LES PYGMÉES SONT-ILS PROCHES DES POPULATIONS

BANTOUPHONES?

Travaux d’étude et de recherche

Mohamed Aziz Mezlini

Plan

1 - Contexte :

Pygmées et bantous

Les données

2 - Approche analytique directe :

Structure : fonctionnement

Exemples

Résultats

3 - Approche indirecte :

Les simulations

Ms : fonctionnement

Méthode de simulation

Modèles

Résultats

4 - Résultats finaux

5 - Conclusion

Les pygmées Les bantous

Chasseurs-cueilleurs

, Nomades dans la forêt équatoriale.

Vivent (ou vivaient) en tribus relativement isolées.

Particularité: petite taille 1,45 m en moyenne

Agriculteurs-éleveurs sédentaires.

Très grande expansion (diaspora) après la découverte de l’agriculture(6000ans).

Présents dans une grande partie de l’Afrique centrale.

Contexte général

Les données

Microsatellites.

Données génétiques mondiales sur 377 locus, 52 populations et 1056 individus.

Deux populations pygmées différentes.

Plan

1 - Contexte :

Pygmées et bantous

Les données

2 - Approche analytique directe :

Structure : fonctionnement

Exemples

Résultats

3 - Approche indirecte :

Les simulations

Ms : fonctionnement

Méthode de simulation

Modèles

Résultats

4 - Résultats finaux

5 - Conclusion

Structure : fonctionnement

Entrées :

Données génétiques des individus

K= nombre de populations

Sortie :

Répartition des individus sur K populations de la manière la plus vraisemblable.

Intérêt : ne prend en compte aucun à priori (géographie, ordre des données…)

Exemple B

an

tou

s

Afr

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K = 15

Résultats

Populations d’Afrique

K=3

K=3

K=5

Biaka Mbuti Bantou San Yoruba Mandenka

Biaka Mbuti Bantou San

Biaka Mbuti Bantou San

Résultats

K=2

K=5

Biaka Mbuti San

Biaka Bantous San

Conclusions

Les pygmées et les bantoues sont deux populations distinctes (malgré la proximité géographique).

Les pygmées ne forment pas une population homogène; les Biaka et les Mbuti sont deux populations distinctes.

Plusieurs interrogations…

Plan

1 - Contexte :

Pygmées et bantous

Les données

2 - Approche analytique directe :

Structure : fonctionnement

Exemples

Résultats

3 - Approche indirecte :

Les simulations

Ms : fonctionnement

Méthode de simulation

Modèles

Résultats

4 - Résultats finaux

5 - Conclusion

Ms : fonctionnement

Entrées:

Nombre d’individus et de locus, taux de mutation.

Configuration (populations, dates de divergences, évènements)

Génère aléatoirement l’arbre généalogique.

Distribue aléatoirement des mutations sur l’arbre.

Sortie: Génotypes des individus finaux résultants.

Méthode

Simuler une configuration plusieurs fois avec Ms.

Comparer les résultats (populations) aux données réelles.

Décider de rejeter ou pas le modèle (configuration).

Méthode : Ce que cela implique

« Nettoyer » les données réelles.

Définir des ensembles de configuration (modèles) à simuler.

Définir le critère de comparaison à la réalité :

Ici 11 statistiques différentes sur les populations (réelles et générées par simulation).

Modèle Une configuration du modèle

Modèles

220000 ans

67000 ans

22000 ans

96000 ans 84000 ans

150000 ans

40000 ans

Il y a 15 modèles Il y a une infinité de configurations

Résultats

Quelques modèles rejetés en entier, sinon il y a toujours des configuration vraisemblables pour les autres modèles.

Une configuration qui se rapproche plus que les autres de la réalité.

On affine encore en ajoutant des évènement, des migrations….

Meilleur modèle / configuration

Remarque:

-Assez cohérent car le pygmées sont plus proches entre eux que des autres populations.

Questions:

-Divergence San 220000 ans??!!

-Migration unidirectionnelle ?

(bantou pygmées)

Plan

1 - Contexte :

Pygmées et bantous

Les données

2 - Approche analytique directe :

Structure : fonctionnement

Exemples

Résultats

3 - Approche indirecte :

Les simulations

Ms : fonctionnement

Méthode de simulation

Modèles

Résultats

4 - Résultats finaux

5 - Conclusion

Résultats finaux

Réponse.

L’à priori de relation privilégiée San-Mbuti non confirmé.

Les San (bochimans), une population ancestrale?

(origine du sud-ouest de l’Afrique?)

Remise en cause de la date d’apparition de l’homme moderne? (Actuellement 200000 ans)

Conclusion

Critique du paquetage microsat de Ms

Apports du TER

Merci.