nf- b : simulations stochastiques alain lilienbaum umr 7000 groupe « voies de signalisation du...
TRANSCRIPT
NF-B : simulations stochastiques
Alain Lilienbaum
UMR 7000Groupe « Voies de signalisation du stress du cytosquelette »Faculté de médecine La Pitié - Salpétrière 105, bd. de l’hôpital 75013 PARIS
GENE A
Start Stop
Eléments de contrôle
Signaux
AAA A
AA
A
A
ARNmessager
Protéines
LE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-BLE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-B
Transcription
Traduction
FACTEURS DE TRANSCRIPTION
Rôles Biologiques du Facteur NF-BRôles Biologiques du Facteur NF-B
- Réponse immunitaire
- Inflammations
- Survie face aux stress (oxydoreductions, ionisations,…)
- Traumatismes neurologiques, maladie d’Alzheimer,
maladie de Parkinson, cancers, arthrites rhumatoïdes.
- Plus d’une centaine de gènes « cibles » identifiés.
- Recherche d’agents inhibiteurs spécifiques.
Agents mitogènes Cytokines Produits viraux et bactériensFacteurs de stress
PMA,Facteurs de croissance…
TNF,IL1, IL2…
VIH, HTLV IEBV, CMV…
ROS, UV, RXTaxol…
NF-BNF-B
Immuno Récepteurs Cytokines, F.C. Redox.Adhérence cellulaire Virus
TNF,IL2, IL6, IL8…
CMH,TCRIL2R…
ELAM1VCAM1ICAM1
SODNOS-iGST
VIHCMVSV40
NF-B
IKKNIK
PAK
MEKK
PKC NAK
LPS Mitogènes TGF
TAK
T R Cytokines
Gènes cibles
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène C
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
SIGNAUX
Récepteurs
Voies designalisation Gène A
Gène B
Gène C
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
SIGNAUX
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène C
Voies designalisation
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène C
IB
p50 p65
IB
(p52, c-Rel, RelB)
(IBIBBcl3, p105, p100)
p50 p52
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Immunoglobulines Ig : GGGACTTTCC
c-myc : GGGAAAACCC
TNF : GGGAATTCAC
IL8 : GGAATTTCCT
SITES DE FIXATION DE NF-B
NF-B actif (nucléaire)
temps (h)0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène IB
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène C
RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B
Récepteurs
Gène A
Gène B
Gène C
t < tmax
n (Réaction n)
t = t +
Réaction n :(A + B -> AB)
A = A - 1B = B - 1AB = AB + 1
FonctionPseudo-aléatoire
30 + 31
32 + 33
34 + 35
36 + 37
38 + 39
40 + 41
42 + 43
44 + 45
46 + 47
48 + 49
50 + 51
52 + 53
54 + 55