Les rotavirus : autre virus de gastro-entérites chez l’Homme

• F : Reoviridae– G : Rotavirus, Reovirus, Orbivirus

(bluetongue), Phytoréovirus (riz)– Le genre Rotavirus comprend des virus

humains et animaux– Chez l’homme, il provoque des gastro-entérites– Agent étiologique majeur des diarrhées sévères

chez le jeune enfant : 30 à 50 % des hospitalisations infantiles pour cause de DA

– 1000.000 décès / an dans monde (enfants)

Organisation et structure

• Virus non enveloppée ; capside icosahédrale formée de 3 couches protéiques (1000 A° )– très résistant dans l’environnement

• Génome ARN double brin segmenté (10 à 12 segments)

• Rotavirus humain : 11 segments = 12 protéines (6 structurales + 6 NS)

• système propre de réplication/transcription

Capside : structure et fonction• Capside double couche ou monocouche non

infectieuses : les 3 couches sont nécessaires

• Couche externe : 260 trimères VP7 (gp 38 kD) + 120 copies VP4 (88 kD) spicules dimériques

• 132 canaux ioniques traversent les 2 couchent externes

Capside : couche externe

• VP 4 : interaction avec la cellule hôte

– Attachement – pénétration – hémagglutination – neutralisation et virulence

• Clivage protéolytique de VP4 augmente son infectiosité et son entrée (ex virus trypsiné)

Couche externe

• VP 4 VP8 (28 kD 247 aa) et VP5 (60 kD aa 248-776) : restent associés dans le virion

• Fusion par VP4 à la cellule clivage : internalisation (?) mécanisme mal connu

Capside – VP4 très flexible

• Chez les rotavirus animaux, VP8 interagit avec les acides sialiques mbr, VP5 avec les intégrines

• Chez le rotavirus humain, VP5 induit l’entrée du virus – sialic indépendant entrée apicale ou baso-latérale des entérocytes

• Si Sialic dépendant : induit une conformation favorable à l’action de VP5

Capside – VP7 et DLP• VP 7 rôle dans la décapsidation : influencé

par de faible [Ca] iC : dissocie VP7 trimers => décapsidation libère les DLP active

• DLP : la transcription à lieu dedans

DLP

• Formée de VP6 (260 trimères - externe interaction VP7/VP4) et de VP2 (interne)

• DLP nécessaire et suffisante pour transcrire en ARNm – transcription endogène à DLP

DLP Transcription

• VP6 assure la structure de DLP pour y assurer la transcription endogène (intra DLP) et VP2 rôle dans la transcription

• Blocage de VP6 par Atc ou VP7 : courts ARNm donc conformation stricte VP6-VP2 nécessaire pour des transcrits complets

Capside « interne » VP1 2 3

• VP2 la plus abondante (60 dimères) : interaction avec VP6 et RNA génomique

– Auto-assemblage en ‘mini’ capside VP1 enzyme RNA pol RNA dép

• VP3 enzyme guanylyl méthyl transférase

Capside interne

• InteractionVP2/RNAg/VP1-3 : transcription

• mRNA 5’ Cap 3’consensus (pas de poly A)

• mRNA libérés par des canaux DLP

Organisation génomique

• 11 segments de 660 – 3300 bp

• Total 18.5 kbp

• Chaque segment a une interaction symétrique avec VP2

génome

• Influence du pH dans la structure de l’ARNg et son interaction avec VP2 : pH élevé : affecte le complexe (déprotonation de VP2) condensation de l’ARN isométrique (au centre de la particule)

Réplication et encapsidation

• Réplication concomitante avec la transcription DANS la DLP

• Organisation en viroplasmes

• Comment la capside englobe le bon set de segments ????– Rôle des NSP

NSP 3

• NSP 3 protéine basique 63 kD, dimère : domaine Nt interagit avec la séquence 3’ des ARNm

• Domaine Ct fixe eIF4G – traduction

• Protège l’ARNm

NSP 2 – NSP 5

• NSP2 et 5 impliquées dans la réplication et l’encapsidation

• Présentes dans les viroplasmes• NSP2 : NTPase, RNA-binding et hélicase• Fournit l’énergie (hydrolyse NTP) pour

l’encapsidation• NSP5 : protéine acide, interaction avec les

domaines basiques de NSP2 (?)

NSP

• NSP5 : rôle de régulation de l’interaction NSP2/ARN pendant la réplication et l’encapsidation

• NSP 4 , gp, aurait un rôle dans la régulation de la [Ca2+] intra C : entérotoxine