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DIREN Languedoc-Roussillon Etude du peuplement diatomique de stations DCE de Languedoc-Roussillon

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ASCONIT Consultants

Novembre 2006

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SOMMAIRE

1. INTRODUCTION ............................................................................................................................... 4 2. MATERIELS ET METHODES................................................................................................................ 4

2.1. STATIONS DE PRELEVEMENTS .......................................................................................................4 2.2. ECHANTILLONNAGE DES DIATOMEES........................................................................................6 2.3. IDENTIFICATION DES DIATOMEES................................................................................................7 2.4. ESTIMATION DE LA QUALITE DE L'EAU ........................................................................................8

3. CARACTERISTIQUES FLORISTIQUES GENERALES : DISTRIBUTION DES FAMILLES........................ 11

4. RESULTATS PAR STATION............................................................................................................... 16 5. RESULTATS DES INDICES ................................................................................................................ 52

5.1. INDICES DIATOMIQUES (IPS ET IBD) ...........................................................................................52 5.2. DIVERSITE ET RICHESSE TAXONOMIQUE...................................................................................59

6. CARACTERISTIQUES ECOLOGIQUES DOMINANTES.................................................................... 62

6.1. AFFINITE A LA MATIERE ORGANIQUE .......................................................................................63 6.2. AFFINITE VIS-A-VIS DE L’OXYGENE DISSOUS............................................................................65 6.3. AFFINITE VIS-A-VIS DU DEGRE DE TROPHIE ..............................................................................66 6.4. AFFINITE VIS-A-VIS DE LA SALINITE.............................................................................................67 6.5. AFFINITE VIS-A-VIS DU PH ...........................................................................................................68 6.6. TAXONS EN REGRESSION ...........................................................................................................69

7. RELATION ENTRE LES INVENTAIRES ET LES ECOREGIONS ........................................................... 71 8. CONCLUSION................................................................................................................................ 73

9. ANNEXES ....................................................................................................................................... 74


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Table des Figures

Figure 1 : Distribution des familles – Stations DCE Languedoc-Roussillon .......................................11 Figure 2 : Evolution de l’IPS – Stations DCE Languedoc-Roussillon...................................................52 Figure 3 : Evolution de l’IBD – Stations DCE Languedoc-Roussillon..................................................53

Figure 4 : Evolution spatio-temporelle de l’IPS (bilan 2005/2006) - Stations DCE Languedoc-Roussillon......................................................................................................................................................56 Figure 5 : Evolution spatio-temporelle de l’IBD (bilan 2005/2006) - Stations DCE Languedoc-Roussillon......................................................................................................................................................58

Figure 6 : Richesse taxonomique de l’échantillon « IBD » (N) et nombre de taxons en plus, à partir du comptage stratifié (N en plus) – Station DCE Languedoc-Roussillon .............................60

Figure 7 : Evolution de la richesse taxonomique et de l’indice de diversité - Stations DCE Languedoc-Roussillon...............................................................................................................................61 Figure 8 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité pour les matières organiques – Stations DCE Languedoc-Roussillon.......................................................................................................63 Figure 9 : Distribution des diatomées selon leur capacité d’hétérotrophie - Stations DCE Languedoc-Roussillon...............................................................................................................................64 Figure 10 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité vis-à-vis de l’oxygène dissous - Stations DCE Languedoc-Roussillon. ...................................................................................................65

Figure 11 : Distribution des diatomées en fonction du degré de trophie - Stations DCE Languedoc-Roussillon...............................................................................................................................66 Figure 12 : Distribution des diatomées en fonction de la salinité - Stations DCE Languedoc-Roussillon......................................................................................................................................................67

Figure 13 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité vis-à-vis du pH - Stations DCE Languedoc-Roussillon...............................................................................................................................68 Figure 14 : Distribution des diatomées rares ou en voie de régression (Rote List) - Station DCE Languedoc-Roussillon...............................................................................................................................69 Figure 15 : Résultats de l’analyses factorielle – Station DCE Languedoc-Roussillon.....................72

Figure 16 : Résultats de l’analyses factorielle – Station DCE Languedoc-Roussillon.....................72


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Table des Tableaux

Tableau 1 : Récapitulatif des stations, des protocoles et des intervenants – (extrait tableau gestion des échantillons ASCONIT) ..........................................................................................................5 Tableau 2 : classes de qualité et code couleur associé de l’IBD ......................................................8

Tableau 3 : classifications proposées par Van Dam et al (1994) .......................................................9 Tableau 4 : classifications proposées par Hofmann (1994)...............................................................10 Tableau 5 : Indices diatomiques (IBD et IPS) pour chacune des stations et classes de qualité (comptage « IBD ») – Station DCE Languedoc-Roussillon .................................................................55


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1. INTRODUCTION

Les objectifs de la présente étude sont en relation avec les prérogatives de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) 2000/60/CE du Parlement européen et du Conseil, du 23 octobre 2000 et qui a pour objet l’acquisition d’informations sur la nature et la composition des peuplements de stations de référence. Ce rapport fait état de la composition du peuplement de diatomées de 25 stations de référence situées en Languedoc-Roussillon et réparties dans 5 hydroécorégions : Cévennes, Massif Central Sud, Grand Causses, Méditerranée et Pyrénées.

Les principaux objectifs sont d’établir une liste des diatomées qui colonisent ces sites de référence et d’en estimer la qualité biologique.

L’estimation de la qualité biologique est estimée via le calcul des indices diatomiques, notamment l’Indice Biologique Diatomées (IBD) et l’Indice de Polluosensibilité Spécifique (IPS). Les inventaires ont été analysés dans le but de déterminer les caractéristiques écologiques dominantes des peuplements.

2. MATERIELS ET METHODES

2.1. STATIONS DE PRELEVEMENTS

25 stations DCE ont été échantillonnées dans de bonnes conditions hydrologiques. Les fiches de description des stations préconisées par le MEDD relatives aux prélèvements et aux stations sont fournies en annexe 1. Un tableau de synthèse visant à bancariser les données est disponible en annexe 4.

Le tableau ci-dessous (Tableau 1) est un récapitulatif des stations, des phases de l’étude, des protocoles utilisés pour le prélèvement des diatomées et des intervenants dans ces différentes phases. Nous avons prélevé, pour chaque station, un échantillon « hors norme IBD » c'est-à-dire que nous avons prospecté un plus grand nombre de substrats et de faciès. Ces échantillons n’ont pas été analysés (option non retenue) mais sont conservés.


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Tableau 1 : Récapitulatif des stations, des protocoles et des intervenants – (extrait tableau gestion des échantillons ASCONIT)


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2.2. ECHANTILLONNAGE DES DIATOMEES

Les prélèvements de diatomées périphytiques ont été réalisés dans de bonnes conditions hydrologiques. Ils ont été effectués au mois d’août 2006 par Florence PERES accompagnée de Véronique JACQUET, pour les stations du Gard, de la Lozère et de l’Hérault et par Anne EULIN-GARRIGUE accompagnée d’une stagiaire pour les stations situées dans l’Aude et les Pyrénées Orientales. Deux stations font exception et n’ont pas été prélevé en aout :

o les Mouges prélevé en mai en raison du risque d’assec par Anne EULIN-GARRIGUE,

o le Séguissous, déjà à sec en mai, a été prélevé en novembre par Julien BARTHES, chargé d’études à ASCONIT et formé aux prélèvements de diatomées par Florence PERES (il a notamment réalisé tout le réseau PACA en 2005).

L’échantillonnage pour le calcul des indices diatomiques a été réalisé conformément aux prescriptions requises par la norme française (NF T 90-354 de juin 2000) et la norme européenne (NF EN 13946 de juillet 2003) ; Les aspects les plus importants sont résumés ci dessous :

- Le prélèvement s'effectue en priorité sur des substrats stables, durs et inertes (rochers, pierres, blocs, galets) de taille suffisante pour ne pas être déplacés par le courant et dont il est sûr qu’ils ont été immergés depuis suffisamment longtemps. Les substrats retenus se situent généralement à environ 20 cm de profondeur. A défaut, on cherchera des substrats durs artificiels comme les piles de pont, berges bétonnées…En cas d'absence de substrats durs, les diatomées peuvent être récoltées sur des végétaux immergés par expression de ceux-ci. Les prélèvements sur des substrats meubles comme la vase ou sur le bois sont strictement proscrits (flore diatomique saprophile). Dans le cadre de cette campagne, tous les prélèvements ont été réalisés sur galets (voir fiches stations).

- Une surface de 100 cm2 est prospectée et est répartie sur 5 substrats différents (20 cm2 par substrat). Dans les cours d'eau pauvres en nutriments où les diatomées ne sont pas abondantes, on augmentera la taille de la surface prospectée ; elle peut aller jusqu'à 1000 cm2 d'après la norme (ex. pour la Dourbie). Les substrats sont rincés dans le courant pour éliminer les particules minérales et/ou les valves mortes éventuellement déposées.

- Les diatomées sont récoltées par grattage de la surface supérieure des substrats à l'aide de brosses à dents. La brosse est idéale pour récupérer les diatomées fixées dans les interstices des supports, en particulier si ces derniers ne sont pas lisses. Afin d'éviter toute interférence entre deux échantillons, les brosses sont systématiquement remplacées à chaque relevé et jetées.

- L'échantillonnage s'effectue au centre du lit mineur du cours d'eau grâce au port de cuissardes (quand cela est possible). Les prélèvements sont toujours effectués en faciès lotique ou semi-lotique (préférence pour les radiers) dans des zones bien éclairées (évitement des couverts forestiers si cela est possible).

- Le matériel biologique prélevé est immédiatement fixé au formol neutralisé 10% et stocké dans un pilulier à double cape en polyéthylène translucide étiqueté avec les renseignements suivants : nom du cours d'eau, nom de la station, date du prélèvement, nom du préleveur.

Un échantillonnage « hors norme » appelé « DCE » a également été réalisé :


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Nous avons réalisé un autre échantillonnage "hors norme". La longueur de la station est augmentée. Cela correspond à 2 ou 3 séquences de faciès radier-mouille. Cette prospection implique l'échantillonnage d'un plus grand nombre de supports que celui préconisé par la norme. Plusieurs faciès ont été prospectés (lotique, semi-lentique, lentique) ainsi que divers types de substrats quand ils étaient disponibles (bryophytes par exemple). Ce prélèvement est conservé dans les mêmes conditions que le précédent et soigneusement identifié pour éviter toute confusion avec celui réalisé selon la norme.

Les différents couples substrats / faciès sont notés sur les fiches.

2.3. IDENTIFICATION DES DIATOMEES

L'identification est effectuée conformément aux normes NF T 90-354 de juin 2000 et NF EN 14407 d’octobre 2004.

L’identification des diatomées étant basée sur l’examen microscopique du frustule siliceux, les échantillons sont traités à l’eau oxygénée H2O2 bouillante (30 %) afin d’éliminer le protoplasme et, le cas échéant, à l'acide chlorhydrique (élimination des carbonates). Ils sont ensuite centrifugés et les culots sont rincés plusieurs fois à l’eau distillée pour enlever toute trace d’eau oxygénée. Après déshydratation, une partie du culot est montée entre lame et lamelle dans une résine réfringente, le Naphrax (Northern Biological Supplies Ltd, Angleterre - Indice de réfraction = 1,74).

Un comptage par champs (balayage par transect) est effectué sur 400 valves (minimum) afin de dresser un inventaire taxonomique, les résultats étant exprimés par l'abondance relative (en ‰) de chaque taxon. Le comptage est réalisé à l'aide d'un compteur manuel afin d'obtenir 400 diatomées. Les valves sont comptées et déterminées au niveau spécifique ou infraspécifique, en microscopie photonique au grossissement x 1000 (microscope Leica DMLB équipé du contraste de phase et d'un micromètre oculaire pour la mesure des diatomées de résolution 1 µm).

Comptage stratifié

Dans le but d’obtenir une liste plus complète de taxons par station, nous avons réalisé un comptage stratifié selon les prescriptions des paragraphes 6-3 et 7h de la norme NF EN 14407.

Une fois le total requis atteint (400 unités diatomiques), la proportion du taxon dominant est notée et l’analyste continue de compter tous les taxons excepté ce dernier jusqu’à ce que le total requis modifié ait été atteint. Le total requis modifié est le même que le total requis initial, après soustraction du taxon dominant de la somme. Ensuite, les effectifs du taxon dominant sont augmentés dans la même proportion que sa représentation une fois le premier total atteint.

Dans la pratique, le comptage est effectué normalement jusqu’à obtention des 400 unités diatomiques requises pour le calcul de l’IBD à l’aide du compteur. Le nombre de valves concernant le taxon dominant est soustrait du total (400 – nombre de valves du taxon dominant) et sa proportion est notée (pourcentage initial avant soustraction) ; le comptage continue alors jusqu’à obtention des 400 unités diatomiques en comptant tous les taxons rencontrés, sauf le taxon dominant. Dans le comptage final et après calcul, on redonne au taxon dominant son pourcentage initial. L’avantage du comptage stratifié est qu’il permet de recenser un plus grand nombre de taxons, en particulier dans le cas où le peuplement de diatomées est constitué en grande partie par un seul taxon.

L’identification fait appel aux ouvrages les plus récents de la Süßwasserflora (Krammer & Lange-Bertalot, 1986, 1988, 1991a, 1991b…) et à d'autres ouvrages et articles pour les taxons


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absents de la flore de référence, notamment celui relatif aux zones des sources (Lange-Bertalot H. 2004).

2.4. ESTIMATION DE LA QUALITE DE L'EAU

Après saisie codifiée (code à 4 lettres) sur ordinateur à l'aide du logiciel OMNIDIA v4.2 (Lecointe & al., 1993) et de la base récemment mise à jour (base 2006), les inventaires conduisent à l’estimation de l’abondance relative des taxons, au calcul d’un indice de diversité (Shannon & Weaver) et de plusieurs indices diatomiques dont l'Indice de Polluosensibilité Spécifique (IPS) et l'Indice Biologique Diatomées (IBD). Dans la mesure du possible, les nouvelles dénominations des diatomées ont été utilisées.

L 'Indice de Polluosensibilité Spécifique (IPS) mis au point par le Cemagref (1982) sur le bassin Rhône-Méditérannée-Corse est un indice fondé sur la pondération "abondance-sensibilité spécifique". Il présente l'avantage de prendre en compte la totalité des espèces présentes dans les inventaires. Il permet de donner une note à la qualité de l’eau variant de 1 (eaux très polluées) à 20 (eaux d’excellente qualité). Il a été utilisé en routine durant plusieurs années et de nombreux auteurs ont noté sa bonne corrélation avec la physico-chimie de l’eau. La sensibilité de l'IPS à la dégradation de la qualité du milieu s'avère meilleure comparativement aux autres indices ; cela a été mis en évidence notamment dans le cadre du suivi de plus de 300 relevés du bassin Artois-Picardie (Coste et Ayphassoro, 1991). Cet indice fait l'objet de mises à jour régulières.

L'indice Biologique Diatomées (IBD), utilise 209 taxons repères dont 57 appariés (diatomées morphologiquement très proches, regroupées au sein d'unités taxonomiques) et le barycentre de leurs profils de distribution établis en probabilités de présence à partir d'un jeu de données volumineux. Notons que l'IBD est un indice de qualité générale de l'eau basé en particulier sur les matières oxydables et la salinité qui ne prend pas en compte tous les taxons d'un relevé. Son calcul diffère notablement de celui de l'IPS et est complexe pour les non-statisticiens. Pour plus d'informations sur le calcul de cet indice, on pourra se reporter à l'article de Lenoir & Coste (1996).

L'interprétation des valeurs des indices IPS et IBD fait référence à l’annexe V de la DCE (cf. tableau ci-dessous). Une couleur est attribuée à chaque classe de qualité.

IBD � 17 Qualité très bonne

17 > IBD � 13 Qualité bonne

13 > IBD � 9 Qualité moyenne

9 > IBD � 5 Qualité médiocre

IBD < 5 Qualité mauvaise

Tableau 2 : classes de qualité et code couleur associé de l’IBD


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Les classifications de Van Dam et al (1994) ou d’Hofmann (1994) sont utilisées afin de définir les caractéristiques auto-écologiques du peuplement (voir ci-dessous).

Saprobies % de saturation DBO5 (mg.l-1)

1 = oligosaprobe > 85 < 2

2 = β-mésosaprobe 70-85 2-4

3 = α-mésosaprobe 25-70 4-13 4 = α-mésosaprobe

à polysaprobe 10-25 13-22

5 = polysaprobe <10 >22

Salinité Cl- (mg.l-1) Salinité ‰

1 = douces <100 <0.2

2 = douces à légèrement saumâtres <500 <0.9

3 = moyennement saumâtres 500-1000 0.9-1.8

4 = saumâtres 1000-5000 1.8-9

Oxygénation N (C) - hétérotrophie

1 = élevée (100%) 1 = autotrophe sensible à de faibles [C], [N] organiques

2 = forte (>75%) 2 = autotrophe tolérant

3 = modérée (>50%) 3 = hétérotrophe facultatif

4 = basse (>30%) 4 = hétérotrophe obligatoire

5 = très basse (10%)

Statut trophique

1 = oligotrophe

2 = oligo-mésotrophe

3 = mésotrophe

4 = méso-eutrophe

5 = eutrophe

6 = hypereutrophe

7 = indifférent

pH Catégories Intervalles de variations du pH

1 acidobionte pH optimum <5,5

2 acidophile pH optimum 5,5<pH<7

3 neutrophile pH optimum voisin de 7

4 alcaliphile pH optimum >7

5 alcalibionte pH exclusivement >7

6 indifférent optimum non défini

Tableau 3 : classifications proposées par Van Dam et al (1994)


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Tableau 4 : classifications proposées par Hofmann (1994)


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3. CARACTERISTIQUES FLORISTIQUES GENERALES : distribution des familles

Les inventaires diatomiques sont fournis en annexe 2. Nous avons inventorié plus de 200 taxons sur les 25 sites prospectés.

Les diatomées recensées ont été regroupées par familles et les résultats sont représentés par la figure 1.

Figure 1 : Distribution des familles – Stations DCE Languedoc-Roussillon

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Les Monoraphidées

Ce sont essentiellement des espèces épiphytes (Cocconeis) ou fermement fixées au substrat (Achnanthes). Elles sont généralement sensibles aux altérations du milieu et caractérisent donc de ce fait, des cours d’eau peu perturbés. Il existe cependant dans la famille des Monoraphidées, des taxons saprobes tels que Achnanthidium saprophilum, Lemnicola hungarica, ou supportant une forte eutrophie comme Achnanthidium straubianum, Cocconeis placentula var euglypta.

Les Monoraphidées sont logiquement bien représentées au niveau des stations DCE, supposées de bonne qualité biologique. La proportion de Monoraphidées est très élevée (plus de 80% du peuplement) dans la Jonte, le Baumale, le Tarnon, la Mimente, la Boulzane, le Rieutort à La Bastide Esparbaïrenque.

Cette famille est représentée par au moins un taxon dont l’abondance est égale ou supérieure à 10%, dans toutes les stations échantillonnées (tableau ci-dessous). Notons la forte représentation d’Achnanthidium minutissimum, présent dans 16 stations sur 25 à une abondance relative supérieure à 10%. La plupart des taxons répertoriés dans le tableau ci-dessous sont des formes polluo-sensibles, plus ou moins répandues dans les cours d’eau de montagne, à l’exception de Cocconeis placentula var euglypta, davantage inféodé aux milieux plus riches en éléments nutritifs.

Taxons dont l’abondance est supérieure à 10%

Ecologie

Monoraphidées : principaux taxons

Saprobie Trophie

Station

Achnanthidium atomoides Pas de données – Bonne qualité d’eau selon l’IPS Le Baumale à Vebron

L’Aude aux Angles

La Vis à Saint Maurice de Navacelles

Achnanthidium catenatum Pas de données – Bonne qualité d’eau selon l’IPS Le Galeizon à Cendras

Achnanthidium minutissimum β-mésosaprobe indifférent au niveau trophique Allier à Chasseradès

Les Plèches à Nasbinals

La Dourbie à Dourbies

Le Tarn à Mas Camargues

Le Rieutort à Vialas

Le Luech à Génolhac

Le Galeizon à Cendras

L’Agly à Camps sur Agly

Les Mouges à Palairac

L’Aude aux Angles

Le Rieutort à La Bastide Esparbaïrenque

L’Orbieu à Vignevieille

La Vis à Saint Maurice le Navacelles

Le Lamalou à Rouet

La Buèges à Pégairolles de Buèges

Le Séguissous à Bouquet

Achnanthidium rivulare Pas de données Le Galeizon à Cendras

Achnanthidium pyrenaicum oligosaprobe mésotrophe Les Plèches à Nasbinals

Le Baumale à Vebron


La Boulzane à Montfort sur Boulzane

Le Galbe à Espousouille

L’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux



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Achnanthidium subatomus Pas de données mais polluo-sensible d’après l’IPS La Jonte à Gatuzières

Le Tarnon à Bassurels

La Mimente à Cassagnas

Le Tech à la Preste


Cocconeis placentula var lineata oligo-mésosaprobe oligotrophe La Jonte à Gatuzières


Le Tech à La Preste


L’Aude aux Angles


Cocconeis placentula var euglypta β-mésosaprobe eutrophe L’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux



Cocconeis pseudolineata Pas de données – Bonne qualité d’eau selon l’IPS L’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux

Cocconeis af euglyptoides Pas de données Le Baumale à Vebron

Psammothidium oblongellum oligosaprobe oligotrophe L’Orbiel aux Martys

Psammothidium subatomoides oligosaprobe oligo-mésotrophe L’Orbiel aux Martys

Les Araphidées

Elles regroupent principalement des espèces lacustres (Diatoma, Fragilaria, Tabellaria) et sont souvent synonymes de bonne qualité d’eau en milieux lotiques.

Elles sont présentes dans de nombreuses stations prospectées et particulièrement abondantes dans l’Allier, le Tarn, le Luech où elles représentent plus de la moitié du peuplement.

Au moins un taxon appartenant à cette famille possède une abondance supérieure ou égale à 10% dans 6 stations (tableau ci-dessous).


Ecologie

Araphidées : principaux taxons

Saprobie Trophie

Station

Fragilaria bidens �-mésosaprobe eutrophe Le Luech à Génolhac

Fragilaria capucina var capucina �-mésosaprobe mésotrophe L’Allier à Chasseradès


Fragilaria capucina var vaucheriae α-mésosaprobe eutrophe Allier à Chasseradès

Fragilaria gracilis oligosaprobe oligo-mésotrophe Le Tarn à Mas Camargues

Le Luech à Genolhac

Fragilaria rumpens mésosaprobe oligo-mésotrophe L’Orbieu à Vignevieille


Staurosira venter β-mésosaprobe méso-eutrophe Les Plèches à Nasbinals


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Novembre 2006

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Les Brachyraphidées

Les Brachyraphidées, sont composées essentiellement de formes acidophiles et sont généralement indicatrices de bonne qualité d'eau (Eunotia, Peronia). Elles sont très sensibles aux perturbations d’origine anthropique. On les trouve surtout dans l’Allier et dans l’Orbiel et en moindre abondance toutefois dans le Séguissous et l’Agly.

L’espèce la mieux représentée est Eunotia incisa, caractérisant les milieux propres peu minéralisés.


Ecologie

Brachyraphidées : principaux taxons

Saprobie Trophie

Station

Eunotia incisa oligosaprobe oligotrophe L’Orbiel aux Martys

Les Centrophycidées

Ce sont des espèces le plus souvent planctoniques (lacs et milieux lentiques) et généralement peu présentes dans le périphyton à l’exception de Melosira varians, espèce épilithique. Elles apparaissent ponctuellement mais ne sont jamais abondantes. Aucune Centrophycidée n’atteint 10% du peuplement au niveau des stations étudiées.

Les Naviculacées

Elles regroupent le plus grand nombre de genres (Amphora, Caloneis, Craticula, Cymbella, Diadesmis, Encyonema, Encyonopsis, Eolimna, Fallacia, Fistulifera, Frustulia, Geissleria, Gomphoneis, Gomphonema, Hippodonta, Luticola, Mayamaea, Navicula, Naviculadicta, Neidium, Pinnularia, Placoneis, Reimeria, Rhoicosphenia et Sellaphora,…). Les genres Eolimna, Fallacia, Fistulifera, Gessleiria, Hippodonta, Luticola, Mayamaea, Navicula, Placoneis et Sellaphora renferment une majorité de formes alcaliphiles.

Les Naviculacées représentent une bonne partie (au moins 50%) des peuplements de diatomées des cours d’eau, Séguissous et Mouges.

Notons l’abondance du genre Gomphonema, représenté par 6 espèces (tableau ci-dessous).

Ecologie

Naviculacées : principaux taxons

Saprobie Trophie

Station

Amphora pediculus �-mésosaprobe eutrophe Les Mouges à Palairac

Cymbella excisiformis Pas de données Le Séguissous à Bouquet

Cymbella tropica Pas de données Le Galeizon à Cendras

Encyonopsis cesatii oligosaprobe oligotrophe Le Séguissous à Bouquet

Encyonopsis minuta Pas de données Le Lamalou à Rouet

Gomphonema dichotomum �-mésosaprobe méso-eutrophe Le Séguissous à Bouquet

Gomphonema olivaceum �-mésosaprobe eutrophe Les Mouges à Palairac

Gomphonema minutum �-mésosaprobe eutrophe L’Orbieu à Vignevieille

Gomphonema parvulius oligosaprobe oligotrophe L’Orbiel aux Martys


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Novembre 2006

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Gomphonema pumilum var elegans Pas de données mais sensible d’après l’IPS Le Galbe à Espousouille

Gomphonema rhombicum Pas de données mais sensible d’après l’IPS La Dourbie à Dourbies

L’Aude aux Angles

Navicula notha oligosaprobe oligo-mésotrophe La Dourbie à Dourbies


Les Nitzschiacées

Elles renferment un grand nombre d’espèces habituellement saprophiles ou N-hétérotrophes. Cependant, il existe des formes sensibles et alcaliphiles telles que Nitzschia fonticola ou Nitzschia dissipata.

Elles ne sont pas très abondantes dans ces sites DCE et représentées uniquement par deux taxons d’eaux propres dans seulement deux cours d’eau : le Lamalou et la Buèges (cf. tableau ci-dessous).

Ecologie

Nitzschiacées : principaux taxons

Saprobie Trophie

Station

Denticula tenuis oligosaprobe mésotrophe Le Lamalou à Rouet

Nitzschia fonticola β-mésosaprobe méso-eutrophe La Buèges à Pégairolles de Buèges


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Novembre 2006

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4. RESULTATS PAR STATION

Les résultats ont été synthétisés pour chacune des stations, par la réalisation de tableaux et de graphiques.

Dans les tableaux « l’effectif IBD » correspond à l’effectif total utilisé pour le calcul de l’IBD. Les tableaux sont réalisés à partir du comptage « IBD » et «stratifié » pour chaque station.

Afin de caractériser les taxons les mieux représentés dans les relevés, les camemberts rassemblent les diatomées qui ont une abondance relative supérieure ou égale à 5%. Ils sont réalisés également à partir du comptage « IBD ».

Remarques préliminaires :

Quelques remarques taxinomiques peuvent être faites concernant les taxons identifiés dans le cadre de cette étude :

Achnanthidium minutissimum (ADMI) et Achnanthes taiaensis (ATAI) ; ce dernier taxon se distingue de ADMI par la présence de « verrues » situées sur la valvocopula. Il est parfois présent, comme dans le Tarn à Pont de Montvert ou peut être dans l’Allier à Chasseradès. Cette dénomination n’a pas été retenue car la seule façon de s’assurer qu’il s’agit bien de cette espèce est l’observation en microscopie à balayage qui n’a pas encore été réalisé. La dénomination ADMI a donc été conservée.

L’espèce Achnanthidium rivulare (ADRI) a été confirmée grâce à l’utilisation du microscope électronique réalisée dans le cadre d’un stage au CRP au Luxembourg début 2006. Le doute qu’il y avait l’an dernier a été levé en ce qui concerne ce taxon. Il en est de même pour Encyonopsis subminuta, identifiée grâce à l’utilisation du MEB.

Eunotia minor (EMIN), E. intermedia (EINT), E. subarcuatoides (ESUB) : bien représentées dans l’Allier, ces Brachyraphidées ne se distinguent pas facilement en raison du “chevauchement” des densités des stries entre les deux premières.

Dans nos listes, Adlafia sp correspond à un Adlafia décrit dans la flore du Luxembourg mais qui n’est pas encore éditée. Il s’agirait d’A. lange-bertalotii, qui n’a pas encore de code dans OMNIDIA.

Le Cocconeis trouvé dans le Baumale est à ce jour non identifié. Il a été regroupé l’an dernier dans C. pseudolineata. Il est proche de C. euglyptoides décrit dans Iconographia Diatomologica n° 13. Des investigations plus poussées seront nécessaires pour identifier ce taxon.

Notons que Achnanthidium biasolettianum et A. pyrenaicum ont été regroupés sous la dénomination A. pyrenaicum, d’après l’article récent de Potapova (2004).

Pour être en phase avec l’évolution des connaissances et les notes de sensibilité de l’IPS, nous avons modifié ou ajouté certains taxons dans les classifications d’OMNIDIA (Van Dam et al, 1994) : Cocconeis placentula var lineata, C. pseudolineata, Achnanthidium subatomus, A. pyrenaicum.


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Novembre 2006

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L’Allier à Chasseradès

04026500

Comptage « IBD » Peuplement dominant

Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x

N-Hétérotrophie Saprobie Trophie

19

2

,

6

2

18,1 17,7

F

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a

g

i

N-Autotrophe tolérant β-mésosaprobe mésotrophe

Effectif IBD 359

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L’Allier à Chasseradès se caractérise par un peuplement dominé par des Fragilaria. Ces dernières sont des Araphidées qui se mettent en chaînes, accolées les une aux autres, et il n’est pas facile de les disloquer, même avec un traitement chimique poussé. Aussi, toutes les chaînes ont été comptées et la détermination réalisée, après le comptage des vues valvaires. Fragilaria capucina var capucina (FCAP) apparaît nettement dominante ; elle représente quasiment la moitié du peuplement diatomique. Il s’agit d’une diatomée �-mésosaprobe et mésotrophe. Elle est bien notée par l’IPS (sensibilité de 4,5/5) et possède un « bon profil » avec l’IBD (probabilité maximale en classe 7 – cf. graphe ci dessus). On trouve aussi F. capucina var. vaucheriae (FCVA), forme plus ubiquiste et plus fréquente ; elle présente aussi un caractère plus résistant que la précédente, d’après les données de Van Dam et al (1994). La Monoraphidée Achnanthidium minutissimum (ADMI sensu lato) est bien présente ; très sensible à la qualité de l’eau et notamment aux conditions d’oxygénation, elle témoigne d’un milieu bien oxygéné. Notons la présence d’Eunotia intermedia (EUIN), forme acidophile oligotrophe, fortement menacée d’après la « Rote List ». Le pH, mesuré au moment du prélèvement était de 5,9, ce qui explique la présence de ces formes acidophiles.

Les deux indices diatomiques estiment la qualité biologique très bonne.

Le peuplement est à l’image du taxon dominant : sensible à la matière organique, moyennement tolérant à la matière minérale.


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Novembre 2006

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L’Allier à Chasseradès

04026500

Comptage « stratifié» Peuplement dominant

Nombre de

taxons Diversité IBD IPS Taxons dominants (>10%) N-Hétérotrophie Saprobie Trophie

24 2,81 18,5 18,0 Fragilaria capucina var. capucina (46%)

Achnanthidium minutissimum (15%)

N-Autotrophe tolérant

β-mésosaprobe mésotrophe

A partir du comptage stratifié, 24 taxons sont identifiés, soit 5 de plus par rapport au comptage « IBD ». Les indices ne sont que très peu modifiés et appartiennent également à la classe très bonne. On peut signaler la modification de la proportion de Fragilaria capucina var vaucheriae qui tombe en dessous de 10% ; cela s’explique car les Fragilaria formant de chaînes, selon que l’on « tombe » ou non sur une chaîne au cours du comptage, on modifie plus ou moins la proportion.


05096850


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


41

3

,

9

0

18,8 17,5

A

c

h

n

a

N-Autotrophe tolérant β-mésosaprobe indifférent

Effectif IBD 348

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Le peuplement de cet échantillon est dominé par deux Achnanthidium : A. minutissimum (ADMI) et A. pyrenaicum (ADPY). Ils sont synonymes d’une eau de bonne qualité, non polluée par la matière organique. A. pyrenaicum est associé à A. biasolettianum (ADBI) dans le calcul


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Novembre 2006

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de l’IBD. Ils sont bien notés par l’IPS (sensibilité 5/5) et également par l’IBD avec une probabilité de présence maximale en classe 7 (cf. graphe ci dessus). On trouve aussi une Araphidée, Staurosira venter, qualifiée de �-mésosaprobe et de méso-eutrophe par les classifications de Van Dam et al (1994). Le peuplement comprend une autre Araphidée, Fragilaria rumpens (FRUM), mésosaprobe d’après Hofmann (1994), ainsi que Gomphonema rhombicum (GRHB). Ce dernier n’est pas répertorié par les auteurs précédemment cités, n’est pas pris en compte dans l’IBD mais est bien noté par l’IPS (sensibilité 5/5). D’après nos investigations, ce taxon a été rencontré toujours dans des eaux très propres et n’est pas très fréquent ni abondant.

Les deux indices diatomiques estiment la qualité biologique très bonne. Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes tolérantes, �-mésosaprobes, et indifférentes au degré de trophie, à l’instar d’ A. minutissimum.


05096850

Comptage « stratifié » Peuplement dominant

Nombre de


47 3,97 18,5 17,4


A. pyrenaicum (13%)

Staurosira venter (11%)


β-mésosaprobe indifférent

Le comptage stratifié permet de recenser 6 taxons de plus. Les proportions des espèces sont peu modifiées, de même que les indices diatomiques.


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Novembre 2006

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05148200


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


27

3

,

2

0

17,2 18,4

A

c

h

n

a

N-Autotrophe tolérant β-mésosaprobe indifférent

Effectif IBD 264

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On retrouve dans ce relevé, Achnanthidium minutissimum (ADMI), qui représente 36% du peuplement. Navicula notha (NNOT) est également bien présente. D’après Lange-Bertalot (2001) ce taxon est oligosaprobe, peuplant les eaux neutres à légèrement acides de faible conductivité. Elle n’est pas retenue par l’IBD mais est bien notée par l‘IPS (sensibilité = 4,8/5). Le peuplement comprend également Gomphonema rhombicum, précédemment décrit ainsi que deux autres diatomées : Fragilaria bidens (FBID) et Encyonema ventricosum (ENVE). Dans le calcul de l’IBD, la première est associée à F. capucina et la seconde à Encyonema minuta. Ces deux taxons sont bien notés par l’IPS (sensibilité de 5/5 et 4,8/5, respectivement).

Les deux indices sont en bon accord et estiment la qualité biologique très bonne.

Le peuplement est à l’image du taxon dominant, �-mésosaprobe et indifférent à la trophie.


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Novembre 2006

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05148200


Nombre de


33 3,15 17,2 18,8


Navicula notha (15%)

Gomphonema rhombicum (13%)


β-mésosaprobe indifférent

Le comptage stratifié permet de trouver 6 taxons de plus ; les valeurs des indices diatomiques sont très peu modifiées.

La Jonte à Gatuzières

05149520


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


12

1

,

8

3

20,0 17,4

C

o

c

c

o

N-Autotrophe tolérant oligosaprobe oligo-mésotrophe

Effectif IBD 393

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Ce relevé se caractérise par la forte proportion de Cocconeis placentula var lineata (CPLI = 49 % du peuplement). Il s’agit d’une forme plus sensible que C. placentula var euglypta (CPLE), généralement rencontrée dans les eaux moins minéralisées. Dans l’IBD les profils de distribution sont d’ailleurs assez différents avec un décalage de celui de CPLI vers les meilleures qualités d’eau. Achnanthidium subatomus (ADSU) est également bien présent dans l’échantillon. Associé à A. biasolettianum dans le calcul de l’IBD, il est bien noté par l’IPS (sensibilité 5/5). Van Dam et al (1994) ne donnent pas de valeurs pour cette espèce. A titre d’exemple, F. Rimet a


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Novembre 2006

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montré que ce taxon est présent en classe 2 c'est-à-dire dans la classe oligo-�-mésosaprobe (étude réalisée au niveau des cours d’eau Lorrains). Etant données les notes de l’IPS, nous considérons ce taxon comme indicateur d’oligotrophie et d’oligosaprobie. Le peuplement se compose aussi de la diatomée polluo-sensible A. pyrenaicum (ADPY).

Les deux indices diatomiques estiment la qualité biologique de cette station très bonne, avec 20/20 pour l’IBD.

Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes tolérantes, oligosaprobes et oligo-mésotrophes.

La Jonte à Gatuzières

05149520


Nombre de


13 1,71 20,0 17,4 Cocconeis placentula var lineata (49%)

Achnanthidium subatomus (37%)


oligosaprobe oligo-mésotrophe

Avec le comptage stratifié, on obtient 1 taxon de plus seulement et des notes indicielles de l’IPS et de l’IBD sont identiques.


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Novembre 2006

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05150900


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


10

2

,

0

5

17,9 19,1

F

r

a

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i

N-Autotrophe sensible oligosaprobe oligo-mésotrophe

Effectif IBD 396

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Comme dans l’Allier à Chasseradès, les Fragilaria sont nombreuses et ont nécessité une détermination a posteriori, après détermination des vues valvaires. L’espèce la plus abondante est F. gracilis (FGRA) ; elle représente la moitié du peuplement de diatomées du Tarn à Mas Camargues. Il s’agit d’une forme oligosaprobe et oligo-mésotrophe d’après Van Dam et al (1994). Elle est bien notée par l’IPS (sensibilité = 4,8/5) ; associée à Fragilaria capucina var capucina (FCAP) dans l’IBD, elle possède donc le même profil (cf. Allier à Chasseradès). On retrouve Achnanthidium minutissimum (ADMI) dans cet échantillon. Tabellaria flocculosa (TFLO) est aussi représentée dans cette station ; c’est une espèce sensible d’après l’IPS (sensibilité 5/5). Elle est acidophile, �-mésosaprobe et mésotrophe d’après Van Dam et al (1994).

Les deux indices indiquent une très bonne qualité de milieu.

Le peuplement est dominé par des formes sensibles, aussi bien à la matière organique que minérale.


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Novembre 2006

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05150900


Nombre de


15 2,16 17,8 19,3

Fragilaria gracilis (49%)


F. capucina var. capucina (10%)

N-Autotrophe sensible


Le comptage stratifié permet d’identifier 5 taxons de plus comparativement au comptage « IBD ». Les proportions des taxons sont un peu modifiées mais les indices appartiennent toujours à la classe de très bonne qualité.


05151050


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


16

2

,

5

0

20,0 19,5

C

o

c

c

o

N-Autotrophe tolérant �-mésosaprobe mésotrophe

Effectif IBD 216

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Cet échantillon est dominé par un Cocconeis non identifié de façon certaine mais qui se rapproche morphologiquement de C. euglyptoides (CEUO). Ce dernier n’est pas pris en compte dans les indices, ni dans les classifications de la littérature. Etant donné les taxons avec lesquels il est associé, on peut supposer qu’il s’agit d’une forme polluo-sensible. On trouve en


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Novembre 2006

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effet des diatomées indicatrices de bonne qualité d’eau parmi les dominantes : Achnanthidium pyrenaicum (ADPY), C. pseudolineata (COPL), A. minutissimum (ADMI).

A. atomoides (ADAM) n’est pas classé par les auteurs ni retenu par l’IBD. D’après Monnier (com. pers.), il est plutôt d’eaux propres mais avec une certaine tolérance à la trophie.

Les deux indices montrent que la qualité biologique est très bonne. Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes tolérantes, �-mésosaprobes et mésotrophes.


05151050


Nombre de


20 2,61 20,0 19,5

Cocconeis af euglyptoides (37%)

Achnanthidium pyrenaicum (28%)

A. atomoides (10%)


�-mésosaprobe mésotrophe

4 taxons de plus ont été identifiés avec le comptage stratifié. Les indices diatomiques ne sont pas modifiés. A. atomoides atteint 10% du peuplement contre 9% avec le comptage « IBD ».


05151100


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


12

2

,

1

5

20,0 18,5

A

c

h

n

a

N-Autotrophe tolérant oligosaprobe oligotrophe

Effectif IBD 384


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Novembre 2006

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Le peuplement diatomique du Tarnon à Bassurels se caractérise par la dominance de taxons synonymes de bonne qualité d’eau, de milieux bien oxygénés. On retrouve les taxons déjà décrits comme tels : Achnanthidium subatomus (ADSU), Cocconeis placentula var lineata (CPLI), C. pseudolineata (COPL), A. minutissimum (ADMI).

Vue la composition de ce peuplement, les deux notes indicielles sont logiquement de très bonne qualité.

Le peuplement est à l’image des formes dominantes, oligosaprobe et oligotrophe.


05151100


Nombre de


18 2,11 20,0 18,4 Achnanthidium subatomus(41%)

Cocconeis placentula var lineata (36%)


oligosaprobe oligotrophe

6 diatomées de plus ont été identifiées à partir du comptage stratifié. Ni la composition du peuplement, ni les indices ne sont modifiés.


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Novembre 2006

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05151150


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


9

1

,

2

9

20,0 18,9

A

c

h

n

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Effectif IBD 368

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L’échantillon est très nettement dominé par Achnanthidium subatomus (ADSU) qui représente 78% du peuplement diatomique. Les espèces qui l’accompagnent sont également indicatrices de bonne qualité de milieu.

Les deux indices sont en bon accord et estiment la qualité biologique très bonne.

Comme dans le relevé précédent, le peuplement, très ressemblant, est dominé par des formes oligosaprobes et oligotrophes.


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Novembre 2006

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05151150


Nombre de


22 1,40 20,0 19,2 Achnanthidium subatomus (78%) N-Autotrophe tolérant


13 taxons de plus ont ici été trouvés ; ceci est normal car, vu la forte proportion, d’A. subatomus, on a dû compter un grand nombre de valves en plus lors du comptage stratifié. Les indices diatomiques sont peu modifiés.


06118500

Comptage «IBD» Peuplement dominant

Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


14

2

,

1

6

17,5 19,0

A

c

h

n

a

N-Autotrophe tolérant �-mésosaprobe indifférent

Effectif IBD 257

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La moitié du peuplement est composée par Achnanthidium minutissimum (ADMI), déjà décrit dans de nombreux échantillons au cours de cette étude. Il est accompagné ici par Navicula notha (NNOT), comme dans la Dourbie à Dourbies. Rappelons que cette Naviculacée n’entre pas dans le calcul de l’IBD. Les classifications généralement utilisées, montrent qu’il s’agit d’une diatomée élective de milieux oligosaprobes et oligo-mésotrophes. On trouve aussi Fragilaria gracilis (FGRA) et Achnanthidium catenatum (ADCT). Ce dernier n’est pas classé par


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Novembre 2006

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Van Dam et al (1994) mais Hofmann le considère oligo-�-mésosaprobe et �-méso-eutrophe. Il peut témoigner de la présence des petites retenues (vasques) car il se développe généralement dans les lacs de montagne.

Les deux indices diatomiques montrent que la qualité du milieu est très bonne.

A l’image d’A. minutissimum, le peuplement est composé en majorité de formes �-mésosaprobes et indifférentes à la trophie.


06118500

Comptage «stratifié» Peuplement dominant

Nombre de


20 2,24 17,5 18,9 Achnanthidium minutissimum (51%)

Navicula notha (24%)


�-mésosaprobe indifférent

6 taxons de plus ont été inventoriés avec ce comptage. La composition du peuplement est peu modifiée. Il en est de même pour les indices diatomiques.


06118550


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


23

3

,

1

1

17,8 18,1

F

r

a

g

i

N-Autotrophe sensible �-mésosaprobe eutrophe

Effectif IBD 346


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Novembre 2006

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L’échantillon est dominé par deux Fragilaria : F. bidens (FBID) et F. gracilis (FGRA). Ces deux dernières sont associées à F. capucina var capucina dans le calcul de l’IBD. L’IPS les considère sensibles avec des valeurs de sensibilité respectives de 5/5 et 4,8/5. D’après Van Dam et al (1994), F. bidens est un peu plus résistante que F. gracilis : �-mésosaprobe pour l’une contre oligosaprobe pour l’autre et eutrophe contre oligo-mésotrophe. On rencontre également Achnanthidium minutissimum (ADMI) dans cet échantillon.

La qualité biologique est estimée très bonne par les deux indices diatomiques utilisés.

Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes sensibles, �-mésosaprobes et eutrophes.


06118550


Nombre de


25 3,18 17,9 18,3

Fragilaria bidens (36%)


F. gracilis (13%)


�-mésosaprobe eutrophe

Seulement deux taxons de plus sont trouvés. Le comptage stratifié inverse la dominance entre A. minutissimum et F. gracilis comparativement au comptage « IBD » mais les indices diatomiques sont très peu modifiés.


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ASCONIT Consultants

Novembre 2006

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06119950


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


31

4

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1

5

14,9 18,9

A

c

h

n

a

n

N-Autotrophe sensible oligosaprobe oligotrophe

Effectif IBD 207

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Le peuplement présent dans le Séguissous à Bouquet est tout à fait particulier. Notons que seulement un effectif de 207 participe au calcul de l’IBD. Il n’y a pas de nette dominance, mais plusieurs taxons sont présents dans le relevé à une abondance relative proche. Si la diatomée la mieux représentée, Achnanthidium minutissimum (ADMI) est bien connue, la deuxième, Gomphonema dichotomum (GDIC) est rare à notre connaissance. Il s’agit, d’après Van Dam et al (1994) d’un taxon subaérien et on peut supposer, même si le cours d’eau était en eau depuis un mois, que son assèchement estival a sélectionné une microflore particulière. D’après la « Rote List », ce taxon est en régression. Il est bien noté pas l’IPS et associé à G. pumilum dans l’IBD. Encyonopsis cesatii (ECES) est également subaérienne d’après les auteurs précédemment cités. Elle est considérée comme élective de bonnes qualités de milieux, étant classé parmi les diatomées oligosaprobes et oligotrophes. Elle n’entre pas dans le calcul de l’IBD. On trouve aussi Cymbella excisiformis (CEXF) dont l’écologie n’est pas bien connue. Encyonopsis microcephala (ENCM) représente 7% du peuplement et est synonyme de bonne qualité d’eau, tout comme Eunotia arcus (EARC). La présence de Sellaphora stroemii (SSTM), considérée comme aérophile, renforce l’hypothèse d’une sélection d’espèces liée à l’assec du ruisseau.

Dans cet échantillon, les deux indices ne sont pas en accord. Tandis que l’IBD indique une qualité bonne, l’IPS l’estime très bonne. L’effectif total utilisé pour le calcul de l’IBD étant de seulement 207, l’IPS nous semblera plus crédible ici, avec un effectif pris en compte supérieur.

Le peuplement est dominé par des diatomées de milieux propres : N-autotrophes sensibles, oligosaprobes et oligotrophes.


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ASCONIT Consultants

Novembre 2006

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06119950

Comptage «stratifié Peuplement dominant

Nombre de


31 4,14 14,9 18,9


Encyonopsis cesatii (12%)

Gomphonema dichotomum (11%)

Cymbella excisiformis (10%)



Dans le cas du Séguissous, le comptage stratifié, n’apporte pas plus de taxons. Les notes indicielles ne sont pas modifiées, malgré une inversion entre G. dichotomum et E. cesatii.


06127050


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


25

3

,

2

6

17,0 15,7

A

c

h

n

a

n


Effectif IBD 112

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Le taxon dominant est Achnanthidium rivulare (ADRI) avec une abondance relative de 30%. Il était déjà dominant en 2005 et sa détermination a fait l’objet d’une étude au microscope électronique au niveau de cette station. On suppose ici qu’il s’agit de la même espèce en 2006. Ce taxon n’est pas très bien connu mais est rapporté dans plusieurs stations du Limousin, dans des eaux faiblement minéralisées (Ector, com. per.). Ni l’IPS ni l’IBD ne le prennnent en


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Novembre 2006

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compte pour le moment et aucune classification disponible ne le répertorie à ce jour. Il en est de même pour Cymbella tropica (CTRO), d’origine Vénézuelienne (Krammer, 2002), déjà identifiée l’an dernier. On retrouve Achnanthidium minutissimum (ADMI) témoignant de la bonne oxygénation de l’eau. A. catenatum (ADCT) est également bien présent et atteste de la présence de zones lentiques (vasques). Gomphonema pumilum (var pumilum ?) (GPUM) est bien présent, ainsi que Encyonopsis subminuta (ESUM). La première espèce est bien notée par l’IPS (sensibilité = 5/5) tandis que la seconde n’est pas prise en compte encore dans le calcul des indices diatomiques. Notons que le groupe « Encyonopsis microcephala » a été scindé par Krammer (2002) en plusieurs espèces : E. minuta, E. subminuta… qui ne sont pas faciles à distinguer et dont la détermination nécessite le recours au microscope électronique. Cela a été fait pour l’espèce présente dans ce relevé, ce qui nous permet d’identifier E. subminuta. D’après les classifications de Van Dam et al (1994), cette espèce est oligosaprobe et oligotrophe. Notons que nous avons retrouvé dans ce relevé Gomphonema cf. entolejum, forme identifiée l’an dernier et qui a également fait l’objet d’une étude en microscopie électronique ; il s’agirait de la même espèce que celle décrite en Guadeloupe (Tudesque & Ector, 2002).

Avec cet échantillon du Galeizon, nous avons affaire à un peuplement très particulier, récurrent, au vu des deux années d’étude et qui nous parait sans doute insolite car ce genre de station n’a jamais été prospecté auparavant. Notons que seulement 112 individus participent au calcul de l’IBD.

L’IPS estime la qualité biologique bonne et l’IBD la juge très bonne mais quelle est la pertinence de ces valeurs étant donné la non prise en compte des deux premiers taxons ?

Il en est de même pour les caractéristiques auto-écologiques du peuplement, qui sont le reflet surtout de l’écologie d’ A. minutissimum.


06127050


Nombre de


31 3,32 17,1 16,0

Achnanthidium rivulare (30%)

Cymbella tropica (16%)

A. minutissimum (13%)

A. catenatum (10%)



6 taxons de plus ont été recensés avec le comptage stratifié. Les indices diatomiques sont peu modifiés.


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Novembre 2006

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06166900


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


33

4

,

0

0

19,2 16,8

A

c

h

n

a


Effectif IBD 379

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Le peuplement est dominé par un taxon synonyme de très bonne qualité d’eau : Achnanthidium subatomus (ADSU). Comme nous l’avons vu cet Achnanthidium est associé à A. biasolettianum dans le calcul de l’IBD et est bien noté par l’IPS (sensibilité 5/5). On trouve aussi Cocconeis placentula var lineata (CPLI), forme également sensible. Nitzschia fonticola (NFON) est une Nitzschiacée peu résistante à la matière organique et moyennement inféodée à la matière minérale. Toutefois, ce relevé se distingue, comme cela s’était produit en 2004, par la présence de diatomées plus ou moins saprobes. Planothidium lanceolatum (PTLA) est �-mésosaprobe et eutrophe d’après Van Dam et al (1994). On trouve des diatomées encore plus résistantes, qualifiées même de polysaprobes comme Mayamaea atomus var permitis (4%) ou encore Naviculadicta seminulum (4%) dans cet échantillon. En 2004, les analyses bactériologiques avaient montré une contamination, qui avait également été suspectée à juste titre par les diatomées. Cette année aussi, les diatomées tendent à traduire une contamination organique dans le milieu, légère vue la persistance de formes sensibles. Cet apport organique peut être lié à la présence d’animaux, chèvres ou vaches par exemple, qui sont susceptibles de s’abreuver dans le cours d’eau et d’y apporter des déjections, ou à la présence de campeurs (« camping sauvage ») car le lieu est très touristique.

De ce fait, l’IPS, plus sensible, n’indique qu’une qualité bonne alors que l’IBD juge la qualité très bonne.

Le peuplement est à l’image du taxon dominant, oligosaprobe et oligotrophe.


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Novembre 2006

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06166900


Nombre de


38 4,07 19,2 16,8 Achnanthidium subatomus (29%)




5 taxons de plus sont identifiés avec le comptage stratifié. Les notes indicielles ne sont pas modifiées.


06172880


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


41

3

,

8

5

19,3 18,4

A

c

h

n

a


Effectif IBD 282

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Le peuplement de l’Agly se compose essentiellement d’Achnanthidium qui ont été décrits dans les précédents relevés : A. minutissimum (ADMI), A. pyrenaicum (ADPY), A. atomoides (ADAM). Ce sont des espèces polluo-sensibles. On trouve une forme peu commune à notre connaissance : Achnanthes biasolettiana var thienemannii (ABTH) ; on ne dispose pas de données sur l’écologie de ce taxon si ce n’est qu’il est assez bien noté par l’IPS (sensibilité = 4/5). Il n’est en revanche pas considéré par l’IBD.


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Novembre 2006

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Les deux indices diatomiques estiment la qualité biologique très bonne.

Le peuplement est dominé par des diatomées �-mésosaprobes et indifférentes au degré de trophie.


06172880


Nombre de


46 3,88 19,4 18,5 Achnanthidium minutissimum (26%)

A. pyrenaicum (24%)



Le comptage stratifié permet d’obtenir 5 taxons de plus. Les indices diatomiques sont très peu modifiés.


06172930


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


13

2

,

5

0

20,0

17,4

C

o

c

c

o


Effectif IBD 395

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Le peuplement de la Boulzane à Montfort sur Boulzane est constitué quasi-exclusivement de Monoraphidées, en particulier des Cocconeis et des Achnanthidium indicateurs d’un milieu de


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Novembre 2006

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très bonne qualité : Cocconeis placentula var lineata (CPLI), C. pseudolineata (COPL), Achnanthidium pyrenaicum (ADPY), A. subatomus (ADSU).

Logiquement, les indices diatomiques appartiennent à la classe de très bonne qualité biologique, avec un 20/20 pour l’IBD.

Le peuplement est à l’image de la diatomée dominante, oligosaprobe et oligo-mésotrophe.


06172930


Nombre de


21 2,55

20,0

17,4



A. subatomus (14%)



Le comptage stratifié a permis de recenser 8 taxons de plus, comparativement au comptage « IBD ». Les notes indicielles restent inchangées.


06173563


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


24

3

,

6

2

12,1

17,5

G

o

m

p

h

N-Autotrophe tolérant �-mésosaprobe eutrophe

Effectif IBD 330

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Novembre 2006

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Cet échantillon est dominé par deux Naviculacées assez communes, Gomphonema olivaceum (GOLI) et Amphora pediculus (APED). Toutes deux sont qualifiées de ��mésosaprobes et d’eutrophes par Van Dam et al (1994). Elles tendent à montrer un milieu enrichi en matières minérales. On rencontre dans le relevé des formes sensibles comme Achnanthidium minutissimum (ADMI) qui montre que le milieu est bien oxygéné ou G. pumilum var elegans (sensibilité 5/5) (GPEL). Psammothidium grischunum (PGRI), n’est pas classé par les classifications utilisées, ni pris en compte par l’IBD, mais est bien noté par l’IPS (sensibilité 5/5). Il y a aussi des taxons plus résistants comme Planothidium lanceolatum (PTLA), forme �-mésosaprobe et comme P. frequentissimum (PLFR), �-méso-polysaprobe qui tendent à montrer un enrichissement du milieu. Le cours d’eau était en phase d’assèchement et il y a probablement eu un impact plus marqué vu le faible niveau d’eau. La présence rapportée de nombreux sangliers aux abords du point peut expliquer l’apport de composés organiques dans le milieu.

La minéralisation est relativement élevée (594 µS/cm) mais du même ordre de grandeur que les années précédentes. La conductivité est toutefois une mesure ponctuelle qui ne traduit pas toujours l’ensemble des conditions du milieu.

Les deux indices sont en désaccord au niveau de cette station ; alors que l’IPS juge la qualité très bonne, l’IBD l’estime seulement moyenne. Cette différence d’appréciation peut s’expliquer par le profil écologique de G. olivaceum, déplacé vers les qualités moyennes (maximum en classe 5) alors que l’IPS note bien cette espèce (sensibilité de 4,6/5). L’IBD ne prend pas en compte G. pumilum var elegans ni Psammothidium grischunum, ce qui accentue la différence entre les deux notes.

Le peuplement est à l’image des deux taxons dominants, de type �-mésosaprobe et eutrophe.


06173563


Nombre de


29 3,68

12,3

17,5

Gomphonema olivaceum (26%)

Amphora pediculus (14%)




5 taxons de plus ont été identifiés avec le comptage stratifié. Les notes indicielles ne sont pas modifiées.


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Novembre 2006

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L’Aude aux Angles

06175480


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


13

2

,

3

7

18,6 19,2

A

c

h

n

a

n


Effectif IBD 270

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Les diatomées majoritaires dans le peuplement de l’Aude aux Angles sont toutes synonymes de bonne qualité de milieu : Achnanthidium minutissimum (ADMI), A. atomoides (ADAM), Cocconeis placentula var lineata (CPLI), Ghomphonema rhombicum (GRHB).

De façon logique, vu le peuplement, les deux indices diatomiques estiment la qualité biologique très bonne.

D’un point de vue des caractéristiques écologiques dominantes, le peuplement est de type N-autotrophe tolérant, �-mésosaprobe et indifférent au niveau trophique.


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Novembre 2006

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L’Aude aux Angles

06175480


Nombre de


20 2,43 18,5 19,2


A. atomoides (19%)


Gomphonema rhombicum (11%)



Avec le comptage stratifié, 7 taxons de plus sont identifiés. Les indices diatomiques ne sont que très peu modifiés.


06175517


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


23

2

,

8

2

20,0 19,6

A

c

h

n

a

N-Autotrophe tolérant �-mésosaprobe mésotrophe

Effectif IBD 230

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Le taxon qui domine le peuplement de cette station est Achnanthidium pyrenaicum (ADPY), diatomée polluo-sensible déjà décrite dans les stations précédentes. On trouve aussi, bien représenté, Gomphonema pumilum var elegans (GPEL). Rappelons que cette dernière n’entre pas dans le calcul de l’IBD et n’est pas classée par les compilations utilisées. En revanche, l’IPS la considère sensible (sensibilité = 5/5). Achnanthidium minutissimum (ADMI) est également présent au niveau de cette station ainsi que Fragilaria arcus (FARC). Cette Araphidée est


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Novembre 2006

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qualifiée de �-mésosaprobe et d’oligo-mésotrophe par Van Dam et al (1994) et est bien notée par l’IPS (sensibilité =5/5).

Les deux indices montrent que la qualité biologique est très bonne.

Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes tolérantes, �-mésosaprobes et mésotrophes.


06175517


Nombre de


26 2,85 20,0 19,6 Achnanthidium pyrenaicum (35%)

Gomphonema pumilum var elegans (31%)


�-mésosaprobe mésotrophe

Seulement 3 taxons en plus sont trouvés avec ce comptage. Les indices diatomiques sont inchangés.


06178006


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


18

3

,

0

1

17,1 17,3

C

o

c

c

o


Effectif IBD 356

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Novembre 2006

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L’échantillon est dominé par Cocconeis placentula var euglypta (CPLE) qui est plus tolérant que la variété lineata, en particulier au degré de trophie. On rencontre aussi dans ce relevé des taxons sensibles tels que Achnanthidium pyrenaicum (ADPY), A. minutissimum (ADMI), A. atomoides (ADAM), C. pseudolineata (COPL), Gomphonema pumilum var. elegans (GPEL) et une espèce plus tolérante aux matières minérales comme Amphora pediculus (APED). Ce cours d’eau a peut-être été contaminé car la personne propriétaire du terrain au niveau du gué où nous garons la voiture, nous a informé qu’il avait observé de la mousse vers la mi-juillet, et ce, pendant une semaine.

Les valeurs des deux indices diatomiques sont très proches et appartiennent à la classe de qualité très bonne.

Le peuplement est à l’image du taxon dominant, N-autotrophe tolérant, �-mésosaprobe et eutrophe.


06178006


Nombre de


25 3,16 16,9 17,2

Cocconeis placentula var. euglypta (31%)


C. pseudolineata (12%)



Le comptage stratifié permet de recenser 7 taxons de plus. Bien que peu modifié (0,2 point), l’IBD passe dans la classe de bonne qualité biologique.


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Novembre 2006

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L’Orbiel aux Martys

06178800


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


31

3

,

8

6

20,0 18,7

P

s

a

m

m

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N-Autotrophe sensible oligosaprobe oligotrophe

Effectif IBD 264

6� ��2�!"��/�+��"��"��!�/��

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Le peuplement de l’Orbiel est composé de plusieurs espèces de différents types écologiques, acidophiles à neutrophiles, notamment. Il se distingue par la présence de diatomées acidophiles comme Psammothidium subatomoides (PSAT) et P. oblongellum (POBG) ou encore par des Eunotia. P. subatomoides est qualifié d’oligosaprobe et d’oligo-mésotrophe par Van Dam et al (1994). C’est une espèce bien notée par l’IPS (sensibilité = 5/5) et prise en compte dans l’IBD, avec un profil de distribution clairement orienté vers les classes de bonnes qualités d’eau (cf. graphe ci-dessus). P. oblongellum, en revanche, n’est pas pris en compte dans l’IBD actuel. Il est prévu que cette espèce soit introduite dans le nouvel IBD. D’après Van Dam et al (1994), c’est aussi une espèce d’eaux propres, classée parmi les formes oligosaprobes et oligotrophes. Gomphonema parvulius (GPVL) est associé à G. exillissimum (GEXL) dans l’IBD et possède une probabilité de présence maximale dans les classes de bonnes qualités d’eaux. Ces deux dernières sont présentes dans le relevé et sont répertoriées par les auteurs cités précédemment comme oligosaprobes et oligotrophes. Le peuplement se compose aussi d’Eunotia, indicatrices de bonnes qualités d’eaux : E. incisa (EINC) et E. minor (EMIN). La première n’entre pas dans le calcul de l’IBD tandis que la seconde est associée à E. pectinalis (EPEC). Son profil est proche de celui de G. parvulius, c'est-à-dire indicateur de bonne qualité. Sont présents également dans cet échantillon, Achnanthidium minutissimum (ADMI) et Fragilaria rumpens (FRUM), taxons plus communs.

L’IPS et l’IBD estiment la qualité biologique très bonne.

Le peuplement est dominé par des formes très sensibles à la pollution : N-autotrophes sensibles, oligosaprobes et oligotrophes.


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Novembre 2006

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L’Orbiel aux Martys

06178800


Nombre de


37 3,85 20,0 18,8

Psammothidium subatomoides (20%)

Gomphonema parvulius (12%)

P. oblongellum (12%)

Eunotia incisa (11%)



Le comptage stratifié permet de gagner 6 taxons en plus dans cet échantillon. Les indices diatomiques ne sont pas ou peu modifiés.


06178865


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


7

1

,

5

3

19,2 17,7

C

o

c

c


Effectif IBD 369

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Cet échantillon est très nettement dominé par Cocconeis placentula var lineata (CPLI) qui représente plus de la moitié du peuplement diatomique (55%). Rappelons qu’il s’agit d’une forme sensible, généralement rencontrée dans les eaux peu minéralisées. On retrouve ici encore Achnanthidium minutissimum (ADMI) ainsi que Gomphonema rhombicum (GRHB). Jamais très abondant, ce dernier taxon témoigne néanmoins de la bonne qualité du milieu.

Les deux indices sont en bon accord et montrent que la qualité est très bonne.


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Novembre 2006

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Le peuplement est à l’image de Cocconeis placentula var lineata, N-autotrophe tolérant, oligosaprobe et oligo-mésotrophe.


06178865


Nombre de


14 1,54 19,2 17,6 Cocconeis placentula var lineata (55%)




Dans ce cas, le comptage stratifié permet de doubler le nombre de taxons inventoriés. Les notes indicielles restent quasiment inchangées.


06179615


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


25

3

,

3

5

14,9 16,4

A

c

h

n

a

n


Effectif IBD 342

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Le peuplement diatomique de l’Orbieu à Vignevieille est dominé par Achnanthidium minutissimum (ADMI) et par Cocconeis placentula var. euglypta (CPLE). Comme nous l’avons vu dans les relevés précédents, la première est indifférente à la trophie alors que la seconde


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Novembre 2006

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est tolérante à la matière minérale et est qualifiée d’eutrophe par Van Dam et al (1994). Gomphonema minutum (GMIN) est également classée par les auteurs parmi les diatomées �-mésosaprobes et eutrophes. La composition du peuplement tend donc à indiquer un milieu où les nutriments sont présents. On trouve aussi Fragilaria rumpens (FRUM), caractérisant les milieux moins minéralisés que la dernière espèce ; elle est qualifiée d’oligo-mésotrophe.

Les deux indices diatomiques montrent une qualité bonne et non très bonne, ce qui permet de suspecter la présence d’une charge minérale. La présence de jardins sur le bord du cours d’eau peut éventuellement expliquer l’apport de molécules phytosanitaires (lessivage des jardins par les pluies?).

Le peuplement est dominé par des formes sensibles à la matière organique mais résistantes à la matière minérale.


06179615


Nombre de


29 3,38 14,8 16,3


Cocconeis placentula var euglypta (22%)

Gomphonema minutum (11%)



5 taxons de plus sont identifiés avec le comptage stratifié. Les pourcentages des taxons sont légèrement modifiés mais les deux indices montrent toujours une qualité biologique bonne.


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Novembre 2006

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06181945


Nombre de

taxons

D

i

v

IBD IPS

T

a

x


26

3

,

8

3

16,5 17,5

C

o

c

c

o

n


Effectif IBD 334

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Le peuplement se caractérise par un mélange de taxons d’écologie sensiblement différente. On trouve des taxons sensibles, déjà identifiés dans de nombreux échantillons, comme Achnanthidium pyrenaicum (ADPY), A. atomoides (ADAM), A. minutissimum (ADMI), Nitzschia fonticola (NFON), des taxons plus résistants vis-à-vis de la trophie notamment, Amphora pediculus (APED), Cocconeis placentula var euglypta (CPLE), et également une forme plus résistante, Planothidium frequentissimum (PLFR).

Seulement 1 point sépare les deux notes indicielles mais l’IBD appartient à la classe de qualité bonne et l’IPS à la classe très bonne.

Le peuplement est dominé par des formes N-autotrophes tolérantes, �-mésosaprobes et eutrophes, à l’instar de Cocconeis placentula var euglypta.


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ASCONIT Consultants

Novembre 2006

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06181945


Nombre de


27 3,81 16,5 17,5

Cocconeis placentula var euglypta (15%)

Achnanthidium atomoides (15%)

A. pyrenaicum (11%)

A. minutissimum (10%)



Seulement 1 taxon de plus a été trouvé à partir de ce comptage. Les indices diatomiques sont inchangés.

Le Lamalou à Rouet

06182045


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Novembre 2006

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ne sont pas en accord dans ce relevé. On trouve aussi Encyonopsis minuta (ECMP), qui n’est pas encore prise en compte dans le calcul des indices. Nous ne disposons pas non plus de données écologiques sur ce taxon d’après les compilations de Van Dam et al (1994) ou d’Hofmann (1994). On retrouve ensuite Achnanthidium minutissimum (ADMI), témoignant de la bonne oxygénation du milieu.

A cause de la différence de profils du taxon dominant, l’IBD est plus pessimiste que l’IPS et juge la qualité bonne plutôt que très bonne.

Le peuplement est dominé par des taxons N-autotrophes sensibles, oligosaprobes et mésotrophes.

Le Lamalou à Rouet

06182045


Nombre de


28 2,81 15,6 19,3

Denticula tenuis (36%)


Encyonopsis minuta (21%)


oligosaprobe mésotrophe

Le comptage stratifié permet de recenser 5 taxons de plus. Les indices diatomiques restent inchangés.


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06182062


Nombre de

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Les indices diatomiques sont en léger désaccord au niveau de cette station : l’IBD estime la qualité bonne tandis que l’IPS la juge très bonne. Cette différence est liée à plusieurs facteurs, dont la différence d’appréciation de D. tenuis et la non prise en compte de C. parva dans le calcul de l’IBD.

Le peuplement est de type N-autotrophe tolérant, �-mésosaprobe et indifférent au niveau trophique.


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06182062


Nombre de


34 3,87 16,2 17,4

Nitzschia fonticola (21%)


Fragilaria rumpens (13%)



On obtient 9 taxons de plus avec le comptage stratifié. Les indices diatomiques sont peu modifiés.


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5. RESULTATS DES INDICES

5.1. INDICES DIATOMIQUES (IPS et IBD)

Les notes obtenues avec l'Indice de Polluosensibilité Spécifique (IPS) et l’Indice Biologique Diatomées (IBD) sont représentées par les figures 2 et 3. Les valeurs sont également indiquées dans le tableau 2.

Figure 2 : Evolution de l’IPS – Stations DCE Languedoc-Roussillon

Les figures 2 et 3 montrent que les notes de l’IPS et de l’IBD, obtenues à partir du comptage « IBD » ou du comptage stratifié, sont du même ordre de grandeur. Au maximum, la différence entre les deux valeurs est de 0,4 point pour l’IPS (Dourbie à Dourbies) et également de 0,4 point pour l’IBD (Allier à Chasseradès) (cf. annexe 3).

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Avec l’IPS (figure 2), la grande majorité des stations étudiées en 2006 sont estimées de très bonne qualité biologique (22 sur 25 sites).

Trois sites sont jugés de bonne qualité :

o Le Galeizon à Cendras ; nous avons vu que le taxon dominant ne participait pas au calcul de l’indice, de ce fait la note obtenue est quelque peu faussée,

o Le Tech à La Preste, qui, malgré la bonne note (16,8/20) possède un peuplement hétéroclite, avec notamment la présence de quelques taxons saprobes,

o L’Orbieu à Vignevieille, dont le peuplement présente quelques taxons eutrophes.

Aucune station n’appartient en revanche à la classe moyenne.

Figure 3 : Evolution de l’IBD – Stations DCE Languedoc-Roussillon

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Avec l’IBD, 19 stations sur 25 sont estimées de qualité très bonne (figures 5 et 6).

5 sites sont estimés de bonne qualité biologique :

o Le Séguissous au Bouquet ; rappelons que seulement un effectif de 207 participe au calcul de l’IBD, ce qui explique la différence de notation avec l’IPS qui estime la qualité très bonne,

o L’Orbieu à Vignevieille ; l’IBD et l’IPS sont bien en phase au niveau de cette station,

o La Vis à Saint Maurice Navacelles ; l’IPS estime la qualité très bonne. Cette différence est liée à la non prise en compte d’un taxon dominant Achnanthidium atomoides dans le calcul de l’IBD. Notons toutefois que seulement 1 point sépare les deux indices,

o Le Lamalou à Rouet ; l’IPS indique la qualité très bonne et la différence de notation avec l’IBD tient au profil de distribution du taxon dominant (Denticula tenuis) orienté vers les classes moyennes, alors que l’IPS le juge très sensible,

o La Buèges à Pégairolles de Buèges ; ici également l’IBD sous estime légèrement la qualité comparativement à l’IPS à cause du profil de D. tenuis, et de la non prise en compte d’autres taxons comme Cymbella parva.

La plus grande différence avec l’IPS réside dans le fait, qu’avec l’IBD, une station est de qualité moyenne ; il s’agit des Mouges à Palairac, avec un IBD de 12,1/20 contre 17,5/20 pour l’IPS. Comme nous l’avons vu dans l’analyse par station, cette différence de notation tient à la différence d’appréciation de la sensibilité du taxon dominant, Gomphonema olivaceum entre les deux indices ainsi qu’aux non prises en compte de taxons sensibles comme Psammothidium grischunum.


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Bilan comparatif de 2005 à 2006

L’évolution spatio-temporelle des indices diatomiques IPS et IBD a été synthétisée sur les figures 7 à 10. Notons que les notes indicielles de 2005 ont été recalculées avec la base 2006 d’OMNIDIA.

La figure 4 représente l’évolution de l’IPS au niveau des 25 stations étudiées en 2005 et 2006. En 2005, nous n’avons pas de valeurs pour le Séguissous.

Figure 4 : Evolution spatio-temporelle de l’IPS (bilan 2005/2006) - Stations DCE Languedoc-Roussillon

Les résultats montrent que, dans la plupart des cas, les notes de l’IPS sont stables sur les deux années d’études et appartiennent, en grande partie, à la classe de très bonne qualité biologique. Quelques points appartiennent à la classe de bonne qualité mais aucun, à la classe moyenne, ni bien sur, à la classe médiocre ou mauvaise. Ces résultats sont plutôt satisfaisants et montrent la bonne robustesse des stations DCE de cette région.

Il est possible de noter une évolution positive de la note entre 2005 et 2006 au niveau (nous considérons qu’il y a variation quand la note change de classe de qualité ; toutefois cette considération est arbitraire, un test statistique serait nécessaire pour connaître la véritable signification de ces variations) :

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o Des Plèches à Nasbinals, avec, en 2006 une note très bonne contre bonne en 2005. La station se situe dans une zone d’élevage et il est possible qu’on ait un impact variable des troupeaux sur le cours d’eau, en fonction de leur localisation de pâture. On peut aussi penser que le débit a une influence ; d’après les données communiquées par la DIREN, l’étiage était plus sévère en 2005 par rapport à 2006, avec des débits plus faibles en 2005.

o De la Buèges à Pégairolles de Buèges ; en 2006, la qualité est estimée très bonne contre bonne en 2005. On a soupçonné en 2005, l’impact de campeurs mais la variation de la qualité est peu explicable avec ces éléments. Les débits moyens, globalement plus élevés en juillet 2006 qu’en août 2005 peuvent constituer une hypothèse.

A l’opposé, la qualité biologique est sensiblement diminuée au niveau :

o Du Tech à la Preste ; la qualité n’est plus que bonne en 2006 contre très bonne en 2005 ; le peuplement montre, cette année, quelque signe d’un apport organique, comme cela s’était produit en 2004 (station alors prospectée dans le cadre du RNB).

o De l’Orbieu à Vignevieille avec un indice bon en 2006 contre très bon en 2005. cette année, le peuplement traduit un apport minéral, avec quelques taxons eutrophes présents.


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L’évolution de l’IBD est représentée par la figure 5.

Figure 5 : Evolution spatio-temporelle de l’IBD (bilan 2005/2006) - Stations DCE Languedoc-Roussillon

Avec l’IBD aussi, la majorité des points se situe dans la classe de très bonne qualité biologique. Quelques points se trouvent dans la classe de bonne qualité biologique et un seul dans la classe moyenne, ce qui constitue une différence majeure avec l’IPS.

Entre les deux années, la qualité est globalement stable sauf au niveau de quelques stations qui présentent une légère dégradation en 2006. Ainsi, on peut noter une baisse sensible de la note IBD au niveau :

o Des Mouges à Palairac avec, en 2006, une qualité estimée moyenne contre bonne en 2005 ; compte tenu du peuplement (cf. § 4), il est difficile de savoir si ces résultats ont un sens,

o De l’Orbieu à Vignevieille qui était de très bonne qualité en 2005 et n’est plus que de qualité bonne en 2006 ; c’est la seul station pour laquelle le résultat est semblable entre l’IPS et l’IBD, ce qui semble traduire un impact. La présence de

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jardins sur le bord du cours d’eau peut éventuellement expliquer cette dégradation (lessivage de phytosanitaires ?).

o La Vis à Saint Maurice de Navacelles, bonne en 2006 contre très bonne en 2005. L’IBD ne prend pas en compte un des taxons dominant en 2006, ce qui pose un problème d’appréciation ici. On peut noter toutefois que les concentrations en nitrates sont sensiblement plus élevées en 2006 par rapport à 2005 (données DIREN).

5.2. DIVERSITE ET RICHESSE TAXONOMIQUE

Les figures 6 à 7 représentent les valeurs de richesse taxonomique (nombre de taxons) et de l’indice de diversité (Shannon & Weaver). Les valeurs de ces paramètres sont consignées en annexe 3.

La diversité d’une biocénose peut s’exprimer simplement par le nombre d’espèces présentes. Mais ce nombre n’est pas souvent connu avec exactitude. Plusieurs indices de diversité ont été proposés, permettant de comparer entre eux des peuplements. Nous avons calculé l’indice de Shannon et Weaver (1949). Un indice de diversité élevé correspond généralement à des conditions de milieu favorables (stabilité) permettant l’installation de nombreuses espèces mais n’est pas toujours synonyme de bonne qualité de milieu.


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La figure 6 représente la richesse taxonomique de l’échantillon « IBD » (N) ainsi que le nombre de taxons trouvés en plus, à partir du comptage stratifié (N en plus).

Figure 6 : Richesse taxonomique de l’échantillon « IBD » (N) et nombre de taxons en plus, à partir du comptage stratifié (N en plus) – Station DCE Languedoc-Roussillon

Globalement, le nombre de taxons inventoriés dans les stations DCE est assez faible (21 en moyenne), ce qui est souvent le cas dans les milieux très propres, du fait de la limitation en éléments nutritifs, principalement.

Les richesses taxonomiques les plus élevées sont obtenues à la station des Plèches et celle de l’Agly avec une quarantaine de taxons présents dans le comptage « IBD ». Les Plèches est un cours d’eau très éclairé et légèrement minéralisé (97 µS) et l’Agly possède une forte conductivité (358 µS), ce qui permet le développement d’un plus grand nombre de taxons.

A l’opposé les valeurs les plus faibles sont obtenues dans le Tarn, la Mimente ou encore le Rieutort avec moins de 10 taxons recensés dans le comptage « IBD ». C’est ici la très faible minéralisation de l’eau (Tarn) et/ou l’ombrage important du cours d’eau (Mimente, Rieutort) qui est limitante et sélectionne certainement une microflore adaptée.

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D’une manière générale, le comptage stratifié apporte peu de taxons supplémentaires rares comparativement à la prospection d’un échantillon prélevé « hors norme », comme cela a été fait en 2005.

En moyenne, sur l’ensemble des relevés, 5 taxons en plus sont trouvés. Cela représente toutefois 25% de taxons en plus.

En revanche, ce nombre est beaucoup plus important et atteint même plus de 100% de la richesse taxonomique quand un taxon est nettement dominant comme dans la Mimente à Cassagnas ; on trouve alors 13 taxons en plus avec le comptage stratifié alors que seulement 9 taxons ont été inventoriés avec le comptage « IBD ». Il en est de même pour le Rieutort à La Bastide Esparbaïrenque avec 7 taxons obtenus avec le comptage « IBD » et 14 avec le comptage stratifié.

La figure 7 représente les valeurs de l’indice de diversités, issues des deux comptages.

Figure 7 : Evolution de la richesse taxonomique et de l’indice de diversité - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

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Les peuplements les plus diversifiés, sont observés dans les cours d’eaux suivants : les Plèches, le Lamalou, le Tech, l’Agly, les Mouges, l’Orbiel, la Vis. L’indice de diversité est alors proche ou supérieur à 4. Ces stations sont caractérisées, comme nous l’avons vu, par des conductivités relativement élevées ou par un peuplement mixte, c'est-à-dire composé de taxons d’écologie différente (Tech, Orbiel, Vis).

Les plus faibles indices de diversité sont proches ou inférieurs à 1,5 et sont mesurés dans la Jonte à Gatuzières, la Mimente à Cassagnas, le Rieutort à La Bastide Esparbaïrenque. Ces trois stations correspondent à des milieux très fermés et c’est sans doute le facteur lumière qui est limitant, associé à des minéralisations assez faibles.

Le comptage stratifié ne permet par toujours d’augmenter la valeur de l’indice de diversité. Elle est par exemple augmentée dans l’Allier, l’Ilouvre ou encore la Buèges mais reste inchangée voire amoindrie dans la Jonte, l’Aude ou la Vis.

6. CARACTERISTIQUES ECOLOGIQUES DOMINANTES

Elles sont extraites automatiquement des compilations de la littérature scientifique à l'aide du logiciel OMNIDIA v4.2. Les classifications utilisées sont celles de Van Dam et al (1994) (voir matériels et méthodes). Les résultats sont représentés par des histogrammes qui cumulent, pour chaque relevé, les abondances relatives des taxons caractéristiques de chaque classe (tableaux en annexe 4). Ces classifications sont parfois à considérer avec prudence car toutes les diatomées ne sont pas prises en considération, en particulier les formes tropicales nouvellement décrites.

NB. Ces classifications ont été amendées et modifiées en fonction des avancées de la littérature scientifique.


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6.1. AFFINITE A LA MATIERE ORGANIQUE

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Figure 8 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité pour les matières organiques – Stations DCE Languedoc-Roussillon.

Logiquement, dans ces stations qui ont été estimées de très bonne ou de bonne qualité biologique par les indices diatomiques, ce sont les taxons oligosaprobes voire �-mésosaprobes, c'est-à-dire sensibles à la pollution organique, qui dominent. A titre d’exemple, dans la Jonte à Gatuzières, le Tarnon à Bassurels ou encore la Mimente à Cassagnas, le peuplement est composé à 90% par des formes oligosaprobes.

Toutefois, quelques sites présentent un pourcentage non négligeable de diatomées plus résistantes, �-méso-polysaprobes, qui témoignent d’un apport organique dans le milieu ; c’est la cas du Tech à la Preste, colonisé à plus de 10% par des taxons plus ou moins saprobes, comme Mayamaea atomus var permitis, Naviculadicta seminulum ou encore Eolimna minima. Il est possible que ce cours d’eau soit soumis à un impact de déjections animales, comme nous l’avions supposé en 2004, alors qu’une bactériologie positive avait été décelée et venait conforter l’analyse des diatomées. Les Mouges à Palairac et la Vis à Saint Maurice de Navacelles présentent également quelques signes d’apport organique. Le Ruisseau des Mouges était en phase d’assèchement (concentration des éléments dissous et sénescence des macrophytes) En ce qui concerne la Vis, nous n’avons pas d’explication pour la présence de tels taxons (Planothidium frequentissimum par exemple) si ce n’est un impact de campeurs dans cette zone touristique.

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Les taxons N-autotrophes sensibles utilisent seulement la matière minérale comme source de nutriment et sont sensibles (régression immédiate) à la présence de faibles quantités d’azote organique. Les taxons N-autotrophes tolérants supportent la présence de fortes quantités d’azote organique (pas de régression importante si la présence d’azote organique n’est pas permanente). Les taxons N-hétérotrophes facultatifs utilisent la matière minérale comme source de nutriment pour se développer mais ont besoin aussi de l’azote organique de façon intermittente. Les taxons N-hétérotrophes obligatoires se développent en présence de fortes quantités d’azote organique de façon permanente.

Les résultats sont représentés sur la figure 9.

Figure 9 : Distribution des diatomées selon leur capacité d’hétérotrophie - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

Les peuplements des stations étudiées sont logiquement dominés par des diatomées autotrophes, les apports organiques étant nuls ou faibles dans la plupart des cas, comme nous l’avons vu précédemment.

On trouve néanmoins une proportion non négligeable de taxons hétérotrophes, au niveau du Tech à La Preste, et en moindre importance toutefois, du ruisseau des Mouges à Palairac ; Ils sont le signe d’une contamination organique modérée, suspectée avec le système des saprobies. Celle-ci reste faible tout de même, étant donnée la dominance des formes autotrophes dans ces relevés. Signalons que la Vis, n’apparaît pas ici, ce qui montre que les composés organiques, si ils sont présents, restent peu abondants.

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6.2. AFFINITE VIS-A-VIS DE L’OXYGENE DISSOUS

La figure 10 représente l’affinité des diatomées vis-à-vis des conditions d’oxygénation du milieu.

Figure 10 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité vis-à-vis de l’oxygène dissous - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

L’analyse des peuplements des stations de référence, indique que l’oxygénation est élevée dans la majorité des sites. En effet, les diatomées polyoxybiontes et oxybiontes dominent les peuplements de nombreuses stations comme la Dourbie à Dourbie, la Jonte à Gatuzières, le Tarn à Mas Camargues, le Rieutort à Vialas…

Dans quelques cas, on note la présence de taxons qui tolèrent une oxygénation modérée, comme dans l’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux, l’Orbieu à Vignevieille ou encore la Vis à Saint Maurice de Navacelles. Dans ces trois cas, cette proportion plus forte de ces diatomées est liée à la présence dans les peuplements de Cocconeis placentula var. euglypta, qui est une forme assez tolérante et généralement bien répandue dans les cours d’eau de plaine.

Mais, c’est encore au niveau du ruisseau des Mouges que l’on décèle un problème, avec 10% de taxons qui tolèrent une oxygénation basse (30% de saturation). Même si, au moment du prélèvement, l’oxygénation était bonne (96% de saturation), la composition du peuplement tend à traduire un épisode de désoxygénation passagère du milieu, ce qui va dans le sens de l’hypothèse précédemment émise.

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6.3. AFFINITE VIS-A-VIS DU DEGRE DE TROPHIE

L’affinité des diatomées vis-à-vis des nutriments est représentée par la figure 11.

Figure 11 : Distribution des diatomées en fonction du degré de trophie - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

Les résultats obtenus avec cette classification montrent souvent des peuplements assez hétérogènes, avec un mélange de diatomées dont l’affinité aux matières minérales est plus ou moins prononcée. Par exemple, dans les Plèches à Nasbinals, le peuplement est dominé par des diatomées indifférentes, mais qui coexistent dans le relevé, avec des taxons, oligotrophes à eutrophes. De la même façon, dans le Luech à Génolhac, on rencontre des formes oligo-mésotrophes (Fragilaria gracilis) et également eutrophes (F. bidens est qualifiée d’eutrophe par Van Dam et al, 1994). Ces résultats tendent à traduire la présence d’éléments nutritifs, même de manière ponctuelle dans ces milieux. Cet apport peut d’ailleurs être lié à de la dégradation végétale tout simplement.

La Jonte à Gatuzières, le Tarnon à Bassurels, la Mimente à Cassagnas, l’Orbiel aux Martys ou encore le Rieutort à La Bastide Esparbaïrenque se distinguent en revanche par des peuplements clairement oligotrophes à oligo-mésotrophes, ce qui montre de très faible degré de trophie de ces stations.

A l’opposé le peuplement des Mouges à Palairac, composé à plus de 70% par des formes eutrophes (Gomphonema olivaceum, Amphora pediculus) montre un enrichissement minéral certain. Il en est de même pour l’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux, l’Orbieu à Vignevieille, la Vis à Saint Maurice de Navacelles qui présentent une part de formes eutrophes non négligeable.

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6.4. AFFINITE VIS-A-VIS DE LA SALINITE

La figure 12 représente la distribution des diatomées en fonction de leur affinité vis-à-vis de la salinité.

Figure 12 : Distribution des diatomées en fonction de la salinité - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

Les peuplements sont majoritairement oligohalobes, c'est-à-dire d’eaux douces moyennement minéralisées, ce qui est logique dans ce type de milieu.

Les diatomées halophobes se développent également et plus abondamment dans l’Orbiel aux Martys et dans le Lamalou à Rouet. Les taxons représentatifs sont respectivement Psammothidium subatomoides et Denticula tenuis.

De même, les diatomées halophiles se développent de manière très ponctuelle comme dans le Galbe à Espousouille ou l’Orbieu à Vignevieille.

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6.5. AFFINITE VIS-A-VIS DU PH

La figure 13 montre la distribution des diatomées selon leur affinité au pH.

Figure 13 : Distribution des diatomées en fonction de leur affinité vis-à-vis du pH - Stations DCE Languedoc-Roussillon.

Les peuplements des stations prospectées sont constitués pour la plupart, d’un mélange de taxons neutrophiles (optimum de développement pour un pH voisin de 7) et alcaliphiles (optimum pH > 7). Dans certains cas, comme dans l’Allier à Chasseradès, le Tarn à Mas Camargues ou le Rieutort à Vialas, les diatomées neutrophiles dominent nettement ; ceci indique un pH moyen plus faible pour ces sites (par rapport à ceux à dominante alcaliphile), les diatomées reflétant les conditions globales du milieu. Les diatomées acidophiles se développent d’ailleurs préférentiellement dans ces stations ; elles représentent 10% du peuplement ou plus, dans l’Allier à Chasseradès, la Dourbie à Dourbies, le Tarn à Mas Camargues, le Rieutort à Vialas et surtout dans l’Orbiel aux Martys. Parmi ces taxons, citons ceux caractéristiques de cette dernière station comme Psammothidium subatomoides, P. oblongellum, Eunotia incisa, E. minor. Ces résultats traduisent bien l’influence du pH sur la communauté diatomique, les pH mesurés « in situ » au niveau de ces stations étaient en effet assez bas : 5,9 pour l’Allier, 6,6 pour le Tarn, 6,9 pour la Dourbie. En revanche, pour l’Orbiel, le pH mesuré « in situ » ne correspond pas à ce peuplement (7,5), ce qui reste inexplicable car l’an dernier le pH mesuré était légèrement acide. Le pH mètre fonctionnant bien, ce ne peut pas être un artéfact dans la mesure.

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Les diatomées alcalibiontes sont peu représentées si ce n’est dans le ruisseau des Mouges à Palairac où elles constituent 30% du peuplement. Ceci est récurent car nous avions recensé environ 25% de taxons alcalibiontes en 2005. Cette proportion élevée est liée à l’abondance de Gomphonema olivaceum, taxon alcalibionte dans ce relevé (Le pH mesuré est de 7,5 mais, comme nous l’avons dit précédemment ces valeurs ponctuelles ne traduisent pas l’ensemble des conditions du milieu.

6.6. TAXONS EN REGRESSION

Nous avons utilisé la classification des espèces en voie de disparition de Lange-Bertalot (1996). Ces résultats sont donnés seulement à titre indicatif, (la liste ayant été établie pour l'Allemagne) pour permettre de mettre en évidence la présence de taxons peu communs au niveau des secteurs apicaux encore peu connus, dont la prospection en matière de diatomées, a débutée seulement en 2005. Les résultats sont représentés par la figure 14.

Figure 14 : Distribution des diatomées rares ou en voie de régression (Rote List) - Station DCE Languedoc-Roussillon.

Les résultats obtenus avec cette classification, montrent la présence de diatomées peu communes dans les relevés, certaines étant menacée ou en voie de disparition, d’après les auteurs.

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Par exemple, dans l’Allier à Chasseradès, on trouve des taxons « fortement menacés » représentées en rouge, comme Eunotia intermedia, espèce bien présente dans ce relevé.

Dans la Dourbie, certaines diatomées sont répertoriées comme présentant un risque de disparition, tout comme dans le Rieutort à Vialas ; Il s’agit principalement de Navicula notha, bien représentée dans ces deux échantillons. Le Séguissous au Bouquet présente aussi un peuplement peu commun, avec des formes en régression (Gomphonema dichotomum), en danger (Sellaphora stroemii, Eucocconeis flexella) ou fortement menacées ou présentant un risque (Eunotia arcus, Delicata delicatula). Citons également, dans l’Orbiel aux Martys, Psammothidium oblongellum, P. subatomoides, en régression, Gomphonema parvulius, Neidium alpinum, en danger…

Enfin, comme en 2005, nous avons pu identifier un peuplement atypique dans le Galeizon comparativement aux autres stations avec des taxons à affinités tropicales, Gomphonema cf. entolejum et Cymbella tropica. Ces taxons ne sont bien sur pas répertoriés par les auteurs cités ici.


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7. RELATION ENTRE LES INVENTAIRES ET LES ECOREGIONS

Des unités homogènes ont été définies visant à regrouper des cours d’eau par types. Ainsi 22 hydroécorégions ont été définies en France. Les stations se situent dans les écorégions suivantes : Cévennes (bleu clair), Grands Causses (vert clair), Plaine Méditerranéenne (orange), Pyrénées Orientales (jaune), Corbières (violet), Haute Loire Cévenole (rouge), Garrigues Subcévenoles rose), Montagne Noire (vert foncé), Hautes Terres Volcaniques (bleu foncé), Causses Cévenols (vert-bleu), Cévennes/Grands Causses (vert brillant).

Dans le but de mettre en relation les inventaires de diatomées avec les hydroécorégions citées, une AFC a été réalisée. La distribution des points et des individus sur les plans factoriels est représentée par les figures suivantes (figures 15 et 16).

La figure 15 montre un regroupement net des stations de « Garrigues Subcévenoles » ainsi que celles de « Haute Loire Cévenole ». On peut remarquer que, malgré le fait que le Séguissous ait été prélevé en novembre, il se rapproche bien du groupe des autres stations de l’hydroécorégion «Garrigues Subcévenoles » prélevées en août, ce qui indique l’apparenté des peuplements.

Pour les autres stations, on ne note pas de discrimination particulière en fonction des hydroécorégions. Toutefois, celles des Pyrénées Orientales sont bien groupées. Les stations de la Montagne Noire font exception, surtout à cause de l’Orbiel, complètement excentré des autres sites « Montagne Noire ». On peut noter également que les stations des Cévennes ne sont pas ensemble mais 2 par 2 : la Dourbie avec le Luech et le Tarnon avec la Mimente.

Les stations fortement contribuantes à la formation de l’axe 1 sont : l’Orbiel, le Tarn et l’Allier, côté négatif et la Mimente et la Jonte, côté positif.

Pour les individus (taxons), les plus contribuants à la formation de l’axe 1 sont : Achnanthidium subatomus (ADSU), Cocconeis placentula var. lineata (CPLI), coté positif et Fragilaria capucina (FCAP), F. gracilis (FGRA), Psammothidium subatomoides (PSAT), P. oblongellum (POBG), côté négatif (figure 30).

Les stations dont la contribution est la plus forte à l’axe 2 sont : l’Orbiel du coté négatif de l’axe et le Séguissous du coté positif. Les taxons les plus contribuants à l’axe 2, sont, du côté positif, Gomphonema dichotomum (GDIC), Encyonopsis cesatii (ECES). Du côté négatif, les taxons qui contribuent le plus à la formation de l’axe sont Psammothidium subatomoides (PSAT), P. oblongellum (POBG), Eunotia incisa (EINC), Gomphonema parvulius (GPVL), E. minor (EMIN).

Les axes 1 et 2 semblent traduire une action combinée du pH et de la minéralisation.

Les stations les plus acides se situent du côté négatif de l’axe 1 et les plus basiques du côté positif. Les taxons contribuants cités précédemment sont alcaliphiles, côté positif et neutrophiles à acidophiles, côté négatif. L’axe 2 oppose les stations faiblement minéralisées aux sites fortement minéralisés. Les stations pour lesquelles on a mesuré une faible conductivité se situent du cote négatif de l’axe (Orbiel : 35µS ; Allier : 27 µS …) et les stations à fortes conductivités du coté positif (Séguissous : 545 µS ; Lamalou : 521 µS…). Ces axes traduirent la nature du substrat géologique traversé par les cours d’eau, les stations calcaires se situant en haut du graphe.

Il est intéressant de noter que A. rivulare, pour qui nous n’avons que très peu d’information sur l’écologie, se situe avec les stations bien minéralisées à pH plutôt neutre.


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Figure 15 : Résultats de l’analyses factorielle – Station DCE Languedoc-Roussillon

Figure 16 : Résultats de l’analyses factorielle – Station DCE Languedoc-Roussillon

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I185I186

I188

I190

PDAO

I192

PHEL

I194I196I198

I200

I201

I202

I203

I205

I206

I207

I209

I210

I211

I212

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Haute-Loire Cévenole

Corbières

Pyrénées orientales

Gds Causses

Garrigues sub cévenoles

Cévennes

Montagne Noire

Hautes terres volvaniques

Plaine méditérannée

Causse Cévenols

Cévennes / grand Causses

Haute-Loire Cévenole

Corbières

Pyrénées orientales

Gds Causses

Garrigues sub cévenoles

Cévennes

Montagne Noire

Hautes terres volvaniques

Plaine méditérannée

Causse Cévenols

Cévennes / grand Causses

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8. CONCLUSION

L'étude des diatomées des 25 stations de référence de Languedoc-Roussillon et l'application des indices diatomiques, notamment l'Indice de Polluosensibilité Spécifique (IPS) et l'Indice Biologique Diatomées (IBD), ont permis d'appréhender la qualité biologique de ces stations, ainsi que la réalisation d’un inventaire plus exhaustif, à l’aide de la technique du comptage stratifié.

Les résultats ont montré que tous les cours d’eau prospectés sont de bonne à très bonne qualité biologique avec l’IPS et qu’ils ne subissent donc pas de perturbations anthropiques majeures.

Avec l’IPS, 22 stations sur 25 sont estimées de très bonne qualité biologique et 3, de bonne qualité biologique : la Galeizon à Cendras, le Tech à La Preste et l’Orbieu à Vignevieille.

Avec l’IBD, 19 sites sur 25 sont jugés de très bonne qualité biologique. 5 sont de bonne qualité : le Séguissous à Bouquet, l’Orbieu à Vignevieille, la Vis à Saint Maurice de Navacelles, le Lamalou à Rouet, la Buèges à Pégairolles de Buèges. Une station est estimée de qualité seulement moyenne : les Mouges à Palairac. Nous avons vu que ces différences étaient principalement dues à une non prise en compte de taxons dominants dans l’IBD et / ou par des profils écologiques divergents, entre l’IBD et la valeur de sensibilité de l’IPS.

L’analyse plus approfondie du peuplement diatomique nous permet de soupçonner un apport organique au niveau de la station du Tech à La Preste, avec la persistance de taxons saprobes, impact sans doute lié à la présence d’animaux ou de campeurs.

La composition du peuplement permet également d’appréhender un niveau trophique assez élevé dans le ruisseau des Mouges, qui, en phase d’assèchement, subit certainement une concentration en éléments dissous à un moment donné. Un enrichissement minéral modéré peut être appréhendé dans l’Orbieu à Vignevieille, attribué très certainement à des apports provenant de jardins (engrais, produis phytosanitaires… ?), dans l’Ilouvre à Babeaux-Bouldoux (pollution en juillet ?), ainsi que dans la Vis à Saint Maurice de Navacelles (touristes ?).

L’application du comptage stratifié a permis, en moyenne, de recenser 30% de taxons en plus, comparativement au comptage « IBD ». Ce comptage est particulièrement intéressant dans les cours d’eau où un seul taxon domine nettement le peuplement. En revanche, moins de diatomées très rares sont trouvées, par rapport à l’examen de l’échantillon réalisé « hors norme », effectué en 2005.

Depuis 2005, nous avons avancé dans la détermination de certains taxons, certains échantillons ayant fait l’objet d’un traitement en microscopie électronique au Luxembourg (Centre de Recherche G. Lippmann) ; c’est le cas pour Achnanthidium rivulare, Encyonopsis subminuta, Gomphonema af entolejum. Pour ce dernier taxon, la similitude avec celui décrit à la Guadeloupe a été confirmée.

D’autres formes nécessitent encore un examen plus approfondi, notamment le Cocconeis identifié dans le Baumale.

Comme en 2005, le peuplement du Galeizon à Cendras est apparu très particulier avec la présence de diatomées « tropicales » et non répertoriées encore à ce jour, en dehors de cette station.


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9. ANNEXES

ANNEXE 1 : Fiches stations

ANNEXE 2 : Inventaires des diatomées et liste floristique (fichier au format OMNIDIA « .PRN »)

ANNEXE 3 : Tableaux des indices

ANNEXE 4 : Bancaristation des données

ANNEXE 5 : Caractéristiques auto-écologiques

ANNEXE 6 : Planches photographiques


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ANNEXE 1 Fiches stations


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ANNEXE 2 Inventaires diatomiques


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ANNEXE 3 Tableau des indices


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ANNEXE 4 Bancarisation des données


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ANNEXE 5 Caractéristiques auto-écologiques


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ANNEXE 6 Planche de diatomées

sommaire - occitanie.developpement-durable.gouv.fr€¦ · implique l'échantillonnage...

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