Etude des paramètres génétiques affectant le

rendement laitier en 180 jours, le TDY et la durée de lactation en

Espagne chez le mouton de race Assaf

Le groupe 42

Benjamin Dufour Bertrand Mattart Aurélien Evrard

• Objectif de l’étude : estimer l’importance des paramètres génétiques affectant le TDY, le rendement laitier standardisé sur 180 jours et la durée de lactation dans un plan de sélection de la race Assaf.

• Pour cela 42197 TDY et 7654 lactations de 3854 brebis Assafs espagnoles furent analysés utilisant des modèles univariants et mutivariants.

Introduction

• La race Assaf : Historique et caractéristiques

Créée en Israël en 1955 Issue du croisement de

l’East Friesian et de la race Awassi

Ont été introduits pour la première fois en Espagne en 1977

Estimation des paramètres génétiques pour la production laitière établie sur 180 jours,

la production laitière quotidienne,la durée de lactation

Matériel et méthodes

• On a utilisé la bande de donnée de la coopérative Castellana de Ganaderos.

• Les traites des brebis sont rapportées 2x par jour.• L’étude s’est portée sur 19 troupeaux obtenus par

insémination artificielle, localisés dans la région de Madrid et dans le nord castillan

• Chaque troupeau contenait en moyenne 500 têtes.• Dans la base de données initiales, après retrait des cas

ambigus, nous avions 7654 lactations de 3854 individus.

Matériel et méthodes

• On a obtenu 6 enregistrements d’un jour chacun par lactation.

• Le test a été mené selon un plan d’enregistrement matin et soir ( am-pm ) à des intervals mensuels commençant 3 jours post-sevrage, la période d’allaitement étant de 6 semaines.

Résumé des enregistrements d’analyseDonnées MY180 TDY LL

Nombre d’enregistrements 7654 42197 7654

Animaux avec enregistrements

3854 3854 3854

Nombre de béliers 170 170 170

Nombre de mères sans enregistrement

147 147 147

Nombre de mères avec enregistrement

1593 1593 1593

Nombre total d’animaux 4491 4491 4491

Béliers avec progéniture dans les données

165 165 165

Brebis avec progéniture dans les données

1714 1714 1714

Brebis avec enregistrement et progéniture

1593 1593 1593

Troupeaux 19 19 19

Mois 12 12 12

Années 10 10 10

Moyenne 431.6 1660.5 199.5

Déviation standard 164.4 1044.1 27.1

Présentation des modèles utilisés

• Modèle 1 : Modèle univariant incluant - l’effet génétique additif

- l’environnement permanent de l’animal

- l’effet résiduel

avec l’effet génétique additif, étant le seul effet aléatoire dépendant de la matrice.

Présentation des modèles utilisés

• Modèle 2 : Modèle multivariant Ici, les 3 caractères de production sont analysés;

incluant l’effet génétique additif, l’effet environnemental permanent et l’effet résiduel, ceux-ci étant choisis de manière aléatoire.

Héritabilité obtenue selon les différents modèles.

LL MY180 TDY

Modèle 1 h 0,048 0,131 0,099

c 0,006 0,099 0,27

Modèle 2 h 0,055 0,177 0,106

c 0,049 0,417 0,28

1 2 3

2

2

2

2

1 Durée de lactation

2 Production laitière sur 180 jours

3 Test day yield

Résultats et discussion

• Valeur moyenne pour la production de lait (180j) = 431,6 kg

• Valeur moyenne pour la durée de lactation = 199,5 jours• Valeur moyenne pour la TDY = 1660,5 mg• L’estimation de l’héritabilité montre les mêmes

résultats indifféremment du modèle utilisé.• La production de lait en kg(180j) a la plus grande

héritabilité alors que la durée de lactation a la plus basse.

• Les chiffres moyens de production laitière de l’Assaf sont considérablement supérieurs que ceux rapporté des brebis laitières espagnoles.

• La race Assaf a une lactation plus longue que les races natives espagnoles,180 jours pour 12O jours.

• La plus longue durée de lactation n’est pas la seule explication d’un rendement laitier supérieur chez les Assaf,il a aussi un plus grand TDY moyen par rapport aux races espagnoles.

• Une plus longue persistance de la lactation est l’intérêt majeur des Assaf et de ce fait explique sa propagation en Espagne.

Héritabilité du rendement laitier• L’héritabilité pour le rendement laitier total chez les brebis

espagnoles est habituellement plus élevé que celle reporté ici pour les Assafs

• L’héritabilité pour le rendement laitier standardisé reporté dans la littérature pour les brebis laitières non-espagnoles(Lacaune ou Sarda) est aussi plus élevé.

• Portolano trouva, chez les Barbaresca siciliana, une héritabilité toujours comprises entre 0,14 et 0,15 pour le rendement laitier standardisé pour différentes durées de lactations.

• Nikolau ,lui, l’estima l’héritabilité du rendement laitier total chez les Lesbos entre 0,16 et 0,20.

• L’estimation de l’héritabilité du TDY est rarement reportée chez le mouton, la plupart varie de 0,14 à 0,35, càd plus élevée que celle estimée chez les Assaf.

Héritabilité de la durée de lactation

• L’estimation de l’héritabilité de la durée de lactation est assez rare dans la littérature, elle varie de 0,015 pour la race Chura (El-Saied) à 0,128 pour les meilleures Awassi et 0,147 pour les Barbaresca sciliana (Portolano).

• El-Saied obtint ses résultats avec un seul troupeau de Churra et conclu que c’était plus des facteurs d’origine non génétique qui influençaient la durée de lactation.

• Portolano obtint ses résultats sur 44 troupeaux de Barbaresca siciliana montrant une large variation phénotypique pour la durée de lactation.

• L’estimation de l’héritabilité dans ce travail qui est approximativement de 5%(0,05) met l’accent sur le fait que la variabilité génétique pour la durée de lactation chez l’Assaf est plus grande que chez les brebis espagnoles.

Héritabilité de la durée de lactation

• Les valeurs maximales n’ont pas été prises en comptes ce qui a diminué la variabilité du caractère durée de lactation (cfr règles espagnoles).

Effet de l’environnement permanent

• Les estimations de l’effet environnemental permanent (c²) montre de grandes variations suivant le modèle utilisé, sauf pour TDY qui ne varie pas quelque soit le modèle.

• Les valeurs de c² pour MY et LL sont plus grandes quand le modèle 2 est utilisé.

Corrélation génétique

LL-MY180 LL-TDY TDY-MY180

rg 0,825 0,792 0,999

re 0,932 0,940 0,999

rp 0,215 0,185 0,509

rg: corrélation génétique

re: corrélation du à l’environnent permanent

rp: corrélation du au phénotype

Corrélation génétique• La corrélations génétiques obtient toujours de hautes valeurs allant

de 0,792 pour LL-TDY et 0,999 pour MY180-TDY.

• Les corrélations entre les effets de l’environnement permanent sont plus hautes allant de 0,932 pour LL-MY et 0,999 pour MY-TDY.

• Aucune corrélation génétique n’ont été publiées entre le rendement laitier standardisé et TDY chez le mouton. Cependant il en existe chez les bovins laitiers (0,77 à 1).

• Des estimations publiées de la corrélation génétique entre LL et MY sont rares mais toujours élevées et positives comme celles rapportées ici pour l’Assaf (0,64 pour B. siciliana et 0,555 pour l’awassi).

• Les corrélations génétiques et de l’environnement permanent sont plus ou moins les mêmes pour les trois caractères étudiés.

Conclusion• Avec tous ces résultats, nous pouvons maintenant décider oui ou non

de la mise en place d’un plan de sélection sur le caractère laitier de la race Assaf.

• L’héritabilité estimée ici pour les trois caractères analysés est basse ce qui limite la possibilité de sélection.

• La faible héritabilité pour le caractère lactation a aussi été rapportée pour le rendement laitier standardisé chez les Awassi(un des deux parents de l’Assaf) et l’Assaf en Israël.

• Pollot et Gootwine soutiennent que les faibles variations génétiques additives et la faible héritabilité pour le rendement laitier mais les grands effets de l’environnement permanent (qui doivent être du en partie à la dominance et à l’épistasie), peuvent être le reflet que la haute production laitière en Israël chez les Assaf est peut être du aux effets génétique non additifs. Ceci peut être une explication du scénario de cette étude .

Conclusion

• Une explication moins élaborée peut être aussi considérée; le schéma d’enregistrement laitier de Castellana de Ganaderos a été récemment fondé et la généalogie disponible est superficielle donc limite les possibilités d’une séparation correcte de l’additivité et de l’effet permanent de l’environnement.

• La faible héritabilité trouvée dans cette étude peut être due aussi a des effets environnementaux négligés dans le modèle tel que le nombre d’agneaux au pis avant le sevrage ou la date des test day et son interaction avec le troupeau.

Conclusion

• L’estimation de c² pour TDY est plus conforme que pour les autres caractères donc suggère que le breeding value estimée pour ce caractère peut être plus fiable.

• Jensen résume dans un travail les avantages de l’utilisation des TDY au contraire des MY pour l’évaluation génétique dans le programme laitier, car il justifie mieux les effets environnementaux de chaque test day.

Bibliographie

• Gutierrez, J.P., Legaz, E.,Goyache,F., 2006, Genetic parameters affecting 180 days standarised milk yield, test day milk yield and lactation length in spanish assaf dairy sheep. Small ruminant research 3097.

• http://www.sheep101.info/breedsA.html