Master PFA-PV Physique du Vivant

Université Paul Sabatier Toulouse

Faculté des Sciences et d’Ingénierie Master Mention PFA

Physique Fondamentale et Applications

Responsables : Manoel Manghi (M1) manghi@irsamc.ups-tlse.fr

Nicolas Destainville (M2) destain@irsamc.ups-tlse.fr

http://masterpcvs.ups-tlse.fr

De la molécule ... … jusqu’à la dynamique des populations dans les sociétés animales ...

◆ Modélisation des macromolécules du vivant

◆ Biologie structurale et imagerie

◆ Biopolymères, biomembranes, molécule unique ◆ Biophysique et matière molle

◆ Modéliser les comportements collectifs dans systèmes biologiques ◆ Phénomènes hors-équilibre

◆ Modélisation multi-échelle en physique et chimie

Objectif : approche physique pertinente pour des problématiques biologiques à toutes les échelles...

◆ Biophysique ◆ Biopolymères et biomembranes, molécule unique

virus HIV

...en passant par la cellule ...

flagelles bactériens

...et les organismes multicellulaires et les tissus.

◆ Imageries médicales◆ Rhéologie des milieux biologiques ◆ Transferts, transport et ondes en milieu vivant

Philosophie de la formation Etudier (observer, comprendre) le vivant avec les outils du physicien

M1 Physique pour le Vivant

Semestre 7 (physique fondamentale) (en grande partie en commun avec M1 Physique)

• Langues (3 ECTS) • Electromagnétisme et optique (6 ECTS)

– Electromagnétisme et optique (18h C,18h TD) – Compléments d’électromagnétisme et optique (12h C,22h TD)

• Mécanique quantique (3 ECTS,18h C,18h TD) • Physique expérimentale (6 ECTS)

– Instrumentation (6h TD,15h TP) – Montages de physique (30h TP, en autonomie)

• Physique statistique et dynamique des fluides (9 ECTS) – Physique statistique (24h C,24h TD) – Dynamique des fluides (12h C,12h TD) – Physique non-linéaire et phénomènes hors équilibre (24h C-TD-TPO,

projet en autonomie) • Introduction à la biologie (3 ECTS, 24h Cours-TD)

Ouvert de droit aux L3 Physique, Physique-chimie

Semestre 8 (physique pour le vivant)

• Biophysique (6 ECTS) – Biophysique et Matière molle (24h C,24h TD,projet tuteuré) – Biochimie (10h C,10h TD)

• Imageries médicales (3 ECTS,10h C,20h TD) • Modélisation des macromolécules du vivant (3 ECTS,20h C,5h TD,5h TPO) • Physique numérique (6 ECTS)

– Langage C pour la physique (6h C,18h TPO) – Analyse de données statistiques (4h C,10h TPO) – Projet numérique (en autonomie)

• Stage (12 ECTS, 2 mois, soutenance en anglais)

M1 Physique pour le Vivant

"7

M2 Physique pour le VivantSemestre 9 (chaque UE fait 3 ECTS)

• Phénomènes hors d’équilibre (30h C-TD) • Bio-polymères, bio-membranes, biophys. de la molécule unique (30h C-TD) • Rhéologie des milieux biologiques (30h C-TD) • Transfert, transport et ondes en milieu vivant (30h C-TD) • Biologie structurale et imagerie (15h C,15hTD,6h TP) • Modélisation multi-échelle en physique et chimie (15h C,15hTD,6h TPO) • Comportements collectifs dans le vivant

– Comportements collectifs dans les systèmes biologiques (4h C,20h TD) – Modélisation des comportements collectifs (16h TD)

• Méthodologie : initiation à l’utilisation des bases de données (24h TD) • ForCom2 : Fonctions d’ORganisation et de COMmunication (Certif. C2i) • Langue (24h TD)

Semestre 10 : stage de recherche (30 ECTS, 5 mois)

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Master Physique pour le Vivant Devenir des étudiants

M1 Physique du vivant :

• 26 étudiants en M2R Physique du Vivant • 5 étudiants en M2R Radiophysique et Imagerie Médicale puis physiciens des hôpitaux ou développeur (imagerie Alzheimer) • 7 redoublants en M1 PV

2011–18:

M2 Physique du vivant :

• 14 étudiant•e•s en thèse en physique du vivant • 1 pompier (officier) risques technologiques • 1 ingénieure d’études (laboratoire public de recherche) • 1 gendarme (Risques NRBC) • 1 service civique • 4 ré-orientations • 1 arrêt et 2 non reçus

2012–18 :

Pourquoi cette formation ? Emergence des « Science des systèmes complexes » à

l’interface entre Physique, Biologie, Chimie, Santé

Pluridisciplinarité, exemples :

Biophysique Physique du cancer Physique de l’évolution Physique de l’imagerie pour la biologie & médicale (rayonnements)

Biologie Systémique Réseaux biologiques Génomique Puce à ADN

➢ Des débouchés académiques (doctorat) avec des laboratoires de plus en plus visibles et nombreux, notamment à Toulouse : ◆Équipes de recherche de UPS, CHU, CNRS, INSERM ◆Plateforme toulousaine CompleX SYstems Studies (XSYS) http://isc-t.fr/en/complex-systems-institute-of-toulouse-isct/ ◆ Génopole Toulouse Midi-Pyrénées http://www.genotoul.fr/ ◆ Centre Pierre Potier (ITAV)

➢ Des débouchés industriels : http://www.france-biotech.org/ ◆ Oncopole de Toulouse : Sanofi-Avantis, Pierre Fabre, Cyclopharma http://www.oncopole-toulouse.com ◆ PME : Palumed, Hemodia, Innopsys, Picometrics ◆ Start-ups : Novaleads, GTP Technology, Immune Pharma, Affichem, Dendris, ManoMePS, Nanotimes, Nanobiotics, Pylote, Novamems, Chromalys, Carbios, Pixience, Synelvia, etc. Exemple : entreprise leader du peignage moléculaire