ANNEXES

1. AG implémentation avancée2. Optimisation des hyper-paramètres de contrôle3. Distributions non-uniformes4. brins de cyclophiline B5. tournant de hPIN16. Optimisation du champ de forces

Annexe 1

Implémentation avancée

retour

B. Parent

Implémentation avancée

Évolution Taux de gradient conjugué

Taux de croisements/mutations

Population Taille de population

Nombre d’îles parallèles

Taux de migration

retour

B. Parent

Sélection : basée sur le rang

nombre d’élites

limite d’âge

dissimilarité minimale

Contrôle : apocalypses

arrêt global

nouvelle générationgénération temporaire

Implémentation avancéeretour

Annexe 2

Optimisation des hyper-paramètres de

contrôle

retour

B. Parent

Hyper-paramètres de contrôleretour

Annexe 3

Hybridation : distribution de probabilités non uniformes

retour

B. Parent

Distributions non uniformes

Statistiques sur une variable

retour

B. Parent

Distributions non uniformesretour

B. Parent

Distributions non uniformes

Fragmentation

mn +

Statistiques sur des n-uplets

retour

B. Parent

Distributions non uniformes

0%

20%

40%

60%

80%

100%

4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6

0%

20%

40%

60%

80%

100%

4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6

PIN

0%

20%

40%

60%

80%

100%

4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6

succ

ess

rate

Very High

High

Medium

Weak

Failed

0%

20%

40%

60%

80%

100%

4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6

But : retrouver la conformation native parmi les solutions proposées

retour

Annexe 4

Brins terminaux de la cyclophiline B

retour

B. Parent

Brins de cyclophiline B

Placement manuel

Prédiction de l’algorithme :

retour

Annexe 5

Tournant du domaine WW de hPIN1

retour

B. Parent

Tournant de hPIN1

PIN1 sauvage

retour

B. Parent

Tournant de hPIN1

PIN1 mutant 7

retour

Annexe 6

Optimisation du champ de forces

retour

B. Parent

modifier certains paramètres internes…

afin de maximiser l’avantage en énergie libre de la région native

MC AG

TOT

NATIFBTkG ln.

i B

i

Tk

Eexp

retourOptimisation du champ de forces

retour