Mardi 12 décembre 2006

8h30(50 min)

La phylogénie, ses concepts et ses applications à la génomique, Vincent Laudet

9h20(50 min)

Les concepts de l’évolution pour l’annotation des génomes, Pierre Pontarotti

10h10 Discussion (30 min)

10h40 Pause (30 min)

11h10(1h05)

Génomes végétaux et fongiques, F. Martin

12h15 DEJEUNER (1h45)

14h00(40 min)

Génomes animaux, P. Monget

14h40(40 min)

Métagénome, P. Simonet

15h20 Discussion (40 min)

16h00 Pause (40 min)

  16h40(1h00)

L’ alignement de séquences, O. Poch

17h40 Pause (40 min)

18h20(1h)

Les modèles de reconstruction phylogénomique, M. Gouy

19h20 Discussion

20h00 DINER

Mercredi 13 décembre 2006

8h30(30 min)

Construction d’arbres génomiques à partir des profils de conservations des protéines

, F. Tekaia9h00

(30 min)Algorithmes, O. Gascuel

9h30(30 min)

Détection de changements fonctionnels, N. Galtier

10h00 Discussion (40 min)

10h40 Pause (30 min)

11h10(1h05)

Annotation des génomes et réalité biologique, P. Rouzé

12h15 DEJEUNER (1h45)

14h00 Ontologies et annotation, C. Froidevaux

14h30 La phylogénomique sans alignement de séquences, J. L. Risler

15h00 Pause (30 min)

15h30 HOVERGEN/HOBACGEN : ressources du pôle lyonnais, G. Perrière

16h00 Discussion (40 min)

16h40 Pause 40 min

17h20 L’empreinte phylogénétique (transphylogénétiques), J. Imbert

17h50 MicroARNs, conservation, comparaisons, E. Bonnet

18h20 Eléments répétés (champignons), M.J. Daboussi 

18h50 Discussion (1h10 min)

20h00 DINER

Jeudi 14 décembre 2006

8h30(30 min)

Inférence fonctionnelle, P. Coutinho

9h00(30 min)

Concepts biologiques et prédiction fonctionnelle, A. Levasseur

9h30(30 min)

Profils phylogénétiques, E. Danchin 

10h00 Pause (30 min)

10h30(30 min)

Utilisation des informations structurales dans l’analyse des familles de gènes, J.P Jacquot 

11h Discussion (15 min)

11h15à

11h55

CONCLUSION, BILAN des JOURNEESRéflexion en cours :- Table ronde - Discussion générale entre stagiaires et intervenants

12h00 DEJEUNER ou PANIER REPAS

12h30 Premiers DEPARTS ….