de-mu0-231-03 laboratoire repertoire des analyses ... - biotop

LABORATOIRE BIOTOP

MANUEL DE PRELEVEMENT /REPERTOIRE DES ANALYSES DE

MICROBIOLOGIE DU LABORATOIREBIOTOP

DE-MU0-231-03Version 3

Applicable le : 19-03-2019

Table des matièresINTRODUCTION........................................................................................................................................2REMARQUES GENERALES.....................................................................................................................2

Prélèvements à visée diagnostique...................................................................................................2Prélèvements à visée épidémiologique............................................................................................2Renseignements cliniques.................................................................................................................3

MATERIEL MIS A DISPOSITION ET RECOMMANDE PAR LES LABORATOIRES BIOTOP................41. Ecouvillons......................................................................................................................................4

1.1 Description du matériel...........................................................................................................41.2 Modalités d’utilisation..............................................................................................................6

1.2.1 Ecouvillons Σ-VCM, et Transwab....................................................................................6(Σ-TRANSWAB (violet), Σ-TRANSWAB (orange)ou FECALTRANSWAB).............................61.2.2 Ecouvillon DRYSWAB et milieu REMEL.........................................................................7

2. Flacons stériles...............................................................................................................................8PRECONISATIONS PRE-ANALYTIQUES ET PROTOCOLES DE PRELEVEMENT..............................91. URINES : ECBU ET AUTRES RECHERCHES SPECIFIQUES.........................................................10

1.1 Préconisations............................................................................................................................101.2 Protocole de recueil des urines en vue d’un ECBU.................................................................11

1.2.1 Protocole standard..............................................................................................................111.2.2 Prélèvement avec sac collecteur (pour les enfants)........................................................111.2.3 Sondage à demeure (SAD).................................................................................................121.2.4 Prélèvement par sondage chez les patients incontinents..............................................12

2. SELLES : COPROCULTURE / EXAMEN PARASITOLOGIQUE.......................................................133. SANG : HEMOCULTURES ET RECHERCHES DE PARASITES (PALUDISME...)...........................154. PRELEVEMENT DE LA SPHERE GENITALE....................................................................................16

4.1. Prélèvement vaginal...................................................................................................................16 4.1.1 Préconisations....................................................................................................................164.1.2 Protocoles de prélèvement.................................................................................................18

4.2. Prélèvement urétral....................................................................................................................184.2.1 Préconisations.....................................................................................................................184.2.2 Protocoles de prélèvement.................................................................................................19

4.3 Sperme.........................................................................................................................................204.4 Stérilet..........................................................................................................................................20

5. SPHERE ORL......................................................................................................................................216. PRELEVEMENTS PULMONAIRES....................................................................................................237. PRELEVEMENTS DE LCR ET LIQUIDES DE PONCTION................................................................24

8. PRELEVEMENTS DE PEAU ET PHANERE..................................................................................259. PRELEVEMENTS DE PUS, ABCES, BIOPSIES, OS.........................................................................2810. BIOMATERIAUX................................................................................................................................28

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INTRODUCTIONCe manuel spécifique des examens de microbiologie est destiné aux préleveurs internes et externes dulaboratoire BIOTOP.

Son objectif principal est d’apporter un complément d’informations au manuel de prélèvement MQ-MU3-001 nécessaire au respect des exigences du Guide de Bonne Exécution des Analyses de BiologieMédicale « GBEA version 2 » et de la norme NF EN ISO 15189 « Laboratoires de biologie médicale : Exigences concernant la qualité et la compétence. ».

Il décrit les protocoles de prélèvements, indique les préconisations pré-analytiques (température et délai de transport) et les délais de rendu des résultats.

REMARQUES GENERALES

Prélèvements à visée diagnostiqueCe sont des prélèvements dont les résultats conduisent à instituer (ou à modifier ou àsurveiller) une thérapeutique.

Ils comportent deux grands types :• Prélèvements provenant de zones normalement stériles (hémocultures, LCR,

biopsies...) : Ils doivent être prélevés à l’aiguille en traversant la peau ou une muqueuse sainepréalablement désinfectées ou en per-opératoire puis déposés dans des flaconsstériles. Ces prélèvements sont invasifs, mais habituellement les meilleurs car noncontaminés.

• Prélèvements provenant de zones habituellement colonisées par des germes variés(peau, muqueuses, plaies...) :Leur obtention est relativement aisée (écouvillonnage, aspiration...) mais lapathogénicité des germes retrouvés n’est pas aisée à établir. C’est la raison pourlaquelle ces prélèvements superficiels doivent être limités le plus possible.

Certains prélèvements par écouvillonnage fournissent des résultats difficiles à interpréter :• escarres, ulcères variqueux • lésions gangréneuses superficielles • lésions buccales ou gingivales • brûlures • abcès péri rectaux

Ces prélèvements doivent être remplacés, dans la mesure du possible, par une aspiration àl’aiguille du liquide inflammatoire ou par une biopsie après nettoyage soigneux de la lésion.

Prélèvements à visée épidémiologiqueLes résultats de ces prélèvements permettent la mise en évidence de bactéries à l’origined’infections nosocomiales et/ou multi-résistantes aux antibiotiques :

• Entérobactéries productrices de béta-lactamases à spectre élargi (BLSE)• Staphylococcus aureus résistant à la Méticilline (SARM)

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• Entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC)• Entérocoques résistants à la Vancomycine (ERV)

Ces prélèvements doivent être clairement distingués de ceux à visée diagnostique.

Renseignements cliniquesLes techniques microbiologiques étant très diverses, les renseignements cliniques fournis sont primordiaux pour l’interprétation des résultats et l’orientation vers une contamination, une colonisation ou une infection réelle :

• localisation du prélèvement • antibiothérapie • neutropénie / immunodépression • principaux signes cliniques... • notion de voyage en pays exotique...

Ces renseignements sont à indiquer sur la fiche de suivi deprélèvement à joindre à l'ordonnance et à l’échantillon biologique.

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MATERIEL MIS A DISPOSITION ET RECOMMANDE PARLES LABORATOIRES BIOTOP

1. Ecouvillons

1.1 Description du matériel

Type Photo Utilisation Temps de surviemoyen des bactéries

Σ-TRANSWAB (violet) :bouchon violet / écouvillon

standard

VAGIN GORGE

BLESSURES

Bactéries (aérobies,anaérobies, exigeantes) /

MSRA

48H à T° ambiante ou2-8°C

(24H si recherche degonocoques)

Σ-TRANSWAB (orange) :bouchon orange /

écouvillon étroit et profond

URETREOEIL OREILLE NEZ

Bactéries (aérobies,anaérobies, exigeantes) /

MSRA


(24H si recherche degonocoques)

Σ-VCM :bouchon rouge, liquide

rouge / écouvillon standardou étroit

VIRUSCHLAMYDIAE

MYCOPLASMESUREAPLASMAGONOCOQUES

NEISSERIA

VAGIN : utiliser un kit avecécouvillon standard

URETRE : utiliser un kitavec écouvillon fin

48H à T° ambiante ou 2-8°C

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FECALTRANSWAB :bouchon bleu / écouvillon

standard

RECTUM SELLES

Entérobactéries

Entérocoques


DRYSWAB + milieuREMEL :

bouchon vert / écouvillonstandard

PRELEVEMENTNASOPHARYNGE

PCR de Bordetellapertussis (coqueluche)

A décharger dans lemilieu de transport

fourni et à amener leplus rapidement

possible.

Ecouvillon sec PRELEVEMENTNASOPHARYNGE POUR

RECHERCHE DEGRIPPE

24 à 48H à T° ambiante

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1.2 Modalités d’utilisation

1.2.1 Ecouvillons Σ-VCM, et Transwab (Σ-TRANSWAB (violet), Σ-TRANSWAB (orange)ou FECALTRANSWAB)

Remarque : Le milieu des Transwab violet et orange est identique, seule la taille de l'écouvillon change :

• l'orange est plus fin, donc mieux adapté pour les yeux, les prélèvements urétraux et éventuellement le nez, la gorge, les oreilles (prélèvements ORL)

• le violet est plus gros, donc mieux adapté pour le prélèvement vaginal, les plaies et également le nez, gorge

NB: un seul écouvillon par patient suffit.

Noter la localisation exacte du prélèvement et préciser si possible, sur la fiche de renseignements cliniques, si un traitement antibiotique a été pris dans les jours précédant le prélèvement.

La fiche de préconisation de prélèvement bactériologique sur écouvillon est fournie avec chaque kit de prélèvement :- DE-MU0-282 pour la recherche d’EPC ou ERV- IT-MU0-068 pour les autres examens réalisés sur écouvillon

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1.2.2 Ecouvillon DRYSWAB et milieu REMEL

Maintenir la tête du patient inclinée en arrière. Insérer l’écouvillon dans la narine et le pousser délicateemnt le plus loin possible, parallèlement au palais. (cf schéma)

Le laisser en place quelques secondes puis le retirer lentement en lui imprimant un léger mouvement rotatif. Procéder de même pour l’autre narine avec le même écouvillon.

Plonger l’écouvillon dans le milieu de transport : casser la tige manuellement pour permettre la fermeture étanche du bouchon.

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2. Flacons stériles

Flacon pour analyse des urines

Flacon pour analyse de selles

Flacon pour compte d’Addis (HLM)

Flacon pour recueil sur 24 heures

Flacon pour hémocultures

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Flacon UMMT (stabilisateur de mycoplasmes)

PRECONISATIONS PRE-ANALYTIQUES ET PROTOCOLES DE PRELEVEMENT

Les tableaux suivants détaillent les conditions de prélèvement, de transport et de stabilité deséchantillons en fonction de leur origine ainsi que les délais de rendu des résultats.

Les délais indiqués sont des délais moyens pouvant être allongés de 24 à 48h en cas de nécessitéde réaliser des tests complémentaires..

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1. URINES : ECBU ET AUTRES RECHERCHES SPECIFIQUES

1.1 Préconisations

CONDITIONS CONSERVATIONTRANSPORT COMMENTAIRES

Délai derendu desrésultats

ou

+

Recherche de germes banals(ECBU) :Utiliser de préférence lespremières urines du matinprélevées au milieu de lamiction et placées dans unflacon stérileIl est possible de transférer lesurines dans un tube boraté àtransmettre avec le flacon.

2H àtempératureambiante.12H à 2-8°C.

24H àtempératureambiantepour lesurinesboratées.

(voir protocole de recueil dans lechapitre suivant 1.2)

Renseignements cliniques nécessaires : symptômes, sonde,traitement antibiotique...

Préciser l’heure de mise au frigo(ou en tube boraté, le caséchéant)

Le résultat de la cytologie est noninterprétable dans les cas desondage à demeure.

1 à 5 jours

Cytologiecf. ECBU

1 jour

Recherche de Mycobactéries :Mettre le patient en diètehydrique la veille au soir etutiliser un récipient proprepour recueillir la totalité desurines du matin.A renouveler 3 jours de suite.


Examen de seconde intention auvu des premiers résultats del'ECBU.Examen transmis au laboratoireBiomnis ou au CHRU de Lille.

6semaines

Recherche de Chlamydiatrachomatis et /ou Neisseriagonorrhoeae et/ouMycoplasma genitalium :Utiliser les urines du 1er jetprélevées le matin et placéesdans un flacon à urines.

8 jours à 2-8°C.

Examen effectué par PCR.

Recherche de Mycoplasmagenitalium seul = HN 28Є

1 jour

Recherche de Mycoplasmesurogénitaux :Utiliser les urines du 1er jetprélevées le matin et placéesdans un flacon à urines.

1H àtempératureambiante.Jusqu'à 56h à+4°c sitransfert dansUMMT.

2 à 4 jours

Compte d'Addis ou HLM :3 heures avant le lever, le patient doitvider sa vessie dans les toilettes, boireun verre d'eau, se recoucher et resterallongé au repos pendant 3 heures.Après ces 3 heures, uriner


1 jour

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complètement dans le flacon etapporter les urines au laboratoire.

Recherche de parasites(bilharziose) :Utiliser les premières urines dumatin après effort modéré(monter les escaliers ousautiller).

24H àtempératureambiante.

Préciser le contexteépidémiologique (voyage,origine…)

1 à 2 jours

NB : Pour la pose de sonde, seuls les médecins et infirmiers sont habilités à effectuer ceprélèvement. Ce type de prélèvement n'est pas réalisé au laboratoire.

Si le délai d'acheminement ne peut être respecté, le laboratoire peut fournir aux Infirmiers,Médecins, Maisons de retraite et Hôpitaux, des tubes boratés sous vide afin de transvaserl'urine. L'échantillon peut alors être conservé jusque 24heures à température ambiante.

1.soulever la languette 2.mélanger par 8 à 10 retournements 3.bien repositionner la languetteet percuter le tube boraté

1.2 Protocole de recueil des urines en vue d’un ECBU

1.2.1 Protocole standard• Se laver soigneusement les mains.• Faire une toilette du méat urinaire à l'aide de la lingette imprégnée de solution antiseptique

(Chlorure de Benzalkonium) fournie ou avec de l'eau et du savon .• Uriner le premier jet dans les WC.• Uriner ensuite dans le flacon et le refermer soigneusement.• Identifier le flacon.

Une fiche de suivi de prélèvement bactériologique pour ECBU (DE-MU0-486) est fournieavec chaque kit de prélèvement.

1.2.2 Prélèvement avec sac collecteur (pour les enfants)• Mettre l'enfant sur le dos, les jambes repliés.• Se laver les mains, mettre des gants et nettoyer soigneusement la peau qui doit être propre

et sèche.• Détacher et jeter la découpe centrale de la poche et retirer le revêtement qui protège

l'adhésif.• Appliquer d'arrière en avant en massant pour obtenir une bonne adhérence.• Ne pas dépasser 30 minutes de pose du sac collecteur.

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• Pour enlever la poche, soulever un coin et détacher doucement. Pour assurer l'étanchéité,coller l'adhésif face contre face, renforcer éventuellement avec un sparadrap.

• Placer la poche d'urine dans un flacon stérile.• Identifier le flacon.

Une fiche de suivi de prélèvement bactériologique pour ECBU bébé et jeune enfant (DE-MU0-599) est fournie avec chaque kit de prélèvement

1.2.3 Sondage à demeure (SAD)Précautions de base : Respectez impérativement le système clos.Les sondes présentent un site de prélèvement sous forme d'une pastille.

• Clamper sous le site de prélèvement • Attendre• Après désinfection du site de prélèvement, récupérer l'urine fraîchement émise à la

seringue ou en prélèvement sous vide (tube boraté ).• Ne jamais prélever le sac collecteur• Identifier le prélèvement.

1.2.4 Prélèvement par sondage chez les patients incontinents• Respecter les règles d'asepsie (gants et compresses stériles, ........) .• Utiliser une sonde courte à extrémité arrondie.• Recueillir l'urine en milieu de jet.• Enlever la sonde.• Identifier le prélèvement.

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2. SELLES : COPROCULTURE / EXAMEN PARASITOLOGIQUE

CONDITIONS CONSERVATIONTRANSPORT

COMMENTAIRES Délai de rendudes résultats

ou

Recherche de germes banals :Le patient peut émettre lesselles dans un récipient proprepuis transfère, à l’aide d’unespatule, une quantitééquivalente à une noix dans lepot à coproculture fourni par lelaboratoire.

Dans le cas d’analyses sur 24 heures, la totalité est recueillie.

Quantité minimum de selles : 1 noix.

Pour les bébés : couche ou échantillon des selles provenant de la couche.

Dans la mesure du possible, recueillir un échantillon pathologique : liquide, glaireux, sanglant...

4H à températureambiante.12H à 2-8°C.

FECALTRANSWAB :72H àtempératureambiante ou à 2-8°C.

Remplir la fiche derenseignementscliniques (symptômes,traitementantibiotiques...).

2 à 4 jours

Recherche de Clostridiumdifficile

24H àtempératureambiante.5 jours à 2-8°C.

Examen effectué parPCR.

1 jour

Écouvillonnage anal pourrecherches spécifiques :Bactéries multirésistantes (à lavancomycine = ERV, Betalactamase à spectre élargi =BLSE, productrices decarbapénépases = EPC, étudede portage...

Introduire l'écouvillon au niveauintra-rectal profond (commepour une prise de températurerectale)

FECALTRANSWAB :48H àtempératureambiante ou à 2-8°C.

A effectuer impérativement le matin au lever avant la toilette et les premièresselles

2 à 4 jours

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Recueillir obligatoirementdes matières fécales

Examen parasitologique desselles :L’émission des parasitesn’étant pas continue, larecherche se fait de préférencesur 3 recueils avec 3 à 4 joursd'intervalle entre chaqueprélèvement.


Remplir la fiche derenseignementscliniques (symptômes,notion de voyage récent,traitementantibiotiques...).

1 à 3 jours

Recherche d'amibes ouparasites hématophages :Sur rendez-vous.Recueil des selles au laboratoire de préférence.

1/2H àtempératureambiante.


1 jour

Recherche de sang dans lesselles

3 jours entre 15-25°C7 jours entre 2-8°C

Se fait généralement 3jours de suite

Aucune restriction alimentaire

1 jour

Scotch-test (recherche d’oxyures) :Prélèvement le matin, au réveil, avant d'aller aux toilettes et avant la toilette.Appliquer un morceau de scotchcristal transparent, partie collantesur les plis de l'anus etdévelopper le scotch de façon àdéplisser les plis et l'appliquersur toute la surface.Coller ensuite le scotch bien àplat sur une lame de verre sansfaire de plis ni de bulles d’air.Répéter cette opération 1 à 2fois sur des lames différentes.Identifier les lames avec lenom et prénom du patient.



1 jour

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Recherche de Rotavirus ouAdenovirus ou Norovirus


1 jour

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3. SANG : HEMOCULTURES ET RECHERCHES DE PARASITES (PALUDISME...)

CONDITIONS CONSERVATION

TRANSPORT


Hémocultures :Sigma blood culturesystème (1 seul flacon) Recherche de germesaérobies et anaérobies.

Après asepsie rigoureuse : avec de l’alcool iodé, de la Bétadine® ou de l’alcool à70°, réaliser 2 applicationsséparées de 2 à 3 minutessur les doigts du préleveuret la peau du malade ainsique sur le bouchon de flacon d’hémoculture.

Prélever 10 ml de sang par ponction veineuse

(seringue ou dispositif) avec un matériel stérileet les introduire immédiatement dans leflacon d’hémoculture après avoir désinfecté le bouchon du flacon

- Homogénéiser le flacon par 2 ou 3 retournements.


La décharge bactérienne dans le sangn’étant pas toujours constante etpouvant être entravée par lessubstances inhibitrices (anticorps,antibiotiques), une série de 3hémocultures sur 48 heures estnécessaire pour isoler le germe encause.

En cas de prélèvement simultané à unprélèvement de tubes : prélever leflacon d’hémoculture en premier.

Apporter au laboratoire le plusrapidement possible, à l’abri de lalumière, mais l’échantillon seraaccepté jusqu'à 24h après leprélèvement.

Le document « hémocultures etrecommandations préanalytiques »(IT-MU0-127) est joint à chaque kit deprélèvement

Maximum 5jours pour unprélèvementnégatif

14 jours sifongémie oususpiciond’endocardite

ouRecherche depaludisme :Prélever de préférenceau pic fébrile.


Noter les symptômes, la notion de voyage récent et la prise de traitements prophylactiques ou antibiotiques.

Résultat partiel : < 2 h

Résultat complet : 1 jour

ouRecherche de parasitessanguins (leishmanies,filaires, trypanosomes) :


Noter les symptômes, la notion de voyage récent et la prise de traitements prophylactiques ou

Résultat partiel : < 2 h

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Prélever à minuit ou midipour les filaires.

antibiotiques. Résultat complet : 1 jour

4. PRELEVEMENT DE LA SPHERE GENITALE

Prélever avant antibiothérapie, hors période des règles, le cas échéant. Préciser la prise detraitement antibiotique.

4.1. Prélèvement vaginal

4.1.1 Préconisations

Délai d’acheminement < 4 heures en cas d’utilisation d’un écouvillon autre que celui remispar notre laboratoire

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Examenbactériologique desleucorrhées (=ECBL)

Recherche de strepto B

Σ-TRANSWAB(violet) :48H àtempératureambiante ou à 2-8°C.

Absence de toilette vaginale dansles 12 heures qui précédent leprélèvement.Éviter le prélèvement pendant lapériode menstruelle car la flore estmodifiée (sauf avis contraire duprescripteur).

2 à 4 jours

Recherche deMycoplasme :Prélever au niveau del'endocol et le noter surl'écouvillon.

Sigma VCM(rouge) :24-48H àtempératureambiante.48-72H à 2-8°C.

Analyse hors nomenclature 2 à 3 jours

Recherche deChlamydiaetrachomatis :Prélever au niveau del'endocol et le noter surl'écouvillon. Sigma VCM

(rouge)écouvillonnormal :24-48H àtempératureambiante.48-72H à 2-8°C.

1 seul écouvillon dans le milieu detransport pour Chlamydiae +Gonocoque + Mycoplasmagenitalium.

Recherche seule de Mycoplasmagenitalium = HN 28Є

1 jour

Recherche deGonocoque :Prélever au niveau del'endocol et le noter surl'écouvillon.

Recherche deMycoplasmagenitalium :Prélever au niveau del'endocol et le noter surl'écouvillon.

Recherche d'Herpes :Prélever le liquide desvésicules.

VCM (rouge)écouvillonnormal :24-48H àtempératureambiante.48-72H à 2-8°C.

Prise en charge par la sécurité socialesi Recherche d'Herpes par Culture.Si Recherche d'Herpes par PCR = HN61Є.Examen réalisé chez Biomnis ou auCHRU de Lille.

Délai detransmission +maximum 20jours

ECBL SEUL : 1 Σ-TRANSWAB violet suffit.

ECBL AVEC MYCOPLASMES ET/OU CHLAMYDIAE GONOCOQUES MYCOPLASMA GENITALIUM ET/OUHERPES : 1 Σ-TRANSWAB + 1 VCM

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4.1.2 Protocoles de prélèvement

◊ Prélèvement chez la femme pubère• Poser un spéculum, visualiser le col• Prélever au niveau du cul de sac vaginal postérieur et écouvillonner au niveau de lésion, le cas échéant• En cas de recherche de chlamydiae, « moucher » le col avec une compresse montée sur une pince

longuette afin d’éliminer la glaire cervicale en excès puis introduire l’écouvillon• Remettre l'écouvillon dans le milieu de transport

◊ Prélèvement chez la fillette ou la jeune fille vierge• Ecarter les lèvres délicatement• Ecouvillonner l’entrée du vagin sans traumatisme avec un écouvillon avec milieu de transport pour la

bactériologie classique• En présence d’une vulvite, penser à rechercher la présence d’oxyure au niveau de la marge anale par

un scotch-test (appliquer un scotch transparent sur la marge anale de préférence le matin au réveil avant toute toilette et le coller sur une lame)

◊ Prélèvement chez la femme âgée et/ou grabataire• Lavage soigné à l’eau savonneuse de tout le périnée• Spéculum facultatif• Ecouvillonner au niveau du vagin avec l’écouvillon avec milieu de transport pour la bactériologie

classique

Fermer correctement le système de prélèvement contenant l'écouvillon et le milieu de transport liquide

Porter le plus rapidement possible au laboratoire

REMARQUE : UN AUTO-PRELEVEMENT PEUT ETRE REALISE PAR LA PATIENTE (Cf. IT-MU0-168)

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4.2. Prélèvement urétral

4.2.1 PréconisationsDélai d’acheminement < 4 heures en cas d’utilisation d’un écouvillon autre que celui remis par notre

laboratoire

Au laboratoire : le prélèvement se fait sur rendez-vous (sauf si un biologiste est disponible)



Prélèvement urétral :Introduire 1 écouvillon finde 2 cm dans l'urètre.Tourner pendant 3-5 sec.

Σ-TRANSWAB(orange) :48H àtempératureambiante ou à 2-8°C.

Le patient ne doit pas uriner dansles 2 heures qui précédent leprélèvement.

Toilette avec désinfection depuisau moins 2 heures

2 à 4 jours

Recherche deChlamydiaetrachomatis, deMycoplasmes et deGonocoque :Introduire l'écouvillon finde 2 cm dans l'urètre.Tourner pendant 3-5 sec.

Sigma VCM(rouge)écouvillon fin :24-48H àtempératureambiante.48-72H à 2-8°C.

Toilette avec désinfection depuis aumoins 2 heuresLe test utilisé par les laboratoiresBIOTOP est suffisamment sensiblepour travailler sur un 1er jet d'urine ets'affranchir du prélèvement urétraldans le cadre de la recherche deChlamydiae.

Recherche seule de Mycoplasmagenitalium = HN 28Є

2 à 3 jours

Recherche d'Herpes :Prélever au niveauurétral ou le liquide desvésicules.

Sigma VCM(rouge)écouvillon fin :24-48H àtempératureambiante.48-72H à 2-8°C.

Toilette avec désinfection depuisau moins 2 heuresPrise en charge par la sécurité socialesi Recherche d'Herpes par Culture.Si Recherche d'Herpes par PCR = HN61ЄExamen réalisé chez Biomnis ou auCHRU de Lille.

Délai detransmission +maximum 20jours

PRELEVEMENT URETRAL SEUL : 1 Σ-TRANSWAB suffit sauf chez l’homme : 1 Σ-TRANSWAB + 1 VCM (car recherche de Chlamydiae obligatoire)

PRELEVEMENT URETRAL AVEC MYCOPLASMES ET/OU CHLAMYDIAE GONOCOQUES MYCOPLASMAGENITALIUM ET/OU HERPES : 1 Σ-TRANSWAB + 1 VCM Si Chlamydiae + herpès : 2 VCM

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4.2.2 Protocoles de prélèvement◊ Homme

• Introduire l'écouvillon au niveau du méat urétral sur 1 cm• Imprimer une légère rotation contre les parois pour recueillir des secrétions et des cellules épithéliales• Remettre l'écouvillon dans le milieu de transport• S'il existe un écoulement, récupérer la sérosité sur un écouvillon avec milieu de transport

◊ Femme• Après avoir installée la patiente en position gynécologique, écarter les grandes lèvres et introduire un

écouvillon fin au niveau du méat urétral sur environ 1 cm• Imprimer une légère rotation contre les parois pour recueillir des secrétions et des cellules épithéliales

Fermer correctement le système de prélèvement contenant l'écouvillon et le milieu de transport liquide

Porter le plus rapidement possible au laboratoire

4.3 Sperme



Spermoculture :Après avoir uriné etréalisé une toilettesoigneuse du gland,recueillir la totalité del'éjaculat dans leflacon.


Prélèvement par masturbation aprèsune abstinence de 2 à 5 jours, sansexcéder 7 jours

Sur rendez-vous.

2 à 4 jours

Spermogramme :Non réalisé au laboratoire BIOTOP.

4.4 Stérilet



Matériel mis dans unflacon stérile.

2H à température ambiante.24h entre 2-8°C

2 à 4 jours

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5. SPHERE ORLPrélever avant antibiothérapie. Préciser si traitement antibiotique.Mettre une paire de gants


TRANSPORT


Gorge et rhinopharynx :Faire émettre un « aaah » aupatient (diminution desréflexes nauséeux »Dégager la cavité buccaleavec l’abaisse-langue.Prélever à l’écouvillon lesamygdales et leur pourtour.(ou l’amygdale atteinte encas d’amygdaliteunilatérale)Eviter le contact avec lacavité buccale et la langue.

En présence d'ulcération oud'exsudat, effectuer le prélèvement à ce niveau.Suspicion de diphtérie :prélever en périphérie desfausses membranes

Σ-TRANSWAB(violet) :48H àtempératureambiante ou à2-8°C.

Ne pas manger ni boire dansl'heure qui précéde leprélèvement.

2 à 4 jours

Oreille :Éliminer les débris et lescroûtes du conduit auditif(si nécessaire) à l'aide d'unécouvillon humidifié.Prélever au niveau duconduit auditif (de l'oreilledésignée) en faisant tournerl'écouvillon.

Préciser l’oreille : gaucheou droite

Σ-TRANSWAB(violet) ouΣ-TRANSWAB(orange) :48H àtempératureambiante ou à2-8°C.

2 à 4 jours

Langue :Gratter fortement l'écouvillon sur la langue.

Σ-TRANSWAB(violet) :48H àtempératureambiante ou à2-8°C.

Ne pas manger ni boire dansl'heure qui précéde leprélèvement.Ne pas faire de brossage delangue avant le prélèvement.

2 à 4 jours

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Nez :Réaliser 2 prélèvements duconduit nasal en faisanttourner l'écouvillon

Identifier les prélèvementsen précisant la narine :gauche ou droite.

Σ-TRANSWAB(orange) :48H àtempératureambiante ou à2-8°C.

2 à 4 jours

Oeil :

Tirer la partie inférieure del’oeil

Réaliser un prélèvement ducoin inférieur interne del'oeil.

Si blépharite : Prélever lescroûtes palpébrales (croûtesde la paupière) + 1 à 2 cils àla pince à épiler stérile.

Σ-TRANSWAB(orange) :48H àtempératureambiante ou à2-8°C.

Prélèvement à réaliser avant latoilette faciale.

2 à 4 jours

Recherche de grippe :Maintenir la tête du patientinclinée vers l'arrière.Courber l'écouvillonlégèrement afin de l'introduiredans la caviténasopharyngienneInsérer l'écouvillon dans lanarine vers la caviténasopharyngiennepostérieure (pousserl'écouvillon délicatement leplus loin possible,parallèlement au palais)Tourner l'écouvillon àplusieurs reprises contre laparoi nasale puis le retirerlentement.Renouvelerl'opération pour l'autre narineavec le même écouvillon.

Écouvillonsec :24-48H àtempératureambiante.

Délai detransmission +1 jour

Recherche de coqueluche :Maintenir la tête du patientinclinée vers l'arrière.Courber l'écouvillonlégèrement afin de l'introduiredans la caviténasopharyngienne I Insérer l'écouvillon dans lanarine vers la caviténasopharyngienne

2H àtempératureambiante.DRYSWAB(bleu) + milieuREMEL :24-48H àtempératureambiante et à2-8°C.

Examen effectué par PCR.Protocole et fiche derenseignements cliniques jointsavec le kit de prélèvement.Examen réalisé chez Biomnisou au CHRU de Lille.

Délai detransmission +3 jours

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postérieure (pousserl'écouvillon délicatement leplus loin possible,parallèlement au palais).Tourner l'écouvillon àplusieurs reprises contre laparoi nasale puis le retirerlentement.

6. PRELEVEMENTS PULMONAIRES


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Expectorations :Recueillir les sécrétions dansun flacon stérile.

L’expectoration est réalisée parle patient lui-même à sondomicile, le matin au réveil depréférence. Bien expliquer aupatient qu’il ne s’agit pas d’unrecueil de salive mais que leprélèvement doit provenir desbronches. La principaledifficulté est d’éviter decontaminer le prélèvement parla flore salivaire.

Après rinçage bucco-dentaire à l’eau, le patient effectue un effort de toux (kinésithérapie si besoin pour les femmes et enfants) et expectore dans le pot stérile fourni par le laboratoire.


. 2 à 4 jours

Aspiration bronchiqueLavage broncho-alvéolaireCathéter bronchique protégéEn flacon stérile.


2 à 4 jours

Recherche de Mycobactéries :Recueil à jeun.


Examen réalisé chezBiomnis ou au CHRU deLille.Délai de rendu des

Délai detransmission + 6semaines

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résultats : 6 semainesmaximum.

7. PRELEVEMENTS DE LCR ET LIQUIDES DE PONCTION


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x3

LCR :Pour germes banals, 1 ml enflacon stérile.Pour les demandessupplémentaires (biochimie,mycobactéries, biologiemoléculaire, recherchesvirales...), augmenter lesvolumes en conséquence (1flacon par type d’analyse soitde 2 à 5 ml au total pour unadulte, 2 ml pour un enfant).


Examen direct, Gram et MGG : URGENCE <1h

Résultat complet : 3 à 4 jours

8 jours maximum en cas d’antibiogramme

+

Liquide articulaire 2H àtempératureambiante.24H àtempératureambiantepossible :persistancedesmicrocristauxmais perte decellules de 25à 50% .

Le flacon servira pour labactériologie, le tube citratepour la cytologie.

4 jours

+

Liquide pleuralLiquide péritonéalLiquide péricardiqueLiquide d’ascite


Le flacon servira pour labactériologie, le tube citratepour la cytologie.

2 à 4 jours

8 jours maximum en cas d’antibiogramme

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8. PRELEVEMENTS DE PEAU ET PHANEREPrélever avant traitement antibiotique (pour les examens bactériologiques) ou antifongique.(pour les examens mycologiques)Préciser si traitement.


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Prélèvement cutané (Plaiesuintante ou vésiculeuse, ulcère,escarre...) :

Découvrir le site de prélèvement.En cas de lésion au niveau du pied :disposer une protection jetable surle tabouret et y faire poser le pied.

Observer l’aspect de la plaie :➢ Si vésiculeuse : désinfecter

à l’alcool à 70°• Petites vésicules:Percer

avec une aiguille stérile et recueillir le pus sur un écouvillon Ʃ-TRANSWAB (violet)

• Grand nodules:Ponctionner le contenu à l'aide d'une seringue munie d'une aiguille; jeter l'aiguille et reboucher la seringue.

➢ Si suintante : écouvillonnerla plaie avec un écouvillonƩ-TRANSWAB (violet)

Si besoin : recouvrir la plaie d’unsparadrap

Σ-TRANSWAB(violet) :48H àtempératureambiante ouà 2-8°C.

Les renseignements cliniquessont indispensables pour orienterla recherche bactériologique etdifférencier contamination etinfection.

2 à 4 jours

Recherche de dermatophytes auniveau cutané :

A l’aide du vaccinostyle ou de lacurette, gratter fortement lapériphérie de la lésion et recueillirles squames dans un flaconstérile. 1 flacon par localisation enidentifiant les localisations sur leflacon.


4 semaines maximum.

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Recherche de dermatophytes auniveau du cuir chevelu ou deszones pileuses :Découvrir le site de prélèvement.Prélever les poils et cheveux(cassés courts) avec leursfollicules, à l'aide de la pince àépiler stérile à la limite de la peausaine et de la peau malade.Déposer l'ensemble dans unflacon stérile.Racler les squames en périphériede la lésion et les recueillir dansle flacon.Si suppurations : écouvillonner lepus.


4 semaines maximum

Recherche de dermatophytes auniveau unguéal :

Découvrir le site de prélèvement.En cas de lésion au niveau du pied :disposer une protection jetable surle tabouret et y faire poser le pied.- Lésion distale : Couper toute lapartie de l'ongle atteint avec lesciseaux jusqu'à la limite destissus sains. Prélever despoussières d'ongle en raclant latable interne à l'aide d'unvaccinostyle ou d'une curette, etles recueillir dans un flaconstérile.- Lésion proximale : Raclerfortement la table externe jusqu'à lalimite des tissus sains à l'aide d'unvaccinostyle ou d'une curette etrecueillir la poussière d'ongle dans


4 semaines maximum

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un flacon stérile (maintenu sous lalésion).Si suppurations : écouvillonner lepus.

Recherche de Demodex :Prélever les cils ou les poils debarbe dont la base paraît engluéedans une substance jaunâtre(aspect inflammatoire) dans unflacon stérile.


1 jour

Recherche de gale (Sarcoptesscabiei) :Soulever le toit de la vésicule ou dusillon à l’aide de la pointe duvaccinostyle, puis gratter assezfortement le plancher de la lésionavec le côté du vaccinostyle. En casde squames croûteuses, grattersimplement de manière à lesrécupérer à l’aide du vaccinostyle.


Regarder en priorité : -Sur la paume des mains, entreles doigts, le poignet, les avant-bras et le tronc. -Sur la plante des pieds, lesjambes et les aisselles chezles nourrissons. ATTENTION : En cas desquames croûteuses : seméfier d’une gale norvégienne,très contagieuse.

1 à 2 jours

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9. PRELEVEMENTS DE PUS, ABCES, BIOPSIES, OSDésinfecter le site de prélèvement à l'aide d'une solution non alcoolique.


TRANSPORT

COMMENTAIRES Délai derendu desrésultats

Pus :Percer avec une aiguille stérileet recueillir le pus surécouvillons.

Σ-TRANSWAB(violet) :48H àtempératureambiante ouà 2-8°C.

Les renseignements cliniques sontindispensables pour orienter la recherche bactériologique et différencier contamination et infection.

2 à 4 jours

Collections fermées :Ponctionner le contenu à l'aided'une seringue munie d'uneaiguille. Évacuer l'air aumaximum. Jeter l'aiguille etreboucher la seringue.Apporter la seringue dans lesplus brefs délais aulaboratoire.


Les renseignements cliniques sontindispensables pour orienter larecherche bactériologique etdifférencier contamination etinfection.

2 à 4 jours

Biopsies 2H àtempératureambiante.

2 à 4 jours

Prélèvements per-opératoires :Effectuer toujours plusieursprélèvements en des sitesdifférents.Bien les identifier.Pas d'écouvillonnage.


2 à 4 jours

10. BIOMATERIAUX


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CathétersSondes diversesRedonDrainMatériel implantableStérilet


Examen de sonde urinaire sansvaleur car contaminationconstante par de la floreurétrale.

2 à 4 jours

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