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PROGRAMME et RECUEIL DES PRÉSENTATIONS

JOURNÉES TECHNIQUES

CISTUDE4 et 5 FÉVRIER 2015

LE CONSEIL DÉPARTEMENTAL DU BAS-RHINAU DE VOS VIES

Journées techniques cistude, Strasbourg, 4-5 février 2015

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Comité d’organisation

Jean-Yves Georges, CNRS, IPHC, Strasbourg, [email protected]

Fabrice Levresse, CG67, Strasbourg, [email protected]

Benoît Quintard, PZBM, Mulhouse, [email protected]

mailto:[email protected]




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Comité de lecture

Marc CHEYLAN, CNRS, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive, Montpellier.

[email protected]

Jean-Yves GEORGES, CNRS, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, Strasbourg. [email protected]

Fabrice LEVRESSE, Conseil Général du Bas Rhin, Strasbourg. [email protected]

André MIQUET, Conservatoire d’espaces Naturels de Savoie, Le Bourget du Lac. [email protected]

Benoît QUINTARD, Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse. [email protected]

Stéphanie THIENPONT, Coordinatrice Nationale PNA Cistude [email protected]








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Sommaire

Programme des Journées techniques « cistudes » 2015 p4

Présentations orales p7

Session 1 : Suivi de populations p 8

Session 2 : Renaturation et suivi des milieux p14

Session 3 : Elevages p23 Session 4 : Outils de communication p24

Résumés des posters p25


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Programme des Journées Techniques « Cistude » 2015

Le 4 février

- 8h00-8h45 : Accueil et inscription des participants

- 8h45-09h00 : Discours d’ouverture

1. Suivi de populations (Modérateur : A. Miquet)

- 9h00-09h20 Comportements et déplacements à fine échelle d’une cistude d’Europe Emys orbicularis par télémétrie spatiale sur l’Espace Naturel Sensible de Tartuguière (Hérault) Jean-Yves Georges & Thomas Gendre

- 9h25-09h45 Etude de la dispersion chez la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) en Camargue Sébastien Ficheux, Remi Wattier, Arnaud Béchet, Alain Crivelli, François Bretagnolle, Aurélien Besnard & Anthony Olivier

- 09h50-10h20 : Pause café /Posters

- 10h20-10h40 Survie et comportement au cours du premier hiver post-relâcher de cistudes d’Europe Emys orbicularis en Alsace, NE France Jean-Yves Georges

2. Renaturation et suivi des milieux (Modérateur : S. Ficheux)

- 10h45-11h05 Mise en œuvre de travaux de renaturation sur un espace naturel sensible, le site du Woerr Sébastien Kern


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- 11h10 – 11h30

Trois apports de l'écologie moléculaire à la conservation de la Cistude d'Europe: 1) détection par ADN environnemental, 2) gestion des petites populations fragmentées en Bourgogne et 3) quel possible devenir pour les individus captifs ? Remi Wattier, Arnaud Béchet, François Bretagnolle, Alain Crivelli, Tony Dejean, Bernard Devaux, Sébastien Ficheux, Uwe Fritz, Stéphane Gagno, Damien Lerat, Mélodie Lettmann & Anthony Olivier

- 11h35 – 11h55 Estimation de la biomasse disponible en macro-invertébrés aquatiques susceptible de nourrir les cistudes d’Europe Emys orbicularis relâchées sur le site alsacien du Woerr (Nord Est de la France) : résultats préliminaires Corinne Grac, Nadia Fernandez, Albin Meyer, Cybill Staenszel, Jean-Yves Georges, Frédéric Labat

- 12h00-14h00 : Buffet dînatoire à l’Hôtel du Département

- 14h00-14h20 Tests de prédation de la moule zébrée Dreissena polymorpha par la cistude d’Europe Emys orbicularis Jean-Yves Georges, Corinne Grac, Benoît Quintard

- 14h25-14h45 Site d’Etude en Ecologie Globale du Woerr : Approche socio-écologique d’un programme de relâcher de cistude d'Europe Emys orbicularis en Alsace Jean-Yves Georges, Jean-Nicolas Beisel, Isabelle Combroux, Corinne Grac, Daniel Hoch, Philippe Knibiely, Frédéric Labat, Fabrice Levresse, Benoît Quintard, Anne Rozan, Pierre Schneider,

- 14h50-15h20 : Pause café / Posters

3. Elevages (Modérateur : J-Y. Georges)

- 15h20-15h40 L'élevage de cistudes à Zoodyssée : une expérience en mouvement Pierre-Jean Albaret


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- 15h45-16h05

Elevage conservatoire du programme « Cistude Alsace » Benoît Quintard, Baptiste Doenlen, Philippe Knibiely, Fabrice Levresse, Jean-Yves Georges

4. Outils de communication (Modérateur : F. Levresse)

- 16h25-16h45 Présentation du Web-documentaire Christophe Coïc

Le 5 février

- 09h00 - 09h30 : accueil des participants

- 9h30-10h30 : Tables rondes en parallèle 1. Gestion des espaces naturels vs problématiques espèces 2. Elevages 3. Plan National d’Actions cistude (pour les référents PNA régionaux)

- 10h30 – 11h00: Pause café

- 11h00 – 12h00: Synthèse et discussions

- 12h00-13h30 : Déjeuner à l’extérieur à la charge des participants

- 13h30-18h00 : Visite du site de réintroduction et de l’Espace Naturel Sensible du Woerr (selon météo)

o 13h30 : départ de l’Hôtel du Département o 18h00 : retour à l’Hôtel du Département


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Présentations Orales


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Comportements et déplacements à fine échelle d’une cistude d’Europe Emys orbicularis par télémétrie spatiale sur l’Espace Sensible Naturel de

Tartuguière (Hérault)

Jean-Yves Georgesa,b & Thomas Gendrec

a Université de Strasbourg, IPHC, 23 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France b CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France [email protected]

c Conservatoire d’espaces naturels Languedoc-Roussillon, Parc Club du Millénaire, Bâtiment 31, 1025 avenue Henri Becquerel, 34000 Montpellier, France

[email protected]

L’habitat est un élément clé de l’écologie et de la dynamique des populations. Il est donc nécessaire d’étudier l’utilisation de l’habitat pour évaluer le statut d’une espèce, en particulier celles d’intérêt patrimonial ou conservatoire, afin d’établir des plans de gestion raisonnés. Les classiques observations de terrain, suivis démographiques et suivis par VHF ont été largement utilisés pour étudier la distribution des populations set l’utilisation des habitats par les individus. Toutefois, ces approches classiques n’apportent pas d’information à fine échelle sur le comportement, les déplacements et l’utilisation de l’habitat, en particulier pour les espèces cryptiques exploitant des habitats multiples et contrastés. Le domaine de Tartuguière (Lansargue, Hérault) est une zone humide de 15 ha soumise à la double influence des eaux douces et des eaux salées, avec, au Nord, un grand marais et au Sud de grandes digues artificielles. Ce site accueille une population naturelle de quelques 150 cistudes adultes, dont la gestion passe par une meilleure connaissance de l’utilisation qu’elle a de son habitat. Nous avons déployé des GPS CatTrack (http://www.mr-lee-catcam.de) sur 6 cistudes femelles (longueur carapace CL = 159 ± 7 mm [147-170 mm], masse corporelle BM = 712 ± 61 g [656-825 g]) au printemps 2014. Les cistudes étaient capturées lors de sessions de capture/marquage/recapture dédiées à au suivi démographique du CEN-LR. Les GPS étaient modifiés à l’IPHC (pose d’un interrupteur magnétique et encapsulation en résine) afin de les rendre robustes et étanches (masse finale : 22 g). Les GPS étaient programmés pour fournir 1 position par heure sur environ 24 jours. Les GPS ne fournissant des informations que lorsqu’ils sont à ciel ouvert, le comportement d’insolation (diurnes) et de ponte (nocturne) pouvait être déduit en plus des positions horodatées. Les données ont été analysées en lien avec les habitats à l’aide d’un SIG. Des puces RFID actives (http://ela.fr) étaient également utilisées pour améliorer le taux de recapture. Les sessions de recapture avaient lieu 3 semaines après les déploiements.



http://www.mr-lee-catcam.de/

http://ela.fr/


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Parmi les 6 cistudes équipées, seulement 1 (Marilyn) a été recapturée. Son GPS a fourni 117 positions pour 21 jours de suivi (du 3 au 24 juin 2014, soit 5,6 positions/j). Son trajet peut être séparé en 3 phases de résidence séparées par des phases de transit. Phase 1 : du 3 au 10 juin, Marilyn est restée dans un rayon de 100 mètres de son site de relâcher. Le 8 juin, elle sort de l’eau de 15:30 à 22:30 et passe les 3 dernières heures consécutives à 10 m de la roubine, suggérant une (tentative de) ponte. Elle reste alors immergée pendant 36 heures consécutives pour se déplacer (sans temps d’émersion, donc sous l’eau), le 10 au soir, sur 900 mètres en 18 heures (soit ~50m/h). Phase 2 : du 12 au 20 juin, elle reste dans la zone « nord », de dimension similaire à la première, avec plusieurs excursions diurnes dans les champs agricoles alentours. Elle reste à nouveau immergée 48 h en continu avant de se retrouver le 22 juin dans un plan d’eau adoucie situé (à 100 m du site de relâcher initial, soit ~20m/h), où elle est recapturée le 24 juin. Cette étude préliminaire montre, pour la première fois à notre connaissance, que le GPS peut apporter des informations nouvelles, à fine échelle et de manière autonome, sur les comportements, les mouvements et l’utilisation de l’habitat chez les tortues d’eau douce. Toutefois, les GPS devant être récupérés, un gros effort de recapture est nécessaire. Le coût relativement bas de ces unités permet de palier à ces contraintes de terrain en déployant de grands effectifs sur les populations naturelles. Remerciements : Marine Couronne, Marilyne Lopes d’Andrade


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Etude de la dispersion chez la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) en Camargue

Sébastien Ficheuxa,b, Remi Wattierb, Arnaud Bécheta, Alain Crivellia, François Bretagnolleb,

Aurélien Besnardc & Anthony Oliviera

a Tour du Valat, centre de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes, Le Sambuc, 13200 Arles, France. [email protected]

b Equipe Eco-Evo, UMR 6282 Biogéosciences, Université de Bourgogne, 6 bd Gabriel, 21000 Dijon, France. [email protected]

c Laboratoire de Biogéographie et Ecologie des Vertébrés, Ecole Pratique des Hautes Etudes, Centre d’Ecologie Evolutive et Fonctionnelle, UMR 5175, 1919 Route de Mende, F34293

Montpellier cedex 5, France La dispersion est caractérisée par le mouvement d’individus qui quittent leur population natale pour s’installer et se reproduire dans une autre population. Comprendre les mouvements d’individus entre les populations permet de mieux appréhender la dynamique des populations et, dans une perspective de conservation, de prendre des mesures de protection adaptées. La dispersion des animaux aux capacités de déplacement limitées, comme la Cistude d’Europe (Emys orbicularis), devient, au fil des aménagements humains, de plus en plus risquée : écrasement lors des traversées de routes, noyade dans les filets de pêche ou dans les siphons des structures hydrauliques. La Cistude fait donc partie des espèces particulièrement vulnérables face à la fragmentation des zones humides. Consciente de cette fragilité, la Tour du Valat a mis en place en 1997 un suivi individuel par capture-marquage-recapture (CMR) sur deux noyaux de population présents sur sa RNR (les Faïsses et l’Esquineau). Ces trois dernières années, ce suivi a été complété par une étude de génétique des populations à travers une thèse de doctorat portée conjointement par la Tour du Valat et le laboratoire Biogéosciences de l’’université de Bourgogne. Bien que les deux noyaux de population étudiés à la Tour du Valat soient proches géographiquement (distants d’environ 1km) et très connectés fonctionnellement par la présence de nombreux corridors aquatiques, les résultats montrent que les 274 femelles adultes marquées sont d’une fidélité absolue à leur site de naissance et que seulement quelques mâles (2,75% des 254 mâles marqués) se déplacent d’un noyau à l’autre. Les 392 juvéniles marqués sont également totalement fidèles à leur site et la dispersion des mâles ne débute pas avant l’âge de 5 à 6 ans. Aucun autre facteur testé ne semble influencer la dispersion (taille des individus, années de suivi, site d’étude). Les résultats de génétique des populations confirment totalement les données obtenus par CMR. Cependant, la dispersion est bien trop faible sur ce site pour conduire à une homogénéisation de la diversité génétique. Par conséquent, les populations présentes sur le domaine de la Tour du Valat sont différenciées génétiquement.




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Nous émettons l’hypothèse que la disponibilité des ressources (sites de ponte et nourriture) est suffisamment importante et que le recrutement des juvéniles est trop faible pour générer une dispersion importante dans cette population. Il serait alors plus avantageux pour les cistudes de la Tour du Valat de se cantonner à leur site de naissance et d’éviter les risques associés à la dispersion. L’accroissement important et récent de l’effectif d’un des deux noyaux de population permettra peut-être à l’avenir de suivre le processus de reconnexion des deux populations.


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Survie et comportement au cours du premier hiver post-relâcher de cistudes d’Europe Emys orbicularis en Alsace, NE France

Jean-Yves Georgesa,b

a Université de Strasbourg, IPHC, 23 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France b CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France [email protected]

L’évaluation du succès d’introduction ou de réintroduction d’espèces consiste à mesurer, dans un premier temps, le taux de survie des individus relâchés. Cette évaluation est d’autant plus importante que plusieurs études rapportent une survie particulièrement faible chez les individus issus d’élevage. Toutefois, les protocoles d’élevage et de relâcher sont aussi variés que nombreux, de sorte qu’une généralisation n’est pas évidente. L’étude des déterminants de la survie, qu’ils soient environnementaux (conditions météo, état des masses d’eau, etc.) ou individuels (état de santé, comportement, etc.) est donc une étape primordiale pour mieux appréhender les causes des (in-)succès de telles actions de conservation et proposer d’éventuelles améliorations. Dans le cadre du programme de relâcher de la cistude d’Europe en Alsace (NE de la France, porté par le Conseil Général du Bas-Rhin), un premier groupe de 15 subadultes (6-7 ans) issus d’un élevage dédié (station de recherche de la Petite Camargue alsacienne, St Louis) a été relâché en octobre 2013 sur le site du Woerr (Lauterbourg). Avant leur relâcher, 9 de ces individus (longueur de carapace CL = 104 ± 6 mm [95-114 mm], masse corporelle BM = 211 ± 32 g [162-263 g]) ont été équipés d’un enregistreur de pression/température/lumière opérant à 1Hz (type WACU, produits à l’IPHC http://www.iphc.cnrs.fr). A partir de mars 2014, des sessions de recapture successives ont permis de récupérer les 15 cistudes (survie hivernale 100%). Au cours de ces 5 mois d’hiver, les cistudes avaient perdu 0,6 ± 1,0 g/mois (0,7 ± 1,0 g/mois pour les cistudes équipées d’enregistreur). Le comportement de plongée des cistudes variait à mesure que l’hiver progressait, avec des apnées plus longues mais moins nombreuses : ainsi, au cœur de l’hiver alsacien (alors que la température de l’eau variait entre 6°C et 9°C), les cistudes ne venaient en surface pour respirer qu’une fois par 24 heures !!! Ces apnées record avaient essentiellement lieu lorsque la température de l’eau était en deçà de 8,5°C, ce qui suggère un seuil thermique au-delà duquel d’autres activités apparaissent. Cette hypothèse est soutenue par le fait qu’à certaines périodes de l’hiver, les cistudes montraient une activité marquée avec une fréquence de respiration en surface élevée. Ces premiers résultats montrent que les cistudes d’Europe relâchées en Alsace survivent à des conditions hivernales relativement douces comme celles observées en hiver 2013 et qu’elles ajustent leur comportement de manière marquée en fonction des conditions environnementales et en particulier thermiques.


http://www.iphc.cnrs.fr/


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Les apnées reportées ici, pouvant dépasser 24 heures, pulvérisent le record absolu toutes espèces à respiration aérienne confondues. Les études à venir sur les prochains hivers et sur les autres groupes relâchés permettront de préciser les capacités de survie à long terme de cette nouvelle population de cistudes en Alsace.


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Mise en œuvre de travaux de renaturation sur un espace naturel sensible, le site du Woerr

Sébastien Kerna

a Conseil Général du Bas Rhin, Strasbourg, France [email protected]

Le site du Woerr, à Lauterbourg, a été classé zone de préemption Espace Naturel Sensible par le Conseil Général du Bas-Rhin en 2001. Ce site est à la confluence du Rhin et de la Vieille Lauter, et accueille un patrimoine naturel remarquable. Ce classement a permis de maitriser le foncier d’une partie du site, garantissant sa préservation à long terme. Des investigations naturalistes et hydrauliques du site ont mis en évidence la présence d’une espèce d’amphibien en très mauvais état de conservation localement, un atterrissement progressif des zones humides conjugué à une fermeture des espaces ouverts par la végétation arbustive et arborée. Sur la base de cet état des lieux, le Conseil Général du Bas-Rhin a entrepris des travaux de restauration écologique. Ils visent à offrir de nouvelles zones humides favorables à l’expression de la biodiversité rhénane, dont le pélobate brun (Pelobates fuscus) et la tortue cistude (Emys orbicularis). Une hétérogénéité de formes, d’orientations et de profondeur a été mise en œuvre lors de ces travaux.



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Trois apports de l'écologie moléculaire à la conservation de la Cistude d'Europe: 1) détection par ADN environnemental, 2) gestion des petites

populations fragmentées en Bourgogne et 3) quel possible devenir pour les individus captifs ?

Remi Wattiera, Arnaud Béchetb, François Bretagnollea, Alain Crivellib, Tony Dejeanc, Bernard Devauxd, Sébastien Ficheuxa, b, Uwe Fritze, Stéphane Gagnod, Damien Leratf,

Mélodie Lettmanna & Anthony Olivierb

a Equipe Eco-Evo, UMR 6282 Biogéosciences, Université de Bourgogne, 6 bd Gabriel,

21000 Dijon, France [email protected] b Tour du Valat, centre de recherche pour la conservation des zones humides

méditerranéennes, Le Sambuc, 13200 Arles, France c SPYGEN Savoie Technolac - Bât. Koala, 17, rue du Lac Saint-André - BP 274,

73375 Le Bourget-du-Lac Cedex, France d Le Centre de Recherche et de Conservation des Chéloniens (CRCC) de la Station

d’Observation et de Protection des Tortues et de leurs Milieux (SOPTOM), Village des Tortues BP24, 83590 Gonfaron, France

e University of Leipzig, Museum of Zoology, Senckenberg Natural History Collections Dresden, A. B. Meyer Building, D-01109 Dresden, Germany

f Société d'Histoire Naturelle d'Autun, Observatoire de la Faune de Bourgogne Maison du Parc 58230 Saint-Brisson, France

Trois applications d’outils moléculaires (ADN) à la conservation de la cistude d’Europe sont présentées :

1. L’ADN environnemental ou ADNe permet de détecter de manière qualitative la présence d’organismes aquatiques à travers les traces (desquamations…) qu’ils laissent dans l’eau. La mise au point d’un tel outil pour la Cistude est actuellement achevée. Une paire d’amorces PCR a été développée et sa spécificité pour la cistude a été testée. La possibilité de détecter la présence de l’espèce en conditions naturelles a été vérifiée, même si la densité de la population est faible. La cinétique de dégradation de l’ADN a été mesurée en mésocosmes, indiquant une dégradation assez rapide comparativement à d’autres organismes tels que poissons et batraciens. Une technique de prélèvement par filtration d’une quantité importante d’eau a donc été adoptée. L’avenir de cette technique dans le cadre du PNA cistude sera discuté.



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2. Les populations de Cistudes de Bourgogne sont caractérisées à la fois par une petite

taille de dénombrement (quelques fois inférieure à quelques dizaines d’individus) et un très fort degré de fragmentation associé à une très forte rupture de connectivité fonctionnelle. Cinq populations (150 individus) ont été analysées. Les séquences mitochondriales (cytb) montrent la présence de deux lignées (IIa et IVa).

Si la première est attendue étant donné l’histoire phylogéographique actuellement

connue pour l’espèce, la deuxième ouvre la question d’une introduction récente ou d’une recolonisation postglaciaire non documentée jusqu’à présent. L’application de 11 marqueurs microsatellites montre une forte différentiation mais une perte de variabilité allélique assez variable. L’impact sur le plan de gestion au niveau régional sera discuté.

3. Le Centre de Recherche et de Conservation des Chéloniens (CRCC-SOPTOM) de

Gonfaron, possède actuellement environ 70 tortues apportées par des particuliers. Dans un effort visant à : soit utiliser ces individus dans des programmes de réintroductions ou soit de les rapatrier dans leur populations d’origine, la séquence cytb de tous les individus a été obtenue : 12 individus de types IIa, 2 individus de types I (Ia et Ig) et une grande majorité (58 individus) de type Va. Les JTC seront le cadre idéal pour discuter de l’avenir possible de ces individus captifs et surtout de la meilleure stratégie pour y parvenir : 1. échantillonnage de populations naturelles sources en France, mais aussi en Espagne et Italie et 2. panel commun de microsatellite pour l’identification des populations sources et des hybrides.


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Estimation de la biomasse disponible en macro-invertébrés aquatiques susceptible de nourrir les cistudes d’Europe Emys orbicularis relâchées sur le

site alsacien du Woerr (Nord Est de la France) : résultats préliminaires

Corinne Graca, Nadia Fernandeza, Albin Meyera, Cybill Staenszela, Jean-Yves Georgesb,c , Frédéric Labatd,

a Laboratoire Image, Ville et Environnement, UMR 7362, CNRS-Université de Strasbourg-

ENGEES, 3 rue de l'Argonne, 67000 Strasbourg [email protected] b Université de Strasbourg, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), 23 rue Becquerel,

67087 Strasbourg, France c CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France

d Aquabio, ZA du Grand Bois Est, 33750 Saint-Germain-du-Puch

Le Département du Bas-Rhin (CG67) est porteur du projet de réintroduction de la cistude d’Europe (Emys orbicularis), inscrit dans sa Charte de l'Environnement de 1990, pour lequel le Ministère de l’Ecologie et du Développement Durable a donné son accord en septembre 2004. Cette espèce aurait disparu de la zone du Rhin supérieur vers la fin du 19ème siècle, notamment en raison de la destruction de son habitat. Le projet de réintroduction de la cistude, au-delà du relâcher des animaux, a permis d’aménager et de protéger des milieux naturels, et ainsi, de favoriser le retour de tout un cortège d’animaux et de plantes inféodés aux zones humides. Le site de relâcher est le site frontalier du Woerr, à Lauterbourg : d’une superficie d’environ 150 hectares situés entre le Rhin et la Vieille Lauter, il répond aux exigences variées, aquatiques et terrestres, de la cistude et bénéficie d'un bon cadre de protections réglementaires (Natura 2000, Zone Naturelle d’Intérêt Ecologique Faunistique et Floristique, Réserve Biologique Domaniale et Espace Naturel Sensible du CG67). En 2011 et 2012, des travaux de restauration des milieux aquatiques ont été réalisés par le CG67 afin de donner toutes les chances de réussite au projet de réintroduction et de rétablir des continuités écologiques aquatiques. Ainsi, six nouveaux milieux lentiques ont été créés : quatre mares et deux « étangs » dont un connecté à la gravière ; des zones de berges peu profondes ont également été aménagées sur la gravière. En vue d’estimer une partie des ressources alimentaires disponibles pour les cistudes relâchées, nous avons tenté d’approcher la biomasse disponible en macro-invertébrés aquatiques du site. Des échantillonnages en macro-invertébrés couplés aux relevés des caractéristiques habitationnelles de chaque milieu lentique ont été réalisés en 2012 et en 2013.



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Tous milieux confondus, en 2013, 140 taxons ont été identifiés, aux niveaux du genre ou de la famille principalement, et dénombrés. Dix taxons, parmi les plus abondants ou les plus gros, ont été pesés par lots de 50 à 100 individus, à raison de 3 répliquats par taxon. Il s’agit des gastéropodes Planorbidae et Physa, des bivalves Dreissena (l’espèce exotique invasive D. polymorpha : la moule zébrée), des crustacés Daphnies, Assellidae, et Mysidae, des larves d’insectes Chironomidae et Leptocerus, Ephemeroptères principalement représentées par les Caenidae et Anisoptères. Les poids frais unitaires trouvés sont compris entre 0.032 mg pour les Mysidae et 113.6 mg pour les Anisoptères, avec une moyenne de 14.89 mg. La calcination (à 550°C) des échantillons a permis d’estimer que la part de matières organiques allait de plus de 90% chez les Arthropodes pesés à 49% chez les mollusques (Dreissena). Pour le calcul de biomasse invertébrée par milieu, nous avons attribué aux taxons non pesés les poids des animaux pesés aux proportions les plus proches. En tenant compte pour chaque milieu de sa surface totale en eau, des surfaces échantillonnées et du dénombrement de chaque taxon par habitat, ainsi que la proportion de chaque habitat présent. En 2013, les biomasses estimées variaient en 2013 de 0.06 kg à 12 kg dans les mares dont les surfaces vont de 82 à 1 646 m² et de 5 à 10 kg dans les étangs d’environ 1 000 m² chacun. Globalement, ces biomasses ont augmenté par rapport à 2012 dans ces nouveaux milieux. La biomasse de la gravière (surface 8 ha) a été estimée à 484 kg, dont 95% est constituée de Dreissena. Les moules zébrées représentent donc le réservoir de la biomasse en macro-invertébrés aquatiques sur le Woerr. Ce résultat nous a conduits à mettre en œuvre des tests de prédation de Dreissena par les cistudes en captivité.


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Tests de prédation de la moule zébrée Dreissena polymorpha par la cistude d’Europe Emys orbicularis

Jean-Yves Georgesa,b , Corinne Gracc, Benoît Quintardd

a Université de Strasbourg, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), 23 rue Becquerel,

67087 Strasbourg, France [email protected] b CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France

c Laboratoire Image, Ville et Environnement, UMR 7362, CNRS-Université de Strasbourg-ENGEES, 3 rue de l'Argonne, 67000 Strasbourg, France

d Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse, 51 rue du jardin zoologique, 68100 Mulhouse, France

Dans le contexte actuel de la 6ème crise de la biodiversité, les programmes de réintroduction sont considérés comme une stratégie d’avenir à long terme pour la gestion durable des espaces et des espèces. Toutefois, les actions de réintroduction, mais également de renforcement de populations, peuvent induire des impacts imprévisibles sur les espèces déjà présentes dans le milieu, et de manière plus globale, sur le fonctionnement des écosystèmes. Dans le cadre du programme de relâcher de cistudes en Alsace (NE de la France, porté par le Conseil Général du Bas-Rhin), nous avons réalisé des tests de prédation de cette tortue d’eau douce de taille moyenne sur une espèce invasive, la moule zébrée, déjà présente sur le site de relâcher. La moule zébrée est une espèce d’eau douce de petite taille (< 4 cm à l’âge adulte), hautement invisible, originaire des Balkans et de l’Europe de l’Est. Elle est aujourd’hui fermement installée dans toute l’Europe. On s’accorde sur le fait qu’une fois établie dans un plan d’eau, les méthodes actuelles ne permettent pas d’éradiquer la moule zébrée. Les tests expérimentaux ont été réalisés au Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse en été 2014. Ils consistaient à fournir des moules zébrées de différentes tailles à des cistudes isolées individuellement dans un petit bassin extérieur. Les moules fraîchement prélevées du milieu naturel étaient détachées de leur substrat initial. Les tortues étaient à jeun depuis les 2 jours précédant les expériences. Chaque expérience durait 4 jours: 5 moules fraîches (coquille de 8 à 30 mm de longueur) étaient apportées le premier jour à 10 cistudes (longueur de carapace CL = 123 ± 15 mm [102-148 mm], masse corporelle BM = 333 ± 128 g [190-626 g]). Cinq tortues étaient placées au soleil et 5 autres à l’ombre. Trois expériences ont été réalisées, mais pour des raisons logistiques, les moules du deuxième run étaient fraîchement mortes.



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Toutes les cistudes (sauf une, CL = 107 mm, BM = 196 g) ont consommé des moules indépendamment de leurs conditions d’exposition (ensoleillé/ombragé), de leur taille et de l’état des moules (mortes ou vivantes). La consommation (nombre de proies consommées/nombre de proies disponibles) était liée à la taille des proies, les cistudes consommant 50% des moules vivantes disponibles < 15 mm alors qu’elles n’ont consommé aucune proie vivante > 25 mm. La consommation était supérieure sur proies mortes que sur proies vivantes, les cistudes consommant ≥ 65% de proies mortes disponibles < 20 mm et > 25% des proies mortes disponibles > 25 mm. De la même manière, au cours des 4 jours de run, les cistudes sélectionnaient en premier lieu les petites proies vivantes avant de passer (lorsqu’elles le faisaient) aux proies vivantes plus grandes, indépendamment des conditions d’ensoleillement. Dans nos conditions expérimentales, la taille des cistudes n’avait pas d’effet sur leur comportement de prédation. Cette étude préliminaire montre que la cistude d’Europe est un consommateur potentiel de la moule zébrée. Les tortues sélectionnent les moules les plus petites, probablement du fait que celles-ci sont plus faciles à ouvrir que les grandes moules. Cette première hypothèse est confortée par le fait que les cistudes consomment de grandes moules mais seulement lorsque celles-ci sont mortes. La manipulation de proie semble donc être ici un facteur important. Des expériences utilisant des moules fixées sur un substrat sont nécessaires pour tester cette seconde hypothèse. Enfin, des tests à grande échelle sont nécessaires pour tester l’impact potentiel des grandes populations de cistudes sur les moules zébrées en milieu naturel. Remerciements: Bertille Marquet, Virginie Malvaso, Sandra Avril et Adélie Krellenstein


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Site d’Etude en Ecologie Globale du Woerr: approche multicritère d’un programme de relâcher de cistudes d'Europe en Alsace

Jean-Yves Georgesa, b, Jean-Nicolas Beiselc, Isabelle Combrouxc, Corinne Gracc,

Daniel Hochd, Philippe Knibielye, Frédéric Labatf, Fabrice Levresseg, Benoît Quintardh, Anne Rozani, Pierre Schneiderd

a Université de Strasbourg, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), 67087 Strasbourg,

France [email protected] b CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France

c Laboratoire Image, Ville et Environnement, UMR 7362, CNRS-Université de Strasbourg-ENGEES, 67000 Strasbourg, France

d Office National de la Forêt, Unité territoriale de Hatten, 67690 Hatten, France e Réserve Naturelle de la Petite Camargue alsacienne, 68500 St Louis, France

f Aquabio, Bureau d’Etude, 33750 Saint-Germain-du-Puch, France g Conseil Général du Bas Rhin, Strasbourg, France

h Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse, 68100 Mulhouse, France i Gestion Territoriale de l'eau et de l'environnement, UMR ENGEES-Irstea, 67070 Strasbourg,

France Dans le contexte actuel de la 6ème crise d’extinction de la biodiversité et du changement global, la mise en place de politiques environnementales opérationnelles nécessite une compréhension globale des liens existant entre la variabilité environnementale, la dynamique des populations et des écosystèmes et les services écosystémiques associés aux activités humaines, qu’elles soient ou non liées aux mesures de conservation. Dans le cadre de sa Charte de l'Environnement de 1990, le Conseil Général du Bas-Rhin (CG67) a initié en 1995 son « programme de réintroduction de la cistude d’Europe, Emys orbicularis, en Alsace ». Cette petite tortue d’eau douce aurait disparu du Rhin supérieur vers la fin du 19e siècle suite à la canalisation du Rhin qui a fortement perturbé l’écologie des zones humides originelles. En 2014, l’Institut Ecologie et Environnement du CNRS (InEE) a labélisé le site de relâcher du Woerr (Lauterbourg), en Site d’Etude en Ecologie Globale (http://www.cnrs.fr/inee/outils/seeg_woerr.htm). Le SEEG du Woerr propose, par une approche globale, de réaliser une évaluation socio-économico-écologique de ces actions de conservation. Il visera en particulier à évaluer (1) l’évolution du fonctionnement des hydrosystèmes continentaux naturels et restaurés dans le cadre de ce programme, (2) la valeur socio-économique de ces actions de conservation et (3) les capacités d’adaptation de la cistude, espèce emblématique des zones humides, face aux changements environnementaux, afin d’apporter une base scientifique d’aide à la gestion des espaces et des espèces.


http://www.cnrs.fr/inee/outils/seeg_woerr.htm


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Le SEEG du Woerr propose ainsi de développer des outils originaux de suivi et d’évaluation des socio-écosystèmes pour les mettre à la connaissance et à la disposition de la communauté scientifique et des gestionnaires. Remerciements: Guillaume Bazin, Florian Bresson, Nadia Fernandez, Marion Le Berre, Céline Martel, Noémie Martin, Albin Meyer, Juliette Molmy, Antoine Perrier, Hugo Wayman.


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Elevage conservatoire du programme « Cistude Alsace »

Benoît Quintarda, Valentin Amrheinb, c, Baptiste Doenlend, Philippe Knibielyd, Fabrice Levressee, Jean-Yves Georgesf, g

a Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse, 68100 Mulhouse, France

[email protected] b University of Basel, Zoological Institute, Basel, Switzerland

c Research Station Petite Camargue Alsacienne, 68500 Saint-Louis, France d Réserve Naturelle de la Petite Camargue alsacienne, 68500 St Louis, France

e Conseil Général du Bas Rhin, Strasbourg, France f Université de Strasbourg, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), 67087 Strasbourg,

France g CNRS, UMR7178, 67037 Strasbourg, France

Le protocole initial du « programme de réintroduction de la cistude en Alsace » du Conseil Général du Bas Rhin (CG67), validé par le Ministère en charge de l’écologie en 2004, est basé sur le lâcher de quelques 500 cistudes subadultes (6-7 ans) sur l’espace naturel sensible du Woerr (Lauterbourg) restauré à cette fin. Ces individus sont issus de deux élevages dédiés mis en place à la station de la recherche de la Petite Camargue alsacienne (St Louis, PCA) depuis 2006 et au Parc Zoologique et Botanique de Mulhouse (PZBM) depuis 2007. Chaque élevage abrite une population de

reproducteurs (15 ♀ : 8 ♂ en PCA et de 5 ♀ : 3 ♂ au PZBM) de souche brenouse (E.o.o. IIa) prélevés en milieu naturel en Brenne. Les reproducteurs disposent d’un bassin extérieur et d’une butte de ponte suivie annuellement pour assurer la collecte des œufs en vue de leur incubation artificielle. Les cohortes produites annuellement (une centaine d’œufs en PCA, une dizaine au PZBM) font l’objet d’un suivi individuel (marquage, croissance, état sanitaire et vétérinaire) et d’une quarantaine sanitaire avant leur lâcher en bassins d’acclimatation sur le site du Woerr. Les conditions d’élevage seront présentées. Depuis 2012, les deux élevages bénéficient de protocoles standardisés (alimentation, hivernage, suivi sanitaire, etc.) qui seront détaillés ici. Au-delà de leur fonction conservatoire, ces élevages offrent des conditions expérimentales idéales pour tester des hypothèses et des techniques originales vouées à être appliquées à grande échelle en milieu naturel. Quelques exemples (marquage de nouveau-nés, haplotypage, croissance compensatoire, sexage par cytoscopie, tests expérimentaux, etc.) seront présentés.



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Présentation du Web documentaire

Gabrielle Saureta, Cristophe Coïca

Cistude Nature ,33185 Le Haillan, France [email protected]

Dans le cadre des déclinaisons régionales du PNA en faveur de la Cistude en Aquitaine et en Rhône-Alpes, Cistude Nature et le CEN Savoie coproduisent un web documentaire sur la Cistude d’Europe. Cet objet filmique a pour but la sensibilisation du grand public à la préservation de la Cistude d’Europe. Sa diffusion via Internet et sa construction en séquences vidéo permettent une large diffusion d’un propos riche et informatif. Basé exclusivement sur de la vidéo, le web documentaire s’articule autour de deux thématiques fortement corrélées l’une à l’autre : la biologie de l’espèce, et les hommes et femmes qui l’étudient et la protègent. Ces thématiques possèdent chacune une identité formelle propre. Les exemples de vidéos présentées illustrent le choix immersif proposé pour la thématique biologie, et la forme retenue pour les vidéos liées à l’étude et la préservation de l’espèce.



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Posters


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La Cistude d’Europe, un support de biodiversité algal? Description du peuplement d’algues épizoïques sur la Cistude en Camargue

Anthony Oliviera, Claire Koeniga, Marie Sueta, Sébastien Ficheuxa,c & Stéphanie Fayolle-

Sannab

a Centre de recherche de la Tour du Valat, la Tour du Valat, 13200 Arles b IMBE, UMR-CNRS 7263, Ecologie des Eaux Continentales Méditerranéennes, 431, Aix-

Marseille Université. Faculté de St-Jérôme, 13397 Marseille Cedex 20 France. c UMR 6282 Biogéoscience, Université de Bourgogne, 6 Boulevard Gabriel, 21000 Dijon

e-mail : [email protected]

Depuis quelques années, les acteurs de la conservation de la Cistude d’Europe en France signalent des proliférations d’algues sur certaines tortues susceptibles d’engendrer des problèmes pathologiques. Ce phénomène est également perçu en Camargue (delta du Rhône, sud France), où la gestion hydraulique appliquée à certains plans d’eau a conduit à des proliférations d’algues filamenteuses. La cistude, de part sa carapace dispose d’un support idéal pour le développement de ces algues qualifiées d’épizoïques. Nous avons récolté les algues fixées sur la carapace et le corps de 41 Cistudes d’Europe (19 mâles et 22 femelles). L’échantillonnage s’est déroulé de juin à juillet 2013 dans 4 noyaux de population de Cistudes de Camargue. En parallèle, des échantillons d’eau ont été collectés pour inventorier le phytoplancton présent et les principaux paramètres physico-chimiques ont été relevés dans les mares, marais et canaux d’où provenaient les cistudes. 49 espèces d’algues fixées sur la carapace des tortues ont été inventoriées ! Les espèces appartiennent aux phylums des Cyanobactéries, Chlorophycées, Bacillariophycées, Xanthophycées et Dynophycées. La richesse spécifique et leur développement varient fortement d’un individu à l’autre. Parmi les algues, l’une des espèces (Vaucheria sp) pourrait poser un problème sanitaire pour les cistudes du fait de leur prolifération sur tout le corps de l’animal. La présence de cette espèce est liée aux milieux fortement eutrophisés et pourrait être considérée comme un signal d’alarme du fait de dysfonctionnements hydrauliques en Camargue.



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Restauration de l’étang du Roy en faveur de la cistude d’Europe Commune de Beaucaire (Gard, dép. 30)

Massouh Marlène a, Monchaux Geoffrey a

a COGard - Centre Ornithologique du Gard (Association loi 1901)

Avenue du Champ de Foire, 30190 Saint-Chaptes [email protected]

Objectifs de gestion Restaurer et entretenir l’état écologique de l’étang du Roy en faveur de la Cistude d’Europe Emys orbicularis (et du Triton crêté, Triturus cristatus). Localisation Nom du site : Etang du Roy Lieu-dit : Mas des Garrigues du Grès Surface du site : 1,8 ha Commune : Beaucaire Département : Gard (30) Région : Languedoc-Roussillon Historique du site L’ancienne gravière du Roy a évolué en étang (bassins permanents et temporaires) suite à son arrêt d'exploitation dans les années 1950. Des Cistudes d’Europe Emys orbicularis sont régulièrement observées depuis les années 1980 dans le marais du Roy et les communes limitrophes. Or, depuis les années 2000, le site est en cours de fermeture accélérée et son état écologique se dégrade (colonisation par des ligneux, envasements de zones de clairs, etc.). Le COGard a donc contacté le CEN-LR – coordinateur régional du Plan National d’Action pour la Cistude d’Europe – qui a alors inclus cette action dans la déclinaison régionale du PNA pour entreprendre des travaux de restauration en 2013 et 2014. Actuellement, un plan de gestion 2015-2019 est cours de rédaction. Effectifs de la population de Cistude d’Europe En mai 2012, 8 individus ont été observés simultanément dans l’étang. De mai à juillet de la même année, une session de capture marquage recapture (CMR) a été réalisée sur le site. Cette CMR a permis le marquage de 4 individus : 2 mâles (adulte et immature), 2 femelles adultes (en 53 nuits/pièges, avec des nasses souples et un verveux). La présence d’un individu immature laisse à supposer qu’il pourrait y avoir de la reproduction sur le site. Ces résultats ne permettent pas d’avoir une estimation fiable de la taille de la population. C’est pourquoi, d’autres sessions de CMR sont prévues pour 2015, 2017 et 2019 et permettront également d’évaluer l’impact de la gestion du site sur la population.



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Restauration et gestion En 2013 et 2014, des travaux de réouverture du site ont été réalisés : coupes et dessouchages de ligneux, curage de bassins, création d’une digue de ponte pour la Cistude, décapage de la roselière. Pour maintenir et renforcer la population de Cistudes d’Europe, le plan de gestion prévoit pour 2015-2019 l’entretien du site par des coupes et dessouchages de ligneux, et par le pâturage de chevaux Camargue. De plus, des actions de restructuration des pentes de bassins et de la digue de ponte sont prévues pour une meilleure compatibilité avec les exigences écologiques des Cistudes.

INFO+CONSEIL DÉPARTEMENTAL DU BAS-RHINHÔTEL DU DÉPARTEMENTPlace du Quartier Blanc / 67964 STRASBOURG cedex 9Tél : 03 88 76 67 67 / Fax : 03 88 76 67 97

www.bas-rhin.frPÔLE DÉVELOPPEMENT DES TERRITOIRESDIRECTION DE L’AGRICULTURE, DE L’ESPACE RURAL ET DE L’ENVIRONNEMENTService Agriculture, Espaces Ruraux et Naturels Fabrice LEVRESSETél. : 03 69 20 75 [email protected]

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