L3MA – UMR ECOFOG 

Protocole pour la réalisation d’un herbier Présentation de la base Aublet2 de l’Herbier de Guyane

Emeline Houël  01/08/2007  

PROTOCOLE HERBIER 

 

SOMMAIRE 

 

 

INTRODUCTION  

1. RECOLTE 

2. SECHAGE 

3. ETIQUETTES 

4. ANNEXES 

4.1. La constitution d’un herbier 

4.2. Copies d’écran du site de l’Herbier de Cayenne (base Aublet2): Liste des localités, Taxons, Liste des grands types d’habitats en Guyane française 

4.3. Liste des familles présentes en Guyane française 

  4.4. Liste simplifiée des habitats 

4.5. Liste partielle des types biologiques 

4.6. Liste partielle des phénologies 

 

 

 

 

 

INTRODUCTION  

A. L’Herbier de Guyane:   L'Herbier  de  Guyane,  créé  en  1965,  est  géré  par  l'IRD  dans  le  cadre  de  son  Unité  de  Service "BIODIVERSITE VEGETALE  TROPICALE  :  CONNAISSANCE  ET VALORISATION"  (IRD N°84 BIODIVAL).  Il comprend plus de 150.000 spécimens de  la flore de  la région des Guyanes gérés et exploités par  la Base de données AUBLET 2. Il joue un rôle fondamental en tant qu'observatoire de la flore régionale et participe activement aux programmes nationaux et internationaux d'inventaires floristiques et de rédaction  de  flores  tropicales.  C'est  également  un  outil  incontournable  pour  la  valorisation  de  la biodiversité végétale, l'aide à la décision et l'expertise. Un fond documentaire important est associé à l'Herbier et à  la Base de données. L’Herbier et  la base de données sont des outils de base pour  la recherche fondamentale, la valorisation et l’aide au développement, l’expertise et la formation.  

  

B. La base Aublet 2 

La base AUBLET2  réunit  les données concernant  les  spécimens botaniques collectés  sur  le plateau des  Guyanes,  surtout  en  Guyane  Française,  et  déposés  à  l'Herbier  de  Guyane  (CAY).  Elle  a  pour  but  de  gérer  l'Herbier  à  Cayenne,  et  de mettre  à  la  disposition  des  utilisateurs  les informations qu'il contient. Elle permet en outre de sélectionner des  informations répondant à des requêtes  spécifiques. La base de données Aublet a été créée en 1988 par M. Hoff, G. Cremers, C. Feuillet et J.‐J. de Granville et administrée jusqu'en 1997 par G. Cremers et M. Hoff.  

 

 

 

  

C. La constitution d’un herbier (d’après R.A.A. OLDEMAN)  Voir document en annexe. 

 1. RECOLTE 

 ‐ Lors de  la  récolte, se munir d’un carnet de collecte  (modèle Herbier CAY ou autre) afin de 

pouvoir noter sur place : 

. le récoltant 

. le numéro de récolte : les numéros d’herbier doivent être séquentiels (pas d’interruption dans la liste) et de préférence dans l’ordre des dates de récolte. 

.  éventuellement    genre  /  espèce  /  famille  ou  nom  vernaculaire.  Les  noms  seront  ensuite systématiquement vérifiés grâces flores (= ouvrages permettant de déterminer  les plantes), aux révisions et aux monographies (disponibles à l’Herbier de Cayenne). 

. la date 

. la localité (commune et localisation précise, par exemple le PK, le lieu‐dit…) 

. l’écologie du lieu de récolte : type d’habitat ou milieu 

. la phénologie (c'est‐à‐dire l’état de l’échantillon prélevé pour l’herbier : stérile, fleurs, fruits…)  

. le type biologique (herbacée, arbre, arbuste…)  

. une indication de la taille de la plante vivante : hauteur et/ou diamètre (ou circonférence) 

Ces données seront reportées sur l’étiquette pour le montage (voir 3.). 

‐ Se munir  soit  de  grilles,  de  cordes  et  de  journaux  (format  France Guyane)  pour  faire  les herbiers sur place, soit d’un sac plastique (avec un peu d’eau au fond, permet de conserver un certain temps la fraîcheur des feuilles), de scotch et de marqueurs (afin de numéroter les rameaux), d’un sécateur / couteau / machette.  

‐ Faire  la  description  de  l’échantillon  avant  séchage :  il  faut  décrire  au moins  tout  ce  qui disparait  au  séchage  (couleur,  texture,  odeur…  pour  les  feuilles,  les  fleurs,  les  fruits…). L'écorce est aussi une caractéristique de l’espèce.  

‐ Un  échantillon  doit  être  représentatif  du  végétal  que  l'on  veut  illustrer.  Il  faut  récolter également  un  fragment  représentatif  de  rameau  ou  de  la  tige,  pour montrer  de  quelle manière  sont  insérées  les  feuilles,  car  l’insertion  des  feuilles  est  caractéristique  pour  une espèce donnée (feuilles opposées, alternes ou en verticille, présence de stipules, d’épine, de gaine, feuilles simples ou composées, etc.).   Par  exemple  dans  le  cas  de  plantes  à  feuilles  composées,  bien  prendre  garde  à  ne  pas prendre  qu’une  seule  feuille mais  bien  un  rameau  comportant  plusieurs  feuilles  afin  de garder visible leur insertion. Sinon on ne voit que l’insertion des folioles…  Si  la plante est  très grande et qu’il est  impossible de  la mettre en  l'état dans  l'herbier, on peut  préciser  la  taille  de  la  plante,  et  quel  est  le morceau  prélevé  (exemple  : morceau d’inflorescence  terminale) ou préciser  si  c’est une  feuille basale ou  caulinaire.  Les  feuilles 

basales n’ont pas toujours la même forme que les feuilles se trouvant sur la tige. De même, les  feuilles proches de  l'inflorescence peuvent avoir une  forme différente de  celles qui en sont éloignées. Et c'est évidemment une caractéristique de l'espèce en question.  Exemple  :  Passiflora  coccinea Aubl.:  coller  juste  une  feuille  n'est  pas  représentatif.  Il  faut avoir  un morceau  de  tige,  sur  laquelle  sont  insérées  des  feuilles,  ainsi  que  les  vrilles  qui accrochent la plante sur son support.  

‐ Pour  la  plupart  des  plantes,  les  faces  supérieures  et  inférieures  des  feuilles  ne  sont  pas identiques, il faut donc avoir au minimum deux feuilles par plante. Les graines peuvent être mises dans des petits sachets en papier.   

‐ Lors  de  la  récolte  un  point  GPS  pourra  également  être  pris  si  un  GPS  est  disponible (recommandé)  

‐ Des photos de la plante sur pied et/ou des échantillons frais pourront être jointes à l’herbier pour être intégrées dans la base de données Aublet2 avec le même numéro de collecte que l’échantillon (numérotation des photos : NOM_RECOLTANT/N°HERBIER/x si plusieurs photos ex : HOUEL2a). 

 

2. SECHAGE 

Le séchage peut se faire soit à l’Herbier (étuve à 60°C) soit en ambiance climatisée (intérêt : permet de mieux conserver la couleur des plantes). 

Les échantillons doivent être placés dans des journaux (format France Guyane) pour le séchage, avec une  feuille  retourner  afin  de  pouvoir  observer  directement    les  faces  supérieure  et  inférieure  du limbe une fois la planche montée. 

Les feuilles peuvent être repliées si jamais elles dépassent du format du journal, ce n’est pas gênant. 

 

 

Dans  tous  les cas, placer entre chaque échantillon des cartons  (découpés au  format du  journal) et presser les échantillons (grilles ou poids) afin d’assurer un séchage des feuilles bien à plat. 

 

3. ETIQUETTES 

Pour  que  les  échantillons  puissent  être montés  en  planches,  il  est  nécessaire  de  compléter  des étiquettes : 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Date de récolte

N° herbier 

Déterminateur : ce peut‐être le collecteur ou toute personne capable de reconnaître la plante, mais seules les déterminations effectuées par des spécialistes peuvent être considérées lors de comparaisons. 

Duplicate : nombre de parts. Au moins une part  pour l’Herbier de Cayenne (acronyme CAY) et éventuellement une part envoyée à l’herbier où se trouve le spécialiste de la famille (demander à l’Herbier) par exemple : Missouri Botanical Garden (MO), Paris (P), New York (NY), Utrecht (U), Washington (US), Kew (K), Berlin (B).  La confirmation ou correction de la détermination par le spécialiste sera reportée sur l’étiquette et dans la base Aublet2. 

Description de ce qui disparait au séchage et éventuellement des critères botaniques qui permettent la détermination 

Ne pas oublier le nom du descripteur et bien vérifier l’orthographe du nom. Le plus simple : vérification ou copier/coller depuis http://www.cayenne.ird.fr/aublet2/ puis > Taxons : taper le nom et Soumettre. En cliquant sur le nom on accède à Famille / Genre / Espèce / Synonymes et en cliquant sur Specimen aux échantillons classés à CAY (voir copie d’écran en annexe). Possible d’utiliser ces informations comme aide pour remplir les champs type bio / habitat / description. Autre lien pour des vérifications : liste des plantes du plateau des Guyanes sur http://www.mnh.si.edu/biodiversity/bdg/planthtml/index.html (depuis la page d’accueil d’Aublet : > Biological Diversity of the Guianas > BDG Publications and Resources > Plant Checklist > Checklist of the Plants of the Guianas) 

Coordonnées soit relevées sur le terrain avec le GPS soient complétées à posteriori avec la liste des localités de la base Aublet (chercher la référence la plus proche) : http://www.cayenne.ird.fr/aublet2/ puis  >Localités    > Localités de Guyane française 

En premier recours voir la liste simplifiée fournie en annexe. 

La liste intégrale des habitats CORINE‐Biotope (liste « officielle ») est disponible sur le site http://www.cayenne.ird.fr/aublet2/  puis > Habitats > Liste des espèces par habitat. On accède à la liste des grands types d’habitats en Guyane française. Cliquer sur l’habitat souhaité puis bouton Soumettre pour accéder à la liste des habitats rattachés au type (habitats détaillés).  

 

4. ANNEXES  4.1. La constitution d’un herbier 

 

 4.2. Copies d’écran du site de l’Herbier de Cayenne (base Aublet2):  

 ¤ Liste des localités 

 

 

 

         ¤ Taxons 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

¤  Liste  des  grands types  d’habitats  en Guyane française 

 

 

 

4.3. Liste des familles présentes en Guyane française 

ACANTHACEAE  CARYOPHYLLACEAE  GENTIANACEAE  MONIMIACEAE  SABIACEAE 

ACERACEAE  CARYOCARACEAE  GESNERIACEAE  MORACEAE  SANTALACEAE 

ACORACEAE  CASUARINACEAE  GINKGOACEAE  MORINGACEAE  SAPINDACEAE 

ACTINADIACEAE  CECROPIACEAE  GLEICHENIACEAE  MUSACEAE  SAPOTACEAE 

ADANTIACEAE  CELASTRACEAE  GNETACEAE  MYOPORACEAE  SAURURACEAE 

AGAVACEAE  CHENOPODIACEAE  GOODENIACEAE  MYRICACEAE  SAXIFRAGACEAE 

ALANGIACEAE  CHLORANTHACEAE  HAMMAMELIDACEAE  MYRISTICACEAE  SCHISANDRACEAE 

ALISMATACEAE  CHRYSOBALANACEAE  HEMONORACEAE  MYRSINACEAE  SCHIZAEACEAE 

ALSEUOSMIACEAE  CLUSIACEAE  HERNANDIACEAE  MYRTACEAE  SCROPHULARIACEAE 

AMARANTHACEAE  COMBRETACEAE  HIPPOCASTANACEAE  NYCTAGYNACEAE  SELAGINELLACEAE 

AMBORELACEAE  COMMELINACEAE  HUMIRIACEAE  NYMPHAEACEAE  SIMAROUBACEAE 

ANACARDIACEAE  COMPOSITAE  HYDRANGEACEAE  OCHNACEAE  SMILACACEAE 

ANCISTROCLADDACEAE  CONNARACEAE  HYMENOPHYLLACEAE  OLACACEAE  SOLANACEAE 

ANISOPHYLLEACEAE  CONVALLARIACEAE  HYPERICACEAE  ONAGRACEAE  SPHENOSTEMONACEAE 

ANNONACEAE  CONVOLVULACEAE  HYPOCYDACEAE  OPILIACEAE  STAPHYLEACEAE 

APIACEAE  CORNACEAE  ICACINACEAE  ORCHIDACEAE  STEMONACEAE 

APOCYNACEAE  CORYNOCARPACEAE  IRVINGIACEAE  OXILIDACEAE  STERCULIACEAE 

AQUIFOLIACEAE  COSTACEAE  IXONANTHACEAE  PAEONIACEAE  STROMATOPTERIDACEAE 

ARACEAE  CRASSULACEAE  JUGLANDACEAE  PANDACEAE  STYRACACEAE 

ARALIACEAE  CTENOLOPHONACEAE  LABIATEAE  PARACRYPHIACEAE  SYMPLOCACEAE 

ARAUCARIACEAE  CUCURBITACEAE  LAMIACEAE  PASSIFLORACEAE  TACCACEAE 

ARECACEAE  CUNONIACEAE  LARDIZABALACEAE  PENTAPHRAGMATACEAE  THEACEAE 

ARISTOLOCHIACEAE  CUPRESSACEAE  LAURACEAE  PHELLINACEAE  THELYPTERIDACEAE 

ASCLEPIADACEAE  CYCADACEAE  LECYTHIDACEAE  PHOIPTELEACEAE  THYMELAEACEAE 

ASPARAGACEAE  CYPERACEAE  LEEACEAE  PHORMIACEAE  THYMELAECEAE 

ASTELLIACEAE  DAPHNIPHYLLACEAE  LEGUMINOSAE  PHYLESACEAE  TILIACEAE 

ASTERACEAE  DAVALLIACEAE  LEGUMINOSAE‐FABACEAE  PHYTOLACCACEAE  TRIGONACEAE 

AUCUBACEAE  DENNSTAEDTIACEAE LEGUMINOSAE‐CAESALPINIACEAE  PIPERACEAE  TRIMENIACEAE 

AVICENNIACEAE  DICHAPETALACEAE LEGUMINOSAE‐MIMOSACEAE  PITTOSPORACEAE  ULMACEAE 

BALANOPACEAE  DICKSONIACEAE LEGUMINOSAE‐PAPILIONACEAE  PLUMBAGINACEAE  URTICACEAE 

BALANOPHARACEAE  DILLENIACEAE  LICHEN  POACEAE  VALERIANACEAE 

BALSAMINACEAE  DIOSCOREACEAE  LILIACEAE  PODOCARPACEAE  VERBENACEAE 

BETULACEAE  DIPTEROCARPACEAE  LINACEAE  POLEMONIACEAE  VIOLACEAE 

BIGNONIACEAE  DRACAENACEAE  LOGANIACEAE  POLYGACEAE  VISCACEAE 

BIXACEAE  DRYPTERIDICACEAE  LORANTHACEAE  POLYGONACEAE  VITACEAE 

BLECHNACEAE  EBENACEAE  LYCOPODIACEAE  POLYPODIACEAE  VITTARIACEAE 

BOMBACACEAE  ELAEOCARPACEAE  LYGODIACEAE  PRIMULACEAE  VOCHYSIACEAE 

BORAGINACEAE  EPACRIDACEAE  LYTHRACEAE  PROTEACEAE  WINTERACEAE 

BRASSICACEAE  ERICACEAE  MAGNOLIACEAE  QUIINACEAE  XANTHOPHYLLACEAE 

BUDDLEJACACEAE  ERIOCAULACEAE  MALPIGHIACEAE  RANUNCULACEAE  XANTHORROHEACEAE 

BURSERACEAE  ERYTHROXYLACEAE  MALAVCEAE  RAPATACEAE  ZINGIBERACEAE 

CAMPANULACEAE  ESCALLONIACEAE  MARANTACEAE  RHABDODENDRACEAE  ZYGOPHYLLACEAE 

CANNABACEAE  EUPHORBIACEAE  MARATTIACEAE  RHAMNACEAE   

CAPPARACEAE  FAGACEAE  MELASTOMATACEAE  RHIZOPHORACEAE   

CAPPARIDACEAE  FLACOURTIACEAE  MELIACEAE  ROSACEAE   

CAPRIFOLIACEAE  FLAGELLARIACEAE  MENISPERMACEAE  RUBIACEAE   

CARLEMANNIACEAE  GANODERMATACEAE  METAXYACEAE  RUTACEAE   

 

 

4.4 Liste simplifiée des habitats de Guyane française 

Bord de route en végétation ouverte Bords de pistes forestières Bords de route et de pistes Bords de routes forestières Cours et abords des maisons 

Cultures Défrichement récent Forêt dégradée Forêt exploitée Forêt inondable Forêt primaire 

Forêt primaire, bas fonds humide Forêt secondaire 

Forêt sur sable blanc Jardins 

Layons forestiers Mangrove 

Plantation d’arbres Plante cultivée 

Plante cultivée sur brûlis Savane 

Savane inondée Savanes‐roches Terrains vagues 

Végétation des bords de mer Végétation secondaire 

Zone rudérale  

4.5 Liste partielle des types biologiques 

ARBRISSEAU ARBRE ARBUSTE PALMIER 

HERBACEE TERRESTRE ARBUSTE LIANESCENT 

LIANE  

4.6 Liste partielle des phénologies 

Stérile  Inflorescences   Fleurs  Infructescences Fruits  Boutons floraux