examen cytobactériologique urinaire (ecbu) 18 juin 2009 michelle boyer
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Examen cytobactériologique urinaire (ECBU)
18 juin 2009 Michelle BOYER
L’examen cytobactériologique urinaire (ECBU) est l’analyse bactériologique la plus fréquemment pratiquée au laboratoire.
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Indications• Situations d’infection urinaire (IU) sauf
cystites aiguës simples d’évolution favorable.
• Dépistage des colonisations: grossesse,
chirurgie urinaire.
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NOMENCLATURE DES ACTES DE BIOLOGIE MEDICALE
Etapes de l’ECBU: • Prélèvement, conservation
• Examen direct (cellules, bactéries)
• Culture, compte de germes.
1- Prélèvement, conservation
• L’urine est normalement stérile.
• Facilement contaminée par la flore commensale.
• Toilette, élimination du 1er jet.
• Flacon stérile
• Temps de stase ( au moins 4h)
• Problème des patients incontinents
• Recueil chez l’enfant: milieu de jet, poches
(= collecteur) à urines, moins de 30 mn
• 2h à température ambiante
• 24h à +4°
• Jusqu’à 48h en flacon + borate
Sinon:
• Modification du compte de germe
• Altération des cellules
2 - Examen direct Cytologie - bactériurie
Etape capitale pour le dépistage et le diagnostic rapide (Afssaps)
Résultat en urgence ( Pédiatrie)
Leucocyturie et hématurie:• mesure microscopique
• ou automatique
Mesure quantitative
Le seuil normal de la leucocyturie est de:
10/mm3 ou 104/ml
Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 25/mm3 adulte, 10/mm3 enfant
Le seuil de l’hématurie est de:
10/mm3 ou 104/ml
Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 20/mm3 adulte, 10/mm3 enfant
Autres éléments: Résultat semi-quantitatif• Cellules épithéliales• cristaux• Cylindres• Parasites
Bactériurie:
Résultat semi-quantitatif
• Par microscopie (coloration de Gram)
• ou automate + microscopie
Le seuil de détection est de 105 UFC/ml
identique pour les 2 techniques (microscopique ou automatique)
La coloration de Gram donne une orientation
sur le type de bactérie
Exemples:
Bacilles gram négatif polymicrobien
• La présence de bactéries:
Si + : ≥ 105 UFC/ml → Gram pour orientation du traitement
Si - : < 105 UFC/ml, mais IU possible!
Si flore variée (± cellules épithéliales): contamination
• La présence de leucocytes:
en faveur d’une IU si ≥ 10/mm3 ou ≥ 104 /ml +/- cylindres leucocytaires et amas de
leucocytes ( pyurie)
Mais…
La leucocyturie peut être absente au cours d’authentiques IU:
- prélèvement très précoce
- patients neutropéniques
- enfant de moins de 3 mois
- lyse des leucocytes (conservation)
Inversement…
La leucocyturie peut être présente et non spécifique d’IU:
ex: urétrite, vulvo-vaginite, maladie inflammatoire (Kawasaki), porteur de sonde, vessie neurologique…
• L’absence de leucocyturie et de bactériurie a une excellente valeur prédictive négative ( proche de 100%)
• La valeur prédictive positive est médiocre.
3 - Culture, identification, numération, antibiogramme
La culture est nécessaire pour:
• Préciser l’espèce bactérienne (IU mono ou bimicrobienne)
• Réaliser l’antibiogramme
Palmarès des bactéries ( CH de Roanne):
• Escherichia coli 50%
• Enterococcus sp. 10%
• Proteus mirabilis 5%
• Klebsiella pneumoniae 5%
La numération de germes en UFC/ml est nécessaire à l’interprétation.
Plusieurs seuils en fonction de la forme clinique et de l’espèce bactérienne.
• ≥ 103 UFC/ml: cystites aiguës à E.coli et
autres entérobactéries ou Staph. saprophyticus.
• ≥ 105 UFC/ml: cystites à autres bactéries ( entérocoque)
• ≥ 104 UFC/ml: pyélonéphrites et prostatites
Interprétation de l’ECBU:
doit prendre en compte
• L’état clinique du patient
(enfant < 3mois, personne âgée…)
• Les conditions de réalisation du prélèvement.
• L’existence d’une antibiothérapie.
Cas particuliers:
Symptômes urinaires + bactériurie à l’examen direct + culture stérile:
→ UI décapitée ( traitement ATB)
→ bactérie difficile à cultiver (ex:anaérobie)
Si la leucocyturie est présente + absence de bactériurie à l’examen direct + culture stérile:
→ tuberculose
→ traitement antibiotique
Prudence:
Si la leucocyturie est absente et la bactériologie significative:
→ IU chez le jeune enfant,
→ IU chez le neutropénique,
→ IU lorsque le prélèvement est très précoce
Très souvent:
Chez une femme: nombreuses cellules épithéliales + bacilles Gram positif (lactobacilles) à l’examen direct + culture
(103 ou 104 UFC/ml) flore polymorphe :
→ contamination vaginale