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  • couvertureSous-marin habit Nautile en plonge au large de Toulon en 2007 Ifremer / O. Dugornay

    4e de couvertureLac de saumure en mer Mditerrane Ifremer-Victor 6000 / Campagne Medeco 2007

    Dans le cadre de son projet interne co-responsable, lIfremer a confi limpression de ce rapport limprimerieCaractre, entreprise certifie ISO 14 001. Ce document est imprim avec des encres base dhuile vgtale

    sur du papier issu de forts gres durablement PEFC.

  • Prparation la mise leau du robot tlopr Victor 6000pendant la campagne Momareto 2006 (Dorsale mdio-Atlantique) Ifremer / M. Gouillou

  • Banc de thons albacores Thunnus albacares pris au pigedans une senne au large des Seychelles (Ocan Indien)

    Ifremer / M. Taquet

  • Troque-jujube Calliostoma zizyphinnumet anmones perles Corynactis viridis (Bretagne) Ifremer / O. Dugornay

  • Polypes Parazoanthus axinellae au large de Marseille Ifremer / V. Baty

  • Prise de vue sous-marine par un plongeur, pour ltude des bivalves, pour le projet Rebent (Bretagne) Ifremer / O. Dugornay

  • Poulpe qui se gonfle au contact de la pince du sous-marin habit Cyana (au large de la Nouvelle-Caldonie)

    Ifremer-Cyana / Campagne Calsub 1989

  • ponge carnivore Chondrocladia lampadiglobusdresse sur son pdoncule (Ocan Pacifique) Ifremer-Cyana / Campagne Geocyarise 1984

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    Groupe de petites srioles Seriola lalandiau large des Seychelles (Ocan Indien)

    Ifremer / M. Taquet

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    Platax longues nageoires Platax teiraau large des Seychelles (Ocan Indien) Ifremer / M. Taquet

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    Gros plan sur la bouche dun oursinSphaerechinus granularis en rade de Brest

    Ifremer / O. Dugornay

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    Mollusque Lobiger serradifalciet sa ponte sur des algues vertes en mer Mditerrane Ifremer / O. Dugornay

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    Prlvement sur un fumeur noir actif avec la pincedu robot tlopr Victor 6000 (Dorsale mdio-Atlantique)

    Ifremer-Victor 6000 / Campagne Serpentine 2007

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    Paralllement, lIfremer a renforc ses partenariats, tant conomiques (par exemple dans le cadre des ples de comptitivit mer, o nous participons la moiti des projets financs), que scientifiques (avec notamment la participation au GIS Europle Mer), tandis que le taux lev de russite aux appels doffres du 7e PCRD confirmait la place de nos quipes dans lespace europen des sciences marines.

    En Mditerrane, ladoption, Toulon, la faveur dun colloque associant, linitiative de lIfremer, les reprsentants de 35 universits et organismes de recherche provenant de 12 pays des deux rives de la Mditerrane, dune dclaration commune pour dvelopper des programmes de recherches en commun, va contribuer donner aux sciences marines la place quelles mritent dans cet espace gographique.

    Paralllement, en simpliquant dans les travaux et les suites du Grenelle de lenvironnement, lIfremer a confirm sa vocation dans la protection du milieu marin, quillustre aussi laccord que nous avons sign avec lagence des aires marines protges ou notre rle dans la mise en uvre de la directive-cadre sur leau et la stratgie du milieu marin. Cette volution se confirme galement outre-mer o, ct des activits traditionnelles daquaculture, les questions lies lenvironnement littoral et la biodiversit prennent dsormais une place croissante, par exemple en Nouvelle-Caldonie et aux Antilles.

    Enfin, lInstitut a vrifi, la faveur dun sminaire tenu Brest, quil tait globalement en ligne avec les objectifs de son contrat quadriennal qui sachve en 2008.

    Ainsi, lIfremer aborde-t-il avec confiance lhorizon de sa dmarche stratgique, qui doit conduire, en 2008, la prparation pour 2009-2012, dun nouveau cadre contractuel entre ltat et ltablissement.

    Jean-Yves PerrotPrsident-Directeur gnral de lIfremer

    Lanne 2007 aura t marque pour lIfremer par dimportantes avances scientifiques et technologiques qui ont concern, des titres divers, lensemble des grands domaines dactivits de ltablissement.

    Ainsi en est-il dans le domaine des gosciences, avec la dcouverte, la faveur de la campagne Serpentine, du site hydrothermal le plus profond actuellement connu au monde, ainsi que de la mise jour du flux dhydrogne naturel le plus important jamais rencontr.

    De mme, les quipes en charge de locanographie oprationnelle ont contribu activement atteindre, en novembre 2007, lobjectif du programme Argo, qui permet de disposer, pour la premire fois, dun rseau de 3000 flotteurs mesurant en continu, sur lensemble des ocans du monde, la temprature et la salinit depuis la surface jusqu 2000 mtres de profondeur. La comprhension du rle de locan dans lvolution du climat va sen trouver considrablement enrichie.

    Le laboratoire de physiologie et de biotechnologie des algues associe lIfremer au projet ANR Shamash, qui vise dvelopper la recherche de biocarburants de nouvelle gnration partir de micro-algues trs haut rendement nergtique.

    Dans le domaine halieutique, lquipement dun premier groupe de 23 navires de pche dun systme compact autonome dacquisition et de transmission de donnes marque un mode de collaboration nouveau entre pcheurs et scientifiques, qui permettra, un moment o la pche europenne doit affronter de nouveaux dfis, damliorer lvaluation de la ressource en connaissant mieux leffort de pche et les captures.

    En matire denvironnement littoral, la reconnaissance de la base Quadrige2 comme base de donnes de rfrences nationale pour les donnes de lenvironnement ctier au titre des eaux ctires et de transition va conduire en enrichir encore les fonctionnalits pour mieux les valoriser au service des politiques publiques, mais aussi du grand public.

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    Les grandes actions de recherche 18Surveillance, usage et mise en valeur des mers ctires 19

    Dynamique et sant des cosystmes ctiers et estuariens 20Environnement ctier, sant et scurit du consommateur 25Surveillance et valuation de ltat des eaux littorales 29Dveloppement durable et gestion intgre des zones ctires 31

    Surveillance et optimisation des ressources aquacoles 35Durabilit des systmes de production 36Qualit des procds et des produits 39

    Ressources halieutiques, exploitation durable et valorisation 44Systme dinformation et techniques dobservation, conomie et diagnostic de lexploitation et de lvolution des ressources et de leur usage 46Dmarche cosystmique pour une gestion intgre des ressources halieutiques 50

    Exploration, connaissance et exploitation des fonds ocaniques et de leur biodiversit 54Interaction fluides/minraux/cosystmes 55Ressources minrales et nergtiques, processus sdimentaires et impact sur les cosystmes 57Valorisation des ressources biologiques 60

    Circulation et cosystmes marins, mcanismes, volution et prvision 64La recherche sur les mcanismes et le rle de locan dans le changement climatique 65Observation in situ : technologie, rseaux de mesure, centre de donnes Coriolis 68La composante spatiale 70Vers un systme pan-europen de services ocaniques de base 72Rpondre aux besoins ultimes des clients de locanographie oprationnelle 72

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    Grands quipements et infrastructures 75Construction et dveloppement des navires, des engins et des quipements ocanographiques 76Centres de donnes ocanographiques 78Navires ocanographiques 79Infrastructures exprimentales : moyens dessais 82Rseaux informatiques, tlcommunications et informatique de gestion 84

    Les partenariats 85Les partenariats industriels et la valorisation 86Les partenariats rgionaux et les relations avec les collectivits 90Une ambition europenne de coopration scientifique 106LIfremer et la coopration internationale 110

    La vie de ltablissement 116La gestion des ressources humaines 117La qualit 120Le projet interne co-responsable 122La communication 125

    lments financiers et annexes 132Indicateurs dactivit 133Rsultats financiers de lanne 2007 138Bilan et compte de rsultat 143Fiche didentit de lIfremer 148Conseil et comits 152Glossaire 156

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    GRANDES ACTIONSDE RECHERCHE

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    // SuRvEIllANCE, uSAGE ET MISEEN vAlEuR DES MERS CTIRES

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    Dynamique et sant des cosystmes ctiers et estuariens

    Nouveau projet Liteau. Impacts des facteurs environnementaux et des pratiques conchylicoles sur lcosystme de la baie du Mont Saint-Michel et la production conchylicole. tudes de scnarios par modlisation

    Dans le cadre de la dmarche de gestion intgre des zones ctires (GIZC) entreprise en baie du Mont Saint-Michel et pilote par lassociation Interdpartementale Manche - Ille-et-Vilaine, de nombreuses rencontres ont eu lieu entre les diffrents acteurs de la baie (scientifiques, professionnels, dcideurs) qui ont permis didentifier certaines questions concernant lutilisation et le partage de lespace et de la ressource trophique de la baie maritime, rvlant de fait les craintes voire les conflits existants. Le principal objectif de ce projet est de fournir des lments dapprciation qualitatifs et quantitatifs sur lvolution de la ressource trophique et des peuplements qui en dpendent, sous diffrentes hypothses de modification des forages environnementaux et anthropiques. Il est propos dexploiter de manire prospective les modles numriques qui ont t rcemment dvelopps dans le cadre du chantier PNEC baie du Mont Saint-Michel : modle hydrodynamique et de transport sdimentaire (SiAM), modle de production primaire, modle de croissance des principaux filtreurs (hutres, moules et crpidules). Il sagira de proposer des scnarios permettant dapporter des lments de rponse des questions concernant par exemple :

    les effets dannes climatiques et hydrologiques contrastes sur lcosystme ;

    limpact de la restructuration conchylicole (dplacement des concessions, extensification), mene bien ces dernires annes avec laide de fonds publics ;

    les effets dune extension (ou rduction) des exploitations et/ou dune augmentation (ou diminution) des densits cultives ;

    lintensit de la comptition trophique entre la crpidule (gastropode invasif) prsente en grande quantit dans la partie ouest de la baie et les autres filtreurs, sauvages ou cultivs ;

    les risques sur la production conchylicole et pour les autres habitats de la baie dune extension de la crpidule dans lavenir ou, au contraire, les bnfices dune diminution par extraction.

    Parmi les rsultats attendus, on peut citer en particulier des indicateurs synthtiques permettant de caractriser les impacts et les risques des diffrents scnarios afin de les hirarchiser et de fournir ainsi une aide la dcision en matire de gestion durable du milieu littoral.

    Surveillance et recherche menes en 2007 sur le bassin dArcachon la suite des pisodes toxiques de 2005 et 2006

    Au plan oprationnel (rseau de surveillance Rephy)

    La priode risque PSP (toxines paralysantes), qui stend doctobre 2007 fvrier 2008, prvoyait la ralisation de bio-tests hebdomadaires systmatiques ; depuis de nombreuses annes, elle est marque par labsence de rsultats positifs. Ainsi, le cahier de prescriptions Rephy 2008 prvoit le maintien de cette surveillance systmatique, mais un rythme mensuel.

    En ce qui concerne la surveillance des toxines lipophiles (dites DSP), la priode risques (bio-tests hebdomadaires systmatiques) de 2007 a t allonge dun mois et a port sur la priode mars septembre. Comme en 2006, les bio-tests ont t raliss par les laboratoires accrdits Cofrac de La Rochelle, Ste ou Toulon selon leurs disponibilits.

    Lanne 2007 a t marque par quatre courts pisodes de toxicit de type DSP (quinze jours de fermeture chaque fois), en mars, avril et juin, dont un seul a concern les hutres, et trois les moules.

    Un bloom Pseudonitszchia a t observ en avril (1 300 000 cellules/litre), mais les concentrations en acide domoque sont restes faibles dans les coquillages.

    La dmarche daccrditation du laboratoire dArcachon a t lance en 2007, en particulier grce au recrutement dune responsable Assurance Qualit en aot. Elle doit aboutir en 2008.

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    Au plan recherche et expertise

    Dans le cadre du programme de recherche financ par la rgion Aquitaine, les actions concernant la flore phytoplanctonique et les paramtres hydrologiques associs se sont poursuivis essentiellement lextrieur du bassin par la mise en uvre de campagnes spcifiques (Arcadino).

    Ces campagnes constituent galement un apport de connaissances indispensables la ralisation des travaux dun doctorant Ifremer (Franois Batifoulier), dont la thse est cofinance par lIfremer et la rgion Aquitaine et qui est co-encadr par P. Lazure pour lIfremer et P. Bonneton pour luniversit de Bordeaux I.

    En ce qui concerne le programme national Arcachon, pilot par lAfssa, il comporte six actions :

    une action transversale visant stocker prventivement de grosses quantits de coquillages, ncessaires la recherche ultrieure de toxines en cas de toxicit inexplique ;

    cinq actions de recherche :

    - tudes toxicologiques et dveloppement de tests de toxicit sur cultures cellulaires : MNHN-Afssa ;

    - acides gras libres : Afssa en association avec ITERG (Bordeaux I) ;- polluant chimique : Afssa en association avec LPTC (Bordeaux I) ;- toxicit due des formes drives de toxines connues : Ifremer-Phyc-

    Nantes ;- origine phytoplanctonique : Ifremer Arcachon en association avec EPOC

    (Bordeaux I).

    Laction transversale et laction de recherche n2 ont t lances au cours de lt 2007. Les autres ont t lances au printemps 2008.

    tude sur la modlisation de la production vgtale non fixe dans la bande ctire pour la dtermination des objectifs de qualit en nitrateet en phosphate dans les bassins versants bretons

    Dmarre en juillet 2007, cette tude a obtenu un financement de la rgion Bretagne complt par un financement quivalent de lAgence de lEau Loire-Bretagne. Il sagit dvaluer par modlisation les concentrations en nitrate et phosphate de chaque fleuve ou rivire ctiers bretons ne pas dpasser pour viter les excs de production algale. Cela vise donner des rponses pour permettre lAgence de lEau Loire-Bretagne de mettre en oeuvre des stratgies damnagement pour parvenir au bon tat cologique du milieu. Le code hydrodynamique MARS-3D, grce sa fonctionnalit de zoom Agrif, permettra de traiter en parallle et en connexion complte un modle gnral maille carre dun kilomtre de ct et des modles locaux plus fins 200 m. Seront donc raliss : des simulations spares des panaches de dilution du nitrate issu des trente bassins versants bretons les plus importants et de la Loire pour dlimiter les aires dinfluence marine de chacun de ces bassins versants, des comparaisons avec les donnes satellitaires et in situ, des calculs dindicateurs (cartes de production annuelle dulves, de diatomes, de dinoflagells, de maxima annuels de diverses variables, de la participation de lazote ou du phosphore issus de chaque rivire aux productions).

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  • Intgration de rponses molculaires et physiologiques auxcontaminants chimiques en milieu ctier

    Le Groupement de recherche (GDR) Imophys (http://www.Ifremer.fr/delpc/imophys) a permis de rpondre des appels doffres nationaux : deux projets Pnetox, un projet Liteau, deux projets Ecodyn et un projet EC2CO ont ainsi pu tre lancs. Le GDR a galement contribu au programme Interreg III Atlantique et au rseau dexcellence Marine Genomics Europe.

    Les rsultats majeurs concernent la connaissance des effets des contaminants chimiques au niveau molculaire et gntique sur les populations naturelles, mais aussi le lien dmontr entre des effets molculaires prcoces et la perturbation des performances des populations. Ils traitent despces cibles trs prsentes dans les systmes perturbs par la contamination chimique (Eurytemora affinis, Crassostrea gigas, Mytilus edulis et Dreissenna polymorpha, Platichthys flesus). Une stratgie dtude des effets des pesticides sur le continuum eau continentale et eau marine a t initie en 2006. Cette approche originale intgre ltude dun continuum longitudinal le long de lestuaire de la Vilaine et dun continuum transversal reprsent par les tiers qui se jettent dans lestuaire. Enfin, la dmarche de transfert mthodologique est trs prsente.

    Dans le cadre dun programme dintgration Chimie et Biologie initi par Ospar en 2003 (CEMP : coordinated environmental monitoring programme), des mthodes de rfrences ont t tablies pour chaque indicateur (biomarqueurs et bioessais) en adoptant une dmarche dassurance qualit (Bequalm). Ces mthodes seront valides et standardises sur des sites pilotes en Manche-mer du Nord. Le GDR Imophys a contribu llaboration dun programme de validation mthodologique (ICON : Integrated assessment of contaminant impacts on the North Sea) sur diffrents sites ateliers dont lestuaire de la Seine (Seine-Aval). Ces rsultats contribueront llaboration du rapport de la qualit de la Manche-mer du Nord , qui sera rdig par le Conseil international pour lexploration de la mer (CIEM) en 2010.

    Devenir et effet des contaminants chez les soles : un nouveau projetfinanc par lANR

    Intitul rponse biologique lchelle de lindividu et de la population (SoleBEMol-pop) , ce nouveau projet, financ par lANR dans le cadre de lappel doffres du programme Vulnrabilit, milieux et climat, concerne le devenir et leffet des contaminants dans les soles.

    Afin de prserver la qualit des habitats de poissons dans des zones ctires perturbes par les pressions anthropiques, il est propos dtudier le devenir et les effets biologiques des contaminants chimiques chez des juvniles de soles sur trois zones de nourricerie diffrentes (Seine, Vilaine et Pertuis charentais). Le premier objectif est dvaluer la biodisponibilit, la bioaccumulation et la biotransformation de trois familles de contaminants organiques (PCB, HAP et PBDE) chez la sole et de mesurer des indices biologiques en rponse (croissance, lipides, RHS, marqueurs biologiques deffets...). Un deuxime objectif est de comprendre les processus en jeu par une approche exprimentale des effets en milieu contrl en termes de gnotoxicit, de croissance, respiration et reproduction. Le dernier objectif est de proposer un modle mathmatique sur le devenir des contaminants organiques chez les soles, applicable sur diffrents sites du littoral franais et prenant en compte les effets potentiels de ces contaminants sur les fonctions physiologiques des organismes. On tentera ensuite de quantifier les consquences de la contamination pour le renouvellement des populations, en sappuyant sur les rsultats antrieurs du projet et en modlisant deux populations de sole dans le golfe de Gascogne et en Manche-Est. Pilot par lIfremer, il mobilise plusieurs partenaires : dpartement Biogochimie et cotoxicologie (Ifremer, Nantes et Brest), laboratoire de physico- et toxico-chimie des systmes naturels (LPTC, Bordeaux), Centre de recherche sur les cosystmes littoraux anthropiss (Crela, La Rochelle), Agrocampus (Rennes).

  • Comparaison du fonctionnement hydrodynamique de deux systmes atlantiques, lun Marennes-Olron, lautre Arcachon

    Lun des objectifs du projet Chantier littoral Atlantique du Programme nationalenvironnement ctier (PNEC) est la comprhension et la comparaison du fonctionnement hydrodynamique de deux systmes msotidaux (bassins de Marennes-Olron et dArcachon) par le calcul de grandeurs caractristiques telles que les flux rsiduels, le prisme de mare, le temps de renouvellement ou lge des masses deau. La productivit de ce type de systme, leur fonctionnement et leur vulnrabilit dpendent en effet pour beaucoup du comportement des masses deau, de leur renouvellement et des zones dinfluence des apports continentaux. Un mme code de calcul, MARS-2D, dvelopp sur les deux sites, a t exploit pour la caractrisation de lhydrodynamique et le calcul de grandeurs caractristiques. Des mthodes de calcul identiques ont t utilises afin de comparer les deux sites en termes de circulation des masses deau et dindicateurs synthtiques et pertinents de leur fonctionnement.

    Le temps de renouvellement moyen du bassin de Marennes-Olron, en labsence de vent, a ainsi t estim quatorze jours. Ltude spatialise met en vidence un temps de renouvellement beaucoup plus long (trente-cinq jours) dans la partie Est du Coureau dOlron, du fait dun confinement par les courants intenses circulant dans la passe centrale du bassin.

    La Charente influence de manire significative le bassin de Marennes-Olron, mais son panache est restreint au flanc Est de Coureau dOlron (entre lle dAix et le Chapus) et nimpacte donc pas lle dOlron. Laction du vent est surtout sensible sur la circulation rsiduelle et le renouvellement, mais il conditionne galement la nature des eaux alimentant le bassin et la structure du panache dapport de la Charente. Par vent de nord, la circulation rsiduelle vers le sud du bassin est fortement stimule, ce qui se traduit par des temps de renouvellement de onze jours et six jours pour des vents de 5 m/s et 10 m/s.

    Le temps de renouvellement du bassin dArcachon a t estim entre vingt-sept et trente-neuf jours respectivement pour les saisons hivernale et estivale. Les facteurs vent et dbits des rivires ont une influence marque sur ce paramtre. Les vents

    de secteur Nord et Ouest favorisent le renouvellement, alors que des vents de secteur Sud et Est ont plutt tendance augmenter le confinement du bassin. Le calcul de lge des panaches issus de lEyre et du canal des tangs a permis de quantifier le temps mis par les eaux de ces deux rivires pour atteindre diffrents points du bassin. Les eaux de la principale rivire, lEyre, mettront par exemple respectivement cinq ou treize jours pour atteindre le point Eyrac par vent de Nord ou de Sud.

    Plusieurs autres scnarios ont conduit des typologies de circulation et permis de caractriser linfluence de lensemble des cours deau de manire exhaustive pour les deux systmes.

    Projet Contaminants : une nouvelle action

    valuation du risque pesticide pour les cosystmes coralliens de La Runion (Ericor)

    Ce projet, financ par le ministre de lcologie, de lnergie, du Dveloppement durable et de lAmnagement du territoire est coordonn par lArvam La Runion. LIfremer (BE/EX) intervient en collaboration avec linstitut Pasteur de Lille (laboratoire littoral Nord de Gravelines) pour ladaptation des protocoles de bio essais normaliss aux organismes tropicaux cibls, ainsi que la comparaison des sensibilits des espces tropicales avec celles des tests normaliss ; la partie analytique est assure par lIdhesa de Brest.

    Au cours de la premire anne du projet, la mise au point des bio-essais a t ralise sur quatre des six groupes dorganismes cibls :

    pour le phytoplancton : test dinhibition de la croissance de diatomes benthiques et de zooxanthelles ;

    pour les oursins : test dembryotoxicit sur deux espces (Echinometra mathaei et Tripneustes gratilla) ;

    pour les coraux : test sur Pocilopora eydouxi, les essais sur micro-boutures sont concluants et leur matrise assure lapplicabilit sur pesticide ;

  • pour les poissons : le choix sest port sur lombrine tropicale (Sciaenops ocellatus), les tests sont matriss sur des juvniles de 400 mg (J 30) et un protocole a t mis au point sur des larves post closion (J 2).

    Les essais sur bivalve, Modiolus auriculatus, moule de rcif corallien, et crustacs avec des larves post closion de crevettes produites pour laquaculture ( Madagascar en particulier) sont programms pour la seconde anne du projet.

    Le choix des molcules tester est ralis en collaboration avec la Diren et les services dconcentrs du ministre de lAgriculture, afin de disposer rapidement des derniers lments sur les produits imports La Runion pour lagriculture, ainsi quavec ceux du ministre de la sant, qui coordonnent une partie de la lutte anti-larvaire (LAV).

    Les premiers rsultats montrent la dtection de plus en plus systmatique de pesticides dans les eaux et organismes.

    Outre la prsence datrazine (qui nest plus utilise depuis 2002), la prsence dautres molcules comme le fipronil (utilis dans les traitements anti-termites)et la deltametrine (une fois dans des oursins) interroge quant lutilisationde molcules des usages autres quagricoles. Cette prsence est maintenant avre, en particulier pendant les priodes de lessivage en saison humide.

    Les rsultats des bio-essais mis en uvre dans le projet Ericor permettront de :

    dterminer les seuils de toxicit potentiels des biocides utiliss dans un contexte tropical ; les rsultats serviront pour lorientation des politiques de lutte contre les pollutions par les produits phytosanitaires, en particulier dans le cadre de la DCE ;

    proposer des outils adapts aux milieux tropicaux (protocoles standardiss sur espces spcifiques).

    Projet Habitat : deux nouveaux projets sur les aires marines protges(AMP)

    Deux nouveaux projets sur les performances des AMP ont t valus positivement par lANR. Les AMP sont actuellement considres comme un instrument privilgi pour assurer une gestion durable des cosystmes ctiers et de leurs usages. Les textes prvoient lobligation de fournir des indicateurs permettant dvaluer lefficacit des politiques de gestion des AMP au regard des objectifs qui leur sont assigns, notamment en matire de conservation et dutilisation durable des ressources halieutiques.Le premier projet porte sur les indicateurs de la performance daires marines protges pour la gestion des cosystmes ctiers, des ressources et de leurs usages (Pampa). Il est financ par le programme Liteau et pilot par lIfremer. Lobjectif est de construire et tester des tableaux de bord dindicateurs cosystmiques, dindicateurs sur les usages et dindicateurs de gouvernance, permettant dvaluer la performance de systmes de gestion des cosystmes ctiers incluant des AMP. Les terrains dtude sont situs en mtropole et en outre-mer franais : rserves naturelles des bouches de Bonifacio et de Banyuls-Cerbre, parc marin de la Cte Bleue, cantonnement de pche du Cap Roux, rserve et parc naturel marin dIroise, aire marine protge du plan de gestion de lespace maritime (PGEM) de Moorea (Polynsie franaise), Guadeloupe, Mayotte.

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  • Le deuxime projet porte sur la gouvernance des aires marines protges pour la gestion durable de la biodiversit et des usages ctiers (Gaius) , pilot par luniversit de Perpignan. En complment du projet Liteau, il consiste mettre en relation les analyses de la gouvernance et de la prise de dcision avec les indicateurs cologiques, conomiques et sociaux qui seront produits, afin de nourrir une rflexion collective et pluridisciplinaire sur la contribution des AMP la gestion durable des cosystmes ctiers et de leurs usages. Cette approche pluridisciplinaire impliquera lintervention de chercheurs en droit, en conomie et en cologie.

    En complment, le consortium intgrera dans sa dmarche les scientifiques et les gestionnaires des AMP, ainsi que des reprsentants des acteurs et des organisations prsents sur ces espaces. Le projet permettra de rpondre la problmatique de la gestion durable des cosystmes ctiers et de leurs usages et dapporter des lments concrets la question actuelle de la gestion des parcs naturels marins en France et plus gnralement dAMP en Europe et dans le monde.

    Ces travaux sinscrivent dans le cadre de la collaboration entre lIfremer et lAgence des aires marines protges.

    Dmarrage du projet Freplata

    Le fonds franais pour lenvironnement mondial (FFEM) et le GEF (Global Environmental Facilities) financent le projet Freplata, ddi ltude environnementale et la protection de lestuaire du Ro de la Plata. La participation de lIfremer ce projet se traduit par quatre actions :

    1 // la modlisation hydro-sdimentaire de lestuaire ;2 // la mise en place de stations de mesures environnementales pour la validation

    de modles ;3 // linterprtation dimages satellitales utilises pour une mesure globale

    et indirecte des donnes de chlorophylle et de turbidit ;4 // la mise en place dune interface du modle, qui aidera au dveloppement

    dune stratgie de gestion de lestuaire.

    La premire anne sera ddie la collecte des donnes ncessaires la mise en place du modle (un effort particulier devra tre fait concernant les donnes mtorologiques) et limplantation du modle lui-mme. Les instruments de validation seront galement dvelopps, et implants en fin danne (stations de mesure, dveloppement du traitement des images satellitales). Les systmes dinformation gographique existants seront amliors.

    Environnement ctier, sant et scurit du consommateur

    Projet intgr Mditerrane Medicis

    Dans le cadre de ce projet centr sur la contamination chimique en Mditerrane, on notera la clture du projet Interreg Mytilos, le dmarrage de Mytimed, son pendant sur la Mditerrane orientale, ainsi que le lancement du projet ANR Extrema. En lien avec laction Metroc sur les apports en contaminants des grandes mtropoles ctires, une synthse de ltat de la contamination chimique du golfe de Marseille a t labore (http://w3.ifremer.fr/medicis/) et un sminaire a t organis Marseille avec les acteurs scientifiques et gestionnaires impliqus sur la rade de Marseille.

    Projet Mytilos : cartographie de la contamination chimiqueen Mditerrane occidentale

    Pour mesurer les niveaux de contamination chimique dans la bande ctire mditerranenne, le projet Interreg III B Mytilos a utilis des moules en stations artificielles. La mthode a t mise au point dans le cadre du rseau Rinbio (rseau intgrateurs biologiques), cr en 1996 en collaboration avec lAgence de lEau Rhne-Mditerrane et Corse. Les moules sont en effet dexcellents bio-accumulateurs et les concentrations en contaminants retrouves dans leur chair refltent les concentrations en contaminants biodisponibles dans leau.

    Dans le cadre de Mytilos, trois campagnes ocanographiques, coordonnes par lIfremer, ont t ralises en 2004, 2005 et 2006 grce au soutien actif des partenaires scientifiques et institutionnels du projet (France, Espagne, Italie, Tunisie, Algrie, Maroc). Elles ont permis la pose de 148 stations artificielles, rparties

  • de faon homogne entre les diffrents pays, avec un taux de rcupration de plus de 82,5 %.

    Les niveaux mesurs pour ces contaminants organiques sont faibles et sans risques connus pour la faune et la flore marines. Ils ncessiteront toutefois des investigations complmentaires. Les rsultats dtaills des analyses sont consultables sur le site ddi : http://mytilos.tvt.fr/. Mytilos a reu le soutien du PNUE/PAM - Medpol et de lAgence de lEau Rhne Mditerrane et Corse.

    Lancement du projet europen Mytimed : vers un rseau interrgional de surveillance de la qualit des eaux ctires de la Mditerrane orientale

    Sinscrivant dans la continuit du projet Mytilos lanc en 2004 et coordonn scientifiquement par lIfremer, le projet Mytimed a pour objectif la mise en uvre dun rseau dvaluation, et moyen terme, de surveillance de la contamination chimique littorale en Mditerrane orientale. Il vise dvelopper un rseau de surveillance bas sur la mise en place de stations artificielles de moules sur le pourtour du bassin mditerranen.

    Prvu sur une dure de deux ans, avec un budget total de prs dun million deuros, Mytimed vise trois objectifs :

    la crat ion dun rseau de partenaires utilisant la mme mthodologie ;

    lapplication dun protocole standardis au pourtour de la Mditerrane orientale et son transfert vers les partenaires du Maghreb et du Machrek ;

    lvaluation de la qualit chimique des masses deau identifies dans les zones concernes, au titre de la Directive-cadre sur lEau.

    Mytimed associe ainsi des partenaires scientifiques et institutionnels des pays mditerranens, membres de lUnion europenne (France, Italie et Grce) et des pays du programme MEDA pour le partenariat euro-mditerranen (Tunisie, Syrie, Liban, Maroc), ainsi que le plan daction pour la Mditerrane du programme des Nations Unies pour lenvironnement.

    terme, Mytimed permettra lobtention dun tat de rfrence complet, lintercalibration des protocoles danalyse et la cration dun rseau dalerte prenne.

    Grce la mise en uvre de ce rseau de biointgrateurs, les autorits rgionales et/ou nationales disposeront dun outil dvaluation et de mesure de la qualit des milieux. Ils seront ainsi plus mme de dcider des mesures de prvention et/ou de traitement mettre en uvre.

    Le projet Interreg III B/Mytimed pour la Mditerrane orientale, qui bnficie de lexprience Interreg III B/Mytilos pour la Mditerrane occidentale, permettra dobtenir un tat complet de la contamination chimique (champ moyen) portant sur lensemble de la mer Mditerrane, et de conforter la technique de caging de moules comme la mthode mditerranenne de caractrisation de ltat chimique des eaux (pour les contaminants bioaccumulables).

    Deux campagnes supplmentaires Mytiad (2008) en Adriatique et Mytlyb (2009) en gypte, Lybie et Tunisie (Est) devraient permettre de complter lvaluation pour lensemble des ctes de Mditerrane.

    Ifremer / G. Herv

  • Extrema : un nouveau projet sur les pisodes mto-climatiquesextrmes financ par lANR

    Le projet Extrema pisodes mto-climatiques extrmes et redistribution des masses sdimentaires et des polluants associs au sein dun systme ctier a t retenu pour lobtention dun financement par lANR, dans le cadre du programme Vulnrabilit, milieux et climat 2006. La runion de dmarrage du projet sest tenue le 21 fvrier Cadarache. Pilot par lIRSN, il associe lIfremer (en impliquant des quipes de Toulon, Brest et Nantes) et trois laboratoires rattachs au CNRS : le Cefrem de Perpignan, le Cerege dAix-en-Provence et le laboratoire darologie de Toulouse.

    Le volet exprimental dExtrema se droulera en Mditerrane nord-occidentale, o des piges particules et des instruments de mesures autonomes (station Frame) seront dploys. Des travaux sur le Rhne et les canyons sous-marins du golfe du Lion sont notamment prvus. Le projet comporte aussi une composante modlisation lchelle rgionale. Cette action est rattache au projet intgr Mditerrane Medicis.

    Sminaire consacr ltat des connaissances actuellessur la rade de Marseille

    Le sminaire Oceanomars, organis le 16 mars Marseille par le Cerege avec la collaboration de lIfremer, a runi une quarantaine de participants reprsentant les universits et laboratoires de recherche dAix-Marseille, de Toulon et de Nice, lIfremer et lIRSN. Des reprsentants de la ville de Marseille, de lAgence de lEau Rhne-Mditerrane et Corse, de la prfecture de rgion, du ple Mer et du GIP Calanques, taient galement prsents. Lobjectif consistait faire un tat des connaissances actuelles sur la rade de Marseille, puis dfinir et formaliser un projet dtude sur cette zone privilgiant une approche intgre et pluridisciplinaire.

    Les exposs scientifiques ont port sur trois thmatiques : contaminants chimiques, biologie, hydrodynamique - sdiment et rosion ctire. Ensuite, une prsentation par lAgence de lEau Rhne-Mditerrane et Corse des attentes des diffrents gestionnaires a introduit le dbat prospectif qui a permis de dfinir plusieurs thmes approfondir.

    Ces thmes feront lobjet dune demande explicite dtudes ou de complmentsdinformation :

    la lutte contre les toxiques et lamlioration des techniques dassainissement en cohrence avec laction Metroc de Medicis ;

    la scurisation des sites de baignade (qualit de leau et des plages) ;

    la protection des cosystmes et la restauration de milieux dgrads.

    Pour aborder ces questions dans une zone trs fortement anthropise, limplication de chercheurs en sciences humaines est reconnue comme indispensable. Les laboratoires et organismes de recherche sont convenus dlaborer des propositions de recherche en ce sens.

    Validation de la technique de dnombrement des E. coli par impdance dans les coquillages

    Ltude pour la validation europenne de la mthode rapide danalyse des E. coli dans les coquillages par impdancemtrie sur systme BacTrac, organise en collaboration avec le laboratoire communautaire de rfrence du Cefas (Weymouth, UK), vient de sachever avec succs. Au total, douze laboratoires ont particip cette tude : cinq laboratoires de lIfremer (les LER Normandie Port-en-Bessin, Morbihan Pays-de-Loire La Trinit-sur-Mer, Poitou- Charente La Tremblade, Languedoc-Roussillon Ste et le LNR Nantes), trois laboratoires vtrinaires dpartementaux et quatre laboratoires europens dont les LNR du Royaume-Uni et dAutriche.

    Cette tude avait pour objectifs, dune part, de dmontrer lquivalence des rsultats obtenus par la mthode impdancemtrique et la mthode de rfrence europenne (ISO/TS 16649, partie 3, Technique du nombre le plus probable) et, dautre part, de faire reconnatre la mthode impdancemtrique comme mthode alternative pour lanalyse des coquillages dans le cadre des rglements europens relatifs lhygine des aliments. La premire phase de ltude a consist comparer la mthode alternative et la mthode de rfrence selon quatre critres (linarit, exactitude relative, limite de dtection et slectivit). La seconde phase, ou tude collaborative

  • interlaboratoire, a consist dterminer les caractristiques de performances de la mthode impdancemtrique en termes dexactitude relative, de rptatibilit et de reproductibilit, comparativement la mthode de rfrence.

    Cette mthode danalyse rapide des E. coli sur analyseur BacTrac 4300 permet dobtenir des rsultats moindre cot en huit heures environ, et mme en cinq six heures en cas de contamination leve, au lieu de quarante-huit heures avec la mthode de rfrence. Son usage devrait se gnraliser dans les laboratoires vtrinaires des dpartements du littoral, de lAtlantique la Manche, qui ralisent les analyses dautocontrle des professionnels de la conchyliculture. Des laboratoires italiens, espagnols et anglais sont galement intresss par cette mthode.

    Ralise selon un protocole de la norme EN ISO 16140, la validation de la mthode alternative de dnombrement des E. coli dans les coquillages par impdancemtrie sur systme BacTrac ouvre la voie lutilisation de cette mthode analytique, mise au point lIfremer, au-del de lEurope. Auparavant, le rapport de synthse sur les travaux de validation, effectus par le LNR microbiologie des coquillages de lIfremer dans le cadre de ltude collaborative interlaboratoire, devra recueillir un avis favorable du LCR du Cefas. Il sera adress la Commission europenne au cours de lt 2008.

    Participation de lIfremer au groupement de recherche Eau et Sant

    LIfremer a particip au lancement du groupement de recherche (GDR) Eau et Sant .

    Regroupant trente et un participants, essentiellement en provenance du CNRS, des universits, de lInserm, de lINRA, de lINSA, de linstitut Pasteur et de lIfremer, ainsi que des reprsentants du ministre de lcologie, de lnergie, du Dveloppement durable et de lAmnagement du territoire et du ministre de la Sant, ce projet a pour objectif de crer un GDR, qui rpond une forte demande socitale, au plus tard en 2008.

    LIfremer se propose de participer lvaluation des risques sanitaires lis aux contaminations microbiologiques, biologiques et chimiques en zones ctires. Il cherche qualifier le devenir des microorganismes pathognes, ainsi que les

    processus de production et daccumulation de biotoxines dans le milieu marin. Il sattache galement dterminer les contaminants chimiques et les espces cibles reprsentant un niveau de risque non acceptable pour le consommateur. Enfin, le programme vise anticiper le risque de contamination en venant en appui aux diffrents rseaux de surveillance de la qualit du milieu marin (RNO, REMI et Rephy). ce titre, la contribution de lIfremer concernera les domaines suivants :

    vulnrabilit : il sagit, dans le domaine du risque sanitaire, dtudier labondance, la survie et le maintien du pouvoir pathogne des bactries et virus entriques arrivant en zone ctire ;

    interactions : cet aspect sapplique principalement la modlisation des changes cte/large et ltude du cycle biogochimique des contaminants chimiques en Mditerrane occidentale (projet PIM-Medicis) ;

    risques : un recensement annuel est effectu, ainsi que le suivi des TIACs virus entrique et le dveloppement dans un avenir trs proche de lcotoxicologie en Mditerrane ;

    mergence : la dtection, les sources et le mode de transfert des contaminants mergents font partie des objectifs du programme Environnement ctier, sant et scurit du consommateur (Ecoss). Cela concerne la mise en vidence de produits pharmaceutiques la sortie des missaires de Cortiou et Montpellier, le typage des sources de contamination microbiologiques (animales et humaines) en Bretagne et la mise en vidence de nouvelles phycotoxines telles que les spirolides Arcachon et les azaspiracides au large de Roscoff.

  • Surveillance et valuation de ltat des eaux littorales

    Rapport final sur le GDR Gestion des cosystmes littoraux mditerranens

    Le rapport final du groupement de recherche (GDR) liant lIfremer, luniversit de Corse, le GIS Posidonie et la Stareso, intitul Gestion des cosystmes littoraux mditerranens , est paru au dbut de lanne 2007.Ce GDR a permis de rapprocher les quipes sur les thmatiques de bio-intgration des contaminants en utilisant les moules et les posidonies et en proposant un systme daide la dcision pour les gestionnaires corses dans un esprit dapproche intgre des zones ctires.

    Le rapport final est accompagn dun CD-Rom prsentant les conclusions du sminaire de clture, ainsi que ceux du dernier conseil de groupement et comit scientifique du GDR.

    Deux thmatiques avaient t prises en compte au cours des quatre annes coules :

    la biosurveillance laide dorganismes sentinelles indicateurs de contamination, et notamment la complmentarit moules-posidonies comme organismes bio-intgrateurs et la comprhension de mcanismes daccumulation des mtaux lourds ;

    la gestion de linformation utile la gestion intgre de la zone ctire (GIZC) Corse, en dveloppant en partenariat avec les gestionnaires les outils quantitatifs dun systme dinformation adapt la Corse.

    Trois sminaires, deux conseils de groupement et deux comits scientifiques ont jalonn ce GDR, qui a servi de plateforme notamment plusieurs tudes Interreg, dont les programmes Interreg III A Moniqua (monitorage de la qualit de leau et de lenvironnement) et AISC (analyse intgre des systmes ctiers), qui ont dbut en 2002 et se sont termins en 2007, en collaboration avec les rgions Toscane et Sardaigne. Le CDRom Interreg III B Moniqua est disponible sur demande au LER PAC.

    Sminaire de clture du projet Posidonia

    Le projet Posidonia avait pour objectifs la mise en cohrence, le dveloppement, lharmonisation et la validation de mthodes dvaluation de la qualit du milieu littoral par le suivi de lherbier de Posidonia oceanica, en Catalogne, Corse, Provence-Alpes-Cte dAzur et Ligurie.

    Le sminaire de clture, qui sest tenu en mars 2007 Marseille, a permis didentifier les avances sur les quatre grands volets du projet : la coordination inter-organismes, la surveillance, les bio-indicateurs et la cartographie des herbiers. La possibilit de comparer les rsultats dindicateurs bass sur les posidonies afin de les utiliser pour la mise en oeuvre de la directive cadre sur leau constitue un rsultat important.

    Le site internet www.ifremer.fr/posidonia/ comporte lensemble des rapports finaux tlchargeables, notamment un manuel de gestion de lherbier de posidonie, labor lattention des gestionnaires, une validation in situ des diffrentes filires dacquisition (acoustique, vido remorque, tldtection, plonge sous-marine),

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    des recommandations techniques et financires quant leur mise en uvre, la dfinition de descripteurs, la dfinition dun indice globalis et la ralisation dun exercice dintercalibration pour la caractrisation dun tat cologique.

    Quadrige2 : un nouveau systme dinformation pour lenvironnementctier, base de rfrence des eaux ctires et de transition

    LIfremer a dvelopp la base de donnes Quadrige depuis le milieu des annes 1990 afin de grer les donnes produites par les rseaux de surveillance de lenvironnement ctier. Ce systme dinformation utilise des outils comme les systmes de gestion de base de donnes relationnelles et est construit autour dun ensemble dapplications couvrant deux grands types de besoins fonctionnels que reprsentent le stockage de donnes brutes et leurs outils dextraction, dinterprtation, de valorisation et de diffusion de la donne. Le systme Quadrige fait partie du systme dinformation sur leau (SIE) et contribue aux groupes de normalisation des changes autour de leau (Sandre).Aujourdhui, aprs dix annes dexploitation de Quadrige, un nouveau systme va voir le jour, qui doit prendre en compte de nouveaux besoins et intgrer de nouvelles technologies. La mise au point de Quadrige2, qui avait dbut au milieu de lanne 2004, sest termine fin 2007.

    Le systme Quadrige2 sera une base de donnes de rfrence nationale pour les donnes de lenvironnement ctier acquises par lIfremer et ses partenaires. Le systme rpondra aux obligations juridiques nouvelles comme la directive cadre sur leau, la protection du milieu marin de lAtlantique du Nord-Est (Ospar) et la rglementation sur les contrles sanitaires dans les zones de production conchylicoles. Le ministre de lcologie, de lnergie, du Dveloppement durable et de lAmnagement du territoire a dsign aujourdhui Quadrige2 comme la base de donnes de rfrence pour les eaux ctires et de transition.

    Le systme Quadrige2 introduira de nombreuses fonctionnalits nouvelles, grce principalement :

    lintgration de nouveaux programmes de surveillance,

    la reprsentation spatiale des donnes et la possibilit de stocker, slectionner et interroger avec des fonctionnalits de type SIG,

    des changes de plus en plus frquents de donnes aux niveaux internationaux, nationaux et locaux,

    la diffusion de linformation environnementale au grand public.

    Concernant la valorisation et la diffusion, le grand chantier en cours concerne Surval 2007, outil de diffusion des donnes stockes dans Quadrige2. Il sagit de sites Internet/extranet comportant une interface cartographique, diffusant les donnes qualifies au grand public et nos partenaires. Lobjectif est de rendre ces nouvelles interfaces oprationnelles dbut 2008.

    Prochainement, le systme continuera dvoluer en vue dintgrer dautres systmes dinformations (SIE notamment) et la poursuite de la valorisation/diffusion via toute une srie de produits sur diffrentes thmatiques (cartographie, statistiques, etc.).

    Des avances sur le Rebent Mditerrane

    Suite la diffusion de lavant-projet sommaire du Rebent Mditerrane en 2006 et de ses composantes par lintermdiaire de la DCE et des projets Interreg, le laboratoire LER / PAC a instruit au ct du GIS Posidonie les dossiers financs par le Parc national de Port Cros (PNPC) ; ils concernaient la cartographie des zones Natura 2000 des les du Levant et de Porquerolles et celle des biocnoses du secteur de Saint-Raphal (cofinanc par la rgion PACA et lAgence de leau Rhne-Mditerrane et Corse). Une tude mthodologique consistant comparer les performances acoustiques du sonar Ifremer et du sondeur de la socit Semantic-TS a galement t entreprise en 2007, ce qui a permis au laboratoire LER / PAC de saffiner sur le traitement des donnes acoustiques issues du logiciel Carabe .

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    Nouvelles technologies pour la surveillance

    La station Micado (module lger dimagerie ctire autonome pour le dveloppement, lobservation et la surveillance) a t installe pour la premire fois sur un site de parcs hutres La Tremblade, de juillet septembre 2007. Elle a permis le suivi temporel de la croissance des hutres en corrlation avec un suivi hydro-biologique haute frquence (plusieurs mesures par heure), effectu par une station Marel-estran, du milieu dans lequel elle se dveloppent. Ces outils constituent une aide prcieuse pour ltude et la surveillance de ces environnements sensibles et offrent ainsi des lments daide la gestion de la bande littorale.

    Dveloppement durable et gestion intgre des zones ctires

    Contribution au manuel A Handbook for measuring the progress and outcomes of integrated coastal and ocean management, COI-Unesco

    Une tude consacre aux indicateurs de dveloppement durable a t mene en partenariat avec lAgrocampus de Rennes, luniversit de Montpellier I, le Cepralmar et le SMBT. Une mthodologie de construction, suivie de tests de validation, a t labore et mise au point avec les partenaires locaux du bassin de Thau.

    Ce travail participe llaboration dune dmarche conduite par la Commission ocanographique intergouvernementale (COI) et lUnesco, dindicateurs de progrs et de rsultats de la gestion des ctes et des ocans. Le groupe de travail ad-hoc, auquel lIfremer a particip, a retenu plusieurs sites dont celui de ltang de Thau pour y tester une slection dindicateurs relevant des domaines de lcologie, de la socioconomie et de la gouvernance. (Rfrence de louvrage publi : IOC. A Handbook for Measuring the Progress and Outcomes of Integrated Coastal and Ocean Management Preliminary Version. IOC and Guides 46, Paris, Unesco, 2005).

    Audit de lactivit de gestion intgre des zones ctires aux Antilles franaises

    La fin du projet Liteau et le dpart du dlgu Ifremer aux Antilles ont t loccasion de raliser une mission dvaluation des rsultats et des potentialits de poursuite de ces activits dappui la GIZC. Laudit a montr des rsultats trs probants dans lacquisition de connaissances la fois sur le bassin versant et la baie du Robert, grce aux partenariats tablis en particulier avec le Cemagref et le bureau dtudes Impact-Mer. Ces actions ont t menes titre exprimental sur le site du Robert, considr comme un site-atelier pour mettre en uvre les principes de la gestion intgre et ont t perues comme trs bnfiques. Elles ont permis de nouer des partenariats scientifiques locaux, notamment dans le domaine des sciences sociales comme avec les acteurs dcisionnels et gestionnaires, reprsents par la commune du Robert. Lintrt de travailler sur un site atelier a t confirm en ce quil facilite lintgration des connaissances au sein de la communaut scientifique et par les dcideurs. Ce travail collectif et de proximit troite entre les deux communauts a fourni des lments utiles daide la dfinition dune politique de gestion du territoire considr.

    Les rsultats positifs de la premire phase de la dmarche exprimentale ralise (une premire en Martinique) ont conduit lensemble des partenaires poursuivre cette initiative avec la commune du Robert, les partenaires scientifiques de lIfremer et la Diren.

    Ifremer / S. Guesdon

  • Projet SIG Mont Saint-Michel

    Le projet SIG Mont Saint-Michel a dmarr le 1er juin 2007 pour une dure de dix-huit mois, sur commande de la Diren Basse-Normandie, de la rgion Bretagne et de lassociation du Mont Saint-Michel (cadre de la Mimel). Un comit de pilotage a t constitu. Les grandes questions daide la gestion auxquelles le SIG devra rpondre ont t identifies. Le SIG vise aussi conserver la mmoire du programme PNEC, dont le colloque de restitution, organis par lIfremer et le Musum national dhistoire naturelle (MNHN) les 23 et 24 mai 2007, tablit un bilan des rsultats scientifiques du programme de recherche men sur la baie du Mont Saint-Michel depuis 2001.

    Omega Thau

    La convention du projet Omega Thau a t signe fin fvrier 2007. Les partenaires sont le syndicat mixte du bassin de Thau, la communaut dagglomration du bassin de Thau, la communaut des communes Nord du bassin de Thau, le BCEOM, BRL Ingnierie, lAgence de lEau et lIfremer. Dune dure de dix-huit mois, cette action est destine concevoir, dvelopper et valider un systme de management des risques de contaminations microbiologiques des zones dlevage conchylicole et des zones de baignade de la lagune de Thau (systme davertissement prcoce). LIfremer est le coordinateur scientifique et technique du projet et couvre toutes les actions relatives au domaine lagunaire.

    Dautre part, le dmonstrateur Syscolag sur Thau, dvelopp par le Cepralmar, est en phase de finalisation. Cet outil propose une mthodologie pour valuer limpact conomique et environnemental des activits conomiques maritimes. Construit de manire gnrique pour tre utilis sur nimporte quelles zones ctires, il est mis en application sur ltang de Thau titre pilote. LIfremer a particip la conception dindicateurs et a contribu la mise au point mthodologique de la dmarche.

    Runion de lancement du projet Spicosa

    La runion de lancement officiel du projet Spicosa (Science and Policy Integration for Coastal System Assessment), coordonn par lIfremer, sest tenue Rome, du 20 au 23 fvrier 2007. Ce projet a pour objectif le dveloppement doutils dintgration des connaissances scientifiques au service dune dmarche prospective concerte pour la gestion intgre des zones ctires. Plus de quatre-vingt scientifiques ont particip aux dbats sur la mise en place des plans daction pour les dix-huit premiers mois. Les problmes soulevs, notamment par le transfert et la ncessit de disposer dlments en provenance des sites pour adapter la mthodologie au plus prs des proccupations locales, ont t dbattus. Le comit de pilotage scientifique du projet en a profit pour rappeler les rgles de gouvernance et donner des prcisions sur lavancement de la signature du contrat. Le site web du projet auquel lIfremer a contribu est oprationnel ladresse suivante : http://www.spicosa.org/.

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  • Bilan de la loi littoral et mesures en faveur du littoral

    loccasion des vingt ans de la loi littoral, un bilan a t entrepris sous la coordination de la Dlgation Interministrielle lamnagement et la comptitivit des territoires (DIACT) et du Secrtariat gnral la Mer (SG Mer). LIfremer tait concern, notamment au travers de leffort de recherche et dinnovation sur les particularits et les ressources du littoral et, ce titre, il a contribu de nombreuses rubriques dans le rapport final du bilan, notamment sur les points relatifs aux actions de recherche dans le cadre du PNEC, de Liteau, linformation littorale (rfrentiel gographique, systmes dinformation), aux activits conomiques du littoral (dont la pche, laquaculture, les activits portuaires), aux rseaux de surveillance de la qualit des eaux littorales, en particulier dans le cadre de la DCE. LIfremer a apport son aide pour la partie conclusive et prospective, en soulignant limportance des travaux poursuivre dans le domaine des outils de promotion de la connaissance dvelopper dans la perspective dune vritable gestion intgre du littoral.

    Nouveau programme Liteau

    Le nouveau programme Liteau dveloppe des projets de recherche mettant en uvre des approches interdisciplinaires, avec une forte implication des acteurs de la gestion, tout en se situant dans une perspective de reproductibilit des rsultats. Lappel propositions de recherche a t lanc en fvrier 2007 et trente-et-une propositions ont t soumises aux instances de pilotage du programme. Neuf projets de recherche ont finalement t retenus (dont deux coordonns par lIfremer) ainsi quune proposition danimation Diraliteau , porte galement par lIfremer. Ce projet a t retenu comme modalit danimation du programme Liteau III pour 2008-2010. Il vise la conception dun dispositif innovant de recherche par la mise en place de rseaux de scientifiques et de gestionnaires, lanalyse des besoins en outils et connaissances et lanalyse dun mode impliqu de contribution de la recherche la GIZC.

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    Slection de publications sur le thme Surveillance, usage et mise en valeur des mers ctires

  • // SuRvEIllANCE ET OpTIMISATION DES RESSOuRCES AquACOlES

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  • La demande mondiale de produits aquatiques ne cesse de progresser sous leffet conjugu de la croissance dmographique, de laugmentation des revenus et des recommandations mdicales sur les bienfaits pour la sant des produits de la mer. Les experts saccordent sur une stagnation des apports de la pche en raison de ltat actuel des stocks sauvages : lapprovisionnement futur du march mondial repose sur lessor de laquaculture.

    Avec 48 millions de tonnes, laquaculture (majoritairement deau douce) reprsente 43 % de ce march en 2005. Cette production aquacole devrait atteindre 80 Mt en 2030 pour maintenir le niveau actuel de la consommation mondiale en produits aquatiques qui se situe aux alentours de 16,6 kg par habitant (12,4 kg de poissons, 2,7 kg de mollusques, 1,5 kg de crustacs).

    Dans ce contexte de stabilisation de loffre dorigine halieutique, de prise de conscience de la fragilit de notre environnement, de conflits dusage sur la bande ctire, daugmentation des cots de lnergie... laquaculture mondiale, pour se dvelopper et relever le dfi des 80 millions de tonnes en 2030, devra rsoudre de nombreux problmes : laccs lespace maritime, lapprovisionnement en eau de bonne qualit, la substitution des farines et huiles de poissons par des sources vgtales, la diminution de son impact sur lenvironnement

    Durabilit des systmes de production

    Si laquaculture marine est appele se dvelopper, elle ne pourra le faire dans les pays dvelopps quen trouvant sa place dans la zone ctire : les travaux en cours ont pour but dimaginer et de prparer des conditions nouvelles de production, respectueuses de lenvironnement voire capables de lamliorer en combinant, par exemple, production et utilisation de nutriments.

    Par ailleurs, on connat de mieux en mieux les effets environnementaux de laquaculture et les tudes portant sur les moyens dy remdier savrent prometteuses. Que ce soit le dveloppement de laquaculture multitrophique intgre, en marais ou en mer, laquaculture en systme clos, ou lamlioration de laliment pour poissons, les pistes sont de plus en plus nombreuses.

    Un nouveau projet pour la production de crevettes en Nouvelle-Caldonie

    Deduction (Dveloppement durable de la crevetticulture, traitement de linformation et observatoire du systme en Nouvelle-Caldonie) a pris la suite du projet Desans (cf. encadr) et sest orient vers :

    ldition dun guide des bonnes pratiques destination des professionnels et la validation dindicateurs environnementaux dtat de sant des fonds de bassin, compartiment prpondrant dans lexplication du confort cologique ;

    la finalisation du transfert de la souche Hawaii pour une production dhybrides par la profession, avec la dfinition des protocoles de traitement prophylactique vitant la dissmination de matriel biologique contamin. Lvaluation de peptides antimicrobiens comme marqueurs de rsistance sera mene en collaboration avec le dpartement BOME de Montpellier ;

    Le projet Desans

    Ralis entre 2003 et 2006, le projet Desans (Dfi Sant Stylirostris) a permis de mieux connatre les facteurs de risque susceptibles de provoquer des vibrioses de type syndromes dt ou dhiver, affectant les levages de crevettes Litopenaeus stylirostris en Nouvelle-Caldonie. Limportance du confort cologique dans les bassins, facteur prpondrant vis--vis du confort physiologique des animaux, qui leur confre une plus grande rsistance aux micro-organismes pathognes, a t mise en exergue. Des gains significatifs de survie et de croissance ont galement t obtenus par croisement des souches caldoniennes et Hawaii de L. Stylirostris. Finalement, Desans a identifi le respect des bonnes pratiques dlevage et la qualit des post-larves issues des quatre closeries prives comme les paramtres clefs pour la filire caldonienne.

  • la dtermination des bases biologiques en cophysiologie larvaire et post-larvaire, avec ltude du dveloppement des dfenses anti-oxydantes au cours de lontognse ;

    ltude de lcologie microbienne en closerie : la connaissance de la flore htrotrophe totale devrait permettre de contrler le mode daction des probiotiques et antibiotiques vis--vis des pathognes (vibrios).

    Deduction aborde ainsi la crevetticulture caldonienne dans un contexte largi :

    en amont, en accompagnant la filire dans des choix stratgiques (conservation de la souche Hawaii, colabellisation, veille zootechnique, transformation des produits) ;

    en aval, en situant lactivit crevetticole au sein de lcosystme lagonaire, dont la mangrove : pressions et impacts (connaissance des intrants, en particulier la production primaire).

    Ce dernier point marque lorientation environnementale de lIfremer en Nouvelle-Caldonie, avec pour cadre le plus grand lagon du monde et sa biodiversit exceptionnelle, en voie de classement par lUnesco au patrimoine mondial de lhumanit, face aux pressions agricole, aquacole (dont la crevetticulture), minire et urbaine.

    Le projet Ogive : Outils daide la gestion intgre et la valorisationdes cosystmes conchylicoles de Basse-Normandie

    Ogive est un projet destin dvelopper des outils daide la dcision pour les gestionnaires du domaine public maritime. Lactivit conchylicole normande produit chaque anne 27 000 tonnes dhutres creuses et 16 000 tonnes de moules, rpartie au sein de quatre grands bassins gographiques (ctes Ouest et Est du Cotentin, baie des Veys et secteur de Meuvaines). La production dpendant troitement de la qualit du milieu, le maintien et loptimisation de cette filire doivent donc se faire dans un souci de prservation de lenvironnement. Initie en 2005, la premire phase du projet, acheve en mars 2008, a mis en place trois outils :

    Approche cosystmique pour une aquaculture durable

    Le programme europen Ecasa (ECosystem Approach for Sustainable Aquaculture) est arriv a son terme fin 2007.

    Ce programme avait trois objectifs :

    1 // Identifier des indicateurs qualitatifs et quantitatifs des effets de laquaculture sur lenvironnement et vice-versa et valuer leur applicabilit. Ces 58 indicateurs regroupent des outils concernant le benthos, la colonne deau, la gestion de la bande ctire et la socio-conomie.

    2// Dvelopper des outils oprationnels, incluant les modles, pour dcrire et caractriser les relations existantes entre les conditions environnementales et laquaculture, travers la diversit des cosystmes daccueil, des systmes de production aquacole et des espces cultives en Europe. Ces modles permettent de prdire sur un site donn, ltendue spatiale de limpact dinstallations au niveau du sdiment, des communauts benthiques, les risques deutrophisation, la dpltion du phytoplancton, les performances de croissance et de production de certaines espces aquacoles.

    3 // Dvelopper sur quinze sites tests, dont deux franais (Normandie et Charente), des mthodes efficaces dtudes dimpact environnemental et de slection de sites pour laquaculture, pour amliorer lamnagement de la bande ctire. Les effets de laquaculture sont spatialement trs limits (conchyliculture) limits (pisciculture), en fonction essentiellement des conditions hydrodynamiques. Les effets environnementaux sont contrasts, puisque lon observe des effets positifs (rle de la conchyliculture dans le contrle de leutrophisation, effets-rcifs des installations dlevage) et ngatifs (accumulation de matire organique rfractaire sous les installations).

  • 1 // Un outil empirique sous Systme dinformation gographique permettant de rpondre des questions de restructuration petite chelle des zones conchylicoles (par exemple, le dplacement dune concession) et de slection de nouveaux sites propices limplantation dune activit dlevage. Il sagit de produire des indicateurs permettant de dterminer la potentialit dun milieu soutenir une activit conchylicole, mais galement linfluence de cette dernire sur lenvironnement. Ces indicateurs reposent sur des donnes lies lenvironnement physique (bathymtrie, vitesses de courant) et biologique (nourriture disponible pour les bivalves, performances dlevage).

    2 // Des modles dcosystme reproduisant, pour chaque bassin dlevage, les interactions trophiques entre les levages de bivalves et leur environnement. Ces modles permettent de fournir une estimation de la capacit trophique, cest--dire de la biomasse maximale mettre en levage compte tenu du potentiel trophique des zones.

    3 // Des modles dcosystme couplant les interactions trophiques et lhydrodynamisme. Ils permettront de tester diffrents scnarios de ramnagement des zones dlevage. Cette premire phase a bnfici dun co-financement de lIFOP (Fonds dorientation pour la pche), du Conseil rgional de Basse-Normandie, de lAgence de lEau Seine-Normandie, des Conseils gnraux du Calvados et de la Manche ainsi que de la section rgionale conchylicole NormandieMer du Nord.

    Le Groupement de recherche europen AquaDEB

    Le Groupement de recherche europen (GDRE) AquaDEB ( Flexibilit physiologique des animaux aquatiques : analyse partir dun modle gnrique de bilan dnergie et liens avec les processus cologiques et volutifs ), lanc fin 2006, a pour objectif dtudier la sensibilit despces cls (hutre, sole, anchois) la variabilit environnementale dorigine naturelle ou anthropique et de comparer les rponses physiologiques de ces espces diffrentes chelles biologiques (individu, population, cosystme) et temporelles (cycle de vie, dynamique de population, volution).

    AquaDEB utilise un outil thorique, le modle des budgets dnergie dynamique (DEB), qui permet de quantifier les changes et les transformations dnergie entre un tre vivant et son environnement et danalyser la stratgie de rpartition de cette nergie entre diffrentes fonctions vitales (croissance, reproduction, maintenance). Ce modle va servir prvoir, pour diffrents scnarios de perturbations environnementales (eutrophisation excessive, pollution, exploitation, changement climatique), les rpercussions sur la croissance, la reproduction et la survie des individus et de prciser les stratgies de survie et dexpansion des populations selon les espces.

    Trois groupes de travail ont t forms pour :

    valider un modle DEB sur les principales espces tudies (hutre creuse, sole) et tester sa gnricit en comparant, entre les espces, la valeur des diffrents paramtres du modle ;

    valuer le devenir et leffet des contaminants organiques dans les organismes aquatiques ;

    relier les processus physiologiques ( lchelle des individus) aux processus cologiques et volutifs.

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  • Ce GDRE regroupe huit partenaires, en France (universits de Brest, Caen, Nantes, IRD, Ifremer) et aux Pays-Bas (NIOZ, Royal Netherlands Institute for Sea Research ; Wageningen Imares, Institute for Marine Resources & Ecosystem Studies ; Vrije Universiteit Amsterdam) et prvoit une collaboration avec lINRA, BIO-Littoral et lIMR (Institute of Marine Research) de Bergen (Norvge). AquaDEB fonctionne comme un rseau de recherche et de formation, en impliquant entre autres une douzaine de jeunes chercheurs au niveau doctoral et postdoctoral.

    Qualit des procds et des produits

    Face la concurrence internationale et lapport massif de produits daquaculture, les pays industrialiss doivent se diffrencier notamment travers la qualification des produits.

    Les procds dlevage font lobjet de recherches afin dassurer les conditions de vie satisfaisantes pour les animaux et les conditions de la durabilit de laquaculture avec des rejets contrls et des dpenses nergtiques minimises.

    La traabilit, la scurit alimentaire, la dittique et la qualit organoleptique des produits sont une demande socitale forte qui reprsente un enjeu pour la recherche et le secteur professionnel.

    Observations non destructives par imagerie chez lhutre creuse

    La mise au point de techniques dobservation permettant dvaluer directement, travers la coquille, lvolution saisonnire de la physiologie de lhutre creuse (cycles de reproduction, indice de condition, composition biochimique...) vient de se conclure entre lIfremer et le Cemagref. Les techniques de RMN (Rsonance magntique nuclaire) et IRM (Imagerie par rsonance magntique) sur Crassostrea gigas se sont avres toutes deux particulirement prometteuses. Le dveloppement dun instrument bas sur la RMN est envisag en sappuyant sur la technique dimagerie pour :

    loptimisation de squences RMN partir dun appareil possdant un tube dun diamtre denviron 5 cm,

    la description non invasive de la croissance des tissus somatiques (indice de condition) et de la gonade (indice gonadique) par une approche compare RMN/IRM,

    lidentification du sexe par une mthode non destructive (aucun paramtre externe nepermet didentifier le sexe des gniteurs).

    Lestimation du poids sec de lhutre creuse par RMN est obtenue en moins dune minute avec une trs bonne prcision.

    La prdiction des stades de maturation par cette technique a galement permis dobtenir un pourcentage de classement correct proche de 80 %.

    Ainsi, la morphologie de lhutre C. gigas acquise en IRM permet la reconnaissance de la plupart des organes des tissus mous, et les rsultats obtenus par RMN autorisent avec un cot raisonnable, la quantification rapide du poids sec, du niveau de maturation et du sexe des gniteurs pour de futures applications la fois dans les domaines scientifique et professionnel.

    Mise au point dun photobioracteur de production de microalgues

    Ce travail, conduit dans le cadre dune thse Cifre et soutenu par les Pays de la Loire, portait sur le dveloppement technologique dun photobioracteur de type commercial vocation aquacole. Les contraintes technico-conomiques propres ce secteur ont orient les choix vers un racteur simple, modulable en volume, peu onreux en cots de fabrication et de fonctionnement et fiable sur le long terme (culture en continu). Son module lmentaire est compos de deux colonnes verticales, relies par des brides, dans lesquelles le fluide est mis en circulation par une injection dair situe en bas de colonne (racteur airlift) ; afin de minimiser la formation de biofilm sur les parois, un coulement tourbillonnaire est cr au sein de chaque colonne.

    Le couplage entre un modle de transferts radiatifs (modle deux flux) et la cintique de croissance de la microalgue aquacole Isochrysis aff. galbana, a permis de prdire la productivit dans le photobioracteur pour diffrentes conditions opratoires (flux de lumire incident, taux de dilution, diamtre de colonne). Ralises

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    par traage conductimtrique et vlocimtrie images de particules (PIV), les tudes hydrodynamiques ont donn accs aux profils radiaux des composantes axiale et tangentielle de vitesse, aux vitesses dbitantes et lintensit tourbillonnaire. Diffrents dbits dair, types dinjections dair et de brides modifiables au niveau des facteurs de vitesse (FV) ont t tests. Lensemble de ces tudes a permis le dimensionnement dun photobioracteur industriel prototype (18 modules lmentaires, 120 litres), innovant, fonctionnant en continu et ddi spcifiquement au secteur industriel des closeries de mollusques.

    Le transfert dans les locaux dune closerie de production des Pays de la Loire a t ralis. La productivit maximale des cultures en continu est de lordre de 13 106 cell.mL-1.j-1. Cela correspond une augmentation dun facteur suprieur dix par rapport la culture traditionnelle, squentielle en colonne de plastique transparent.

    Dveloppement des hutres creuses polyplodes dans les closeries franaises

    La production contrle dhutres creuses triplodes (3N) est obtenue par le croisement dhutres ttraplodes (4N) et diplodes (2N). La descendance ainsi produite en closerie ne produit quasiment pas de gamtes et amliore ainsi sa constance de qualit de chair et sa rusticit au cours de lanne. LIfremer est en charge de la production et du confinement des hutres ttraplodes la fois pour prserver le milieu naturel et pour fournir aux closeurs franais des gniteurs selon un protocole standardis, bas sur la cession dune licence dexploitation du brevet europen n0752814 tetraploid shellfish . Les gniteurs ttraplodes actuellement utiliss ont t obtenus suite au croisement de femelles triplodes, possdant un niveau lev de fertilit avec des mles diplodes. Des recherches rcentes en cytogntique lIfremer ont permis de proposer des amliorations sensibles sur les techniques dobtention et la qualit potentielle des gniteurs 4N.

    Deux brevets viennent ainsi dtre dposs. Le premier est bas sur le croisement de femelles diplodes sans tri ovocytaire pralable avec des mles ttraplodes, le tout en amliorant significativement les conditions dinduction des ttraplodies et des diffrentes tapes zootechniques pour les larves et le naissain. Le deuxime brevet permet de saffranchir, pour obtenir des individus 4N, du passage toujours dlicat par les triplodes. Il autorise le passage direct du stade diplode au stade ttraplode, ouvrant la voie un largissement notable de la base gntique de ces produits et la possibilit, aprs une campagne de testage des performances de leurs descendances, de fournir terme la filire triplode nationale et internationale.

    Amlioration de la qualit du naissain de moule en closerie

    Contrairement lhutre, la totalit du naissain de moule mis en culture est aujourdhui issu de captage naturel. Des proccupations dordre environnemental et/ou conomique amnent un nombre croissant de rgions productrices importer du naissain dautres rgions (Nouvelle-Zlande, Australie, tats-Unis). Dans le cadre du projet europen Blue Seed , cinq partenaires privs et quatre instituts de recherche (France, Pays-Bas, Royaume-Uni et Espagne) ont permis la mise au point dun protocole dlevage (conditionnement, stade larvaire, fixation, prgrossissement).

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    Ce guide inclut galement un protocole de production de triplodes par induction directe, pour la premire fois en Europe. Un petit effectif de moules ttraplodes a t produit. Une concertation avec les acteurs de la filire sera ncessaire avant de pouvoir estimer lintrt de cette dernire avance en terme dapplication aquacole.

    Dcontamination, dsinfection et purification des organismes marins

    Cest lutilisation terre de systmes de conservation sur plusieurs semaines de produits destins la vente en priode de crise. Elle pourra se raliser en eau ou hors deau et devra rpondre aux exigences de qualit fixes par la profession et par les services sanitaires officiels.

    Dans limpossibilit dutilisation deau non contamine par les algues (eaux salessouterraines par exemple), elle aura recours des procds de re-circulation de leau par souci dconomie.

    La sauvegarde ne fera pas appel des techniques de traitement des eaux de rejet puisque les animaux ainsi stocks seront imprativement sains ds le dbut de la stabulation. En revanche, des procds de traitement de leau devront maintenir le circuit ferm en eau de mer propre.

    Enfin, dans lhypothse o les dlais de fermeture devraient tre prolongs de plusieurs semaines, des procds garantissant le maintien de la qualit de chair seront tudis (basse temprature ou/et nourrissage).

    La dtoxification des coquillages

    Elle interviendra faute davoir pu enclencher, temps, les procdures de sauvegarde. Lobjectif sera de rendre, dans les meilleurs dlais, les coquillages nouveau acceptables pour la consommation. Les tudes sorienteront vers lapport dalgues fourrages et/ou dargiles pour acclrer la dcontamination des coquillages. Dans ce cas, les effluents devront tre imprativement traits pour viter toutes propagations de toxines dans le milieu naturel.

    La finition des coquillages

    Elle regroupe lensemble des procds permettant lamlioration de la qualit de chair des coquillages par lapport satit dalgues fourrages.Dans un premier temps, celle-ci ne pourra tre envisage quen circuit ouvert et hors priode risque defflorescences toxiques. Ainsi, elle permettra la valorisation et lamortissement des infrastructures prvues pour la gestion de crise.

    Comsaumol

    Suite aux pisodes rcurrents de dveloppement defflorescences toxiques, lIfremer a propos au comit national de la conchyliculture un projet de recherche sur trois ans (2007- 2009), dnomm maintien de la commercialisation par la sauvegarde et la dtoxification des mollusques Comsaumol qui sefforcera de rpondre la question suivante : Quels moyens peuvent tre mis en uvre terre par les entreprises pour minimiser limpact conomique de lapparition dalgues toxiques sur leurs sites de production ? Ce projet a t valid par le COSTE (Comit dorientation scientifique et technique et dvaluation) et le PFPA (Ple filire produits aquatiques). Cinq rgions littorales ont notifi leur soutien financier.Le principal objectif de cette tude est de donner aux conchyliculteurs, les moyens et les techniques de sauvegarde et de dtoxification ncessaires et transfrables tous les bassins conchylicoles franais soumis des efflorescences toxiques. La conception des procds devra tenir compte des spcificits de ressources en eau sale (eau souterraine, eau de percolation, eau de dcantation) propres chaque bassin producteur. Ces tudes seront compltes par une estimation du cot des procds afin de tendre vers le meilleur amortissement des infrastructures en dehors des priodes de crises (ex : finition de la qualit des coquillages).

  • Gestion globale des ressources marines et des risques dans les espaces ctiers (Gerrico) (2007-2009)

    Financ partiellement par la rgion des Pays de la Loire, ce projet concerne une centaine de chercheurs (dont quatre doctorants et cinq post-doctorants) de lIfremer et de luniversit de Nantes autour dun site atelier : la baie de Bourgneuf.

    Les proprits physiques de cet cosystme (richesse leve en eaux sales souterraines, influence de la Loire et des bassins versants), conjugues aux activits humaines plurisculaires (conchyliculture, saliculture) ou plus rcentes (tourisme) font de cet espace un lieu de rencontre et dexprimentation particulirement bien adapt pour des travaux scientifiques croiss, sur trois axes : bioressources marines, analyse des risques en conchyliculture et saliculture et interaction nature-socit.

    Les premiers rsultats marquants du projet sont les suivants :

    mise au point dun photobioracteur pilote de 120 litres pour la culture de microalgues des fins dalimentation des coquillages en closerie ;

    validation lchelle pilote dun procd de macration enzymatique des macroalgues ;

    mise en vidence du seuil de temprature de 14C de leau de mer permettant de conserver la qualit de chair des hutres stockes en circuit ferm tout en vitant le nourrissage ;

    mise en vidence pour la premire fois de la toxicit de peptabols (peptides linaires lipophiles) issus de champignons marins microscopiques sur les larves dhutres Crassostrea gigas ;

    confirmation de lintrt dutiliser un capteur passif (sachet contenant une rsine polymre SPAT ) pour concentrer les toxines dissoutes et lipophiles (DSP) contenues dans leau de mer ;

    ralisation denqutes conomiques et de perception des risques au niveau des ostriculteurs de la baie de Bourgneuf ;

    ralisation dun premier modle hydrodynamique de la baie de Bourgneuf ;

    comparaison de stratgies de modlisation partir dun jeu de donnes environnementales communes (hydrobiologie et croissance) acquises en baie de Bourgneuf.

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    Le Rseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines(Rephy)

    Premier maillon de la chane alimentaire marine, le phytoplancton se constitue dalgues microscopiques. Gnralement inoffensives, certaines espces (Dinophyis, Alexandrium et Pseudo-nitzschia) sont cependant connues pour produire des phycotoxines, nocives ou mortelles pour les animaux vivant dans le milieu marin ou lorsque ceux-ci sen nourrissent, comme les coquillages, provoquant ainsi lintoxication de leur consommateur. Les symptmes varient selon les toxines : diarrhe pour les DSP, paralysie pour les PSP et amnsie pour les ASP. Le rseau Rephy est charg de la surveillance de ce risque sur les ctes franaises depuis 1984. Pour cela, des tests sont effectus dans 242 points o se mesure la concentration en cellules par litre deau, appuys par des tests sur la chair des coquillages lorsque les espces toxiques sont repres dans une zone. Les rsultats de ces tudes, outre lmission dalertes la consommation, ont mis en vidence des zones sensibles favorables la prolifration de ce type de phytoplancton.

  • Slection de publications sur le thme Surveillance et optimisation des ressources aquacoles

    F. Batista, et al., Detection of ostreid herpesvirus 1 DNA by PCR in bivalve molluscs: A critical review, Journal of Virological Methods, January 2007; 139 (1), 1-11.

    C. Burge, et al., Summer seed mortality of the Pacific oyster, Crassostrea gigas Thunberg grown in Tomales Bay, California, USA: The influence of oyster stock, planting time, pathogens, and environmental stressors, Journal of Shellfish Research, April 2007; 26 (1), 163-172.

    C. Cahu, J. Infante, Ontogenesis of digestive functions and nutritional requirements in marine fish larvae., Cybium, June 30 2007; 31 (2), 217-226.

    L. Degrernont, B. Ernande, E. Bedier, P. Boudry, Summer mortality of hatchery-produced Pacific oyster spat (Crassostrea gigas). I. Estimation of genetic parameters for survival and growth, Aquaculture, February 14 2007; 262 (1), 41-53.

    C. Di-Poi, J. Attia, C. Bouchut, G. Dutto, D. Coves, M. Beauchaud, Behavioral and neurophysiological responses of European sea bass groups reared under food constraint, Physiology and Behavior, March 16 2007; 90 (4), 559-566.

    S. Dubois, J. Marin-Leal, M. Ropert, S. Lefebvre, Effects of oyster fanning on macrofaunal assemblages associated with Lanice conchilega tubeworm populations: A trophic analysis using natural stable isotopes, Aquaculture, October 3 2007; 271 (1-4), 336-349.

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  • // RESSOuRCES HAlIEuTIquES, ExplOITATION DuRABlE ET vAlORISATION

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  • 142 millions de tonnes (Mt), cest la production mondiale de poissons, mollusques et crustacs gnre en 2005, par la pche et laquaculture pour une valeur totale de 127 mil