantillon clinique

Pour le calcul de la proportion du nombre de souches de n-MRSA par type d’échantillon clinique sur l’ensemble des souches (cliniques) de MRSA, 11 hôpitaux ont fourni les données nécessaires et valides. Ces hôpitaux totalisaient 73 souches de MRSA nosocomial en provenance de prélèvements cliniques dont 2 (2.7%) à partir d’une hémoculture.

Rubriques et calcul: 3A*100/ dénominateur Dénominateur : 1A Conditions : Données de type D uniquement Réponse pour 3A et 1A

Rubriques et calcul: 4B *100/ dénominateur 4C *100/ dénominateur

Dénominateur : 4B + 4C Conditions : Réponse pour 4B et 4C

4B + 4C = 3A + 3B

Rubriques et calcul: 5A *100/ dénominateur 5B *100/ dénominateur

Dénominateur : 5A + 5B Conditions : Réponse pour 5A et 5B et 3A

5A + 5B = 3A

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

8

5. DEPISTAGE DE MRSA

5.1. Nombre de cas de n- MRSA détectés par prélèvement de dépistage

Un seul hôpital n’a pas répondu à la question, les 14 autres hôpitaux chroniques ont déclaré faire un dépistage de MRSA parmi les patients. Onze hôpitaux isolaient également 69 souches nosocomiales à partir de prélèvements de dépistage (rubrique 3B) : min. 1 – max. 15 souches. Quatre hôpitaux rapportaient zéro souches à partir d’un dépistage. En tenant compte du dépistage, l’incidence moyenne de nouveaux cas de MRSA acquis à l’hôpital passe de 0.20 cas/1000 à 0.33 cas de n- MRSA pour 1000 journées d’hospitalisation.

5.2. Indications et fréquence du dépistage de MRSA

5.2.1. Fréquence de dépistage de MRSA à l’admission

Au cours de l’année 2009, les 14 hôpitaux chroniques qui ont fourni des données pour le calcul de l’incidence de n-MRSA, déclaraient qu'ils pratiquaient un dépistage à l’admission du patient. Dans 4 hôpitaux un dépistage systématique de tous les patients à l’admission était effectué. Sept institutions réalisaient un dépistage auprès de patients venant d’un hôpital en situation épidémique. Le dépistage était le plus souvent ciblé : 5/14 (36%) hôpitaux faisaient un dépistage à l’admission dans certains services, 8/14 (57%) en fonction de l’origine du patient (autre hôpital, MR/MRS) et 7/14 (50%) le réalisait en fonction du risque pour le patient. Trois hôpitaux ont fourni les données nécessaires à quantifier la pratique du dépistage à l’admission au sein de l’hôpital. Parmi les patients admis (2700) au cours de l’année 2009 dans ces hôpitaux, 2292 patients (6B) ont été dépistés pour la recherche de MRSA à l’admission, c’est à dire 84.9/ 100 patients admis (tableau 3).

Tableau 3 : Proportion de patients admis avec un dépistage de MRSA à l’admission, année 2009

Nombre hôpitaux

Valeurs

absolues

Proportion moyenne de patients ayant subi dépistage/ 100 admissions

Distribution des proportions

Moyenne des prop.

25% 50% médiane

75% Min/Max

Belgique 3 2292/2700 84.9 87.1 75.2 92.0 94.2 75.2 – 94.2

Parmi ces 2292 patients (6B), 5536 prélèvements (6A) ont été effectués : en moyenne 2.4 prélèvements par patient (min. 1 – max. 3.3).

Rubriques et calcul: 6A, 6B 6B *100/ dénominateur

Dénominateur : 7A Conditions : Réponse pour 6B et 7A

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

9

5.2.2. Fréquence de dépistage de MRSA en cours d’hospitalisation

- Les 14 hôpitaux chroniques déclaraient réaliser des dépistages en cours d’hospitalisation : 12/14 (86%) hôpitaux le faisaient en situation épidémique, 3/14 (21%) dans certains services (Gériatrie) et 9/14 (64%) en fonction du risque du patient. Trois hôpitaux ont fourni les données nécessaires à quantifier la pratique du dépistage en cours d’hospitalisation au sein de l’hôpital. Parmi les patients admis (2700) au cours de l’année 2009 dans ces hôpitaux, 802 patients (6D) ont été dépistés pour la recherche de MRSA en cours d’hospitalisation (> 48h. après l’admission), c’est à dire 29.7/100 patients admis (tableau 4).

Tableau 4 : Proportion de patients admis avec un dépistage de MRSA en cours d’hospitalisation, année 2009

Nombre hôpitaux

Valeurs

absolues

Proportion moyenne de patients ayant subi dépistage/ 100 admissions

Distribution des proportions

Moyenne des prop.

25% 50% médiane

75% Min/Max

Belgique 3 802/2700 29.7 42.5 0.42 17.4 109.7 0.42 – 109.7

Parmi ces 802 patients (6D), 8975 prélèvements (6C) ont été effectués : en moyenne 11.2 prélèvements par patient (min. 3 – max. 13).

Rubriques et calcul: 6C, 6D 6D *100/ dénominateur

Dénominateur : 7A Conditions : Réponse pour 6D et 7A

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

10

6. CONCLUSIONS

Afin de permettre une plus grande stabilité des taux et incidences, nous avons réalisé ce rapport pour les 15 hôpitaux chroniques sur l’ensemble des données pour l’année 2009. Lorsqu’on compare le taux de résistance des hôpitaux chroniques à celui des aigus (2009/2) on constate que ce taux est nettement plus élevé (39.5% versus 21.7%) et qu’il se rapproche du taux observé en maison de repos et de soins (étude nationale de la prévalence du portage de MRSA en MR/MRS, 2005 : 37.8%). L’incidence de MRSA présent à l’admission était de 0.60 cas par 1000 journées d’hospitalisation en chronique et de 1.06 cas/1000 en aigu (2009/2). L’incidence de MRSA acquis à l’hôpital était fort comparable entre les deux types d’établissements à condition de prendre comme dénominateur le nombre de journées d’hospitalisation au lieu du nombre d’admissions: en chronique : 0.20 cas de n-MRSA/1000 journées d’hospitalisation, en aigu (2009/2) : 0.18 cas/ 1000 journées d’hospitalisation. La proportion de MRSA nosocomial (3A) parmi l’ensemble des souches de MRSA (1A) était identique : 38.4% en chronique et 31.5 % en aigu (2009/2). La proportion de souches de n-MRSA en provenance d’hémocultures était plus petite en chronique (2.7%) qu’en aigu (10.4%) et peut sans doute s’expliquer par la faible utilisation de cathéters vasculaires en chronique. Aussi dans les pratiques de dépistage, de grandes similitudes ont été répertoriées, Tout comme en aigu, le dépistage à l’admission en chronique est guidé par l’origine et par le risque du patient. Le nombre d’hôpitaux chroniques pouvant livrer des données pour le calcul de l’intensité et de la fréquence du dépistage à l’admission et en cours de séjour est encore trop petit pour pouvoir en tirer des conclusions, mais il apparaît déjà que la pratique du dépistage y est beaucoup plus fréquente et intensif qu’en hôpital aigu.

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

11

7. EVOLUTION DES TAUX ET INCIDENCES

Les taux de résistance Figure 2 : Evolution du taux de résistance moyen : 2007 - 2009

Figure 3 : Evolution des médianes des résistances : 2007 - 2009

26,7

37,939,5

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

2007/2 2008 2009

% M

RSA

/ S.

aure

us

31,4

48,4

38

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

2007/2 2008 2009

me

dia

ne

s d

es

rési

stan

ces

(%)

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Surveillance de MRSA dans les hôpitaux chroniques belges : année 2009

12

L’incidence de MRSA nosocomial Figure 4 : Evolution de l’incidence moyenne globale de MRSA nosocomial (par 1000 journées d’hosp.): 2007 - 2009

Figure 5 : Evolution des médianes des incidences de n-MRSA : 2007 - 2009

Proportion de n-MRSA/MRSA total Figure 6 : Evolution de la proportion de MRSA acquis à l'hôpital (échantillons cliniques uniquement): 2007 - 2009

0,240,26

0,20

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

2007/2 2008 2009

n-M

RSA

/10

00

jou

rn.-

Ho

sp.

0,260,28

0,39

0

0,05

0,1

0,15

0,2

0,25

0,3

0,35

0,4

2007/2 2008 2009

me

dia

ne

s d

es

inci

de

nce

s

29,5

38,4 38,4

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

2007/2 2008 2009

n-M

RSA

/MR

SA t

ota

l (%

)