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Module 2, TD 1

Utiliser un logiciel de gestion de références bibliographiques : Zotero

Marie-Laure Malingre

URFIST Bretagne / Pays de la Loire

Février 2013

Maîtrise de l’information scientifique en Doctorat 2012-2013 - URFIST de Rennes / SCD Rennes 2

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Quels besoins ?

Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web)

Exploiter facilement de gros corpus de références

Récupérer ses références pour la rédaction d’un travail scientifique pour l’élaboration rapide d’une bibliographie

Pouvoir appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes (thèse, revues scientifiques)

Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer

Partager et collaborer

3

Que peut-on faire avec Zotero ?

… Etc.

Bibliographie

1__________2__________3__________4__________5__________

Article avec citations et bibliographie

Pages web

Base Zotero de références et PDF

biblio en ligne, groupes

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Travailler avec Zotero

Qu’est-ce que Zotero ?

Comment installer Zotero ?

L’interface de travail

Importer des références

Créer et manipuler des références

Classer, organiser, gérer ses références

Gérer les documents correspondant aux références

Choisir un style et produire une bibliographie

Utiliser zotero en travaillant sur un traitement de texte

Exporter ses références

Synchroniser ses références

Partager ses références et travailler à plusieurs

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Qu’est-ce que Zotero ?

Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université George Mason (USA)

Téléchargement de la version 3 synchronisation et accès aux

références en ligne via le serveur Zotero

Modification de la bibliothèque en ligne

Une extension (plugin) de Firefox

OU

Une application autonome : Zotero Standalone Utilisation possible avec Firefox,

Chrome, Safari grâce à des connecteurs correspondants

Windows, Mac, Linux

Open source : logiciel libre et gratuit

Un outil de gestion de références et de signets

Site de référence : http://www.zotero.org

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Fonctionnalités de Zotero

Zotero permet principalement de :

Constituer sa base personnelle de références en saisissant ou important les données

Organiser sa base, trier, classer ses références Annoter ses références Rechercher des références précises dans sa base Gérer le texte intégral Produire automatiquement sa bibliographie dans un style

donné Récupérer des références pour intégrer des citations et sa

bibliographie en rédigeant sur un traitement de texte Exporter ses références

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Fonctionnalités de Zotero

Mais aussi :

D’accéder à sa base de références où qu’on soit via le serveur Zotero,et depuis peu de la modifier en ligne

De détecter automatiquement les métadonnées du PDF De créer des groupes De diffuser et partager sa base de références De suivre d’autres personnes sur le serveur Zotero (Zotero

People) De restaurer sa bibliothèque de références D’ajouter des styles depuis le gestionnaire de styles

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Installer Zotero

Module principal, depuis http://www.zotero.org

Citation pendant la rédaction : Installation complémentaire du module d’interfaçage avec le

traitement de texte (Word / Open Office / Libre Office)

Après l’installation de Zotero : redémarrer Firefox Icône Zotero en bas à droite de l’écran + Menu Outils > Zotero

Sous Firefox :

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Installer / activer Zotero

Pour activer / désactiver Zotero

Menu « Outils > Modules complémentaires » de Firefox

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Installer / activer Zotero

Si l’on a à utiliser un autre logiciel bibliographique en parallèle : Utiliser les Préférences >

Générales Décocher « Utiliser

Zotero… » Cliquer sur « Mettre à jour

maintenant »

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Premières références Zotero

Récupération de références

Ex : requête « identité / écriture littéraire» sur le SUDOC, http://sudoc.abes.fr

Récupération d’un lot de références : cliquer sur le dossier

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Premières références Zotero


Sélectionner les références que l’on souhaite récupérer

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Premières références Zotero.


Références récupérées dans Zotero

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L’interface de travail de Zotero

L’interface de Zotero : en 3 panneaux

La bibliothèque et ses collections

La liste des références d’une collection donnée

Le détail de la référence sélectionnée

+ la barre d’outils et le panneau des marqueurs

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Bibliothèque et ses

collections

Liste des signets / références

Une référence

Panneau des

marqueurs

+ Requêtes

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La barre d’outils

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La barre d’outils

Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)

Créer un nouveau groupe

Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences …

Nouveau document

(= référence) : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral

Créer un nouveau document (= référence) à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d’écran est liée à la notice

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La barre d’outils

Créer une référence à partir de l’identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID)

Créer une note, indépendante ou liée à la référence

AttacherUne capture de la page couranteLe lien vers la page couranteUne copie d’un fichierLe lien vers le fichier

Recherche dans la base Recherche avancéeBoîte de recherche simple

Synchronisation des données avec le serveur Zotero

Passage en mode plein écran

Fermeture de l’interface

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Actions > Préférences dans la barre d’outils

1er onglet : Préférences générales

Les préférences de zotero

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8ème onglet : Préférences avancées

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Importer des références Sites « Zotero compatibles » :

voir http://www.zotero.org/translators ex : SUDOC, Google Scholar et Books, Persée, CAIRN, JSTOR,

Revues.org, ScienceDirect, Bases Ebsco Host, BHA et RILA, BNF …

Plateformes de partage de références comme CiteUlike, Connotea

Icone dans la barre d’adresse

Sites partiellement compatibles (ex : HAL)

Récupération sur les sites compatibles de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans

barre d’adresse)

référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)Source des images :

Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier

22


Import d’un ensemble de références

Import de références individualisées

Alimenter la base en choisissant diverses sources

Chaque type de document est identifié par une icône particulière

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Problème : Pas d’icône zotero dans la barre d’adresse Échec de l’enregistrement

Une solution : Enregistrer les résultats sous forme d’un fichier au format RIS ou

BibTeX Importer ensuite le fichier dans Zotero Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les

fichiers RIS/ Refer téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero

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Importer des références Possibilité dans certains

cas de créer la référence à partir du fichier PDF Sauvegarder le fichier PDF

en local

Le faire glisser dans la bibliothèque Zotero

Le sélectionner et choisir dans le menu contextuel (clic droit) : « Récupérer les métadonnées du PDF »

La référence est créée

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Ajouter un élément par son identifiant ISBN, DOI, PMID

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Par l’ISBN

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Récupération du texte intégral du document

Récupération du fichier PDF associé à la référence

1/ par glisser / déposer2/ en attachant une copie du fichier 3/ en joignant le lien vers le fichier

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Références de pages web

Création d’un élément à partir de la page web courante (métadonnées)

Capture d’écran État de la page à un

moment donné

Choisir la collection adéquate

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Références de pages web

Attacher à une référence existante :

Une capture de la page courante

Un lien vers la page courante

La copie d’un fichier local Le lien vers un fichier

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Manipuler les captures de pages webIl est possible d’annoter et de surligner les captures web

31


Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels

Ex : formats RIS, bibteX

Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique

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Une référence complète : onglet info

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Créer une nouvelle référence

34


La référence

Onglet Info = les différents éléments de la référence Localiser : résolveur de lien Afficher … : la capture d’écran, le fichier, la page

Onglets Marqueurs = possibilité d’apposer des tags (mots clés libres) sur une référence

Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes)

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La référence Affichage

Afficher en ligne, afficher la capture d’écran liée à une référence, Afficher le PDF

Localisation Recherche dans la bibliothèque (Worldcat) CrossRef Lookup > avec ISBN (ou en utilisant Google

Scholar par exemple, voir « Gérer les moteurs de recherche »)

Localiser le fichier PDF

Pour lancer le résolveur de lien OpenURL à partir des données bibliographiques de l’élément

Voir les préférences avancées de Zotero pour le paramétrage du serveur de résolution

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Le résolveur de liens permet de diriger l’utilisateur vers le texte intégral du document à partir de la référence bibliographique correspondante

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Menu déroulant

34 types de références

Les types de référence

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Créer et manipuler des références Ensemble de champs pour chaque type de

référence

39


Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés

Zone de modification des éléments

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Modifier une référence

Modification d’un champ

Ajout de données supplémentaires

41

Classer, organiser, gérer ses références Ma bibliothèque

Contient toutes les références

42


Gestion des collections de la bibliothèque Créer une collection /

des sous-collections Nouvelle sous-

collection Renommer la collection Supprimer la collection Exporter la collection Classer les références

Clic droit

C’est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d’éléments par glisser-

déposer dans une collection

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Gestion de la base personnelle

Modification de référencesGestion du texte intégralRecherche dans la baseTri des noticesAjout de notes de lectureAjout de tags (marqueurs)Export de la bibliothèque de référencesLien de deux notices

44

Classer, organiser, gérer ses références Enrichir ses références : annoter ses collections de

références Ajouter un tag

Afficher les tags et rechercher

par tag

45


Créer une note indépendante ou liée à une référence

Zone de création de la note

46


Capturer la page courante : page figée

Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page

Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero

Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)

Gérer les documents associés à la référence

47


Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée

Afficher le document

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Classer, organiser, gérer ses références Recherche des références

Fenêtre de recherche avancée, accessible par la barre d’outils

Possibilité d’enregistrer la recherche / création d’un dossier correspondant

Lors de la mise à jour de la base, les nouvelles références correspondant à la requête seront automatiquement classées dans ce dossier

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3ème onglet : Recherche, pour indexer et rechercher dans les documents en texte intégral qu’on a associés aux références

Rechercher dans le texte intégral des documents associés

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Pour rechercher dans les documents associés, sélectionner « Contenu de la pièce jointe »

51


Créer une chronologie Menu Actions

52

Exporter la bibliothèque

Menu Actions > Exporter la bibliothèque

Formats d’export :

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Produire une bibliographie

Création d’une bibliographie À partir d’une collection donnée, d’une sous-collection,

d’éléments sélectionnés. Formatage dans un style donné (styles par défaut + page

Repository pour les styles : http://www.zotero.org/styles ) Langage CSL, adaptation du XML

Passerelle avec les traitements de texte Avec Word et Open Office Choix d’un style Insertion de citations Génération de la bibliographie

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Générer automatiquement une bibliographie

En utilisant le menu contextuelà partir d’une collection, sous-collection ou des références sélectionnées(clic droit) :« Créer une bibliographie… »

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Formater sa bibliographie Utilisation des styles fournis par Zotero

Enregistrement en format RTF ou HTML

Choisir un style parmi ceux proposés

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57



4ème onglet : Exportation : paramétrer les options de copie rapide et l’encodage des caractères

Utilisation : glisser-déposer ou Ctrl+Alt+C et coller des références sélectionnées dans une page

Autre possibilité

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5ème onglet : Citer, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie

Les paramètres de style

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Pour chercher d’autres styles dans le Répertoire Zotero de Styles

Pour récupérer un style stocké en local

Le Gestionnaire de styles

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Le Répertoire de styles

Aperçu du styleIntitulé du style

Rechercher un styleStyles par domaines ou formats

Installer un style

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Produire une bibliographie Styles Zotero

Choix de styles par défaut dans l’interface (15 styles)

Voir aussi http://www.zotero.org/styles Possibilité d’installer d’autres styles : 1713 styles disponibles Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien

Actuellement, pas d’interface graphique de modification ou de création de style

Création de style avec le langage CSL Le générateur CSL de Zotero :

chrome://zotero/content/tools/csledit.xul

62

Produire un rapportOption du menu contextuel : « générer un rapport à partir de la collection »

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Utiliser Zotero dans Word ou Libre Office / Open Office

Plugin spécifique pour installer la barre d’outils Zotero dans le traitement de texte

Lié aux versions du système d’exploitation et du traitement de texte

Installation d’une barre d’outils dans le traitement de texte

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Utiliser Zotero dans Word ou Libre Office / Open Office Citer dans un traitement de texte depuis Zotero

Barre d’outils Zotero dans

Word

Editer et modifier une

citation

Insérer une citation

Créer la bibliographie à partir des citations insérées

Editer la bibliographie insérée

pour la modifier

Modifier les préférences du document

Mettre à jour les références (citations et bibliographie) à

partir des modifications faites

dans Zotero

Supprimer le lien entre

Zotero et le document

65


Si la barre Zotero n’apparaît pas dans le traitement de texte…

Dans Firefox, aller à :

Outils > Modules complémentaires > Extensions

Cliquer sur Options, puis sur « Reinstall Word Add-in » pour Word par ex.

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Après avoir défini les Préférences du Document (choix du style, du mode de citation

1. Cliquer sur l’icône d’insertion2. Sélectionner la référence pour insérer la citation

12

67


Création de la bibliographie

- Pour générer la 1ère référence bibliographique correspondant à la citation- Les références suivantes sont ensuite automatiquement insérées, au fur et à mesure des citations

Pour changer ensuite le style du document

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Utiliser Zotero en ligne

Pour utiliser zotero en ligne,il faut :

Se créer un compte sur le serveur Zotero, qui permet :

l’accès à sa bibliothèque personnelle (My Library) l’accès aux groupes créés (zotero Groups) l’accès au « réseau social » (Zotero People)

On pourra alors : synchroniser ses références les modifier en ligne [Récent] partager ses références et créer des bibliothèques

collectives

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Fonctions collaboratives : Zotero 2.0

La synchronisation :

Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero

Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero

Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav / Zotero

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Utiliser Zotero en ligneBouton de synchronisation

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2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne

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Utiliser Zotero en ligne Synchronisation des données

Paramétrage de la synchronisation

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La bibliothèque en ligne

Gratuit jusqu’à 300mb

Attention : problème des PDF partagés en public

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Utiliser Zotero en ligneCréation de groupes

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Les groupes sur Zotero

Consulter, rechercher, créer des groupes

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Utiliser Zotero en ligne Définition du groupe :

Nom Description Statut Disciplines concernées Logo, image Page web Commentaires

Gestion des membres

Options pour la gestion de la bibliothèque

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Un exemple : la bibliothèque du groupe Aesthetics and the National Parks

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Utiliser Zotero en ligneAccès aux Bibliothèques de groupes Zotero sur le plugin Firefox

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Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis

Réseaux de personnes

Intégration de groupes publics et / ou suivi de bibliothèques publiques par flux RSS

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Quelques ressources sur Zotero

Le site de Zotero, http://www.zotero.org En particulier fr/quick start guide

Le blog francophone de Zotero, http://zotero.hypotheses.org Le tutoriel de Julien Sicot, sur Formadoct, http://guides-

formadoct.ueb.eu/zotero Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon), http://portaildoc.chu-

lyon.fr/hcldoc/uploads/media/manuel_Zotero.pdf Fiche Zotero / ECLORE,

http://www.projet-plume.org/ressource/eclore FAQ Zotero / URFIST de Nice,

http://wiki-urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2.0

La rubrique Zotero, sur la « Boîte à outils des historiens », http://laboiteaoutils.blogspot.com/search/label/Zotero

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