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Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie

FMPOS/UCAD/DAKAR

RESISTANCE BACTERIENNEAU SENEGAL

Pr Cheikh Saad Bouh BOYE

M I C R O C SB Sy st em

. Fréquence des Infections. Surveillance de la Résistance

. Efficacité thérapeutique


DEMARCHE QUALITE

PALM EGEM

INSPEAROBSAIRV

BASKETT INSPIRATION


Cytologie ColorationFlore bactérienne

- Isolement , Identification

- Etude de la Sensibilite( ABG , CMI… )

- Contrôle Qualité ( Références ATCC )

Isolement Bactérien


DEMARCHE QUALITE

IRBC

IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES)

Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie

FMPOS/UCAD/DAKAR

Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis

Bactéries Atypiques

à Dakar ( SENEGAL) ( 1996-2007)M I C R O C SB Sy st em

Observatoire Sénégalais pour l ’Antibiothérapie dans les

Infections Respiratoires de Ville

PROJET OBSAIRV


07/05/23

ETIOLOGIE BACTERIENNE CAP

S. pneumoniae

Bacteries atypiques:Legionella sppChlamydia sppMycoplasma spp

S. aureus

Autres

BGN

H. influenzae et M. catarrhalis

22%

6%

15%

8%15%

34%

(OMA) (n = 113 souches)

15

32

17 36

Enfants n= 63 souches

31

13

21

35

Adultes n= 50 souches

Haemophilus

S.pneumoniae

Moraxella

Autres

S.pneumoniae

Haemophilus

Moraxella

Autres

(Sinusites Aigues) (n = 66 souches)

48

35

107

Enfants n= 42 souches

38

29

18

17

Adultes n= 24 souches

Haemophilus

Haemophilus

S.pneumoniaeS.pneumoniae

Moraxella

Moraxella

AutresAutres

Profil des Souches isolées

Souches % % Afrique % Monde

S.pneumoniae (DRSP) 32 15-50 > 50

S.pneumoniae (DSSP) 68

H.influenzae (Ampi S) 32

H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 25-40 30-80

H.influenzae(Ampi R/BL- 02 1-5 2-4

M.catarrhalis ( BL+) 70 70-90M.catarrhalis ( BL-) 30

Profil des Souches isolées

Souches % IRB IRH

S.pneumoniae (DRSP) 32 23 35

S.pneumoniae (DSSP) 68

H.influenzae (Ampi S) 72

H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 35 28

H.influenzae(Ampi R/BL- 02

M.catarrhalis ( BL+) 70 68 75M.catarrhalis ( BL-) 30

Beta Lactamines

Penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae

Egypt29.1% 0.0%

South Africa20.9% 51.0%

Kenya41.2% 1.8%

Senegal2% 30%

Ghana17.0% 0.0%

Tunisia24.0% 11.0%

Algeria11.4% 5.7%

Penicillin-intermediate (MIC 0.12–1 µg/mL)Penicillin-resistant (MIC 2 µg/mL)

Ethiopia17% 0.0%

Namibia21% 9%

Botswana25% 0.0%

Zimbabwe7%

Zambia14% 0.0%

Rwanda21.0% 0.0%

INSPIRATION , BASKETT

Streptococcus pneumoniae

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

Penicil

lin

Amox/cl

av

Cefurox

ime

Cefaclo

r

Ceftria

xone

Azithro

mycin

Clarithrom

ycin

Ofloxa

cin

Co-trim

oxaz

ole

Tetrac

yclin

e

Chloram

phen

icol

Resistant

Intermediate

Susceptible

S.pneumoniae

ATB PSSP(68%) PISP(30%) PRSP(2%)

AminoPeni S S(60%) R

AminoP+Inhib S S(98%) R

CSP1,2,3 S S(93%) R

Macrolides S S S(87%)

Tetracycline S R(72%) R

Vancomycin S S S

Macrolides

Macrolide-resistant S. pneumoniae

Egypt2.5%

South Africa52.7%

Tunisia28.0%

Algeria21.7%

Erythromycin-resistant (MIC 1 µg/mL)

Senegal 4%

INSPIRATION , BASKETT

Haemophilus influenzae

Important pathogène dans IRA

Plus de 30% -lactamasepositive4



β-lactams


0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

Resistant

Intermediate

Susceptible

07/05/23

Senegal. Antimicrobial Resistance TrendsAmong Respiratory Tract Pathogens

0

25

50

75

100

1960 1970 1980 1990 2000 2010

% R

esis

tant

Resistancemechanism:

Beta-lactamase

Altered PBPs

Beta-lactamase

Altered PBPs

M. catarrhalis

H. influenzae

S. pneumoniae

M.catarrhalis

ATB BL+ ( 70%) BL-(30%)

Aminopenicilline R S

AminoP+Inhib S S

CEFADROXIL S S

CSP2,3 S S

Macrolides S S

Tetracycline S S


1996-2007

Staphylocoques Streptocoques

EnterocoquesEntrobactéries Autres BGN


INFECTIONS NOSOCOMIALES

Bactériémies : ……………………………15% Pneumonie post ventilation :…………… 21% Infection urinaire (UTI) : …………………38% Infection respiratoire basse : ……………..4% Infections gastro intestinales , cutanées,

cardiovasculaires : ………………………10% Infections du site opératoire : …………..10% Infections respiratoires hautes : ………….2%

INFECTIONS URINAIRES

Enterobactéries : …………….50%

GNNF : ……………………….35%

Enterocoques : ……………...10%

Autres : ……………………….5%

BACTERIEMIES NOSOCOMIALES Enterobacteries : ………………..50% Enterocoques : ………………….11% Staphylococcus aureus : ………12% Staphylocoques CN : …………..10% Pseudomonas : ………………….11% Acinetobacter : …………………...5% Autres : ……………………………1%

INFECTIONS DU SITE OPERATOIRE

S aureus : ………………………………20% Pseudomonas : ………………………..16% Staphylocoques CN : ………………….15% Enterobacteries : ……………………… 25 Enterocoques: ………………………….12 Autres BGN : …………………………...12

SENSIBILITEAUX ANTIBIOTIQUES

Staphylococcus aureus

ATB MehiR 43%) Methi S(57%)

Aminopenicilline R S

AminoP+Inhib R S

CSP2,3 R S

Macrolides S S

Tetracycline S S

Aminosides S/R S

Streptocoques

ATB Enterococcus(84) Streptococcus(359)

Aminopenicilline S(63%) S

AminoP+Inhib S(72%) S

CSP1,2,3 S( 76%) S

Macrolides S S

Tetracycline S S

Klebsiella pneumoniae

ATB Souches Klebsielles

Béta-lactamines Aminosides Quinolones Cotrimoxazole

Sauvages (12%) S S S R

PHN ( 22%) MS S S R

BLSE (63%) S MS S R

ATBSouches

Béta-lactamines

Aminosides Quinolones Sulfa- triméto

Sauvages (40%) R S S R

Pénicillinase Haut niveau (28%)

R S S R

Céphalosporinase (16%) R/MS S S R

Pseudomonas aeruginosa


1999-2007

Données sur les bactéries entéropathogènes: Tendances et Antibiorésistance

Les données sur les les bactéries entéropathogènes proviennentdu Centre National Sénégalais des Entérobactéries (CNSE) sis à l’Institut Pasteur de Dakar.

Missions du CNSE:

•Assurer pour l’ensemble des structures sanitaires du Sénégal l’identification complète et l’antibiogramme des souches d’entérobactéries, en particulier les salmonelles et les shigelles, •Suivre l’évolution épidémiologique des souches et de leur résistance aux antimicrobiens

Salmonella:

Entre 1999 et 2007, le CNSE a collecté 1426 souches de salmonelles dont 985 d’origine humaine et 441 d’origine alimentaire.Quatre nouveaux sérotypes ont été identifiés : Salmonella Keurmassar, Salmonella Ketiabargny, Salmonella Yombesali, Salmonella Yagounasally. Tous ces nouveaux sérotypes ont été isolés exclusivement de l’alimentation, à l’exception de Salmonella Keurmassar présent également dans des prélèvements d’origine humaine.

•Grande sensibilité des souches aux antibiotiques testés. Cependant des résistances inquiétantes ont été notées chez les souches de Salmonella Agona, Kentucky et Keurmassar isolées d’aliments: •production d’une BLSE : le typage moléculaire a révélé la circulation au Sénégal de BLSE de type CTX-M15, SHV-12•d’intégrons: éléments génétiques mobiles porteurs de facteurs de résistance et capables de les disséminer au sein du monde bactérien et portant des cassettes. Des intégrons de classe 1 ont été détectés chez S. Keurmassar avec des cassettes codant la résistance à la streptomycine (gènes de résistance aadA) et la cassette codant la codant la résistance à l’érythromycine (gène de résistance ereA2), une macrolide largement utilisée en antibioprophylaxie dans les élevages de poulets de chair au Sénégal.

Shigella:

Entre 1999 et 2007, le CNSE a reçu 538 souches de shigelles, toute d’origine humaine.La tendance au niveau des sérotypes montre un recul de flexneri . Le sérotype sonnei prend la place de leader.

L’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est caractérisée par une résistance importante vis-à-vis des cyclines et du cotrimoxazole, pour l’ensemble des espèces et une circulation de souches avec une diminution de la sensibilité aux quinolones.

Merci de votre attention

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