Travail paraclinique de génétique 2eme doc

BESSE Mélanie

DEWAIDE Frédérique

HERVEY Audrey

Objectifs

Analyse mixte à 2 variables pour étudier la relation entre le poids corporel et les indicateurs d’ascite chez les poulets de chair.

Pourquoi ?

Ascite = source de pertes sévères dans les poulaillers (1 billion $/an !!!)

Plan

• Symptômes de l’ascite• Matériel• Méthodes• Résultats• Conclusions de l’article• Critiques• Notre conclusion• Bibliographie

Symptômes de l’ascite

• 1er signe clinique : hypoxie car la demande en 02 est augmentée et dépasse la capacité pulmonaire

hypertension pulmonaire + hypertrophie du ventricule droit et de la valvule auriculo-ventriculaire droite

• Changement hématologique : de l’hématocrite et de la viscosité sanguine

Matériel

• Paramètres d’ascite :

HCT = valeur d’hématocrite RV:TV = rapport poids ventricule droit sur poids total du ventricule LIV = Couleur et surface du foie HRT= accumulation de liquide dans la cavité cardiaque ABD = accumulation de liquide dans la cavité abdominale

Matériel

• Animaux : Poulets de chair de race White Plymouth Rock

Utilisation de la 3eme génération issue du croisement suivant :– Femelle de haute performance reproductive et

à plumage solide– Mâle à croissance rapide et plumage tardif

Matériel

• Conditions d’élevage des animaux:

2,98kcal/kg avec 21% de protéine

23h/j de lumière artificielle

20 animaux/m2

• 2 groupes sont constitués:

Groupe 1 (4202) : naissance=30° jusqu’à 10° à 22j10° jusqu’à 35j (abattage)

Groupe 2 (795) : naissance=34° jusqu’à 18° à 35j18°jusqu’à 49j (abattage)

Matériel

• Modèle mixte bivariable:

Utilisé pour séparer les populations hétérogènes en les assignant à une distribution quand les paramètres seuls ne permettent pas de classer les individus.

Matériel

• µ1,1 et σ1,1 : moyenne et déviation standard du premier indicateur dans la distribution 1

• µ1,2 et σ1,2 : moyenne et déviation standard du second indicateur dans la distribution 1

• P : Fréquence des oiseaux de la distribution 1

• ρ1 : corrélation entre les indicateurs dans la distribution 1

• modèle

Méthode

• Mesures avant abattage : BW HCT

• Mesures après abattage : – RV:TV– LIV– HRT grade : 0(normal), 1, 2(pathologique++)

– ABD}

Résultats

1. Mesure des moyennes et déviations standard pour les différents paramètres d’ascite en condition froide et normale.

Moyennes HCT et RV:TV > et moy BW < en conditions froides (pas significatif pour les autres paramètres)

Déviation standard > en conditions froidespopulation plus hétérogène

Résultats

• Les distributions en conditions froides sont plus étalées. Hypothèse : ce groupe 1 est un mélange de sous populations aux caractéristiques différentes

Conditions froides

Résultats2. Application du modèle mixte bivariable aux

paramètres HCT et RV:TV en conditions froides Sur le graphique ainsi obtenu le score des autres indicateurs (HRT,

LIV, ABD) sont ajoutés

2 sous groupes de poulets apparaissent:- Poulets sans ascite: petites valeurs HCT et RV:TV et pas de signes sévères d’ascite (HRT=1) - Poulets avec ascite: hautes valeurs HCT et RV:TV et signes significatifs d’ascite

Résultats3. Mesure moyenne et écart standard des paramètres d’ascite

dans les 2 sous populations en conditions froides et applications du modèle mixte bivariable

Résultats

• La fréquence estimée des oiseaux ascites P < à 1 preuve d’un mélange de 2 distributions dans les conditions froides.

• Groupe des poulets ascites:Moyenne RV:TV HCT > Corrélation HCT RV:TV positive Corrélation BW RV:TV et BW HCT negative

• Groupe des poulets sans ascite: Corrélation proche de 0

Résultats

4. Mesures de corrélations en conditions froides et normales

Corrélations BW RV:TV et HCT ainsi que HCT RV:TV du groupe au froid > s’explique par une forte corrélation chez les poulets ascites de ce groupe

Conclusion de l’article

• Une corrélation entre le poids (BW) et les paramètres d’ascite (RV:TV et HCT) n’est significative que dans la sous population de poulets avec ascite en condition froide.Cette corrélation est négative.

Croissance moins importante des poulets à RV:TV et HCT élevés donc de ceux atteints d’ascite

• La corrélation totale entre le poids (BW) et les paramètres d’ascite (RV:TV et HCT) dans le groupe au froid est dépendante de la fréquence d’ascite dans ce groupe.

Critiques

• Dans les groupes 1 et 2 : - taille de groupes et date d’abattage différentes - temps d’exposition aux conditions différent

• Dans les sous populations, au froid :- les indicateurs d’ascite ne sont pas tous mesurés sur les mêmes individus - nombre d’individus ascite/sans ascite pris en compte pour l’analyse statistique ???

• Poulets au score HRT=1 considéré comme non ascite !?

Critiques

• Littérature précédente : corrélation entre BW et Ascite positiveLes poulets à croissance rapide ont plus tendance à développer de l’ascite lié à un plus fort déséquilibre entre le besoin et l’apport en O2.

• Présente étude : corrélation entre BW et Paramètres d’ascite négative en conditions froides!!!

Ces conditions stressantes la conso d’O2 (lutte contre le froid) et l’immunité affaiblissement des poulets (moyenne des poids < en conditions froides)Les poulets les plus faibles seront plus sensible à l’ascite.

Critiques

• Présente étude :pas de corrélation entre BW et Paramètres d’ascite en condition normale d’élevage !!!

- Ne travail pas sur des poulets à croissance rapide mais sur un croisement

- taille de groupe insuffisante (795)

Notre conclusion

• Dans les conditions normales d’élevage, les températures sont maintenues strictement au dessus de 22°C.

• L’existence d’une corrélation entre le BW et les indicateurs d’ascite à 10°C n’a pas d’intérêt en élevage industriel.

• Une corrélation en condition normale d’élevage aurait présentée un intérêt en sélection génétique des poulets.

Bibliographie

ZEREHDARAN S., VAN GREVEHOF E.M., VAN DER WAAIJ E.H., BOVENHUIS H. 2006. A bivariate mixture model analysis of body weight and ascites traits in broilers. Poultry Science 85:32-38