VIE ET MORT DES MALADIES INFECTIEUSESVIE ET MORT DES MALADIES INFECTIEUSESVIE ET MORT DES MALADIES INFECTIEUSESVIE ET MORT DES MALADIES INFECTIEUSES

Grandes épidémies. Fléaux d’hier et d’aujourd’hui

Les succès de la microbiologievariole, polio, rougeole, les vaccins

Maladies nouvelles, émergentes et ré-émergentespaludisme, tuberculose, antibiorésistancesSIDA, hépatites, cancers

Facteurs favorisant l’émergence de nouvelles maladi eshôtes, réservoirs, vecteurscomment naît un nouveau virus

Les GRANDES EPIDEMIESLes GRANDES EPIDEMIESLes GRANDES EPIDEMIESLes GRANDES EPIDEMIESTrois grandes épidémies de pesteTrois grandes épidémies de pesteTrois grandes épidémies de pesteTrois grandes épidémies de peste

Peste justinienne empire Byzantin 6-8eme siècle, 100 millions de morts

Peste moderne ~1860, Yunnan, 1894, Hong-Kong)introduite à San Francisco en 1899-1900

Peste Noire Chine, 1334, Europe : 1347-51)>25 millions de morts en Europeestimation globale > 200 millionsjusqu’à la peste de Londres en 1665

Khan (2004) Trans. Royal. Soc. Trop. Hyg. 98, 270-7

(Chine, 224 av. JV, première épidémie répertoriée)

GRANDES EPIDEMIESGRANDES EPIDEMIESGRANDES EPIDEMIESGRANDES EPIDEMIESLa peste noire en Europe (1347La peste noire en Europe (1347La peste noire en Europe (1347La peste noire en Europe (1347----1351)1351)1351)1351)

1334 – une nouvelle maladie touche le sud-est de la Chine: mortalité 90%- s’étend vers l’ouest

1346 – Kaffa, Crimée

1347 – atteint l’Europe (marins génois, Messine ?)

1351 – toute l’Europe infectée. Un tiers de la population meurt.

LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (I)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (I)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (I)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (I)

Peste (plague)

Grippe (influenza, “flu”)

Variole (smallpox)

Rougeole (measles)

Paludisme (malaria)

Tuberculose

Yersinia pestis

virus influenza A

virus variole (poxvirus)

virus (paramyxovirus)

parasite Plasmodium falciparum

Mycobacterium tuberculosis

SIDA (AIDS) VIH-1, VIH-2

Cholera Vibrio cholerae

Hépatites B et C HBV, HCV

LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (II)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (II)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (II)LES FLEAUX D’HIER ET D’AUJOURD’HUI (II)

Typhus

Fièvre typhoïde

Diphtérie

Coqueluche (pertussis)

Tétanos

Lèpre

Rickettsia prowazekii (1910)

Salmonella typhi

Corynebacterium diphteriae

Bordetella pertussis

Clostridium tetani

Mycobacterium leprae

Méningite cérébro-spinale Neisseria meningitidis

Charbon (anthrax) Bacillus anthracis

Les principales causes de décès(estimations OMS, 1999)

Pays pauvres : 45%

Years of life lost (YLL, OMS 2002)- all causes : 924.691.000-infections .. 303.970.000-(dont SIDA : 77.014.000)- resp. infections 84.800.000

Les maladies infectieuses les plus meurtrières

année 2001, source : OMS

0,0

0,5

1,0

1,5

2,0

2,5

3,0

3,5

4,0

Tuber

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HIV-A

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LA NAISSANCE DE LA MICROBIOLOGIELA NAISSANCE DE LA MICROBIOLOGIELA NAISSANCE DE LA MICROBIOLOGIELA NAISSANCE DE LA MICROBIOLOGIE

Louis PASTEUR (1822-95)

Robert KOCH (1843-1910) Cultures pures (1880)Bacille Tuberculeux

Germes responsables de fermentationsAttenuation (cultures vieillies, chauffées)Cholera des poules (1879)Charbon (1881, Pouilly-le-Fort)Rage (1885, J. Meister, JB Jupille)

Casimir-Joseph Davaine (1861) Germes dans le sang d’animaux / charbon

Ivanovski & Beijerinck (TMV), Loeffler & Frosch (FMDV)

VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (I)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (I)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (I)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (I)

La VARIOLE (La VARIOLE (La VARIOLE (La VARIOLE (smallpoxsmallpoxsmallpoxsmallpox))))

300 millions de morts au 20e siècle

Existe depuis l’antiquité (10 000 B.C.) momie de Ramses V

Epidémies probables : -595, - 490, +165 (?)…(?)

Distinguée de la rougeole en 910 (Al-Razi)

16ème siècle : la variole en Amérique, des millions de morts(Hispaniola, Cuba, puis Mexique)

Victoire de Cortès sur les Aztèques, facilitée par la variole (3 millions de morts au Mexique)

VARIOLATIONVARIOLATIONVARIOLATIONVARIOLATION

Pratiquée sous la dynastie Sung (960-1280)- inhalation de poudre préparée à partir de croûtes desséchées- scarification avec du liquide extrait de vésicules

Dr. Timoni, médecin de l’ambassade britannique à ConstantinopleVariolation du fils de Lady Montagu (1718)

Princess of Wales : variolation de sa fille de 3 ans (Dr Maitland ,1721)Puis 6 condamnés , qui seront ensuite infectés, et protégés

Mortalité tombe de 15-20% à 2.5 %

Shapona, the West African god of smallpox

VACCINATION (Edward JENNER 1798)VACCINATION (Edward JENNER 1798)VACCINATION (Edward JENNER 1798)VACCINATION (Edward JENNER 1798)

cowmaids : indemnes de variole (cowpox, vaccinia viru s)

Liquide extrait de vésicules --> inoc. James Phipps , épreuve (1796)

Travaux publiés en 1798

James Madison, 4th Pres. USA: loi encourageant la v accination

L’ERADICATION GLOBALE DE LA VARIOLEL’ERADICATION GLOBALE DE LA VARIOLEL’ERADICATION GLOBALE DE LA VARIOLEL’ERADICATION GLOBALE DE LA VARIOLE

1950 : Pan-American Health Org. : Americas free of smal lpox

1953 : eradication globale proposée par Dr. Chisholm, Dir. OMSAbandonné , trop complexe (déjà un programme / malaria)

1958 : Victor Zhadnov propose un programme sur 10 ansVote, budget $100,000 , oppositions

1966 : $ 2,4 M Dr. Donald Henderson : Chief Medical Officer for the Smallpox Eradication Progr am

Centres Internationaux pour tester les vaccinsEquipes de surveillance des cas de variole

1977 : dernier cas, Somalie

Clés du succès : seul hôte = homme, pas d’infection persistante

Coût : $ 300M (11 y), professionnels dévoués, aide militaire

COMBIEN CA COÛTE ?COMBIEN CA COÛTE ?COMBIEN CA COÛTE ?COMBIEN CA COÛTE ?

$ 300 millions Eradication de la variole, sur 11 ans (196 8-79)

$ 500 milliards Guerre d’Irak et Afghanistan (USA, 2001-20 07)(Congressional Research Service 10 july 2007)

POLIOMYELITE (polio, infantile POLIOMYELITE (polio, infantile POLIOMYELITE (polio, infantile POLIOMYELITE (polio, infantile paralysisparalysisparalysisparalysis))))

Epidemies estivales dans grandes villes USA (NY, 19 16, 1921)1952 : 58,000 cas, 21,000 paralysés, 3000 morts (US A)

Infection inapparente dans 98% des casune fraction : paralysie des membres inférieurs et resp. (iron lung)

VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (II)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (II)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (II)VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (II)

National Foundation for Infantile Paralysis (1937, FDR, B. O’Connor)

Polio crusade, “March of Dimes”

Collectes d’argent et organisation de la recherche

NFIP NFIP NFIP NFIP andandandand thethethethe March of DimesMarch of DimesMarch of DimesMarch of Dimes

NFIP - Typing Committee : 3 types (195 souches typées sur primate, 17500 primates)

Enders, Weller, Robbins : cultures de cellules (1950)(vaccinia virus, rougeole, polio)

-440,000 vaccinés-210,000 placebo-1,180,000 contrôles2 yr test (12 april 1955)

Testé en URRS, Europe-est, Mexique(4.5 M doses)

US Public Health Service (1961)

Jonas SalkVirus tué (IPV)

Albert SabinVirus vivant atténué (OPV)

Deux vaccins contre la poliomyéliteDeux vaccins contre la poliomyéliteDeux vaccins contre la poliomyéliteDeux vaccins contre la poliomyéliteavant : 57600 cases (USA, 1952)après : 5749 (268)Mais quelques accidents (virus mal inactivé)

LE SUCCES de la VACCINATIONLE SUCCES de la VACCINATIONLE SUCCES de la VACCINATIONLE SUCCES de la VACCINATION

FMDV cases, France

1

10

100

1000

10000

100000

1955 1960 1965 1970 1975 1980

Num

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1988 : OMS lance le « Global Polio Eradication Initiative »~350 000 cas / an (125 pays)

1999 : dernier cas de Poliovirus-type 2 «sauvage»2003 : 784 cas de polio (6 pays)

http://www.polioeradication.org

ERADICATIONS ENVISAGEESERADICATIONS ENVISAGEESERADICATIONS ENVISAGEESERADICATIONS ENVISAGEES

Maladies humaines

Polio début du 21ème siècle

Rougeole 2010-2020

Maladies animales

Rinderpest (paramyxovirus)

VICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (IIVICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (IIVICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (IIVICTOIRES DE LA MICROBIOLOGIE (IIIIII))))

Rinderpest statusScience, 21 mars 2008

LES ETAPES DE LA LUTTE CONTRE LA ROUGEOLE

Fourfold strategy against measles(PAHO, supplementary immunization activities, SIAs)- mass-immunisation campaign < age 15 Catch-Up- follow-up campaigns every 4yr, age<4 Follow-Up- routine shots at age 1 Keep-Up- children difficult to reach Mop-Up

1954 Virus isolé du sang de David Edmonston (Enders & Peebles)

1960 Vaccin à virus atténué (Enders et al., 1960)

Wolfson et al., The Lancet 369, 191-200 (2007)Moss & Griffin (2006) Global measles eliminationNature Rev. Microb. 4, 900-8

1974 Programme étendu de vaccination (OMS, 1974)

1990 Vaccination Universelle des enfants (UNICEF, 19 90)une dose à 9-mois, >80% enfants dans chaque pays

2000 Comprehensive strategy for measles mortality reduct ionWHO / UNICEF 47 priority countries

Wolfson et al., The Lancet 369, 191-200 (2007)

OBJECTIFS DE LA LUTTE CONTRE LA ROUGEOLE- (-60%) in the 1999-2005 period- (-90%) in the 1999-2010 period)

1960(> 6M)

FAISABILITE de l’ELIMINATION de la ROUGEOLE

Circonstances favorables

Vaccin efficace et sans danger

Pas de réservoirs non-humains

Diagnostic facile

Antigéniquement stable et monotype

Moss & Griffin (2006) Global measles eliminationNature Rev. Microb. 4, 900-8

Obstacles

Infectiosité (reproductive number R 0 =12-18)

Immunodeficiences liées au SIDA (Afrique)

Volonté politique

Méfiance du public, et fausses croyances(MMR vaccine and autism, UK)

Les vaccinations courantes et obligatoires (France)Les vaccinations courantes et obligatoires (France)Les vaccinations courantes et obligatoires (France)Les vaccinations courantes et obligatoires (France)Conseil supérieur d'hygiène publique de France (CSHPF) section des maladies

transmissibles et du Comité technique des vaccinations (CTV)

ObligatoiresObligatoiresObligatoiresObligatoires• diphtérie, tétanos, poliomyélite (DT polio)• BCG• (hépatite B, Fièvre jaune).

RecommandéesRecommandéesRecommandéesRecommandées• coqueluche, rougeole, oreillons, rubéole• hépatite B, Haemophilus influenzae de type b• (rage, grippe, leptospirose, hep. A) .

Haemophilus influenzae type b polysaccharideTetanos anatoxine + protéineDiphtérie anatoxineBordetella pertussis bactéries inactivéespolio type 1 virus inactivépolio type 2 virus inactivépolio type 3 virus inactivé

PentacoqPentacoqPentacoqPentacoq

Vacciner ou pas ? Qui décide ?Vacciner ou pas ? Qui décide ?Vacciner ou pas ? Qui décide ?Vacciner ou pas ? Qui décide ?Haut Conseil de la Santé Publique, section des maladies transmissibles et du Comité

technique des vaccinations (CTV)

(D’après Daniel Lévy-Bruhl)

Avantages

Inconvénients

Un vaccin obtient son AMM : prise en charge ou pas ??

• 200 à 300.000 cas de gastro/an chez <5ans• 18.000 hospitalisations, 7-20 décès.

Exemple : Exemple : Exemple : Exemple : rotavirusrotavirusrotavirusrotavirus

• coût > 100 euros / enfant• ratio coût/efficacité peu favorable• très grande majorité des décès dûs à une mauvaise prise en charge (non hydratation)

Décision = non prise en charge

VACCINATION : LIBRE-CHOIX ou IMPOSEE ?

Lorsque la maladie a presque disparu, seuls restent les problèmes liés à la vaccination

- ou des rumeurs sur ses effets néfastes

- La balance bénéfice / risque est moins favorable

Nécessité d’une stratégie appliquée par tous, et no n d’un arbitrage individuel

L’expertise n’est plus perçue comme infaillible

Suggested reading : James Colgrove. State of Immunity, The politics of vaccination in twentieth century America(Science 1 june 2007)

Remise en question de la valeur de la vaccination

Conflit entre liberté individuelle / santé publique

MeaslesMeaslesMeaslesMeasles comescomescomescomes back…le retour de la rougeoleback…le retour de la rougeoleback…le retour de la rougeoleback…le retour de la rougeole

…………by by by by lacklacklacklack of vaccinationof vaccinationof vaccinationof vaccination

News natureAugust 2003

La REVANCHE DES GERMESLa REVANCHE DES GERMESLa REVANCHE DES GERMESLa REVANCHE DES GERMES

Paludisme = malaria

Tuberculose, MDR-TB et XDR-TB

Développement des résistances aux anti-infectieux

SIDA, hépatites et cancers

vecteur : Anopheles

Plasmodium falciparum (P. vivax)

Parasite des globules rouges

Asie du sud-est, Afrique

Premiers succès contre le paludismePremiers succès contre le paludismePremiers succès contre le paludismePremiers succès contre le paludismeUSA & Panama : traitement chloroquine(début 20e s.) drainage des marais, DDT

USA : malaria eliminée (1947-52, $7M)1958 - 63 Programme d’Eradication (WHO, UNICEF)

$23.3 M / 5 yr, DDT , Chloroquine

1963La fin du programme – la malaria revient(Sri Lanka : 1M cas 1955, 18 cas 1963)

MALARIAMALARIAMALARIAMALARIA

Parasites et vecteurs sont devenus résistantsParasites et vecteurs sont devenus résistantsParasites et vecteurs sont devenus résistantsParasites et vecteurs sont devenus résistants

DDT-resistance chez les insectesChloroquine-resistance chez le parasite

Aujourd’hui, l’éradication de la malaria Aujourd’hui, l’éradication de la malaria Aujourd’hui, l’éradication de la malaria Aujourd’hui, l’éradication de la malaria n’est plus envisagéen’est plus envisagéen’est plus envisagéen’est plus envisagée

Chine 1M en 1961, 9M cas en 1975

1989 Brésil 84 % cas chloroq-res73 % amodiaquine-res

1988-90 malaria cérébrale

TUBERCULOSETUBERCULOSETUBERCULOSETUBERCULOSE

Tuberculosis decline (UK & Wales)

0

50

100

150

200

250

300

1850 1900 1950 2000

Mor

ts p

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100

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hab.

sanatoriums

1947, chimiotherapy

immunisation

Eradication of bovine tuberculosis

La REVANCHE DES GERMES (II)La REVANCHE DES GERMES (II)La REVANCHE DES GERMES (II)La REVANCHE DES GERMES (II)

Plus du tiers de la population mondiale infectéeDont 10% ont une chance de développer la maladieDont 1% de cas mortelsDe très grandes disparités selon sociétés

Déclin de la tuberculoseAu 20e siècle

Les facteurs favorisants

- pauvreté, famines- baisse des défensesimmunitaires

La Tuberculose aux USALa Tuberculose aux USALa Tuberculose aux USALa Tuberculose aux USA

1900 2000 morts / million1940 60 morts / million

Années 90 résurgence de la Tuberculose

Tuberculosis cases / year (New-York)

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

3500

4000

1980

1981

1982

1983

1984

1985

1986

1987

1988

1989

1990

1991

Chez patients infectés par HIV et TBXDR = MDR-TB qui est aussi résistant à

- fluoroquinolones- au moins un parmi [capreomycin, kanamycin, amikacin]

NY, 1991 40 % des nouveaux cas = AB res (isoniazid, rifamp.)

Causes : - « maladie du passé », budgets réduits- traitements mal suivis- défaut de surveillance

Chaque année, ~ 450.000 nouveaux cas de TB sont « multiresistants »,

MDR-TB = Resistants à rifampicine et isoniazide (OMS).

MultiMultiMultiMulti----drugdrugdrugdrug resistantresistantresistantresistant tuberculosistuberculosistuberculosistuberculosis (MDR(MDR(MDR(MDR----TB)TB)TB)TB)

ExtensivelyExtensivelyExtensivelyExtensively drugdrugdrugdrug resistantresistantresistantresistant tuberculosistuberculosistuberculosistuberculosis (XDR(XDR(XDR(XDR----TB)TB)TB)TB)

DEVELOPPEMENT DE GERMES RESISTANTSDEVELOPPEMENT DE GERMES RESISTANTSDEVELOPPEMENT DE GERMES RESISTANTSDEVELOPPEMENT DE GERMES RESISTANTS

utilisation excessive d’antibios, traitements mal conduits--> développement de résistances--> transferts intra- et interspécifiques de résistances--> avec transferts de gènes de virulence

Une nouvelle souche de Staphylococcus aureus, devenue resistante à la vancomycine.Résistance acquise provenant d’un transposon de Enterococcusfaecalis(Weigel et al., Science, 2003, 302, 1569)

LES VIRUS FONT DE LA RESISTANCELES VIRUS FONT DE LA RESISTANCELES VIRUS FONT DE LA RESISTANCELES VIRUS FONT DE LA RESISTANCE

HerpesvirusHerpesvirusHerpesvirusHerpesvirus

1981 Antiviral Acyclovir

1989 herpes resistants (acyclovir, ganciclovir)

HIVHIVHIVHIV premiers traitements AZT --> résistancesnouvelles molécules (ddI, ddC, FLT, Zalcitabine, …)trithérapie : aussi des résistances

GrippeGrippeGrippeGrippe traitements amantadine, rimantadine--> résistances

Comment empêcher l’apparition de résistances ?Comment empêcher l’apparition de résistances ?Comment empêcher l’apparition de résistances ?Comment empêcher l’apparition de résistances ?

opposition intérêt individuel / intérêt collectif

Ecologie des maladies infectieuses

Développer de nouveaux anti-infectieux ?(TB : diarylquinoline, 2005)

Nouvelles stratégies de lutte anti-infectieuse ?

Le SIDALe SIDALe SIDALe SIDA

1ere description, 1981, 4 homosexuels (P. carinii)

USA, fin 1995 : 501.000 cas rapportés, 311.000 morts

2007 >33 M porteurs >25 M décès depuis 1981 (www.unaids.org)

HIV identifié en 1983 (LAV)

Cas de SIDA identifiés a posteriori (1959)

Origine ? Chimpanzé (HIV-1)

Explosion épidémique sexedrogues IVtransfusionshôpitaux (Afrique)

Hépatite B Hépatite B Hépatite B Hépatite B

Hépatite C Hépatite C Hépatite C Hépatite C Infections chroniques : 170 millions3-4 millions de personnes infectées / an (80 % progressent vers infection chronique)

Infections chroniques : 350 millionsRisques de cirrhose et cancer du foie

(500 à 750 000 morts / an)

VIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERS

Papillomavirus humains (HPV) Papillomavirus humains (HPV) Papillomavirus humains (HPV) Papillomavirus humains (HPV)

500 000 cas de cancer du col / an< 300 000 morts / an.Un vaccin (Gardasil / Merck/ HPV16-HPV18)

France, an. 2001 4000 décès imputables à HBV + HCV(BEH, 01/07/08) 585 décès dus au SIDA

VIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERSVIRUS ET CANCERS20 à 25% des cancers ont une étiologie virale connue

Fan, 2007, PNAS 104,1449

* XMRV = xenotropic murine leukemia-related virus (zoonotic ?)

Merkel Cell Carcinoma nouveau polyomavirus humain (Feng et al., 2008)

Facteurs favorisant l’émergence et la résurgencede maladies infectieuses

Hôte, société

Réservoir, hôte intermédiaire

Vecteur

Environnement

Franchissement de la barrière d’espèce

UNE DEMOGRAPHIE QUI FACILITE LES EPIDEMIESUNE DEMOGRAPHIE QUI FACILITE LES EPIDEMIESUNE DEMOGRAPHIE QUI FACILITE LES EPIDEMIESUNE DEMOGRAPHIE QUI FACILITE LES EPIDEMIES

La population mondiale a triplé au 20e s.mégapoles, ghettos et bidonvilles

(pauvreté, hygiène)

« Crowd diseases » nécessitent populations de plusieurs centaines de milliers (rougeole, rubéole)

Guerres déplacements de populations, camps de réfugiés

Immunodéficiences malnutritionSIDA, greffes

Circulation internationale avions, tourismeguerre (WWII, Corée, Vietnam)

La population mondiale

0

1

2

3

4

5

6

7

-500 0

500

1000

1500

2000

milli

ards

d'h

abita

nts

BAISSE DE L’IMMUNITE SPECIFIQUEBAISSE DE L’IMMUNITE SPECIFIQUEBAISSE DE L’IMMUNITE SPECIFIQUEBAISSE DE L’IMMUNITE SPECIFIQUE

déficiences dans les vaccinations

- refus, laxisme (oubli des rappels)

- populations mal suivies ou oubliées

population “vierge” (variole/ amériques, myxomatose, 1952)

Diversité génétique de la population

RESERVOIRS ET HOTES INTERMEDIAIRESRESERVOIRS ET HOTES INTERMEDIAIRESRESERVOIRS ET HOTES INTERMEDIAIRESRESERVOIRS ET HOTES INTERMEDIAIRES

VECTEURSVECTEURSVECTEURSVECTEURS

Peste noire : pullulation de rongeurs ?

Anopheles (malaria)Aedes (Fièvre jaune, Rift Valley Fever, Chikungunya)

Développement de résistancesExtension géographique (réchauffement global)

Environnement modifié (barrage d’Assouan, 1977 :200 000 cas RVF, 600 morts)

Elevages industriels

Nipah porcs flying fox

RESERVOIRS, hôtes intermédiaires, vecteursRESERVOIRS, hôtes intermédiaires, vecteursRESERVOIRS, hôtes intermédiaires, vecteursRESERVOIRS, hôtes intermédiaires, vecteurs

NipahEbola(Leroy et al.Nature 1dec 2005)

Flying fox

Peste, Hantaan

H5N1

Nipah,Grippe

Rift Valley feverchikungunya

Réservoir

Hôte intermédiaire(amplificateur)

Homme

Vecteur

Facteurs de risque : taille et proximité du réservoir, présence d’un Hôte intermédiaire, population de vecteurs

Origines possibles de maladies humainesOrigines possibles de maladies humainesOrigines possibles de maladies humainesOrigines possibles de maladies humaines(d’après Wolfe et al., Nature 447, 279-83 (2007)

Disease AgentRoute of

transmissionEnvironmental

reservoirAnimal

reservoir Likely origins

DiphteriaeCorynebacteriumdiphteriae aerosol, contact clothes, dust no Herbivores domestiques

Hepatitis B Hepatitis B Virusperinatal, horizontal, sexual, parenteral on surfaces no singes

Influenza A Influenzavirus A aerosol No Wild birds Canards, porcs, oiseaux

measles morbillivirus aerosol No No bétail

Plague Yersinia pestis fleas, aerosol soil Rodents rongeurs

Smallpox variola virus aerosol, skin textiles No Camelidés ?

TuberculosisMycobacteriumtuberculosis aerosol No No ? Ruminants ?

AIDS HIV-1 sexual, blood No No

Chimpanzee (HIV N & M), gorilla (HIV group O) ?

cholera Vibrio cholerae fecal-oral aquatic environments

aquaticcopepods, algae, crustacea aquatic organisms ?

Falciparummalaria

Plasmodium falciparum mosquitoes no no ultimately birds ?

after Wolfe et al., Nature 447, 279-83 (2007)

- Contact direct toucher, morsures, griffures- Contact indirect transmission par voie aérienne (gr ippe)

transmission par un vecteur (fièvre jaune, peste)consommation (ESB, ESF, vCJD)utilisation de produits biologiques contaminés

xénogreffes (foies de babouin, USA 1993)vaccins atténués / tissus ou culture cell.(vaccin Swine Fever Virus/ BVDV)

Le Franchissement de la barrière d’espèceLe Franchissement de la barrière d’espèceLe Franchissement de la barrière d’espèceLe Franchissement de la barrière d’espèce

Des exemples récents de maladies venues d’ailleursDes exemples récents de maladies venues d’ailleursDes exemples récents de maladies venues d’ailleursDes exemples récents de maladies venues d’ailleurs- Canine parvovirus (gastro-enterite canine)- HIV-1, HIV-2- vCJD ( et peut-être BSE)- Nipah virus, grippe équine H3N8 chez les chiens, gr ippe aviaire- SARS, bluetongue (fièvre catarrhale ovine) Chikungu nya

Comment naît un nouveau virus ?Comment naît un nouveau virus ?Comment naît un nouveau virus ?Comment naît un nouveau virus ?

Venant d’ailleurs, il apparaît soudain dans une population vierge(rongeurs, chiroptères, primates ------ SARS, Ebola)

Recombinaison / réassortiment : création d’un nouveau génome,à partir de deux virus parentaux (grippe)

Mutations avec changement de propriétésreconnaissance de nouveaux récepteurschangement de tropisme

le virus se multiplie dans d’autres organesle virus peut infecter une nouvelle espèce

Ré-assortiment, recombinaison, mutationsH3N2

HA

NA

H1N1

H1N2

HA (H1N1)

NA (H3N2)

Virus A

Virus B

Virus recombinant

Virus mutant

Virus « sauvage » ou parental

Virus réassortant

Cellule intestinaleCellule respiratoire

Ou bien autre espèce animale

Virussauvage

Virusmutant

Pathologies en quête d’agents infectieuxPathologies en quête d’agents infectieuxPathologies en quête d’agents infectieuxPathologies en quête d’agents infectieux

sarcome de Kaposi (HHV-8)Ulcères gastriques et cancers (Helicobacter pylori)cancers (hépatite B/ C)Diabètes (type I : Coxsackie B4, Dotta et al. 2007)affections neurologiques (SEP)

Germes en quête de pathologies ?Germes en quête de pathologies ?Germes en quête de pathologies ?Germes en quête de pathologies ?

Quelques nouvelles maladies identifiées depuis 1970Quelques nouvelles maladies identifiées depuis 1970Quelques nouvelles maladies identifiées depuis 1970Quelques nouvelles maladies identifiées depuis 1970Ebola, Marburg, Lassa et autres fièvres hémorragiquesLegionellose (1976, Philadelphie)HIV, HTLV, HepCESB, vCJDgrippe H5N1Gastro-entérite canine (CPV)Nombreux virus d’élevages industriels (volailles, porcs)

QUE FAIRE CONTRE LES MALADIES INFECTIEUSES ?QUE FAIRE CONTRE LES MALADIES INFECTIEUSES ?QUE FAIRE CONTRE LES MALADIES INFECTIEUSES ?QUE FAIRE CONTRE LES MALADIES INFECTIEUSES ?

Ces maladies ne sont pas invincibles Certaines ont été éliminées (variolation, vaccination…)

Même les spécialistes les plus réputés ne croyaient pas à l’éradication de la variole (René Dubos)

Nous avons vaincu la variole , et presque vaincu la polio(sans compter de nombreuses maladies animales)L’éradication de la rougeole est envisagée

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Ne pas sous-estimernos succèsnos moyens (vaccins)

Nécessité d’une volonté politique partagée

« Le progrès, c’est l’utopie réalisée » (Oscar Wilde)

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