du bon usage du laboratoireaaap13.fr/asso/dc/mv/mv2p.pdf · 2018-12-07 · du bon usage du...

Du Bon Usage

du Laboratoire

Pathologie d’Importation

GARNOTEL Eric

Service de Biologie

HIA Laveran

Marseille

Limites :

pathologies spécifiquement tropicales

infectieuses

diagnostic au laboratoire

Contexte anamnestique :

pays, lieu, durée, dates

contexte épidémiologique

exposition à un risque

Prophylaxie chimioprophylaxie

vaccinations

Clinique

Démarche

Prédéfinir les agents pathogènes potentiels

« On ne trouve que ce que l ’on cherche »

Syndromes :

fièvre

splénomégalie

ADP…..

Diagnostic biologique

Eléments d’orientation : non spécifiques

numération formule

syndrome inflammatoire

Diagnostic de présomption

Diagnostic de certitude :

mise en évidence directe de l’agent infectieux

Valeur d ’orientation de l ’hémogramme

hyperleucocytose à PNN

leucopénie

anémie

amibiase, leptospirose

paludisme, typhoïde, leishmaniose,

viroses (arboviroses)

paludisme, leishmaniose

thrombopénie

hyperéosinophilie

syndrome mononucléosique

paludisme, dengue , leishmaniose

bilharziose, distomatose, trichinose,

toxocarose, phase invasion helminthes

VIH, hépatite virale

Syndrome inflammatoire

VS, CRP, électrophorèse des protéines…..

Leishmaniose viscérale

Trypanosomiase

Fièvre et splénomégalie

Paludisme

Fièvre typhoïde

Brucellose

Borréliose

Leishmaniose viscérale

Trypanosomiase

Diagnostic du Paludisme

Diagnostic du Paludisme

Frottis sanguin : diagnostic d ’espèce

parasitémie

S de 100 HP / µl

Goutte épaisse : temps de réalisation

S de 1 HP / µl

QBC : 5 mn

S de 0,5 HP / µl

HRP2 : diagnostic de P falciparum

faux négatifs

Biologie moléculaire

Valeur des Tests : Se et Sp

Expérience du Biologiste

référence

Tests de diagnostic rapide

Quantified Buffy Coat

PCR

PCR classique

PCR en temps réel

•Se PCR = Se QBC

•Faux + et faux-

•Disponibilité

Fièvre typhoïde et fièvres paratyphoïdes

Taux d’incidence des fièvres typhoïde et paratyphoïdes dans le monde

21M de cas/an Létalité de 1 à 4% 216-600 000 décès

Asie 13M

Fièvre typhoïde et fièvres paratyphoïdes

Ac anti O

Ac anti H

J0 J8 J12

Hémocultures

Coprocultures

Widal et Felix

1/800

1/1600

1/400

Spécificité :

Vaccin TAB

Co aggl T B

faux +

Brucellose

Rose bengale Ig G 80% 90% qualitative

Wright IgM 60% 90% 10 - 12 ième j

négativation rapide

faux-

faux+ (Yersinia, Vibrio)

fixation du Cpt IgG 60% 95% stade tardif

IFI Ig GMA 90% 95-100%précoce et tardif

Hémocultures : bactérie à croissance difficile

phase aiguë

Autres localisations

Action sur l ’immunité spécifique

CPAg CD4

IL 2

IFN

IL 4-5

10-13

CD4 Th1 CD4 Th2

Facteurs : espèce

inoculum

réponse de l ’hôte

inf concomitante

LV

LCD LC

Leishmaniose viscérale ou cutanée

Leishmaniose viscérale ou cutanée

Orientation : anamnèse

VS

pancytopénie

protidogramme

Présomption : sérologie IFI

ELISA, HA,….

Certitude : prélèvements moelle, ADP, foie, peau

examen direct

culture

biologie moléculaire

LV

Peau Moelle

Peau

(ana path)

Diagnostic biologique (3)

Diagnostic indirect :

problème des VAT

IFI ELISA aggl. en µplaque (T.b r)

HAI CATT

Trypanosomiase

Diagnostic direct :

adénopathie sang suc dermique LCR

état frais (mobilité), coloration (MGG)

techniques de concentration :goutte épaisse QBC

diagnostic de phase

Fièvre et adénopathies

Primo infection VIH

Viroses (EBV, CMV….)

Dengue (arboviroses)

Tuberculose

Primo-infection VIH

Ag p24-25 Ac anti VIH

ARN viral

15 jours

Sérologie : évolution des tests (sous-type O, Ag p24)

2 ELISA confirmés par Western Blot

ELISA Combo : Ac et Ag p24

Primo-infection VIH

Confirmation sur le premier prélèvement

Western blot

GP160

GP120

P24

P18

GP41

P68

Dengue et autres arboviroses

Culture virale :

EDTA

couche leucocytaire

Sérologie : ELISA

Ig M

Ig G

Laboratoires spécialisés +/-

Réactions sérologiques croisées

Fièvre et ictère

Paludisme

Hépatites virales A

B – D

E

C

Leptospirose

0-9 10-19 20-29 30-39 40-49 +50ans

Séroprévalence VHA %

Afrique - Asie

Pourtour méditérranéen

Europe - EU

Pays nordiques

100%

50%

IgM

Ig totaux

Ictère

Transaminases

Diagnostic

Hépatite A

Ag HBs

Ac anti HBs

Ac anti HBc totaux

Ac anti HBc IgM

Ac anti HBe Ag HBe

ADN viral

Phase symptomatique

Cinétique des marqueurs Hépatite B

4-12 sem 1-2 sem 2 sem-3 mois

Ag delta IgM IgG

1 - 4 sem

2 - 5 sem

Cinétique des marqueurs de l ’hépatite D

RT PCR

VHE

Epidémies du passé

1915 : Epidémie de la

« Campagne de Mésopotamie »

Troupes britanniques

Troupes indiennes

Hépatite E

VHE

Aujourd’hui

New Dehli (1955)

•crue de la rivière Yamunâ

•29 300 cas d’hépatites ictériques

Inde : 50% des hépatites aiguës de l’adulte

20 à 30% des hépatites aiguës de l’enfant

Monde : nombreux cas sporadiques

Cycle du VHE

Zoonose Rôle du porc?

•VHE : 71% des porcs au Japon

•Transmission inter-espèce

•Souches humaines ou animales

proches ou identiques

Eau

Aliments

Contact direct (0,7-2,2%)

Autres

Inde

1955 : 29 300

1975 : 2 600

1978 : 274

1990 : 79 000

Népal

1973 : 10 000

1981 : 6 000

1995 : 692

Pakistan

1987 : 133

1993 : 3 800

Birmanie

1976 : 20 000

1982 : 400

Bornéo

1987 : 2 000

Chine

1986 : 119 000

Algérie : 788

RCI : 623

Tchad : 38

Soudan : 2000

Somalie : 2000

Ethiopie : 423

Djibouti : 111

Aspects épidémiologiques du VHE

Epidémies ou VHE>25%

des hépatites non A non B

Souches de VHE isolée

Sources CDC

Okamoto, Virus Research, 127 (2007)

Ig G

Ig M

Ictère

Sang Selles

ARN VHE

15-50j

Grandes épidémies - cas sporadiques

Inde - Asie - Afrique

Mortalité 1 - 2%

Diagnostic de l’infection par le VHE

Hépatite C

Importance épidémiologique

Mode transmission

Variabilité des transaminases

Asymptomatique dans 75% des cas

2 tests ELISA de 3 ième génération

RT PCR qualitative

Génotypage

Leptospirose

Diagnostic direct :

hémoculture (période septicémique, 10-12 j)

LCR

(urine)

Sérologie (15iéme jour) :

dépistage (macroaggl Ag TR, HA …)

confirmation (Martin et Pettit, micro aggl)

>20 sérovars

seuil 1/800 ou 2 dilutions sur 2 sérums

Hépato-néphrite

Fièvre et image hépatique

Amibiase hépatique

Kyste hydatique

Abcès à pyogènes

Amibiase hépatique

Examens morphologiques

Sérologies : diagnostic et suivi du traitement

IFI : très Se et Sp >1/200

titres très élevés

précoce, suivi du TTT

HA : GR sensibilisés >1/128

persistance des Ac

Kyste hydatique

Pas de ponction

Sérologie : foie>poumon

HAI Se 89%

>1/320

IFI Se 96%

>1/100

IEF : spécificité

ELISA

diagnostic et suivi du traitement

Fièvre et hyperéosinophilie

Bilharziose

Distomatose

Trichinose

Anguillulose

Bilharziose

Sérologies:

IF : coupe de foie de souris

Se (seuil 1/10)

précoce (Ig M)

suivi du traitement

HA : seuil 1/64

précoce

immuno-électrophorèse : confirmation

(arc 4 et 8)

Distomatose

Sérologie : + à la phase d ’invasion

IF (sur coupe de F hepatica) :

seuil 1/20, Se 95%

moins Sp (bilharziose, filariose)

HA : 1/320, Se 90%

ELISA : Se et Sp

Immuno-électrophorèse : Sp

(arc 2 spécifique de F hepatica)

Trichinose

CPK

hyperéosinophilie

Mise en évidence du parasite : biopsie musculaire

Sérologie : IF

50% + à 3sem 95% à 8 sem

ELISA

Anguillulose

Infestation massive

Examen parasitologique des selles après 1 semaine:

méthodes de concentration spécifiques

répétition des examens

Diarrhées

Shigelles

Salmonelles

Campylobacter

Aeromonas-Plesiomonas

Yersinia+/-

Amibiase

Virale

Paludisme (enfant)

Examen cyto bactériologique des selles : faible rendement

Pathovar d’Escherichia coli non recherchés

Nécessaire car risque Shigella et résistance aux AB

Réalisé 1 fois, spécifier le pays visité

Examen parasitologique des selles : cas particulier des amibes

1 prélèvement pour les protozoaires

3 prélèvements à quelques jours d’intervalles pour

les métazoaires : élimination intermittante

Méthodes de concentration

Conclusion

Diagnostic des Pathologies d’importation :

parfois spécialisée

Prendre en compte

•les VPP et VPN des examens biologiques

•l’expérience des laboratoires