rapport annuel 2006-2007 - uqar

Réseau Aquaculture Québec — Rapport annuel 2006-2007

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Rapport annuel 2006Rapport annuel 2006Rapport annuel 2006Rapport annuel 2006----2007200720072007 Réseau Aquaculture QuébecRéseau Aquaculture QuébecRéseau Aquaculture QuébecRéseau Aquaculture Québec

L’année 2006-2007 marque un tournant important dans l’histoire du Réseau Aquaculture Québec (RAQ). Ce réseau démarré en 2001 sous l’égide de Valorisa-tion Recherche Québec a fait du chemin. Tout d’abord concentré sur les problèmes rencontrés en aquaculture d’eau douce, il a élargi son cadre d’activité à la mari-culture et a obtenu sa reconnaissance en tant que Re-groupement Stratégique du Fonds québécois de la re-cherche sur la nature et les technologies. En 2006-2007, le RAQ a bénéficié du support financier de deux organismes: le Ministère du Développement économi-que, de l’Innovation et de l’Exportation du Québec et d’AquaNet (Réseau des centres d’excellence du Cana-da).

Le RAQ est un réseau qui s’est donné comme mis-sion de contribuer au développement de l’aquaculture québécoise en soutenant la recherche et en devenant un acteur de premier plan dans la formation de personnel qualifié. Le RAQ se veut également un outil majeur de la mise en réseau des compétences québécoises, entend favoriser au maximum les échanges nationaux et inter-nationaux et participer activement à la reconnaissance de la recherche québécoise dans le secteur aquicole.

C’est avec beaucoup de fierté que je vous invite à prendre connaissance des activités du RAQ pour l’an-née 2006-2007.

Bonne lecture!

Céline Audet Directrice scientifique du RAQ

Équipe de direction 2006Équipe de direction 2006Équipe de direction 2006Équipe de direction 2006----2007200720072007 Céline Audet, UQAR/ISMER Louis Bernatchez, U. Laval Réjean Tremblay, UQAR/ISMER Richard Villemur , INRS-IAF Joël de la Noüe, U. Laval Florent Chazarenc, École Polytechnique, chercheur post-doctoral Andréane Bastien, UQAR/ISMER, étudiante 3ième cycle Dominique Lavallée, UQAR/ISMER, coordonnatrice

Comité ConseilComité ConseilComité ConseilComité Conseil Chantal Cahu, IFREMER Thierry Chopin , Université du Nouveau-Brunswick Pierre Dubé, Secrétaire exécutif, ociété de recherche et développement en aquaculture continentale Dominique Gascon, Directeur, Direction des sciences halieutiques et de l’aquaculture, Pêches et Océans Canada Sylvain Lafrance, Directeur, Société de développement de l’industrie maricole Ginette Levesque, Directrice, Division de l’innovation et des technologies, Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec

Table des matièresTable des matièresTable des matièresTable des matières Membres ………………………..………….... p. 2 Boursiers post-doctoraux …….…..………….. p. 4 Bourses pour étudiants gradués .…..……….... p. 5 Stages et congrès …………………………….. p. 12 Projets réalisés en partenariat avec le RAQ … p. 25 Échanges chercheurs ……………………….... p. 30 Conférences ………………………………..… p. 32 Activités de transfert …………………..……. p. 33 Publications 2006 ………………………….… p. 35 Rapports 2006 …………………………..…… p. 35 Mémoires et thèses 2006 …………………….. p. 36

Notre site WEBNotre site WEBNotre site WEBNotre site WEB

http://raq.uqar.qc.ca/

Pour nous joindrePour nous joindrePour nous joindrePour nous joindre

Dominique Lavallée, coordonnatrice [email protected]

(418) 723-1986, poste 1425


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Liste des chercheurs membresListe des chercheurs membresListe des chercheurs membresListe des chercheurs membres 2006200620062006----2007200720072007

Chercheurs universitairesChercheurs universitairesChercheurs universitairesChercheurs universitaires Aubin-Horth, Nadia. Université de Montréal Audet, Céline. UQAR-ISMER Belhumeur, Pierre. Université de Montréal Bernatchez, Louis. Université Laval Blier, Pierre. UQAR Comeau, Yves. École Polytechnique de Montréal Cyr, Daniel. INRS-IAF de la Noüe, Joël. Université Laval Dodson, Julian J. Université Laval Fussmann, Gregor. Université McGill Garant, Dany. Université de Sherbrooke Guderley, Helga. Université Laval Juteau, Pierre. INRS-IAF Koutitonsky, Vladimir. UQAR-ISMER Lambert, Rémy. Université Laval Létourneau, Lyne. Université Laval Tamigneaux, Éric. Cégep de la Gaspésie et des Îles Tremblay, Réjean. UQAR-ISMER Vandenberg, Grant. Université Laval Villemur, Richard. INRS-IAF

Chercheurs gouvernementauxChercheurs gouvernementauxChercheurs gouvernementauxChercheurs gouvernementaux Archambault, Philippe. Pêches et Océans Canada Fréchette, Marcel. Pêches et Océans Canada Lambert, Yvan. Pêches et Océans Canada McKindsey, Chris. Pêches et Océans Canada Myrand, Bruno. MAPAQ Sévigny, Jean-Marie. Pêches et Océans Canada

Chercheurs associés et sousChercheurs associés et sousChercheurs associés et sousChercheurs associés et sous----octroi octroi octroi octroi Kharoune, Lynda. École de Technologie Supérieure Kharoune, Mourad. École de Technologie Supérieure Le François, Nathalie. MAPAQ/UQAR Parent, Serge. Biodôme de Montréal Tita, Guglielmo. MAPAQ/UQAR

Chercheurs hors QuébecChercheurs hors QuébecChercheurs hors QuébecChercheurs hors Québec Blancheton, Jean Paul. IFREMER, France Cahu, Chantal. IFREMER, France Claireaux, Guy. Université de Montpellier, France Hutchings, Jeffrey. Université Dalhousie (N.-É.)

Olivier, Frédéric. Musée national d’Histoire naturelle, France Pernet, Fabrice. Université de Moncton (N.-B.) Plante, Sébastien. Université de Moncton (N.-B.) Samain, Jean-François. IFREMER, France Schrader, Kevin. Thad Cochran Research Center, USA Summerfelt, Steven. Conservation Fund Freshwater Institute, USA Thouzeau, Gérard. Institut Universitaire Européen de la Mer

Liste des membres étudiants et stagiaires Liste des membres étudiants et stagiaires Liste des membres étudiants et stagiaires Liste des membres étudiants et stagiaires postpostpostpost----doctoraux 2006doctoraux 2006doctoraux 2006doctoraux 2006----2007200720072007

Archer, Bruno (J. Wilson, N. Le François) M. Sc., UQAR Ardelean, Francisc-Manuel (Y. Comeau) M. Sc., École Polytechnique Bastien, Andréane (C. Audet, L. Bernatchez) Ph. D., UQAR-ISMER Bélanger, Michel (C. Audet, Y. Lambert) M. Sc., UQAR-ISMER Bélanger-Lamonde, Amélie (G. Vandenberg, J. Bai-ley), M. Sc., U. Laval Bernier, Andréane (R. Roy, N. Le François) M. Sc., UQAR Bigras, Sébastien (R. Villemur, S. Parent) Ph. D., INRS-IAF Bilodeau, Francis (M. Fréchette, J. Wilson) M. Sc., UQAR Bougas, Bérénice (L. Bernatchez, C. Audet) Ph. D., U. Laval¸ Callier, Myriam (C. McKindsey, P. Archambault) Ph. D., UQAR-ISMER Caron, Mathieu (C. Audet, L. Bernatchez) Ph. D., UQAR-ISMER Chazarenc, Florent (Y. Comeau) Chercheur post-doctoral, École Polytechnique Clynick, Brianna (P. Archambault) Chercheur post-doctoral, UQAR-ISMER Côté, Guillaume (L. Bernatchez) M. Sc., U. Laval Crespel, Amélie (C. Audet, L. Bernatchez) Ph. D., UQAR-ISMER Croisetière, Sébastien (P. Belhumeur, L. Bernatchez)Ph. D., U. de Montréal Dagenais, Guillaume (G. Vandenberg, D. Bureau) M. Sc., U. Laval D’Amours, Olivier (P. Archambault, L. Jonnson) M. Sc., U. Laval Daoud, Dounia (Y. Lambert, C. Audet, D. Chabot) Ph. D., UQAR-ISMER de Montgolfier, Benjamin (D. Cyr, C. Audet) Ph. D., INRS-IAF


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de Francesco, Matilde (G. Vandenberg, D. Bureau)Chercheur post-doctoral, U. Laval Diouf, Diadié (R. Tremblay, F. Pernet) M. Sc., UQAR-ISMER Doiron, Kim (K. Lemarchand, R. Tremblay) M. Sc., UQAR-ISMER Dupont-C., Bernard Antonin (N. Lefrançois, G. Van-denberg, R. Roy), M. Sc., U. Laval Dupont-Prinet, Aurélie (G. Claireaux, D. McKen-zie), Ph. D., U. de Montpellier Faille, Arianne (P. Belhumeur, G. Vandenberg) M. Sc., U. de Montréal Faye, Aliou (C. Audet, D. Cyr) M. Sc., UQAR-ISMER Fraboulet, Erwann (C. Audet, Y. Lambert) Ph. D., UQAR-ISMER Gagné, Renée (R. Tremblay, F. Pernet, J.F. Samain) M. Sc., UQAR-ISMER Gagnon, Daniel (Y. Comeau) M. Sc., École Polytechnique Gagnon, Vincent (J. Brisson, F. Chazarenc, Y. Co-meau), M. Sc., U. de Montréal Gallet, Nathalie (D. Cyr) Ph. D., INRS-IAF Gaudreau, Catherine (N. Le François, P. Blier, H. Tveiten), M. Sc., ISMER-UQAR Genard, Bertrand (F. Pernet, R. Tremblay) Ph. D., ISMER-UQAR Granier, Sarah (C. Audet, L. Bernatchez) M. Sc., ISMER-UQAR Guillemart, Céline (C. Rouleau, G. Tita, É. Pelletier)M. Sc., ISMER-UQAR Guyondet, Thomas (V. Koutitonsky, J. Grant) Ph. D., ISMER-UQAR Hedger, Richard (J.J. Dodson, C. Audet) Chercheur post-doctoral, U. Laval Houle, Stéphanie (G. Vandenberg) M. Sc., U. Laval Koko, Koffi D. Gabriel (J. de la Noüe, G. Debailleul)Ph. D., U. Laval Labelle, Marc-André (Y. Comeau) Ph. D., École Polytechnique Lachance, Andrée-Anne (R. Tremblay, R. Myrand)M. Sc., ISMER-UQAR Lachance-B., Myriam (M. Fréchette, J. Himmelman)M. Sc., U. Laval Lafleur, Colin (L. Kharoune, J.P. Revéret) M. Sc., U. de Montréal Lake, Jennifer (G. Vandenberg, C. Robert) M. Sc., U. Laval Lamarre, Simon (W. Driedzic, N. Le François, P. Blier), Ph. D., UQAR Lavoie, Geneviève (P. Juteau) M. Sc., INRS-IAF Lefrant, Annabelle (C. Audet, P. Belhumeur, J.-M. Sévigny), M. Sc., ISMER-UQAR

Mamadou M., Ndiaye (R. Lambert) M. Sc., U. Laval Mavárez, Jesús (L. Bernatchez, C. Audet) Chercheur post-doctoral, U. Laval Nassif, Richard (P. Belhumeur) M. Sc., U. de Montréal Normandeau, Éric (L. Bernatchez, J. Hutchings) M. Sc., U. Laval Pan, Yi (D. Cyr, C. Audet) Ph. D., INRS-IAF Parent, Geneviève (F. Pernet, R. Tremblay) M. Sc., ISMER-UQAR Pariseau, Julie (R. Tremblay, F. Berthe, J.M. Sévi-gny), Ph. D., ISMER-UQAR Perez-C., Hernan-Mauricio (H. Guderley) Ph. D., U. Laval Picard, Rachel (R. Tremblay, B. Myrand) M. Sc., ISMER-UQAR Pichaud, Nicolas (P. Blier, W. Ballard) Ph. D., UQAR Rayssac, Nathalie (R. Tremblay, J-M. Sévigny) Ph. D., ISMER-UQAR Roberge, Christian (L. Bernatchez, H. Guderley) Ph. D., U. Laval Robichaud, Lisa (C. McKindsey, P. Archambault) M. Sc., ISMER-UQAR Rossignol, Orlane (H. Guderley, J.J. Dodson) Ph. D., U. Laval Sanchez-C., Carlos Gerardo (Y. Comeau) M. Sc., École Polytechnique Seychelles, Laurent (C. Audet, R. Tremblay) Ph. D., ISMER-UQAR St-Laurent, Jonathan (C. Audet, J.J. Dodson) M. Sc., ISMER-UQAR Swan, Kim (J. Davidson, R. Tremblay, T. Landry) M. Sc., AVC-UPEI Thibault, Isabel (J.J. Dodson) M. Sc., U. Laval Toupoint, Nicolas (R. Tremblay, F. Pernet, B. My-rand, F. Olivier), Ph. D., ISMER-UQAR Tremblay, Isabelle (H. Guderley, J. Himmelman) Ph. D., U. Laval Trottet, Aurore (S. Roy, É. Tamigneaux) Ph. D., ISMER-UQAR Vaillancourt, Robert (C. Audet, J. Brown) Ph. D., ISMER-UQAR Vallet, Bertrand (Y. Comeau, S. Parent) Ph. D., École Polytechnique Werstink, Guillaume (G. Tita, J. Wilson) M. Sc., UQAR


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Florent Chazarenc (École Polytechnique de Montréal) Supervision : Yves Comeau (École Polytechnique de Montréal), Jacques Brisson (U. de Montréal) et Ri-chard Villemur (INRS-IAF) Traitement d’effluents piscicoles par voie extensive avec des marais artificiels plantés de roseaux et des pièges à phosphore à sco-ries à air libre

Ce stage post-doctoral s’est déroulé en grande partie dans le cadre d’un projet stratégique finan-cé par le CRSNG et diri-gé par Yves Comeau de l’École Polytechnique de Montréal et intitulé : « Captage des matières particulaires d'effluents piscicoles, traitement des boues par lit de séchage à macrophytes et dé-phosphatation par piège

à phosphore extensif ». Le principal objectif de ces travaux de recherche a

été de mettre au point des dispositifs expérimentaux pour proposer des solutions extensives de traitement des boues et des eaux usées aux pisciculteurs confron-tés à des problèmes de rejets. La méthodologie a consisté à mettre en œuvre plusieurs installations à l’échelle de banc d’essais, deux systèmes de lits de traitement de boues piscicoles plantés de macrophytes, un dispositif de traitement d’effluents de piscicultures

en recirculation et enfin un lit de scories pour arrêter le phosphore. La majeure partie du stage post-doctoral a consisté à planifier les expérimentations, dimensionner et réaliser les installations pilotes et recruter et partici-per à l’encadrement du personnel étudiant (3 maîtrises recherche et un doctorat). Par ailleurs, nous avons tra-vaillé avec un pisciculteur partenaire chez qui un suivi de la production ainsi qu’un dispositif expérimental de traitement des boues sont en cours de réalisation. Matilde de Francesco (U. Laval) Supervision : Grant Vandenberg (U. Laval) et Domini-que Bureau (U. of Guelph) Utilisation de la farine de maïs jaune et blanc dans l’alimentation de la truite arc-en ciel.

Au cours des der-nières années, de nouvelles sources protéiques ont été étudiées dans le but de remplacer par-tiellement ou totale-ment la farine de poisson dans la formulation des

aliments utilisés en aquaculture. Plusieurs études ont démontré que la farine de maïs, avec son contenu pro-téique élevé, peut être utilisée dans l’alimentation de la truite arc-en ciel sans réduire la croissance et les per-formances d’élevage. Cependant, la couleur du filet des truites alimentées avec le maïs jaune peut être altérée car les xanthophylles, pigments jaunes contenus dans cette plante, changent la couleur de la chair du poisson. Ce problème peut modifier la qualité du pro-duit aquacole, ainsi que la perception du consomma-teur face au produit.

Le but du projet était d’évaluer les effets de la subs-titution de la farine de poisson et d’autres sources pro-téiques d’origine animale, avec une farine de maïs jau-ne ou de maïs blanc, c’est-à-dire dépigmentée, dans l’alimentation de la truite arc-en ciel. L’utilisation du maïs blanc pourrait réduire les effets indésirables sur la couleur du filet et on pourrait ainsi augmenter son utili-sation dans les aliments pour poissons.

Boursiers postBoursiers postBoursiers postBoursiers post----doctorauxdoctorauxdoctorauxdoctoraux En 2006-2007, le financement combiné du MDEIE et d’AquaNet nous a permis d’accorder quatre demi bourses post-doctorales. L’objectif était de renforcer la collaboration entre les chercheurs du RAQ et d’offrir un soutien financier, dans le cadre de pro-jets en cours, qui permettrait d’associer à ces projets des chercheurs post-doctoraux et d’ainsi augmenter la productivité des équipes. Certains de ces jeunes chercheurs sont encore associés aux travaux du RAQ pour l’année 2007-2008, alors que d’autres ont trouvé un emploi ou continuent leur formation dans d’autres laboratoires. Voici un bref résumé des projets qu’ils ont réalisés l’an dernier.


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Richard Hedger (U. Laval) Supervision : Julian Dodson (U. Laval) et Céline Au-det (UQAR/ISMER) Susceptibilité des rivières du Québec à la colonisation par la truite arc-en-ciel

Les objectifs poursuivis dans le cadre de ce projet étaient : (1) d’identifier l’ampleur de l’établissement des popula-tions de truite arc-en-ciel dans les rivières de l’Est du Québec; (2) d’identifier les variables abiotiques et bioti-ques qui caractérisent à la fois les rivières qui assurent la subsistance des popula-

tions de truite arc-en-ciel et celles qui n'ont pas encore de population établies; (3) d’identifier les effets possi-bles des changements climatiques sur ce phénomène de colonisation.

Pour estimer la distribution spatiale de la truite arc-en-ciel au Québec et des espèces compétitrices comme le saumon atlantique, nous avons utilisé les données du Ministère des Ressources Naturelles et de la Faune (MRNF), données que nous avons complétées par des échantillonnages dans plusieurs rivières.

L’identification des variables abiotiques des riviè-res a été réalisée à partir de suivis aériens du MRNF, des donnés numériques d'élévation issues de GEOBA-SE ainsi que des données météorologique du modèle numérique BIOSIM8. Nous avons converti ces don-nées en variables qui produisent un effet sur la truite arc-en-ciel (e.g. taille de substrat, période de croissan-ce, caractéristiques du régime hydrologique). Les effets biotiques sont identifiés à partir des données de distri-bution du saumon atlantique pour lesquelles une inte-raction existe avec la colonisation de truite arc-en ciel. Toutes les données sont traitées dans l'environnement de ArcGIS.

Nous sommes en train d'analyser les relations en-tres les variables à l’aide du logiciel "R". Pour détermi-ner les effets des changements climatiques, nous allons construire un modèle démontrant comment les prédic-tions des modèles de circulation générale (GCM’s) vont affecter les caractéristiques des régimes thermaux et hydrologiques des rivières. Jesús Mavárez (U. Laval) Supervision : Louis Bernatchez (U. Laval) et Céline Audet (UQAR/ISMER) Génomique fonctionnelle et hybridation

chez les ombles (Salvelinus sp.)

Mon sujet de recherche se développe autour de la géno-mique fonctionnelle de l'om-ble de fontaine, en se focali-sant sur deux processus évo-lutifs différents : 1) les bases génétiques des modes de vie anadrome et résident et 2) l'évolution de la dominance. Nous utilisons des biopuces à ADN (GRASP Canada) pour mesurer et comparer les ni-

veaux d'expression de plusieurs milliers de gènes chez des lignées anadromes et résidentes de l’omble de fon-taine (objectif 1), ainsi que chez des hybrides intra-spécifiques « anadrome x résident » et inter-spécifiques « omble de fontaine x omble chevalier » (objectif 2). Les croisements ont été effectués en fin d’année 2006, les échantillonnages à l’hiver et au prin-temps 2007 et les analyses sont actuellement en cours de réalisation.

Michel Bélanger (2ième cycle, UQAR) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER), Yvan Lambert (MPO/IML) et Matt Litvak (U. du Nouveau-Brunswick) Influence de l’âge au moment du sevrage sur la croissance et la survie des juvéniles de plie rouge (Pseudopleuronectes america-nus)

La p l ie ro uge , (Pleuronectes ameri-canus Walbaum 1792) est une espèce maintes fois qualifiée de pro-metteuse pour la diver-sification de la pisci-

Bourses pour étudiants graduésBourses pour étudiants graduésBourses pour étudiants graduésBourses pour étudiants gradués En 2006-2007, le support AquaNet via une subven-tion « Strategic Knowledge Node » a permis de soutenir financièrement de nombreux étudiants aux cycles supérieurs. Ce programme qui avait pour but de renforcer les liens des chercheurs RAQ avec d’autres chercheurs du réseau AquaNet a connu un immense succès et a contribué à la formation de six étudiants à la maîtrise et de sept étudiants au docto-rat.


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culture dans l’Est canadien. Elle est en effet adaptée aux conditions locales, tolère les eaux froides à salinité variable et s’adapte bien à la vie en captivité.

Les proies vivantes telles que les rotifères, Brachio-nus plicatilis (Müller), et les artémies, Artemia frans-ciscana (Linne), sont requises pour l’alimentation des premiers stades de vie des poissons marins d’élevage. Cette alimentation est nécessaire pour obtenir une bon-ne croissance et un bon taux de survie. Cependant, l’élevage des proies vivantes est coûteux et demande beaucoup d’efforts de production. En aquaculture, le sevrage correspond à l’arrêt complet de l’utilisation des proies vivantes et leur remplacement par des mou-lées commerciales.

L’objectif principal de cette étude est de vérifier s’il y a une plage optimale pour réaliser le sevrage des juvéniles sans affecter ni leur croissance, ni leur survie. Dans les cas où le sevrage est associé à des mortalités ou à des retards de croissance, nous voulons détermi-ner si les mortalités sont causées par une incapacité à s’alimenter ou à des carences alimentaires. Quatre temps de sevrage différents seront testés pour ce projet, soit à la métamorphose, un mois, deux mois et trois mois après la métamorphose. Des échantillonnages à intervalles réguliers permettront de mesurer différents indicateurs biochimiques de croissance, ainsi que la composition lipidique des juvéniles.

Amélie Bélanger-Lamonde (2ième cycle, U. Laval) Supervision : Grant Vandenberg (U. Laval), Janice Bailey (U. Laval) et Dominique Bureau (U. of Guelph) Remplacement des huiles marines par des huiles végétales dans la moulée de salmoni-dés : influence sur la bioaccumulation de contaminants

Le remplacement de 75% d’huile de poisson par de l’huile végétale (soya, canola, canola et algues marines) dans la moulée de truite a r c - e n - c i e l (Oncorhynchus

mykiss) a été étudié afin de diminuer l’exposition aux polluants organiques persistants (POPs), de réduire les coûts de production et de minimiser l’impact de l’aqua-culture sur les stocks de poissons sauvages. Les mou-lées expérimentales isocaloriques étaient à base de 2

ratios protéines digestibles (PD)/ énergie digestible (ED), soit 18 et 25 PD/ED. L’étude de 9 mois a porté sur la croissance, suivie de 3 mois d’affinage ou wash-out (rétablissement des acides gras polyinsaturés à lon-gue chaîne (PUFA) bénéfiques pour l’humain avec une moulée à 100 % d’huile de poisson. L’analyse des ré-sultats démontre que la survie, l’efficacité de conver-sion alimentaire et la croissance n’ont pas été influen-cées par la source de lipides, ni par le ratio huile de poisson/huile végétale. Au niveau des filets, la teneur en lipides totaux a significativement été influencée par le ratio et la source de lipides et l’huile de soya aug-mente significativement la concentration de n-6 dans les filets. Cette huile, même suite à une période d’affi-nage, n’a pas su rétablir les bons niveaux de PUFA. L’huile de canola, avec ou sans algues, a contribué à maintenir le ratio n-6/n-3, peu importe le ratio utilisé. Il est à noter que l’appétence des poissons n’a pas été influencée par les moulées. L’analyse de l’accumula-tion des POPs dans les filets démontre un accroisse-ment lors de la période d’affinage, cependant les va-leurs étaient inférieures à celles rencontrées avec la moulée contenant 100 % d’huile de poisson. De plus, ces concentrations étaient sous les limites des recom-mandations de Santé Canada, de la Food and Drug Administration (FDA, ÉU) et de la Commission Euro-péenne. En conclusion, dans les conditions expérimen-tales du projet, l’huile de soya ne peut être utilisée pour remplacer 75 % de l’huile de poisson comprise dans les moulées commerciales. L’huile de canola, avec ou sans algues, a démontré des résultats similaires aux groupes contrôles et pourrait remplacer efficacement l’huile de poisson dans la moulée de truite arc-en-ciel.

Sébastien Bigras (3ième cycle, INRS-IAF) Supervision : Richard Villemur (INRS-IAF) et Serge Parent (Biodôme de Montréal) La déphosphatation biologique

Parmi les enjeux environnementaux actuels, l’apport en nutriments dans le milieu avoisinant des entreprises piscicoles, peut entraîner des phé-nomènes d’eutro-

phisation dans les eaux de surface, phénomène nuisi-ble, voir toxique, pour la faune et la flore aquatique. L’introduction de phosphore est le principal responsa-ble de croissances végétales excessives. Outre les mé-thodes chimiques qui sont habituellement onéreuses,


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l’utilisation de réacteurs biologiques dans lesquels une population bactérienne capable de déphosphatation biologique s’avère être une voie prometteuse pour le retrait du phosphore des effluents piscicoles.

Des bioréacteurs de petite (moins d’un litre) et de moyenne (110 l) échelle à lit fluidisé fonctionnant en batch ont été aménagés de manière à conduire des ex-périences autant en eau douce qu’en eau saumâtre. La croissance de biofilms faisant la déphosphatation bio-logique est favorisée par l’alternance de phases anaéro-bie et aérobie. Dans ces conditions, les organismes accumulateurs de phosphate (OAP) assimilent l’acétate comme source de carbone en anaérobiose et le trans-forment en polyhydroxyalkanoates (PHA) grâce à l’é-nergie provenant de la lyse du glycogène. Durant la phase aérobie / anoxie (présence de nitrates), les OAP utilisent les PHA comme source de carbone pour croî-tre, assimiler des phosphates et stocker du glycogène. Une partie de la biomasse contenant un excédant de phosphore est retirée à chaque cycle. Les phosphates totaux, les PHA et le glycogène sont suivis au niveau de la biomasse régulièrement afin de suivre l’évolution de ces différents paramètres.

L’identification par biologie moléculaire est en cours afin de caractériser la biomasse déphosphatante. Pour ce faire des suivis de profil de population par PCR-DGGE et des identifications par clonages et gé-nothèque du gène codant pour l'ARN ribosomal 16S sont en cours. Des amorces spécifiques des espèces présentes pourront être élaborées à partir des séquences obtenues dans la génothèque. La visualisation des or-ganismes à l’aide de sondes fluorescentes spécifiques s’hybridant à des acides nucléiques in situ (FISH) et de la microscopie confocale à balayage laser est égale-ment en cours. Des sondes spécifiques pourront être conçues suite à l’établissement de la génothèque 16S.

Sébastien Croisetière (3ième cycle, U. de Montréal) Supervision : Pierre Belhumeur (U. de Montréal) et Louis Bernatchez (U. Laval) Étude d'un minisatellite dans le gène du

CHMII β chez l'omble de fontaine. Dans une première partie du pro-jet nous avions évalué l’effet de quatre allèles du CMHIIβ chez l’omble de fontaine sur la résis-tance/susceptibilité envers le pa-thogène Aeromonas salmonicida.

Dans cette seconde partie, nous étudions un minisatel-lite présent dans l’intron 2 du CMHIIβ ainsi que sa capacité à tenir un rôle régulateur sur l’expression des allèles du gène. Le minisatellite retrouvé dans l’intron 2 du gène du CMHIIβ est constitué d’un motif palin-dromique de 32 nucléotides (38% G+C) répété en tan-dem. Chaque allèle identifié chez l’omble de fontaine possède une taille de minisatellite qui lui est propre : 60, 27, 21 et 40 répétitions du motif pour les allèles Safo-DAB*0101 à Safo-DAB*0401 respectivement. Nous avons étudié l’effet de la taille du minisatellite sur la transcription du CMHIIβ. Une expérience de RT-PCR semi-quantitatif a été réalisée sur l'ARN du pro-néphros de poissons gardés à 6°C et 18°C. Les résul-tats indiquent qu’à haute température (18°C), un allèle portant un long minisatellite est associé à une baisse de la transcription d’un facteur 2 par rapport à un allèle qui en porte un court. La transcription d’un allèle ayant un long minisatellite est donc sensible à l’effet de la température. Il est intéressant de constater que l’allèle DAB*0101, qui est associé à une plus grande résistan-ce face au pathogène Aeromonas salmonicida, possède également le plus long minisatellite dans l’intron 2 du CMHIIβ et démontre le plus faible niveau de transcrip-tion du gène. Afin d’expliquer ces résultats, nous avons entrepris l’identification du (des) mécanisme(s) molé-culaire(s) pouvant expliquer le rôle régulateur du mini-satellite. Renée Gagné (2ième cycle, UQAR) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER), Fa-brice Pernet (U.MCS/IRZC) et Jean-François Samain (IFREMER) Effet de l’addition de Rhodomonas salina dans le régime alimentaire de Pecten maxi-mus

Le but de notre pro-jet est de tester l’ef-fet de l’addition de Rhodomonas salina dans le régime ali-mentaire de la Co-quille St-Jacques durant l’élevage larvaire et post-larvaire. Deux régi-

mes alimentaires sont utilisés. Le premier régime est un régime standard utilisé couramment en écloserie-nurserie composé de plusieurs micro algues (Pavlova lutheri, Isochrysis galbana et Chaetoceros calcitrans) et le second est le régime standard auquel on a addi-tionner une micro algue, Rhodomonas salina. Les deux


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régimes ont d’abord été testés afin de vérifier leur effet sur la croissance, la survie, le succès de métamorphose, ainsi que sur le contenu biochimique des larves et post-larves. Une seconde partie de l’expérience consiste à comparer l’effet de ces deux deux régimes alimentaires sur la fixation des post-larves de Pecten maximus. Cet-te partie de l’étude a eu lieu au Musée d’Histoire natu-relle de Dinard, France, à l’aide d’un canal hydrodyna-mique tandis que les élevages larvaires et post-larvaires ont eu lieu au centre IFREMER de Brest, France. Thomas Guyondet (3ième cycle, UQAR) Supervision : Vladimir Koutitonsky (UQAR/ISMER) et John Grant (U. Dalhousie) Capacité de support de la lagune de Gran-de-Entrée pour la mytiliculture

Mon travail de doctorat s’insère dans un projet vi-sant à déterminer la capaci-té de support d’un écosys-tème côtier pour la culture de moules. Cette étude rassemble plusieurs cher-cheurs et étudiants de l’IS-MER, l’IML et l’Universi-té Dalhousie (Halifax) au-tour de la Lagune de Gran-

de-Entrée (Iles-de-la-Madeleine, Québec). La méthodologie la mieux adaptée à la complexité

des interactions bivalves/environnement et aux diffé-rentes échelles spatiales et temporelles qu’elles com-portent est la modélisation numérique, à la fois de l’hy-drodynamique et des processus biogéochimiques du système étudié. Mon rôle dans cette étude est de mettre en commun l’ensemble des connaissances acquises sur la lagune par l’intermédiaire d’une suite de modèles numériques décrivant l’hydrodynamique et la biogéo-chimie de ce système côtier. Cette combinaison de modèles devrait permettre de reproduire de façon dy-namique le fonctionnement de l’écosystème de la lagu-ne et d’étudier le rôle joué par l’élevage mytilicole au niveau local et à l’échelle du système lagunaire dans les cycles du carbone et des sels nutritifs. Gabriel Koffi D. Koko (3 ième cycle, U. La-val) Supervision : Joël de la Noüe (U. Laval) et Guy De-bailleul (U. Laval)

Aspects technico-économiques d’une aqua-culture durable dans les pays de la CE-DEAO : cas du Togo

À ce jour, l’aquaculture est presque inexistante dans les pays de la CEDEAO. Pour-tant il y existe d’énormes potentialités pour l’aqua-culture et une demande en forte croissance pour le pois-son et autres produits aquati-ques. Quels sont les leviers techniques, scientifiques et socio-économiques sur les-quels agir pour un dévelop-pement durable de l’aqua-

culture dans ces pays ? Le présent projet se propose de répondre à cette question, à travers une étude-diagnostic. Dans le cadre de cette thèse, le projet porte-ra essentiellement sur le cas du Togo.

La recherche bibliographique a permis de rassem-bler une quantité importante d’informations sur l’aqua-culture tropicale, africaine et sub-saharienne. Malheu-reusement, les informations sur la situation de l’aqua-culture dans les pays de la CEDEAO et particulière-ment au Togo ne sont pas abondantes, ce qui confirme la nécessité d’aller sur le terrain. Dans l’ensemble, les informations recueillies confirment le faible dévelop-pement de l’aquaculture en Afrique, malgré les énor-mes potentialités du continent, et la nécessité d’actions concrètes et bien ciblées afin d’aider à un "boum aqua-cole africain", à l’instar des pays asiatiques. Au cours de cette première phase, nous avons créé un organisme qui servira de cadre de mise en œuvre des résultats du projet de recherche. Il s’agit d’une ONG de développe-ment international dénommée Poisson pour l’Afrique et dont le site internet est www.fishforafrica.org. Geneviève Lavoie (2ième cycle, INRS-IAF) Supervision : Pierre Juteau (INRS-IAF) Devenir de pathogènes aquatiques bacté-riens dans un bioréacteur de dénitrification et déphosphatation simultanées utilisé pour un système aquicole marin.

Un bioréacteur de dénitrification et déphosphata-tion simultanées utilisé pour des systèmes aquicoles marins est à l’essai au Biodôme de Montréal. Toutefois un des problèmes qui se pose dans un système où l’eau recircule, est la recirculation possible des pathogènes


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bactériens. Ceci est problématique compte tenu que l’utilisation d’antibiotiques dans un procédé utilisant des microorganismes n’est pas souhaitable. Les patho-gènes Aeromonas salmonicida, Yersinia ruckeri et Vi-brio anguillarum causent de grandes pertes dans les piscicultures et, ce, à l’échelle mondiale. Les différen-tes phases d’anaérobie, d’aérobie et d’anoxie des pro-cédés ainsi que la microflore présente dans les bioréac-teurs peuvent influencer leur devenir. À travers le pré-sent projet, nous tenterons de déterminer le devenir de ces pathogènes dans le procédé des bioréacteurs. Pre-mièrement, un profil de la diversité de l’affluent et l’effluent des bioréacteurs sera établi par PCR-DGGE et les principaux organismes seront identifiés par sé-quençage de l’ADNr 16S, afin de déterminer si des pathogènes piscicoles sont présents dans la flore domi-nante du système. Les pathogènes de l’eau du bassin représentant le St-Laurent marin du Biodôme seront ensuite inventoriés à l’aide de méthodes classiques de microbiologie et de biologie moléculaire. Le devenir des pathogènes sera étudié en fermenteurs recréant les conditions des bassins suite à leur inoculation dans l’affluent et leur suivi sera fait de manière quantitative en utilisant la PCR en temps réel et des méthodes clas-siques, notamment par croissance sélective. Éric Normandeau (2ième cycle, U. Laval) Supervision : Louis Bernatchez (U. Laval) et Jeff Hut-chings (U. Dalhousie) Génomique fonctionnelle de l’hybridation introgressive entre des populations domes-tiques et sauvages de saumon atlantique (Salmo salar)

Les effectifs des populations de saumon atlantique ont chu-té dramatiquement au cours des 30 dernières années. Ce déclin semble principalement dû à la pollution, la surpêche et la modification des riviè-res. Par ailleurs, le nombre important de saumons atlanti-que domestiques échappés annuellement de l’industrie

aquicole risque d’engendrer des conséquences addi-tionnelles sur les populations sauvages. En Amérique du Nord, peu d’études ont porté sur les impacts généti-ques des saumons domestiques envahissant des popula-tions naturelles et s’hybridant avec les individus de ces populations. Or, il existe un risque d'introgression de matériel génétique mal-adapté aux conditions naturel-

les et présentant une faible diversité allélique dans les populations sauvages. Cette situation pourrait entraî-ner, chez des populations qui sont déjà menacées d’ex-tinction, un fardeau génétique plus important, de même qu’une capacité réduite d’adaptation aux changements environnementaux.

Le niveau de transcription des gènes semble jouer un rôle important dans la réponse à la sélection et dans l’évolution. Nous mettons donc à profit la technologie des biopuces à ADN afin de mieux caractériser les impacts sur les profils de transcription des gènes en-gendrés par l'introgression de matériel génétique de saumons atlantiques domestiques dans des populations sauvages. Afin d’étudier l’introgression, nous utilisons des individus issus du rétrocroisement entre des hybri-des sauvage-domestique et des individus descendants de deux populations sauvages de Nouvelle-Écosse. Ce projet a aussi pour objectif de corroborer la découverte de gènes possiblement associés à la réponse à la sélec-tion artificielle, telle qu’observée chez la lignée domes-tique originaire de la Rivière Saint-John au Nouveau-Brunswick. Le dernier objectif du projet consiste à explorer les bases génomiques fonctionnelles de l'adap-tation locale des populations de saumon atlantique. Nicolas Pichaud (3ième, UQAR) Supervision : Pierre Blier (UQAR), Jocelyne Pellerin (UQAR/ISMER) et Michel Fournier (INRS-IAF) Immunocompétence, endocrinologie et en-zymologie du pétoncle Placopecten magel-lanicus : contribution à la physiologie d’u-ne espèce à fort potentiel commercial

Le but de ce projet est de relier le d éve lop p ement des capacités mé-taboliques et l’état physiologique via les mesures de stress oxydant et d’immunocompé-tence d’un stock

de pétoncle géant (Placopecten magellanicus) des Îles- de-la-Madeleine, suivant un profil saisonnier et en fonction de différents stades de développement. Un grand nombre de paramètres a été pris en compte in-cluant l’histologie des gonades pour l’évaluation des stades de maturation, l’évaluation des activités enzy-matiques dans la glande digestive (soit trypsine, lipase, aspartate aminotransférase, pyruvate kinase et citrate synthase) et dans la chair (mannose phosphate isomé-


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rase, glucose phosphate isomérase, amino aspartate transférase, pyruvate kinase et citrate synthase). Nous avons estimé l’immunocompétence de chaque organis-me (nombre d’hémocytes et viabilité de ces mêmes cellules), puis nous avons utilisé l’hémolymphe à l’état frais pour l’évaluation de la phagocytose. Enfin, les différentes concentrations d’hormones (oestradiol, pro-gestérone et testostérone) ont été mesurées dans cha-cun des individus.

La plupart des résultats sont encore en cours de traitement, mais certaines tendances au niveau enzy-matique ont été détectées. Ainsi, dans le muscle nous avons remarqué que les individus de 5 ans ont des acti-vités plus importantes au niveau des enzymes glycoly-tiques et des taux de citrate synthase plus faibles com-parativement aux individus de 2 ans. Ceci laisse présu-mer que les individus de 2 ans ont une plus forte activi-té aérobie au niveau de la production d’énergie. Ils ont moins de réserves de glycogène que les individus de 5 ans qui eux, ont une activité métabolique anaérobie plus forte. De même, les individus de 5 ans présentent un plus fort taux d’aspartate aminotransférase, indi-quant une utilisation des acides aminés pour leur pro-duction d’énergie. Dans l’hépatopancréas, on obser-ve de forts taux de chymotrypsine et d’aspartate ami-notransférase. Ceci y confirme l’utilisation d’acides aminés pour la production d’énergie, notamment les acides aminés possédant des ponts disulfures. Cepen-dant la pyruvate kinase présente aussi une forte activi-té, donc également utilisation de glycogène. Les faibles taux de lipase nous indiquent qu’il n’y a pas ou peu d’utilisation des réserves lipidiques. Les individus de 2 ans ont une plus forte activité aérobie que ceux de 5 ans dans l’hépatopancréas. Les taux de lipase et d’as-partate aminotransférase sont aussi plus élevés chez les individus de 2 ans: les pétoncles utiliseraient donc plus les acides aminés tels que l’aspartate (ainsi que l’alani-ne) ainsi que les réserves lipidiques en début de vie, ce qui est confirmé par le fait que les mollusques utilisent en général leur réserves lipidiques lors des stades de développement embryonnaire et larvaire. Cette étude serait la première, à notre connaissance, à mettre en relation tous les paramètres physiologiques évoluant au cours de la vie du pétoncle, permettant ainsi une meil-leure compréhension de cet organisme en vue d’amé-liorer les conditions de culture inhérentes à une meil-leure efficacité de production.

Nathalie Rayssac (3ième cycle, UQAR) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Jean-Marie Sévigny (MPO/IML) Recrutement de Mytilus spp. dans le Havre de Gaspé (Québec, Canada) : de l’espèce à la communauté

En écologie ben-thique, de nom-breux travaux sont centrés sur le recrutement à cause de son rôle déterminant dans l’organisation et le fonctionne-ment des com-munautés. La

plupart des invertébrés benthiques ont un cycle de vie complexe de type meroplanctonique qui leur confère une capacité de colonisation importante grâce à la dis-persion des larves par les courants. Dans cette étude nous nous intéressons au recrutement d’un invertébré d’intérêt maricole, Mytilus spp., dans une zone d’hybri-dation des espèces M. edulis et M. trossulus. Le pre-mier objectif est de documenter la dynamique du recru-tement de Mytilus spp. en tenant compte des facteurs propres à l’espèce, tels que la stratégie de reproduction et le patron de recrutement, tout en prenant en considé-ration les interactions avec les organismes compéti-teurs et prédateurs. Le deuxième objectif vise à étudier les effets de la dispersion et du synchronisme du recru-tement des moules et des espèces épibenthiques sur les interactions biologiques et la saturation d’un collecteur artificiel de type commercial. Cette étude est effectuée dans une baie semi-fermée, le Havre de Gaspé, où les échantillons ont été récoltés au cours de deux années consécutives (2005 et 2006). Dans un premier temps, les prélèvements hebdomadaires de larves planctoni-ques, d’individus matures et l’immersion de collecteurs ont permis d’analyser les relations entre la gamétoge-nèse, les abondances larvaires, les intensités de fixation et de recrutement. D’après les résultats préliminaires, il n’y aurait pas de relation significative entre la gaméto-genèse, l’abondance larvaire et l’intensité de fixation. Cependant, conformément à diverses études, la prédic-tion de la période de fixation basée sur le pic d’abon-dance larvaire a été favorable au captage commercial. L’identification spécifique, actuellement en cours, des individus aux différents stades du cycle de vie permet-tra d’établir et de comparer les stratégies de reproduc-tion et les patrons de recrutement des deux espèces. L’analyse de la composition spécifique sera utilisée pour examiner les interactions biologiques et la régula-


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tion de la communauté à l’échelle d’un collecteur arti-ficiel. Enfin, les outils de modélisation seront mis à profit pour améliorer les connaissances des mécanis-mes de dispersion larvaire et analyser les effets d’un décalage du recrutement entre différentes espèces sur les interactions biologiques et la saturation d’un collec-teur.

Lisa Robichaud (2ième cycle, UQAR) Supervision : Chris McKindsey (MPO/IML) et Philip-pe Archambault (UQAR/ISMER) Influence de la mytiliculture sur la produc-tivité secondaire des macroinvertébrés benthiques

Les structures utilisées pour cultiver les bi-valves pour-raient agir com-me des récifs artificiels et augmenter la p r o d u c t i v i t é secondaire des

communautés benthiques. La productivité secondaire est un paramètre important pour la gestion des pêches au Canada, notamment par son inclusion dans la Loi sur les Pêches.

On a échantillonné des macroinvertébrés dans 8 baies de l’Île-du-Prince-Édouard pour tester l’hypothè-se que les boudins de moules augmentent la productivi-té des macroinvertébrés benthiques. Dans les sites my-tilicoles, on a échantillonné les macroinvertébrés vi-vant sur les boudins de moules ainsi que ceux vivant sur le fond. À l’extérieur des sites mytilicoles on a pré-levé des échantillons témoins sur le fond.

Mes résultats comparant des estimations de produc-tivité secondaire à l’intérieur et à l’extérieur de sites mytilicoles confirment l’hypothèse que la mytiliculture augmente la productivité des communautés macroben-thiques. Ces résultats, qui incluent les macroinverté-brés vivant en association avec les boudins de moules, contribuent à forger une vision plus complète du rôle de la mytiliculture dans les écosystèmes côtières.

Orlane Rossignol (3ième cycle, U. Laval) Supervision : Helga Guderley (U. Laval) et Julian J. Dodson (U. Laval) Héritabilité et stratégie conditionnelle chez le saumon atlantique (Salmo salar L.) : in-fluences sur les capacités métaboliques de la descendance

Les saumons atlantique mâles suivent une stra-tégie condition-nelle de repro-duction et em-ploient soit une tactique de re-p r o d u c t i o n « combattante »

avec une maturation sexuelle en milieu marin, soit une tactique « furtive » avec une maturation entièrement dulcicole (tacons matures). Ces phénotypes reproduc-teurs suggèrent des allocations énergétiques différentes entre la croissance et la maturité sexuelle. Les deux tactiques coexistent au sein d’une même population et au niveau du même site de frai. Le choix de la tactique est dicté par la capacité de l’individu d'atteindre une valeur seuil. La position du seuil est fortement déter-minée par les conditions biotiques et abiotiques, mais peut également être influencée par un déterminisme génétique. Dans cette étude, nous comparons la progé-niture engendrée par des mâles anadromes à celle en-gendrée par des tacons matures, et ce, depuis l’éclo-sion de la progéniture jusqu'à l’âge de 2 ans. Ces ale-vins issus de géniteurs connus sont élevés dans des conditions environnementales identiques, afin de faire ressortir l’impact du déterminisme génétique dans le choix d’une tactique de reproduction. Au cours de ces deux années, nous mesurons différents paramètres directement reliés à la croissance (longueur, masse, taux de croissance et teneur en protéines). De plus, nous déterminons la consommation d’oxygène afin de définir le taux métabolique de routine. Nous utilisons aussi des indicateurs enzymatiques pour évaluer la capacité métabolique des alevins, en nous focalisant sur la capacité aérobie (CCO et CS), la capacité glyco-lytique (LDH) et le métabolisme azoté (GDH).


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Les Stages Les Stages Les Stages Les Stages Andrée-Anne Lachance (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Bruno Myrand (MAPAQ/CERMIM), Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Jean-Marie Sévi-gny (MPO/IML) Comparaison saisonnière de la biomécani-que de filaments de byssus de moules d’éle-vage en suspension provenant de deux en-vironnements différents (lagune vs mer) aux Îles-de-la-Madeleine

Ce projet de stage s’insè-re dans mon projet de maîtrise qui s’intitule : Facteurs influençant la force d’attachement du byssus de la moule bleue Mytilus edulis en élevage en suspension aux Îles- de-la-Madeleine. Le stage a été effectué au Friday Harbor Laboratories, Uni-versité de Washington dans le laboratoire du Dr Emily Carrington et s’est

déroulé du 16 au 27 octobre 2006. Un des objectifs principaux du projet de maîtrise est de caractériser la variation de la force d’attachement du byssus des mou-les de culture sur une période d’échantillonnage s’éta-lant de la fin mai à la mi-octobre. L’objectif de ce stage était de caractériser et de comparer la force d’attache-ment mesurée sur des filaments individuels de byssus

provenant de moules récoltées à l’été et à l’automne, dans deux environnements différents : la lagune et la mer. Les résultats obtenus durant le stage permettent de corroborer les résultats de force d’attachement obte-nus préalablement sur des moules entières attachées par un ensemble de filaments de byssus. La Dr Car-rington travaille en biomécanique marine. J’ai donc appris beaucoup sur la biomécanique des filaments de byssus de moule durant ce stage notamment comment effectuer des tests de tension sur les filaments indivi-duels de byssus à l’aide d’un tensiomètre pour mesurer la force des filaments ainsi que leur extensibilité. De plus, j’ai pu rencontrer et travailler avec la Dr Carring-ton et son assistante Gretchen Moeser. J’ai également rencontré le directeur du Friday Harbor Laboratories, le Dr Kenneth P. Sebens travaillant sur l’écologie des communautés subtidales ainsi que le Dr Mark Denny, chercheur en biomécanique à l’Université de Stanford, Californie. Myriam Callier (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Chris McKindsey (MPO/IML) et Philip-pe Archambault (UQAR/ISMER) Stage effectué au laboratoire du Dr Tas-man Crowe, Dept of Zoology, University College Dublin (Dublin, Ireland)

L’objectif de ce stage était d’acquérir des connaissances sur les effets de l’aquaculture sur l’environnement en Irlande et d’écrire un projet de recher-che sur le sujet suivant: déve-lopper des méthodes afin de diminuer l’effet des flux de matière organique sous les cultures. Une méthode pro-metteuse est le développement de l’aquaculture intégrée ou

polyculture. Dans un même milieu, des poissons, des bivalves et des macroalgues sont cultivés. L’hypothèse est qu’une partie des particules organiques (fèces et excédant de nourriture) produites par les poissons est filtrée par les bivalves et les excrétions dissoutes sont utilisées par les macroalgues suspendues en périphérie des filières de moules.

Ce stage m’a permis de faire connaître mes recher-ches menées au Québec (Étude sur la capacité de sup-port environnementale de la mytiliculture, dirigée par Chris McKindsey), d’approfondir mes connaissances sur les impacts environnementaux liés à l’aquaculture

Stages et congrès pour les étudiants Stages et congrès pour les étudiants Stages et congrès pour les étudiants Stages et congrès pour les étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires postaux cycles supérieurs et stagiaires postaux cycles supérieurs et stagiaires postaux cycles supérieurs et stagiaires post----doctorauxdoctorauxdoctorauxdoctoraux Au cours de l’année 2007-2008, le RAQ a soutenu financièrement la réalisation de stages étudiants, ces stages étant réalisés soit dans une université autre que l’université d’appartenance, soit dans une sta-tion de recherche gouvernementale. D’autres ont reçu une aide financière pour présenter leurs résul-tats de recherche dans des congrès nationaux et in-ternationaux.


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en Irlande et de comparer les méthodes employées en Irlande et au Québec pour évaluer ces impacts, d’ap-profondir mes connaissances sur des méthodes d’ana-lyses (nouvelle version du logiciel PRIMER v6) et PERMANOVA. Il m’a également permis d’écrire un projet de recherche afin de continuer mes travaux en collaboration avec l’Irlande. Mathieu Caron (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Louis Bernatchez (U. Laval) Formation en génétique quantitative à Seattle, juin 2007

Le « Summer Institute in Statistical Gene-tics » (SISG) est une session de formation spéciale dispensée par le département de bios-tatistiques de l’Univer-sité de Washington, à Seattle. Les professeurs

qui y enseignent proviennent principalement de l’Uni-versité de Washington, mais parfois d’autres universi-tés américaines. Cette formation s’adresse à des étu-diants oeuvrant dans des domaines de recherche plus ou moins étroitement liés à la génétique quantitative et comporte plusieurs modules différents. Les objectifs principaux de cette formation étaient d’approfondir ma connaissance des concepts fonda-mentaux de la génétique quantitative (additivité de la variance, déséquilibre de liaison et héritabilité), de m’initier aux techniques informatiques et statistiques les plus couramment utilisées dans ce domaine, ainsi que d’apprendre comment, et dans quelles circonstan-ces, utiliser ces méthodes pour analyser efficacement les résultats expérimentaux générés dans le cadre de mon projet de doctorat et présenter ces résultats en utilisant la terminologie appropriée. Cette formation devait aussi me permettre d’améliorer ma connaissance de certains logiciels statistiques. Le SISG m’a été utile sur plusieurs plans, outre l’apprentissage de nouvelles techniques et connaissances théoriques. Cette forma-tion s’est avérée une excellente occasion d’élargir mon réseau de contacts, d’en apprendre plus sur les modes de fonctionnement de la recherche scientifique, ainsi que sur les sujets de recherche de prédilection, dans d’autres pays. Sur le plan personnel, le SISG m’a per-mis d’améliorer substantiellement mon anglais parlé, et plus précisément d’utiliser régulièrement cette langue

dans un contexte scientifique. Aurélie Dupont-Prinet (3ième cycle, Univer-sité de Montpellier, France) Supervision : Guy Claireaux (U. de Bretagne occiden-tale, Brest) et David McKenzie (U. Montpellier) Stage au laboratoire de Céline Audet (UQAR/ISMER) dans le cadre d’un projet stratégique mené en collaboration avec Louis Bernatchez (U. Laval)

L’objectif de cette colla-boration entre l’ISMER et le CNRS (Département de Biologie Intégrative de l’Institut des Sciences de l’Evolution de Mont-pellier, France) était, dans un premier temps, d’examiner les variations des performances nata-toires et osmorégulatrices chez différents croise-ments de salmonidés.

Dans ce contexte, nous avons soumis 4 croisements d’omble de fontaine, de souches anadromes/sédentaires, réalisés pour étude de l’effet hétérosis, à un test de nage. Celui-ci a permis de mettre en éviden-ce des différences de performances de nage entre les 4 croisements. La capacité d’osmorégulation a été exa-minée en évaluant la performance de nage en eau dou-ce puis en eau de mer. Dans le but d’expliquer les dif-férences de performances, nous avons ensuite examiné certains caractères biochimiques. Des prélèvements ont été effectués sur tous les poissons sélectionnés, juste après le test de nage. Sept variables biochimiques ont été sélectionnées et étudiées afin d’évaluer l’état de fatigue des poissons après le test de nage. Afin d’expli-quer les différences au niveau de l’osmorégulation, 3 autres variables biochimiques ont été mesurées. Les performances natatoires et osmorégulatrices seront corrélées avec les paramètres biochimiques et les ca-ractéristiques morphologiques seront corrélées aux performances natatoires.

Ce stage fait partie intégrante de mon projet de doctorat. Il m’a permis d’apprendre plusieurs techni-ques d’analyses biochimiques et d’observer l’organisa-tion que pouvait avoir une station aquicole (protection et cloisonnement des bassins, mesures de sécurité et d’hygiène). J’ai pu également rencontrer et échanger des idées auprès de nombreuses personnes.


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Erwann Fraboulet (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Yvan Lambert (MPO/IML) Évaluation de la contribution paternelle dans la résistance au gel de juvéniles de plie rouge d'origines différentes : une ap-proche génétique

Ce stage a été réalisé au mois de juin 2007 à l'Institut des bios-ciences marines (IBM), Halifax (N.-É.), sous la direction du Dr Vanya Ewart du laboratoire de bio-chimie et de génomi-que fonctionnelle. Un

des objectifs associés au projet de recherche stratégi-que dont je fais partie est de déterminer le nombre de copies du gène codant pour la puissante protéine anti-gel "MAXI", celui-ci étant proportionnel à la capacité de résistance au gel, chez différentes populations de plie rouge. Les objectifs de ce stage étaient d'apprendre les techniques d'analyse quantitative par PCR (Polymerase chain reaction) en temps réel, puis d’ap-prendre à doser le gène maxi. Un important soutien technique et pédagogique m'a été apporté par Gisela Martinez, étudiante au doctorat sous la direction de Vanya Ewart, et Robert Richards, agent de recherche, afin de m'aider à optimiser les différentes étapes de l'analyse. La méthodologie employée correspond à celle actuellement développée par G. Martinez pendant son doctorat qui vise à déterminer la résistance au gel de différentes populations de plie rouge en Amérique du Nord et est basée sur l’utilisation du SYBR Green comme fluorophore. Suite à une formation sur la sécu-rité et les usages du laboratoire de génomique, j’ai ex-trait et purifié l'ADN des individus échantillonnés, je me suis familiarisé avec les appareillages et vérifié l'efficacité des amorces utilisées, puis j’ai testé diffé-rentes approches de quantification relative. La quantifi-cation absolue du nombre de copies d’un gène par PCR quantitative est une approche qui émerge en biologie marine, et très peu d’études ont été réalisées sur les poissons marins. De plus, la protéine MAXI vient d’ê-tre découverte et de nombreux travaux restent encore à faire pour la caractériser tant au niveau génétique que physiologique. Ce stage m’aura permis de comprendre la méthodologie et les subtilités de l’analyse quantitati-ve d’un gène, ainsi que le travail en équipe au sein d’un important laboratoire de génomique fonctionnelle.

Bertrand Genard (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Fabrice Pernet (U.MCS/IRZC) Approche génomique de l’impact d’un challenge bactérien sur les larves d’huîtres américaines (Crassostrea Virginica).

Ce stage a été réalisé à l’Institut Universitaire Européen de la mer à Brest (France) sous la supervision du Dr Dario Mora-ga. L’objectif principal de ce stage était de profiter de l’expé-rience en génomique des bival-ves du laboratoire du Dr Mora-ga pour mettre au point une méthode de quantification de l’expression de plusieurs gènes pour des larves de Crassostrea

virginica soumises à un challenge bactérien. Le travail s’est déroulé en quatre étapes : 1) validation d’une mé-thode d’extraction de l’ARN et de formation d’ADN recombinant (transcriptase inverse) pour des larves de C. virginica ; 2) utilisation de l’ADN recombinant pour la PCR en temps réel ; 3) sélection des sondes pour les gènes étudiés ; 4) calcul de l’expression génique des gènes pour lesquels on avait une bonne amplification. Le choix des différents gènes a été effectué sur la base des travaux réalisés par les chercheurs de l’équipe du Dr Moraga et les gènes testés ont été classés en trois groupes fonctionnels : immunité, métabolisme énergé-tique et stress.

Éric Normandeau (2ième cycle, U. Laval) Supervision : Louis Bernatchez (U. Laval) et Jeff Hutchings (U. Dalhousie) Génomique fonctionnelle de l’hybridation introgressive entre des populations domes-tiques et sauvages de saumon atlantique

Mon stage a été réalisé à l’Université Dalhousie, à Halifax, au laboratoire du Professeur Jeffrey Hut-chings, affilié au département de biologie, du 2 au 7 octobre 2006. Les objectifs poursuivis étaient de procé-der à l’échantillonnage devant servir à mon projet de maîtrise, de discuter avec le Professeur Hutchings ainsi qu’avec Dylan Fraser (stagiaire post-doctoral) des as-pects de mise en contexte du projet (contexte démogra-phique des populations, pollution dans les rivières étu-


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diées, conditions d’élevage des individus que j’utilise-rai et autres). J’ai également rencontré un chercheur du Ministère des Pêches et Océans à Dartmouth, Patrick O’Reilly, pour discuter de la possibilité d’utiliser cer-taines de ses données sur les distances génétiques des populations de la Baie de Fundy afin de procéder à une analyse comparative des distances génétiques obtenues pour les mêmes populations en utilisant les biopuces à ADN.

En plus de me donner une expérience concrète de dissection de jeunes poissons pour recueillir foie, cer-veau et muscle blanc, ce stage m’a permis de connaître d’autres aspects liés à mon projet. J’ai en effet vu pré-cisément les conditions dans lesquelles les individus avaient été élevés, et j’ai pu discuter de la façon dont les familles des différents croisements ont été obte-nues. Je suis maintenant plus conscient des forces et des limites du protocole expérimental de mon projet et j’ai maintenant un meilleur tableau des connaissances réelles concernant l’habitat, la démographie et l’histo-rique d’ensemencement pour les populations et les rivières sur lesquelles porte mon projet. Ce stage est une étape essentielle à la réalisation de mon projet de maîtrise et ouvre la possibilité à de nouvelles collabo-rations avec les gens que j’ai rencontrés.

Julie Pariseau (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER), Jean-Marie Sévigny (MPO/IML) et Franck Berthe (U. of Prince Edward Island p53, y-a-t’il une connexion avec la néopla-sie hémique de la mye commune (Mya are-naria) ?

Mon stage a été réalisé en avril 2007 au Atlantic Veterinary Colle-ge de l’Universi-té de l’Ile du Prince-Edouard, au laboratoire de Franck Berthe. La néoplasie

hémique est une maladie invasive et progressive connue depuis 1952 et qui affecte plusieurs espèces de bivalves dont la mye commune (Mya arenaria). On n’a que peu d’informations sur cette maladie, sur sa prévalence et les facteurs pouvant influencer son déve-loppement (pesticides, biotoxines, génétique, agent rétroviral, etc.). Le gène p53 codant pour la protéine p53 est un gène suppresseur de tumeur qui semble avoir muté chez des myes communes atteintes de néo-

plasie hémique et les anomalies du gène p53 pour-raient être associées avec le développement de cellules tétraploïdes. Une meilleure compréhension de l’étiolo-gie de cette maladie permettra de faciliter le dévelop-pement de la myiculture au Canada Atlantique. Mon objectif était donc de confirmer d’éventuelles muta-tions du gène codant pour la protéine p53 et leur lien avec le développement de néoplasie hémique chez les myes communes de North River, Île-du-Prince-Édouard. Lors de ce stage, nous avons procédé à l’é-chantillonnage de 240 myes de North River (Île du Prince Édouard). Une trentaine de myes ont été sélec-tionnées suite à une analyse par cytométrie en flux qui avait pour but de déterminer la présence de tétraploï-die, notre marqueur de néoplasie hémique. L’ARN a été extrait, l’ADNc synthétisé par RT-PCR, nous avons déterminé le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP), puis les gènes ont été séquencés pour vérifier la présence éventuelle de mu-tations. Nos résultats ont démontré qu’il n’y avait aucune mutation au niveau du gène p53 en présence de néoplasie hémique chez la mye commune et l’hy-pothèse de la séquestration cytoplasmique de la protéi-ne p53 par la mortaline devrait donc être envisagée pour étudier la présence de néoplasie hémique chez la mye à l’Île du Prince Édouard.

Rachel Picard (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Bruno Myrand (MAPAQ/CERMIM)

Stage pour des travaux de terrain au Cen-tre de recherche du MAPAQ aux Îles-de-la-Madeleine (CEMIM), mai-juin 2007

La bourse offer-te par le RAQ a permis de dé-frayer une par-tie du séjour d’un mois au centre de re-cherche du MAPAQ des Î l e s - d e - l a -Madeleine. Ce

stage s’inscrit dans le cadre de mon projet de maîtrise en océanographie et qui traite des indices comporte-mentaux de vitalité lors des premières phases opéra-tionnelles conchylicoles, plus précisément de l’effet d’un agent stressant (l’émersion) sur la force d’attache-ment de la Moule bleue (Mytilus edulis) et sur la vites-se d’enfouissement de la Mye commune (Mya arena-


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ria). Ce stage m’a permis d’utiliser le matériel disponi-ble aux Îles-de-la-Madeleine. Les bateaux, voitures et véhicules tout terrain du MAPAQ ont aussi été très utiles pour la collecte des individus. Le fait d’être sur place limitait les stress induits par le transport et le temps d’émersion entre les sites de collecte et la salle des bassins. De plus, le séjour aux îles a permis de bé-néficier de l’expertise des différents techniciens (aide sur le terrain, collecte des spécimens, navigation, mani-pulation des appareils, matériel disponible) et cher-cheurs (plan d’échantillonnage, références). Ce stage m’a beaucoup appris sur l’écologie et la culture des moules et des myes. J’ai pu observer la disposition des multiples filières dans la lagune de Ha-vre-aux-Maisons et me familiariser avec les techniques pour récupérer les larves (collecteurs en tapis) ainsi que les techniques de culture (radeaux flottants, upwel-ler, FLUPSY). Nicolas Toupoint (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER), Bru-no Myrand (MAPAQ/CERMIM), Fabrice Pernet (U. MCS/IRZC) et Frédéric Olivier (MNHN) Facteurs responsables du succès de l’ap-provisionnement en naissain de moule (Mytilus edulis, Linné 1758) de qualité dans le bassin du Havre-Aubert (Iles-de-la-Madeleine, Qc)

Depuis une quinzaine d’années, le Bassin de Havre-Aubert (BHA) est le principal site de capta-ge pour les mytili-culteurs des Iles-de-la-Madeleine car le naissain de moule (Mytilus edu-lis) récolté y est considé-ré de qualité supérieure à tout autre. Généralement fiable au fil des ans, cet approvisionnement fut réduit, voir très réduit,

depuis ces trois dernières saisons. Le stage a eu lieu au cours de l’été 2007 et diffé-rents objectifs étaient visés dans le cadre du projet in-cluant: 1) un suivi des moules des gisements naturels ; 2) le suivi larvaire ; 3) le suivi du seston ; 4) le suivi des paramètres environnementaux; et 5) le suivi de la dynamique de captage. Bien entendu, toutes ces mani-

pulations n’auraient pu se réaliser sans l’aide des tech-niciens qualifiés du CeMIM (MAPAQ) que ce soit en laboratoire comme sur le terrain. Étant donné l’am-pleur des tâches à effectuer, ma principale activité fut concentrée sur le suivi larvaire ainsi que sur l’acquisi-tion des échantillons destinés aux analyses lipidiques. Sur le terrain, j’ai participé aux sessions de pompages larvaires et été initié à une technique d’échantillonnage de larves dans la colonne d’eau. Au laboratoire, j’ai été formé à l’identification des larves de moules en fonc-tion de leur stade de développement afin de pouvoir déterminer la distribution spatiale des abondances dans le BHA au cours du temps, à la filtration sur colonne millipore des échantillons d’eau pour analyse ultérieure du seston, au prélèvement de larves pédivéligères au sein des échantillons et aux techniques de préparation des différents produits utilisés pour la conservation des échantillons « lipides », « histologie » et « compteur de particules ». Par ailleurs, j’ai assisté à la pose des appa-reils océanographiques dans le BHA, ce qui m’a donné un aperçu du type de matériel utilisé pour étudier la circulation de masses d’eau. J’ai également effectué la maintenance de ces appareils pour prévenir le dévelop-pement de salissures sur les capteurs (4 plongées dans la saison).

Participation des étudiants à des Participation des étudiants à des Participation des étudiants à des Participation des étudiants à des congrès internationauxcongrès internationauxcongrès internationauxcongrès internationaux Florent Chazarenc (Stagiaire post-docto-ral, École Polytechnique de Montréal) Supervision : Yves Comeau (École Polytechnique de Montréal) International Conference on Multi Func-tions of Wetland Systems, juin 2007, Leg-naro (Padova), Italie F. Chazarenc, A. Boumecied1, J. Brisson2, Y. Boulan-ger3, Y. Comeau 1Ecole Polytechnique ; 2Institut de Recherche en Biolo-gie Végétale, Montréal ; 3Pisciculture des Alléghanys,


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St-Philémon (Québec) Phosphorus removal in a fresh water fish farm us-ing constructed wetlands and slag filters In Quebec, growing concerns over the negative envi-ronmental impact of phosphorus discharge from fish farm effluent has resulted in more severe regulations and has hampered the growth of this industry. The aim of our work was to design a low maintenance and effi-cient treatment system to treat fish farm wastewaters. Settled solids were removed weekly at a fresh water fish farm and were treated using a combination of an anaerobic digester, constructed wetlands and static columns containing electric arc furnace slag. Pollutant removal was monitored during 2 years. Brianna Clynick (Stagiaire post-doctorale, MPO/IML) Supervision: Philippe Archambault (UQAR/ISMER) et Chris McKindsey (MPO/IML) Benthic Ecology Meeting, mars 2007, Atlanta, Georgia

At the Benthic Ecol-ogy meeting, At-lanta, I presented research on monitor-ing the environ-mental impacts of mussel aquaculture. Specifically, this research tests the hypothesis that bi-

valve culture sites increase the productivity of fish and macroinvertebrates within them and therefore can also be linked to the production of fish stocks. Results of this study support the hypothesis that productivity of fish and macroinvertebrates at mussel sites are equiva-lent to that in nearby seagrass beds. This increase in the productivity of this component of the ecosystem may offset some of that commonly believed to be lost due to the presence of aquaculture. Therefore this pro-ject also provides key information for the environ-mental assessment and management of aquaculture sites. B. Clynick, C. McKindsey, P. Archambault Influence of shellfish culture on ecosystem produc-tivity: monitoring fish and macroinvertebrates as-sociated with mussel farms The public perception of aquaculture is often negative, with the common belief that the bottom below culture

sites is devoid of organisms. In contrast, our observa-tions suggest that aquaculture structure may function in a manner analogous to artificial reefs. We also suggest that aquaculture structure may increase the productiv-ity of organisms similarly to natural complex habitats, such as seagrass beds. The extent to which such in-creases in abundances of fish and macroinvertebrates associated with artificial complex habitats translates into heightened productivity remains to be investi-gated. This research tests the general hypothesis that bivalve culture structures increase the abundance and productivity of fish and macroinvertebrates. The study was done at two mussel farms in the Magdalen islands, Canada. Fish and macroinvertebrates were sampled in different areas within farms sites and in adjacent natu-ral vegetated and unvegetated habitats. The instantane-ous growth ra te o f Winter f lounder (Pseudopleuronectes americanus) and the Rock crab (Cancer irroratus) were estimated using RNA:DNA techniques. The results demonstrated that mussel sites are not equivalent to natural structurally complex sea-grass beds with respect to fish and macroinvertebrate assemblages. We did observe a heightened abundance of a few dominate species in mussel farms including the commercially important American lobster (Homarus americanus) and Winter flounder, (Pseudopleuronectes americanus). At this point, how-ever, our work has provided no evidence to suggest that this increase in abundance translates to greater productivity of fish and macroinvertebrates. This study, to our knowledge, is the first attempt to deter-mine changes in productivity brought about by aqua-culture. Benjamin de Montgolfier (3ième cycle, INRS-IAF) Supervision : Daniel Cyr (INRS-IAF), Céline Audet (UQAR/ISMER) American Society of Andrology, avril 2007, Tampa, FL

Le congrès portait sur les derniers avan-cements des connaissances en andrologie. Les études sur l’humain et les r o n g e u r s étaient majori-taires. Il est


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intéressant de noter l’intérêt croissant pour les cellules souches dans le testicule et leur rôle spécifique. Concernant les études sur les poissons, un groupe bré-silien présentait une nouvelle méthode de transfection de cellules germinales chez le tambour brésilien. Un groupe japonais a identifié l’expression de la voie de signalisation Wnt dans les testicules de poisson, ce qui montre à nouveau l’importance de cette voie dans la différenciation cellulaire. Mes buts personnels pour ce congrès étaient tout d’abord de suivre les avancements des études récentes dans ce domaine, et de présenter le modèle d’omble de fontaine à la communauté de cher-cheurs. Je souhaitais aussi établir des liens avec d’au-tres laboratoires en vue de post-doc ou de collabora-tions futures. La présentation de mon étude a reçu un accueil très favorable, et a permis de montrer l’utilité d’un modèle de poisson pour l’étude d’un phénomène aussi complexe que la spermatogenèse. L’intérêt que cette étude a suscité m’a permis d’établir plusieurs contacts avec des chercheurs du Massachussetts Hospi-tal et de l’US EPA et du Woods Hole Oceanographic Institute. De par la qualité des présentations, l’intérêt porté à ma recherche et les contacts établis, le congrès de l’ASA a été un succès. B. de Montgolfier, A. Faye1, C. Audet, D.G. Cyr. 1UQAR/ISMER. Influence of androgens on testitcular connexins in brook trout Gap junctions are composed of connexons which are themselves made up of transmembrane proteins termed connexins (Cxs). In mammals decreased Cx43 expres-sion is associated with altered spermatogenesis. Brook trout are seasonal breeders and spermatogenesis is syn-chronous. As such these fish represent an excellent model in which to study the cellular processes impli-cated in spermatogenesis. We have previously shown in rainbow trout that there are 4 Cxs (Cx43, Cx43.4, Cx30, and Cx31) that are expressed in a stage and cell specific manner during spermatogenesis. To date, how-ever, there is no information on the endocrine regula-tion of testicular Cxs in fish. The objective of this study was to determine whether or not androgens can directly regulate the expression of Cxs in brook trout. Trout were sampled on a monthly basis from May to November during spermatogenesis. Histological ex-amination of the testes indicated that fish were at Stage I in May and June; Stage II in July; Stage III in Au-gust; Stage IV in September-October and Stage V in October-November. Serum 11-KT levels were low (0.2 ng/ml) in June but increased progressively by 75-fold to peak levels in September. Levels decreased dramati-cally to less than 2.0 ng/ml afterwards. Levels of Cx43, which is expressed in Sertoli cells, and Cx30 which is expressed in Leydig cells, were elevated from June to September and significantly decreased by 60-80% in

November at end of spermatogenesis. Levels of Cx43.4, which is expressed in spermatogonia and sper-matocytes, increased from June to peak in July, pro-gressively decreased by almost 75% in September and were undetectable thereafter. Levels of Cx31, which is expressed in endothelial cells, were constant from June until September and decreased by 80-90% thereafter. These results suggest that Cx levels vary according to stages of spermatogenesis independent of androgens. To determine if this was the case, in vitro assays using cultured seminiferous tubules were done. Tubules were cultured for up to 20 days in the presence of either 0, 1, 10 or 100 ng/ml of 11-KT. Tubules cultured with 0 or 1 ng/ml of 11-KT underwent spermatogenesis with most tubules reaching stages III and IV while the higher dose group reached stage V. Cx43 mRNA lev-els in the high dose group remained constant from days 5-15 but significantly decreased at day 20 when tu-bules reached stage V, suggesting that Cx43 levels were stage dependent and that these were not directly influenced by 11-KT. These data indicate that while high concentrations of 11-KT can influence spermato-genesis in the salmonid testis, it does not regulate Cx43 expression. Gabriel Koffi D. Koko (3ième cycle, U. La-val) Supervision : Joël de la Noüe (U.Laval) et Guy De-bailleul (U. Laval) World Aquaculture Society, mars 2007, San Antonio, Texas, USA Plaidoyer pour le développement d’une aquaculture durable en Afrique de l’Ouest : cas du Togo et du Bénin À ce jour, l’aquaculture est presque inexistante au To-go et au Bénin. Pourtant il existe dans ces deux pays d’énormes potentialités pour l’aquaculture et une de-mande en forte croissance pour le poisson. Quels sont les leviers techniques, scientifiques et socio-économiques sur lesquels agir pour un développement durable de l’aquaculture dans ces pays ? Pour tenter de répondre à cette question, un projet de recherche a été initié au département des sciences animales de l’Uni-versité Laval. Le projet devra déboucher sur l’élabora-tion d’outils de prise de décision (cartes de faisabilité et modèles de production), de programme d’interven-tion et sur la mise en place d’un organisme régional d’intervention. La participation à Aquaculture 2007, conférence an-nuelle de la World Aquaculture Society (WAS), a pour


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but de sensibiliser les sommités de l’aquaculture mon-diale à la situation du secteur en Afrique Occidentale et de susciter des partenariats à court, moyen et long ter-mes. Stéphanie Houle (2ième cycle, U. Laval) Supervision : Grant Vandenberg (U. Laval) The Sixth International Conference on Re-circulating Aquaculture, juillet 2007, Vir-ginie, USA

Ce congrès por-tait sur l’aqua-culture en recir-culation. Les différentes pré-sentations se re-groupaient parmi différents sujets reliés à l’aqua-culture en recir-culation. Les

sujets traités étaient : l’aquaculture des crevettes mari-nes, le développement de nouveaux marchés, les pro-blèmes actuels en santé piscicole, la production aqua-cole intensive des poissons marins et des sujets d’ingé-nierie sur les systèmes en recirculation. Plusieurs pré-sentations ont été données par des membres du Fresh-water Institute. Il y avait aussi des sujets qui étaient regroupés en séances spéciales et ma présentation orale était dans l’une d’elles. S. Houle, K.K. Schrader1, G. Vandenberg 1 United States Departement of Agriculture, Agricul-tural Research Service, MS, USA Geosmin causes off-Flavors in Arctic Char produce in Recirculating-Water System The taste of off-flavors in aquacultured products is a problem that can be really costly for the industry and can also lead to the lost of consumers. The problem was first recognized in farmed fish raised in outside pond but it is now also observed in fish raised in recir-culating and partly recirculating systems. The earthy and muddy off-flavor taste in aquaculture fish is due to the presence of geosmin and 2-methylisoborneol (MIB) in the flesh of the fish. Planktonic and benthic algae, cyanobacteria and actinomycetes are know pro-ducer of MIB and geosmin. The process of elimination of these compounds by the fish is much longer then the absorption. When the compounds are absorbed in the flesh of the fish it causes the fish to be an unmarket-able product unless they go into depuration before they

are sold to the market. A lot of research has been done on the problem in channel catfish (Ictalurus punctatus) (USA) raised in ponds. However, no previous reports exist on fish, like char, raised in recirculating system. In this primary study, we examine water, biofilms and filets from cul-tured arctic char that had an off-flavor and needed de-puration. We used instrumental and human sensory analyses to determine the cause and the source of off- flavors in the filets. We found the presence of geosmin but not MIB to be the problem for the off-flavors in the filets. The cyanobacteria responsible for the earthy/ musty flavour in commercial catfish pond are usually Oscilla-toria perornata producer of MIB and the Anabaena species, producer of geosmin. Neither of these two cyanobacteria were found in the water and biofilm samples taken in the recirculating system. The cyano-bacteria releasing the geosmin in the water are not yet identified but further studies are on the way. Christian Roberge (3ième cycle, U. Laval) Supervision : Louis Bernatchez (U. Laval) et Helga Guderley (U. Laval) Evolutionary Change in Human-altered Environments, février 2007, U. de Califor-nie, Los Angeles (UCLA)

Ce sommet visait à éta-blir un dialogue entre la communauté scientifi-que et les décideurs politiques afin que les résultats d’études évo-lutives soient davantage considérés lors de la mise en place de mesu-res environnementales. Dans ce contexte, j’ai eu l’occasion d’assister à 45 présentations de haut niveau en biologie

évolutive appliquée à des questions de conservation, de découvrir les résultats de nombreux autres chercheurs et étudiants sous forme d’affiches, d’assister à des dis-cussions entre chercheurs et décideurs politiques, de rencontrer et d’échanger avec d’autres chercheurs et étudiants ainsi que de présenter mes résultats les plus récents sous forme d’affiche. Sur cette affiche, j’ai montré qu’un grand nombre de différences génétiques du niveau de transcription des gènes étaient observa-bles entre des saumons de l’Atlantique d’origine sau-


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vage et des hybrides entre des saumons d’élevages et sauvages rétrocroisés à des saumons sauvages. Ces résultats suggèrent que le problème des échappées de saumons d’élevages pourrait être encore plus néfaste qu’on le pensait pour les populations sauvages et ap-pellent à des politiques plus responsables pour limiter les échappées de saumons d’élevage et leur reproduc-tion en nature. C. Roberge, É. Normandeau, S. Einum1, H. Guderley1 et L. Bernatchez 1Norwegian Institute for Nature Research, Trondheim, Norway A follow upon the evidence of rapid evolutionary of gene expression profiles in farmed Atlantic salmon Farmed salmon strains have been selected in man-made environments (fish hatcheries and sea cages) since de 1970’ to improve growth rates as well as other traits of commercial interest, and the 2 million farmed salmon escaping annually may enhance risk of extinc-tion of wild populations through genetic and ecological interactions. Recently, we used cDNA microarrays to gather evidence of genetic differences in gene tran-scription profiles between farmed and wild Atlantic salmon from Norway and Canada. Several candidate genes which transcription levels showed genetic differ-ences between farmed and wild salmon were identi-fied. In a follow up study, we present here quantitative PCR confirmation of some of these results. We also studied the transcriptomics of outbreeding depression and transgressive segregation in crosses of farmed hy-brids to wild salmon, which provided new information on the potential mechanisms of introgression of farmed characters in wild populations. Overall, our results could lead to a better understanding of the molecular basis of recent evolution and of introgression of tran-scription level differences from farmed to wild salmon, clarifying how gene flow from farmed escapees may affect the genetic integrity of wild populations. Isabelle Tremblay (3ième cycle, U. Laval) Supervision : Helga Guderley (U. Laval) et John Himmelman (U. Laval)

International Pectinid Workshop, mai 2007, Halifax (N.É.) I. Tremblay, H. Guderley, M. Fréchette Swimming performance, meta-bolic rates and their correlates in the Iceland scallop, Chlamys

islandica Scallops can escape their predators by swimming using jet propulsion. The escape response of the scallops Chlamys islandica, Euvola ziczac and Argopecten pur-puratus can be modified by reproductive investment (Brokordt et al. 2000a,b) and the escape response of Placopecten magellanicus changes with ambient tem-perature (Lafrance et al. 2002). Identification of the causes of these changes in escape performance requires knowledge of the underlying physiological determi-nants. Much is known about the physiology underlying the escape response, but little is known about the func-tional link between escape response performance, metabolic rates, and tissue metabolic capacities. We utilized Iceland scallop (Chlamys islandica) to exam-ine these relationships, measuring metabolic rates (standard and maximal), aerobic scope, escape re-sponse behaviour (initial and repeat performance), tis-sue mass, condition index, protein content, and enzy-matic activities (glycolytic and mitochondrial); then examining the relationships between these parameters. Postexercise oxygen consumption (PEOC) gave meta-bolic rates 12 fold standard metabolic rates. PEOC rates were positively linked with contraction rate (repeat test) and with pyruvate kinase activity in the adductor muscle. PEOC rates were negatively linked to digestive gland wet mass. Swimming performance characteristics were mainly related to the activity of glycolytic enzymes while enzymatic activities were related to the anatomic parameters. Scallop behaviour and physiology changed with size, both within our sample and on a larger scale (when compared with results obtained by Brokordt et al. 2000a). When com-pared with larger scallops, small scallops showed more intense swimming performance and had higher argin-ine kinase activities but lower glycolytic enzymatic activities in the adductor muscle. This corresponds to the ontogenetic change in susceptibility to predation and in habitat use observed in C. islandica by Arsenault and Himmelman (1996).

Participation à des congrès nationauxParticipation à des congrès nationauxParticipation à des congrès nationauxParticipation à des congrès nationaux Mathieu Caron (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Louis Bernatchez (U. Laval) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.) M. Caron, A. Bastien1, C. Audet, L. Bernatchez


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1UQAR/ISMER Expression of the cathepsin L and IGF-I genes in livers of anadromous, resident, and hybrid brook charr Many physiological processes linked to reproduction, such as somatic growth and vitellogenesis, probably vary with life-history strategies (anadromy or freshwa-ter residence). This study will compare the expression patterns of the cathepsin L and insulin-like growth factor I (IGF-I) genes in the livers of anadromous, resi-dent, or hybrid brook charr. The objective is to deter-mine if gene expression is predominantly linked to the parental group (anadromous, resident, or hybrid), to familial traits, or to individual traits. This presentation will focus on the expression patterns of the cathepsin L and IGF-I genes during the first weeks of summer (in freshwater) and 10 days after transfer to seawater. Erwann Fraboulet (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Yvan Lambert (MPO/IML) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.) E. Fraboulet, Y. Lambert, M. Litvak1, C. Audet 1CCSA, UNB, St. John, NB Does parental origin influence growth of young winter flounder in a cold environment? Winter flounder (Pleuronectidae) populations are found in different habitats along their geographical distribution in the NW Atlantic. Larval growth from breeders captured at three different locations (Passamaquoddy Bay, NB; St. Lawrence estuary, QC; Baie-des-Chaleurs, NB) was examined in the labora-tory under cold water conditions typical of the St. Law-rence estuary. Slower growth was found in families from the estuary. Half-sib hybrid families produced from breeders reared for a year under similar con-trolled conditions were used to study potential paternal effects on larval and juvenile growth (until complete weaning onto commercial food). Growth, pigmentation index, fin erosion index, and the RNA/DNA ratio were also used to compare the performance of the families.

Renée Gagné (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision: Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Francis Pernet (U. MCS/IRZC) Congrès de l’Association Aquacole du Ca-nada, novembre 2006, Halifax (N.É.) R. Gagné; R. Tremblay; F. Pernet; P. Miner1; J.-F. Samain1, F. Olivier2 1Centre IFREMER, Brest, France; 2Museum national d’histoire naturelle, Dinard, France Effect of the addition of Rhodomonas salina in the diet of the scallop Pecten maximus Sea ranching and intensive culture of scallop is possi-ble by a supply of good quality juvenile. In hatchery, the nutrition is an essential factor in the success of the larval and post-larval development. A Diet rich in triglycerids with adequate polyunsatured fatty acid profil present a advantage for growth, survival and metamorphosis success. In this study, the microalgae Rhodomona. Salina will be tested on larval and post-larval culture of Pecten maximus in addition to a stan-dard diet. The present study show the effect of the ad-dition of R. salina on the growth, the survival, the settlement and the biochemical contents of the larvae of P. maximus. A diet with R. salina show a growth increasing related to an increase in AA (20 :4n-6), but a decrease of DHA (22 :6n-3) and EPA (20 :5n-3) dur-ing larval and post-larval development.. The exposure of 2 months juvenile in currents of various velocity in benthic biological flumes show a settlement success lower with R. salina in comparaison at the standard diet. Catherine Gaudreau (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Nathalie Le François (UQAR), Pierre Blier (UQAR) et Helge Tveiten (Fiskeriforskning) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.)

C.M. Gaudreau, N.R. Le François, P.U. Blier Mitochondrial func-tion and viability of wolffish hybrids The interaction be-tween mitochondrial and nuclear gene

products in inter-specific hybridization may expose


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metabolic limitations at the mitochondrial catalytic capacity level. Fitness or performance traits are likely to depend critically on these interactions as disruption of mitochondrial functions may result in an increase of reactive oxygen species (ROS) production. The objec-tive of this study is to assess if wolffish hybrids (Anarhichas minor x A. lupus) are viable by using mor-phometric and metabolic indicators. Hybrid and pure lines of spotted and Atlantic wolffish were produced and juveniles were raised under two temperatures (8, 10°C). The inferior aerobic to anaerobic capacities ratio and the higher oxidative stress in some hybrid lines seem to indicate a lower mitochondrial activity in the hybrids. Bertrand Genard (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision: Réjean Tremblay (ISMER/UQAR) et Fabrice Pernet (U. MCS/IRZC) Congrès de l’Association Aquacole du Ca-nada, novembre 2006, Halifax (N.É.) B. Genard, F. Pernet, R. Tremblay, D. Moraga2, K. Lemarchand1 1ISMER-UQAR; 2IUEM, LEMAR, Université de Bre-tagne Occidentale; CNRS, Brest (France) Bacterial challenge on oysters larvae (Crassostrea Virginica): biochemical and genomic reponses. Bivalve larvae often experience high mortalities during their protracted larval development due to outbreak of opportunistic bacteria. Therefore, the understanding of the relationship between opportunistic bacteria and larvae is important for the success of hatchery opera-tions. This study examines the performance of Ameri-can oyster from egg to pediveliger stages in relation to the bacterial community profiling in the larval tanks, the lipid dynamic of larvae and gene expression. Chloramphenicol addition have strongly limited mor-tality until pediveliger stage. Losses during the plank-tonic larval period occurred primarily during late veliger stages (d13 to 20) as previously observed on other bivalve species. Groups of larvae reared without antibiotic showed massive mortality presumably re-flecting the emergence of pathogenic bacteria. Prelimi-nary analyses showed that the expression of genes re-lated to immune response, stress response, lipid me-tabolism and cell communication was strongly influ-enced by mortality event and seawater treatment (antibiotic vs. control).

Sarah Granier (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Louis Bernatchez (U. Laval) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.) S. Granier, L. Bernatchez, C. Audet

Effect of inter-stock hybridization for improving growth in young of the year brook charr (Salvelinus fontinalis)

Heterosis is a wel l -studied phenomenon in the agro-food industry, b u t o u r knowledge of the underlying mechanisms in fish still needs to be

improved. This is especially true in salmonids, for which contradictory results have been published. To study this phenomenon, we made crosses between three different strains of brook charr. Eight cross types were made (three pure strains and five hybrids) with ten full-sib families for each. Samplings were made at hatching, at the beginning of exogenous feeding, 15 weeks after exogenous feeding, and at the end of sum-mer. During the first six months of life, heterosis and outbreeding depression were revealed, but with varia-tions among developmental stages. Andrée-Anne Lachance (2ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Bruno Myrand (MAPAQ/CERMIM), Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Jean-Marie Sévi-gny (MPO/IML) Congrès de l’Association Aquacole du Ca-nada, novembre 2006, Halifax (N.É.) A-A. Lachance, B. Myrand, R. Tremblay, J.-M. Sévi-gny, V. Koutitonsky1, E. Carrington2 1 ISMER, UQAR; 2University of Washington, Friday Harbor Laboratories, Friday Harbor, WA Influence of different factors on the attachment strength of blue mussel (Mytilus edulis) from sus-pended culture, in the Magdalen Islands (Quebec, Canada) Passive lost of mussels by fall-off in suspended culture


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can induce a substantial decrease of the yield. Mus-sels growth on sleeves is possible by the byssal threads produce by mussels that tether themselves to the substratum. Since the attachment strength of mus-sels is variable in time, it is primordial to fully under-stand the factors that might affect this important characteristic to provide against mussel’s losses. There have been a lot of studies on attachment strength of mussels in intertidal zone but no one has ever examined attachment of suspended cultured mussels. In the present study, variation of mussel’s attachment strength has been weekly measured in farms from Magdalen Islands between May to Octo-ber. We will discuss attachment strength of mussels in relation with environmental parameters (temperature, food availability, wind and current velocity and direction, wave’s height, turbulence) and physiological conditions like reproduction. We observed that spawning events and water turbulence seems to have a significant impact on the attachment strength of mussels. Iften Redjah (1er cycle, UQAR) Supervision: Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) Congrès de l’Association Aquacole du Canada, novembre 2006, Halifax (N.É.) Iften Redjah, Réjean Tremblay, Fabrice Pernet Physiological responses of the Eastern oyster Crassostrea virginica to temperature in relation to selective breeding

In the St. Lawrence Gulf, the American oyster, Crassostrea virginica, leaves in salted waters with high temperature variations between the winter (~ 0°C) and the summer (~ 20°C). As the sum-mer growing season

related to high temperature is short, New-Brunswick oyster producers need fast growing individuals. The first part of this study was to compare the physiologi-cal (scope for gowth) and biochemical (lipid class) parameters in relation to thermal changes of different oyster families, pool (mix of families) and natural spat produced in the Shippagan’s (N.B.) Aquarium and Marine Center hatchery. Physiological and bio-chemical parameters have been compared after 4

months transfer in commercial growing site, at three temperatures: 20°C (optimum conditions), 12°C (field condition at sampling) and 4°C (wintering preparation condition). The scope for growth showed significant differences between hatchery spats and with natural spat. These differences were related to metabolic demand and filtration capacity. Finally, relation between physiological parameters and lipid class analysis will be presented in relation with hatchery and natural spat performance. Christian Roberge (3ième cycle, U. Laval) Supervision : Louis Bernatchez (U. Laval) et Helga Guderley (U. Laval) Congrès de la Société Canadienne d’Éco-logie et d’Évolution, mai 2007, Toronto (Ont.) C. Roberge, É. Normandeau, S. Einum, H. Guderley, L. Bernatchez Genetic consequences of interbreeding between farmed and wild Atlantic salmon : insights from the transcriptome The important yearly amount of fugitive farmed At-lantic salmon enhances the risk of extinction of wild populations through genetic and ecological interac-tions. Recently, we gathered evidence of genetically-based gene transcription differences between farmed and wild salmon. How much interbreeding with farmed individuals will change the genetic makeup of wild salmon populations? Here, we compared the genome-wide gene transcription profiles of Norwe-gian wild salmon to that of farmed hybrids (backcross: (farmed X wild) X wild). Over 6% of the genes exhibited significantly different transcription levels and the range and average magnitude of those changes was higher than previously described be-tween pure farmed and wild strains. Most of these differences appear to result from cases of non-additive gene transcription level inheritance. Hence, genetic differences in gene expression between farmed and wild salmon cannot be assumed to etio-late through interbreeding, which suggest unpredict-able and potentially injurious effects on wild popula-tions.


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Orlane Rossignol (3ième cycle, U. Laval) Supervision : Helga Guderley (U. Laval) et J. Dodson (U. Laval) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.) O. Rossignol, H. Guderley, J. Dodson Heritability and conditional strategy in atlantic salmon (Salmo salar L.): impact on offspring meta-bolic capacities.

Male Atlantic salmon (Salmo salar L.) follow a conditional strategy and e i t h e r b e c o m e “combatants” that under-take a seaward migration and spend a minimum of one year at sea, or “sneakers” that remain in freshwater and mature as parr. These male repro-ductive phenotypes sug-

gest marked energy tradeoffs between investment in growth and sexual maturity. The two tactics coexist in a given population and often, on the same spawning site. The choice of tactic is dictated by the capacity of an animal to attain a physiological threshold. The threshold position is strongly determined by the biotic and abiotic environments but it also may be influenced by parental genotype. In this study, we compared off-spring fathered by anadromous males with those fa-thered by mature parr from hatching up to two years old. At hatch and at maximum attainable wet weight (MAWW), we measured different parameters directly related to growth (length, mass, growth rate and pro-tein content). We measured oxygen consumption to determine the routine metabolic rate. Then, we used enzymatic indicators to evaluate the metabolic capac-ity of the alevins, focusing upon aerobic capacity (cytochrome C oxidase (CCO) and citrate synthase (CS)), glycolytic capacity (lactate dehydrogenase (LDH)) and nitrogen metabolism (glutamate dehydro-genase (GDH)). Funded by C.R.S.N.G, Québec- Océan and R. A. Q.

Laurent Seychelles (3ième cycle, UQAR/ISMER) Supervision : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Louis Bernatchez (U. Laval) Réunion annuelle de la Société canadienne de zoologie, mai 2007, Montréal (Qué.) L. Seychelles, C. Audet, R. Tremblay, K. Lemarchand1 et F. Pernet 1ISMER, UQAR Bacterial colonization of fish larvae and dietary essential fatty acids

Proliferation of bacteria in inten-sive aquaculture systems may rep-resent health risks to the fish in cul-ture, leading to poor growth and mass mortality of fish larvae. Es-sential fatty acids

provided in the diet modulate the immune response through the production of eicosanoids from arachi-donic acid (AA) and eicosapentanoic acid (EPA). The main objective of this study was to determine if there was a relationship between the dietary essential fatty acids present in live food (rotifers) and the develop-ment of opportunistic bacteria in winter flounder lar-vae. Larvae were fed rotifers enriched with three com-mercial diets for 21 days. Larvae fed rotifers having the higher AA proportion and higher DHA:EPA ratio showed better growth and lower bacterial colonization in the gut than those fed the diet with the lowest AA and DHA:EPA levels.

Étudiantes à l’œuvre! Marie Léonard et Marion Richard sur le Gibord

(MPO) aux Îles-de- la-Madeleine


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EnvironnementEnvironnementEnvironnementEnvironnement « Captage des matières particulaires d’ef-fluents piscicoles, traitement des boues par lit de séchage à macrophytes et déphospha-tation par piège à phosphore exten-sif » (Projet CRSNG-Stratégique 2006-2009) Responsable : Yves Comeau (École polytechnique de Montréal) Co-responsables : Jacques Brisson (U. de Montréal) Partenaires : Société de Recherche et de Développe-ment en Aquaculture Continentale (SORDAC), Mittal Canada Inc., Multiserv, Harsco Canada et Réseau Aquaculture Québec

La meilleure stratégie pour enlever le phos-phore des pol-luants produits dans les pisci-cultures consiste à enlever les boues (fèces,

nourriture non consommée par les poissons…). Une fois retirés ces solides peuvent être disposés de plu-sieurs façon, soit par valorisation agricole suivant un plan d’épandage, soit par enfouissement, ils peuvent également être traités. Dans le cadre de notre projet de recherche nous nous sommes intéressé aux modalités de captage et de traitement des boues piscicoles dans un contexte de piscicultures en étangs, d’une produc-tion de moins de 20 t de poisson/an. Les activités de recherche ont été reportées selon les quatre objectifs de recherche définis dans le projet : 1) caractériser la nature des boues et mettre au point un système de collecte; 2) concentrer et stabiliser les boues piscicoles, développer des lits de séchage de boues au Québec; 3) développer un piège à phosphore extensif (PAPE) fonctionnant à l’air libre; et 4) valori-ser les solides, boues minéralisées et mélanges de ré-tention du phosphore « Sédimentation magnétique avancée pour l’enlèvement des MES et du phosphore » (Financement CRSNG et ÉTS) Responsables : Lynda Kharoune (ÉTS) et Grant Van-denberg (U. Laval) Collaborateurs : Sylvain Martel (École Polytechnique de Montréal), Mourad Kharoune (ÉTS), Éric Tami-gneaux (CGI) et Sébastien Sauvé (U. de Montréal)

La plus grande partie des MES, générées par l’ac-cumulation de fèces et de moulée excédentaire forme une boue de faible siccité récupérée dans des zones de sédimentation et qu’il faut extraire rapidement pour limiter la dissolution du phosphore particulaire. Cette boue constitue le rejet solide d’une installation aquaco-le. Par ailleurs, l’autre partie des MES et le phosphore particulaire qui lui est associé ainsi que les orthophos-phates libérés durant la décantation lente des MES dans les bassins d’élevage, sont rejetés dans l’effluent liquide. L’hydrolyse des MES et des boues durant leurs décantations respectives entraîne la dissolution du phosphore particulaire causant ainsi l’eutrophisation des cours d’eau. Plusieurs systèmes de traitement ont été utilisés pour traiter spécifiquement soit l’effluent liquide soit le rejet solide tels que les sédimenteurs, les séparateurs circulaires, le chaulage, les marais artifi-ciels. Cependant, ces technologies n’ont pas donné entière satisfaction.

Le projet en cours propose une approche intégrée de la gestion des rejets aquacoles. Il a pour objectif de traiter à la fois les boues et l’effluent liquide par un procédé de sédimentation magnétique avancée utilisant du chitosane optimisé pour l’enlèvement du phosphore particulaire et dissous. Il s’agit, d’une part, d’ajouter de

Projets de recherche réalisés en parte-Projets de recherche réalisés en parte-Projets de recherche réalisés en parte-Projets de recherche réalisés en parte-nariat avec le RAQ 2006nariat avec le RAQ 2006nariat avec le RAQ 2006nariat avec le RAQ 2006----2007200720072007 En 2006-2007, le RAQ a participé directement au financement de divers projets de recherche s’ins-crivant dans un ou plusieurs thèmes de sa program-mation scientifique. La section qui suit présente un résumé des projets auxquels le RAQ a été directe-ment associé en les regroupant en fonction du ou des thèmes touchés. Comme vous pourrez le consta-ter, les thèmes de recherche sont loin d’être exclu-sifs et, au contraire, sont très souvent inter-reliés favorisant ainsi des collaborations variées entre les chercheurs du réseau. Les projets sélectionnés devaient inclure au mi-nimum deux chercheurs du regroupement et l’aide financière être utilisée pour l’embauche d’aide tech-nique ou professionnelle. Ces fonds de contrepartie ont souvent joué un rôle important dans la capacité des chercheurs du RAQ à obtenir du financement externe. Lorsque ce fut le cas, l’organisme subven-tionnaire est également identifié dans les descrip-tions qui suivent.


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la magnétite dans le bassin de décantation des boues et d’accélérer leur décantation, grâce à un faible champ magnétique, pour minimiser la solubilisation du phos-phore particulaire et ainsi augmenter la siccité des boues. D’autre part, la magnétite associée au chitosane est utilisée comme floculant dans un procédé de coagu-lation-floculation pour traiter l’effluent liquide. La combinaison d’un coagulant (sel métallique) avec le chitosane magnétisé permettrait l’enlèvement rapide du phosphore particulaire et dissous. Le produit de la coa-gulation–floculation magnétique sera récupéré rapide-ment grâce à un faible champ magnétique (proche du champ magnétique terrestre). Il s’agit d’une récupéra-tion non destructive contrairement aux systèmes méca-niques conventionnels. « Utilisation des bouées de navigation pour le monitorage du naissain de mou-les » (Projet PCRDA 2007-2010) Responsable : Marcel Fréchette (MPO, IML) Partenaires : Société de développement de l’industrie maricole, Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation, Centre aquacole de la Côte-Nord, Réseau Aquaculture Québec

Le choix des zones à potentiel mytilicole se heurte dans beaucoup de cas à un manque de connaissances préala-bles sur le recrutement et la croissance en conditions d’élevage, surtout en ce qui concerne le naissain, pierre angulaire de tou-te entreprise. D’autre part, une fois établie, la mytiliculture continue d’avoir besoin d’infor-

mation sur la performance du naissain, intégrée sur une base annuelle. En outre, les approches généralement utilisées en cette matière se heurtent souvent aux pro-blèmes inhérents à la variabilité spatio-temporelle en milieu marin. Or a priori, le territoire aquicole poten-tiel du Québec est d’une étendue géographique consti-tuant à elle seule un puissant frein à l’acquisition des informations pertinentes. L’objectif du projet est de mettre au point une méthode de monitorage du recrute-ment et de la croissance du naissain de moules qui soit simple, efficace et économique. Nous aurons recours à la comparaison de populations de naissain de collec-

teurs classiques à celles de bouées de navigation en différents sites du Golfe du Saint-Laurent. Les bouées de navigation présentent des avantages notoires parce qu’elles permettent un échantillonnage très standardisé et sont facilement accessibles en fin de saison après leur retour à quai.

Génomique fonctionnelleGénomique fonctionnelleGénomique fonctionnelleGénomique fonctionnelle « Hétérosis chez l’omble de fontaine : Ba-ses génomiques fonctionnelles et intérêt pour l’aquaculture » (Financement CRSNG-Stratégique) Responsable : Louis Bernatchez (U. Laval) Collaborateurs : Céline Audet (UQAR/ISMER) et Da-niel Cyr (INRS-IAF) Partenaires : SORDAC, Pisciculture de la Jacques Car-tier, Aquaculture Forestville et SODIM

La croissance de l’indus-trie aquacole canadienne est présentement ralentie par la compétition féroce sur le marché internatio-nal et la diversification et l’amélioration des perfor-mances des espèces pro-duites apparaissent com-

me des voies à privilégier pour mieux faire face à cette compétition. L’omble de fontaine (Salvelinus fontina-lis) est une espèce indigène à l’Est du Canada et le Québec en est le principal producteur mondial. Toute acquisition de connaissances menant à une améliora-tion du rendement de production d’omble de fontaine entraînera donc des avantages concrets pour l’industrie aquicole canadienne.

L’objectif général poursuivi dans le cadre de ce projet est d’élucider les bases physiologiques et géno-miques de la vigueur hybride. Pour ce faire, nous ap-pliquons une approche intégrant la quantification de la vigueur hybride pour plusieurs traits d’importance pour la production aquacole, l’analyse comparée de profils d’expression de gènes et la recherche d’éléments endo-criniens régulateurs. Ces connaissances contribueront directement à l’amélioration de la production aquacole en identifiant les combinaisons de lignées génétiques et de régimes thermiques permettant de tirer le maximum de rendement du phénomène de la vigueur hybride chez l’omble de fontaine.


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SantéSantéSantéSanté----NutritionNutritionNutritionNutrition « Dynamique de la néoplasie hémique chez la mye commune Mya arenaria: un cas d’interaction complexe entre l’hôte, l’envi-ronnement et un virus » (AquaNet) Responsables : Réjean Tremblay (UQAR/ISMER), Frank C.J. Berthe (U. of Prince Edward Island) et Jean-Marie Sévigny (MPO/IML) Collaborateurs : Jeffrey Davidson (U. of Prince Ed-ward Island) et Arnost Cepica (U. of Prince Edward Island)

La conchyliculture est une activité économique d’importance dans les zones côtières de l’est du Cana-da et la mye commune (Mya arenaria) y est considérée comme une espèce importante pour la diversification. Son prix de vente est relativement élevé et les conflits potentiels avec les autres types d’exploitation limités. Tant dans les populations naturelles qu’en production, entre 20 et 100 % de taux de mortalités sont enregistrés sur les sites où sévit la néoplasie hémique. Cette mala-die est caractérisée par la présence d’hémocytes modi-fiés qui sont détectés dans l’hémolymphe et les tissus mous. L’objectif principal de l’étude était de détermi-ner l’état de santé de myes et la dynamique de dévelop-pement de cette maladie en fonction des caractéristi-ques génétiques des individus. L’hypothèse testée est que le développement de cette maladie est un proces-sus dynamique temporel, se déroulant dans des condi-tions environnementales spécifiques, impliquant une activité rétrovirale et des mutations du gène P53.

ÉconomieÉconomieÉconomieÉconomie----ÉthiqueÉthiqueÉthiqueÉthique----DroitDroitDroitDroit

« Aquaculture, éthique et société: évalua-tion de la prise en compte de la notion de responsabilité sociale par l’industrie aqua-cole québécoise » (AquaNet) Responsable : Lyne Létourneau (U. Laval) Collaborateur: Dominique Jean (U. Laval)

Ce projet avait pour but d’effec-tuer une évalua-tion partielle de la prise en compte de la notion de r e s p o n s a b i l i t é sociale par l’in-dustrie aquacole québécoise. Pour

ce faire, des entrevues ont été réalisées auprès de diver-ses parties prenantes de ce secteur dans le but de re-cueillir leurs perceptions quant aux réalités, défis et enjeux auxquels cette jeune industrie fait face. Au to-tal, 20 entrevues ont été réalisées et les personnes consultées incluaient des représentants des secteurs suivants: gouvernements et régulateurs (2); groupes sociaux et environnementaux (4); promoteurs et entre-prises privées (6); organismes de soutien et de concer-tation (3); chercheurs et centres de recherche (5). Quoi-que n’englobant pas un échantillon assez vaste pour être représentatif, les données générées permettront de dégager certaines tendances qui pourront servir à ali-menter des réflexions supplémentaires sur le sujet.

Environnement Environnement Environnement Environnement –––– Génomique fonc-Génomique fonc-Génomique fonc-Génomique fonc-tionnelle tionnelle tionnelle tionnelle –––– ÉconomieÉconomieÉconomieÉconomie « Impacts génétiques et écologiques des en-semencements chez l’omble de fontaine : enjeux pour la viabilité écologique et éco-nomique de l’industrie aquacole québécoi-se » (Projet CRSNG-Stratégique 2006-2009) Responsable : Louis Bernatchez (U. Laval) Co-responsables : Dany Garant (U. de Sherbrooke) et Rémy Lambert (U. Laval) Partenaires : É. Gaudreault, Aquaculture Forestville,

Boues piscicoles Florent Chazarenc en pleine action!


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Fédération Québécoise des Gestionnaires des Zecs, Société d’établissement de plein air Québec, Ministère des ressources Naturelles et de la Faune du Québec et Réseau Aquaculture Québec

L'omble de fontaine (Salvelinus fontinalis) est une espèce indigène au Québec et à l'Est du Canada et est la plus utilisée pour supporter l'offre de pêche sportive et l'industrie récréo-touristique qui en découle partout au Québec. L'espèce fait donc l'objet d’ensemence-ments depuis plusieurs décennies. De fait, le marché des ensemencements d'omble de fontaine représente près de 50% du chiffre d'affaires total pour l'industrie aquicole québécoise et s'avère donc vital pour celle-ci. Or, le public et les autorités gouvernementales se ques-tionnent de plus en plus quant aux impacts négatifs potentiels associés aux ensemencements d'ombles non indigènes. Ces facteurs de risque ont mené le gouver-nement québécois à revoir ses lignes directrices d'ense-mencement sur son territoire. La mise en place de nou-velles lignes directrices doit prendre en compte l'in-quiétude des représentants de l'industrie aquicole qui tient principalement du niveau d'incertitude qui plane quant aux conséquences économiques possibles de tels changements pour l'industrie. L'objectif général de ce projet est de contribuer à la mise en place harmonieuse de nouvelles lignes directrices d'ensemencements afin de préserver l'intégrité génétique des populations indi-gènes tout en assurant la viabilité économique des in-dustries aquicole et récréo-touristique. Nous évalue-rons le niveau de contamination génétique de popula-tions d'omble de fontaine par la quantification de la variation génétique moléculaire et phénotypique. Cette variation sera mise en relation avec l'historique des ensemencements et l'hétérogénéité de facteurs environ-nementaux pouvant en moduler l'impact. Nous déve-lopperons un modèle qui permettra de mieux prévoir les conséquences économiques pour l'industrie aquico-le des résultats obtenus et de leur application éventuel-le dans un cadre réglementaire. Cette recherche repré-sente un des premiers efforts visant à documenter d'une manière étayée et rigoureuse les impacts biologiques et économiques des ensemencements chez les salmoni-dés.

Environnement Environnement Environnement Environnement –––– SantéSantéSantéSanté----NutritionNutritionNutritionNutrition « Dispersion des myes ensemencées aux Îles-de-la-Madeleine en relation avec leur état nutritionnel et certains facteurs envi-ronnementaux (sédiments et cou-rants) » (Financement IRZC et CRSNG-

Découverte) Responsables : Bruno Myrand (MAPAQ/CERMIM), Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Fabrice Pernet (U. MCS/IRZC)

Ce projet vise à comprendre les mécanismes envi-r o n n e m e n t a u x (principalement les caractéristi-ques du courant, le type et le ni-veau d’érosion du

sédiment) pouvant conduire à la perte sur les sites aquacoles d’un grand nombre de myes entre la fin de l’automne et le printemps suivant l’ensemencement. Aux Iles-de-la-Madeleine, les myes sont ensemencées sur un substrat sablonneux, et donc dynamique, qui est soumis régulièrement à des conditions de turbulence importante en raison des vents omniprésents. Les taux de récupération des myes ensemencées ont été, jusqu’à maintenant, inférieurs à 30% et suffisent difficilement à rentabiliser les entreprises myicoles. La caractérisa-tion des conditions hydrodynamiques des sites myico-les aux Îles-de-la-Madeleine (mise en place de couran-tomètres ADCP et ADV) et des essais en canal hydro-dynamique ont permis d’identifier les conditions de courant favorisant l’érosion du sédiment et la disper-sion des myes. Nos résultats démontrent clairement, que les périodes de tempêtes observées à l’automne favorisent des pertes passives importantes des myes par l’érosion. La simulation de conditions similaires d’énergie cinétique turbulente par la combinaison de courants et de houle en canal hydrodynamique démon-tre clairement que la majorité des myes, indépendam-ment de leur taille, sont dispersées par ces conditions environnementales. La discrimination des pertes passi-ves et actives a été réalisée par la comparaison entre des myes vivantes et fixées au formol et confirment que ces phénomènes sont des mécanismes de pertes passives. Différents types de sédiments et différentes tailles de myes ont été examinés en canal d’écoulement pour donner une portée plus large à l’étude. Grâce aux résultats obtenus, nous envisageons de développer des pratiques de production limitant ces pertes et ainsi l’ex-portation importante de matière organique dans l’envi-ronnement fragile des lagunes des Îles-de-la-Madeleine.

Un deuxième objectif est de valider si l’état phy-siologique des myes, influencé par une alimentation plus ou moins riches en acides gras polyinsaturés, pourrait accroître l’activité d’enfouissement et la réten-tion des myes dans le sédiment. Une carence en acide


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gras polyinsaturés dans les membranes cellulaires, par-ticulièrement dans celles des mitochondries influence négativement l’activité métabolique des animaux et pourrait donc contribuer à accentuer la perte des myes par dispersion suite à l’ensemencement. En alimentant les myes durant 4 semaines avec des régimes de micro algues plus ou moins riches en acide gras polyinsaturés (principalement en DHA et EPA), il a été possible de tester en canal hydrodynamique la relation entre les caractéristiques en acide gras des membranes cellulai-res des myes, la vitesse d’enfouissement et la capacité de rétention des myes dans le sédiment face à différen-tes vélocités de courant. D’un point de vue pratique, les résultats pourraient éventuellement inciter à fournir un supplément alimentaire de courte durée aux juvéni-les de myes en fin de croissance, juste avant l’ense-mencement en milieu naturel afin de minimiser les pertes par dispersion.

Environnement Environnement Environnement Environnement ---- Valeur AjoutéeValeur AjoutéeValeur AjoutéeValeur Ajoutée « Étude sur le mauvais goût des poissons produits en circuit fermé » (FQRNT-Actions concertées) Responsable : Grant Vandenberg (U. Laval) Collaborateurs : Yves Comeau (École Polytechnique de Montréal), Nathalie Le François (MAPAQ/UQAR), Rémy Lambert (U. Laval), Mourad Kharoune (ÉTS), Paul Lessard (U. Laval)

Ce projet vise à déter-miner les facteurs envi-ronnementaux (physico-chimiques, microbio-logiques et nutrition-nels) qui occasionnent l’apparition du mauvais goût (géosmine, MIB) chez le poisson d’éle-vage (en circuit fermé notamment) ainsi qu’à trouver une méthode rapide d’épuration du poisson. Il vise égale-ment à mettre au point

une méthode fiable et reproductible de mesure de la stabilité des fèces de poisson ainsi qu’à trouver un ad-ditif alimentaire peu coûteux permettant d’accroître leur stabilité. Le but du projet est de réduire les problè-mes environnementaux causés par les élevages inten-sifs de poisson tout en permettant de résoudre un pro-blème de qualité de la chair des poissons produits en

Dégagement d’enseignement et partici-Dégagement d’enseignement et partici-Dégagement d’enseignement et partici-Dégagement d’enseignement et partici-pation à la recherche pour chercheur col-pation à la recherche pour chercheur col-pation à la recherche pour chercheur col-pation à la recherche pour chercheur col-légiallégiallégiallégial Éric Tamigneaux, Professeur-chercheur, Halieu-tec (Centre collégial de transfert de technologie des pêches), École des pêches et de l’aquaculture du Qué-bec (anciennement Centre spécialisé des pêches), Cé-gep de la Gaspésie et des Îles

Toutes mes activités de R&D en aquaculture ont été rendues possibles, entre autres choses, grâce au déga-gement de ma tâche d’enseignement que m’a valu ma participation au RAQ ainsi qu’à la subvention de cher-cheur collégial fournie par le FQRNT. Ma principale collaboration directe avec des chercheurs du RAQ en 2007 a été d’assurer la co-direction de la thèse d’Auro-re Trottet (Impact de la mytiliculture sur les commu-nautés planctoniques de la lagune de Grande-Entrée, Îles-de-la-Madeleine (Québec)), en collaboration avec Réjean Tremblay (ISMER, RAQ). En tant que cher-cheur collégial, j’ai participé en 2007 à de nombreux projets en aquaculture, projets supportés financière-ment par divers organismes : i) suivi de captage du naissain de pétoncle géant dans la baie de Gaspé ; 2) optimisation de la croissance en cage modulaire de pétoncles collectés dans la baie de Gaspé; 3) l’essai d’un système de plateaux empilables pour l’élevage du pétoncle géant en baie de Gaspé et biocontrôle des salissures par l’oursin vert; 4) programme d’améliora-tion des pratiques mytilicoles; 5) optimisation des équipements de récolte en mer; et 6) essais de culture de l’algue brune dans la Baie des Chaleurs.

Réunion annuelle RAQ 2006 Une assistance attentive


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Grant Vandenberg (U. Laval) Visite au laboratoire du Dr Kenneth Cain (U. Idaho), octobre 2006

Une visite a été effectuée au début du mois d’octo-bre 2006 au laboratoire du Dr Kenneth Cain, spécialis-te en maladies de truite arc-en ciel et chercheur au Fish and Wildlife Resources, Aquaculture Research Institu-te, University of Idaho. Le Dr Cain a développé une expertise en immunologie des poissons, identification et caractérisation des antigènes et développement des vaccins pour prévenir des maladies. Cette rencontre a permis des discussions sur les maladies retrouvées chez la truite et les ombles et des approches thérapeuti-ques ont été abordées. Nous avons convenu de mettre en place une entente de collaboration de recherche sur le développement d’un modèle d’infection par voie orale pour le pathogène Flavobacterium psychrophi-lum, qui cause la maladie de l’eau froide chez la truite arc-en-ciel. Ces études vont commencer à l’automne 2007. Des échanges d’informations sur la quantifica-tion de réponse immunitaire mucosale chez la truite, faite de façon routinière au laboratoire du Dr Cain, vont par ailleurs continuer afin de promouvoir les étu-des sur l’interaction nutrition/immunologie à l’Univer-sité Laval.

Guy Claireaux, Institut des sciences de l’évolution de Montpellier, Sète (France) Visite à l’Institut des sciences de la mer de Rimouski, février 2007

Le Dr Claireaux a visité l’ISMER en février 2007 sur invitation de Céline Audet (UQAR/ISMER). Durant son séjour à Ri-mouski, trois objec-tifs principaux ont été réalisés. 1) Les

Dr Claireaux et Audet ont pu finaliser les analyses et l’interprétation d’un projet conjoint qui portait sur l’a-natomie cardiaque en fonction de différentes condi-tions d’élevage chez la truite arc-en-ciel. 2) Ils ont pla-nifié en collaboration avec Réjean Tremblay (UQAR/ISMER) et Louis Bernatchez (U. Laval) une série d’expériences en physiologie du poisson d’élevage visant à mesurer la vigueur hybride et utilisant le canal hydrodynamique mis au point par Réjean Tremblay. Ces discussions ont permis la venue de Mme Aurélie Dupont-Prinet au printemps 2007 pour la réalisation de ces travaux expérimentaux (voir section « Stages »). 3) Le Dr Claireaux a également présenté une conférence à l’ISMER intitulée (voir section « Conférences »). Pierre Boudry, IFREMER, La Tremblade (France)

Visite à l’Institut des sciences de la mer de Rimouski, février 2007

Cette mission, réalisée à l’invitation du Dr Réjean Tremblay de l’ISMER a été particulièrement remplie et a permis de remplir diffé-rents objectifs. 1) Participa-tion au comité de thèse de Bertrand Génard. Cette thèse est intitulée « Études physiologiques et génomi-ques des stades larvaires pré-métamorphiques chez l ’ h u î t r e a m é r i c a i n e (Crassostrea virginica) en relation avec la structure

des communautés bactériennes ». Les discussions ont notamment porté sur le déroulement de la thèse, sa

Échanges entre chercheurs québécois Échanges entre chercheurs québécois Échanges entre chercheurs québécois Échanges entre chercheurs québécois et chercheurs hors Québec, membres et chercheurs hors Québec, membres et chercheurs hors Québec, membres et chercheurs hors Québec, membres du réseaudu réseaudu réseaudu réseau

Le RAQ a également choisi de promouvoir les échanges avec les chercheurs hors Québec (CHH), membres du réseau, en fournissant une aide finan-cière pour des visites soit des CHH vers les labora-toires québécois, soit des membres québécois vers les laboratoires de ceux-ci et ainsi promouvoir nos activités sur le plan national et international. En 2007-2008, nous avons ainsi soutenu un certain nombre de ces échanges.


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valorisation en terme de publications et l’intérêt de réaliser des expérimentations complémentaires. La possibilité de réaliser de telles expérimentations à l’I-fremer a été évoquée. 2) Participation au comité de thèse de Nathalie Rayssac. Cette thèse est intitulée « Dispersion larvaire et succès de recrutement de la moule bleue (Mytilus spp.) en Gaspésie ». Les discus-sions ont notamment porté sur les analyses génétiques à venir et les problèmes liés aux microsatellites actuel-lement disponibles. 3) Présentation de mes travaux de recherche sous la forme de deux exposés à l’ISMER (voir Section « Conférences ». 4) Visite de la Station aquicole de Pointe-au-Père guidée par le Dr Réjean Tremblay qui m’a présenté les recherches qu’il y effec-tue, notamment dans le domaine de la nutrition et de la physiologie des bivalves. 5) Visite de l’Institut Mauri-ce-Lamontagne (Pêches et Océans Canada) guidée par le Dr Jean-Marie Sévigny avec emphase plus particu-lière sur le laboratoire de génétique et les installations expérimentales. Discussions sur les travaux menés par J-M Sévigny sur la génétique des populations de Pec-ten (en lien avec les travaux en cours à St Pierre et Miquelon) et de Mytilus (développement de nouveaux marqueurs microstellites). Discussions avec le Dr Mar-cel Fréchette sur l‘analyse de données expérimentales de compétition trophique chez. C. gigas. 6) Discus-sions avec le Dr Fabrice Pernet de l’Institut de recher-che sur les zones côtières à Shippagan sur les possibili-tés de développer des collaborations franco-canadiennes dans le domaine de la génétique et la phy-siologie en phase larvaire chez les bivalves. Frédéric Olivier, Muséum national d’Histoire na-turelle, Dinard (France) Séjour à l’Institut des sciences de la mer de Rimouski, avril 2007

Au cours de mon court séjour à l’ISMER/UQAR, j’ai principale-ment participé à des séances de travail avec les chercheurs et étu-diants membres du RAQ pour définir et discuter les stratégies d’échantillonnage asso-ciées à deux projets

majeurs, l’un portant sur l’étude de la variabilité inter-annuelle du captage des moules dans une lagune des Îles-de-la-Madeleine (co-direction de thèse doctorale de N. Toupoint inscrit à l’UQAR) et l’autre sur l’analy-

se du rôle des installations mytilicoles dans la structu-ration spatiale des communautés benthiques de subs-trats meubles de l’archipel des îles Chausey (co-direction de maîtrise de C. Grant inscrite à l’UQAR). Les multiples réunions que j’ai eu pendant cette semai-ne avec les Drs Réjean Tremblay (ISMER/UQAR), Fabrice Pernet (IRZC), P. Archambault (ISMER/UQAR) et C. Mc Kindsey (Pêches et Océans/IML) nous ont permis de mieux définir les stratégies d’é-chantillonnage de terrain, les protocoles des expérien-ces à mener et de régler de nombreux problèmes logis-tiques.

En outre, j’ai participé au traitement des données vélocymétriques acquises dans le canal hydrodynami-que de l’ISMER (avec I. Redjah), j’ai travaillé sur la rédaction d’articles de R. Gagnée (mémoire de maîtri-se, UQAR) sur l’amélioration des capacités de fixation des post-larves de Pectinidés et j’ai donné une confé-rence à l’UQAR sur le rôle du couplage physique-biologie sur la régulation des populations de recrues des invertébrés marins benthiques.

Philippe Archambault (UQAR/ISMER), Chris McKindsey (MPO/IML) Rôle des installations mytilicoles dans la structuration des communautés benthi-ques: cas des assemblages de l’archipel des îles Chausey, France, mai-juin 2007.

Le projet de maîtrise de Mme Cindy Grant (ISMER) est effectué en col laborat ion avec le Dr Fré-déric Olivier du Muséum natio-nal d’Histoire naturelle et le

Dr C.W. McKindsey de l’Institut Maurice Lamonta-gne. Nous avons développé un projet de recherche sur un habitat original et prépondérant (1/3 de l’estran meuble) d’un site à haute valeur patrimoniale, l’archi-pel des îles Chausey, France. Le projet a pour objectif d’étudier le rôle des installations mytilicoles (culture sur bouchot) dans la structuration spatiale des commu-nautés benthiques. Les hypothèse testées étaient les suivantes : i) la structure des assemblages benthiques diffère selon leur distance des bouchots et leur orienta-tion par rapport au courant principal (e.g. amont/aval) ;


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ii) le recrutement de l’endofaune est facilité au sein des concessions mytilicoles où l’intensité de l’hydrodyna-misme est diminuée ; et iii) la dynamique sédimentaire est modifiée par la présence des bouchots. Les perspec-tives d’un tel projet sont bien évidemment de proposer des éléments de gestion de cette activité à l’échelle de l’archipel.

Notre expertise (Aquaculture-environnement) a été sollicitée pour planifier le plan expérimental, effectuer l’échantillonnage et analyser les données. Dans ce contexte Chris McKindsey et Philippe Archambault se sont rendus en France entre le 9 mai et le 30 juin 2007 pour effectuer la campagne d’échantillonnage. Les échantillons ont été récoltés et seront analysés à l’IS-MER dans le cadre de la maîtrise de Cindy Grant. L’é-tudiante pour sa part est demeurée en France entre le début mai et juillet 2007. Cet échange a permis d’éta-blir une collaboration qui se renouvellera en 2008 pour la suite du projet. André Pauss, Université de Technologie de Com-piègne (France) Visite à l’École de Technologie Supérieure, juin2007

Cette mission avait pour objectif de discuter les

domaines de recherche dans lesquels des actions com-munes pourraient être entreprises, dans la problémati-que de l’environnement et du génie des procédés. Une convention cadre entre l’École de Technologie Supé-rieure et l’Université de Technologie de Compiègne sera bientôt signée. Cette convention prévoit que des actions communes de recherche et d’enseignement pourront êtres soutenues et encouragées entre deux ou plusieurs groupes de chercheurs appartenant aux deux entités. Cette mission s’inscrit dans cet esprit de colla-boration. Durant cette mission, M André Pauss a visité les installations de l’ÉTS, rencontré un grand nombre de chercheurs (M. Robert Hausler, M. Mourad Kharoune, Mme Lynda Kharoune, M. Frédéric Monette, M. Pa-trick Niquette), d’étudiants et M. Claude Olivier, Di-recteur des Affaires académiques et Directeur exécutif de l’ETS. Il a également présenté un séminaire (voir section « Conférences ». Cette mission a permis d’éla-borer un plan d’action de collaborations, tant sur le plan de la recherche que de l’enseignement. En ce qui concerne la recherche, des actions communes pourront être menées sur les thématiques de captation du CO2 et de mesures en ligne de composés azotés. Des proposi-tions de financement vont êtres entreprises en ce sens. En ce qui concerne l’enseignement, l’UTC aidera l’ETS pour la création à moyen terme d’un baccalau-

réat en bioprocédés.

ConférencesConférencesConférencesConférences En 2006-2007, le RAQ a organisé différentes confé-rences conjointement avec l’ISMER et l’ÉTS. Nous avons à la fois profité de la venue de nos collègues dans le cadre de nos échanges entre chercheurs, mais également invité d’autres conférenciers afin de contribuer à la diffusion des connaissances dans le domaine de l’aquaculture auprès d’un public plus large. Dans certains cas, le réseau a également aidé financièrement la venue d’étudiants RAQ en prove-nance de d’autres universités et qui désiraient assis-ter à ces conférences.

Thierry Chopin , U. of New-Brunswick (Nouveau-Brunswick) Développement de l’aquaculture intégrée multi-trophique (AIMT) poisons/algues/mollusques pour la durabilité environnementale, la diversification écono-mique et l’acceptabilité sociétale. Conférence donnée à l’ISMER, Janvier 2007. Guy Claireaux, Institut des sciences de l’évolution de Montpellier, Sète (France) Le taux de croissance chez les poissons : limitations d’ordre anatomique, physiologique et environnementa-le. Conférence donnée à l’ISMER, février 2007. Pierre Boudry, IFREMER, La Tremblade (France) Variance du succès reproducteur chez les huîtres plates et creuses: implications en génétique des populations et pour la production en écloserie. Conférence donnée à l’ISMER, février 2007. Génétique des populations et variance du succès repro-ducteur chez l’huître plate européenne (Ostrea edulis). Conférence donnée à l’Institut Maurice-Lamontagne, février 2007. Frédéric Olivier , Musée national d’Histoire natu-relle, Dinard, France Rôle du couplage Physique/Biologie en couche limite benthique: régulation des populations de recrues d’in-vertébrés marins. Conférence donnée à l’ISMER, avril 2007. Frédéric Guichard, Université McGill


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Échelles spatiales définissant la connectivité des éco-systèmes côtiers: de l’individu aux métapopulations. Conférence donnée à l’ISMER, avril 2007. Chris Parrish , U. Memorial (Terre-Neuve) Lipids in fish biochemistry and physiology. Conféren-ce donnée à l’ISMER, avril 2007. André Pauss, Université de Technologie de Com-piègne (France) On-line monitoring of nitrate, nitrite and soluble COD by UV spectrophotometry in a SBR process used for the treatment of industrial wastewaters. Conférence donnée à l’ÉTS, juin 2007.

Activités de transfertActivités de transfertActivités de transfertActivités de transfert Un des mandats du RAQ est de permettre le trans-fert des résultats de recherche vers les partenaires et le secteur en général. Si les activités scientifiques usuelles permettent le transfert des connaissances vers la communauté scientifique internationale, el-les ne sont pas toujours les plus aptes pour rejoindre les secteurs d’application. En 2006-2007, nous avons donc organisé ou participé à la réalisation d’une série d’événements ou d’actions qui visaient à réaliser cette partie de notre mandat.

Réunion annuelle du RAQ La première réunion annuelle du RAQ en tant que Re-groupement stratégique FQRNT a eu lieu le 6 novem-bre 2006. Lors de cette réunion qui regroupait 65 parti-cipants, 11 présentations orales et 22 affiches ont été présentées illustrant les travaux du regroupement dans ses différents champs d’activité. Rencontre de transfert technologique à l’industrie RAQ/SODIM Le 7 novembre 2006, le RAQ a organisé conjointement avec la SODIM, une journée de transfert technologique axée vers la mariculture et regroupant 87 personnes. Un conférencier invité, M. Yves Bastien (Pêches et Océans Canada), a donné la conférence d’ouverture et 11 présentations orales ont été données en présence des représentants de l’industrie maricole. Cette journée a également été filmée et un DVD a été préparé et distri-bué par la SODIM aux producteurs n’ayant pu se ren-dre à Rimouski. 6ième Journée Pisciculture Phosphore Cet événement est organisé annuellement par le groupe de recherche intéressé par la problématique environne-mentale liée à la production piscicole en eau douce. Le RAQ est fier de s’être associé financièrement à la te-

Rencontre de transfert technologique à l’industrie RAQ/SODIM

Stéphane Morissette, Président du regroupement des mariculteurs du Québec, Yves Bastien, Pêches et Océans Canada, Serge Demers, Directeur de l’ISMER, Céline Au-

det, Directrice scientifique du RAQ, Réjean Allard, Président de la SODIM


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nue de cette réunion qui a eu lieu à l’École Polytechni-que de Montréal et qui comptait 46 participants. Du-rant cette journée, 15 conférences ont été présentées. Décembre 2006. 4ième colloque international du Réseau Atlantique Cet événement, organisé par le Centre interinstitution-nel de recherche en écotoxicologie, ECOBIM, s’est tenu à l’UQAR/ISMER, du 30 mai au 1er juin 2007. Le RAQ a participé en fournissant des bourses de voyage à des étudiants étrangers impliqués dans la recherche en conchyliculture et intéressés à participer à cet évé-nement. Canadian Aquaculture Research and De-velopment Review Cette présentation résumée et vulgarisée de 200 projets scientifiques a été coordonnée par Tim DeJager et pro-duite et financée conjointement par le British Colum-bia Aquaculture Research and Development Commit-tee, Pêches et Océans Canada (PCRDA), AquaNet, l’Institut des biosciences marines (CNRC), le Centre for Fisheries Innovation et le RAQ. Cette publication permet de publiciser l’ensemble des travaux de recher-che effectués dans le secteur de l’aquaculture au Cana-da. AquaPort En 2006-2007, le RAQ a participé activement au projet

AquaPort, projet soutenu financièrement par AquaNet (Réseau des Centres d’excellence). Ce projet, sous la gouverne de Tim DeJager, a permis de colliger une importante somme de documents d’intérêt pour l’in-dustrie aquicole canadienne. Andréane Bastien, étu-diante au 3ième cycle, a participé à cette collecte de données en s’intéressant particulièrement au contenu francophone. L’atelier de travail tenu en mars 2007 à Nanaimo (CB) a permis de jeter les bases pour la créa-tion « d’un portail d’échange du savoir pour l’aqua-culture au Canada ». Toute l’information au sujet d’A-quaPort et de son développement est disponible à l’a-dresse suivante : http://www.aquaport.ca/ Éthique Dans le cadre de ses travaux sur la responsabilité so-ciale des producteurs aquacoles, l’équipe du Dr Létour-neau (U. Laval) a réalisé une série d’entrevues télépho-niques avec producteurs et intervenants divers. Le RAQ a contribué financièrement à la transcription de ces entrevues. Juin 2007. Refonte du site WEB du RAQ Afin de faciliter la communication de nos activités et des retombées de celles-ci avec nos membres et parte-naires, nous avons procédé à une refonte de notre site Web. Ce processus se veut une activité continue et vous êtes tous invités à nous faire part de vos commen-taires afin d’améliorer cet important outil de communi-cation.

Réunion annuelle RAQ 2006 Éric Normandeau, Guillaume Côté et Jesús Mavárez


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Articles publiés en 2006Articles publiés en 2006Articles publiés en 2006Articles publiés en 2006 Aubin-Horth N., J.-F. Bourque, G. Daigle, R. Hedger & J.J. Dodson. 2006. Longitudinal gradients in threshold sizes for alternative male life history tac-tics in a population of Atlantic salmon (Salmo salar). Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 63: 2067-2075. Bellier N., F. Chazarenc & Y. Comeau. 2006. Phos-phorus removal from wastewater by mineral apatite. Water Research, 40: 2965-2971. Dautremepuits C., M. Fortier, S. Croisetière, P. Belhumeur & M. Fournier . 2006. Modulation of ju-venile brook trout (Salvelinus fontinalis) cellular im-mune system after Aeromonas salmonicida challenge. Vet. Immunol. Immunopathol, 110: 27-36. Drizo A., C. Forget, Y. Comeau & R. Chapuis. 2006. Phosphorus removal by steel slag and serpen-tinite. Water Research, 40: 1547-1554. Dupla M., Y. Comeau, S. Parent, R. Villemur & M. Jolicoeur. 2006. Design optimization of a self-cleaning moving bed bioreactor for seawater denitrifi-cation. Water Research, 40: 249-258. Gauthier-Clerc S., J. Pellerin & J.C. Amiard. 2006. Estradiol-17ß and testosterone concentrations in the gonad of male and female soft-shell clam Mya arenaria (Mollusca bivalva) during gametogenesis. General and Comparative Endocrinology, 145: 133-139 Gauthier-Clerc S., J. Pellerin, M. Fournier M & J.C. Amiard. 2006. Immunological and biochemical responses in Mya arenaria (Mollusca bivalva) exposed in vivo to 17ß–estradiol. Comparative Biochemistry and Physiology Part C, 144: 228-234. Guyondet T., V.G. Koutitonsky & S. Roy. 2006. Effects of water renewal estimates on the oyster aqua-culture potential of an inshore area. Journal of Marine Systems, 58: 35-51. Laurin V., N. Labbe, P. Juteau, S. Parent & R. Vil-lemur R. 2006. Long-term storage conditions for carri-ers with denitrifying biomass of the fluidized, metha-nol-fed denitrification reactor of the Montreal Bio-dome, and the impact on denitrifying activity and bac-terial population. Water Research, 40: 1836-1840. McKindsey CW. 2006. La mariculture peut-elle aug-menter la productivité des écosystèmes? Le Naturaliste

Canadien 130: 69-73.

Ouellet-Plamondon C., F. Chazarenc, J. Brisson & Y. Comeau. 2006. Artificial aeration to increase pol-lutant removal efficiency of constructed wetlands in cold climate. Ecological Engineering, 27: 258-264. Pernet F., R. Tremblay, C. Gionet & T. Landry. 2006. Remodeling of lipids in wild and selectively bred hard clams at low temperature in relation to ge-netic and physiological parameters. The Journal of Experimental Biology, 209: 4663-4675. Richard M., P. Archambault, G. Thouzeau & G. Desrosiers. 2006. Influence of suspended mussel lines on biogeochemical fluxes in adjacent water in Îles-de-la-Madeleine (Quebec, Canada). Can. J. Fish. Aquat. Sc., 63: 1198-1213. Roberge C., S. Einum, H. Guderley & L. Ber-natchez. 2006. Rapid evolutionary changes of gene transcription profiles in farmed Atlantic salmon. Mo-lecular Ecology. 15: 9-20. Shoemaker C., G.W. Vandenberg, A. Desormeaux, P. Klesius & J. Evans J. 2006. Efficacy of a Strepto-coccus iniae modified bacterin delivered using Oral-ject™ technology in Nile tilapia (Oreochromis niloti-cus). Aquaculture, 255: 151-156.

Rapports publiés en 2006Rapports publiés en 2006Rapports publiés en 2006Rapports publiés en 2006 Archambault P. & P. Goudreau. 2006. Effect of the commercial fishery on the Ile Rouge Iceland scallop (Chlamys islandica) bed in the St. Lawrence estuary: assessment of the impacts on scallops and the benthic community. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2006/079. Belvin S., R. Tremblay, M. Roussy & S. McGlad-dery. 2006. Induction de la mortalité par l'injection de tissus provenant de Pétoncle géant, Placopecten ma-gellanicus, moribonds. MAPAQ, C MAPAQ, DIT, Rapport de recherche-développement N°144, 34p Bourque F. & B. Myrand . 2006. Étude descriptive du dégrappage en milieu lagunaire aux Iles-de-la-Madeleine. Rapport de recherche-développement No. 152. Les publications de la Direction de l’innovation et des technologies. Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec, Gaspé, 9 pp. Cranford P., R. Anderson, P. Archambault, T. Balch, S. Bates, G. Bugden, M.D. Callier, C.


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Carver, L. Comeau, B. Hargrave, G. Harrison, E. Horne, P.E. Kepay, W.K.W. Li, A. Mallet, M. Ouellett & P. Strain. 2006. Indicators and thresholds for use in assessing shellfish aquaculture impacts on fish habitat. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2006/034. Chevarie L. & B. Myrand (éd.). 2006. Programme de recherche-développement en myiculture aux Iles-de-la-Madeleine (Programme MIM)- 2003. Compte rendu No 28. Les publications de la Direction de l’innova-tion et des technologies. Ministère de l’Agriculture, des pêcheries et de l’Alimentation du Québec, Gaspé, 50 pp. : Chevarie L. & B. Myrand (éd.). 2006. Programme de recherche-développement en myiculture aux Iles-de-la-Madeleine (Programme MIM) 2000-2002. Compte rendu No 19. Les publications de la Direction de l’in-novation et des technologies. Ministère de l’Agricul-ture, des pêcheries et de l’Alimentation du Québec, Gaspé, 71 pp. Drouin A., P. Sirois P & P. Archambault. 2006. Structure des communautés d’invertébrés et des espèces d’amphibiens dans des lacs avec et sans omble de fontaine (Salvelinus fontinalis) en forêt boréale. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 2628:vii + 40p. Landry T., M. Skinner, A. LeBlanc, D. Bourque, C. McKindsey, R. Tremblay, P. Archambault, L. Comeau, S. Courtenay, F. Hartog, M. Ouellette & J.M. Sévigny. 2006. A scientific review of bivalve aquaculture: interaction between wild and cultured species. In: Fisheries and Oceans Canada 2006. A Sci-ent ific Review of the Potential Environmental Effects of Aquaculture in Aquatic Ecosystems. Volume V. Can. tech. rep. fish. aquat. sci. 2450: 80-120. Moreau V., B. Thomas & R. Tremblay. 2006. Distri-bution de Mytilus edulis et de Mytilus trossulus dans les régions maritimes de l’Est du Québec et des Mari-times entre 1999 et 2001. MAPAQ, DIT, Rapport de recherche-développement N°153, 13p. Tamigneaux É. 2006. Programme d’amélioration des pratiques mytilicoles, phase II. Rapport final. SODIM, 45 p. Vandenberg G.W. 2006. Towards a more efficient and sustainable aquaculture industry. CRSNG. Rapport final. 24 p. Weir L.K., I.A. Fleming, C.L. Podemski, P.J. Blanchfield, T. Landry, M. Skinner, A. LeBlanc, D. Bourque, C. McKindsey, R. Tremblay, P. Archam-

Mémoires déposés en 2006Mémoires déposés en 2006Mémoires déposés en 2006Mémoires déposés en 2006 Faye, Aliou. Avril 2006. Profil endocrinien de mâles d’omlbes (Salvelinus fontinalis et Salvelinus alpinus) en fonction ou non d’apparition de maturation sexuelle précoce. Université du Québec à Rimouski. Guillemart, Céline. Décembre 2006. Accumulation du cadmium chez le Pétoncle géant et le Pétoncle d’Islan-de de la Côte-Nord du Saint-Laurent (Québec). Univer-sité du Québec à Rimouski. Lefrant, Annabelle. Septembre 2006. Résistance des ombles (Salvelinus fontinalis et Salvelinus alpinus aux infections bactériennes opportunistes en milieu marin. Université du Québec à Rimouski. Swan, Kim. Juin 2006. The effect of clubbed tunicate (Styela clava) treatments on the physiological fitness of juvenile cultured blue mussel (Mytilus edulis) in Prince Edward Island, Canada. Atlantic Veterinary College.

Thèses déposées en 2006Thèses déposées en 2006Thèses déposées en 2006Thèses déposées en 2006 Richard, Marion . Décembre 2006. Influence de l’a-quaculture sur les flux biogéochimiques dans le cou-plage pelagos-benthos : Îles-de-la-Madeleine (Québec, Canada). Université du Québec à Rimouski.

bault, L. Comeau, S. Courtenay, F. Hartog, M. Ouellette & J.M. Sévigny. 2006. A Scientific Review of the Potential Environmental Effects of Aquaculture in Aquatic Ecosystems. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. Vol : 2450 : 1-138.

Participants à la journée Phosphore 2006 École polytechnique, décembre 2006

rapport annuel 2006-2007 - uqar

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