1ère ANNEE

Présentation des unités d’enseignement :

- Anatomie : encolure et tronc - Anatomie : membres et tête - Anglais - Bactériologie générale - Bactériologie systématique - Bases en biostatistique - Bases de la nutrition - Biologie moléculaire et génétique précliniques - Biologie parasitaire - Bromatologie - Chimie biologique I

- Epidémiologie générale, Prophylaxie - Statistique appliquée à l’épidémiologie

- Ethologie - bien-être animal – protection animale - Filière agro-alimentaire - Histoire de la médecine et des sciences vétérinaires - Histologie - Immunologie générale - Notions de base en sciences du médicament - Physiologie générale, physiologie de la circulation, physiologie de la

respiration - Physiologie de la reproduction et fonctions de l’appareil urinaire

- Physique biologique médicale - Zootechnie générale

Unité d’enseignement facultative :

- Clinique faune sauvage

Unité : Anatomie des animaux domestiques

UE : ANATOMIE : ENCOLURE ET TRONC Semestre : 5 Enseignant responsable : N. CREVIER-DENOIX Personnes intervenant dans l’UE : N. CREVIER-DENOIX, C. DEGUEURCE, C. ROBERT

H. CHATEAU + vacataires pour les dissections Heures de formation par étudiant : Cours : 23 heures Crédits : 5 TD : 9 heures TP : 40 heures (dissections) A ces horaires, s’ajoutent 2h de présentation de radiographies du thorax et de l’abdomen, et 6 h environ de révisions d’ostéologie et de radiologie (ostéologie, thorax et abdomen), où les étudiants sont autonomes. OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables de :

1. Connaissances : - citer l’organisation générale de tous les appareils traités dans l'U.V., décrire et dessiner la

conformation et la topographie des formations anatomiques présentées ; - reproduire, dans cet objectif, les dessins sélectionnés (concepts de base) et réalisés devant

eux, en cours.

2. Application – Raisonnement et transfert : - adapter cet acquis aux applications professionnelles en matière de propédeutique, de

sémiologie, d’imagerie médicale, de chirurgie et d’inspection des denrées animales. Une liste d’objectifs spécifiques sera distribuée par les enseignants au début de chaque

cours. En voici quelques exemples : à l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables de :

. énoncer et situer sur l’animal les zones d’auscultation et de percussion des poumons ;

. énoncer et situer sur l’animal les zones de projection de la silhouette du coeur et de ses orifices ;

. décrire l’anatomie radiographique du thorax sur des clichés de face et de profil chez le Chien et le Chat;

. palper, sur l’animal vivant, les noeuds lymphatiques superficiels et de citer les noeuds lymphatiques du bassin palpables par voie rectale ;

. citer les viscères du bassin et de l’abdomen palpables par voie rectale (Equidés, Bovins);

. expliquer les diverses anomalies de position des testicules (cryptorchidie) ;

. corréler l’anatomie des organes génitaux aux états physiologiques de ces organes ;

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. décrire les particularités spécifiques de l’anatomie du placenta chez les Mammifères domestiques ;

. énoncer les applications professionnelles liées à l’anatomie des annexes foetales en gynécologie-obstétrique. PROGRAMME Appareil locomoteur (6h) : Squelette (1,5 h), Articulations (2h), Muscles (1,5h), Système nerveux (1h) Appareil respiratoire (1h) : Trachée-poumons, Plèvres et topo. thorac. (1h). Angiologie (4h) : Coeur (1h), Aorte, Veines caves et porte (1h), Noeuds lymphatiques du tronc (2h). Appareil digestif (5h) : Estomac et Intestin des Monogastriques (1h), Intestin et Topographie abdominale du Cheval (2h), Estomac des Ruminants (1h), Grand Omentum et topographie abdominale des Ruminants (1h). Appareil uro-génital (7h) : Reins et voies urinaires (1h), Appareil génital mâle (2h), Appareil génital femelle (2h), Mamelles (1h), Annexes foetales et placenta (1h).

- Travaux dirigés (groupes de 30 étudiants) Total : 9 h Ostéologie du tronc (6h) - Coeur (2 h) - Appareil génital Carnivores (1h)

- Travaux pratiques (Dissections - groupes de 30 étudiants) Total : 40 h Encolure -Thorax (10h) – Abdomen - Bassin (10h) - Cheval (10h) - Ruminants (10h). CONTROLES DE CONNAISSANCES - Un contrôle de connaissances en fin de semestre. - Interrogations de dissection et de diagnose à la fin de chaque semaine de dissection. - Examens généraux (fin de semestre).

Unité : Anatomie des animaux domestiques

UE : ANATOMIE : MEMBRES ET TETE Semestre : 6 Enseignant responsable : H. CHATEAU Personnes intervenant dans l’UE : N. CREVIER-DENOIX, C. DEGUEURCE, C. ROBERT, H. CHATEAU + vacataires pour les dissections Heures de formation par étudiant : Cours : 14 heures Crédits : 4,5 TD : 12,5 heures TP : 40 heures (dissections) OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront: 1. Connaissances : Avoir acquis les bases anatomiques indispensables à l’exercice de la médecine vétérinaire au sens large, dans le domaine des animaux domestiques. Pour cela, ils devront être capables de : - décrire pour tous les appareils ou les régions étudiés dans l'U.V., la conformation et la topographie des organes et des formations anatomiques présentés ; - reproduire, dans cet objectif, les dessins sélectionnés et réalisés devant eux, en cours. 2. Application – Raisonnement et transfert : Savoir utiliser cet acquis : 1- Dans le cadre de l’étude des grandes fonctions (enseignement de physiologie) et de l’anatomie microscopique (histologie) et pathologique. 2- Pour les applications professionnelles en matière de :

- propédeutique et de sémiologie (inspection, palpation, percussion, auscultation) : examen clinique d’un animal, - imagerie médicale (en particulier: analyse et interprétation de clichés radiographiques et d’images échographiques), - chirurgie (abord et technique), - autopsie, - inspection des denrées animales.

Une liste d’objectifs spécifiques sera distribuée par les enseignants au début de chaque cours. Les objectifs des semaines de dissection seront affichés sur le panneau de l’UP au début de chaque semaine pratique. L’ensemble de ces documents est disponible en ligne à l’adresse : http://cours.vet-alfort.fr/ (rechercher : « Anatomie des animaux domestiques » ; auteurs : « les enseignants de l'unité d'anatomie »)

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PROGRAMME Intitulé Durée

Boulet du cheval 1 h Grasset du Chien 1 h Groupes et actions musculaires des membres 1 h Allures du cheval 1 h Tendons et gaines de la main 1 h Productions cornées et phanères 1 h Plexus brachial 1 h Plexus lombo-sacral 1 h Pharynx et Larynx 1 h Nerfs trijumeau et intermédio-facial 1 h Nerfs glosso-pharyngien, vague, accessoire et hypoglosse

1 h

Oeil 2 h

CM

Oreille 1 h Ostéologie du membre thoracique 2 h Radio-anatomie du membre thoracique 1 h Ostéologie du membre pelvien 2 h Ostéologie de la tête 2 h Dents 2 h Cavité orale, langue et glandes salivaires 1,5 h

TD

Pharynx, cavités nasales, sinus, larynx 2 h Dissection du membre thoracique 10 h Dissection du membre pelvien 10 h Dissection de la tête 10 h Anatomie appliquée des membres du Cheval 5 h

TP

Œil 5 h CONTROLES DE CONNAISSANCES - Un contrôle de connaissances en fin de semestre (coef 4). - Interrogations de dissection et de diagnose à la fin de chaque semaine de dissection (coef 6). - Examens généraux (fin de semestre).

Discipline : Anglais

UE : ANGLAIS Semestre : 5 Enseignant responsable : M. CONAN Personnes intervenant dans l’UE : M. CONAN Heures de formation par étudiant : TD : 14 Crédits : 1,5 Auto-formation : 6 OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : • de comprendre un texte scientifique traitant d’un sujet connu. • de trouver une information pertinente dans des textes de difficulté moyenne, des

émissions spécialisées (reportages, documentaires…) produites dans un langage clair et standard.

• d’en rédiger une courte synthèse. • d’utiliser ces informations dans une présentation succincte

PROGRAMME Acquérir le lexique et la syntaxe communs aux textes scientifiques. Acquérir le lexique propre aux sciences de la vie (ex : anatomie, biodiversité…) Développer des stratégies pour mieux comprendre un document, tant à l’écrit qu’à l’oral.

PRESENCE AUX TD L’étudiant ayant deux absences non-justifiées verra sa note d’UE diminuée de deux points. Au delà, il aura zéro. CONTROLES DE CONNAISSANCES A préciser ultérieurement

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Discipline : Anglais

UE : ANGLAIS Semestre : 6 Enseignant responsable : M. CONAN Personnes intervenant dans l’UE : M.CONAN Heures de formation par étudiant : TD : 14 Crédit : 1 Autoformation : 6 OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : D’utiliser tous types de documents (articles publiés dans un Scientific Journal,

émissions spécialisées …) pour approfondir leurs connaissances sur un sujet connu. De présenter ces nouvelles informations, tant à l’écrit qu’à l’oral, de les commenter,

de les compléter par un échange dans le groupe.

PROGRAMME

Approfondir les compétences de compréhension et d’expression à partir de thèmes et supports liés à la profession vétérinaire.

Acquérir le lexique de spécialité (médical et vétérinaire) Dans le cadre de la mobilité internationale, faire une recherche de stage (+ rédaction d’un

CV et d’une lettre de motivation) PRESENCE AUX TD L’étudiant ayant deux absences non-justifiées verra sa note d’UE diminuée de deux points. Au delà, il aura zéro. CONTROLES DE CONNAISSANCES A préciser ultérieurement.

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Unité : Pathologie générale, Microbiologie, Immunologie

UE : BACTERIOLOGIE GENERALE Semestre : 5 Enseignant responsable : H.J. BOULOUIS Personnes intervenant dans l’UE : H-J. BOULOUIS ; F.QUINTIN-COLONNA ; C. COLMIN Heures de formation par étudiant : Cours : 13 Crédits : 2 TD : 6 OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : - de dessiner et décrire les différents éléments de structure (éléments constants et inconstants) et la morphologie des bactéries ; - de décrire les différentes modalités de transfert et de modification de l’information génétique des bactéries, leurs caractéristiques et leurs intérêts ; - de décrire les principales sources de nutriments et d’énergie des bactéries ; - de dessiner et commenter les principales courbes de croissance bactérienne ; - de décrire les facteurs conditionnant la croissance bactérienne ; - de décrire la réalisation d’une coloration différentielle ; - de décrire le principe de l’identification bactérienne ; - de lire des résultats d’identification bactérienne ; - de décrire le principe et la réalisation d’un antibiogramme ; - de décrire les principes de base régissant l’écologie microbienne

PROGRAMME Cours : Anatomie bactérienne (2h) Physiologie bactérienne (2h) Génétique bactérienne (1h) Classification et Taxonomie bactérienne (1h) Ecologie microbienne (2h) Facteurs du pouvoir invasif (2h) Toxine GLP (1 h) Toxines protéiques (2h).

Travaux dirigés Séance 1 : Identification et taxonomie bactérienne Séance 2 : Evaluation de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques Séance 3 : Génétique fonctionnelle des bactéries / Analyse d’article CONTROLES DE CONNAISSANCES Contrôle théorique : QCM et QROC en fin d’enseignement. Contrôle pratique : QROC en fin d’enseignement.

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Unité : Pathologie générale, Microbiologie, Immunologie

UE : BACTERIOLOGIE SYSTEMATIQUE Semestre : 6 Enseignant responsable : HJ. BOULOUIS Personnes intervenant dans l’UE : F. QUINTIN-COLONNA, HJ. BOULOUIS, L.FREYBURGER

Heures de formation par étudiant : Cours : 12 heures Crédits : 2,5 TD : 6 heures TP : 8 heures OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE - Décrire les grands syndromes infectieux d’origine bactérienne ; - Associer le nom des principales maladies bactériennes aux espèces qui les provoquent ; - Désigner les espèces animales sensibles à certaines maladies infectieuses ; - Pour chaque espèce bactérienne d’intérêt vétérinaire :

. Citer les caractères de définition ; Décrire les éléments de morphologie et de structure nécessaires à l’identification ; . Décrire les propriétés antigéniques nécessaires à l’identification, au diagnostic et à la prophylaxie ; . Associer les éléments de biologie (habitat naturel, propriétés de résistance ; vectorisation,…) à l’épidémiologie et la clinique des maladies induites ; . Décrire les éléments de physiopathologie nécessaires à la compréhension du tableau clinique ; . Citer les méthodes de mise en évidence de l’infection ; . Citer les méthodes de prophylaxie des maladies induites ; . Citer les antibiotiques utilisables en pratique ; . Décrire les particularités des prélèvements nécessaires au diagnostic de laboratoire et les techniques de prélèvements employées.

- Décrire les mécanismes cellulaires et moléculaires de résistances aux antibiotiques et antibactériens. - Réaliser, lire et interpréter une/des colorations différentielles ; - Mettre en œuvre une identification bactérienne ; - Effectuer un antibiogramme ; PROGRAMME Heures de Cours : 11 heures Famille des Entérobactéries 2 heures Autres Bactéries Gram négatif 2 heures Anaérobies 1 heure Mycobactéries 1 heure Rickettsiales/Chlamydiales 2 heures Spirochétales/Légionellales 1 heure Mycoplasmes 1 heure Bactéries Gram positif 2 heures TP : 4 séances de 2heures Bactériologie systématique et médicale : Isolement, identification, antibiogramme. TD : 3 séances de deux heures Séance 1 : Prélèvements en bactériologie Séance 2 : Facteurs de pouvoir pathogène des bactéries Séance 3 : Diagnostic recourant à d’autres techniques que bactériologique classique CONTROLES DE CONNAISSANCES modalités confirmées en cours d’année. Contrôles théoriques : QCM et QROC (avec et sans documents) en fin de semestre Contrôles pratiques : TP : Compte rendu noté de TP ; TD : QROC

Discipline : Nutrition - Alimentation

UE : BASES DE LA NUTRITION Semestre : 6 Enseignant responsable : B.-M. PARAGON Personnes intervenant dans l’UE : B.-M. PARAGON, D. GRANDJEAN Heures de formation par étudiant : Cours : 22h Crédits : 2,5 TD : 10h OBJECTIFS GENERAUX DE LA MATIERE Savoirs Identifier les principales relations entre alimentation, production, reproduction et santé dans les espèces animales les plus représentées au sein des différentes branches d'activité du vétérinaire généraliste omnipraticien : carnivore domestique, bovins, monogastrique d’élevage et cheval. Ces savoirs permettront d'appréhender de façon non spécifique ces relations dans les autres espèces (petits ruminants, lapin, porcs, volailles en particulier), et de les approfondir de façon spécifique si d’autres orientations professionnelles le justifient. Savoirs-faire Être en mesure d’analyser une ration pour les principales espèces animales précitées afin d’identifier d’éventuels déséquilibres nutritionnels, et de calculer une ration équilibrée Identifier correctement le statut nutritionnel d’un animal. Savoirs-être Être capable d'intégrer à ses conseils et traitements les éléments de nutrition et alimentation spécifiques à l'état physiologique ou pathologique de l'animal.

OBJECTIFS D’ENSEIGNEMENT Au cours de cet enseignement, les étudiants envisageront :

Les principales classes de principes nutritifs : eau, protides, glucides, lipides, minéraux majeurs et oligo-éléments, vitamines hydro- et liposolubles, en identifiant les principales différences relatives à leur nature chimique, leur utilisation digestive et métabolique par les principales espèces animales domestiques.

Les principales interférences existant entre les divers principes nutritifs. Le rôle de chacune de ces catégories de principes nutritifs, les quantités optimales, les

valeurs minimales (seuils de carences) et maximales (seuils de toxicité) pour chacun d’eux chez les principales espèces domestiques.

Les contraintes nutritionnelles majeures chez les principales espèces domestiques et dans les principales situations physiologiques (entretien, gestation, lactation, croissance).

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Les principales maladies et les conséquences zootechniques associées à un excès, une carence ou un déséquilibre en ces nutriments.

Les principales situations à risques inhérents aux affections d'origine alimentaire (nutritionnelle ou métabolique) dans une démarche de médecine préventive tant individuelle que collective.

Les relations alimentation-qualité dans le cadre des productions animales, au delà de la seule prise en compte de la productivité. PROGRAMME DE L’UV

• Enseignement théorique :

Besoin alimentaire 2h Energétique alimentaire 3h Les glucides en alimentation animale 3h Les lipides en alimentation animale 3h Les protéines en alimentation animale 3h Les minéraux majeurs en alimentation animale 2h Les oligo-éléments en alimentation animale 2h Les vitamines en alimentation animale 2h Les additifs alimentaires et adjuvants de l’élevage 2h

Enseignement dirigé :

TD à propos de l’énergétique alimentaire 2h TD à propos de la fibre alimentaire 2h TD à propos des acides gras essentiels 2h TD à propos de la qualité des protéines 2h TD à propos de l’équilibre minéral 2h

CONTROLES DE CONNAISSANCES Une courte question de synthèse et un QROC/commentaire de diapo/ portant sur le programme théorique des bases de l’alimentation et les discussions ouvertes des TD

Discipline : Biostatistiques

UE : BASES EN BIOSTATISTIQUE Semestre : 5 Enseignant responsable : M. SANAA Personnes intervenant dans l’UE : M. SANAA Heures de formation par étudiant : Cours : 2 heures Crédit : 1 TD : 10 heures OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE . A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables :

- d’utiliser et interpréter les résultats des méthodes descriptives simples (tableaux statistiques à une ou deux dimensions, diagrammes en bâtons ou circulaires, histogrammes, graphiques décrivant les tendances chronologiques) ;

- de calculer les différents types de probabilités (marginales, conjointes et conditionnelles)

- d’indiquer les principales lois de distribution de probabilité et leurs domaines d’application (BINOMIALE, POISSON, HYPERGEOMETRIQUE, NORMALE, χ2, t de STUDENT, F de Fisher) ;

- décrire les relations entre les différentes lois de distribution de probabilité et indiquer dans quelles conditions on a la convergence vers une loi Normale ;

- de calculer l’intervalle de confiance de l’estimation d’un paramètre de population à partir d’un échantillon (moyenne, proportion, écart-type) ;

- d’utiliser les tests statistiques simples : comparaison de deux moyennes, de deux pourcentages, de deux écart-types ;

- d’interpréter les résultats d’un test statistique, en intégrant les notions de risque (α et β), la valeur de p et la signification biologique

PROGRAMME Statistiques descriptives Probabilités Principales lois de probabilité et utilisation des tables statistiques Fluctuations d’échantillonnage, intervalle de fluctuation Estimation : intervalle de confiance d’un pourcentage, d’une moyenne et d’une variance Principe des tests Comparaison de deux pourcentages. Test du Chi2 Comparaison de deux moyennes

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Comparaison de deux variances CONTROLES DE CONNAISSANCES

Contrôle continu par interrogation écrite au début de chaque TD (coefficient 3), et récapitulatif en fin d’UV (coefficient 3) sans note et document. Examen en fin de semestre (coefficient 4 ; dispense pour les étudiants ayant obtenu au moins 12 /20 au contrôle continu).

PRE-REQUIS : (indispensables à la matière) Notions de calcul de probabilités ; principales lois de distribution des probabilités (loi Normale, loi Binomiale, Loi de Poisson), le théorème central limite, les principaux paramètres statistiques (moyenne, mode, médiane, écart-type, variance, percentiles …).

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Unité : Génétique médicale et moléculaire

UE : BIOLOGIE MOLECULAIRE ET GENETIQUE PRECLINIQUES Semestre : 6 Enseignant responsable : M. ABITBOL Personnes intervenant dans l’UE : M. ABITBOL, P. BOSSE, J-F COURREAU Heures de formation par étudiant : Cours : 20 h Crédits : 3,5 TD : 18 h TP : 4 h OBJECTIFS D’ENSEIGNEMENT

L’objectif à court/moyen termes de cet enseignement est de préparer les étudiants à recevoir les enseignements de diverses UE qui font appel à des connaissances de base en génétique et génétique moléculaire (Exemples : Biologie moléculaire et Génétique paracliniques, modules de Zootechnie spéciale, Biologie du développement, Physiologie de la reproduction, etc). En ce sens, il abordera les grandes lois de la génétique des organismes diploïdes, complétant l'étude de la génétique des organismes haploïdes réalisée en classe préparatoire. Il abordera en parallèle, les bases théoriques et techniques de la Génétique Moléculaire. L’association de ces deux facettes de la génétique dans une même UE vise à ce que les étudiants soient convaincus de leur forte complémentarité et les apprennent de façon intégrative.

L’enseignement incite l’étudiant à mettre ses connaissances en génétique au service de son cursus

d’études vétérinaires. Ainsi, concernant l’ethnologie des carnivores domestiques (cf UE « Connaissances du chien et du chat sains » en A1-S6), elle ne doit pas être apprise sous un angle purement descriptif. Chaque fois que possible, le phénotype d’une race donnée devra être analysé à partir des gènes qui ont été artificiellement sélectionnés pour l’obtenir. Ce mode de raisonnement est facilité au travers d’un thème récurrent utilisé dans le module « Génétique et biologie précliniques » : la génétique de la couleur du pelage chez les mammifères domestiques.

Au delà d’un objectif purement scolaire (réussite aux contrôles de connaissances), l’enseignement vise, pour

le long terme, à une utilité dans la carrière professionnelle. Ces notions contribueront fortement à créer l’image de généraliste du monde du vivant (ce qui est attendu du vétérinaire praticien sur le plan marketing), et renforceront les compétences de spécialiste des animaux de rente et de loisirs. En outre, cette base permettra d’actualiser rapidement et plus facilement les connaissances du futur praticien dans le domaine de la recherche biologique. OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables :

- de définir tous les termes spécifiques présentés dans le programme d'enseignement et dont la liste est distribuée en début de semestre,

- de décrire la structure du génome et des gènes chez les Mammifères (pré-requis), - de décrire et donner les applications des différentes techniques de biologie moléculaire vues en cours, - de rendre compte des mécanismes moléculaires permettant d’expliquer la survenue de maladies génétiques chez les

Mammifères, - de décrire le mode de transmission et les causes moléculaires de la myopathie de Duchenne chez l’Homme, le

Chien et la Souris, - d’expliquer le principe de la création et l’intérêt des animaux transgéniques, - d'expliquer comment sont déterminés génétiquement les caractères qualitatifs et les caractères quantitatifs, - d'expliquer la notion d'héritabilité et l'intérêt qu'elle présente pour l'amélioration génétique des caractères quantitatifs,

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- pour les exemples présentés dans le programme d'enseignement, de décrire les modes de transmission, les interactions entre gènes, les processus biologiques perturbés par les mutations, - pour les exemples présentés dans le programme d'enseignement, d'expliquer comment l'analyse au niveau

moléculaire permet de comprendre les phénotypes observés, - de résoudre une analyse génétique en utilisant les pedigrees et/ou les croisements dirigés, - de définir une population en équilibre de Hardy et Weinberg et d'expliquer la variation de sa composition

génétique en fonction de l'effectif, de la sélection opérée et du mode de reproduction, - de résoudre des cas simples de calculs de coefficients de consanguinité.

PROGRAMME Cours : Bases de la génétique factorielle des organismes diploïdes (3h). Introduction à la part de la génétique dans les maladies animales et humaines (1h). Les outils du génie génétique (3h). Clonage cellulaire de l’ADN (2h). Présentation des concepts récents de pathologie moléculaire (2h). Concepts principaux de génétique des populations et de génétique quantitative appliqués en Zootechnie spéciale (6h). Modification du matériel génétique chez les Mammifères (3h). TP et TD : Pedigrees : écriture, utilisation pratique pour la détermination du mode de transmission des caractères héréditaires (2h). Couleurs du pelage chez le chat domestique, illustration pratique des principaux concepts de la génétique factorielle au travers de problèmes utilisant les divers locus déterminant la pigmentation chez le chat (2 x 2h). Techniques de biologie moléculaire : illustration pratique à travers l’exemple de la Myopathie de Duchenne de l’Homme, du Chien et de la Souris (2h TD + 2 x 2h TP). Mutations : illustration concrète de la nature et des mécanismes moléculaires d’action des mutations au travers d’un exemple de variation de pigmentation chez la souris (gènes agouti et extension) (2 x 2h et 1h). Approche du principe de cartographie d’une mutation chez la Souris (1h). Génétique des populations : au travers d’exercices d’application, manipulation de la Loi de Hardy Weinberg, évaluation des effets de la sélection, calcul de coefficients de consanguinité (2 x 2h). CONTROLES DE CONNAISSANCES Contrôle de semestre unique sans note ni document Coefficient 6 sur 10 Questionnaire mixte type Questions à Choix Multiples (QCM) et Questions à Réponses Ouvertes et Courtes (QROC) portant sur l’ensemble des cours, TD et TP. Exercice(s) d’application directe des cours et TD. ATTENTION : conformément à la décision qui a été acceptée en C.E.V.E., les absences en séances de T.D. seront sanctionnées de la façon suivante : - moins 2 points sur la note de contrôle de semestre du module pour 1 absence non justifiée auprès de

l’enseignant réalisant la séance - moins 5 points sur la note de contrôle de semestre du module pour 2 absences non justifiées auprès de

l’enseignant réalisant la séance - note « 0 » au contrôle de semestre du module pour plus de 2 absences non justifiées auprès de l’enseignant

réalisant la séance Oral de fin de semestre pour les étudiants ayant une note de semestre inférieure à 12 sur 20. Coefficient 4 sur 10 Présentation, après préparation, d’un sujet théorique tiré au hasard sur une liste distribuée à l’avance.

Unité : Parasitologie et Maladies parasitaires

UE : BIOLOGIE PARASITAIRE Semestre : 6 Enseignant responsable : J. GUILLOT Personnes intervenant dans l’UE : R. CHERMETTE, J. GUILLOT, L. HALOS, B. POLACK Heures de formation par étudiant : Cours : 10 heures Crédits : 1,5 TD : 6 heures OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables de :

- exposer les caractères généraux des organismes parasites eucaryotes ; - décrire les modalités de la rencontre hôte / parasite ; - décrire les mécanismes de défense de l'hôte et d'échappement du parasite ; - exposer et interpréter les caractères épidémiologiques généraux des parasitoses animales ; - exposer la démarche et les grandes modalités du diagnostic des parasitoses animales ; - exposer les principes de la lutte vis-à-vis des parasitoses animales ; - exposer l’impact des parasitoses en Santé publique vétérinaire et les divers cycles des

zoonoses parasitaires illustrés par des exemples majeurs.

PROGRAMME Enseignement théorique • Généralités concernant: parasites, parasitisme, cycles évolutifs ............................ 3 heures • Analyse du système hôte / parasite ......................................................................... 4 heures • Epidémiologie des parasitoses animales................................................................. 1 heure • Diagnostic des parasitoses et lutte contre les parasitoses animales ........................ 1 heure • Zoonoses d’origine parasitaire................................................................................ 1 heure Enseignement pratique Les TD (3 séances interactives) porteront sur les : • critères utilisés en zoologie permettant l’approche de la classification et de la diagnose des espèces animales d’intérêt vétérinaire ; • systèmes de modélisation des relations hôte-parasite ; leurs applications aux méthodes de lutte; • l’impact des parasitoses animales en Santé publique au cours de la formation vétérinaire. CONTROLES DE CONNAISSANCES Interrogation écrite : coefficient 6 Examen final oral : coefficient 4

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Discipline : Nutrition - Alimentation

UE : BROMATOLOGIE Semestre : 5 Enseignant responsable : D. GRANDJEAN Personnes intervenant dans l’UE : D. GRANDJEAN Heures de formation par étudiant : Cours : 10 heures Crédits : 2 TD : 8 heures OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables :

- de savoir reconnaître les aliments de base - de connaître les grandes lignes de leur composition - de connaître les bases du rationnement par espèce - d’être capable d’équilibrer une ration

Savoir…ce qui caractérise une matière première alimentaire Savoir être…un conseiller critique pour l’éleveur ou le propriétaire Savoir faire… un rationnement équilibré

PROGRAMME DE L’UV Cours théoriques :

Analyse alimentaire : 1 h Aliments Veau – Bovins engrais 2 h Abreuvement 1 h Aliments cheval 1 h Aliments porcelet et volaille 1 h Aliments vache laitière 2 h Les fourrages 2 h

CONTROLES DE CONNAISSANCES QCM

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Unité : Biochimie

UE : CHIMIE BIOLOGIQUE I Semestre : 6 Enseignants responsables : S. BELLIER et J.M. MICHAUX Personnes intervenant dans l’UE : S. BELLIER et J.M. MICHAUX Heures de formation par étudiant : Cours : 14h Crédits : 1,5 TD : 7h (par quart de promotion) Pré-requis indispensables : connaissances correspondant au programme de biochimie en classe de BCPST OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE Les étudiants devront savoir:

- Décrire : o Le métabolisme glucidique o Le métabolisme de l’azote o Le métabolisme lipidique o Le métabolisme des nucléotides

- Décrire les structures et exposer les métabolismes et les mécanismes d’action moléculaire (à l’exclusion de la régulation à l’échelle de l’organisme) :

o Des hormones vues en cours o Des vitamines vues en cours

- Décrire les méthodes d’étude du transcriptome et du protéome, des glucides et des lipides. ORGANISATION DE L’UV Cours Magistraux : Cours 1 : Anabolisme glucidique – 2h Cours 2 : Catabolisme azoté (urée – acide urique) - 2h Cours 3 : Anabolisme lipidique - 3 h Cours 4 : Biochimie des vitamines liposolubles – 3h Cours 5 : Biochimie des Hormones peptidiques– 4h Travaux-Dirigés Les modalités des TD seront exposées lors du premier cours magistral de semestre. Il sera demandé un travail personnel qui fera l’objet d’une évaluation. CONTROLE DE CONNAISSANCES L’interrogation écrite dure une heure, d’abord sans notes ni documents pour le QCM, puis avec notes et documents pour les autres exercices demandés.

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Unité : Zootechnie, économie rurale

UE Libre : CLINIQUE FAUNE SAUVAGE NIVEAU 1 NB : cette UE est libre, c'est-à-dire facultative ; elle donne lieu à une attestation de formation et est mentionnée sur le supplément au diplôme. Semestre : toute l'année Enseignant responsable : J-F. COURREAU Crédits : 2 Personnes intervenant dans l'UE : P. ARNE, J-F. COURREAU, F. POPELIN Heures de formation par étudiant : Cours : 8h TD : 3h Cliniques : au moins 10 gardes équivalent à 20h (susceptible d'être modifié selon le nombre d'inscrits) AVERTISSEMENT Cet UE libre CFS suppose un engagement sans ambiguïté de l'étudiant qui y adhère. Cela signifie qu'aucune absence ne peut être admise, sauf cas de force majeure, du fait de la responsabilité prise : - vis-à-vis des animaux recueillis qui réclament des soins quotidiens attentifs, - vis-à-vis des camarades dont le travail se trouvera alourdi, - vis-à-vis des responsables qui organisent un apprentissage original et auxquels l'Ecole demande d'assurer un service de qualité. En conséquence, - la présence aux cours, TD et gardes cliniques est obligatoire et conditionne la validation de l'UV ; - la motivation de l'étudiant doit être forte car il doit assurer son service quelles que soient ses charges de travail, par ailleurs. OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE A l'issue de l'enseignement, l'étudiant doit être capable :

- de faire la diagnose des principales espèces accueillies dans les centres de sauvegarde ;

- de réaliser une contention adaptée à l'espèce, sans danger pour l'animal et pour le manipulateur ;

- de réaliser une installation assurant le bien-être de l'animal conformément à son espèce, son âge et son état physiologique ;

- de composer la ration alimentaire quotidienne d'un animal et de la lui mettre à disposition en tenant compte de son espèce, de son âge et de son état physiologique ;

- de mettre en pratique les différentes techniques de nourrissage manuel selon l'espèce, l'âge et l'état physiologique de l'animal ;

- de décrire les principales particularités anatomiques d'un oiseau ; - de comprendre le déroulement d'un examen clinique et d'aider le consultant par

une contention appropriée ; - d'aider à la réalisation des soins infirmiers ;

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- d’expliquer les conséquences pratiques du statut légal de protection pour une espèce dans le milieu sauvage, recueillie par une personne ou détenue dans un centre de sauvegarde.

PROGRAMME Cours Présentation générale, organisation de la Clinique Faune Sauvage (1h) Diagnose de l'espèce, de l'âge, du sexe des animaux recueillis (1,5h) Principales causes d'entrée selon l'espèce et l'âge (1,5h) Alimentation, logement et hygiène des animaux hospitalisés (2h) Législation relative à la faune sauvage (2h) TD Contention et examen clinique (2h) Anatomie des oiseaux et radioanatomie (1h) Clinique L'équipe de garde est composée d'étudiants préparant le Niveau 1 et, pour les encadrer, d'étudiants préparant ou ayant le Niveau 2 ; selon leur qualification, les étudiants sont chargés au cours des 24h de la garde : - de recueillir tous les animaux sauvages arrivant aux Urgences ; - de réaliser leur examen clinique, les radios nécessaires, les premiers soins et leur installation; - d'assurer l'alimentation des animaux en cours de soins ; - d'assurer le nettoyage des litières ; - de maintenir propres les locaux ; - de compléter les dossiers cliniques. NB : la mise en place des protocoles thérapeutiques et la décision d'euthanasie sont du ressort des enseignants. Validation de l'UE : La validation de l'UE "Clinique Faune Sauvage Niveau 1" est conditionnée par la présence à tous les enseignements et par la réalisation du nombre de gardes requis. Cette condition sine qua non étant remplie, la validation de l'UE est acquise si l'étudiant a assuré un travail de qualité en garde et montré sa capacité à atteindre les objectifs d'apprentissage. NB : Les dates de garde sont imposées. En cas d'empêchement le jour où il est affecté à une garde, l'étudiant doit prévenir le responsable de l'UV et trouver un autre étudiant avec lequel il permutera sa garde. NB : Toute absence, excusée, en cours ou TD pourra être compensée par un examen de rattrapage, oral ou écrit, sur le programme concerné.

Unité : Maladies contagieuses

UE : EPIDEMIOLOGIE GENERALE, PROPHYLAXIE Semestre : 6 Enseignant responsable : Epidémiologie : J.J. BENET Personnes intervenant dans l’UE d'épidémiologie : J. J. BENET, N. HADDAD-HOANG-XUAN, B.

DUFOUR Heures de formation par étudiant : Epidémiologie : Cours : 4 h Crédits : 2,5* TD : 14 heures * Les crédits sont partagés avec l’enseignement de statistique appliquée à l’épidémiologie (responsable M. Sanaa) : 3/4 pour épidémiologie, ¼ pour la statistique appliquée à l’épidémiologie.

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE La numérotation à trois chiffres des objectifs donnée entre parenthèse renvoie à celle du référentiel de diplôme. Les objectifs figurant en italique sont repris tels qu’ils sont rédigés dans ce référentiel. Les autres constituent soit un développement de l’objectif sous lequel ils apparaissent, soit un objectif qui ne figure pas encore dans le référentiel, mais devra y figurer.

Objectifs généraux (11.1) : A l’issue de cet enseignement, l’étudiant doit posséder une culture générale pour communiquer sur une maladie dans une population et des connaissances pour appliquer de façon pertinente les concepts épidémiologiques au diagnostic différentiel d’une maladie, à la prévention et à la lutte contre une maladie, que ce soit à l’échelon de l’individu ou du troupeau et pour participer efficacement à une enquête épidémiologique.

DEUX CATEGORIES D'OBJECTIFS : A (libellé souligné) et B Les objectifs A correspondent à des notions de base indispensables à posséder (ex. : définitions) pour pouvoir répondre à d'autres objectifs ou pour pouvoir remplir les missions exigées d’un vétérinaire sanitaire. Ils demeurent exigibles au cours de la scolarité.

Les objectifs B relèvent de l'aptitude au raisonnement.

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables de :

• participer efficacement au travail d’un groupe sur un problème.

1. (11.2) donner la signification des principaux termes utilisés en épidémiologie : épidémiologie ; épidémiologie descriptive / épidémiologie analytique (explicative) ; épidémie (épizootie) / endémie (enzootie) / pandémie (panzootie ) / anadémie (anazootie) ; incidence / prévalence ; taux de morbidité / taux de mortalité / taux de létalité ; maladie / infection, réservoir, vecteur ; espèce réceptive et espèce sensible ;

2. (11.3) expliquer la différence entre la démarche d’épidémiologie descriptive et celle d’épidémiologie explicative ainsi que les conséquences sur les critères de qualité des enquêtes correspondantes ;

3. (11.4) appliquer la démarche d’épidémiologie descriptive à une maladie dans une population :

a) construire, calculer et interpréter les principaux indicateurs épidémiologiques (incidence, prévalence et différents

taux) en utilisant l’unité épidémiologique appropriée (animal, élevage), pour décrire la situation d'une maladie selon sa distribution dans la population, son évolution dans le temps et sa répartition dans l'espace ;

b) comparer les pourcentages de prévalence ou taux dans deux populations ;

4. (11.2) donner la signification des termes : dépistage, diagnostic, sensibilité et spécificité d’un test, valeurs prédictives (positive, négative) d’un résultat, prévalence apparente, prévalence réelle ;

5. (11.5) calculer les sensibilités, spécificités et valeurs prédictives d’une méthode de dépistage appliquée à l’échelle individuelle et à celle de groupe d’individus ; en distinguant qualité d’un test et qualité des résultats ;

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6. 1 (11.6) préparer un plan d’échantillonnage en vue d’estimer une prévalence ou un taux d’une maladie à l’échelon d’une région, et/ou d’un foyer :

a. indiquer les facteurs (représentativité, effectif de l’échantillon) conditionnant l’exactitude et la précision du résultat d’un sondage ;

b. distinguer les pourcentages de prévalence d'un échantillon et d'une population ;

c. interpréter les résultats d’une enquête d’épidémiologie descriptive en utilisant les outils statistiques appropriés (χ², p, risque α, puissance de test) ;

6.2 préparer un plan d’échantillonnage en vue de déterminer si une population est indemne d’une maladie (ou une infection) par rapport à un seuil donné :

a. indiquer le nombre d’unités nécessaire, en fonction du risque d’erreur admis ;

b. interpréter le résultat d’une enquête qualitative ;

7. (11.7) utiliser les notions de base d'infectiologie en vue de déterminer les conséquences pratiques relatives à la lutte contre une maladie, notamment :

a) sources d'agents pathogènes, excrétion, modalités de transmission, voies de pénétration, réceptivité,

b) délais de latence diagnostique / d'incubation,

c) délais diagnostiques minimal / maximal notamment en relation avec les rythmes de contrôle d'assainissement et de requalification d'un cheptel ;

8. (11.8) proposer des hypothèses pour expliquer l'apparition d'une infection ou d'une maladie dans un élevage et en déduire les principes d'enquêtes amont et aval autour d'un foyer primaire ;

9. (11.9) appliquer la logique hypothético-déductive en épidémiologie explicative :

a) définir le principe des protocoles exposés / non exposés et cas / témoins ; de les reconnaître dans une publication ;

b) interpréter les résultats d’une enquête d’épidémiologie explicative en utilisant les outils appropriés (risque relatif, odds ratio ; association statistique / relation causale ; signification statistique / signification biologique).

PROPHYLAXIE

10. (11.2) donner la signification des termes : prophylaxie, prophylaxie sanitaire, prophylaxie médicale, prophylaxie mixte médico-sanitaire; élevages infecté, indemne, éventuellement contaminé, contaminé ; animal indemne, infecté, suspect.

PROGRAMMEProgramme détaillé affiché au bâtiment Goret.

COURS (durée 2 h)

Concepts de base en épidémiologie descriptive (2 h). Concepts de base en épidémiologie analytique (1 h). Transmission des maladies infectieuses et prophylaxie (1 h).

TRAVAUX DIRIGES (7 séances de 2 h) 1. Vocabulaire ; indicateurs épidémiologiques. 2. Qualité des tests (dépistage) 3. Etude descriptive quantitative 4. Etude descriptive qualitative 5. Enquêtes analytiques 6. Révision 7. Transmission des maladies infectieuses et

prophylaxie

Cet enseignement fait appel à la méthode d’apprentissage par résolution de problèmes.

Matériel indispensable (à chaque séance) : calculatrice + livre d’épidémiologie

CONTROLES DE CONNAISSANCES L'épidémiologie générale et la statistique appliquée à l'épidémiologie ont respectivement un poids relatif de 3/4 et 1/4.

Contrôle continu formatif par une interrogation au début de chaque séance sauf la première (non notée).

Contrôle récapitulatif (coefficient 6) par une interrogation écrite en fin de semestre portant de façon distincte sur les programmes d’épidémiologie générale et de statistique. Les étudiants obtenant à ces contrôles (ou à la moyenne des deux enseignements, épidémiologie et statistique appliquée) au moins 12 peuvent être dispensés de l’examen de fin d’UV (qui porte alors sur la, ou les, partie(s) correspondante(s)).

Examen en fin de semestre (coefficient 4) : sur la (ou les) partie(s) (épidémiologie, statistique appliquée) non validée(s).

La notation du contrôle n’est pas proportionnelle au nombre de questions réussies : le barème tient compte des conditions d’interrogation (notes et documents autorisés ; questions strictement limitées aux objectifs ; faible nombre d’objectifs) et du seuil « libératoire » de 12. Tout objectif de rang A non atteint peut conduire à une note très basse.

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Il peut être tenu compte, dans la notation sous forme de bonus / malus pouvant aller jusqu’à deux points de la moyenne générale, du travail réalisé par les étudiants pour la préparation des séances de TD ou au cours des séances.

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Discipline : Ethologie

UE : ETHOLOGIE – BIEN-ETRE ANIMAL-PROTECTION ANIMALE Semestre : 6 Enseignant responsable : B.L. DEPUTTE Personnes intervenant dans l’UE : B.L. DEPUTTE, A. FABRE-de LOYE Heures de formation par étudiant : Cours : 16h Crédits : 1,5 TD : 8h OBJECTIFS D’ENSEIGNEMENT L’objectif général de la discipline est de comprendre la vie de relation des animaux d’intérêt vétérinaire afin d’appréhender la genèse des comportements anormaux. Cet objectif sera atteint en fournissant les bases

• de l’étude scientifique du comportement, selon l’approche intégrative de l’éthologie. • des comportements de relation et des spécificités comportementales des espèces d’intérêt

vétérinaire. • de l’approche fondamentale et appliquée du bien-être et de la protection animale

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

Au terme de l'enseignement "Ethologie / Bien-être / Protection animale", les étudiants devront être capables de:

• Expliquer les spécificités de l’éthologie au sein des sciences du comportement. • Expliquer les concepts fondamentaux de l'éthologie liés

o à la communication animale (nature du processus de communication, la spécificité des différents canaux de communication, le processus de "ritualisation"= mise en place, au cours de l'évolution, de signaux spécifiques de communication, le caractère multimodal des interactions).

o aux différents modes de groupement des animaux (espèces solitaires, grégaires et sociales, implication de la structure sociale sur la dynamique des populations, structure et organisation sociale, différence entre interactions et relations, réseaux de relations et organisation sociale, les différentes composantes de la relation sociale – relations positives amicales / relations négatives – agonistiques, la composante dominance/subordination de la relation sociale)

o au développement ontogénétique du comportement (maturation et développement, le caractère fondamental du processus de développement, la notion d'épigenèse probabiliste, les traits d'histoire de vie, leur influence sur le développement comportemental, les concepts de nidifuge/nidicole, la particularité de la relation mère-jeune, le concept d' attachement lié aux espèces nidifuges)

• Appréhender l’adaptation de l’animal à son milieu en situations non contraintes ou de contraintes. • Expliquer comment le concept subjectif de bien-être peut être objectivé • Présenter différentes manières d'évaluer le bien-être et une atteinte à ce dernier. • Expliquer les contraintes inhérentes aux différents modes d’élevage et de vie et en apprécier les

conséquences sur le comportement des animaux (comportements anormaux, expression de la douleur) : application au bien-être animal.

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• Citer les grandes lignes de la réglementation en matière de bien-être animal et de protection animale.

PROGRAMME

Enseignement théorique (16 h) Cours magitraux destinés à l'ensemble de la promotion:

- Introduction à l'éthologie (1h) - Bien-être animal et comportement (1h) - L'animal et son milieu (2h) - La communication et l'expression des émotions (2h) - Différents modes de groupement des animaux (2h) - Ontogenèse – Développement comportemental (2h) - Capacités cognitives 1 - Apprentissages (2h) - Capacités cognitives 2 (2h) - Contraintes inhérentes aux différents modes d'élevage (2h)

Enseignement dirigé (8 h) par groupe de ¼ de promotion Les TD, à partir d'exemples concrets, porteront sur

• Les méthodes d'études des interactions en éthologie (2h) • Les méthodes d'évaluation du bien-être animal (2h) • La réglementation en matière de bien-être animal : Elevage, Transport, Abattage (2h) • La réglementation en matière de bien-être - protection animale: Animaux de compagnie,

animaux dangereux. (2h) CONTROLES DE CONNAISSANCES Théorique : 1 interrogation de type QROC sans notes ni document à la fin de l’UE. Les questions porteront sur l'ensemble des cours ET sur les TD de réglementation (une question pour chacun des TD). IMPORTANT : Conformément à ce qui a été décidé au C.E.P., des points de pénalité seront enlevés à la note de contrôle en cas d'absences non excusées aux séances de TD, selon le barême suivant : moins 2 points pour une absence, moins 5 points pour 2 absences, une note de 0 pour trois absences ou plus. NB. L'enseignement d'éthologie générale est prolongé par des enseignements portant sur les différentes espèces d'intérêt vétérinaire. Cet enseignement d'éthologie est alors dispersé dans les différentes filières (Zootechnie S5). Ils sont poursuivis au cours de la deuxième année , S7-S8, dans le cadre d'autres UEs (Connaissance du chien et du chat, Filière Cheval, Zootechnie). Ils portent notamment sur des aspects spécifiques du comportement des bovins, du chien, du chat, du cheval et de mongastriques (Gallinacées, Porc). Ces enseignements seront à la fois des cours magistraux et des travaux dirigés.

Unité : HIDAOA

UE : FILIERE AGRO-ALIMENTAIRE Semestre : 6 Enseignant responsable : F.H. BOLNOT Personnes intervenant dans l’UE : J.C. AUGUSTIN, V .CARLIER, O. CERF, C. COLMIN Heures de formation par étudiant : Cours : 8 h Crédit : 0,5 OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : - d’identifier les principales filières agroalimentaires ; - de décrire la place du vétérinaire dans ces filières ; - d’expliciter les obligations légales en terme de sécurité des aliments.

PROGRAMME Présentation générale des filières agroalimentaires Santé publique vétérinaire et sécurité sanitaire des aliments Filière viande et filière lait : missions des vétérinaires

Restauration collective (idem) Grande distribution (idem)

Industrie agroalimentaire (idem) Administrations et services de contrôle (idem) CONTROLE DES CONNAISSANCES Les modalités seront précisées au début de l’enseignement.

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Département : DSBP

UE : HISTOIRE DE LA MEDECINE ET DES SCIENCES VETERINAIRES Semestre : 5 Enseignant responsable : C. DEGUEURCE Personnes intervenant dans l’UE : C. DEGUEURCE Heures de formation par étudiant : Cours : 6 heures Crédit : 1 OBJECTIFS D’ENSEIGNEMENT Mettre à la disposition des élèves des éléments d’histoire de la médecine vétérinaire et de la profession, formant un socle de connaissances commun à tous les vétérinaires, leur permettant de ne pas ignorer un passé qui influe toujours sur le présent. OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : - de décrire les raisons et les circonstances de la naissance de la profession vétérinaire, - de décrire son développement aux XIXème et XXème siècles, notamment du point de vue de sa diversification et de sa structuration. PROGRAMME 3 conférences de 2 h – Le thème principal de la conférence est indiqué en gras. Les éléments qui suient sont donnés à titre indicatifs et ne sont pas exclusifs d’autres notions. Conférence 1 : la médecine vétérinaire, de l’Antiquité au XVIIème siècle : rappels de chronologie ; les premiers documents vétérinaires (Mésopotamie et Egypte) ; les Hippiatrica ; les pratiques médicales dans l’Empire romain d’orient ; la médecine vétérinaire au moyen âge en Europe (médecine religieuse et sorcellerie) ; la médecine vétérinaire au moyen âge en terre d’Islam… Conférence 2 : la médecine vétérinaire au XVIIIème siècle et pendant la première moitié du XIXème siècle : le développement d’une médecine vétérinaire institutionnelle ; la création des Ecoles Vétérinaires et son interaction avec les mouvements scientifiques et philosophiques du siècle des Lumières ; les premiers développements de la profession ; les pratiques médicales… Conférence 3 : la médecine vétérinaire pendant la seconde moitié du XIXème siècle et le XXème siècle : les révolutions médicales – développement des méthodes expérimentales, épopée pasteurienne ; une profession, des métiers – le développement des cliniques canines, le statut du vétérinaire militaire, l’inspection des denrées alimentaires, le développement de la police sanitaire… ; structuration de la profession et syndicalisme ; évolutions majeures du XXème siècle… CONTROLES DE CONNAISSANCES Vérification de la présence à chaque séance ; interrogation à la fin de chaque séance nécessitant simplement d'avoir été attentif ; validation quand l’étudiant aura obtenu 12/20 au contrôle d'attention.

Unité : Histologie, Anatomie pathologique

UE : HISTOLOGIE Semestre : 5 Enseignant responsable : N. CORDONNIER Personnes intervenant dans l’UE : F. BERNEX, N. CORDONNIER Heures de formation par étudiant : Cours : 18h Crédits : 3 TD : 16h

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables : - de définir les objectifs, les moyens et les techniques utilisées en Histologie ; - de citer les grands appareils détaillés dans le cours, énumérer leurs organes et en préciser la localisation anatomique ; - pour chaque organe, d’exposer et / ou de représenter la topographie (organisation tissulaire, vascularisation, innervation), la structure histologique (détail de l'organisation tissulaire, particularités cytologiques et ultrastructurales des constituants essentiels) et l'histophysiologie (rôle des différents éléments topographiques et structuraux) ; - d’analyser des lames histologiques en dégageant les éléments caractéristiques permettant la diagnose des éléments cellulaires, du tissu ou de l’organe.

PROGRAMME DE L’UV Enseignement théorique

♦ Epithéliums et cellules épithéliales (1 heure de cours) ♦ Tissus conjonctifs et squelettiques (2 heures de cours) ♦ Tissus musculaires (1/2 heure de cours) ♦ Système nerveux (1/2 heure de cours) ♦ Système circulatoire (1,5 heure de cours) ♦ Hématologie (2 heures de cours) ♦ Système endocrine (1,5 heure de cours) ♦ Système hémato-lymphopoïétique (1 heure de cours) ♦ Appareil digestif et glandes annexes (2 heures de cours) ♦ Appareil respiratoire (1 heure de cours)

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♦ Appareil urinaire (2 heures de cours) ♦ Appareil génital et tissu mammaire (2 heures de cours) ♦ Peau et annexes cutanées (1 heure de cours)

Enseignement pratique (par 1/4 et 1/8ème de promotion) 8 séances de travaux dirigés de 2 heures

♦ Les techniques histologiques et cytologiques ♦ Les tissus et hématologie ♦ Le système endocrine et l’appareil respiratoire ♦ Le tube digestif et ses glandes annexes ♦ L’appareil génital, la mamelle et l’appareil urinaire ♦ Les organes lymphoïdes et la peau ♦ Immunohistochimie ♦ Analyse bibliographique

Un programme et des objectifs plus détaillés sont fournis en début de semestre. CONTROLES DE CONNAISSANCES Contrôle continu (interrogations de TD) Coefficient 2 Examen pratique de travaux dirigés Coefficient 1,5 Contrôle écrit d'Histologie Coefficient 2,5 Examen oral Coefficient 4

Unité : Immunologie, Microbiologie et Pathologie Générale

UE : IMMUNOLOGIE GENERALE Semestre : 5 et 6 Enseignant responsable : F. QUINTIN COLONNA Personnes intervenant dans l’UE : F. QUINTIN COLONNA, HJ. BOULOUIS, L. FREYBURGER Heures de formation par étudiant : Cours : 30 h (dont 14 h au 1er semestre) Crédits : 2 (en S5) TD/TP : 10 h (dont 4 h au 1er semestre) 2 (en S6) OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables :

- de caractériser les principaux paramètres de la Réponse Immunitaire (RI) : Antigènes, Anticorps, Cytokines, Cellules de l’immunité, Molécules de surface, Complément ; - de décrire les réponses immunitaires physiologiques ainsi que leurs différentes explorations (sérologiques et cellulaires) ; - de définir et caractériser les différents types Immunités (Innée, Active, Passive, Naturelle, Artificielle) ; - de définir et caractériser les réactions d’Hypersensibilité.

NB : les objectifs détaillés seront distribués avec les cours, et les diaporamas des cours seront disponibles sous forme de polycopiés, et mis en ligne sur intranet. Les enseignants se tiennent à la disposition des étudiants pour toutes explications complémentaires. PROGRAMME :

Cours (promotion complète) : 1) Présentation générale 0 H 30 2) Réponse immunitaire innée 1 H 30 3) Les antigènes 2 H 4) Les immunoglobulines 3 H 5) Le complément 1 H 6) Les cytokines 2 H 7) les réactions sérologiques 2 H 8) Le CMH 1 H 30 9) Cellules présentatrices d’antigènes 1 H 30 10) Physiologie de la réponse immunitaire 6 H

11) Les immunités 5 H 12) Les hypersensibilités 2 H 13) Exploration cellulaire 2 H

Travaux dirigés (TD) et Travaux pratiques (TP) :

1) L’agglutination 2 H 2) La précipitation 2 H 3) La neutralisation 2 H 4) Le complément – titrage et RFC 2 H 5) La cytométrie de flux 2 H

CONTROLES DE CONNAISSANCES : (Toutes les précisions seront fournies lors du premier cours) - Contrôles théoriques : QCM, QROC ou exercices en milieu et/ou fin d’enseignement sans document, coef. 2/3 - Contrôles TD : QROC et exercices avec documents en fin d’enseignement coef. 1/3. Mesures disciplinaires : un retrait de 3 points sur le contrôle de TD aura lieu pour chaque absence non justifiée en TD

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Unité : Immunologie, Microbiologie et Pathologie Générale

UE : IMMUNOLOGIE GENERALE Semestre : 5 et 6 Enseignant responsable : F. QUINTIN COLONNA Personnes intervenant dans l’UE : F. QUINTIN COLONNA, HJ. BOULOUIS, L. FREYBURGER Heures de formation par étudiant : Cours : 30 h (dont 14 h au 1er semestre) Crédits : 2 (en S5) TD/TP : 10 h (dont 4 h au 1er semestre) 2 (en S6) OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables :

- de caractériser les principaux paramètres de la Réponse Immunitaire (RI) : Antigènes, Anticorps, Cytokines, Cellules de l’immunité, Molécules de surface, Complément ; - de décrire les réponses immunitaires physiologiques ainsi que leurs différentes explorations (sérologiques et cellulaires) ; - de définir et caractériser les différents types Immunités (Innée, Active, Passive, Naturelle, Artificielle) ; - de définir et caractériser les réactions d’Hypersensibilité.

NB : les objectifs détaillés seront distribués avec les cours, et les diaporamas des cours seront disponibles sous forme de polycopiés, et mis en ligne sur intranet. Les enseignants se tiennent à la disposition des étudiants pour toutes explications complémentaires. PROGRAMME :

Cours (promotion complète) : 1) Présentation générale 0 H 30 2) Réponse immunitaire innée 1 H 30 3) Les antigènes 2 H 4) Les immunoglobulines 3 H 5) Le complément 1 H 6) Les cytokines 2 H 7) les réactions sérologiques 2 H 8) Le CMH 1 H 30 9) Cellules présentatrices d’antigènes 1 H 30 10) Physiologie de la réponse immunitaire 6 H

11) Les immunités 5 H 12) Les hypersensibilités 2 H 13) Exploration cellulaire 2 H

Travaux dirigés (TD) et Travaux pratiques (TP) :

1) L’agglutination 2 H 2) La précipitation 2 H 3) La neutralisation 2 H 4) Le complément – titrage et RFC 2 H 5) La cytométrie de flux 2 H

CONTROLES DE CONNAISSANCES : (Toutes les précisions seront fournies lors du premier cours) - Contrôles théoriques : QCM, QROC ou exercices en milieu et/ou fin d’enseignement sans document, coef. 2/3 - Contrôles TD : QROC et exercices avec documents en fin d’enseignement coef. 1/3. Mesures disciplinaires : un retrait de 3 points sur le contrôle de TD aura lieu pour chaque absence non justifiée en TD

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Unité : Pharmacie et Toxicologie

UE : NOTIONS DE BASE EN SCIENCES DU MEDICAMENT Semestre : 5 Enseignant responsable : S. PERROT Personnes intervenant dans l’UE : B. ENRIQUEZ, R.TISSIER, S. PERROT Heures de formation par étudiant : Cours : 22 h Crédits : 4,5 TD : 12 h TP : 30 h OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE Objectifs généraux Les objectifs généraux de la discipline "Pharmacie" en formation initiale sont de fournir : - les bases pharmaceutiques, réglementaires et techniques nécessaires à la préparation, à la délivrance au détail, à la prescription et à l'utilisation raisonnée des médicaments vétérinaires dans le cadre de leur activité professionnelle. - Les bases scientifiques permettant de comprendre les interactions des molécules avec les récepteurs, les cellules, les organes et les organismes, et ainsi de fonder sur des bases rationnelles le mode d'action des médicaments. - Les bases scientifiques et réglementaires nécessaires à l'évaluation et à la gestion des risques des xénobiotiques pour la santé de l'Homme et des animaux et pour l'environnement. - Les bases scientifiques indispensables à l'utilisation des médicaments dans les applications au diagnostic, à la pathologie, à la zootechnie, en tenant compte des espèces de destination.

PROGRAMME Enseignements magistraux Initiation à la connaissance du médicament vétérinaire 2 h Etude des matières premières entrant dans la composition des médicaments 4 h Pharmacie Galénique vétérinaire 4 h Législation pharmaceutique vétérinaire 5 h Introduction aux TD "efficacité et innocuité" 1 h Pharmacocinétique : notions générales 2 h Pharmacocinétique 1ére partie : l'absorption et la distribution des xénobiotiques 2 h Pharmacocinétique 2éme partie : le métabolisme et l'élimination des xénobiotiques 2 h

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Enseignements dirigés : Reconnaissance de plantes médicinales 2 h Etudes des matières premières entrant dans la composition des médicaments 2 h Exercices de rédaction d’ordonnances 2 h Exercices d’exécution d’ordonnances et de pharmacovigilance 2 h Evaluation expérimentale de l'efficacité des médicaments vétérinaires 2 h Evaluation expérimentale de l'innocuité des médicaments vétérinaires 2 h Enseignements pratiques : Reconnaissances d’excipients 3 h Contrôle des matières premières 4 h Réalisation d'une préparation extemporanée 3 h Réalisation d'une préparation magistrale 4 h Synthèse de médicaments 3 h Réalisation et contrôle d'une émulsion 4 h Extraction et identification d'alcaloïdes 3 h Introduction à la toxicologie clinique : exemple d'une intoxication féline au paracétamol 3 h Examen de Travaux pratiques 3 h

CONTROLES DE CONNAISSANCES : - Moyenne des contrôles continus effectués à la fin des séances de TD : coefficient 1 - Contrôle de connaissances théoriques réalisé à la fin de l’enseignement : coefficient 2 - Note de TP : note des comptes-rendus + interrogation de fin de TP : coefficient 1 Pour les étudiants qui ont obtenu une note d’année inférieure à 12, un examen est prévu en fin de semestre ; son coefficient sera de 4, la note d’année ayant un coefficient de 6.

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Unité : Physiologie et Thérapeutique

UE: PHYSIOLOGIE DE LA REPRODUCTION & FONCTIONS DE L'APPAREIL URINAIRE

Semestre : 6 Enseignant responsable : Laurent TIRET Personnes intervenant dans l’UE : H. COMBRISSON & L. TIRET Heures de formation par étudiant : Cours: 17h Crédits : 2,5

TD: 12h Autoenseignement dirigé: 6h

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE Mise à jour annuelle sur PhysioWeb, site ENVA dédié à l'enseignement de la Physiologie: http://cours.vet-alfort.fr PROGRAMME – Les heures sont indiquées (en gras), les alinéas du référentiel de diplôme [entre crochets]. • Enseignement théorique Physiologie de la reproduction 13 heures Endocrinologie de la différenciation sexuelle et anomalies chez les mammifères (1,5) [R7.1, R2.4, R2.5 et R6.2] ; Fonctions gonadiques : fonction germinale mâle (0,5) [R7.30] et femelle (0,5) [R7.32], fonction endocrine mâle et femelle (3) [R7.32] ; Régulation des fonctions gonadiques (1,5) [R7.32 et R7.7] ; Rapprochement sexuel, érection, éjaculation (1,5) [R7.31] ; Fécondation, gestation et ses étapes, placenta (1) [R7.33] ; La vie fœtale et les adaptations périnatales (0,5) [R7.34] ; La parturition, son mécanisme, son déterminisme et ses anomalies (1,5) [R7.33] ; La lactation, le développement mammaire, la galactopoïèse, l'éjection du lait (1) [R7.35] ; La reproduction chez les oiseaux (0,5) [R7.35]. Appareil urinaire 4 heures Elaboration de l’urine (2) [R7.19] ; Régulation de la diurèse (2) [R7.19]. • Enseignement dirigé Reproduction TD-R1 : Particularités de la Reproduction chez les ruminants (2) [R7.31 & R7.32] TD-R2 : Particularités de la Reproduction chez les carnivores (2) [R7.31 & R7.32] TD-R3 : Insémination, Fécondation, Fécondation in vitro, Superovulation (2) [R7.32 & R7.33] Appareil urinaire TD-U1 : Régulation des fonctions urinaires (2) [R7.19]. TD-U2 : Physiologie et exploration fonctionnelle du bas appareil urinaire (2) [R7.20 & R7.21]. TD-U3 : Régulation rénale et pulmonaire de l'équilibre acido-basique sanguin (2) CONTROLES DE CONNAISSANCES Théorique et pratique : Deux interrogations écrites portant sur la physiologie de la reproduction et sur les fonctions de l'appareil urinaire. Contrôles de connaissances sans notes ni documents, éventuellement analyse d'articles.

Unité : Physiologie et thérapeutique

UE : PHYSIOLOGIE GENERALE, PHYSIOLOGIE DE LA CIRCULATION & PHYSIOLOGIE DE LA RESPIRATION

Semestre : 5 Enseignant responsable : Fanny STORCK Personnes intervenant dans l’U.V : F. STORCK, L. TIRET & L. GUILLAUD (TPs) Heures de formation par étudiant : Cours : 19h Crédits : 2 TD-TP : 11h (3 séances de 2 heures et une séance de 5 heures) OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE Disponibles sur : http://cours.vet-alfort.fr Les alinéas correspondant du Référentiel de diplôme sont indiqués [entre crochets].

A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être capables de :

Physiologie générale [7.2, 7.3 & 7.7] : • décrire l'organisation des neurones périphériques et leurs rapports avec le segment médullaire, qu'il s'agisse du système cérébro-spinal ou du système nerveux végétatif ; • décrire les grandes lignes de l'organisation centrale du système nerveux cérébro-spinal et du système nerveux végétatif ; • décrire le neurotransmetteur, les récepteurs et les voies de signalisation mis en jeu lors de l’activation du système nerveux parasympathique ; • décrire les ligands (neurotransmetteurs et hormone), les récepteurs et les voies de signalisation mis en jeu lors de l’activation du système nerveux orthosympathique ; • décrire les mécanismes de polarisation et de dépolarisation de cellules recevant ou générant une activité électrique ; • expliquer les notions de communication endocrine et paracrine et de citer pour chacune un exemple de substance impliquée ; • expliquer le mécanisme d'action des hormones à récepteurs membranaires et indiquer un exemple d’hormone impliquée ; • expliquer le mécanisme d'action des hormones à récepteurs nucléaires et indiquer un exemple d’hormone impliquée ; • expliquer les différentes catégories de ligands, les principaux types de récepteurs, les principales voies de signalisation et réponses cellulaires utilisées par l’organisme. Cœur et Circulation : Révolution cardiaque : phénomènes électriques, mécaniques et acoustiques [7.8 à 7.10] • placer sur un même schéma les phénomènes mécaniques, électriques et acoustiques au cours de la révolution cardiaque, expliquer leur chronologie et leurs conséquences hémodynamiques. • réaliser un électrocardiogramme chez le chien et le cheval. Justifier du choix des dérivations et interpréter les tracés chez l’animal sain.

Automatisme cardiaque [7.8 & 7.9] • présenter les structures responsables de l’automatisme cardiaque. Dessiner un potentiel d’action d’une cellule sinusale et myocardique. Pour chacune des phases, donner le rôle des canaux ioniques impliqués. • décrire les voies de conduction de l’influx nerveux dans le coeur. Couplage excitation-contraction [7.8] • établir la séquence des flux ioniques de la membrane plasmique au sarcolemme, assurant la contraction des fibres myocardiques. • présenter les constituants moléculaires dont les changements conformationnels induisent cette contraction. Innervation cardio-régulatrice [7.10] • décrire les éfférences cardio-accélératrice et modératrice (nerfs, neurotransmetteurs, récepteurs et effets). Pression artérielle et vasomotricité [7.12 à 7.13] • écrire l’équation reliant la pression artérielle, le débit sanguin et les résistances périphériques. Citer les paramètres déterminant les résistances périphériques. • donner les valeurs de pression sanguine dans le réseau artériel, capillaire et veineux de la circulation systémique et pulmonaire. Expliquer les mécanismes d’échanges au niveau capillaire. • réaliser une mesure non invasive de pression artérielle chez le chien et l’âne. • détailler la régulation nerveuse, humorale, locale de la vasomotricité. • décrire les mécanismes de régulation de la pression artérielle : régulation rapide (barosensibilité…), régulation lente (système rénine-angiotensine…).

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Appareil respiratoire : Transport des gaz, hématose [7.15 & 7.16] • décrire les diverses formes de transport des gaz par le sang en indiquant les valeurs normales de pressions partielles et de contenus. • décrire les phénomènes d’hématose, en déduire les conséquences dans des circonstances physiologiques (repos, effort), cliniques (animal intubé) ou pathologique (défaut de perfusion ou de ventilation).

Mécanique ventilatoire et régulation [7.17, 7.23 & 7.24] • citer les actions nerveuses et humorales régulatrices de la ventilation en indiquant pour chacune d’elles son rôle dans les conditions de repos et dans des conditions d’effort ou de perturbation de l’équilibre acido-basique. • pratiquer des prises de sang artériel chez la brebis et le chien, mesurer, calculer et interpréter les différents paramètres acido-basiques (gaz du sang, tampon) chez un animal sain ou en déséquilibre. • décrire le rôle des poumons et des reins dans le maintien de l’équilibre acido-basique.

PROGRAMME

• Enseignement théorique Physiologie générale (4h) Organisation du système nerveux cérébro-spinal et du système nerveux végétatif (1,5) Mécanismes de polarisation et de dépolarisation électriques des cellules (0,5) Ligands, récepteurs et voies de signalisation impliqués dans le fonctionnement du système nerveux végétatif (1) Ligands, récepteurs et voies de signalisation impliqués dans les communications endocrines et paracrines (1). Coeur et circulation (11h) Introduction à la circulation, révolution cardiaque (1) Automatisme cardiaque (2) Conduction cardiaque, électrocardiographie (1) Préparation au TP sur le lapin (1) Couplage excitation-contraction et contraction (1) Innervation extrinsèque accélératrice (1) Inervation extrinsèque modératrice - Tonus - Intégration centrale (1) Réseaux vasculaires haute et basse pression. Pression artérielle (1) Echanges capillaires & régulation rapide de la pression artérielle (1) Régulation locale et lente de la PA. Conclusion (1). Physiologie de la respiration (4h) Transport des gaz par le sang (1) Mécanique respiratoire (1) Ventilation alvéolaire, hématose (1) Régulation nerveuse et humorale de la ventilation (1).

• Enseignement dirigé (11h) Cœur, circulation, respiration (8 h) TD1 : Exploration fonctionnelle de l'activité cardiaque : électrocardiographie (2). TD2 : Mesure de la pression artérielle & Préparation au TP (2). TD3 : Régulation de la circulation et de la respiration – Analyse des résultats du TP sur le Lapin & révisions (2). Travaux pratiques (une séance sur le Lapin) : Mesure invasive de la pression artérielle, ECG, régulation de la PA, régulation de la ventilation (5). CONTROLES DE CONNAISSANCES - Ecrit: un contrôle écrit en début de semestre portant spécifiquement sur la physiologie générale, un contrôle écrit sur la physiologie de la circulation et un contrôle écrit sur la physiologie de la respiration. - Oral : pour les étudiants non dispensés de l'examen de fin de semestre.

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Discipline : Physique et chimie biologiques et médicales

UE : PHYSIQUE BIOLOGIQUE ET MEDICALE Semestre : 5 Enseignant responsable : G. MOUTHON Personnes intervenant dans l’UE. : G. MOUTHON Heures de formation par étudiant : Cours : 8 heures Crédit : 1 TD : 4 heures

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE A l’issue de cet enseignement, les étudiants doivent être capables de : - définir les effets des rayonnements ionisants sur la matière avec les applications en dosimétrie, en analyse physico-chimiques et en décontamination ; - interpréter les troubles entraînés par ces rayonnements et par les isotopes radioactifs sur les organismes cellulaires, les cellules, les tissus et l’organisme entier ; -expliquer la loi de Bergonié et Tribondeau et ses conséquences en radiothérapie et en radioprotection ; - par la connaissance du fonctionnement des réacteurs nucléaires ou d’une arme nucléaire, en particulier les réactions en chaîne, de prévenir les conséquences d’un incident ou accident nucléaire et de la contamination par les radionucléides sur le cheptel et les chaînes alimentaires, produits dangereux et absorbés par les organismes ; - définir les méthodes de protections physiques et chimiques contre les radiations ionisantes et leurs effets. La production des rayonnements utilisés en radiodiagnostic et radiothérapie sera étudiée dans le cadre de l’enseignement d’imagerie médicale.

PROGRAMME - Eléments de physique nucléaire 2 heures • Les nucléons et les particules constitutives • Quelques éléments de physique quantiques et de physique relativiste et particules de haute énergie - Les différents types de radioactivité : 2 heures • α • β- et β+ • γ • Rayonnement neutronique et protonique - Les réactions nucléaires : 1 heure • Réaction en chaîne

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• Fonctionnement d’une centrale nucléaire et incidents pouvant contaminer l’environnement et les chaînes alimentaires • La production et l’utilisation des radio-isotopes pour le diagnostic et la thérapeutique - Conduite à tenir lors de contaminations accidentelles ou par des armes ou déchets nucléaires pour le cheptel et les productions animales 1 heure - Les radiations non-ionisantes 1 heure (champs électromagnétiques, rayonnements infra-rouges, lasers) Travaux dirigés et pratiques : par quart de promotion : • spectroscopie X et γ et les microsondes ioniques 2 heures • Détection et mesure de la radioactivité 2 heures CONTROLES DES CONNAISSANCES Un contrôle écrit des connaissances d’une heure comportant plusieurs questions (questions de synthèse et questions de cours).

STATISTIQUE APPLIQUEE A L'EPIDEMIOLOGIE

Semestre : 6 Enseignant responsable pour la statistique appliquée à l'épidémiologie : M. SANAA Heures de formation par étudiant : Statistique appliquée : Cours : 2 h - TD : 4 h

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE

STATISTIQUE APPLIQUEE A L'EPIDEMIOLOGIE

S1 : Sensibilité et spécificité des tests : incertitude et variabilité

-prendre en compte les conditions expérimentales ou d'observation lors de l'estimation des caractéristiques intrinsèques d'un test de diagnostic ou de dépistage :

a) calculer l’intervalle de confiance d’une sensibilité et d’une spécificité en fonction du protocole utilisé.

b) expliquer et mettre en œuvre la démarche permettant l’établissement d’un seuil de positivité d’un test.

c) expliquer les facteurs de variabilité de la sensibilité et la spécificité d’un test

d) expliquer la différence entre la sensibilité d’un test en microbiologie et en épidémiologie.

S2 : Enquêtes descriptives en épidémiologie : différentes méthodes de sondage

- mettre en œuvre les différentes méthodes de sondage

a) proposer un plan de sondage (grappe, stratification) en fonction de l’objectif et les contraintes de la réalisation de l’étude épidémiologique ;

calculer la prévalence et son intervalle de confiance en tenant compte à la fois du protocole d’échantillonnage (cas des sondages en grappes et stratifiés) et des

caractéristiques des outils de mesures utilisés (sensibilité et spécificité des tests

S3 : Enquêtes analytiques en épidémiologie : tester l'hypothèse d'un ou plusieurs facteurs de risque

a) calculer l’intervalle de confiance d’un risque relatif et d’un Odds ratio.

b) expliquer les limites de la valeur de p (signification d’un test statistique)

c) tenir compte d’un facteur de confusion dans l’estimation d’un risque relatif ou d’un Odds ratio.

d) expliquer pourquoi il est parfois nécessaire d’avoir recours à des modèles d’analyse statistiques plus sophistiqués.

e) expliquer la démarche de validation des résultats d’une étude épidémiologique (validité interne et validité externe)

PRE-REQUIS : (indispensables à la matière)

Statistique de base : statistique descriptive ; notions de calcul de probabilités ; théorie de l’estimation et des tests ; méthodes d’analyse statistiques simples (comparaison de deux ou plusieurs pourcentages ou moyennes). Conditions d’emploi nécessaires des différents tests statistiques.

PROGRAMME

Statistique appliquée à l'épidémiologie

SUPPORTS DE COURS

CD-ROM comprenant les notes de cours sous forme de texte et de diaporama, des exercices et des problèmes corrigés et des outils de calcul et d’apprentissage sous Excel.

THEMES des TRAVAUX DIRIGES (2 h)

Ces thèmes sont complémentaires aux développements donnés en épidémiologie générale.

S1 : Sensibilité et Spécificité des tests : incertitude et variabilité

L’objectif de ce TD est de présenter aux étudiants les traitements statistiques permettant la prise en compte des conditions expérimentales ou d’observation lors de l’estimation des caractéristiques intrinsèques d’un test de diagnostic ou de dépistage.

S2 : Enquêtes descriptives en épidémiologie : les différents types de sondage

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L’objectif de ce TD est de présenter des exemples d’application des méthodes de sondages (stratification, grappe) dans les enquêtes visant à estimer la prévalence d’une maladie.

S3 : Enquêtes analytiques en épidémiologie : tester l’hypothèse d’un ou plusieurs facteurs de risque

L’objectif de ce TD est de montrer les principes de base de l’analyse d’une enquête analytique et les limites des méthodes statistiques classiques.

CONTROLES DE CONNAISSANCES

Cf : fiche épidémiologie générale précédente.

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Unité : Zootechnie, Economie rurale

UE : ZOOTECHNIE GENERALE Semestre : 5 Crédits : 5 Enseignants coordonnateurs : P. Bossé pour l’enseignement sur le site alforien Isabelle Leroy pour l’enseignement sur le site de Champignelles et pour le stage en exploitation laitière

Personnes intervenant dans l’UE sur le site alforien : P. Arné, P. Bossé, S. Chastant Maillard, F. Constant

B. Deputte, B. Grimard Ballif, I. Leroy, A. Ponter Heures de formation par étudiant :

Sur le site alforien - CM (*): 30 heures (dont 20h lors de la « semaine de préparation au stage ») - TD (*) : 13 heures (dont 5h lors de la « semaine de préparation au stage » et 4h

sur le site de Champignelles) Sur le site de Champignelles : TP & TD répartis sur une semaine En exploitation agricole : une semaine de stage en atelier bovin laitier (*) (*) enseignements soumis au contrôle de connaissances

OBJECTIFS D’ENSEIGNEMENT

L'enseignement dit de "Zootechnie Générale " concerne les animaux domestiques. Sur le plan théorique, il explique les bases de l'élevage (hors amélioration génétique). Sur le plan pratique, il vise à rendre les étudiants opérationnels pour l’acquisition et la mise en forme de données permettant de juger de la santé et de la qualité des animaux, ainsi que de la santé économique et de la technicité des ateliers de production. Un effort particulier est réalisé pour replacer cet enseignement dans le cadre de l'amélioration de la productivité des élevages et de la qualité des produits animaux. Tout ceci prépare l'étudiant à recevoir les enseignements de "Zootechnie Spéciale" dispensés espèce par espèce, les années suivantes. L’élevage des bovins laitiers est le modèle développé dans ce module d’où un stage en exploitation laitière bovine qui constitue le socle de l’enseignement dispensé dans cette U.E. OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE Au terme de l'enseignement de "Zootechnie Générale", l'étudiant devra être capable : - de savoir orthographier correctement et définir tous les termes spécifiques présentés dans le module et inscrits dans la liste distribuée au début du programme de l’U.E. ; Economie et économie rurale - de connaître les différentes composantes de la PAC qui régissent le fonctionnement d’une exploitation agricole ; - de répondre à des questions de culture générale sur l’élevage des bovins. Ces questions portent sur la description des filières des productions de lait et de viande bovine (principaux acteurs et économie), la description des produits animaux concernés (types et critères de qualité), la description des techniques d'élevage, de reproduction et de logement, les caractéristiques descriptives, de production et de répartition des 6 premières races bovines françaises ; - d’expliquer pourquoi et comment les producteurs laitiers adaptent leur production aux exigences des consommateurs et transformateurs ; - de connaître la définition et les grands blocs qui composent le bilan et le compte de résultats, la définition des divers résultats, la définition et l'intérêt de l'amortissement et de la marge brute, la définition et le fonctionnement de la TVA ; - de savoir effectuer une analyse financière du bilan ;

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Gestion de la reproduction et du prétroupeau - de savoir utiliser la comptabilité agricole pour améliorer le fonctionnement économique d’une exploitation ; - de recueillir les données brutes et calculer les principaux indicateurs nécessaires à la réalisation d’un bilan de reproduction dans un élevage bovin laitier et de commenter les chiffres de l’élevage par rapport aux recommandations usuelles ; - de décrire les signes cliniques associés à l’oestrus chez la vache ; - de décrire les méthodes de détection des chaleurs chez la vache (observation visuelle et techniques d’aide à la détection) ainsi que les difficultés associées, les avantages et inconvénients de chacune; - de connaître l’organisation de la filière insémination dans l’espèce bovine en France et les grandes lignes de sa réglementation ; - de décrire les modalités de récolte, de conditionnement, de stockage et de mise en place de la semence ; - de citer les avantages et inconvénients de l’utilisation de l’insémination artificielle dans l’espèce bovine ; - de justifier les recommandations concernant les différentes étapes de la croissance de la génisse de renouvellement ; - de décrire le cycle de production d’une vache laitière ; Gestion de la production laitière - de reproduire le schéma d’une courbe de lactation classique, d’en nommer les principales variations normales et anormales ; - de lister les modalités standardisées et les principaux critères mesurés lors du contrôle laitier officiel de base ; - de dessiner un schéma complet d’une machine à traire avec lactoduc en indiquant l’emplacement des divers composants de ce type de machine (cas d’une traite en salle de traite) ; - de décrire la structure, le rôle, le fonctionnement normal pour un régulateur, un pulsateur, une griffe, un gobelet trayeur à double chambre ; - d’exposer les conséquences d’un fonctionnement anormal, en terme de qualité du lait et de santé de la mamelle, pour un régulateur, un pulsateur, une griffe, un gobelet trayeur à double chambre, un lactoduc ; - de lister, décrire et justifier sur le plan technique et sur le plan hygiénique, les opérations de préparation de la mamelle pour la traite mécanique - de définir, expliquer l’origine et les conséquences de la « surtraite », de la « traite humide » et de « l’effet impact » ; - de définir les paramètres de traite cités en cours, de donner les chiffres recommandés les concernant et les conséquences du non respect de ces chiffres en terme de santé de la mamelle ; Gestion de l’alimentation des animaux - de juger la valeur alimentaire et la qualité des matières premières utilisées dans la ration de vaches laitières ; - d’estimer les besoins d’une vache laitière (en production et pendant le tarissement) et de connaître les facteurs de variation ; - d’estimer la quantité de fourrage (ration) consommée par une vache laitière dans les différents systèmes de rationnement ; - de connaître la définition de la ration individuelle (traditionnelle) pour vache laitière ; - de connaître la définition de la ration (semi-) complète pour vache laitière ; - de contrôler la ration effectivement ingérée par les vaches ; - d’établir un jugement global du système de rationnement par rapport aux objectifs de production ; Gestion du bien être et du logement des animaux (objectifs d’éthologie présentés en début d’enseignement) - d’exposer la notion de plage de neutralité thermique, les facteurs de variation des bornes de cette plage, l’intérêt de

cette notion dans l’élevage des animaux de rente ; - de lister les objectifs à atteindre par la ventilation dite « naturelle » des locaux d’élevage des animaux de rente ; - d’expliquer le mode de fonctionnement et les facteurs de variation d’efficacité de la ventilation dite « naturelle » ; - de décrire et justifier la conception de certains équipements utilisés en élevage des animaux de rente (à limiter aux

exemples présentés en enseignement) ; - de lister les effet du photopériodisme sur l’activité sexuelle de la poule et des espèces ovine, caprine, équine,

cunicole

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- d'exposer les éléments fondamentaux du comportement des bovins : notamment organisation temporelle des activités, communication, relation mère-jeune, relation humain-bovin. Ces éléments sont indispensables pour apprécier le bien-être des bovins placés dans des conditions contraignantes.

Gestes pratiques - de réaliser, sur des animaux, en toute sécurité, les opérations de contention et d'appréciation enseignées au Centre d'Application de Champignelles ;

PROGRAMME PARTIE THEORIQUE Cette partie est réalisée à Alfort et à Champignelles sous forme de cours et de travaux dirigés

Cours magistraux destinés à toute la promotion :

Semaines Jours Sujets/Enseignants Préparation

au stage

Du 09 au 11

septembre

Les marchés agricoles aux niveaux mondial et européen (1ère partie), 3h, I. Leroy (F) Elevage bovin en France, 2h, P. Bossé Fonctionnement d'une exploitation laitière, 2h, P. Arné Carrière de la vache laitière : de la naissance à la réforme, 2h, P. Arné Détection des chaleurs, 2h, S. Chastant Insémination artificielle, 2h, F. Constant Bases du rationnement alimentaire, 2h, A. Ponter Machine à traire et traite mécanique de la vache laitière, 4h, P. Bossé

0 Lu 15/09

Me 17/09

Ve 19/09

Ethnologie des bovins laitiers 1h, P. Bossé Ethologie et bien-être des bovins 1h, B Deputte Les marchés agricoles aux niveaux mondial et européen (2ème partie) 2h, I. Leroy Economie et microéconomie rurales (1ère partie) 2h, I. Leroy Bases du logement des animaux domestiques (1ère partie) (a) 2h, P. Bossé

1 Me 24/09 Economie et microéconomie rurales (2ème partie) 2h, I. Leroy 3 Lu 06/10 Contrôle de connaissances sur les cours magistraux (1h)

(a) lire avant le cours et apporter en cours le polycopié " l'environnement dans les locaux d'élevage". Apporter

aussi en cours le polycopié " Logement en élevage bovin laitier " (b) voir le programme et les coefficients ci-après

(F) Un film sur les bovins laitiers sera projeté juste avant le cours

Travaux dirigés réalisés en groupes

- Semaine « Préparation au stage » du 09 au 12 septembre : séances Reproduction (2h), Alimentation (2h), Bromatologie (1h)

- Courant semestre 5 Séance "Ethologie & bien être des bovins" (2h), dans les « Semaines pratiques » groupe « TD1 », de 16h15 à 18h15 les 01/10 ; 13/10 ; 03/11 ; 19/11 ; 10/12 et 17/12 (attention, c’est lundi ou mercredi selon les groupes !!!) Séance "Conseils pour réussir le stage" (2h), dans les créneaux « TD » ou dans les « Semaines pratiques » groupe « Anatomie » Séance "Zootechnie – Micro économie agricole" (3h) suivie d’un contrôle de connaissances (1h), dans les « Semaines Champignelles » (ATTENTION, apporter le polycopié "Notions de comptabilité" et une calculette)

PARTIE PRATIQUE Une partie est réalisée au centre d'Application de Champignelles sous forme de séances pratiques et de visites d'élevages : un programme vous sera distribué par I. Leroy

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Une partie est réalisée en ferme au cours du stage en exploitation laitière (semaine du 20 octobre 2008). NOTA : le stage est évalué au travers de deux rapports

- un premier rapport portant sur le bilan de reproduction de votre élevage sera à rendre fin S5. Sa note sera inclue dans l’U.E. « Zootechnie ».

- un second rapport sur tous les autres points de votre élevage sera à rendre en S6. Sa note constitue celle de l’U.E. « Stage en exploitation laitière »

CONTROLES DE CONNAISSANCES La Zootechnie Générale et la première semaine de stage constituent une seule et unique Unité d’Enseignement (U.E.) Le Lundi 06 octobre 2008, contrôle écrit, de type Q.C.M., portant sur l'ensemble des cours, y compris ceux réalisés en semaine de préparation en stage, à l’exception des cours « Micro-économie rurale » – contrôle sans note ni document - coefficient 3 En fin de séance de TD, contrôle écrit sur la micro-économie rurale (cours « Micro-économie rurale » et TD sur ce sujet) – contrôle sans note ni document - coefficient 1,5

IMPORTANT : Conformément à ce qui a été discuté et accepté au C.E.V.E., des points de pénalité seront soustraits à cette note de contrôle en cas d'absences injustifiées aux séances de TD. Le barème sera le suivant : - retrait de 2 points pour une absence - retrait de 5 points pour deux absences - note de 0 pour trois absences et plus En fin de trimestre, rendu d’un rapport sur le bilan de reproduction de l’atelier bovin laitier du lieu de stage. – contrôle avec notes et documents - coefficient 1,5 IMPORTANT : Conformément à ce qui a été discuté et accepté au C.E.V.E., des points de pénalité seront enlevés à cette note de contrôle en cas de retard injustifié pour rendre ce rapport. Le barème sera de un point de moins par jour de retard après la date de restitution du rapport

La moyenne de ces notes constitue la note de contrôle continu de semestre. Oral de fin de semestre en fin d'année pour les étudiants ayant une note de contrôle continu inférieure à 12 sur 20. L'oral consiste en une question de synthèse tirée au sort parmi celles d'une liste distribuée à l'avance. coefficient 4

Unité : Zootechnie, économie rurale

UE Libre : CLINIQUE FAUNE SAUVAGE NIVEAU 1 NB : cette UE est libre, c'est-à-dire facultative ; elle donne lieu à une attestation de formation et est mentionnée sur le supplément au diplôme. Semestre : toute l'année Enseignant responsable : J-F. COURREAU Crédits : 2 Personnes intervenant dans l'UE : P. ARNE, J-F. COURREAU, F. POPELIN Heures de formation par étudiant : Cours : 8h TD : 3h Cliniques : au moins 10 gardes équivalent à 20h (susceptible d'être modifié selon le nombre d'inscrits) AVERTISSEMENT Cet UE libre CFS suppose un engagement sans ambiguïté de l'étudiant qui y adhère. Cela signifie qu'aucune absence ne peut être admise, sauf cas de force majeure, du fait de la responsabilité prise : - vis-à-vis des animaux recueillis qui réclament des soins quotidiens attentifs, - vis-à-vis des camarades dont le travail se trouvera alourdi, - vis-à-vis des responsables qui organisent un apprentissage original et auxquels l'Ecole demande d'assurer un service de qualité. En conséquence, - la présence aux cours, TD et gardes cliniques est obligatoire et conditionne la validation de l'UV ; - la motivation de l'étudiant doit être forte car il doit assurer son service quelles que soient ses charges de travail, par ailleurs. OBJECTIFS D'APPRENTISSAGE A l'issue de l'enseignement, l'étudiant doit être capable :

- de faire la diagnose des principales espèces accueillies dans les centres de sauvegarde ;

- de réaliser une contention adaptée à l'espèce, sans danger pour l'animal et pour le manipulateur ;

- de réaliser une installation assurant le bien-être de l'animal conformément à son espèce, son âge et son état physiologique ;

- de composer la ration alimentaire quotidienne d'un animal et de la lui mettre à disposition en tenant compte de son espèce, de son âge et de son état physiologique ;

- de mettre en pratique les différentes techniques de nourrissage manuel selon l'espèce, l'âge et l'état physiologique de l'animal ;

- de décrire les principales particularités anatomiques d'un oiseau ; - de comprendre le déroulement d'un examen clinique et d'aider le consultant par

une contention appropriée ; - d'aider à la réalisation des soins infirmiers ;

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- d’expliquer les conséquences pratiques du statut légal de protection pour une espèce dans le milieu sauvage, recueillie par une personne ou détenue dans un centre de sauvegarde.

PROGRAMME Cours Présentation générale, organisation de la Clinique Faune Sauvage (1h) Diagnose de l'espèce, de l'âge, du sexe des animaux recueillis (1,5h) Principales causes d'entrée selon l'espèce et l'âge (1,5h) Alimentation, logement et hygiène des animaux hospitalisés (2h) Législation relative à la faune sauvage (2h) TD Contention et examen clinique (2h) Anatomie des oiseaux et radioanatomie (1h) Clinique L'équipe de garde est composée d'étudiants préparant le Niveau 1 et, pour les encadrer, d'étudiants préparant ou ayant le Niveau 2 ; selon leur qualification, les étudiants sont chargés au cours des 24h de la garde : - de recueillir tous les animaux sauvages arrivant aux Urgences ; - de réaliser leur examen clinique, les radios nécessaires, les premiers soins et leur installation; - d'assurer l'alimentation des animaux en cours de soins ; - d'assurer le nettoyage des litières ; - de maintenir propres les locaux ; - de compléter les dossiers cliniques. NB : la mise en place des protocoles thérapeutiques et la décision d'euthanasie sont du ressort des enseignants. Validation de l'UE : La validation de l'UE "Clinique Faune Sauvage Niveau 1" est conditionnée par la présence à tous les enseignements et par la réalisation du nombre de gardes requis. Cette condition sine qua non étant remplie, la validation de l'UE est acquise si l'étudiant a assuré un travail de qualité en garde et montré sa capacité à atteindre les objectifs d'apprentissage. NB : Les dates de garde sont imposées. En cas d'empêchement le jour où il est affecté à une garde, l'étudiant doit prévenir le responsable de l'UV et trouver un autre étudiant avec lequel il permutera sa garde. NB : Toute absence, excusée, en cours ou TD pourra être compensée par un examen de rattrapage, oral ou écrit, sur le programme concerné.