Paraclinique de génétique

« Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de

Salmonella abortusovis, Rv6 »

Marie LejongKatinka van Golen

2ème Doc

Objectifs

1) Étude de la susceptibilité à salmonella abortusovis chez le mouton

2) Étude du contrôle génétique de la réponse à l’infection (héritabilités et corrélations génétiques)

quel(s) critère(s) sélectionner pour augmenter la résistance à

S. abortusovis

Matériel

Population « Inra401 » de 1216 agneaux

Issue de 30 pères Lignée développée à.p.d. 2 races: Berrichon du Cher et Romanov

Souche vaccinale (atténuée) de S.abortusovis: souche Rv6

Lieu: Institut National de la Recherche Agronomique en France

Année: 2002

Protocole expérimental

J0

Prise de poids: Wt0 (objectif M:38kg et F:32kg)

Prise de sang: IgG10 et IgM0

Inoculation IV: 108 bactéries de la souche vaccinale Rv6

J7

Prise de poids: Wt7

Prise de sang: IgG17 et IgM7

Protocole expérimental

J10: Abattage et échantillonnage ( rate/nœuds lymphatiques)

Enumération bactérienne BgS: n bactéries/g de rate BgS01: absence/présence de bactéries dans la rate BgRN: n bactéries/g de NL préscapulaire droit BgLN: idem nœud lymphatique gauche

Poids des organes Wts poids de la rate Wtln/rn poids des NL Wtrs: poids relatif de la rate: Wts/Wt0

Perte de poids entre J0 et J7: loss-Wt

Modèles

1) Analyse des variables continues: le modèle gaussien:

effets fixes significatifs

effets fixes choisis dans le modèle final: P<0,05

Modèles

2) Analyse de la variable binaire: le modèle seuil

« présence ou absence de salmonella abortusovis

dans un gramme de rate ».

Signification des effets testés

variable Variance

expliquée

sexe poids Age type

Nais/tétée

ssgroupe père

IgM0

Var IgM

Log IgG10

LogVaIgG10

0.35

0.17

0.13

0.22

NS

+

NS

NS

NS

NS

NS

NS

+++

+

++

NS

NS

NS

++

+

+++

+

+++

+++

+++

+++

+++

+++

LogBgLN

LogBgRN

LogBgS

0.10

0.11

0.05

++

++

++

NS

NS

NS

+

+++

NS

NS

NS

NS

NS

NS

NS

+++

+++

+

LogWtLN

LogWtRN

LogWtS

LogWtrS

0.17

0.18

0.30

0.18

+++

+++

+++

+++

NS

NS

+++

NS

+++

+++

+++

+++

NS

NS

+++

+++

+++

+++

++

++

+++

+++

+++

+++

LogLossWt 0.11 +++ + ++ NS NS ++

BgS01 - + - NS NS NS +

Modèles

• Estimation de l’héritabilité et des corrélations phénotypiques et

génétiques: le modèle mixte linéaire:

Ykl=Xkl.β+ε

Y: variable aléatoire dépendanteX: variable explicativeβ: effets fixesε : erreur corrélée

LogIgG10

LogVarIgG10

IgM0 VarIgM

LogLN

LogBgRN

LogBgS

LogLN

LogWtRN

LogWtrS

LogLossWt

Log IgG10 0.14±0.04

-0.53 -0.17 -0.06 -0.05 0.19 -0.11 0.49 0.48 0.27 0.12

LogVarIgG1

-0.10 0.30±0.03

0.11 0.55 0.16 0.12 0.11 0.28 0.45 0.27 0.24

IgM0 0.13 0.04 0.64±0.03

-0.12 0 0.09 -0.60 -0.12 -0.12 0.25 -0.38

VarIgM -0.01 0.33 -0.09 0.37±0.02

0.29 0.25 0.13 0.14 0.16 0.31 0.45

LogBgLN 0.03 0.09 0.04 0.18 0.22±0.03

O.93 0.56 0.01 0.06 0.26 0.41

LogBgRN 0.04 0.06 -0.02 0.19 0.53 0.27±0.03

0.51 -0.06 0.07 0.38 0.20

LogBgS -0.02 0.07 -0.04 0.19 0.16 0.17 0.06±0.01

-0.34 -0.12 0.01 O.58

LogWtLN -0.04 0.01 0.05 -0.03 0.25 0.10 0.02 0.33±0.04

0.89 0.08 0.06

LogWtRN -0.01 0.05 0.04 -0.01 0.16 0.26 0.04 0.52 0.26±0.03

0.24 0.16

LogWtrS -0.02 -0.01 0.13 0.06 0.01 0.04 0.01 0.07 0.10 0.54±0.03

0.24

LogLossWt -0.03 O.16 -0.07 0.40 0.06 0.09 0.25 -0.14 -0.17 -0.14 0.10±0.02

Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques

Applications

• Objectif: une plus grande résistance des moutons face à salmonella abortusovis.

• En pratique: utilisation de IgM0 comme critère de sélection??

Remarques• Effet maternel???

• Recherches à approfondir avant sélection!

LogIgG10

LogVarIgG10

IgM0 VarIgM

LogLN

LogBgRN

LogBgS

LogLN

LogWtRN

LogWtrS

LogLossWt

Log IgG10 0.14±0.04

-0.53 -0.17 -0.06 -0.05 0.19 -0.11 0.49 0.48 0.27 0.12

LogVarIgG1

-0.10 0.30±0.03

0.11 0.55 0.16 0.12 0.11 0.28 0.45 0.27 0.24

IgM0 0.13 0.04 0.64±0.03

-0.12 0 0.09 -0.60 -0.12 -0.12 0.25 -0.38

VarIgM -0.01 0.33 -0.09 0.37±0.02

0.29 0.25 0.13 0.14 0.16 0.31 0.45

LogBgLN 0.03 0.09 0.04 0.18 0.22±0.03

O.93 0.56 0.01 0.06 0.26 0.41

LogBgRN 0.04 0.06 -0.02 0.19 0.53 0.27±0.03

0.51 -0.06 0.07 0.38 0.20

LogBgS -0.02 0.07 -0.04 0.19 0.16 0.17 0.06±0.01

-0.34 -0.12 0.01 O.58

LogWtLN -0.04 0.01 0.05 -0.03 0.25 0.10 0.02 0.33±0.04

0.89 0.08 0.06

LogWtRN -0.01 0.05 0.04 -0.01 0.16 0.26 0.04 0.52 0.26±0.03

0.24 0.16

LogWtrS -0.02 -0.01 0.13 0.06 0.01 0.04 0.01 0.07 0.10 0.54±0.03

0.24

LogLossWt -0.03 O.16 -0.07 0.40 0.06 0.09 0.25 -0.14 -0.17 -0.14 0.10±0.02

Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques

Merci