Diversité du VIHSurveillance dans le cadre de la DO

F BarinInserm ERI 19 - CNR VIH

CHU Bretonneau - Université F Rabelais

Tours

Diversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIH

HIV-1HIV-1 HIV-2HIV-2

HIV-1HIV-1OO

HIV-1HIV-1MM

HIV-1HIV-1NN

AA

CC

virusvirusmosaïquesmosaïques

BB

DDEE

GG

HH

IIJJ

FF

AABB

CCDD EE

CRF01-AECRF01-AE > 30 CRFs> 30 CRFs

CRF04-cpxCRF04-cpx

KK

FF

HHGG

Diversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIH

HIV-1HIV-1

HIV-1HIV-1OO

HIV-1HIV-1MM

HIV-1HIV-1NN

AA

CC

virusvirusmosaïquesmosaïques

BB

DDEE

GG

HH

IIJJ

FF

CRF01-AECRF01-AE > 30 CRFs> 30 CRFs

CRF04-cpxCRF04-cpx

KK

Distribution géographique

Résultats(mars 2003 – décembre 2005)

11 190 nouveaux diagnostics

18 HIV-1/2(0.2%)

131 HIV-2(1.4%)

10 874 HIV-1

10 892

543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O

2 HIV-1M/O(0.2%)

3 428 non-B**(45.9%)

414 NT(M)4 039 B*(54.1%)

* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2

2 457 nondisponibles

167 inconnus

HIV-2 F M Total

MSM Heterosex. Transfusion Unknown

65 1

27

3 42 0 11

3 107

1 38

93 56 149

• France (n=15)• Portugal (n=2)

• Côte d’Ivoire (n=54)• Mali (n=17)• Senegal (n=9)• Guinea (n=7)• Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3)• Cape-verde (n=2)• Burkina, Gambia, (n=1)

• Cameroon (n=1)• Congo (n=1)

• Madagascar (n=1)

• Algérie, Peru, Colombie (n=1)• Unknown (n=26)

F M Total

MSM Heterosex. Transfusion Unknown

65 1

27

3 42 0 11

3 107

1 38

93 56 149

HIV-2

• France (n=15)• Portugal (n=2)

• Côte d’Ivoire (n=54)• Mali (n=17)• Senegal (n=9)• Guinea (n=7)• Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3)• Cape-verde (n=2)• Burkina, Gambia, (n=1)

• Cameroon (n=1)• Congo (n=1)

• Madagascar (n=1)

• Algérie, Peru, Colombie (n=1)• Unknown (n=26)

F M Total

Heterosex. Unknown

7 -

2 2

9 2

7 4 11

HIV-1 group O

• France (n=2)

• Cameroon (n=8)• Chad (n=1)

Résultats(mars 2003 – décembre 2005)

11 190 nouveaux diagnostics

18 HIV-1/2(0.2%)

131 HIV-2(1.4%)

10 874 HIV-1

10 892

543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O

2 HIV-1M/O(0.2%)

3 428 non-B**(45.9%)

414 NT(M)4 039 B*(54.1%)

* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2

2 457 nondisponibles

167 inconnus

Résultats: B vs non-B(mars 2003 - décembre 2005)

Non-B p

N % (IC 95 %)

Sexe

Hommes 1 406 32.8 (31.4 - 34.2) < 0.0001

Femmes 2 006 63.5 (61.9 - 65.2)

Mode de contamination

Rapports homosexuels 197 12.0 (10.4 - 13.6) < 0.0001

Rapports hétérosexuels 2 489 58.4 (56.9 - 59.9)

Injection de drogues 27 15.8 (10.3 - 21.3)

Autres/Inconnu 699 50.8 (48.1 - 53.4)

3 412 / 7 449(45.8%)

Résultats: B vs non-B(mars 2003 - décembre 2005)

Non-B p

N % (IC 95 %)

Nationalité

France 666 21.4 (20.0 - 22.9) < 0.0001

Europe (hors France) 45 30.4 (23.0 - 37.8)

Afrique subsaharienne 2 096 78.6 (77.0 - 80.1)

Afrique du Nord 57 37.5 (29.8 - 45.2)

Autres/Inconnu 548 39.9 (37.3 - 42.5)

B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005)

Homo-bisexuels

B Non-B NT

Nationalité

France (795) 369 63 363

Europe (hors France) (26) 11 1 14

Afrique sub-saharienne (7) 3 4 -

Afrique du Nord (4) 2 - 2

Autres/Inconnu (118) 45 9 64

Total (950) 430 77 443

(46.6%)

• 77/507 (15.2 %)• 63/432 (14.6 %)

B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005)

Rapports hétérosexuels

B Non-B NT

Nationalité

France (422) 158 96 264

Europe (hors France) (8) 4 3 1

Afrique subsaharienne (229) 42 127 60

Afrique du Nord (21) 7 5 9

Autres/Inconnu (133) 55 41 37

Total (813) 266 272 275

(33.8%)

• 272/538 (50.6%)• F: 96/254 (37.8%) non-B• Af S-S: 42/169 (24.9%) B

Résultats(mars 2003 – décembre 2005)

11 190 nouveaux diagnostics

18 HIV-1/2(0.2%)

131 HIV-2(1.4%)

10 874 HIV-1

10 892

543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O

2 HIV-1M/O(0.2%)

3 428 non-B**(45.9%)

414 NT(M)4 039 B*(54.1%)

* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2

2 457 nondisponibles

167 inconnus

NT: infections récentes pour la plupart

Génotypage sur DSS

RNA extractionRT-PCR (env)JC Plantier et al., AIDS 2005

- 460 bp

SéquençageAnalyse phylogénétique

302 échantillons sélectionnées: 100 M 168 NT Plupart récents. M et NT consécutifs (< 20 janvier 2005) 22 B 12 NB

Résultats: génotypage

Génotypage

B Non-B Non-amplifiés

Sérotypage

B (22) 12 1 9

Non-B (12) - 6 6

M (100) 38 9 53

Non-typables (168) 75 28 65

Total (302) 125 44 133

• CRF02_AG: 20• A: 7• G: 4• CRF01_AE: 2• D: 2• F: 2• Autres: 7

Résultats: génotypage(facteurs de risques)

Hommes FemmesB Non-B NT Total B Non-B NT Total

Homo-Bis. 80 13* 47 140 - - - -

UDI - - - - 2 - 1 3

Hétérosex. 20 5 23 48 17 17 46 80

Inconnu 6 4 12 22 - 5 4 9

Total 106 22 82 210 19 22 51 92

* Dont 9 français nés en France