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THESE DE DOCTORAT En Biologie Option : Microbiologie Fondamentale et Appliquée Présenté par : Bengarnia Benmerine THEME Contribution à l'étude et l'évaluation de la qualité physico- chimique et bactériologique des eaux de consommation de la région d’oued Es-Saoura cas de Béni-Abbès, Ougarta et Zeghamra Membre du Jury : Président : HEDDADJI M. Prof. Université d'Oran 1 Examinateur : SAIDI N. MCA. Université d'Oran 1 Examinateur : BEKADA A. Prof. C U deTISSEMSILT Examinateur : MEDAH B. Prof. Université de MASCARA Examinateur : KABINE M Prof. Université de Casablanca Directeur de thèse : KIHAL Mebrouk Prof. Université d'Oran 1 2016

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THESE DE DOCTORAT En Biologie

Option : Microbiologie Fondamentale et Appliquée

Présenté par : Bengarnia Benmerine

THEME

Contribution à l'étude et l'évaluation de la qualité physico- chimique et bactériologique des eaux de consommation de la

région d’oued Es-Saoura cas de Béni-Abbès, Ougarta et Zeghamra

Membre du Jury :

Président : HEDDADJI M. Prof. Université d'Oran 1

Examinateur : SAIDI N. MCA. Université d'Oran 1

Examinateur : BEKADA A. Prof. C U deTISSEMSILT

Examinateur : MEDAH B. Prof. Université de MASCARA

Examinateur : KABINE M Prof. Université de Casablanca

Directeur de thèse : KIHAL Mebrouk Prof. Université d'Oran 1

2016

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Remerciements

Ces quelques lignes me permettront de remercier les responsables et les personnes qui ont

contribué de près ou de loin à la réalisation de ce travail tant au niveau scientifique qu’au

niveau personnel, et sans leur aide, ce travail n’aurait pas pu aboutir à sa fin.

Je tiens tout d’abord à remercier mon Directeur de thèse, le Professeur KIHAL Mebrouk, qui

a dirigé ce travail, ça ne sera jamais suffisant pour lui exprimer ma grande reconnaissance

pour la confiance qu’il m’a accepté pour faire avancer ce travail, pour sa patience, sa

gentillesse, et son esprit responsable, critique et rigoureux. Malgré ses innombrables

occupations au laboratoire comme ailleurs, il m’a confisqué énormément de temps, il m’a

attribué une grande partie de son savoir de biologiste avec beaucoup de patience et de rigueur.

À mon président de jury, Monsieur le Professeur Heddadji Miloud q ui m’a fait le plus

grand honneur de présider cette thèse. Qu’il trouve ici le témoignage de mon profond

respect et de ma sincère reconnaissance.

Je tiens à remercier Monsieur le Professeur Meddah Boumedien de l’université de Mascara, le

docteur SAIDI Noureddine le professeur Bekada Ahmed du centre universitaire de

Tissemsilt et le professeur Kabine Mostapha de l’université Ain ElChok Casablanca Maroc

pour avoir accepté de participer à mon jury et qui a bien voulu examiner le travail de

recherche de ma thèse

J’adresse également ma reconnaissance aux professeurs Henni Djamel Eddine, Guessas

Bettache et Benmecherene Zineb, pour leur soutient et leur aide durant la réalisation de ma

thèse au niveau du laboratoire de microbiologie appliquée de l’université d’Oran1.

Je tiens à remercier l'ensemble du personnel du laboratoire hospitalier de Béni-Abbès. Merci à

Mr Metahri Abdelhamid, directeur EPSP Béni-Abbès. Merci à tous les citoyens de Béni-

Abbès et aux autorités locaux, Merci au Docteur Bahira Belkacem a qui je souhaite une

Long et heureuse vie et de la santé.

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I

Table des matières

Remerciements

Table des matières.................................................................................................................... I

Résumé...................................................................................................................................... III

Summary .................................................................................................................................. IV

V ......................................................................................................................................... يخص

Liste des abréviations ............................................................................................................... VI

Liste des figures........................................................................................................................ VII

Liste des tableaux ..................................................................................................................... VIII

INTRODUCTION .................................................................................................................. 1

Contexte général de l’étude...................................................................................................... 3

I. Généralités sur l’eau ............................................................................................................. 4

I.1. L’usage de l’eau ................................................................................................................. 5

I.1.1. L’usage domestique ........................................................................................................ 5

I.1.2. Les besoins agricoles ...................................................................................................... 5

I.1.3. Les besoins industriels .................................................................................................... 5

I.2. Les ressource en eau ........................................................................................................... 5

I.3. Les types d’eaux douces .................................................................................................... 6

I.3.1. Les eaux souterraines ...................................................................................................... 6

I.3.1 Les eaux de surface .......................................................................................................... 6

I.4. Généralités sur la pollution ................................................................................................ 6

I.4 .1. Les origines de la pollution ............................................................................................ 7

I.5. Les principales causes de la pollution d’origine agricole .................................................. 7

I.5.1. Les principaux contaminants .......................................................................................... 8

I.6. Les effets et les conséquences de la pollution agricole¨ .................................................... 8

I.6.1. L’effet des fertilisants ..................................................................................................... 9

I.6.2. Les engrais chimiques ..................................................................................................... 9

I.6.3. Les phosphates ................................................................................................................ 9

I.6.4. Les métaux lourds ........................................................................................................... 9

I.6.5.Les produits phytosanitaires : .......................................................................................... 9

I.7. Les effets des plastiques et des déchets agricoles .............................................................. 9

I.7.1. Effet et dégagement de la mécanisation........................................................................... 9

I.7.2. Les effets des pesticides ................................................................................................... 10

I.7.3. Les pesticides .................................................................................................................. 10

I.8. Comportement et transfert des pesticides dans l’environnement........................................ 10

I.8.1.Transfert des pesticides vers les milieux aqueux .............................................................. 10

I.8.2.Transfert vers les eaux de surface (ruissellement) ........................................................... 10

I.8.3.Transfert dans le sol vers les eaux profondes (lixiviation et lessivage) ........................... 11

I.9. Effets toxiques des pesticides ............................................................................................ 11

I.9.1. Effets sur la santé humaine ............................................................................................. 11

I.9.2. Impact environnemental : écotoxicologue ...................................................................... 11

I.10. Cadre législatif et réglementaire ...................................................................................... 12

I.11.Qualité bactériologique ...................................................................................................... 13

I.11.I L'eau et la santé .............................................................................................................. 13

I.11.2. Bactéries pathogènes liées aux éclosions des maladies d'origine hydrique .................. 15

I.12. L'eau et les contaminations bactériennes ......................................................................... 17

I.12.1. Cadre réglementaire ...................................................................................................... 17

I.13. L’eau: véhicule d'agents pathogènes................................................................................. 20

I.13.1. L'eau : réserve d'agents pathogènes .............................................................................. 20

I.14. Méthodes de détection ...................................................................................................... 20

I.14.1. La méthode du nombre le plus probable (NPP) ............................................................ 20

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II

I.14.1.1. Les indicateurs de contamination fécale.................................................................... 22

I.14.1.2. Les microorganismes clés de la contamination ......................................................... 25

I.14.1.3. Bactéries hétérotrophes aérobie et anaérobies facultatives ........................................ 26

I.14.1.4.Coliformes totaux........................................................................................................ 26

I.14.1.5. Coliformes thermo tolérants....................................................................................... 27

I.14.1.6. Les entérocoques intestinaux ..................................................................................... 28

I.14.1.7. Clostridium perfringens et autres Clostridium sulfito-réducteurs.............................. 28

I.14.1.8. Les coliphages............................................................................................................. 28

II. Matériel et méthodes ............................................................................................................ 31

II.1. Présentation de la zone d’étude ........................................................................................ 31

II.2. Echantillonnage ................................................................................................................. 34

A. Prélèvement d'échantillons d'eau ......................................................................................... 34

B. Transport et conservation au laboratoire ............................................................................. 35

II.3. Analyse physicochimique ................................................................................................. 35

II.3.1. La température ............................................................................................................... 35

II.3.2. Le pH .............................................................................................................................. 35

II.3.3. Détermination résidus secs (RS).................................................................................... 36

II.3.4. La conductivité électrique.............................................................................................. 36

II.3.5.Détermination de l’alcalinité (TA –TAC) : .................................................................... 36

II.3.6.Détermination du titre hydrotimétrique (TH) : ............................................................... 36

II.3.7. Dosage des chlorures (Cl-) :........................................................................................... 36

II.3.8. Dosage des nitrates (NO-3 ) : ........................................................................................ 37

II.4.Analyses bactériologiques ................................................................................................. 42

II.4.I. Recherche et dénombrement des germes totaux ............................................................ 43

II.4.2.Dénombrement des coliformes totaux et fécaux : .......................................................... 44

II.4.3.Recherche et dénombrement des streptocoques fécaux ou Entérocoques ...................... 48

II.4.4.Recherche et dénombrement des spores de bactéries des anaérobies sulfitoréductrice

et de Clostridium sulfitoréducteurs...........................................................................................

50

II.4.4.1.Recherche et dénombrement des Clostridium Sulfito-Réducteurs .............................. 50

II.5. Recherche des germes pathogènes : .................................................................................. 52

II.5.1. Recherche de Salmonella................................................................................................ 52

II.5.2. Recherche de Vibrion cholirérique : .............................................................................. 54

II.5.3.Recherche de Staphylocoques à coagulase positive : ..................................................... 55

Résultats et discussion.............................................................................................................. 59

III.1. Paramètres physico-chimiques ........................................................................................ 59

III.1.1. La température............................................................................................................... 59

III.1.2. Le pH (potentiel hydrogène) ........................................................................................ 59

III.1.3. Conductivité ................................................................................................................. 60

III.1.4. Les résidus secs (RS)..................................................................................................... 60

III.1.5. La turbidité ................................................................................................................... 60

III.2. Résultats des analyses bactériologiques .......................................................................... 65

III.2.1. La microflore totale. ..................................................................................................... 65

III.2.2. Les indicateurs de contamination ................................................................................. 67

Article : 01 .......................................................................................................................................................... 76

Article :02 ............................................................................................................................................................................ 95

Références bibliographiques..................................................................................... 105

Annexe ........................................................................................................................................... 114

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III

Résumé Face au déficit hydrique, à la croissance démographique élevée, à l'urbanisation effrénée et

aux taux de croissance économique élevés que connaissent certains pays à climat aride tel

l’Algérie et surtout au sud dans des zones subarides comme Béni Abbes. L’eau jeu un rôle

très important dans la stabilité des citoyens. Avec la rareté des sources d’eaux d’une part et la

vulnérabilité de l’autre part.

Les eaux de consommation sont susceptibles de renfermer et de déplacer une grande diversité

d'agents pathogènes pour l'homme (virus, bactéries et parasites). Les organismes pathogènes

présents dans les eaux de consommation d'une société, en expriment l'état sanitaire. En

Algérie et principalement dans la Wilaya de Béni Abbes. L’objectif de cette étude est de

évaluer les caractéristiques physico-chimiques (pH, conductivité, température et salinité), et

bactériologiques par dénombrement des indicateurs de contamination fécale, ainsi que

l’identification des souches pathogènes tout au long du procédé du traitement des eaux brutes

jusqu’à l’arrivée au consommateur. Tandis que les foggaras sont de propriété privé

sont utilisées pour l’irrigation de leurs jardins et au même temps pour la consommation la

foggara d’Ougarta il peut transmettre des maladies hydriques surtout cette foggara n‘est pas

surveillée ni protégé contre les animaux errants tels que les chiens, les chats et les oiseaux.

dans cette source on aremarqué la détérioration de cette eau et elle est impropre à la

consommation de point de vue la charge microbienne. Mais les analyse physico chimiques

montrent le début de la dégradation des eaux surtout celle de puits communal, suite à son

situation prés de rejet principal des eaux usées de la ville et du cimetière et de quelques

mètres de la bergerie de centre de recherche. Ces dernières années de sécheresse par

conséquent augmentation de taux de salinité.

Pour une meilleure interprétation.de ces résultats et de dresser une base de donnes avec des

spectres de référence permettra d’atteindre une plus grande importance de garder la qualité

des eaux et préserver de la dégradation.

Mots clés: Eaux consommation, eaux souterrain, Bactéries fécales, paramètres Physico-

chimiques, zone subaride, Algerie, Béni Abbés

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IV

Summary Facing the water shortage, the high population growth, rapid urbanization and high economic

growth rates experienced by some countries to arid climate as Algeria and especially south in

areas like e sub-arid Beni Abbes. The water play a very important role in the stability of

citizens. With the scarcity of water sources on the one hand and the vulnerability of the other.

consumption of water is likely to contain and convey a wide variety of pathogens to humans

(viruses, bacteria and parasites). Pathogenic organisms in water consumption of a community,

reflected in the health status. In Algeria, mainly in the Wilaya of Beni Abbes. The objective

of this study is to determine the physical and chemical characteristics (pH, conductivity,

temperature and salinity), and bacteriological by counting the indicators of fecal

contamination, and identification of pathogenic strains throughout the process of

processing raw water until the arrival to the consumer. While foggaras are private property

are used for irrigation of their gardens and at the same time for consumption Ougarta’s

foggaras it can transmit waterborne diseases especially this foggaras is not monitored nor

protected against stray animals such as dogs, cats and birds. in this source we noticed the

deterioration of the water and is unfit for consumption of the microbial point of view.

But the physical and chemical analysis show the beginning of the water degradation

especially of communal well, following its rejection principal Meadows waste water

situation of the city and the cemetery and just meters from the fold of the research

center. In recent year’s drought therefore increasing salinity.

For better interpretation. To these results and database drawing with basic reference

spectra will achieve greater importance to keep the water quality and preserve degradation.

Keywords: water consumption, underground water, fecal bacteria, physico-chemical

parameters,sub-arid area , Algeria, Beni Abbes

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V

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VI

Liste des abréviations BCPL: bouillon lactose au pourpre de bromocrésol.

C°: degré Celsius.

PH potentiel d’hydrogène. mg

Méq/l : milligramme par litre. :

TA : milliéquivalent par litre. titre alcalimétrique simple.

TAC : titre alcalimétrique complet.

TH titre hydrométrique

OMS Organisation Mondiale de la Santé.

J.O.R.A Journal Officiel Algérien

Ca+2

ions de calcium

Mg+2

ions de magnésium.

K+ ions de potassium

Na+2

ions de sodium.

Mn+2

ions de manganèse.

MES : matière en suspension.

NO -3

ions de nitrate.

Zn zinc.

MO : matière organique

. % pourcentage.

NNP Nombre le plus probable.

S/C : simple concentration

D/C double concentration. KIA : milieu de Klugér. VF : friande foie.

EVA : bouillon glucosé à l’éthyle violet et de sodium.

EPA : eau péptonée alcalin

SS : Salmonella-Shigella

TSI three sugar iran.

EVA : Bouillon glucosé àl’éthyle violet et de sodium

EPA Eau péptonée alcaline. SFB Bouillon de Sélénite. GNAB. Gélose Nutritive Biliée TGEA : Gélose Tryptone Glucose d’Extrait Agar. OMS : Organisation mondiale de la santé. (+) : Positif. (-) : Négatif µs/cm : Micro siemens par centimètre.

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VII

Liste des figures

Figure N° 01 : stock total d’eau sur la planète 7

Figure N° 02 : Carte géographique de la zone d'étude 36

Figure N° 03 : Positionnement des sites d’étude N° 01, 02,03 et 04 . 37

Figure N° 04 : Positionnement de site d’étude N° 05 37

Figure N° 05 : Positionnement de site d’étude N° 06 38

Figure N° 06 : Recherche et dénombrement des germes totaux dans l’eau 48

Figure N° 07 : Recherche et dénombrement des coliformes totaux et fécaux dans l’eau 53

Figure N° 08 : Recherche et dénombrement des stereptocoques fécaux dans l’eau 53

Figure N° 09 : Recherche et dénombrement des Clostridium sulfito-réducteurs 55

Figure N° 10 : Recherche de Salmonella 58

Figure N° 11 : Recherche de Vibrion cholirérique 59

Figure N° 12 : Recherche de Staphylocoques à coagulase positive 62

Figure N° 13 : variation de la température des eaux des sites d'études 70

Figure N° 14 : variation du pH des eaux des sites d'études 70

Figure N° 15 : La variation des paramètres chimique des eaux de Béni- Abbes 71

Figure N° 16 : variation des la charge microbienne totale des eaux de Béni Abbés 73

Figure N° 17 : Aspect des colonies microbiennes sur milieu de dénombrement dans la

foggara d’Ougarta

73

Figure N° 18 : Aspect de la croissance des coliformes sur milieu BCPL lactose. 75

Figure N° 19 : Croissance des coliformes fécaux sur milieu liquide Shuber indiquant la

production de gaz et l'indole

77

Figure N° 20 : la variation des coliformes totaux, fécaux , E. coli et streptocoques fécaux dans

les eaux de Béni Abbés

77

Figure N° 21 : Croissance des entérocoques sur milieu ROTHE. 79

Figure N° 22 : Aspect des colonies de couleur noir de Clostridium sp. sur milieu VF

incubée à 37°C et à 46°C.

80

Figure N° 23 : Croissance de Vibrion sur milieu Eau peptonée alcalin pH 9. Le

flacon 2 montre la présence d'un film à la surface et l'apparition de l'aspect

des colonies sur GNAB.

80

Figure N° 24 : Identification des isolats par l'utilisation des plaques API 20 E spécifique aux

entérocoques.

81

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VIII

Liste des tableaux

Tableau N° 01 : Principaux microorganismes indicateurs et index d'intérêt en santé

publique

25

Tableau N° 02 : Événements marquants de l'histoire de la recherche sur les indicateurs de

Contamination fécale source

26

Tableau N° 03 : Techniques de conservation des échantillons destinés à l’analyse physico-

chimique

46

Tableau N° 04 : Méthode de dénombrement des germes de contamination fécale et

d’efficacité de traitement

54

Tableau N° 05 : Représente la répartition les espèces dominantes dans les différentes

sources d'eau de la ville de Béni-Abbes.

118

Tableau N° 06 : Paramètres physico-chimiques des eaux de consommation de la zone de

Béni Abbes

119

Tableau N° 07 : Les caracteres biochimiques pour les différentes espèces de

staphylocoques

120

Tableau N° 08 : La charge microbienne et les autres paramètres microbiologiques des

différentes sources d'eau de la ville de Beni-Abbes

118

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Introduction

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1

INTRODUCTION L'eau, c'est la vie, a-t-on l'habitude de dire. C'est en effet « le solvant universel»; il est

composé d'oxygène et d'hydrogène qui, avec le carbone sont indispensables à la formation

cellulaire (Hertig et al., 2006). Dans la nature, l’eau n’est pas toujours source de vie. Elle peut

véhiculer de nombreux micro-organismes, bactéries, virus et protistes de tout genre, qui y

vivent et s’y développent. La bonne qualité de l’eau constitue un élément très important

pour la protection de la santé publique. Dans cet objectif, au cours du temps, les scientifiques

ont inventé des règles protectrices qui vont de la ressource jusqu'au robinet du

consommateur. La m a j o r i t é de ces règles ont été approprié dans les réglementations

sanitaires et s'utilisent spécialement à deux étapes qui sont les risques microbiologiques et

les risques chimiques (WHO, 1996). La menace microbiologique est un risque microbien. La

qualité microbiologique est appropriée à la qualité bactérienne qui ne sont qu'un des éléments

naturel de propagation de micro-organismes, certains d'entre sont pathogènes. Distribuer de

l'eau potable, c'est circuler une eau sans germes pathogènes (Haslay, 1993)

Relatif au risque chimique, la multitude de composants chimiques qui existent, à la fois

d'origines naturelle et anthropique, emportent des analyses nombreuses et complexes, qui

paraissent souvent couteuses. Cependant, de la netteté du résultat analytique résultera la

qualité des eaux et/ou le choix des méthodes de traitement. Ainsi la concordance de l'eau de

distribution est évaluée en comparant les résultats lors de l'analyse d'un échantillon

avec l'ensemble des paramètres qui font l'objet d'une norme ou référence de qualité. Canaliser

de l'eau potable, c'est distribuer une eau conforme aux normes de potabilité (Rodier, 1984).

Les microorganismes pathogènes qui peuvent être présents dans l'eau sont très nombreux et

variés. Leur présence est toujours liée à une pollution fécale de celle-ci. Cependant, il est

difficile de les mettre en évidence, d'une part, parce qu'ils sont trop nombreux pour faire

l'objet d'une recherche spécifique, et d'autre part, parce que leur identification demeure

souvent difficile voire impossible (virus). De plus, leur durée de vie dans l'eau est parfois très

courte.

L'analyse bactériologique est donc une action obligatoire de l’expertise sanitaire, car il permet

de mettre en évidence la pollution fécale de l'eau. Elle permet également de contrôler

l'efficacité des importances de la préservation ou de traitement.

Notre travail contribue à l’identification et la quantification de certains foyers de pollution

d’origine fécale à partir des données rassemblées et traitées.

Ceci acceptera par la suite d’élever le dénombrement du degré de pollution des ressources

en eau souterraine et la préparation d’un plan d’action pour la protection de ses ressources

hydriques.

Pour atteindre cet objectif, notre travail sera subdivisé en trois chapitres :

D a n s un premier chapitre nous présenterons le contexte d’étude et la problématique de la zone fait objet d’étude.

L e deuxième sera consacré à l’étude expérimentale physico-chimiques et

microbiologiques.

Le troisième chapitre nous exposerons les résultats obtenues et leur discussion avec les

travaux comparables réalisés dans d’autres régions.

D a n s le dernier chapitre nous listons les références bibliographiques utilisées dans la

rédaction et la discussion de cette thèse.

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Revue bibliographique

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3

Contexte général de l’étude

En Algérie a toujours fait du développent du secteur de l'eau un avantage et un choix

stratégique. Ce secteur qui constitue un des principaux clés du développement économique et

social, se trouve connecté à deux défis essentiels: Le stress des ressources en eau en rapport

avec l’augmentation de la demande en eau tous usages associés, avec une tendance à la

pénurie. Et la détérioration des ressources en eau qui amènent différentes formes de pollution.

La disette des ressources en eau, et la forte irrégularité aussi bien spatiale, que temporelle, qui

définissent le contexte algérien, ont déterminé les choix des pouvoirs publics à choisir une

stratégie globale dont les résultats ont démontré son efficacité particulièrement durant les

périodes de sécheresse consécutives. Cette astuce a concerné aussi bien le plan législatif et

réglementaire, que le plan de l’évaluation et de la préservation des ressources en eau.

La politique de signal et de protection des ressources en eau, en particulier souterraine,

nécessite une gestion en collaboration ainsi que le recours à de nouvelles approches et

technologies pour compléter les procédés conventionnelles utilisées jusqu'à présent. Les eaux

souterraines ont une double possession, elles font partie et du cycle de l'eau et du sous sol.

Elles sont liées aux eaux de surfaces et s'interpénètrent continuellement dans l'espace et dans

le temps à la faveur d'infiltration et de drainage. Elles se renouvellent par une partie d'eau

pluviale qui s'infiltre, et sont soumises aux effets de 1'atmosphère ou une partie s'y retourne

par évaporation directe ou indirecte. Elles sont profondément liées au sous-sol dont elles sont

un constituant essentiel et actif. Elles ne peuvent être considérées ni comme une

ressource a part, ni comme une ressource naturelle du sol comparable aux autres. Elles

constituent des réserves d'eau et d’écoulement en circulation comme les eaux superficielles.

Leur renaissance s'effectue par 1'infiltration de 1'eau pluviale, et cette alimentation garde leur

débit d'écoulement.

Leur répartition dans l'espace, beaucoup plus continue que celle des eaux de surface, dépend

des formations géologiques dont la structure enveloppe leur dynamique. Ainsi, l'eau

souterraine s'écoule très lentement et offre une grande relâche. Si, en surface, l'eau s'écoule a

des vitesses de l'ordre de mètre /seconde, dans le sous-sol par contre, la vitesse varie selon les

cas des quelque mètre/jour en perméables, a une dizaine de km/jour en milieux fissurés.

L’espace de la prorogation peut aller de quelques mois pour les nappes à faibles réserves et a

fort débit à plusieurs milliers d'années pour les nappes profondes quasi-fossiles.

Alors qu'une réserve d'eau de surface peut mettre quelques jours ou au plus quelques mois

pour se remplir et/ou se vider, pour une réserve souterraine, ces durées s'expriment en

années, avec au plus quelques «sous-alternances» saisonnières. La prise en compte du flux

de renouveau par rapport a la réserve et du degré de liaison aquifère /eau de surface,

permet d'étudier leur Sollicitation et leur gestion. La ressource en eau souterraine est une

notion a la fois relative et diverse (Castany, 1982) : -Relative a l'échelle de l'espace, de la

durée de référence et aux critères d'évaluation;-Multidimensionnelle car elle s'exprime en

terme de flux, de stock, de régime de reprise, de qualité, de conditions d'accès et de prix de

revient, et de désorienté internes et externes au système. Au plan physique, le premier caractère spécifique aux eaux souterraines est la conjonction du

flux et de stock, et par l a suite, l’approvisionnement entre ressource renouvelable et

non renouvelable propre a l'eau souterraine. Les évaluations respectives de ces deux

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termes sont soumis à la fois des conditions naturelles et des objectifs socio-économiques

d'utilisation de l'eau. Au plan socio-économique, la contrariété de l'usager se conduit à

la production de ses ouvrages et au mieux a la ressource locale dont la production et la

préservation ont surtout le sens de protection contre ses concurrents. Leur collecte de la

ressource est très proportionnelle. Elle se limite à 1'intérêt particulier. Au plan économique,

les gestionnaires se placent à l'échelle de la ressource régionale. Ils sont munis de moyens

techniques d'étude, de calcul et de gestion, mais démunis des moyens directs d'action sur

1'eau souterraine ( El Hbil, 1995).

Cette différence de collecte de la ressource selon le niveau auquel on se place entraine une

différenciation entre: -La ressource locale relative a un captage ou groupe de captages en tant qu'élément assurant la

continuité de la production avec un risque de défaillance évalué. -La possibilité régionale d'un système perméable en tant que ressource au sens économique. Ces eaux souterraines jouent un rôle important dans le développement socio-économique. Ces

prélèvements sont réalisés de plus en plus par pompage au déterminent des

écoulements gravitaires. Séparément déjà de tout changement climatique, la gestion de l'eau

est l'un des grands problèmes qui conditionne l'avenir en Algérie et à Béni Abbès Le pays et surtout les zones arides et subarides devrait être en situation de stress hydrique, se

retrouver en situation de pénurie d'eau, car des problèmes importants de qualité se placeront

en relation avec l'érosion, la salinisation et la pollution. Les variations climatiques étaient aptes d’augmenter les impacts négatifs de la rareté, de la

différence spatio-temporelle et de la forte dégradation qui caractérise les ressources en eau sur

le développement socio-économique. Toutes les eaux de la nature ne sont pas bonnes à boire. Même une eau d’apparence pure

transporte avec lui toutes sortes de substances inertes et vivantes, dont certaines peuvent être

nocives pour l’organisme humain. Ces substances résultent soit du milieu physique

dans lequel.L’eau a évolué, soit des rejets de certaines activités humaines dont l’eau est

devenue le réservoir. L’eau est ainsi le vecteur de communication possédant de nombreuses

maladies. En effet, chaque année 2,5 millions de personnes meurent d’avoir bu de l’eau

contaminée (Pujals et al., 2006). L'eau est l'élément naturel indispensable à la vie et au bonheur des différents besoins humains

(Bouziani, 2006). I. Généralités sur l’eau

Nom féminin du latin aqua, l’eau est un corps incolore, inodore, insipide, liquide à la

température ordinaire et composé d’hydrogène et d’oxygène (H2O). L’eau était considérée

par les anciens comme l’un des quatre éléments de base avec le feu, l’air et la terre. Elle fait

un élément essentiel à la vie. Elle est le substrat fondamental des activités biologiques et le

constituant le plus important des êtres vivants (70 % de leurs poids en moyenne). L’eau se retrouve dans l’écosphère sous trois états ; solide, liquide, et gazeux dépendant des

conditions particulières de température et de pression. L’eau a des propriétés physico-

chimiques assez remarquables par rapport aux autres liquides car elle est un excellent

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solvant, elle solubilise de nombreux gaz, corps minéraux et organiques, ionise les

électrolytes et disperse les aloïdes électro chargés (Michard, 2002).

I.1. L’usage de l’eau

I.1.1. L’usage domestique

Les eaux de consommation publique sont utilisées à différentes fins. Un habitant consomme

230 l par jour, n’en utilise que seulement 1 % pour la boisson et 6 % pour la

préparation de la nourriture, les 93 % restant sont consacrés aux bains- douches (39 %), aux

sanitaires (20 %), au lavage de la linge (12 %), de la vaisselle (10 %), à des usages

domestiques divers (6 %) et au lavage des voitures et arrosage du jardin (6 %) (Defrance

Schki, 1996).

I.1.2. Les besoins agricoles

L’agriculture est une grande consommatrice de l’eau pour l’irrigation et l’élevage.

L’irrigation nécessite des volumes élevés. Un hectare de maïs consomme 20.000 m3

d’eau

pendant sa période végétative, et un hectare de riz 40.000 m3

en moyenne ( Bensouilah,

1995).

I.1.3. Les besoins industriels

L’industrie est consommatrice de l’eau. Elle a de multiples fonctions, par exemple celle de

fluides de refroidissement et de substance primaire (dans le domaine de la production) ou de

solvant et de milieu réactionnel (dans l’industrie chimique par exemple) (Gilli et al., 2004).

I.2. Les ressources en eau

La plus grande partie de l'eau sur terre est constitué des océans et mers. La quantité d'eau

douce n'atteint pas 3% dont les 2/3 se trouvent sous forme de glace dans les calottes polaires

et les glaciers. L'eau douce contenue dans le sous sol, les lacs, les rivières, les courants, les

étangs et les marais représente moins de 1% de tout le stock mondial d'eau. (CIR , 1983).

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L’eau recouvre 72 % de la surface terrestre et représente une réserve totale de 1350 milliards

de km3

dans la biosphère. Cependant l’eau se trouve en constant recyclage. L’eau

douce ne représente que 2,5 % du stock total d’eau sur la planète (les 97,5 % restant étant

salés): or 2/3 de l’eau douce planétaire est concentrée dans les glaciers et la couverture

neigeuse et 1/3 dans les nappes souterraines difficiles d’accès. Il ne reste que 0,3 % de l’eau

douce (soit 0,007 % de la totalité de l'eau de la planète) dans les rivières, les ruisseaux, les

réservoirs et les lacs. Seule cette

infime partie est aisément disponible et se renouvelle relativement rapidement : 16 jours en

moyenne pour une rivière, 17 ans pour un lac (Mebarki, 2005).

I.3. Les types d’eaux douces

Il existe deux types d’eaux douces qui sont les eaux souterraines et les eaux de surface.

I.3.1. Les eaux souterraines

Ce sont les eaux des nappes phréatiques qui correspondent à 22 % des réserves d’eaux

douces, soit environ 1000 milliard de m3.L'eau souterraine provient essentiellement de

l'infiltration des eaux de pluie qui atteint les nappes aquifères en traversant les couches

souterraines (CIR, 1983). La porosité de la structure du sol déterminant le type de la nappe

et le mode de circulation des eaux souterraines. Une nappe peut être libre. Elle est alimentée

directement par l'infiltration des eaux de ruissellement. Le niveau de cette nappe fluctue en

fonction de la qualité d'eau retenue. Elle peut être captive. Elle est alors séparée de la surface

du sol par une couche imperméable. Elle est généralement plus profonde. Un cas exclusif est

présenté par les nappes alluviales: ce sont les

nappes situées dans les terrains alluvionnaires sur lesquels circule un cours d'eau. La qualité

de ses eaux est alors influencée par la qualité de l'eau de la rivière.

La nature géologique du terrain a une base caractéristique sur la composition chimique de

l'eau (OMS, 2000). Ces eaux présentent une faible turbidité, une température et une

composition chimique constante.

I.3.1 Les eaux de surface

Elles regroupent toutes les eaux provenant d’un mélange d'écoulements souterrains et des

eaux de pluie qui coulent ou qui demeurent à la surface du sol. Elles comprennent les eaux

des grands cours d'eau, des étangs et des lacs ainsi que des petits ruisseaux alimentés par des

sources et qui captent eaux de ruissellement des bassins versants. Les ruissellements de

surface constituent la cause essentielle de la turbidité et de la teneur en matières organiques

(M D D E P, 2012), des débris d'origine végétale ou animale, ainsi que des

microorganismes pathogènes des eaux de surface. C'est ainsi que les eaux de surface font

plus objets des pollutions physico-chimiques et microbiennes. En outre, elles assurent un développement important de zooplancton et de phytoplancton qui

se multiplient par photosynthèse grâce aux sels minéraux dissouts dans l'eau. La pollution

organique souvent à l'eutrophisation de ces eaux.

I.4. Généralités sur la pollution

Le terme « pollution » informe la présence d’une substance au- delà d’un seuil pour

lequel des Conséquences négatifs sont susceptibles de se produire (Ramade, 2000.). Polluer signifie étymologiquement : contaminer, souiller, salir, dégrader. Ces vocales ne

prêtent pas à équivoque et nous paraissent tout aussi accordes que les longues définitions

données par les experts. Parmi celles- ci nous retiendrons la suivante, publiée dans un

rapport rédigé en 1965 par le comité scientifique officiel de la maison blanche intitulée :

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«pour restaurer la qualité de notre environnement » : «La pollution est une modification

opposé du milieu naturel qui apparaît en totalité ou en partie comme un sous- produit de

l’action humaine, au travers d’effets directs ou indirects altérant les critères de répartition du

flux d’énergie, des niveaux de l’interdiction, de la constitution physico- chimique du milieu

naturel et de l’abondance des espèces vivantes. Ces modifications peuvent attribuer à

l’homme directement ou à travers des ressources agricoles, en eau et en autres produits

biologiques. Elles peuvent aussi l’affecter en altérant les objets physiques qu’ils possèdent, les possibilités

réactives du milieu. » (Ramade, 2002). I.4 .1. Les origines de la pollution

Selon Gaujout (1995) l’origine des substances polluantes est divisée en quatre catégories : I.4.1.1. La pollution domestique

Elle résulte des habitations et elle est, en général, transportée par le réseau

d’assainissement jusqu’à la station d’épuration. La pollution domestique se caractérise par la

présence des germes fécaux, de fortes teneurs en matières organique, des sels minéraux et

des nettoyants (Gaujout,

1995). Elle peut être responsable de la détérioration des conditions de clarté et d’oxygénation

de l’eau ainsi que de la croissance de l’eutrophisation dans les rivières (Faurie et al., 2003 ). I.4.1.2. La pollution industrielle

Elle provient des usines et elle est caractérisée par la présence d’une grande diversité

des polluants, selon l’utilisation de l’eau tels que (Calvet et al., 2005):

Les hydrocarbures (raffinerie) ;

Les métaux (traitement de la surface) ;

Les acides, les bases, les produits chimiques divers (industries chimiques) ;

L’eau chaude (circuit de refroidissement des centrales thermiques) ;

Les matières radioactives (centres nucléaires, traitement des déchets radioactifs). Il peut y avoir un effet toxique sur les organismes vivants, par l’assemblage de certains

éléments dans les denrées alimentaires tels que les métaux et les pesticides (Calvet et al.,

2005). II.4.1.3. Pollution naturelle

Certains auteurs considèrent que divers phénomènes naturels sont aussi à l’origine de la

pollution

(ébullition volcaniques, etc.) (Grosclaude, 999). I.4.1.4. La pollution agricole

Elle provient des fermes ou des cultures et elle se caractérise par les fortes teneurs en sels

présence de produits chimiques du traitement (pesticides, minéraux (NO2, P, K,) et la

engrais...) (Grosclaude, 1999). I.5. Les principales causes de la pollution d’origine agricole

La pollution agricole s’est augmentée depuis que l’agriculture est entrée dans un stade de

motorisation. La pollution d’origine agricole peut se présenter sous deux formes diffuse

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lorsque elle concerne de grandes surfaces et ponctuelle lorsqu’elle est accidentelle ou

chronique sur un espace plus réduit (Grosclaude, 1999).

I.5.1. Les principaux contaminants I.5.1.1. Les fertilisants

Les engrais chimiques sont propagés dans les sols afin de développer les rendements des

végétaux cultivés. Parmi les éléments principaux aux développements des plantes, nous avons

l’azote, le phosphate, le potassium et dans une moindre mesure le souffre, le calcium, le

magnésium et d’autres oligoéléments. L’usage continu de ces produits contamine donc les

eaux superficielles et même les nappes phréatiques (Conrad et al., 1999). I.5.1.2 Les engrais azotés

Parmi les engrais chimiques les plus utilisés nous citons le nitrate d’ammonium, le nitrate de

calcium, le sulfate d’ammonium et l’urée. Les nitrates proviennent essentiellement de la

minéralisation des matières organiques du sol et des apports d’engrais minéraux azotés. La

lixiviation a lieu lorsque la couche du sol atteint l’humidité à la capacité au champ, le

drainage récupère et les pertes vont attacher du stock d’azote minéral présent et de la

pluviométrie hibernale (Conrad et al., 1999). Les dégagements d’ammoniac [NH3] sont issus principalement de l’élevage.

Maintenant, environ 40 % de l’azote ingéré par les animaux sont perdus et rapidement

transformés en ions [NH4+] surtout lors du stockage et l’épandage des déjections

animales. L’utilisation de l’ammoniac anhydre et de l’urée engendre également des pertes

qui peuvent atteindre 15 à 35%, en particulier, lors d’apports superficiels en sol calcaire

(Danish EPA , 1999) . I.5.1.3. Les phosphates

Les phosphates sont surtout propagés sous forme de superphosphates (ortho phosphates

solubles). La majorité du phosphore utilisé comme engrais chimiques est fixé dans les sols à

cause de leur richesse en azote, en aluminium et en fer qui fixent ces éléments (Danish EPA ,

1999) . I.5.1.4. Les pesticides

L’usage des pesticides connaît une extension considérable, non seulement dans les pays

développés et sur les cultures tropicales de commerce, mais aussi dans l’ensemble des

pays du tiers monde où la «révolution verte » a augmenté les exigences en traitements

antiparasitaires car elle a reproduit des variétés moins résistantes aux divers nuisibles des

cultures que les souches indigènes cultivées. Cependant ces pesticides s’accumulent dans les

sols et les nappes phréatiques (Lemercier, 2003).

I.6. Les effets et les conséquences de la pollution agricole I.6.1. L’effet des engrais

Les engrais chimiques tels que le nitrate d’ammonium, de calcium, de sulfate d’ammoniac, le

superphosphate, etc., nécessaires, à la production croissante d’aliments, sont devenus une

source importante de pollution des sols et des eaux (Adriano, 2001). Ils provoquent un

déséquilibre de certains cycles des éléments biogéochimique et la détérioration du sol

(Adriano, 2001). Ils provoquent également l’eutrophisation.

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I.6.2. Les engrais chimiques

La super fertilisation en nitrates des terres des cultures s’accompagnent d’une augmentation

de leurs taux dans les tissus des végétaux qui croissent dans ces derniers. Le nitrate et le

nitrite aident à l’acidification des eaux de pluies, réagissent avec l’oxygène et produisent de

l’ozone(O3) dans les basses atmosphères. Leur forte consommation dans le domaine

provoque le brouillard photochimique (contribue à l’effet de serre).L’ammoniac est toxique

pour les formes aquatiques. Il exciterait les attaques fongiques et la croissance des épiphytes

contribuant ainsi au abattement forestier (Adriano , 2001). I.6.3. Les phosphates

Les phosphates d’origine agricole représentent 0,3 Mt/an, auxquels il faut ajouter ceux libérés

par les élevages. Les apports massifs des lisiers (0,28 Mt/an) posent d’énormes problèmes. Ils

représentent la première cause d’eutrophisation du milieu aquatique (Domange, 2005). Suite à

l’eutrophisation, les qualités physiques et chimiques de l’eau sont altérées, d’où la diminution

d’oxygène dissous et l’empoisonnement des poissons (Boucher et al. , 2003). I.6.4. Les métaux lourds

Divers métaux et métalloïdes (présents dans les engrais phosphatés) constituent un très

sérieux risque potentiel de contamination des terres cultivées. Ils sont à moins de 1l /1000

chez les êtres vivants. Certains sont essentiels à la vie alors que, leur excèdent (Cd, Hg, Pb,

…) est toxique pour l’homme (Bouchon et al., 2003). I.6.5.Les produits phytosanitaires :

Au sens de la directive européenne 91/414, les produits phytosanitaires désignent les

substances actives et les préparations contenant une ou plusieurs substances actives qui

sont destinées à (Colin, 2000.) :

P r o t é g e r les végétaux contre tous les organismes nuisibles ou à prévenir leur

action,

E x e r c e r une action sur les processus vitaux des végétaux,

G a r a n t i r la conservation des végétaux,

D é g a g e r les végétaux indésirables,

D é b a r r a s s e r des parties des végétaux pour freiner ou prévenir une croissance

indésirable. I.7. Les effets des plastiques et des déchets agricoles

Tous les plastiques présentent de nombreux risques écologiques. Bien que

biodégradables, les films enterrés restent dans le sol sous formes de macro déchets. Les films

plastiques favorisent l’érosion en augmentant le ruissellement, c’est un obstacle à la

pénétration des eaux de pluie (Bouchon et al. , 2003).

I.7.1. Effet et dégagement de la mécanisation

La propagation de polluants par les échappées des machines agricoles a conduit à la pollution

de l’atmosphère et contribuera à la dépression de la couche d’ozone ce, qui engendrera le

problème des rayons ultraviolets qui sont néfastes à la croissance des cultures (Guimont,

2005).

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I.7.2. Les effets des pesticides

La mission des pesticides sur l’environnement est certaine. Après ruissellement et infiltration,

ces produits se trouvent dans le sol déterminant sa pollution et celle des nappes phréatiques

(Scholtus, 2004). I.7.3. Les pesticides

L’article 2 de la loi algérienne du journal officiel N° 87- 17 du 1 Août 1987 relative à la

protection phytosanitaire désigne par pesticide : « Toute substance ou mélange de substances destiné à repousser, détruire ou combattre les

organismes nuisibles, en vue de la protection ou de l’amélioration de la production végétale ».

Le terme comprend les agents biologiques, les régulateurs de croissance, les correcteurs de

carence, les défoliants, les agents de dessiccation, les agents d’éclaircissage ainsi que les

substances appliquées sur les cultures avant ou après récolte, pour protéger les produits contre

la détérioration durant l’entreposage et le transport (JORA N°32,1987). Plusieurs autres termes et expressions définissent les pesticides. Ainsi, produits

phytosanitaires, produits antiparasitaires à usage agricole, produits agri sanitaires, produits

agro pharmaceutiques, produits phytopharmaceutiques sont les autres dénominations de ce

terme (Aubertot et al., 2005). I.8. Comportement et transfert des pesticides dans l’environnement

Seule une faible partie de ces produits entre en contact avec les organismes concernes. La

plupart des chercheurs l’évalue à moins de 0,3 ٪, ce qui veut dire que 99,7 ٪ de la quantité

versée n’atteignent pas la cible visée. Cette partie se disperse alors dans les trois

compartiments de l’environnement : l’air, le sol et l’eau. Les mécanismes qui dirigent ce

devenir sont nombreux et complexes et encore souvent mal connus. Cependant, suivant un

schéma habituelle, ils peuvent se classer en trois types (Barriuso et al ., 1996 et Calvet et al.,

2005).

La conservation (dans le sol),

La dégradation (abiotique et biotique),

Le transport (vers l’atmosphère, les eaux de surface et les eaux souterraines). I.8.1. Transfert des pesticides vers les milieux aqueux

La pollution des sols propage, en partie plus ou moins importante selon l’environnement

naturel, les ressources en eau. Qui sont vulnérables à cause aussi d’autres types de pollution

auxquels elles se trouvent montrées. L’eau en excédent est susceptible de mobiliser et de faire

partir les produits phytosanitaires vers les ressources en eau, c’est ainsi que le caractère

polluant d’un produit est en pratique associé à l’inaptitude du sol à le retenir ou à le

détériorer, avant qu’il ne soit, sous l’effet de l’eau, versé dans l’environnement (Meyer et al.,

2003). Ce transfert se produit soit latéralement par ruissellement, soit verticalement par

lixiviation (Marinovich et al.,1996).

I.8.2. Transfert vers les eaux de surface (ruissellement)

Le ruissellement peut être défini comme la circulation latérale de l’eau et des matières

qu’elle enferme à la surface du sol (Levine et al., 1999). Ce phénomène est provoqué

soit par une augmentation de la pluie supérieure à la capacité d’infiltration du sol, soit par

satisfaction du sol au- dessus d’un niveau peu perméable. L’importance de l’entraînement par

ruissellement est très variable selon les situations : volume et augmentation des précipitations,

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pente de terrain, présence ou absence de couvert végétal, le type du sol, les propriétés des

pesticides utilisés ainsi que les quantités appliquées (Munnia et al., 1999). I.8.3. Transfert dans le sol vers les eaux profondes (lixiviation et lessivage)

Le transfert vers les eaux souterraines concerne les molécules en solution et celles

mobilisées par la fuite et la dissolution. Le transport est représenté par le passage des

composés phytosanitaires de la zone non saturée comprenant le sol à la zone saturée ou zone

aquifère. Lorsque les molécules sont en solution, on parle généralement de lixiviation, si les

molécules sont associées à la phase solide, on parle de lessivage (Munnia et al., 1999). I.9. Effets toxiques des pesticides I.9.1. Effets sur la santé humaine

La toxicité d’un pesticide est son potentiel à constituer des effets nocifs sur la santé, à

court ou à long terme (Arias et al., 2008). L’évaluation des effets toxiques des pesticides est

complexe car de nombreux paramètres sont à considérer : la nature du composé, ses

propriétés toxico dynamiques, la durée d’exposition et ses variations, l’effet des mélanges, la

nature libre ou liée des résidus, etc…(Capkin et al., 2006). I.9.1.1. Cancérogenèse

Plusieurs études expérimentales ou épidémiologiques laissent estimer un risque important

d’atteinte par certaines formes de cancer à la suite de l’exposition chronique à certains

pesticides couramment utilisés. Les types de cancers les plus souvent cités sont le cancer de

cerveau, de poumons, de foie et de l’estomac, les sarcomes des tissus mous, les lymphomes

non hodgkiniens et la leucémie (Capkin et al. , 2006). I.9.1.2 Effets sur la reproduction

Les pesticides peuvent affecter la reproduction humaine en exerçant une toxicité directe sur

les organes de reproduction ou en interférant avec la fonction hormonale (Capkin et al. ,

2006) . Les pesticides sont des agents exigeants de porter atteinte au processus de fertilité

masculine via une toxicité testiculaire. Il a été aussi remarqué que chez les femmes exposées à

des pesticides, le risque de mortalité intra- utérin augmentait et que la croissance fœtale

diminuait. Sans oublier les malformations congénitales et les anomalies du système nerveux

central (Cuppen et al., 2000).

I.9.1.3. Perturbation du système endocrinien

Selon l’OMS, un excitateur endocrinien est une substance exogène ou un mélange qui altère

les fonctions du système endocrinien et qui, de ce fait, induit des effets nocifs sur la santé

d’un organisme intact, de ses descendants ou sous population. Certains pesticides attaquent le

développement de la fonction reproductrice et affectent la fertilité masculine en provoquant

une oligospermie ainsi que d’autres effets épidémiologiques (cancer de la prostate, des

testicules, des seins, etc.) (Cuppen et al., 2000). I.9.1.4. Effets sur le système immunitaire

L’exposition à ces produits augmente les risques d’atteinte par des maladies infectieuses en

plus des effets comme la chute de production d’anticorps et des réactions d’hypersensibilité

retardée. D’autre part, plusieurs pesticides communément utilisés pourraient supprimer

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la réponse normale du système immunitaire humain à l’invasion de virus, de bactéries, de

parasites et de tumeurs(Cuppen et al., 2000). I.9.1.5. Effets neurologiques

Les effets neurologiques constituent l’une des manifestations les plus fréquentes des

intoxications aigues des pesticides. Les effets aiguës manifestent à des doses importantes chez

les hommes (agriculteurs), il s’agit de l’apparition d’un syndrome caractérisé par une

paralysie des nerfs, une faiblesse musculaire proximale et respiratoire et, plus tard, des

troubles neurocomportementaux, troubles neuro- dégénératifs (maladie de parkinson), etc.

(Cuppen et al., 2000). I.9.2. Impact environnemental : écotoxicologie

D’un point de vue écologique, les pesticides ne sont pas des produits bénins. En effet, ils sont

responsables de nombreux effets toxiques secondaires causant des risques potentiels pour

l'environnement (Relyea, 2009). I.9.2.1. Effets nocifs sur la microflore du sol

La microflore est essentielle pour la prestance de la productivité du sol. Or, même si les

traitements sont le plus fréquemment appliqués sur les parties aériennes des plantes, plusieurs

études ont montré que l’emploi massif de pesticides peut avoir des conséquences majeures sur

les autres invertébrés (Relyea, 2009). I.9.2.2. Effets nocifs sur les mammifères

Les animaux absorbent les produits phytosanitaires via la nourriture ou l’eau d’alimentation,

via l’air respiré ou au travers de leur peau. Ayant omis diverses barrières, le toxique atteint les

sites du métabolisme où il est stocké. Cette exposition peut multiplier chez les mammifères

toute une série d’effets toxiques dont des baisses extraordinaires de fertilité souvent

remarquées (Ramade, 2010).

I.9.2.3. Effets nocifs sur la faune aquatique

Les produits phytosanitaires et leurs dérivés peuvent provoquer des dégâts importants sur la

faune aquatique. En effet, même si les mortalités des poissons représentent les effets les plus

étonnantes, les autres composantes de l’écosystème aquatique comme les mollusques,

les insectes, les petits crustacés, les algues et les plantes aquatiques sont aussi affectées par les

effets néfastes des pesticides (Ramade, 2010).

I.10. Cadre législatif et réglementaire

En Algérie, le contrôle des produits phytosanitaires s’est établi peu à peu en fonction

de la politique de développement prônée par le pays et la disponibilité des moyens .Ce

contrôle a connu une évolution dans le temps et la notification de la loi N° 87- 17 de 1987

relative à la protection phytosanitaire et a permis d’édicter les mesures relatives à la

fabrication, l’étiquetage, l’entreposage, la distribution, la commercialisation et l’utilisation des

produits phytosanitaires à usage agricole. Au terme de cette loi, aucun produit phytosanitaire

ne peut être commercialisé, importé ou fabriqué s’il n’a pas fait l’objet d’une homologation. Selon le décret exécutif n°95- 405 du 2 décembre 1995 relatif au contrôle des produits

phytosanitaires à usage agricole modifié et complété par le décret exécutif du 20 juillet 1999;

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Article 06: les produits phytosanitaires bénéficiant d’une homologation, sont inscrits

sur un registre tenu et mis à jour par le secrétariat technique de la commission des

produits phytosanitaires à usage agricole. Article 08: le retrait de l’homologation d’un produit phytosanitaire intervient lorsqu’un

élément nouveau apparaît mettant en évidence sa nocivité ou mettant en cause son

efficacité. Article 20: les produits phytosanitaires à usage agricole (particulièrement

dangereux) ne peuvent faire l’objet d’une commercialisation ou d’une utilisation que sur

autorisation délivrée, sur demande, par l’autorité phytosanitaire. Les produits phytosanitaires

à usage agricole particulièrement dangereux sont: Bromure de méthyle, phosphore

d’aluminium, strychnine et phosphore de magnésium. I.11.Qualité bactériologique I.11.I L'eau et la santé

L'organisation mondiale de la santé estime en effet que 80% des maladies qui touchent la

population mondiale sont directement associées à l'eau, on retrouve ainsi en permanence 400

millions de personnes atteintes de gastro-entérite, 200 millions, de schistosomiase

(bilharziose), 160 millions de paludisme et 300 millions d'onchocercose. On considère par ailleurs que les eaux polluées sont responsables de 50% des cas de mortalité

infantile. (Desjardins, 1990). La contamination peut se faire de différentes manières:

Par ingestion indirecte d'eau contaminée.

Par ingestion indirecte d'aliments lavés avec une eau souillée (fruit, légume) ou

contaminés

par leur environnement hydrique (élevages, coquillages, cressons…)

Par contact de la peau et des muqueuses avec une contaminée.

Par inhalation d'aérosols produits à partir d'eau souillée. (Anonyme 2, 1987) I.11.1.1. Choléra

Le choléra est une maladie toxi-infectieuse due à des vibrions pathogènes appartenant au

sérotype O1 des vibrions cholériques (vibrio cholerae O) Bezzaoucha, 2004. Sa

pathogénie est liée à l'action d'une entérotoxine thermolabile qui s'exerce au niveau de la

partie initiale du jéjunum (Beytout et al., 2002(. Le choléra classé parmi les maladies qui se

transmettent par l’intermédiaire de l’eau, il pose un problème de santé publique dans les pays

où les conditions de santé et d’hygiène sont insuffisantes. (Khiati, 1998).

I.11.1.2. Bilharziose

Maladie parasitaire, très largement répandue en zone tropicale. La bilharziose est

provoquée par des vers hématogènes du genre schistosomes qui vivent, au stade adulte, dans

le système porto mésentérique de l'homme. (Pilly, 1982) Les bilharzioses (schistosomiases)

font intervenir obligatoirement des hôtes intermédiaires qui sont des mollusques gastéropodes

d'eau douce (escargots). (Bezzaoucha, 2004) Cinq espèces sont pathogènes pour l'homme

Schistosoma haematobium est l'agent de la bilharziose uro-génitale ; Schistosoma mansoni est

responsable d'une bilharziose intestinale et parfois hépato-splénique; Schistosoma japonicum

et Schistosoma mekongi déterminent une redoutable bilharziose intestinale avec complication

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hépatique; Schistosoma intercalatum provoque une bilharziose rectale et génitale (Gentilini

et al., 1993).

I.11.1.3. Hépatite virale

On réserve le terme d'hépatite virale à l'atteinte du foie par au moins l'un des deux virus : Le type A d'incubation courte est l'hépatite «infectieuse",

Le type B d'incubation longue qui est l'hépatite "sérique". Il existe des hépatites non liées à ces deux virus, on les appelle hépatites non –A, non-B

(hépatite

C) (Azele, 1998) I.11.1.4. Amibiase

Sous le terme d'amibiase, on désigne l'ensemble des troubles causés par Entamoeba

histolytica, seule espèce parasite de l'homme à être réellement pathogène. Très répandues, les infestations latentes sont plus nombreuses que les formes patentes. La

manifestation clinique la plus classiques est dysenterie amibienne, mais il ne faut pas

méconnaître les formes mineures ou atténuées qui ont le même potentiel évolutif (O’fel ,

1987) I.11.1.5. Paludisme

Le paludisme (palus = marais) ou malaria (= mauvais air) et une infection des érythrocytes

due à des hématozoaires du genre Plasmodium transmis par un moustique Anophèles femelle

(Beytout et al., 2002). Des personnes de tous âges peuvent être atteintes de paludisme et tomber malades. Les

nouveau- nés, les petits enfants (de moins de 5 ans) et les femmes enceintes sont les

personnes les plus vulnérables. Ils risquent de mourir s’ils ne sont pas rapidement et

correctement soignés (OMS). Quatre plasmodiums peuvent être agents de paludisme humain : 1. Plasmodium flaciparum, le plus fréquemment rencontré dans les régions tropicales,

agent de la« fièvre tierce maligne » 2. Plasmodium vivax, le plus répandu (zones équatoriales, tropicales, sub-

tropicales, voire tempérées où il tend à disparaître) 3. Plasmodium malariae à répartition beaucoup plus limitée, en foyers (régions tropicales) 4. Plasmodium ovale, très rare (Pilly, 1982). I.11.1.6. Fièvres typhoïdes et paratyphoïdes

La fièvre typhoïde est une septicémie à bacille à Gram négatif à point de départ

lymphatique (Santre, 1999). C'est une toxi-infection spécifique à l'homme due à

des bactéries du Genre salmonelles : bacille d'Ebert (bacilles typhiques) ou un des trois

bacilles paratyphiques (A, B ou C). (Bezzaoucha, 2004). La transmission peut être directe

interhumaine, mais le plus souvent indirecte à partir d'aliments ou d'eau contaminés (Beytout

et al. ,2002). Les salmonelles se multiplient, traversent la paroi intestinale et se fixent au niveau des

ganglions mésentériques. Une fois cette barrière débordée, les germes reçoivent le sang où ils

se multiplient et leur lyse libère une endotoxine responsable des signes cliniques constatés et

des ulcérations des plaques de Peyer caractéristiques de la maladie (Khiati, 1998).

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I.11.2. Bactéries pathogènes liées aux éclosions des maladies d'origine hydrique I.11.2.1. Escherichia coli

Bacille à Gram négatif appartenant à la famille des Enterobacteriaceae. E.coli produit

habituellement de l'indole, fermente le lactose, mais ne produit pas d'acétone. (Beytout et

al.,2002(.Les colibacilles sont des hôtes normaux de l'intestin : ils représentent prés de 80%

de laflore intestinale aérobie de l'adulte : on peut les retrouver également au niveau de

diverses muqueuses chez l'homme et chez les animaux (Azele, 1979). Elle peut devenir

pathogène si les défenses de l'hôte se trouvent affaiblies ou si elle acquiert des facteurs de

virulence particuliers (Khiati, 1998). Selon Sack, (1975) Escherichia coli est associé à au

moins quatre type de maladies entériques chez être humain: 1. A une diarrhée qui se manifeste surtout chez les enfants de 0 à 2 ans. 2. A une diarrhée accompagnée d’abondantes sécrétions séreuses. 3. A une dysenterie semblable à celle qui est causée par les Shigella. 4. A une colite hémorragique I.11.2.2. Salmonella

Les bactéries du genre Salmonella appartiennent à la famille des Enterobacteriaceae.

Les caractères qui permettent d'identifier une Salmonella sont l'absence de fermentation du

lactose (Beytout et al., 2002). Les Salmonella sont particulièrement des parasites du

tube digestif del'homme et des animaux. Elles peuvent être disséminées dans le milieu

extérieur par les excréta, mais ne s'y multiplient pas (Azele, 1979). Elles sont très répondues

dans la nature, leur réservoir s’étend à tout le règne animal. Présentes dans l’intestin de

l’homme et des animaux et représentent des variations importantes de pathogénicité en

fonction de la nature de l’hôte (Bertrand, 1989). La contamination humaine se fait

habituellement par l'ingestion d'eau ou d'aliments contaminés. C'est derniers sont le plus

souvent d'origine animale (coquillages, viande hachée, œufs). La contamination des aliments

peut aussi être d'origine humaine et liée à des manipulations par un personnel porteur de

salmonelles (Nauciel, 2000).

I.11.2.3. Shigella

Les Shigella sont les agents d'une maladie diarrhéique aiguë dont la forme la plus complète

est représentée par la dysenterie bacillaire (Azele, 1979), se sont des bacilles à Gram négatif,

toujours immobiles, appartenant à la famille des Entérobactéries et caractérisés par leur faible

activité métabolique (Beytout et al., 2002). La transmission de la dysenterie bacillaire

se fait donc d'homme à homme par l'intermédiaire d'aliments ou d'eau de boisson

contaminée par les excréments d'un malade ou d'un porteur. (Azele, 1979). Ce sont des

bactéries spécifiques de l'homme, pouvant s'implanter dans l'intestin. (Nauciel, 2000). Les

quatre espèces des genres Shigella–S. dysenteriae, S. boydii,S. flexneri et S. sonnei sont des

Enterobacteriaceae auxotrophes (Richard, 1996).

I.11.2.4. Legionella

Les Legionella sont des bactéries ubiquistes, dont le biotope est l’eau. On les rencontre dans

les eaux de surface (rivières, lacs), également dans les eaux de condensation des systèmes de

climatisation de l’air, provoquant des aérosols, vecteurs de la contamination par la voie

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aérienne (Richard, 1996). Leur croissance est lente, elle est améliorée par la présence de CO2.

L’espèce la plus fréquente en pathologie est Legionella pneumophila (Nauciel, 2000). I.11.2.5. Vibrion de cholerae

La bactérie se multiplie dans l'intestin de l'homme (malade ou porteur sain) ainsi que dans les

eaux contaminées par les matières fécales (Nauciel, 2000). L’homme se contamine par

voie orale à partir d’eaux ou d’aliments (poissons, coquillages), souilles par les selles des

malades cholériques ou de porteurs sains : cycle oro-fécale. Il existe deux grands cycles de

transmission :

un cycle court où le vibrion passe de main en main par contact direct ou indirect;

un cycle long correspondant à la contamination des eaux de boisson et des

aliments (en particulier crustacés, « fruits de mer », qui filtrent de très

importants volume d’eau) (Richard ,1996). I.11.2.6. Bactéries sulfito-réducteurs

Les Clostridium sulfito-réducteurs sont des bactéries anaérobies strictes formant des spores de

grande résistance. (Marjarie, 1989). Ces bactéries considérées comme des témoins de

pollution fécale. La forme spore, beaucoup plus résistante que les formes exclusivement

végétatives des coliformes fécaux et des streptocoques fécaux, permettrait ainsi de distinguer

une pollution fécale ancienne. Sans parler de l'intérêt réel d'une telle indication concernant la

date de la pollution, il faut cependant considérer que si les Clostridium sulfito-réducteurs

peuvent être des germes fécaux, ce sont également des germes telluriques et que de ce fait,

aucune spécificité d'origine fécale ne peut être attribuée à leur mise en évidence (Rodier et al.,

1996).

I.11.2.7. Streptocoques fécaux

Ce sont des bactéries cocci Gram positif. Les streptocoques du groupe sérologique D

de Lancefield, rapprochent aux Coliformes fécaux, ils sont de bons indicateurs de pollution.

Par contre, ils sont peu utilisés comme indicateurs d’efficacité de traitement car ils sont

simplement plus résistants aux désinfectants que les Coliformes et les autres entérobactéries

pathogènes du genre Salmonelles ou Shigella. Chez l’être humain, les streptocoques du

groupe D peuvent être inclus dans la bactériémie, les cholécystites et les infections de

blessures. Ils sont responsables d’environ 20% de toutes infection urinaires et d’environ 20%

de touts les cas d’endocardites (Bertrand, 1989). I.11.2.8. Campylobacter

Les Campylobacters sont des bâtonnets minces, tournés en spirale, sporulés, gram

négatif, mobiles avec un mouvement caractéristique en tire bouchon grâce à un flagelle

polaire unique à une ou deux extrémités de la cellule. La plupart des Campylobacters sont

véhiculées aux milieux aquatiques par les résiduaires des abattoirs. (Beisou et al., 1978). Ces

bactéries sont présentes dans l'intestin de nombreuses espèces animales, en particulier

d'animaux domestiques (Nauciel, 2000).

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I.12. L'eau et les contaminations bactériennes I.12.1. Cadre réglementaire I.12.1.1. Notion de potabilité de l'eau

Les instructions pour la qualité de l'eau de boisson, publiées par l'OMS en 1984, sont des

recommandations à caractère purement consultatif, qu'il ne faut pas confondre avec les

normes légales des Etats membres. La définition de normes pour la qualité de l'eau de

boisson doit procéder d'une démarche très réservée au cours de laquelle le risque pour la

santé est pris en considération au même titre que d'autres facteurs tels que la possibilité

technique et économique. Les directives ont marque à la définition de la base sanitaire et du

risque pour la santé, elle constitue donc une base commune pour la détermination des normes.

Néanmoins, il est admis que dans certains secteurs, il pourrait être nécessaire d'adopter des

normes provisoirement inférieures, tout en œuvrant à la réalisation du but final qui est

d'atteindre les niveaux recommandés par les directives. Les directives mettent d'abord et avant tout l'inflexion sur la sécurité microbiologique de

l'approvisionnement en eau de boisson. En effet, il y a 20 ans, plus de la moitié de la

population mondiale était encore en contact avec une eau contenant des micro-organismes

pathogènes. Les catégories les plus exposées au risque de maladies transmises par l'eau sont

les nourrissons et les jeunes enfants, les sujets affaiblis et les personnes âgées. Pour ces trois

catégories, les doses infectantes sont souvent nettement inférieures à celles valables pour

la population adulte en général. Il est évident que dans certaines régions du monde, les

programmes destinés à garantir la sécurité chimique ou les qualités organoleptiques de l'eau

de boisson occupent un degré de priorité moins élevé. Les pays se fixent naturellement

des priorités différentes dans l'application des valeurs indicatives. Dans les pays

développés, par exemple, où les maladies transmissibles provoquées par l'eau sont rares on

dotera probablement les aspects chimique et organoleptique. Ainsi, en Europe, une eau est déclarée non potable lorsque sa consommation peut être nuisible

à la santé ou lorsqu'elle présente des qualités pouvant présenter des ennuis lors de son

utilisation. Les normes de qualité de l'eau varient en fonction de son usage: eau de boisson,

eau piscicole, eau de baignade. Quelques soient son origine et sa qualité, l'eau de boisson n'est jamais pure. Elle renferme des

micro-organismes et des éléments chimiques.

Les directives CEE (80/778/CEE et 98/83) proposent des normes guides et des concentrations

maximales admissibles pour les eaux destinées à la consommation humaine. En France,

ces normes sont fixées par le décret 89-3 du 03 janvier 1989 modifié par les décrets 90-330 I.12.1.2. Nature des bactéries présentes

L'eau est un habitat pour de nombreux micro-organismes. Elle peut être un fournisseur de

pathologies d'étiologie chimique, bactérienne, virale ou parasitaire lorsqu'elle n'est pas potable

et qu'elle est contaminée par des effluents contenant des matières fécales humaines ou

animales. Cependant, quelle que soit son origine, l'eau n'est jamais stérile, une eau pure

n'existe pas ; elle contient naturellement une flore bactérienne plus ou moins variée et

abondante qui la spécifie.

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I.12.1.2.1.Les bactéries autochtones (originaires)

Contrairement aux micro-organismes pathogènes ou indicateurs qui peuvent venir la

contaminer dans les nappes souterraines ou dans les réseaux et qui ne peuvent subsister que

transitoirement, ces bactéries peuvent se multiplier car elles n'exigent que peu ou pas du tout

de matière organique (oligotrophes ; autotrophes). Parmi les bactéries autochtones que l'on

trouve dans l'eau, les plus communes sont : les bactéries oxydant le soufre, bactéries ferriques,

bactéries spiralées, certaines espèces pigmentées ou non pigmentées, et quelques formes

sporulées. Dans certaines conditions favorables elles peuvent produire des altérations. I.12.1.2.2. Les bactéries Eaux rouges et ferrugineuses

On désigne sous le nom de "bactéries ferrugineuses" des micro-organismes qui interviennent

dans le processus d'oxydation des ions ferreux en ions ferriques. On en distingue trois groupes

: les bactéries filamenteuses du groupe Sphaerotilus-Leptothrix, les bactéries pédonculées du

genre Gallionella et aussi certains membres du groupe Thiobacillus. Les bactéries du genre Sphaerotilus-Leptothrix sont de loin les plus fréquemment

rencontrées et les plus largement décrites. Elles sont mises en cause non seulement dans

l'oxydation des ions ferreux mais aussi des composée manganeux. Elles font partie de la

famille des Chiamydobacteriaceae. On peut les définir comme des bactéries entourées

d'une gaine, imprégnées ou non d'oxyde de fer ou de manganèse, ne prenant pas la coloration

de gram et ne formant pas de spores. Les gaines peuvent présenter de fausses

ramifications, d'ailleurs très courtes. La reproduction des cellules s'effectue soit à partir de

cellules mobiles, libérées par l'extrémité ouverte de la gaine ou au cours de sa fragmentation,

soit à partir de cellules immobiles ou "conidies". Les eaux distribuées dans les canalisations en renferment fréquemment. Dans les conduites, la

stagnation de l'eau permet un développement anormal de ces bactéries qui, en éliminant

l'oxygène du milieu, créent une atmosphère anaérobie entraînant la putréfaction des matières

organiques, l'apparition d'odeurs et de goûts nauséabonds. Les Sphaerotilus, les Leptothrix et les Crenothrix peuvent être à l'origine des dépôts

mucilagineux et visqueux formés dans les eaux de distribution qui proviennent de source ou

de forages profonds contenant du fer dissous et du gaz carbonique. Ces dépôts peuvent

atteindre une épaisseur de 2 cm dans les canalisations et les citernes ; ils sont imprégnés

d'hydrate ferrique. L'eau devient trouble et colorée : elle dégage une odeur désagréable par

suite de la décomposition des bactéries ; sa saveur est également désagréable. Les ferro-bactéries (Leptothrix, Gallionella et Crenothrix) existent déjà en grande abondance

dans les eaux avant que celles-ci ne pénètrent dans les canalisations. Il suffit pour s'en

convaincre d'examiner de nombreux captages ou forages : les échantillons d'eau en

contiennent fréquemment, sans avoir été en contact avec des métaux ferreux. Elles

trouvent dans les canalisations les conditions favorables à leur développement. Grâce aux

composés du fer, elles s'accumulent aux endroits de contre pente, aux vannes, aux coudes,

bref, partout où un ralentissement du courant permet leur sédimentation.

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I.12.1.2.3. Corrosion biologique et bactéries sulfitoréductrices

Les bactéries sulfitoréductrices sont les agents biologiques majeurs du processus naturel de

réduction du soufre. Elles sont bien connues en raison des phénomènes de corrosion des

métaux ferreux dont elles sont responsables. Germes ubiquitaires, on les rencontre

pratiquement toujours dans le sol, les eaux douces, les eaux salées et le tube digestif de

l'Homme et des animaux. Il s'agit d'un groupe physiologique rassemblant des bactéries de

morphologie diverse, ayant en commun la propriété d'utiliser comme accepteurs d'électrons

les sulfates et les sulfures. Les premiers comprennent les genres Desuljuromonas. La corrosion se présente comme un changement ou une décomposition des matériaux. Elle

peut s'expliquer par un retour du métal préparé industriellement à son état naturel sous forme

d'oxydes, de sulfures et de carbonates, formes primitives et stables. La corrosion est un

phénomène qui s'amplifie au niveau des canalisations métalliques qui transportent l'eau ou au

niveau des appareils producteurs d'eau chaude (échangeurs). Elle donne naissance sur le

matériel en fer ou en fonte à des oxydes de fer, des sels de fers à différents niveaux

d'oxydation qui sedéposent avec des carbonates ; elle forme souvent des clous ou des nœuds

très caractéristiques. Bien que la corrosion soit le plus souvent la résultante d'interactions complexes, la théorie la

plus fréquemment admise repose sur la dépolarisation d'un système électrochimique. Un

couple électrochimique est créé à la suite d'une hétérogénéité du milieu : l'eau d'une part

et un dépôt d'autre part, constitué par des sédiments argileux ou un développement de

bactéries ferrugineuses (Gallionella, Leptothrix). Sur la surface anodique le fer est mis en

solution tandis qu'un film d'hydrogène se forme au niveau de la cathode. Le processus

tendrait normalement vers un état d'équilibre. Pour que l'électrolyse se poursuive il nuit que la

pile soit dépolarisée, c'est à dire que l'hydrogène soit consommé au fur et à mesure de son

apparition. Il est bien difficile d'admettre un tel phénomène sans l'intervention d'un

mécanisme biologique. De là provient sans aucun doute la faveur que connaît la théorie de

Von Wolzogen Kühr dite de « la dépolarisation cathodique ». Des observations minutieuses

ont amené cet auteur à déceler un certain nombre de traits communs à tous les phénomènes de

corrosion du fer au contact de l'eau : les produits de la corrosion sont exclusivement des sels

ferreux et ferriques Fe(OH)2, Fe(OH3), Fe2(S04)3, Fe(C03H)2 ; les sulfates sont réduits en

sulfures ;la zone optimale de pH est comprise entre 7 et 7,6 ; c'est elle qui est la plus

favorable à la croissance des germes ;les conditions d'anaérobiose sont créées à la suite de la

formation de dépôts sur les parois métalliques ;lors des expériences au laboratoire, la

corrosion est stoppée par la stérilisation. Ces remarques lui permettent d'émettre l'hypothèse selon laquelle la corrosion en milieu

anaérobie est entretenue par les bactéries réduisant les sulfates grâce à une action

dépolarisante au niveau des surfaces métalliques jouant le rôle de cathode. Le fait essentiel

est instauration d'un véritable courant de corrosion par dépolarisation cathodique. Il en résulte

la formation d'un certain nombre de sous-produits du métabolisme : sulfure de fer, hydroxyde

ferreux, hydroxyde ferrique. Ces produits d'oxydation localisés au niveau de l'anode et

associés ou non avec des dépôts de bactéries ferrugineuses vont tendre à former des nodules

durs et compacts. Dans certains cas, lorsque l'eau est entartrante, une couche mixte de rouille

et de carbonates peut former une protection naturelle.

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Des problèmes de goûts et d'odeurs désagréables sont quelquefois rencontrés dans les eaux de

distribution. Des micro-organismes peuvent en être responsables. Ces odeurs et goûts de

terre et de moisi peuvent provenir des actinomycètes qui souvent prolifèrent dans les

réservoirs de stockage avant le traitement. Certains métabolites responsables ont été

extraits et identifiés. Il s'agit de la géosmine, de la mucidone et du 2-méthyl-isobornéol.

L'eau est le constituant essentiel et principal des organismes vivants. Elle est indispensable

aux besoins physiologiques et peut jouer le rôle de vecteur de microbes pathogènes de

façon directe par les larmes, la salive, l'urine, mais aussi de façon indirecte en assurant

la survie, voire la multiplication de l'agent pathogène. Les maladies sont dans ce cas

appelées hydrotelluriques, ce qui indique le rôle de l'eau et du sol. Les échanges d'eau entre l'environnement et l'Homme se font donc dans les deux sens :

l'Homme consomme de l'eau, et excrète des exsudais plus ou moins aqueux et pouvant

contenir une flore microbienne pathogène. L'Homme et les animaux sont contaminés généralement par voie digestive lors d'ingestion

d'eau de boisson ou d'aliment souillés. Les germes peuvent également pénétrer dans

l'organisme en franchissant les muqueuses des premières voies digestives, respiratoires,

génitales, auriculo oculaires et, enfin, la peau indemne ou traumatisée. I.13. L’eau: véhicule d'agents pathogènes

Les eaux douces sont capables de véhiculer un grand nombre d'agents pathogènes, parasites

stricts de l'Homme et des animaux. Ils peuvent être introduits occasionnellement dans l'eau et

parfois tossérninés loin par l'eau. Une survie temporaire dans un nouveau milieu est

nécessaire dans ce cas. Dans le nouvel environnement, les bactéries d'origine intestinale

humaine (entérobactéries) persistent très longtemps. Mais elles ne se développent pas dans

l'eau contaminée. L'eau peut véhiculer des toxines comme la toxine botulinique de type D

lorsqu'elle est contaminée par un cadavre.

I.13.1. L'eau : réserve d'agents pathogènes

Certaines bactéries contaminent et vivent à l'état naturel dans l'eau. Elles s'y multiplient et y

demeurent très longtemps surtout lorsqu'elles sont spondées : Clostridium botulinum,

Clostridium tetani, Bacillus anthracis, bacille de Whitemore, Pasteurella, salmonella,

Erysipelothrix insidosa et les leptospires.

I.14. Méthodes de détection I.14.1. La méthode du nombre le plus probable (NPP)

En1914, le service de santé publique américain (USPublic Health Service Drinking

Water Standard ) a désigné la première norme sur l'eau de consommation (Wolf, 1972).Celle-

ci Spécifiait qu'il ne devait pas y avoir plus d'une portion de 10 ml sur cinq d'échantillon d'eau

contaminée par une ou des bactéries du groupe E. coli lors de la procédure de fermentation en

tubes multiples. Cette méthode es t désignée aujourd'hui comme la Méthode du nombre le

plus probable (NPP; Most Probable Number ou MPN procedure); (McCrady, 1915). La méthode comporte à inoculer une série de tubes avec les dilutions appropriées d'un

Echantillon d'eau. La production de gaz, la formation d'acide ou encore une très forte

Croissance après 48 heures à 35°C constitue une réaction positive présomptive. Bien que

Cette méthode soit facile à appliquer, l'examen complet, comprenant les tests de

Confirmation, exige quatre jours d'incubation et de transfert (Prescott et al., 2003).De

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plus, il existe un grand nombre de milieu d'isolement différents (bouillon lactose, bouillon

lauryl tryptose, etc.) tous imparfaits et non spécifiques (Rompre et al., 2002). De ce point de vue, les coliformes totaux ont alors être détermines comme étant des bactéries

appartenant à la famille des Enterobacteriaceae dont les espèces détectées varient en fonction

de la composition du milieu d'isolement utilisé. A noter qu'il peut y avoir interaction avec le

bouillon lactose s'il y a trop de bactéries non coliformes dans l'eau (Seidler et al., 1981;

Evans et al., 1981).Une fois obtenus des résultats indiquant la Présence possible de

coliformes totaux dans l'échantillon d'eau avec la méthode de Fermentation en tubes

multiples, d'autres tests sont nécessaire pour confirmer les résultats. La Formation de gaz dans

le bouillon lactose au vert brillant et sels biliaires en moins de 48 heures à 35°C constitue un

test de confirmation positif. Le test des coliformes fécaux peut être utilisé pour déterminer si les coliformes totaux sont

des coliformes fécaux (Apha et al., 1998).La production de gaz après 24 heures d'incubation à

44,5° C dans du milieu EC (pour «bouillon Escherichia coli») est considéré comme un

résultat positif (Prescott et al., 2003). Puis que les résultats du test de fermentation en tubes

multiples sont exprimés en nombre le plus probable de microorganismes présents, cette

technique est semi quantitative. Ce pendant, la précision des estimations est faible et dépend

directement du nombre d'échantillons utilisés pour l'analyse (Rompre et al., 2002). L'intervention par un nombre élevé de bactéries non coliformes (Seidler et al., 1981; Evans

et al.,

1981; Means et al., 1981) et la nature inhibitrice des milieux utilisés Affectent ladétection des

coliformes. Cette technique manque donc de précision au tant Quantitativement que

qualitativement. Le temps requis pour obtenir le résultat est également plus long que celui

requis pour la technique de la filtration sur membrane. Ce pendant, cette technique

demeure utile, particulièrement lors que les conditions ne permettent pas d'utiliser la méthode

de filtration sur membrane (ex: eaux turbides ou colorées (Rompre et al., 2002). En résumé, la technique de fermentation en tubes multiples est facile à implanter et peut Etre

effectuée par un technicien possédant un apprentissage de base en microbiologie .Elle peut ce

pendant devenir laborieuse lors que plusieurs dilutions doivent être réalisées pour analyser

plusieurs échantillons d'eau. Elle n'est pas précieuse et ne demande pas d'équipement

compliqué. Toute fois, cette méthode est très longue (48 heures pour l'obtention des résultats,

suivies de 48 heures supplémentaires pour la confirmation des résultats positifs présomptifs). Il existe également une technique modifiée du NPP par la détection des coliformes totaux Et

thermotolérants. Pour appliquer cette méthode, on incube un échantillon d'eau de 100 ml dans

un seul flacon de culture avec un bouillon trois fois concentré (3X) contenant du lactose, du

sulfate de lauryle et du violet de bromocrésol. Ce test, appelé test de présence/absence (P/A),

est basé sur le postulat qu'aucun coliforme ne devrait être présent Dans100 ml d'eau potable.

La production d'acide (couleur jaune) constitue un test présomptif positif nécessitant une

confirmation (Clark, 1968). Plusieurs études ont montré l'équivalence de la méthode de présence/absence avec la filtration

sur membrane et la méthode du NPP (Jacobs et al., 1986; Pipes et al.; 1986; Bancroft et

al., 1989; Rice et al., 1989). Cette technique a été formellement approuvée par l'Agence de

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protection environnementale américaine (USEPA) en1990 pour la détermination de

la qualité microbiologique de l'eau potable (USEPA, 1990). I.14.1.1. Les indicateurs de contamination fécale

Depuis l'époque des grandes épidémies de choléra, l'eau potable est sujette à des Campagnes et des programmes de surveillance afin de protéger la santé publique des risques

associés à la présence de microorganismes pathogènes. La détection systématique de tous ces

pathogènes est ce pendant hors d'atteinte du domaine de la surveillance publique. Ces

microorganismes sont habituellement retrouvés en faible concentration dans

l'environnement cequi rend difficile leur détection et leur identification. De plus, les

techniques disponibles pour leur découverte sont trop coûteuses pour être utilisées de façon

routinière. Sachant que les microorganismes pathogènes transmis par l'eau sont en grande

majorité d'origine fécale, les méthodes d'estimation de la qualité microbiologique de l'eau

potable ont depuis le début été conçues pour détecter des microorganismes qui justifieraient la

présence de matières fécales dans l'eau. Ces microorganismes sont nommés les indicateurs de

contamination fécale. L’OMS fait à l'avenir la distinction entre trois groupes de

microorganismes indicateurs.

Tableau 01: Principaux microorganismes indicateurs et index d'intérêt en santé

publique

(Pearson, 1926)

Groupe Définition Exemple

Indicateurs de Un groupe d'organismes qui

Les bactéries hétérotrophes

Procédé Démontrent l'efficacité d'un

procédé de traitement

Aérobies et anaérobies, Facultatives ou

les coliformes, Totaux pour la

désinfection au Chlore

Indicateurs

fécaux

Un groupe d'organismes

qui indiquent la présence

de contamination fécale

Les coliformes Thermotolérants ou

les Escherichia coli suggèrent, tout au

plus, la présence de microorganismes

pathogènes

Microorganisme

s

Index

Un groupe d'organismes

qui indiquent la présence et

l'état d'organismes

pathogènes

Escherichia coli comme Index des

Salmonella et les coliphages comme

index des virus entériques humains

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Tableau 02: Événements marquants de l'histoire de la recherche sur les

indicateurs deContamination fécale source (Clesceri et al., 1998; WHO, 2004; Pearson,1926

et Higgins et al., 2003)

Année Événements

1854 John Snow associe une épidémie de choléra à la fontaine à eau de Broad Street

1881

Robert Koch démontre l'effet bactéricide des hypochlorites sur des cultures de bactéries

1882 Friedlânder observe le premier coliforme (Klebsiella pneumoniae)

1885

Robert Koch isole la bactérie Vibrio cholerae de la rivière Elbe en territoire allemand.

Utilisation par Frankland de milieu en gélatine pour effectuer les premières.

Observations de routine de l'eau de distribution publique à Londres

1890

Koch publie son manifeste Germ theory of disease qui expose le lien entre l'épidémie

du choléra et l'éclosion de V. cholerae dans l'eau

1891

Percy et Grâce Frankland décrivent le concept d'indicateur en se basant sur la

Présomption que les fèces des gens malades contiennent des pathogènes. Ils Concluent

que les organismes retrouvés dans les égouts doivent être la cible de Plus amples

recherche sa fin de mieux évaluer le risque associé à la consommation d'eau

1892

Schardinger suggère l'utilisation de B. coli comme indicateur pour la Surveillance de la

qualité de l'eau en Australie

1893

Blachstein décrit les coliformes. Première utilisation de l'ozone comme désinfectant de

l'eau (Hollande)

1895

Smith introduit l'utilisation de B. coli comme indicateur pour la surveillance de la

qualité de l'eau en Australie

1904 Eijkman découvre la thermotolérance de B. coli (45°C)

1905

Mac Conkey élabore le milieu permettant de sélectionner les coliformes selon Leur

habileté à fermenter le lactose en produisant de l'acide

1907

Winslow et Walker rapportent que B. coli est plus souvent d'origine fécale que les

autres coliformes connus

1914

Le service de santé publique des États-Unis émet une première réglementation

Concernant la qualité microbiologique de l'eau : moins de deux échantillons de 10 ml

sur 5 peuvent être positif pour B. coli pour considérer l'eau propre à la Consommation

1915

Le service de santé publique des États-Unis délaisse la détection de B. coli pour Celle

des coliformes sous prétexte qu'ils sont des indicateurs Equivalents

1919 Castellani et Chalmers renomment la bactérie B. coli, Escherichia coli, en l'honneur de

son premier observateur

1938

1938 Élaboration du test IMViC (Indole, Methyl red, Voges-Proskauer and Citrate)

Pour différentier les coliformes fécaux des coliformes Environnementaux

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1948 – 50

L'Angleterre utilise le test de l'indole pour identifier E. coli alors que les États-Unis

identifient les coliformes thermotolérants sur la base de la production de Gaz et

d'acide à 44°C lors de la fermentation du lactose

1930-50

La plupart des pays développés utilisent la chloration comme traitement de l'eau De

consommation

1953 Watson et Crick déterminent la structure en double hélice de l'ADN

1974

L'United States Environmental Protection Agency met en place sa réforme Drinking

water Act décrivant une série de normes concernant la qualité de l'eau De

consommation

1975 Première épidémie d'origine hydrique impliquant entérotoxigène

1980 L'Union Européenne établit ses propres standards (80/778/EEC) s'appliquant à l'eau

de

Consummation

1983

Invention de la réaction de polymérisation en chaîne (PCR) Première présentation à

la conférence Water Quality Treatment d'une méthode Moléculaire pour la détection

de pathogènes transmis par l'eau (hybridation par dot-blot)

1986

Première utilisation de la technique de séparation immuno-magnétique pour la

récupération des pathogènes d'origine hydrique. 'US EPA adopte E. coli comme

indicateur de contamination fécale

1988 Développement de la méthode Colilert® pour la détection des coliformes totaux et

d'E.

Coli 1990 Première utilisation du PCR pour la détection des pathogènes transmissible par l'eau

1993 Épidémie de Cryptosporidium sp .à Mil waukee, Wisconsin, États-Unis

1995 Seule épidémie de Toxoplasma gondii répertoriée dans un pays développé (Canada)

1996 Démonstration de la grande résistance des adénovirus aux rayons UV

1998

L'Union Européenne adoptent E. coli et les entérocoques comme indicateurs de La

qualité microbiologique de l'eau de consommation

2000 Épidémie d'E. coli à Walkerton, Ontario, Canada

2001 Première utilisation de la technologie des microarray ciblant des pathogènes

d'origine

Hydrique 2003

L'Organisation Mondiale de la Santé recommande l'utilisation d'E. coli entant Que

meilleur indicateur de contamination fécale

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I.14.1.2. Les microorganismes clés de la contamination De nombreux microorganismes ou groupe de microorganismes sont retrouvés dans la matière

fécale mais seules quelques espèces ont le potentiel de servir d'indicateur .Les caractéristiques

de l'indicateur idéal ont été décrit il y a quarante ans par Bonde (MacNaughton et al. , 1999 )

et améliorés plus tard par Toranzos et Mc Feters (Blackstock, 2001 ).Ces derniers stipulent

que l'indicateur de contamination fécale idéal doit être:

Uniquement associé à la présence d'organismes pathogènes;

Absent naturellement dans l'environnement;

Autant résistant à l'environnement (transport et survie) et à la désinfection que les

autres microorganismes pathogènes;

Facilement isolable (cultivable) et identifiable;

Ne doit pas se multiplier dans l'environnement;

Doit pouvoir être détecté par des tests simples et robustes;

Présent en quantité proportionnelle au degré de contamination, à la concentration de

microorganismes pathogènes et de risque sur la santé. L'attribut le plus important est sans doute la relation quantitative entre la concentration de

l'indicateur et le degré de risque attiré par la santé publique. Deux méthodes soustraient

quand vient le temps d'évaluer cette relation, les études épidémiologiques d'exposition

récréatives l'évaluation de l’histoire entre la concentration des indicateurs et de différents

microorganismes pathogènes. L'agence états-unienne USEPA privilégie la première de ces

méthodes. La seconde est utilisée moins fréquemment étant donné que la détection spécifique

d'un organisme pathogène dans un Echantillon ne permet pas d'assurer la présence d'autres

pathogènes ni leurs effets respectifs Sur la santé humaine .Certaines études démontrent

cependant que de telles corrélations Peuvent être assez robustes, telles coliphages F+comme

index des entérovirus dans des eaux environnementales, démontré en Hollande (Whitman et

al., 2003). Trois autres attributs importants sont les doses minimales infectantes, les corrélations de

Survie et de transport entre l'indicateur évalué et les pathogènes d'intérêt (Byappanahalli,

2000). La dose minimale infectante (DMI) pourEscherichia colise chiffre entre1million et

100million unités formatrices de colonie (UFC), alors que celle pour E. coli 0157:H7 est de

moins de 100 et celle de Campylobacter jejuni est d'environ 500 UFC. En ce qui a trait aux

protozoaires, Giardia lamblia présente une DMI de10 à100 cystes et Cryptosporidium en

présente une d'environ 10 oocystes. Quand à lui, le virus de l'Hépatite A a une DMI de 1 à 10

unités formatrices de plaque (pfu) (Hardina et al., 1991.).Contrairement aux indicateurs

bactériens, les Virus peuvent se rendre dans les sources souterraines et ainsi contaminer les

nappes phréatiques (Byappanahalli et al., 2006). Aussi, l'indicateur Clostridium perfringens

forme des spores qui résistent longtemps dans l'environnement, plus long temps que les virus

et les parasites pathogènes, faussant ainsi le degré de risque associé à la consommation de

l'eau analysée. D'autre part, les paramètres abiotiques et biotiques influençant la sur vie des

microorganismes indicateurs et pathogènes sont nombreux (Griffîn et al., 2003):les rayons

UV (Jones, 2001) , la température(Madore et al., 1987), la salinité (Malakoff, 2002), la

prédationpar la flore autochtone et sur tout par les protozoaires (Geldreich et al., 1972 ), la

dessiccation (USEPA, 2002)ainsi que la capacité de ces microorganismes à sporuler,

s'enkyster, atteindre un état viable mais non cultivable(VBNC)ou à résister aux produits de

dés infection. Un autre attribut important est la relation de représentation quantitative entre

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l'indicateur et Les pathogènes d'intérêt (Munster et al., 1998). L'indicateur idéal doit

finalement être spécifique à la source d'où proviennent les pathogènes, dans ce cas-ci des

fèces animales (Higgins et al., 2003) I.14.1.3. Bactéries hétérotrophes aérobie et anaérobies facultatives

Les méthodes de détection des bactéries hétérotrophes aérobie et anaérobies facultatives

(BHAA) visent à estimer la population bactérienne générale dans l'eau potable. Ce

Regroupement de microorganismes possède un large spectre de capacités métaboliques et de

besoins de croissance mais ne constituent probablement pas de risque réel sur la

santé (Furgal, 1999). Le microbiologiste allemand Robert Koch en 1893, proposa le

paramètre de 100 UFC deBHAA /ml afin d'évaluer la qualité microbiologique de l'eau

(Furgal, 1999).Ses observations Epidémiologiques lui avaient permis d'établir un lien entre

les événements de maladies d'origine hydrique et le taux élevé de BHAA. Le compte de

BHAA devint rapidement et reste aujourd'hui un des standards d'évaluation de la qualité

microbiologique de l'eau (Furgal, 1999). N’existe incidemment pas de méthodes universelles

pour la détection des BHAA. de nombreux milieux de cultures ont aujourd'hui disponibles,

les températures d'incubation variant de 20° C à 37°C et les périodes d'incubation de quelques

heures à au de là de7 jours(Dworzanski et al., 1997 ).Les méthodes utilisant l'incubation sur

gélose pendant 48 h à 35°C semblent ce pendant les plus propices à la croissance des

bactéries potentiellement pathogènes.L'utilité des décomptes des BHAA pour l'étude ci-

présente réside dans leur capacité à endommager et à réduire la population de coliformes

détectée par les méthodes Classiques ce qui causerait une sous-estimation de la contamination

fécale et potentiellement de la présence de pathogènes. I.14.1.4.Coliformes totaux

Le terme coliforme est utilisé depuis longtemps par les bactériologistes pour désigner un

Groupe de bactéries qui peuvent être employées comme indicateurs de contamination fécale

(Sibille et al., 1998, Pearson, 1926).Ce groupe d'indicateur a ce pendant été employé

enremplacement d'E. coli, de là Le nom coliforme, pour évaluer la présence de

contamination fécale (Medema et al., 1997).Ceci est du à trois raisons principales:

1) les coliformes totaux sont facilement isolables des fèces humaines et de l'eau contaminée

par la matière fécale; la plupart (50-100%) des coliformes totaux isolés de la matière fécale

sont des E. coli (Neu et al. , 1997.) et il était donc admis que la détection des coliformes

totaux reflétait la presence d’E. coli; et que les technologies disponibles au début du 20

ième siècle ne permettaient pas la discrimination des E. coli avec les autres coliformes

totaux sur une base routinièren (Medema et al., 1997).

Ce groupe de bactéries est aujourd'hui définit par l'OMS comme étant des bâtonnets à Gram

négatif, positifs pour la catalase et négatifs pour l'oxydase, capable de croître en présence de

sels biliaires et de fermenter le lactose à 35-37°C en produisant de l'acide, du gaz et de

l'aldéhyde en 24-48heures (Dworzanski et al. , 1997 ). Aussi compris dans ce groupe sont les

bactéries de la famille des Enterobacteriaceae qui Sont positifs pour la β-galactosidase.

Plusieurs coliformes, telles que celles appartenant aux genres Citrobacter

Enterobacter,Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Kluyvera, Morganella et Proteus, sont non

pathogènes pour lagrande majorité et font partie de la flore normale du Tractus gastro-

intestinal, alors que d'autres sont des pathogènes opportunistes, telles les espèces du genre

Salmonella, Shigella, l'espèce Yersinia pestis, ainsi que les sérotypes entérotoxigènes,

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entéroinvasifs et entéropathogènes detype 0157:H7 d'E.coli. Plusieurs études démontrent la

présence de conformes totaux dans des échantillons environnement aux composés de matières

provenant de plantes, d'insectes, de l'eau et du sol (Pearson, 1926).Les coliformes totaux

sont aujourd'hui utilisés comme indicateur de procédé des Systèmes de traitement de

l'eau et de moins en moins entant qu'indicateur de contamination fécale. Ils permettent

aussi d'indiquer la présence potentielle de biofilms. Les BHAA sont ce pendant considérés

comme de meilleurs indicateurs pour ces deux utilisations. Selon des données

recueillies durant les 20 dernières années, les coliformes thermotolérants, E. coli et les

entérocoques sont des indicateurs de contamination fécale plus valides que les coliformes

totaux (Carrillo et al., 1985 ).

I.14.1.5. Coliformes thermotolérants

Les bactéries formant ce sous-groupe des coliformes totaux se distinguent de ces dernières

Par leur capacité à fermenter le lactose et à produire du gaz et de l'acide à des températures

de44.5±0.2°C en 24±2 heures. On croyait d'abord que les bactéries ayant la capacité de

croître à des températures élevées étaient nécessairement d'origine fécale, on les appelait

donc les coliformes fécaux. De nombreuses études ont par la suite démontrées que certains

de ces coliformes thermotolérants (CT) étaient retrouvés dans l'environnement en absence de

contamination fécale (Davies et al., 1995 ). On remplaça donc le terme «coliformes

fécaux» par «coliformes thermotolérants».Ce dernier sera d'ailleurs privilégié dans ce

mémoire, Malgré que le terme de microbiologie le plus adéquat pour désigner ce groupe

d'indicateurs est «coliformes thermotrophes». Les CT forment le groupe de microorganismes

le plus communément utilisé en tant qu'indicateur de contamination fécale et ce malgré que

certains de ses membres soient parfois retrouvés dans l’environnement. Escherichia coli

représente 94% des CT alors que les autres espèces, telles les Klebsiella, Enterobacter et

Citrobacter ne représentent que3.2à7.4% (OMS,2004). E. coli se distinguent des Autres CT

par sa capacité à produire de l'indole à partir du tryptophane et aussi par son Activité β-

glucuronidase. Cette espèce bactérienne estconsidérée comme le meilleur indicateur de

contamination fécale (Clesceri et al., 1998).Ceci est principalement du à sa faible

prévalence dans l'environnement comparativement à celles des autres CT. En effet,

Escherichia coli est rarement présent en absence de contamination fécale, quoique l'on en a

retrouvé dans les écosystèmes tropicaux et subtropicaux (Fujioka, 1981), tempéré, ainsi

que dans des Ecosystèmes spécifiques fermés comme dans la sarracenie pourpre, une

plante herbacée Carnivore et emblème floral de la province de Terre-Neuve (Conroy et al.,

1996). Les méthodes classiques de détection d'E. Coli sont relativement simples à réaliser, sensibles

et abordables. E. Coli n'est ce pendant pas considéré comme un index de la présence de

pathogènes entériques Viraux ou parasitaires. Cette bactérie est sensible aux produits de

désinfection et survit Relativement mal dans l'environnement comparativement aux

pathogènes sus mentionnés (Oates et al., 2003). Il est généralement admis que de plus, amples recherches devraient porter sur la Corrélation

de la présence d'E. coli avec celle des pathogènes a fin de déterminer la nécessité de

développer de nouveaux indicateurs et que la détection des pathogènes viraux et

parasitaires nécessite une analyse directe et indépendante. I.14.1.6. Les entérocoques intestinaux

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Les bactéries regroupées sous l'appellation générale des «Streptocoques fécaux» sont des

Coques à Gram-positif et sont négatifs pour la catalase. De plus, ils hydrolysent l'esculine, ne

sont pas inhibés par les sels biliaires et tolèrent les environnements au pH basique. Ils sont

anaérobies facultatifs et croissent seuls, en paires ou en chaînettes. Ils appartiennent aux

genres Enterococcus et Streptococcus et possèdent l'antigène groupe D de Lancefield

(Higgins et al., 2003). Les entérocoques de la flore intestinale peuvent être discriminés des

streptocoquesFécaux par leur capacité à croître à 10°C et à 45°C, à pH 9.6 et dans un milieu

contenant 6,5% NaCl. Ces bactéries ont d'ailleurs commencé à être utilisées comme indicateur

de Contamination fécale de l'eau de mer aux États-Unis dans les années1940-1950 (Wright et

al., 2004).

Quoique certaines études démontrent la présence des entérocoques intestinaux dans le sol et

Dans l'eau en absence de contamination fécale, ce groupe est considéré comme ayant

une grande spécificité pour la contamination fécale. Les entérocoques intestinaux sont ce

pendant retrouvés en plus faible quantité dans la matière fécale que les E. coli. Une

caractéristique avantageuse des entérocoques intestinaux réside dans leur capacité de survie

dans l’eau, leur résistance à la dessiccation, au pH élevé, à la chloration (Byappanahalli,

2000) et au traitement de l'eau en aérobie comparativement aux E. coli. Selon l'OMS, ils

servent à complémenter la détection des E. coli. I.14.1.7. Clostridium perfringens et autres Clostridium sulfito-réducteurs

Ces bactéries sont des anaérobies stricts qui réduisent les sulfites (S04-) en hydroxyde de

souffre (H2S) .Elles sont à Gram positif, sporulées, non-motiles, en forme de bâtonnet et ont

d'abord été rapportées par Welchet Nutall en1892 comme agent causal de la gangrène. Ces

microorganismes sont utilisés principalement en Europe pour évaluer la qualité

Microbiologique de l'eau potable (Higgins et al., 2003) sont exceptionnellement résistants aux

Conditions environnementales défavorables telles les radiations UV, des valeurs de pH et de

températures extrêmes et la présence d'agents de désinfection. Ils sont ainsi considérés comme

étant les meilleurs indicateurs de la présence des pathogènes entériques viraux et parasitaires,

qui survivent plus long temps dans l'environnement que les indicateurs bactériens de type

coliforme (LeChevallier et al., 1996).Cette grande résistance du C. perfringens dans

l'environnement dépasse ce pendant celle des pathogènes viraux et parasitaires et fausse

potentiellement la perception quand à la qualité microbiologique réelle de l'eau testée (Struck,

1988). Tout comme la plupart des E. coli et des entérocoques intestinaux, C. perfringens ne se

multiplie normalement pas dans l'environnement tempéré. La complexité et le coût élevé

des méthodes de détection sont les principaux inconvénients de l'utilisation de ce groupe

d'indicateur (Struck, 1988). I.14.1.8. Les coliphages

Les coliphages sont des bactériophages qui infectent spécifiquement E. coli ainsi que d'autres

espèces liées (Shigella sp.) et qui les utilisent comme hôte a fin de se répliquer. Ils sont

ainsi assez spécifiques aux E. coli et se répondent donc dans les fèces humaines ou animales

mais aussi dans l'environnement dans la mesure obligatoire ou les hôtes bactériens y sont

présents. On dénombre deux groupes de coliphages utilisés comme indicateur de

contamination fécale: les coliphages somatiques et les coliphages F-ARN. La grande

différence entre ces deux groupes est leur voie d'infection. Les coliphages F-ARN sont

potentiellement de bons indicateurs de contamination fécale Virale étant donné leur similarité

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de comportement, de morphologie et de structure avec les virus entériques humains. La

similarité entre les capacités de sur vie dans l'eau des coliphages et des virus entérique sa

d'ailleurs été démontrée. De plus, les coliphages Sont résistants aux désinfectants utilisés pour

le traitement de l'eau tel que le chlore (Ashbot, 2004 ; Binsztein et al., 2004) .Par contre, ils

ne nuisent pas tous les critères correspondant à l'organisme indicateur absolu (Higgins et al.,

2003).

En effet, Grabow et al en 2000 ont détecté des virus entériques à partir d'échantillons d'eau

qui étaient négatifs pour les coliphages (Higgins et al., 2003).

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Matériel et méthodes

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II. Matériel et méthodes

II.1. Présentation de la zone d’étude

ville de Béni Abbés, fondée sur le bord de l’oued Es-Saoura, est située au Sud-ouest du

Sahara algérien (Fg. 1). Dans le passé, l’eau originale d’une source locale d’origine

souterraine (nappes phréatiques) été estimée comme potable pour la ville. Elle était

abordable , à tous les citoyens, à l’aide d’un réseau de distribution local (Rames, 1941).

L’oasis de Béni Abbés, c’est une partie de la Saoura, prend comme coordonnées (2°1'5'' O,

30°8'7'' N). Elle se situe dans le Sahara occidental de l’Algérie, à environ 240 km au Sud-

Ouest du chef- lieu département de Bechar et à 880 Km au Sud-Ouest d’Alger (fig.02). La

vallée de la Saoura résultant de la conjonction des oueds Guir et la Zouzfana, représente

un principal cours d’eau du Sahara Nord. Cette région est connue par un climat aride à

semi-aride. La température moyenne est 19,5°C en hiver et 48°C en été. La pluviométrie

moyenne annuelle très faible. Les ressources en eau certaines de la région sont

principalement souterraines. Absence des ressources superficielles qui sont inexistantes

(Merzougui et al. , 2007).

La production des eaux potables annuelle été estimée à 1 040 688 m3/an. Les quantités

d’eau consommées étaient variables selon les saisons ; la quantité fournie aux citoyens

atteignait 693 500 m3/an, et, la palmeraie été irriguée par 347188 m

3 /an, 33.36% de

l’eau totale produite (Bennadji et al. , 1998).

Actuellement, suite au développement démographique, la population de la ville s’élève à

13.000 habitants (Deuerlein et al., 2004), le service n’est assuré que deux heures environ par

jour. Cet état a encouragé les services publics à fouiller d’autres sources hydriques par le

forage de nouveaux puits afin d’accentuer la source principale de Sidi Othmane qui a un

débit de 26 litres par seconde. Ainsi, actuellement 2 puits sont mis en service (puits

communal et forage1), ayant chacun un débit de 4 litres par seconde, et représentant 20% de

la production totale (Deuerlein et al., 2004).

Généralement, plusieurs types de microorganismes contaminent l’eau et décadent sa

qualité sanitaire. Cette contamination est souvent résulte de rejet de matières fécales

d’origine humaine ou animale. Certains de ces microorganismes peuvent déclencher des

maladies hydriques graves (Taras et al., 1971). D’autre part, l’implantation d’usine de la

limonaderie de proximité (Deuerlein et al., 2004), qui rejettent des résidus proche du puits

communal, peut être aussi un facteur de dégradation de la qualité sanitaire des eaux. Les

systèmes du réseau d’eau potable, celui qui possède de multiples conduits en parallèle et

celui des foggaras d’irrigation de palmeraie, sont exposés à la contamination croisée

(Bennadji et al., 1998). Les données sur le fonctionnement des deux réseaux n’ont pas fait

l’objet d’étude et sont toujours méconnues (Deuerlein et al., 2004)

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Fig. N°02 : Carte géographique de la zone d'étude

Site 1 : Ain Sidi Otmane :

Il est situé dans la zone Est de la ville de Béni Abbés (30°07’2.68’’N 2°09’56.63’’O). ce site

est menace par les rejets des décharges illégales et suite à l’extension de l’urbanismeIl Reçoit

des infiltrations des fausses septiques des habitants de quartier chaaba

Site 2 : Puits Communal : Il est situé dans la zone sud de la ville de Béni Abbés il

se situe à 300 mètres d’oued ou il ya rejet principale des eaux usées de Béni

Abbés et à 450 mètres du cimetière Sidi Otmane

Site 3 : Foggara de Béni Abbés : Il est situé dans la zone Ouest de la ville de Béni

Abbés elle sesitue dans un quartier populaire entoure par des habitats en toube et dans

ces maisons il ya élevage des animaux et des jardins.

Site 4 : Forage de Béni Abbés : Il est situé dans la zone Nord de la ville de Béni Abbés il est

situe au pied de la dune

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33

Fig. 03 : Positionnement des sites d’étude N° 01, 02,03 et 04 (Google, 2016 modifiée).

Fig. 04 : Positionnement de site d’étude N° 05 (Google, 2016 modifiée).

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Figure 05 : Positionnement de site d’étude N° 06 (Google, 2016 modifiée).

Site 5 : Foggara d’Ougarta : Il est situé dans une localité à 40 km Sud Est de la ville

de BéniAbbés.La foggara se situe dans le village non protégé il ya rejet des déchets

par les habitants en plus des fausses perdus elle est fréquenté par des oiseaux et même

les animaux errants

II.2. Echantillonnage

A. Prélèvement d'échantillons d'eau

L'eau est peut-être le principal élément à prélever dans une usine alimentaire,

puisqu'elle est utilisée pour le nettoyage, qui est l'un des fondamentaux agents de diminution

de la contamination bactérienne.

Pour prélever des échantillons d'eau en vue d'un examen microbiologique, procéder comme

suit:

- Utiliser des bouteilles stériles fournies par le laboratoire. Si l'eau est chlorée, il faut

équilibrer le chlore. Dans ce cas, le laboratoire verse dans les bouteilles, avant la stérilisation,

une quantité de thiosulfate de sodium correspondant à100mg/1 d'échantillon .Lorsque

l'échantillon est pour chercher des micro- organismes (bactéries) pendant le transport de

l'échantillon jusqu'au laboratoire, de sorte que la charge microbiologique, au moment de

l'examen, est la même qu'au moment du prélèvement. - Inspecter soigneusement l'extérieur du

robinet au quel l'échantillon va être prélevé. Si le robinet perd par la poignée, prélever si

possible l'échantillon à un autre robinet; si non, signaler la fuite au laboratoire.

-Nettoyer et sécher1'extérieur du robinet. Il n'est pas nécessaire de le flamber.

-Laisser couler l'eau du robinet grand ouvert pendant au moins 30 secondes avant de prélever

l'échantillon, ou pendant deux ou trois minutes, selon la longueur de la conduite d'eau.

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-Refermer partiellement le robinet pour pouvoir prélever l'échantillon sans éclaboussures.

Ouvrir avec précaution la bouteille pour éviter la contamination, comme pour tout autre

prélèvement aseptique, en veillant à ce que rien d'autre que l'eau ne touche l'intérieur

de la bouteille ou l'intérieur du bouchon. Ne pas rincer la bouteille.

-Remplir soigneusement la bouteille sans éclaboussures et prendre soin que l'eau passée sur

les mains de 1'échantillonner ou sur des objets.

Extérieurs ne pénètre pas dans la bouteille. Ne remplir la bouteille qu'aux trois quarts.

-Sauf indications contraires, le volume minimal nécessaire pour un examen microbiologique

est de 100ml.

-Remettre ou envoyer l'échantillon rapidement au laboratoire. Si l'échantillon n'est pas

analysé dans les 24 heures qui suivent le prélèvement, les résultats risquent d'être faussés.

Transporter l'échantillon dans une caisse isotherme à température de réfrigération. Il peut

aussi être nécessaire de prélever des échantillons d'eau dans des réservoirs ouverts et des

cuves .Il faut veiller à ne pas contaminer les réservoirs et le récipient qui va recevoir

l'échantillon. Frotter l'intérieur et l'extérieur d'un récipient gradué en acier inoxydable à

l'aide d'un-gros tampon de coton imprégné d'éthanol à 95 pour cent ou d'isopropanol à 70

pour cent. Chauffer ce récipient à la flamme pour enflammer l'alcool et laisser celui-ci

flamber complètement. Refroidir le récipient d'acier en le plongeant dans l'eau à

échantillonner et en le vidant deux fois. Prélever l'échantillon d'eau et le verser

immédiatement dans un récipient stérile (FAO, 1989).

B. Transport et conservation au laboratoire

La quantité originale en germes des eaux, risque d’avoir des modifications dans le flacon,

après le prélèvement. C’est pour cela que toute analyse doit être effectuée le plus rapidement

possible. La durée du transport ne dépasse pas 01 heure, et la température extérieures et

inférieure ou égale à 10 °C. Même dans les conditions convenables, l’analyse

bactériologique doit débuter dans un délai maximal de 06 heures, après la prise de

l’échantillon (Rodier et al., 1996).

II.3. Analyse physicochimique

Les prélèvements pour les analyses physico-chimiques ont été effectués dans des flacons en

polyéthylène propres et conservé dans une glacière avec un délai de transport ne dépassant

pas 2 h. Les dosages sont réalisés au laboratoire du contrôle de qualité de Béchar en

suivant les protocoles cités, dont les paramètres sont :

II.3.1. La température

La mesure est effectuée sur le terrain par un thermomètre gradué au 1/10 °C. Il y a lieu de

déterminer la température de l’air au même endroit et au même moment (Rodier et al., 1996).

II.3.2. Le pH

La mesure est effectuée par un pH-métre portable. (Mettler Toledo MX 300).

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II.3.3. Détermination résidus secs (RS)

Principe : l’eau est filtrée et le poids de matières retenus par le filtre est déterminé par

peséedifférentielle (Rodier et al., 1996). Les MES s’obtiennent soit par filtration des effluents

peu chargés soit par centrifugation des solutions puis séchage jusqu’à l’obtention d’un résidu

sec constant.

Mode opération :

Laver le disque de filtration à l’eau distillés, le sécher (105°C) jusqu'à masse

constante, puis le peser à 0,1mg prés après passage au dessiccateur .le mettre en place

sur l’équipement de filtration (Rodier et al., 1996).

Mettre en service le dispositif d’aspiration ou de pression. Verser l’échantillon (V) sur

le filtre. Rincer la fiole ayant continu l’eau à analyser avec 10ml d’eau distillé. Faire

passer sur le filtre cette eau de lavage (Rodier et al., 1996).

Laisser essorer le filtre, sécher à 105°C. Laisser refroidir au dessiccateur et peser à

0,1mg prés jusqu'à poids constant (Rodier et al., 1996).

II.3.4. La conductivité électrique

La mesure est réalisée par un conductimètre portable (Mettler Toledo MX 300) et exprimée

en µS/cm

II.3.5.Détermination de l’alcalinité (TA –TAC) :

La détermination du TA-TAC par la méthode titrimétrie est basée sur la neutralisation d’un

certain volume d’eau par un acide minéral dilué en présence d’un indicateur coloré comme le

montre le protocole en annexes (Rodier et al., 1996).

II.3.6.Détermination du titre hydrotimétrique (TH) :

La détermination par la méthode complexométrique se base sur le fait que les alcalinoterreux

présents dans l’eau sont amenés à former un complexe avec le sel EDTA. La disparition des

dernières traces d’éléments libres à doser est décelée par le virage d’un indicateur spécifique

comme c’est décrit dans les annexes (Rodier et al., 1996).

II.3.7. Dosage des chlorures (Cl-) :

Dans la méthode de Mohr, les chlorures sont dosés en milieu neutre par une solution titrée de

nitrate d’argent en présence de chromate de potassium, la fin de la réaction est indiquée par

l’apparition de la teinte rouge (Rodier et al., 1996).

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3 II.3.8. Dosage des nitrates (NO-

) :

Le dosage par spectrophotométrie d’absorption se base sur le fait qu’en présence de salicylate

de sodium ; les nitrates donnent du paranitrosalicylate de sodium coloré en jaune et

susceptible d’un dosage spectrophotométrie (Rodier et al., 1996).

Dosage de Chlorures par méthode de Mohr

Réactifs : - Acide nitrique concentré.

- Carbonate de calcium Pure.

- Solution de chromate de potassium à 10%

- Solution de nitrate d’argent 0,1 N.

Mode opératoire :

Introduire 100 ml d’eau à analyser dans un erlenmeyer de 250 ml, ajouter 3 gouttes

d’acide nitrique concentré puis une pincée de carbonate de chaux et 3 gouttes de chromate de

potassium à 10%. Verser au moyen d’une burette la solution de nitrate d’argent jusqu'à

apparition d’une teinte rougeâtre.

Résultat :

La teneur en chlorures en mg/l =V×35,5

Avec V = volume de nitrate d’argent utilisé en ml.

Dosage des nitrates par spectrophotométrie d’absorption moléculaire

Réactifs: - Acide sulfurique (d = 1,84).

- Solution de salicylate de sodium à 1 %.

- Solution d’azoture de sodium :

Azoture de Na 50 mg

Eau distillée qsp 100 ml

- Solution d-hydroxyde de sodium :

Hydroxyde de sodium 200 g Sel disodique de EDTA 50 g Eau

distillée qsp 1 l

- Solution étalon de nitrate à 100 mg/l

Mode opératoire :

Introduire dans trois erlenmeyer

Blanc Etalon Echantillon

Eau distillée 10 ml - -

Etalon (5 mg/l) - 10 ml -

Eau à analyser - - 10 ml

Solution d’azoture 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml

Acide acétique 0,2 ml 0,2 ml 0,2 ml

Mélanger et incuber 5 min puis évaporer à sec dans une étuve à 80 °C, ajouter 1 ml de

salicylate de Na, mélanger et évaporer, laisser refroidir.

Reprendre le résidu par 1 ml d’acide sulfurique concentré, attendre 10 min.

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Ajouter 15 ml d’eau distillée puis 10 ml de solution d’hydroxyde de Na qui

développe une couleur jaune, lire à la longueur d’onde de 415 nm.

Résultats : donnés en mg/l.

N.B: la loi de Beer est observée pour des concentrations de 0 à 10 mg/l, il faut donc procéder

à des dilutions convenables de l’échantillon à analyser.

Courbe d’Etalonnage pour dosage des nitrates :

Dans une série de capsules de 60; introduire successivement :

Numéro des capsules T I II III IV

Solution Etalon d’azote nitrique 5 mg/l (ml) 0 1 2 5 10 Eau distillée (ml) 10 9 8 5 0 Correspondance en mg/l d’azote nitrique 0 0,5 1 2,5 5 Solution d’azoture de sodium (ml) 0,5 0,5 0,5 0,5 0,5 Acide acétique (ml) 0,2 0,2 0,2 0,2 0,2

Attendre 5 min puis évaporer à sec au bain marie ou dans une étuve portée à 75 –80°C (ne pas

surchauffer ni chauffer trop longtemps). Ajouter 1 ml de solution de salicylate de

sodium, mélangé puis évaporer, laisser refroidir.

Reprendre le résidu pour 1 ml d’acide sulfurique concentré ayant soin de l’humecter

complètement. Attendre 10 min, ajouter 15 ml d’eau permutée puis 10 ml de solution

d’hydroxyde de sodium qui développe la couleur jaune. Effectuer les lectures au

spectrophotomètre à la longueur d’onde de 451 nm. Soustraire des unités d’absorbance, lues

pour les étalons, la valeur relevée pour le témoin.

Construire la courbe d’étalonnage.

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Courbe d’Etalonnage pour dosage des sulfates:

Dans une série de tubes numérotés, introduire successivement :

Numéro des tubes T I II III IV V VI

2-Solution Etalon de SO4 (ml) 0 1 3 5 7 9 10

Eau distillée (ml) 50 49 47 45 43 41 40

Acide chlorhydrique au 1/10 (ml) 1 1 1 1 1 1 1

Solution de chlorures de baryum stabilisée (ml) 5 5 5 5 5 5 5 5

2- Correspondance en mg/l de SO4 0 3 9 15 21 27 30

Agiter 2 ou 3 fois énergiquement. Après 15 min de repos, agiter à nouveau et faire La lecture

au spectrophotomètre à la longueur d’onde de 650 nm. Construire la courbe d’étalonnage.

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Etalonnage des réactifs utilisés dans les dosages titrimétriques Etalonnage d’une

solution d’Hcl 1 N :

Réactif : - Carbonate de sodium pur et anhydre.

- Solution d’hélianthine.

Mode opératoire:

peser 1,06 g de Na2CO3, le dissoudre dans 100 ml d’eau distillée, ajouter deux gouttes

d’hélianthine puis verser l’acide contenu dans la burette jusqu’au virage du jaune au rose.

Calculs: 1,06 de Na2CO3correspondent à 0,68 g de HCl.

o Etalonnage d’une solution de nitrate d’argent 0,1 N :

Réactif : - Solution d’acide chlorhydrique 0,1 N.

- Carbonate de Calcium.

- Solution d’hélianthine.

- Solution à 10 % de chromate de potassium.

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Mode opératoire:

Introduire la solution de nitrate d’argent dans la burette, placer dans un erlenmeyer 10 ml

d’HCl 0,1 N puis ajouter 1 goutte d’hélianthine et une pincée de carbonate de calcium, agiter

jusqu’au virage de l’hélianthine au jaune orangé, ajouter alors 5 gouttes de solution de

chromate, verser le nitrate d’Argent en agitant jusqu’au virage rouge brique.

Calculs: le titre de la solution.

Avec V : volume versé d AgNO3.

Etalonnage d’une solution d EDTA (0,01 M)

Réactif : - Solution étalon de calcium à 0,4 g/l.

Carbonate de calcium déshydraté 1 g.

Acide chlorhydrique dilué au 1/4 qsp dissoudre

Rouge de méthyle (0.3 %) quelques gouttes

Ammoniaque diluée au 1/10 p virage de l’indicateur

Eau distillée qsp 1 l

Mode opératoire:

Prélever 20 ml de solution étalon de calcium, les diluer à 50 ml et procéder au dosage comme

décrit dans le mode opératoire de la dureté totale.

Calculs: la concentration de la solution EDTA en mol/l

V1 : volume en ml de la solution étalon

V2 : volume en ml de la solution EDTA

Correction du titre d’une solution :

Lorsqu’une solution contient une masse de substance supérieure à celle qui correspond à la

normalité, on peut ramener le titre de cette solution à sa valeur normale de la façon suivante :

Soient m la masse au litre de substance correspondant à une liqueur normale.

m’ la masse au litre de cette substance dans la solution à réajuster.

Compléter ensuite jusqu’au trait de jauge avec la solution à réajuster.

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Tableau N° 03: Techniques de conservation des échantillons destinés à l’analyse physico-

chimique (ISO 5667/3–1985)

Paramètre à

étudier

Technique de conservation Durée de conservation maximale

recommandée avant analyse

Conductivité Réfrigération entre 2 et 5 °C 24 h

Chlorures Plusieurs mois

Dureté totale Acidification avec HNO3 à pH <2 1 à 3 jours

Nitrates

Acidification à pH <2 avec H2SO4

et Réfrigération entre 2 et 5 °C

24 h

Azote ammoniacal

Acidification à pH <2 avec H2SO4

et Réfrigération entre 2 et 5 °C

24 h

pH TA – TAC

Réfrigération entre 2 et 5°C 24 h

réfrigération entre 2 et 5°C 24 h

Oxydabilité au Réfrigération entre 2 et 5°C 24 h

KMnO4

Sulfates Réfrigération entre 2 et 5°C Une semaine

NB : la nature du récipient soit du verre soit du polyéthylène.

II.4.Analyses bactériologiques

L’analyse bactériologique a pour but la recherche et le dénombrement des germes existant

dans les échantillons d’eau à analyser.

Il faut déclarer qu’un examen bactériologique ne peut être interpréter que s’il est effectué sur

un échantillon correctement prélevé dans un récipient stérile, selon un mode opératoire précis

évitant toutes les contaminations accidentelles, correctement transporté au laboratoire et

analysé sans délai ou après une courte durée de conservation dans des conditions

satisfaisantes (Rodier et al., 2005).

En raison de la variété des espèces bactériennes, virales et parasitaire, des germes test vont

être analysés qui désigneront l’aspect microbiologique de ces eaux. Une analyse complète de

l’eau brute a été effectuée en se basant sur la recherche et le dénombrement des paramètres

suivants :

Germes totaux ;

Coliformes totaux et fécaux ;

Streptocoques fécaux ;

Clostridium sulfito-réducteurs.

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II.4.I. Recherche et dénombrement des germes totaux

Définition : Bactéries, Levures, Moisissures se développant en aérobiose, lorsque

l’essai est pratiqué selon la méthode précise. Le principe comporte à mettre en évidence les

bactéries qui se développent à 20°C facilitant ainsi les germes spécifiques de l’eau Et celles

qui se développent à 37°C a idant ainsi les germes issus de l’homme et des animaux à sang

chaud.

Intérêt :

Le dénombrement des germes revivifiables est utilisé comme indicateur de pollution :

dans les milieux de très bonne qualité microbiologique pour contrôler une éventuel

contamination bactérienne. Ce sont essentiellement des eaux souterraines des nappes

profondes qui seront contrôlées.

Dans l’usine de potabilisation, il permet de contrôler l’efficacité des différentes étapes du

traitement.

Dans les réseaux : une augmentation de la concentration bactérienne après la station de

traitement peut être le signe d’une multiplication bactérienne dans le réseau ou d’une

pénétration de bactéries à l’intérieur de celui-ci.

Dans les réservoirs et châteaux d’eau, on suit les effets du stockage et de la stagnation sur la

qualité de l’eau et sur la reviviscence des germes Selon les normes internationales, les

micro-organismes reviviscibles se définissent comme étant la totalité des bactéries, levures et

moisissures capables de former des colonies dans ou sur le milieu de culture spécifié dans les

conditions d’essai décrites.

Mode opératoire

A partir de l’eau à analyser, on met 2 fois 1 ml dans deux boites de Pétri vides préparées à cet

usage et numérotées (figure 7).

Compléter ensuite chacune des boites avec environ 15ml de gélose PCA et mélanger avec

précaution en mouvement rotatoire puis laisser solidifier.

Incubation et lecture

Retourner les boites et incuber à une température de 37 °C pendant 24 h à 48 h, l’autre à

22 °C pendant 72 h. La lecture se fait après chaque 24h. On calcule le nombre de

colonies formées présentes dans un millilitre d’échantillon.

Expression des résultats

Les résultats sont traduits en nombre de germes par 1 ml (germes/1ml).

Tous les isolats sont identifies par des galeries biochimique (API 20 E) puis les résultats sont

portés sur une feuille de calcul pour l'identification microbienne Réalisées par J-Noël JOFFIN

à partir du travail de Michel CAVALLA, des observations de Jean CAU

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Fig 06 : Recherche et dénombrement des germes totauxdans l’eau

II.4.2.Dénombrement des coliformes totaux et fécaux : A.Définitions :

Les coliformes totaux : sont à des bacilles Gram négatif, non sporulé, oxydase négatif,

aérobie et anaérobie facultatifs, capables de se multiplier en présence de sels biliaires et de

fermenter le lactose avec production de d’acide et de gaz en 48h à une température de 35-

37°C. Ils se divisent en deux catégories :

Les germes d’origine fécale stricte : Escherichia coli, Citrobacter, Klebsiella , serratia.

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Les germes provenant d’autre sources environnementales (aquatique et tellurique) :

Enterobacter intermedium et Amnigenus, Klebsiella terrigena.

Les coliformes fécaux ou thermo tolérants : présentent les mêmes propriétés mais qu’ils

S’accroissent à 44°C dont l’origine fécale est plus nette.

Escherichia coli présumé: correspond à des coliformes thermo tolérants qui produisent de

l’indole à partir du tryptophane à 44°C.cet indicateur est le plus spécifique d’une

contamination fécale.

Intérêt :

Dans l’eau, ils lèsent leur viabilité plus lentement que la majorité des bactéries pathogènes et

intestinales et forment donc un bon marqueur de contamination fécale de l’eau de premier

ordre. De plus, leur résistance aux agents désinfectants, et notamment au chlore, est voisine

de la résistance des bactéries pathogènes ; ils vont donc constituer de bons indicateurs

d’efficacité de traitement.

Examen est intéressant pour juger de l’efficacité de la désinfection d’une eau est d’un intérêt

moindre pour prouver une contamination fécale sure

La recherche et le dénombrement des coliformes thermotolérants ou fécaux à 44°C : la

présence de coliformes thermotolérants signe l’existence quasi certaine de la contamination

fécale.

La recherche et le dénombrement des seules Escherichia coli ou présumés : parmi les

coliformes thermotolérants, Escherichia coli est l’espèce la plus représentée dans la flore

intestinale de l’homme et des animaux.

II.4.2.1.Recherche et dénombrement des coliformes totaux en milieux liquides (Méthode

de NPP)

Principe :

Cette méthode est une évaluation statistique du nombre de micro-organisme supposés

subsistés dans l’eau de manière parfaitement aléatoire. L’estimation de la densité bactérienne

est obtenue par application du principe de vrai semblance, à partir de réponses

positives observées pour une ou plusieurs dilutions successives de la suspension bactérienne

originelle. Il s’agit d’une méthode quantique et non pas énumératif.

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A-Test de présomption :

A partir de l’eau à analyser, porter aseptiquement :

- 3 fois 10 ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu BCPL D/C muni d’une cloche de

Durham.

- 3 fois 1ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu BCPL S/C muni d’une cloche de

Durham.

- 3 fois 0,1ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu BCPL S/C muni d’une cloche de

Durham.

Chassez le gaz présent éventuellement dans les cloche et bien mélanger le milieu, l’incubation

se fait à 37 °C pendant 24 à 48 heures.

Seront considérés comme positif + ; les tubes présentant à la fois :

Un dégagement du gaz (supérieur au 1/10 de la hauteur de la cloche).

Un trouble microbien accompagné d’un virage du milieu au jaune (ce qui constitue le témoin

de la fermentation du lactose présent dans le milieu).

La lecture finale se fait selon les prescriptions de la table de Mac Grady NPP.

B- Test de confirmation

Le test de confirmation ou test de Marc Kenzie est basé sur la recherche de coliformes fécaux

parmi lesquels on appréhende surtout la présence d’Escherichia coli.

Les tubes de BCPL positifs, après l’agitation, prélever de chacun d’eux quelques gouttes à

l’aide d’une pipette Pasteur pour faire le repiquage dans un tube contenant le milieu Schubert

muni d’une cloche (figure 7). Chassez le gaz présent éventuellement dans les cloche et bien

mélanger le milieu. L’incubation se fait à 44 °C pendant 24 h.

Lecture

Seront considérés comme positif ; les tubes présentant à la fois :

Un dégagement du gaz (supérieur au 1/10 de la hauteur de la cloche).

Un anneau rouge ou rose en surface, témoin de la production d’Indole par Escherichia coli

après addition de 2 à 3 gouttes du réactif de Kovacs.

La lecture finale se fait selon les déterminations de la table de Mac Grady NPP.

à en tenant compte du fait qu’Escherichia coli est à la fois producteur de gaz et d’indole 44

°C.

Utilisation d’un seul tube confirmatif (Dénombrement d’E. coli).

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Fig N° : 07 : Recherche et dénombrement des coliformes totaux et fécaux dans l’eau

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II.4.3.Recherche et dénombrement des streptocoques fécaux ou Entérocoques

II.4.3.1.Recherche des Streptocoques fécaux en milieu liquide

•Définition : bactéries Gram positif, sphériques ou ovoïdes, formant des chainettes, non

sporulées, catalase négative, possédant l’antigène D, croissant en anaérobiose à 44°C, et à pH

9.6, et capables d’hydrolyser l’esculine en présence de bile. Ils se divisent en deux genres

Streptococcus et Enterococcus.

Intérêt :

L’apport des entéroques par rapport aux coliformes repose en leur plus grande résistance dans

les eaux naturelles ; leur présence serait donc le signe d’une contamination fécale de l’eau

plus ancienne.

La résistance des entérocoques aux agents désinfectant est également plus importante,

apparemment du fait de leur mode groupement en chainettes, et est comparable à celle des

entérovirus. Cette propriété pourrait permettre aux entérocoques de mieux représenter la

contamination virale d’une eau.

Par contre une partie des espèces est peu spécifiques des contaminations fécales. On

retrouve par exemple Streptococcus feacalis var. liquefaciens dans l’environnement, sur les

végétaux ou sur des sols non contaminés.

A.Test de présomption :

A partir de l’eau à analyser, porter aseptiquement :

3 fois 10 ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu Rothe D/C(double concentration);

3 fois 1 ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu Rothe S/C (simple concentration),

3 fois 0.1ml dans 3 tubes contenant 10 ml de milieu Rothe S/C (figure 8) :

- Bien mélanger le milieu et l’inoculum.

- L’incubation se fait à 37 °C pendant 24 à 48 heures.

Lecture

Seront considérés comme positifs, les tubes présentant à la fois :

Un trouble microbien accompagné d’un virage du milieu pendant cette période est

présumé contenir un streptocoque fécal.

La lecture finale se fait selon les prescriptions de la table du NPP.

A. Test de confirmation

Le test de confirmation est basé sur l’affirmation des Streptocoque fécaux éventuellement

présents dans le test de présomption. Les tubes de Rothe positifs, après l’agitation, prélevée de

chacun d’eux quelques gouttes à l’aide d’une pipette Pasteur donc faire l’objet d’un repiquage

dans un tube contenant le milieu Litsky Eva (Figure 9). Bien mélanger le milieu et l’inoculum

et l’incubation se fait à 37°C pendant 24 heures.

Lecture

Seront considérés comme positifs, les tubes présentant à la fois : Un trouble microbien.

Une pastille violette (blanchâtre) au fond des tubes.

La lecture finale se fait selon les règles de la table du NPP, le nombre de

streptocoque fécaux sont par 100 ml de l’eau analysé.

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Fig 08 : Recherche et dénombrement des stereptocoques fécaux dans l’eau

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50

4.4.Recherche et dénombrement des spores de bactéries des anaérobies sulfitoréductrice

et de Clostridium sulfitoréducteurs.

Définitions : Spores de bactéries anaérobies sulfitoréductrices : formes de résistance de

micro-organismes se multipliant en anaérobiose à 37°C ± 1 en 24h et ou 48h en gélose

viande foie et donnant des colonies typiques réduisant le sulfite de sodium.

Spores de Clostridium sulfitoréducteurs : même définition que la précédente pour des

bacilles à Gram positif, ne possédant pas de catalase et ayant l’aspect morphologique des

Clostridia.

Intérêt :

Les bactéries anaérobies sulfito-réductrices ou les clostridia sulfito-réducteur voire encore

Clostridium perfringens ne sont pas tous des indicateurs de contamination fécale.

Clostridium perfringens bien que réellement présent dans les matières fécales, est un germe

assez ubiquiste.

L’intérêt de la recherche de tels indicateurs réside dans la propriété qu'ils sporuler, ce qui

les rend particulièrement résistant aux traitements de désinfection.

Ils sont actuellement considérés comme de bons indicateurs de l’efficacité des traitements

vis-à-vis des parasites et en particulier de Cryptosporidium.

Tableau 04. Méthode de dénombrement des germes de contamination fécale et d’efficacité de

traitement :

Analyse Technique Volume de PE Milieu utilisé T°

d’incubation

confirmatio

n

Microorganism

es revivifiables

Incorporation

en milieu

solide

1ml Gélose à

l’extrait

de levure

37°C ET

20°C

-

Coliformes

totaux

filtration 100ml Gélose

lactosée au

TTC

37°C Colonies

typique OX-

Coliformes

fécaux

filtration 100 ml Gélose

lactosée au

TTC

44°C Colonies

typiques

Streptocoques

fécaux

filtration 100 ml Gélose

Slanertz et

Bartely

37°C Colonies

typiques

+Litsky

Colstridium

sulfitoréducteu

rs

Incorporation

en milieu

solide

20 ml Gélose

tryptone

sulfite au

cyclosérine

37°C Colonies

typiques

II.4.4.1.Recherche et dénombrement des Clostridium Sulfito-Réducteurs

Porter dans deux tubes de 1 ml de l’échantillon à analyser (Fig. 09) ;

Préparer pour les deux tubes un chauffage à 80°C, pendant 10 minutes; puis un

refroidissement brutal sous l’eau de robinet (choc thermique qui à pour but

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51

d’éliminer la forme végétative et reste seulement la forme sporulée des bactéries

Sulfito-Réducteurs).

complémenter ensuite chacune des tubes avec environ 15 ml de gélose TSN (TSN+

Alun de Fer et Sulfite de Sodium) et mélanger avec précaution.

Laisser solidifier, puis incuber à 37°C pendant 48 heures avec une première lecture

après 16 heures d’incubation.

Lecture

Après la période d’incubation sera considère comme positif, les tubes contenant de grosses

colonies noires, qui s'accorde au Clostridium sulfito-réducteur. Le résultat est exprimé par le

nombre des Clostridium sulfito-réducteurs par 1 ml de l’échantillon à analyser.

Remarque :

Le dénombrement après 24 heures d’incubation est effectué parfois après 48 heures, le tube

devient complètement noir et devient donc indénombrable.

Fig 09 : Recherche et dénombrement des Clostridium sulfito-réducteurs

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II.5. Recherche des germes pathogènes :

II.5.1. Recherche de Salmonella

Définition :

L’espèce Salmonella est composée de bâtonnet Gram -qui sont semblables

A la définition de la famille des Entérobacteriacées. Ce sont des germes de lactose

et oxydase négatif, catalase positif. La plupart des souches sont mobiles (Lebres et

al.,2002).

se multiplient à la température de 36 ± 2°C en 24 à 48 h, sur milieu Hektoen,

formant de petites colonies, lisses à contours réguliers, pigmentées en vert ou en bleu

vert à centre noir.

L e s Salmonelles se divisent en deux grands groupes : les typhoidiques

(Hautement pathogènes) et les non typhoidiques.

Principe :

La recherche des salmonella comporte plusieurs étapes dont la première et même,

exceptionnellement, la deuxième, peuvent être supprimées : un pré-enrichissement, un

enrichissement, un isolement et identification (Lebres et al., 2002).

Mode opératoire :

*L’enrichissement : Ensemencement d’un milieu liquide sélectif (milieu au sélénite SFB)

àpartir de l’échantillon à analyser puis incuber à 37C° pendant 24 heures.

*L’isolement: A partir du bouillon d’enrichissement, effectuer des isolements sur 2

Milieux différents. Deux séries d’isolement au moins doivent être pratiquées : l’une après 18

-24 heures d’incubation, l’autre après 48 heures Les géloses d’isolement sont incubées à 37°C

pendent 24 à 48 heures. Au bout de 24 heures il est souvent possible de différencier

les colonies à lactose positif et au bout de 36 à 48 heures, toutes les colonies ont généralement

leurs aspects caractéristiques. Selon le milieu d’isolement choisi, ces aspects sont les suivant :

-Sur gélose Salmonella- Shigella :

Des colonies incolores à centre noir : Salmonella à H2S+

*L'identification :

Des colonies présumées Salmonella ou suspectées, se fait à l'aide de : tests biochimiques, test

antigéniques

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II.5.2. Recherche de Vibrion cholirérique : Définition :

Les Vibrionacae sont :

Bacille Gram négatif droits ou incurvés,

Très mobiles,

Oxydase (+),

AAF,

Fermentant le glucose sans production de gaz ni d'H2S, Hautement pathogènes.

Méthode recherche :(voir schémas)

Enrichissement

Bouillon SFB

Incubation 37°C

pendant 18 à 24 H

Isolement

Hektoen

S.S

Incubation 37°C pendant 24 à 48 H

Identification si il y’a des colonies on fait des tests biochimiques

Sur le milieu S.S

Les colonies caractéristiques de Salmonella (lactose négatif) sont opaques, translucides ou

transparentes et généralement avec un centre noir (H2S positif).

Sur le milieu Hektoen

-Colonies vertes à centre noir: P. mirabilis, Salmonella

Gram, Etat frais ,TSI , Urée Indole, TDA , ONPG ,Oxydase

LDC , ODC , ADH ,GN inclinée, API 20 E ,Agglutination (OMA, OMB …)

les tests de confirmation

Fig 10 Recherche de Salmonella

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Fig 11 : Recherche de Vibrion cholirérique

Jour 2 . Deuxième enrichissement et Isolement.

Ce flacon fera l’objet :

d’une part, d’un deuxième enrichissement sur milieu EPA en tubes à raison de 1

ml

d’autre part, d’un isolement sur gélose GNAB 1. L’incubation se fait donc à 37°C

pendant 24 h.

Jour 3 . Lecture des boites et Identification.

D’une part, le tube d’EPA fera l’objet d’un isolement sur GNAB 2,

D’autre part, la boite de gélose GNAB 1 subira une lecture en tenant compte du

fait que les Vibrions se présentent le plus souvent sous forme de grosses colonies

lisses et transparentes caractéristiques.

Identification morphologique et biochimique.

Cinq colonies caractéristiques et distinctes feront l’objet d’une identification morphologique

et biochimique qui se déroulent comme suit :

Etat frais (bacilles, mobilité),

Coloration de Gram (bacilles Gram négatifs),

Oxydase (+),

Ensemencement d’un tube de KIA qui sera incubé à 37°C, 24 h (Saccharose, Glucose,

Gaz et H2S ),

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Ensemencement d’un tube de gélose nutritive inclinée qui sera incubé à 37°C, 24 h qui

servira à l’agglutination sur lame,

Si l'agglutination avec l'eau physiologique et au sérum polyvalent O1 est négative,

faire une mini galerie basée sur l'étude des acides aminés en vue de différencier entre

les Vibrions, les Pleisiomonas et les Aeromonas selon le tableau suivant :

LDC ODC ADH

Vibrion + + -

Aeromonas - - +

Pleisiomonas + + +

Il s'agit du genre Vibrion, répondre : Vibrion NON Agglutinable (NAG).

Si l'agglutination avec l'eau physiologique et au sérum polyvalent O1 est positive, il s'agit

d'un vibrion rough (auto-agglutinable).

Si l'agglutination avec l'eau physiologique est négative et positive au sérum polyvalent

O1, répondre : Vibrion cholérique.

Lecture et interprétation :

dépister les colonies caractéristiques.

Faire une identification biochimique basée essentiellement sur ONPG, TSI, Urée -

Indole, LDC…

Si nécessaire faire une identification antigénique basée essentiellement

sur l’agglutination à l’aide des sérums de groupe OMA et OMB ou bien demander au

laboratoire de référence.

II.5.3.Recherche de Staphylocoques à coagulase positive : Définition :

On entend par Staphylocoques à coagulase (+):

Cocci à Gram (+)

Isolées ou en grappes de raisin,

Catalase (+) et coagulase (+)

se multiplier en 24 à 48 h à 36 ± 2°C sur un milieu sélectif Chapman au mannitol.

L’espèce type du genre est Staphylococcus aureus. Elle est pathogène et très

appréhendée Staphylococcus aureus se présente sous forme de cocci, en grappe de raisin,

Gram +, possédant une catalase et une coagulase.

Selon la disponibilité des milieux de culture, trois techniques différentes sont recommandées

pour la recherche de Staphylococcus aureus à savoir :

méthode de Baird Parker

méthode d’enrichissement sur milieu de Giolliti Cantonii

méthode d’enrichissement sur milieu de Chapman.

Dans le cas des poissons, la recherche de Staphylococcus aureus par la méthode

d'enrichissement sur milieu de Giolliti Cantonii est recommandée.

Méthode d’enrichissement au milieu de Giolliti Cantonii.

Préparation du milieu d’enrichissement.

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Au moment de l’emploi, ouvrir aseptiquement le flacon contenant le milieu de Giolliti

Cantonii pour y ajouter 15 ml d’une solution de Téllurite de Potassium. Mélanger

soigneusement. Le milieu est alors prêt à l’emploi.

Ensemencement.

A partir des eaux, porter aseptiquement 1 ml par dans un tube à vis stérile. Ajouter par la suite

environ 15 ml du milieu d’enrichissement Bien mélangé le milieu et l’inoculum.

Incubation.

L’incubation se fait à 37°C pendant 24 à 48 heures.

Lecture.

Seront présumés positifs, les tubes ayant virés au noir.

Pour se garantir qu’il s’agit bien d’une croissance de Staphylococcus aureus, ces tubes

feront l’objet d’une approbation par isolement sur gélose Chapman préalablement fondue,

coulée en boites de pétri et bien séchées.

Les boites de Chapman ainsi ensemencées seront incubées à leur tour à 37°C pendant 24 à

48 heures.

Après ce délai, déterminer les colonies suspectes à savoir les colonies de taille moyenne,

lisses, brillantes, pigmentées en jaune et pourvues d’une catalase et d’une coagulase.

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Eau à analyser

Fig N°12 : Recherche de Staphylocoques à coagulase positive

Expression des résultats.

Si le tube a noirci au bout de 24 heures d’incubation, et à l’isolement sur

Chapman, il ya pas de colonies caractéristiques ; ce tube est considéré comme positif

Pour chaque boite des tests biochimiques rapides à savoir :

Une épreuve à la catalase (à l’aide de l’eau oxygénée),

Une épreuve à la coagulase (à l’aide de plasma de lapin).

Quelques caractères biochimiques de différentes espèces de staphylocoques sont résumés

dans le tableau ci - après (Lebres et al., 2002).

Tableau 7: Les caractères biochimiques pour les différentes espèces de staphylocoques

Staphylocoque aureus intermédius Saprophyticus pidermitis

Catalase + + + +

Coagulase + + - -

Mannitol en anaérobie + - - -

Résistance à la Novobiocine (5 µg) S S R S

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Résultats et discussion

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Résultats et discussion

L'eau, élément vital peut aussi être agent efficace de transport et de dissémination de la

pollution et des maladies (Lamy, 1995). La composition physicochimique de l'eau reflète le

milieu géologique dans lequel elle circule. Les minéraux, tels que le calcium, le fer, le soufre

et le manganèse, bien qu’ils ne soient pas dangereux pour la santé humaine, peuvent modifier

la dureté, le goût, l'odeur et la couleur de l'eau, lorsqu'ils sont présents en quantité excessive.

C'est pourquoi nous devons prendre garde avec un soin extrême et une vigilance constante de

sa qualité chimique et de sa potabilité (Salamon, 2003). La qualité de l'eau potable destiné a

l'alimentation suscitent des inquiétudes pour la santé humaine dans tous les pays. L’eau de

consommation devrait être exempte des impuretés et des agents pathogènes (Alexander,

2008).

Les résultats des analyses de l'eau pour les 06 sources étudiées, sont présentés dans le

TableauI.

Dans ce dernier les résultats de l’analyse de quatorze paramètres physicochimiques sont

reportés.

III.1. Paramètres physico-chimiques

III.1.1. La température

La température de l'eau joue un rôle important dans la solubilité des sels et des gaz, en autres,

l'oxygène nécessaire à l'équilibre de la vie aquatique. Par ailleurs la température accroit les

vitesses des réactions chimiques et biochimiques d'un facteur 2 à 3 pour une augmentation de

la température de 10 °C. L'activité métabolique des organismes aquatiques et donc accélérée

lorsque la température de l'eau s'accroit. La valeur de ce paramètre est influencée par la

température ambiante mais également par d'éventuels rejets d’eau résiduaire chaude. Des

changements brusques de température de plus de 3° C s'avèrent souvent néfastes.

La température de l'eau est un paramètre de confort pour les usagers. Elle permit également de

corriger les paramètres d'analyse dont les valeurs sont liées à la température (la conductivité

notamment). De plus en mettant en évidence des contrastes de température de l'eau sur un

milieu, il est possible d'obtenir des indications sur l'origine et l'écoulement de l'eau. Les

valeurs moyennes de la température des eaux de sources pour les prélèvements sont entre 30,7

enregistre à foggara d'Ougarta et 21,3 à la foggara Béni Abbes Les normes Algériennes de

l'eau potable, la température est fixé 25°C (JORA, 2011), les valeurs moyennes des eaux des

sources dépassent légèrement cette norme dans trois sources d'eau les cas forage Zeghamra

(25,3), puits communal (25,02) et celle de la foggara d'Ougarta (30,7).

III.1.2. Le pH (potentiel hydrogène)

Le potentiel hydrogène (pH) c'est un paramètre chimique caractérisant l'acidité d'un milieu, il

est lié à la concentration d'ions H+

en solution. Le pH d'un lac ou d'un étang dépend de

son âge et des déchets déversés. Lors de sa formation, un lac à un pH basique (ou alcalin) et

progressivement il s'acidifie par la formation de matériaux organiques, dissolution de dioxyde

de carbone CO2 avec formation d'ions bicarbonates HCO3-

(Aminot et Kerouel, 2004).

Le pH est l'un des paramètres chimiques importants lorsqu'il s'agit de déterminer la qualité

d'une eau. Les valeurs moyennes du pH des eaux enregistrés sont les suivants 6,96; 6,88;

7,22; 7,98 ; 7,88 et 8,12 pour les sources d’eau F1, F2, F3, F4, F5 et F6 respectivement (Tab.

6). Les normesAlgériennes de l'eau potable, le pH est fixé entre 6,5 et 9,00, les valeurs

moyennes des eaux des sources restent dans cet intervalle (JORA, 2011).

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Les matières en suspension désignent les fines particules dissoutes dans l'eau (sable, argile,

produits organiques, particules de produits polluant, micro-organismes,...) qui donnent un

aspect trouble à l'eau et s'opposent à la pénétration de la lumière nécessaire à la vie aquatique.

Des grandes quantités constituent donc une pollution solide des eaux. La quantité de matière

en suspension totale se mesure par filtration d'un litre d'eau et pesage des résidus séchés. Le

résultat s'exprime en mg/l. Les RS oscillent entre 387 mg/l et 1939 mg/l. La valeur la plus

élevée est enregistrée pour les eaux du puits communal et la plus faible pour les eaux du

forage de Béni Abbes (Tab. I). La norme algérienne de l'eau potable, des RS est fixée à

1500mg/l (JORA, 2011).

III.1.3. Conductivité

La conductivité électrique d'une eau est l'aptitude que possède cette eau à laisser passer le

courant électrique. Le transport des charges se faisant par l'intermédiaire des ions contenus

dans l'eau, il est logique d'admettre que la conductivité d'une eau sera d'autant plus importante

que sa minéralisation sera élevée. Il existe donc une relation entre la conductivité d'une eau et

sa minéralisation, d’où l'intérêt que présente la mesure de la conductivité. Une eau douce

évaluera généralement une conductivité basse et bien au contraire une eau dite dure

enregistrera une conductivité élevée (Bremaude et al., 2006).

Les valeurs moyennes de la conductivité pour les prélèvements varient d'une source à une

autre et varie entre 558 µs/cm et 2766 µs/cm (Tab. I). La valeur la plus élevé est observé au

niveau Foggara Béni-Abbés qui tend vers la valeur maximale fixé par la norme algérienne.

Toutes les autres valeurs ne dépassent pas cette norme qui est fixée à 2800,00 µS/cm.

Concernant la minéralisation de l'eau, toutes les sources présentent une minéralisation élevée

(conductivité > 1000 us/cm) sauf pour la source Ain Sidi Othmane et la Forage de Béni-

Abbés, il a une minéralisation moyenne (conductivité entre 600 et 1000 us/cm) (Vierling,

2008)

III.1.4. Les résidus secs (RS)

On appelle matières en suspension les très fines particules dissoutes dans l'eau (sable, argile,

produits organiques, particules de produits polluant, micro-organismes,...) qui donnent un

aspect trouble à l'eau et s'opposent à la pénétration de la lumière nécessaire à la vie aquatique.

Des grandes quantités constituent donc une pollution solide des eaux. La quantité de matière

en suspension totale se mesure par filtration d'un litre d'eau et pesage des résidus séchés. Le

résultat s'exprime en mg/l. Les RS oscillent entre 387 mg/l et 1939 mg/l. La valeur la plus

élevée est enregistrée pour les eaux du puits communal et la plus faible pour les eaux du

forage de Béni Abbes . Les normes Algériennes de l'eau potable, des RS est fixé à 1500mg/l

(JORA, 2011).

III.1.5. La turbidité

Une eau turbide est trouble. Cette caractérisation vient de la teneur de l'eau en particules en

suspension, associées au transport de l'eau. Au cours de ce parcours, l'eau se charge d'une

quantité énorme de particules, qui troublent l'eau. Les matières mêlées à l'eau sont de natures

très diverses: matières d'origine minérale (argile, limon, sable,…), micro particules

microorganismes. La turbidité joue un rôle très important dans les traitements d'eau. En effet:

Elle indique une probabilité plus grande de présence d'éléments pathogènes.

La turbidité perturbe la désinfection. Le traitement par ultraviolets est inefficace et le

traitement par chlore perd son efficacité.

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61

La matière organique associée à la turbidité favorise la formation de biofilms dans le

réseau et par conséquent, le développement de bactéries insensibles au chlore notamment.

(Rodieret al., 2005; Hade, 2007).

Les valeurs moyennes de la turbidité pour les prélèvements varient entre 2,820 U la valeur la

plus élevé est observée au niveau de puits communal et la valeur la plus faible est de 0,327

NTU pour le forage de Béni Abbes (Tab. I). Toutes ses valeurs de la turbidité sont en dessous

de la norme Algérienne de l'eau potable fixée à 5,00 N.T.U (JORA, 2011)

III.1.5.1. Les paramètres de pollution

III.1.5.1.2. Les sulfate

Leur présence dans les eaux est en général liée à la présence de gypse dans les sols ou proches

de mines de fer. Hydrogène sulfuré ou sulfure d'hydrogène, gaz nauséabond et toxique à forte

odeur d'œuf pourri, produit par la fermentation anaérobie quand l'eau est trop riche en

matières organiques. C'est aussi un indice de présence de microorganismes (Queneau et

Habert, 2009). Les valeurs moyennes des sulfates pour les différents prélèvements sont :

309,78 mg/l ; 427,7 mg/l ; 489,75 mg/l ; 89,7 mg/l ; 170,8 mg/l et 109,24 mg/l pour les

sources d’eau : F1, F2, F3, F4, F5 et F7 respectivement (Tab. I). Selon les normes

Algériennes de l'eau potable le taux des sulfates sont fixées à 400,00 mg/l (JORA, 2011). Les

valeurs moyennes des eaux de sources étudiées ne dépassent pas cette norme sauf pour les

eaux de la foggara d’Ougarta et celle du puits communal.

III.1.5.1.3. Les nitrate

III.1.5.1.3. L'azote

Cet élément peut être présent sous trois formes: l'ammonium (NH4+

) obtenu par

minéralisation de matière organique (oxydation par bactéries nitrifiantes), sera responsable de

laformation des nitrates NO3-et des nitrites NO2. Les nitrites NO2 sont généralement

absents (ou peine mesurables). Leur présence est indicatrice d'une pollution due à des rejets

d'eau non épurée ou à un ralentissement du processus de nitrification. Ils sont toxiques à

faibles doses (dose létale pour les poissons 3-5 mg/l) (Queneau et Habert, 2009)

III.1.5.1.4. L'ammonium

NH4+

provient des processus de décomposition microbiologique des protéines animales et

végétales. Il peut être réutilisé directement par les plantes et utilisé dans les engrais

commerciaux. Lorsque le pH est élevé l'ammonium se transforme en ammoniac NH3

toxique (dose létale pour certains poissons 1 mg/l) (Queneau et Habert, 2009).

Les valeurs moyennes des nitrates pour les prélèvements varient entre 41 ± 1,33 mg/l et

5,98±1,95 mg/l (Tab. I). Selon les normes Algériennes le taux des nitrates dans l'eau potable

est fixé à 50 mg/l (JORA, 2011). Les valeurs moyennes obtenues dans les différents

prélèvements ne dépassent pas cette norme. Des concentrations élevées de nitrates dans l'eau

de consommation constituent la cause la plus probable de méthémoglobinémie qui se

manifeste par un manque d'oxygénation des tissus, s'interprétant par des difficultés

respiratoires et des vertiges (Galvez-cloutier et Arsenault, 2002).

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62

III.1.5.2. Minéralisation globale

III.1.5.2.1. La dureté (TH)

La dureté d'une eau résulte de la présence de cations bivalents (surtout le calcium Ca2+

, le

magnésium Mg2+

, le baryum Ba2+

et le strontium Sr2+

) dont certains sels sont

particulièrement peu solubles. Au point de vue écologique, une eau douce est plus sensible

aux phénomènes biologiques et chimiques. De plus une eau dure est responsable du dépôt de

calcaire dans les canalisations et les dispositifs industriels et ménagers utilisant l'eau

chaude. Une eau douce assure une meilleure solubilisation des métaux lourds toxiques. Les

taux moyens de TH pour les prélèvements varient entre 69,88 mg/l et 337,52 mg/l. Le taux le

plus faible est enregistré pour les eaux d’Ain Sidi Otmane et le taux le plus élevé est

enregistré pour les eaux du puits communaux.

Suivant les normes Algériennes de l'eau potable pour le TH est fixée à 200 mg/l (ADE,

2006). Les taux moyens dépassent la norme uniquement pour les eaux du puits communal

(Tab. I).

III.1.5.2.2. Les Chlorure

Ils ne sont pas nocifs, mais constituent un important indicateur de pollution. Ils ne sont pas

éliminés par les stations d'épuration. Dans la nature ils sont souvent indicateurs d'arrivée

d'effluents urbains. A titre indicatif, dans l'eau de robinet le maximum admis est de 200 mg/l

de chlorures. La concentration en chlorures dans une eau dépend de l'origine de celle-ci

(proximité d'eau salée, rejets domestiques ou industriels) ainsi que de la nature du terrain

qu'elle traverse. En général, la présence de chlorures dans une eau est fréquente à des teneurs

inférieures à 20 mg/l. ils donnent une bonne indication du degré d'eutrophisation des cours

d'eau et un excès de chlorures est généralement dû à une pollution urbaine (station

d'épuration) ou industrielle particulière (agroalimentaire) Sachant que les normes Algériennes

de l'eau potable pour les chlorures sont fixées à 500,00 mg/l (JORA, 2011) et les valeurs

moyennes des prélèvements pour ce paramètre dans les eaux de consommation de Béni Abbes

balancent entre 869,75 et 78 mg/l (Tab. I). Toutes ses valeurs ne dépassent pas cette norme

sauf pour les eaux du puits communal qui enregistre une valeur très élevée. (Ghebouli et

Bencheikh ElHocine, 2008) ont étudié les eaux souterraines de la région deSétif et ont

constaté que les eaux de l’aquifère superficiel de la zone d’étude présentent une salinité

moyennement à assez élevée. Cette dernière a même révélé une mauvaise potabilité.

III.1.5.2.3. Le Calcium

C'est un métal alcalin terreux; composant majeur de la dureté de l'eau (TH). Sa teneur varie

essentiellement selon la nature des terrains traversés (Rodieret al., 2005). Le calcium est

trouvé dans les eaux qui ont traversé des roches calcaires. Avec le magnésium, il est

responsable de la dureté de l'eau. Cette dureté de l'eau est exprimée par le titre

hydrotimétrique en degrés français ou en mg/l (20°F = 4 mg/L de calcium) (Queneau et

Habert, 2009). Les valeurs moyennes decalcium obtenues dans nos échantillons varient entre

246 mg/l pour le puits communal et 52 mg/l dans les eaux de consommation d'Ain Sidi

Othmane. En revanche pour les eaux du puits communal on remarque un taux élevé qui

dépasse les normes. Contrairement à ce qui est souvent affirmé, la présence d'ions de calcium

dans l'eau aurait même tendance à diminuer le risque de formation de calcules rénaux

(Bremaudeet al.2006).

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63

III.1.5.2.4. Le Magnésium

C'est un des éléments les plus répandus dans la nature ; il constitue un élément significatif de

la dureté de l'eau et donne un gout désagréable (Rodieret al., 2005). Les valeurs moyennes de

magnésium obtenues varient entre 91,12 mg/l et 15,55 mg/l. La valeur la plus faible et

observée pour les eaux du forage de Béni Abbes et la plus élevée pour le puits communal

(Tab. I). Selon les normes Algériennes de l'eau potable, les valeurs moyennes des eaux de

Béni Abbes obtenues ne dépassent pas les normes. Selon Queneau et Habert, (2009) des

apports excessifs de magnésium en cas d'insuffisance rénale peuvent entraîner des troubles

cardio-respiratoires.

III.1.5.2.5 . L'alcalinité

Caractérise la possibilité qu'a une eau à maintenir son pH constant. Ainsi un ajout d'une petite

quantité d'acide faible dans une eau pure provoque automatiquement une baisse sensible du

pH. Une eau alcaline sera capable de neutraliser cet acide et donc de maintenir son pH plus ou

moins constant. On parle aussi du pouvoir tampon d'un tel milieu. Une eau alcaline protège

donc la vie aquatique. Lorsqu'une eau se charge en carbonates, bicarbonates (en traversant des

roches calcareuse par exemple), hydroxydes, phosphates, silicates elles augmentent son

alcalinité (Rodieret al., 2005). Les bicarbonates sont d'origines diverses. Ils n'interviennent

pas directement sur la santé. En revanche, ils ont un rôle par les cations auxquels ils sont liés

(sodium, calcium) (Rodieret al., 2005). Les valeurs moyennes de l'alcalinité pour les

prélèvements sont entre 359,9 mg/l et 144,4 mg/l (Tab. I). Les normes algériennes des eaux

potables fixées à 500 mg/l.

III.1.5.3. Eléments indésirables

III.1.5.3.1. Le Fer :

Provient du sous sol ou de l'industrie, mais il n'est pas nocif. Le sulfate de fer peut provenir

des stations de traitement des eaux où il est utilisé comme floculant. La présence de fer dans

les eaux souterraines à des multiples origines: le fer sous forme de pyrite (FeS2), est

couramment associé aux roches sédimentaires déposées en milieu réducteur (marnes, argiles)

et aux roches métamorphiques. Il se retrouve souvent à de fortes concentrations dans les eaux

des cuirasses d'altération de socle. Présent sous forme réduite (Fe2+

), le fer est oxydé par

l'oxygène de l'air et précipite sous forme ferrique lorsque l'eau est pompée

Fe2+

===========> Fe3+

+ e-

Les valeurs moyennes du fer pour les 10 mois de prélèvements sont entre 0,004 mg/l et 0,262

mg/l (Tab. I). Les normes Algériennes de l'eau potable pour le fer, fixée à 0,30 mg/l (JORA,

2011).

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64

Fig N° 13 : Variation de la température des eaux des differentes sites d'études de region

Saoura

Fig N°14 : variation du pH des eaux des differentes sites d'études de la region de la Saoura

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Fig N° 15 : La variation des paramètres chimiques des eaux de la ville de Béni- Abbes

III.2. Résultats des analyses bactériologiques

Notre objectif consiste à se préoccuper d’identifier et de dénombrer les germes indicateurs de

contamination fécale et de chercher à identifier les bactéries dominantes qui peuvent se

trouver dans cette écosystème aquatique dans une région semi aride. Le contrôle

bactériologique consiste à vérifier la présence de différents types de bactéries dans l'eau du

réseau de distribution publique notamment celle des indicateurs de contamination fécale. Les

résultats de l'analyse microbiologique des différentes sources d'eau potable de la ville de

Béni-Abbes sont portés dans le tableau N°1 dans l’artcile1.

III.2.1. La microflore totale.

La numération des bactéries hétérotrophes reflète la charge totale en bactéries aérobies du

réseau d’eau. Bien qu’elle fut utilisée pour évaluer la « pureté » des sources d’eau dès la fin

du 19e

siècle (Bartram et al., ,2003) Numération des bactéries hétérotrophes (NBH) , ne

s’emploie plus comme indicateur sanitaire(Edberg,1988) . De nos jours, les variations

importantes de la NBH servent à indiquer une détérioration possible de la qualité de l’eau

nécessitant des analyses plus approfondies (Health Canada, 2012). L’augmentation de la

NBH de l’eau traitée peut indiquer un problème dans le traitement ou un changement de

qualité à la source, avant même le traitement. Quand les concentrations en bactéries

hétérotrophes sont acceptables à la sortie de la station de traitement mais dépassent les valeurs

de référence dans le réseau de distribution, il pourrait y avoir une recolonisation bactérienne

dans ce dernier (Bartram et al., 2003).

Le dénombrement de la microflore totale cultivable des différentes sources d'eaux de la ville

de Béni-Abbes montre une charge microbienne qui varie de 00 à 140 105

ufc/ml. Les

principales sources destinées à la consommation publique, La source de Sidi Othmane

contient 65 105

ufc/ml, le puit communale 140 105

ufc/ml et le Forage 38 105

ufc/ml.

Les foggaras source d'eau classique privé sont exploitées essentiellement pour l'irrigation

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sont aussi utilisées comme eau de boisson pour les agriculteurs. Ces Foggara ont une densité

microbienne qui varie de 35 à 140 105

ufc/ml. Nos résultats montrent aussi l'absence totale

de toutes sortes de microorganismes dans la Foggara 10. Kihal et al., (2002) ont montré

que 71,42 % des échantillons analysés des eaux de Foggaras d'Adrar représentent une eau non

potable.

La flore bactérienne identifiée par les techniques classiques de comptage sur gélose n'est pas

forcément représentative des bactéries effectivement présentes dans l'eau produite. Il est ainsi

possible que des bactéries blessées ou stressées au sortir des traitements de filtration et de

désinfection soient rendues temporairement inaptes à la croissance sur des milieux de culture

standard suivant les conditions types fixés. La numération de la microflore totale (bactéries

hétérotrophes) peut être utilisée en tant qu'une des nombreuses méthodes disponibles pour

surveiller la qualité globale de l'eau, elle n'indique pas sa salubrité ni par conséquent la

présence possible de germes pathogènes pour les consommateurs de cette eau. L'augmentation

importante des concentrations de bactéries hétérotrophe au dessus des concentrations

normales des eaux traitées (20 ufc/ml), (JORA 35, 1998), indiquent des changements au

niveau de la qualité de l'eau brute, du traitement ou de la désinfection, une recroissance, une

conception inadéquate ou un mauvais entretien du réseau de distribution (Bartram et

al., 2003).

Les micro-organismes sont non seulement les organismes les plus abondants dans les

systèmes d'eau douce normaux, mais sont également les acteurs principaux dans des

processus écologiques, gérant aussi la purification et la qualité de l'eau. La connaissance

détaillée de la diversité et de la fonction des micro-organismes dans les écosystèmes

aquatiques d'eau douce est un pré requis essentiel à la gestion acceptable des ressources d'eau

douce (Hahn, 2006). Les écosystèmes d'eau douce sont souvent colonisés par des

communautés microbiennes indigènes qui ne se produisent pas dans les systèmes aquatiques

et terrestres qu’en présence des éléments nutritifs et des conditions physicochimiques

optimales. En dépit des études récentes sur la caractérisation de la diversité des

micro- organismes d'eau douce, la connaissance essentielle pour une compréhension

holistique de leurs rôles écologiques manque toujours. Plusieurs études ont démontré que la

composition bactérienne de la communauté (BCC) des eaux change temporairement dans

l'espace, les habitats, et aussi bien entre les habitats (Vaerewijck et al., 2005).

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Fig N°16 : variation des la charge microbienne totale des eaux de Béni Abbés

Fig N° 17 : Aspect des colonies microbiennes sur milieu de dénombrementdans la foggara

d’Ougarta

III.2.2. Les indicateurs de contamination

III.2.2.1.Les coliformes totaux.

Les coliformes totaux ne s’utilisent plus comme indicateur de contamination fécale, car les

progrès de la taxonomie montrent qu’ils ne sont pas spécifiques de l’intestin des humains ou

des autres mammifères à sang chaud et qu’ils peuvent également se trouver dans

l’environnement (Leclerc et al., 2001 ; Tallon et al., 2005) . Comme les coliformes totaux

sont sensibles au chlore, leur présence dans les échantillons d’eau peut indiquer l’existence

d’un biofilm ou un manque d’efficacité du traitement (Health Canada, 2012). La présence de

CT peut aussi indiquer une détérioration de la qualité de l’eau, due au système de distribution

(formation de biofilm, infiltration de sol)( Ainsworth, 2004).Mais pour ces types de

problèmes, la numération des bactéries hétérotrophes (NBH) est un meilleur indicateur, car

elle englobe un plus large éventail de bactéries( Ainsworth, 2004)

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Le taux des coliformes totaux dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes varie de 00

à 140 104

ufc/ml. La source principale, Ain Sidi Othmane, d'approvisionnement en eau

potable de la ville de Béni-Abbes contient un taux de 4 104

ufc/ml. En revanche, le puits

communal le taux de coliforme totaux est de 140 104

ufc/ml, et 16 104

ufc/ml ont été

observé dans le forage.

L’analyse des bactéries coliformes totales est utilisée pour le contrôle de l’eau potable depuis

plus d'un siècle. Son faible coût d’analyse, sa reproductibilité et son omniprésence dans les

eaux de surface en font un indicateur universel pour juger de la qualité d’une eau. Ce groupe

hétérogène appartient à la famille des entérobactéries et comprend plusieurs genres bactériens

se retrouvant dans la flore intestinale normale. Cependant, la plupart des espèces se retrouvent

aussi naturellement dans le sol, la végétation et aussi dans l’eau. De ce fait, cette analyse n’est

pas considérée comme un indicateur de contamination fécale ou de risque sanitaire. La

présence de coliformes totaux dans un système de distribution d’eau potable peut avoir

plusieurs significations:

La recroissance bactérienne, une perte d’étanchéité du réseau, une déficience ou une absence

de traitement.

Les coliformes totaux sont un constituant normal du biofilm qui se forme inévitablement à

l’intérieur des conduites. Une eau potable contenant des coliformes totaux peut indiquer une

incapacité à maintenir un résiduel de chlore suffisant dans le système de distribution. En effet,

plusieurs bactéries de ce groupe ont la capacité de recroître dans le réseau lorsque certaines

conditions y sont favorables (chlore libre insuffisant, eau stagnante, température élevée et

présence de nutriments). En période estivale, cette situation est aussi favorisée par la

croissance et le décollement de couches de biofilm entraînées par un débit d’eau plus élevé.

Les coliformes totaux peuvent signaler la présence d’une pollution de surface à cause d’une

perte de l’intégrité du réseau (réparations, contaminations croisées, siphons dus à la présence

de fissures etc.). Cette situation peut être associée à une baisse subite de la pression et de la

concentration de chlore libre ainsi qu’à une augmentation du dénombrement des BHAA. Elle

nécessite alors une investigation plus poussée.

Pour conclure à une déficience du traitement associée à une détection de coliformes totaux

dans le réseau, il est recommandé d’effectuer des analyses à la sortie du traitement. De même,

dans le cas d’une eau souterraine non désinfectée, des analyses complémentaires peuvent être

faites dans l’eau brute (voir algorithme décisionnel).

Il faut toujours porter une attention particulière à la présence récurrente de coliformes totaux

dans un réseau ou un secteur du réseau. Ces situations doivent être investiguées et

documentées, pour en connaître la cause, et éventuellement corrigées pour prévenir un risque

sanitaire éventuel.

L’analyse des bactéries entérocoques, plus résistantes que E. coli, peut être effectuée pour

détecter la présence de contamination fécale, a survie dans l’eau et la résistance au chlore des

bactéries coliformes totales sont plus faibles que celles des virus et des parasites. Ce ne sont

donc pas de bons indicateurs de la présence ou de l’efficacité du traitement pour ces micro-

organismes. Pour cette raison, les algorithmes décisionnels des sections qui suivent tiennent

compte d’un ensemble de facteurs (p. ex. maintien du chlore résiduel ou efficacité de la

filtration) qui viennent compléter la connaissance indispensable à la prise de décision.

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Fig N° 18 : Aspect de la croissance des coliformes sur milieu BCPL.

L’analyse des coliformes totaux se fait habituellement par filtration sur membrane. On peut

ensuite dénombrer les colonies typiques rouges à reflet vert métallique après incubation de

cette membrane dans un milieu spécifique durant 24 heures à 35°C. Les colonies atypiques

sont celles qui ne présentent pas les caractères typiques.

III.2.2.2. Les coliformes fécaux.

Ils s’utilisent encore comme indicateurs microbiens, mais les. Le terme indicateur de

coliformes thermotolérants a remplacé l’indicateur coliformes fécaux en raison du manque de

spécificité du test de recherche des coliformes fécaux (Caplenas et al., 1984) . Ce test détecte

les bactéries qui fermentent le lactose avec production d’acide et de gaz à 44-44.5°C. Bien

que la majorité des bactéries présentant ces caratéristiques soit d’origine fécale, plusieurs

coliformes fécaux proviennent de l’environnement. Pour cette raison, le terme générique

coliforme thermotolérant remplace progressivement celui de coliformes fécaux (Health

Canada, 2012). La bactérie E. coli fait partie du sous-groupe des coliformes thermotolérants,

dont elle est le seul membre à ne se trouver que dans l’intestin des animaux à sang chaud.

Comme mentionné plus haut, les coliformes fécaux sont un sous-groupe des coliformes totaux

et comptent parmi leurs membres des espèces de bactéries comme Escherichia coli et

Klebsiella pneumoniae. Ils s’utilisent encore comme indicateurs microbiens, mais les

publications montrent depuis longtemps un manque de spécificité de la numération des

coliformes quant à l’origine fécale d’une pollution de l’eau potable (Knittel, 1975). On a par

exemple associé des numérations élevées d’entérobactéries du genre Klebsiella à la présence

d’effluents d’usines de pâte à papier et de végétation en l’absence de toute contamination

fécale (Leclerc et al., 2001, Figueras et al., 2010). C'est pourquoi toute détection de

coliformes fécaux doit être interprétéeavec précaution (Figueras et al, 2010) et aucun avis

d’ébullition ne doit être émis seulement à cause d’échantillons positifs pour les coliformes

thermotolérants (USEPA, 2010). Bien que parfois encore utilisé dans certaines juridictions, le

test de recherche des coliformes thermotolérants est obsolète et n’ajoute aucune valeur aux

tests de recherche de E. coli et coliformes totaux (Health Canada, 2012).

Seulement certaines souches d’E. coli sont capables de causer une maladie (Tallon et al.,

2005; Hunter, 2003; Hrudey, 2011) , et seulement sous certaines conditions (comme E.coli

O157 : H7). Lorsque les résultats de laboratoire indiquent la présence de l’indicateur E. coli,

il s’agit le plus souvent de souches non pathogènes. La détection de l’indicateur E. coli est

une preuve incontestable de l’occurrence d’une contamination fécale récente et indique la

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70

présence potentielle de pathogènes entériques (Payment et al. , 2003; Wade et al., 2003) .

Ceci ne s’applique cependant pas aux eaux tropicales dans lesquelles E.coli peuvent être

détectés et se multiplier en l’absence de contamination fécale (Rivera et al., 1988) . Au

Canada, la présence d’E. coli dans l’eau de boisson n’est pas tolérée comme le témoigne la

Concentration maximale admissible (CMA) qui est de Aucune UFC détectable dans 100 m l

(Health Canada, 2012).

Les coliformes fécaux suit la même allure que les coliforme totaux voir tableau N° 4 Le taux

des coliformes fécaux dans les différents sources d'eau de Béni-Abbes varie de 00 à 140 104

ufc/ml. La source principale d'approvisionnement en eau potable de la ville de Béni-Abbes

contient un taux de 4 104

ufc/ml. En revanche, le puits communal le taux de coliforme totaux

est de 140 104

ufc/ml, et 16 104

ufc/ml ont été observé dans le forage.

Les méthodes de détection dont on dispose à l’heure actuelle ne permettent pas l’analyse

régulière de tous les micro-organismes qui pourraient être présents dans une eau potable

inadéquatement traitée. Elles consistent plutôt à déterminer la qualité microbiologique en

analysant l’eau potable afin d’y détecter Escherichia coli, une bactérie qui se trouve en

permanence dans les intestins des humains et des animaux et dont la présence dans l’eau

indique une contamination par des matières fécales. La concentration maximale acceptable

d’E. coli dans l’eau potable a été établie à « aucun micro-organisme détectable par volume de

100 ml » (Squinazi, 2000).

Les coliformes fécaux sont un sous-groupe de bactéries faisant partie des coliformes totaux.

La méthode d’analyse est optimisée pour sélectionner la croissance des bactéries d’origine

fécale. E.coli est la première espèce bactérienne prise en compte comme indicateur depuis

1893, pourtémoigner une contamination fécale. En suite, en 1907 des chercheurs ont observé

qu'E. coli est la bactérie dominante de la matière fécale humaine tandis que les autres espèces

de coliformes peuvent avoir une autre source (Ashbolt et al., 2001).

E. coli est une espèce de coliformes thermotolerantes capable de dégrader le tryptophane

enindole. Elle est aussi définie comme coliforme par la possession de l'enzyme β-

glucuronidase. E.coli est considérée comme germe dominant de la flore intestinal des

animaux à sang chaud et enparticulier les humains, et représente 1% de la biomasse

microbienne totale (Leclerc et al., 2001). Dans la matière fécale, le nombre d'E. coli est

hautement supérieur à l'ensemble des coliformes notamment Citrobacter, Klebsiella, et

Enterobacter. L’incubation se fait à 44,5°C durant 24 heures dans un milieu spécifique

favorisant la croissance de colonies typiques bleutées. Cette température de croissance élevée

confère à ce groupe le terme plus judicieux de coliformes thermotolérants..

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71

Fig N° 19: Croissance des coliformes fécaux sur milieu liquide Shuber indiquant la

production degaz et l'indole

Fig N°20 : La variation des coliformes totaux, fécaux , E. coli et streptocoques fécaux dans

leseaux de Béni Abbés.

Si, en plus des bactéries coliformes totales, des bactéries coliformes fécales sont présentes,

une contamination d’origine fécale est fortement soupçonnée et un avis d’ébullition doit être

émis immédiatement pour protéger la population.

L’analyse des bactéries E. coli, qui représentent environ 90% des bactéries coliformes fécales,

confirme sans aucun doute que cette contamination est d’origine fécale. En effet, E. coli est la

seule espèce bactérienne faisant partie du groupe des coliformes totaux (et des coliformes

fécaux) qui soit strictement d’origine fécale humaine ou animale. Elle est très abondante dans

la flore intestinale à des dénombrements de 1 million de bactéries par gramme. En outre, les

bactéries E. coli représentent environ 95% de toutes les bactéries coliformes de la flore

intestinale.

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72

C’est une bactérie qui est particulièrement sensible à la désinfection. L’absence de détection

d’E. coli ne garantit pas que l’eau peut être bue sans danger, parce que d’une part un

échantillon ne constitue qu’un instantané (Hrudey et al., 2004; Allen et al., 2012)

III.2.2.3. Les Streptocoques fécaux.

Le taux des Streptocoques fécaux dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes varie

de 00 à 140 104

ufc/ml. La source principale, Ain Sidi Othmane, d'approvisionnement en

eau potable de la ville de Béni-Abbes contient un taux de 6 104

ufc/ml. En revanche, le

puit communal le taux de coliforme totaux est de 15 104

ufc/ml, et 00 ufc/ml ont été observé

dans le forage. En étudiant la qualité sanitaire des eaux de consommation en Suisse, Pruss

(1998) a confirmé la corrélation étroite entre la présence des Enterococcus et

Escherichia coli et l'apparition des maladies d'origine hydrique.

L’expression "streptocoques fécaux " désigne les streptocoques fortement présents dans les

fèces de l'homme et des animaux. Tous possèdent antigène du groupe D de Lancefield. Du

point de vue taxonomique, ils appartiennent aux genres Enterococcus et Streptococcus.

Récemment, la taxonomie des entérocoques a été profondément modifiée et la connaissance

de l'écologie de nombreuses espèces présente encore des lacunes. Le genre Enterococcus

comprend maintenant tous les streptocoques qui se caractérisent par certaines propriétés

biochimiques communes et une large tolérance à des conditions de croissance défavorables,

notamment les espèces E. avium, E. casseliflavus, E. cecorum, E. aurons, E. faecalis, E.

gallinarum, E. hirae, E. malodoratus, E. mundtii et E. solitarus. La plus part de ces espèces

sont d'origines fécale et peuventgénéralement être considérées en pratique comme des

indicateurs spécifiques d'une pollution fécale humaine. Toutefois, on peut aussi les isoler à

partir de fèces d'animaux, et certaines espèces et sous-espèces, comme E. casseliflavus, E.

faecalis var .liquefaciens, E. malodoratus et E. solitarusse rencontrent principalement sur des

végétaux (OMS, 1994).

En ce qui caractérise le genre Streptococcus, seuls S. bovis et S. equinus possèdent l'antigène

du groupe D et font partie des streptocoques fécaux. On les recontre en premier lieu dans les

excréments d'animaux. Les streptocoques fécaux se multiplient rarement dans l'eau polluée et

leur continuité n'est pas supérieure à celle de la E. coli et des coliformes (Leclerc et al.,

1996).

Les bactéries du genre Enterococcus appartiennent au groupe de bactéries qu’on appelait

précédemment streptocoques fécaux. Comme les bactéries E. coli, les bactéries

entérocoques se retrouvent en quantité considérable mais moins abondante que ces dernières

dans les matières fécales humaines et animales. Toutefois, certaines variétés ne sont pas

d’origine fécale et sont présentes naturellement dans les végétaux et le sol. Ces bactéries sont

plus résistantes à la chloration que les coliformes et subsistent généralement plus longtemps

dans l’environnement.

En outre, contrairement aux coliformes, elles recroissent très difficilement dans le réseau.

Leur grande résistance à la sécheresse permet d’utiliser aussi les entérocoques comme

contrôle pratique lors de l’installation ou de la réfection de conduites d’un réseau de

distribution.

L’analyse des bactéries entérocoques est souvent réalisée pour évaluer la contamination fécale

des eaux de baignade. L’analyse se fait habituellement par membrane filtrante sur un milieu

spécifique. Dans le contexte du RQEP, les bactéries entérocoques doivent être contrôlées dans

l’eau brute des puits vulnérables (art. 13) et des réseaux ayant démontré une contamination

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73

fécale lors du contrôle bactériologique (art. 37). Elles sont donc utilisées comme indicateur de

contamination fécale dans une eau souterraine non désinfectée

Fig N° 21: Croissance des entérocoques sur milieu ROTHE

III.2.2.4. Les bactéries pathogènes

Nos résultats indiquent l'absence totale des bactéries suivantes, Vibrion cholérique,

Clostridium, Salmonella et Shigella dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes.

Cesbactéries sont des agents provocants de maladies gastro-intestinales et sont donc présents

dans les matières fécales des animaux et des humains. La présence de l’un de ces micro-

organismes dans l'eau découle en général d’une contamination fécale. Des travaux ont

signalé de nombreuses éclosions en relation avec l’eau de robinet contaminée (Angulo et al.,

1997; Alamanos et al., 2000; Taylor et al., 2000; Chen et al., 2001). Dans la plupart des cas,

on les trouve dans l’eau du réseau de distribution contaminé qui n’était pas traitée

convenablement avant la consommation.

Des études réalisées par Zambeze (2004) sur des échantillons d’eau de consommation vendue

en sachet à Lubumbashi (République du Congo), ont révélé des contaminations soit par les

streptocoques soit par une association de streptocoques et des staphylocoques dorés. Les

concentrations obtenues étaient respectivement de 32 102

ufc/ml et 22 102

ufc/ml.

Fig N° 22 : Aspect des colonies de couleur noir deClostridiumsp. sur milieu VF incubée à

37°Cet à 46°C.

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74

Fig N° 23 : Croissance de Vibrion sur milieu Eau peptonée alcalin pH 9. Le flacon 2 montre

laprésence d'un film à la surface et l'apparition de l'aspect des colonies sur GNAB.

Le risque bactérien d'origine hydrique a été historiquement le plus grave et le plus fréquent.

Au 19ème

siècle, plusieurs épidémies mortelles dans le monde ont été transmises par l'eau

(typhoïde, choléra). L'eau est un milieu favorable au développement des bactéries et des

parasites. Les déjections animales ou les rejets des matières fécales d'origine humaine ont été

les principales sources de contamination bactérienne de l'eau. Ce risque a été

considérablement réduit par la mise en place de procédés de désinfection des eaux et des

installations de traitement des eaux usées, mais il n'a pas disparu.

L'eau reste aujourd'hui à l'origine de la mort de 3 à 10 millions de personnes dans le monde,

contaminées par des bactéries d'origine hydrique (Miquel. 2003). Le contrôle de la qualité

microbiologique de l'eau repose sur la recherche d'indicateurs de contamination fécale, qui est

la contamination bactérienne la plus répandue. Elle peut être aisément suivie par la présence

d'une bactérie témoin : l'Escherichia coli, germe habituel de la flore intestinale des animaux et

des hommes, qui se répand dans les matières fécales. La présence d'E coli dans l'eau révèle

une contamination fécale. Les contaminations de ce type se traduisent par des diarrhées, ou

des gastro-entérites (diarrhées + vomissements + fièvre) plus ou moins graves, mais

susceptibles d'engager le pronostic vital pour les personnes les plus fragiles (Miquel. 2003).

III.2.2.4.1.Caractérisation des espèces dominantes.

Suite aux résultats de dénombrement des différents groupes microbiennes des eaux de Béni-

Abbes, Il nous apparu intéressant d'identifier les bactéries les plus dominant en particulier les

indicateur de contamination des eaux. Sur la base des caractères phénotypique morphologique

nous avons choisi des isolats représentatifs de chaque source d'échantillon d'eau.

L'identification du genre est orientée par la croissance des isolats retenu et pure sur des

milieux spécifiques qui sont suivis par l'observation microscopique et la coloration de gram.

Les différents caractères étudiés sont portés dans le tableau N° A. A l'aide d'un logiciel de

taxonomie (Joffin, 2005) sur feuille Excel nous avons pu classer nos isolat en espèces

correspondantes (Tableau N°). Les espèces identifiées appartiennent au E. coli 1,

Enterobacter gergoviae, Salmonella arizonae,Salmonella Paratyphi A, E. coli 2, Citrobacter

freundii, Vibrio vulnificus et Serratia liquefaciens.Cette identification a été vérifiée aussi avec

d'autres sources bibliographiques de taxonomie (Leclercet al.,1996).

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Fig N° 24 : Identification des isolats par l'utilisation des plaques API 20 E spécifique

auxentérocoques.

Les espèces d'Escherichia coli des membres de la famille des Enterobacteriacées dominante

qui se caractérisent par la possession deux enzymes spécifiques la β-galactosidase et la β-

glucuronidase. Elles se développent à 44-45°C sur des milieux complexe, provoquent la

fermentation du lactose et du mannitol avec formation d'acide et de gaz et produisent de

l'indole à partir du tryptophane. Certaines souches peuvent se développer à 37°C mais non à

44°C et certaines ne produisent pas de gaz. E coli ne produit pas d'oxydase et n'hydrolyse pas

l'urée. Son identification complète est trop complexe pour pouvoir être pratiqué en routine,

mais des épreuves ont été mise au point pour l'identifier rapidement avec un haut degré de

certitude. Certaines de ces méthodes ont été normalisé à l'échelon international et national et

accepté pour les analyses de routines, Tandis que d'autres sont encore au stade la mise au

point ou de l'évaluation.

III.2.2.5 Représente des espèces microbiennes.

Le tableau N°5 indique la répartition des différentes bactéries dominantes su niveau des

sources d'eau. L’espèce d'Escherichia coli est présente dans la totalité des sources. En

revanche, les sources principales d'eau destinée à la consommation humaine (Ain Sidi

Othmane 80%, puits communal 15% et le forage 5%) ne contiennent pas de germes

potentiellement pathogènes tels que Salmonella, Vibrion et Clostridium.

En outre nous remarquons que l'eau de la foggara 10 est il ya presence des E.coli tandis

qu’elle a été stérile et aucun microorganisme ne supporte cette eau mais très faible la

majourite ces des germes coliformes de l’environnement (Leclerc et al., 2001, Figueras et

al., 2010) C'est pourquoi toute détection de coliformes fécaux doit être interprétée avec

précaution (Figueras et al., 2010)

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Evaluation de la Qualité Sanitaire des Eaux Brutes de Consommation : cas de la

Ville de Béni-Abbès du Sud Ouest Algérien

BENGARNIA Benmerine, HENNI Jamal Eddine, AL ABOUDI Abdul Kadhum et

*KIHAL Mebrouk Laboratoire de Microbiologie Appliquée, Département de Biologie.

Faculté des Sciences. Université d’Oran. BP 16 Es-Senia, Oran 31100 Algérie.

[email protected]

Résumé

Le développement de la ville de Béni-Abbès, sous le poids de la démographie et des

activités administratives et commerciales, a entraîné le détournement des eaux réservées à

l’irrigation des sols de la palmeraie. L’analyse physico- chimique et microbiologique des

ressources d’eau Ain Sidi Othmane, des deux puits (communal, forage1) et les

anciennes foggaras ont fait l’objet de cette étude. Les résultats montrent en évidence que la

source principale de Ain Sidi Othmane reste une source eaux de qualité sanitaire et

hygiénique irréprochables avec un taux de résidus secs le plus faible. Les nouveaux puits

communal et forage 1 présentent aussi une eau contenant un taux faible de sel par rapport à

celui cité dans la bibliographie. En revanche les eaux de toutes les Foggaras sont inaptes à la

consommation humaine par la présence de Clostridium. Par ailleurs, la foggara 1 contient la

concentration la plus élevée en résidus secs qui est de 2,325 g/l. L’absence de germes dans

la foggara 10 nous nous incite à approfondir les analyses physico-chimiques. Les sources

destinées aux réseaux de distribution doivent être surveillées.

Mot clés : Zones arides, eau de consommation, qualité de l’eau, Foggara, puits, Béni-Abbès.

Abstract

The urban development of Béni-Abbès, under the weight of demography, the administrative

and commercial activities,

involved the diversion of the water reserved for the irrigation of the palm plantation grounds.

The physicochemical and microbiological analysis of the water resources of Ain Sidi

Othmane, communal well, forage1 and the old foggaras were the subject of this study. The

results show clearly that the principal water source of Ain Sidi Othmane remains a water

source of irreproachable quality with a less rate of dry residues. Also the water of the new

communal well and Forage 1, contains a low concentration of mineral salt compared to that

sited in the bibliography. Whereas, the water of the foggara

10 countain a high concentration of dry matter (2.325g/l). The microbiological quality

analysis showed that clostridium was found in all foggeras water wherefore all foggaras water

is inapt for human consumption. No microbial was detected in the water of the foggara 10

which require other physics and chemical analysis. All drinking water sources must be

supervised.

Key words. Béni-Abbes, Drinking water, microbial analysis, wells, Foggara, dry land.

:الملخص

% اىب اىىجهخ ىيز إى 00ىذخ ث عجبس إى تىاجذ سجخ أدي اىتطىر اىعزا، و اىى اىذغزاف

1هذ اىذراسخ إى تق اىىعخ اىصحخ ىصبدر اىب األسبسخ وه ع سذ عثب، اىجئز االستهالك اىسنب، تهذف

ومذىل اىصبدر اىقذخ مبىفقبراد.

أظهزد تبئج اىتحيو اىنبئ أ ىع ب سذ عثب تحى عي سجخ جذ خفضخ اىزواست اىصيجخ و اىعبد،

غ/ه. 2.3.2 سجخ تحتى عي أعي 1ثب اىفقبرح

، وا Colstridiumمب أظهزد اىتحبىو اىنزوثىىىجخ أ ب اىفقبراد غز صبىحخ ىيشزة الحتىائهب عي ثنتزح

تتز ثعذ وجىد مبئبد دققخ ف بههب. 10اىفقبرح

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ىجهخ ىالستهالك اىى.زاقجخ ستزح ىتتجع اىىعخ اىصحخ ىيب اى 1تتطيت ب سذ عثب، اىجئز اىجيذ

: ث عجبس ، ىعخ اىب، اىبطق اىجبفخ ، ب اىشزة، فقبرح، ثئز. كلمات مفتاحية

INTRODUCTION

La ville de Béni-Abbes, fondée sur le bord de l’oued Es-Saoura, est située au sud ouest du

Sahara algérien (Fg. 1). Dans le passé, l’eau native d’une source locale d’origine souterraine

de très bonne qualité (nappes phréatiques) été considérée

comme potable pour la ville. Elle était accessible, à tous les citoyens, par l’intermédiaire d’un

réseau de distribution local

(Rames, 941).

Figure 1. Montre la position géographique de la ville de Béni-Abbes dans l'Algérie.

La production annuelle été estimée à 1 040 688 m3/an. Les quantités d’eau consommées

étaient variables selon les saisons ; la quantité fournie aux citoyens atteignait 693 500

m3/an, et, la palmeraie été irriguée par 347188 m3 /an,

33.36% de l’eau totale produite (Bennadji e t a l . , 1998).

Actuellement, suite à la croissance démographique, la population de la ville s’élève à 13.000

habitants (Deuerlein et Klingel, 2004), le service n’est garanti que deux heures environ par

jour. Cette nouvelle situation a incité les services publics à explorer d’autres sources

hydriques par le forage de nouveaux puits afin de renforcer la source principale de Sidi

Othmane qui a un débit de 26 litres par seconde. Ainsi, 2 récents puits sont mis en service

(puits communal et forage1), ayant chacun un débit de 4 litres par seconde, et

représentant 20% de la production totale (Deuerlein et Klingel, 2004).

Généralement, plusieurs types de microorganismes contaminent l’eau et dégradent sa

qualité sanitaire. Cette contamination est souvent le résultat de matières fécales d’origine

humaine ou animale. Certains de ces microorganismes peuvent provoquer des maladies

hydriques graves (Taras et al, 1971). D’autre part, l’implantation d’usines de proximité

(Deuerlein et Klingel, 2004), qui rejettent des résidus proche du puits communal, peut

être aussi un facteur de dégradation de la qualité sanitaire des eaux. Les systèmes du

réseau d’eau potable, celui qui possède de multiples conduits en parallèle et celui des

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foggaras d’irrigation de palmeraie, sont exposés à la contamination croisée (Bennadji e t a l . ,

1998). Les données sur le fonctionnement des deux réseaux n’ont pas fait l’objet d’étude et

sont toujours méconnues (Deuerlein et Klingel, 2004).

Actuellement, l’évaluation des risques microbiologiques et chimiques est un instrument très

important pour évaluer la qualité sanitaire de l’eau.

Notre travail consiste à l'évaluation de la qualité sanitaire des sources des eaux souterraines

destinées à alimenter les réseaux de distribution de l’eau de la ville de Béni-Abbes. La

comparaison de la composition chimique et microbiologique des différentes sources nous

oriente sur les procédés à utiliser pour le contrôle de la qualité des eaux de consommation de

la ville de Béni-Abbès.

MATERIEL ET METHODES Echantillonnage

Les analyses microbiologique et physico-chimique ont porté sur 35 échantillons d’eau

prélevés aux endroits suivants:

source de Sidi Othmane, puit communale, forage1 et douze foggaras. Le choix de ces sites

s’est réalisé dans le souci de couvrir l’ensemble du territoire de la ville de Béni-Abbes et

d’inclure les différents types de quartiers et les différentes sources d’eau (Fig. 2). Les

échantillons d’eaux analysés ont été prélevés à la source en respectant les conditions

d’asepsie et la stérilisation du matériel de prélèvement (Taras et al., 1971 ; Baudart et al.,

2002 et El Bakouri et al.,2008).

Analyses physico-chimiques

Toutes les analyses chimiques sont réalisées au laboratoire du contrôle de qualité de

Béchar. Les paramètres physico-

chimiques (la température, la dureté, les résidus secs, la conductivité, le taux de calcium, de

magnésium, de sodium, de chlore et de nitrate) sont déterminés selon les techniques

standards d’analyse de (Rodier, 1984 ; Sidney, 1984 ; et Clescerl et al., 1998).

Figure 2. Le plan global de la ville de Béni-Abbes montrant le réseau de distribution d’eau et

les points de prélèvements des échantillons d’eau.

Légendes : CH : château d'eau; PC : puit communal; ASO : Ain Sidi Othmane, For : forage

Analyses microbiologiques

La qualité bactériologique d’une eau n’est pas un paramètre stable et nécessitent des contrôles

permanents afin de

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détecter rapidement les agents microbiens les plus fréquents de la non potabilité de

l’eau. Le dénombrement des différents groupes microbiens nécessite la réalisation des

suspensions de dilutions et des milieux de culture variés et spécifiques. Pour ce faire, on

prépare des dilutions décimales dans l'eau physiologique stérile. Les échantillons d'eau à

analyser sont dilués de 10-1 à 10-5

Le Dénombrement des groupes microbiens tels que la microflore totale, des coliformes totaux

et fécaux, des Salmonelles et Shigelles, des streptocoques totaux et fécaux, des vibrions, des

Sulfito-reducteurs Clostridium, et des Staphylocoques ont été réalisé selon le protocole de

Taras et al., (1971) ; OMS/PNUE, (1994) ; Spellman (2003) et de Clescerl et al., (1998). Le

tableau I résume les donnés sur les milieux de culture et les conditions utilisés pour le

dénombrement des différents groupes microbiens.

Identification des espèces.

L'identification des espèces, des différents genres bactériens isolés à partir des

échantillons d'eau de consommation de Béni-Abbès, a été réalisée selon les procédures

spécifiques pour chaque genre. Après purifications, on réalise les observations

morphologiques (macroscopiques et microscopiques) et les études physiologiques. La

caractérisation de certaines espèces d’enterobactériacées est faite sur la base des galeries

API 20E. Les résultats des identifications ont été confrontés avec la description des espèces

exposées notamment dans la taxonomie numérique de Kaper et al., (1982).

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Tableau I. Techniques de dénombrement des bactéries recherchées dans les eaux de consommations

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RESULTAT ET DISCUSSION

Résultats des analyses physico-chimiques

La température des eaux de Béni-abbès se situe entre 18 et 19.8 °C (Tab II). Ces valeurs

sont largement inférieures à la température maximale (25°C) qui indique la limite de la

bonne qualité de l'eau selon les normes internationales (OMS, 1994). La température de

l'eau affecte énormément la diversité microbienne de l'écosystème aquatique. Les espèces

psychrophiles, mésophiles dont certaines résistent à des hautes températures peuvent

survivre à la température basse de l'eau de consommation (Vaerewijck et a l. , 2005). Les

valeurs de pH des eaux de consommation de Béni-Abbes se situent entre 7.42 et 8.20. Le

pH de la source principale de Sidi Othmane est de 7.52. Tous les échantillons d’eau ont un

pH conforme aux normes de qualité ; il s’agit dans 100 % des cas de l’eau brute souterraine.

Les valeurs de la dureté des différents échantillons se situent entre 180 et 420 mg/l. On

note aussi que ces valeurs sont inférieures à la limite de concentration maximale admissible

(500 mg/l) (OMS, 1994).

La conductivité mesurée dans les différentes eaux peut atteindre 308 µS/cm dans la foggara

1, en revanche celle de la source est de 143,5 µS/cm. Les résidus secs enregistrés dans la

foggara 1 sont largement supérieurs aux autres sources et donnent une valeur de 2325 mg/l.

La source d'eau principale de Béni-Abbes contient une proportion de résidus secs d'environ

3.83 fois inférieure à la foggara1.

Les résultats de l'analyse chimique des ions sont illustrés dans le tableau II. Les valeurs

obtenues de Calcium, de Magnésium, de Sodium, de Potassium et de Chlore se situent

respectivement entre (52,7 et 146,6 mg/l), (12 et 18 µg/l), (109 et 180 mg/l), (11 et 26

mg/l) et (55,2 et 176,40 mg/l.) Les valeurs des nitrites observées se situent entre (0 et 140

µg/l).

Selon le tableau II, les eaux de consommation de la ville de Béni-Abbes contiennent, des

éléments minéraux dissous sous forme ioniques principalement, les ions Calcium,

Magnésium, Sodium, Potassium, Chlorure et Nitrite. Des concentrations différentes

ont été enregistrées. Cette différence dans les valeurs provient pour l'essentiel du lessivage

des sols. Les valeurs de sels minéraux obtenues dans les eaux de Béni-Abbès sont largement

inférieures à celles enregistrées par Tabet-Helal et Ghellai, (2006) dans les eaux du barrage

de Hammam Boughrara en 2004.

Nos résultats montrent clairement que certaines sources d'eaux de consommation de la ville

de Béni-Abbes, telles que le puits communale, la foggara 1 sont les plus probablement

exposées à une contamination chimique externe.

Djellouli et al., (2005) ont déterminé la composition chimique des eaux destinées à la

consommation humaine dans quelques régions du Sud algérien, les résultats de l’analyse

chimique de ces eaux de consommation révèlent qu’elles sont majoritairement sulfatées,

magnésiennes, calciques et fluorées et les valeurs signalées sont largement supérieures à

celles trouvées dans les eaux de la source de Sidi Othmane.

Les eaux de consommation de la ville de Béni-Abbes contiennent généralement des

concentrations en sels minéraux similaires à celles trouvées par Bagh et al., (2004) dans

les eaux de consommation de Denmark, Kumar et Kumar (2005) dans les eaux potables

conditionnées (en bouteille) en Inde. Azoulay et al., (2001) ont réalisé une étude

comparative des eaux mises en bouteilles de différents pays entre autres (la France, la

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Suisse, le Portugal, le Canada, les USA, l'Italie, l'Irlande, l'Angleterre, l'Espagne, l'Australie,

la Finlande, la Belgique ect..) et ont obtenu les valeurs très proches de nos résultats.

Les analyses physico-chimiques de l’eau de la source de Béni-Abbès, réalisées en juin

1939 à l’hôpital militaire de Bechar donnent les résultats suivants : température 22°C,

limpide sans dépôt, sans couleur, sans odeur et sans saveur. Les concentrations de l’azote

ammoniacal, organique, nitreux et nitrique sont de 70µg/l, 1 µg/l, 00µg/l et 2 µg/l

respectivement. L’eau de la source de Sidi Othmane, au point de vu potabilité, est une eau

potable avec une assez forte proportion de chlorure (64 µg/l) probablement d’origine

géologique ; très peu d’ammoniaque et pas de nitrite, faible proportion de nitrate et de

matière organique (Rames 1941).

La composition physico-chimique, des eaux de distribution de Béni-Abbès, est

légèrement différente d'une source à l'autre, ce qui entraîne une installation d'une

microflore résidente différente. Ce qui nous a poussé à procéder à une étude

microbiologique détaillée afin d'évaluer et de préciser la nature des microorganismes

qui colonisent cette eau de distribution.

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Tableau II. Les propriétés chimiques des eaux de consommation provenant de différentes sources souterraines de la région de Beni-Abbes

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Résultats des analyses microbiologiques.

Le contrôle microbiologique consiste à vérifier la présence de différents types de

bactéries dans l'eau du réseau de distribution publique notamment celle des indicateurs de

contamination fécale. Les résultats de l'analyse microbiologique des différentes sources d'eau

de la ville de Béni-Abbes sont portés dans le tableau III.

La microflore totale.

Le résultat de dénombrement de la microflore totale cultivable des différentes sources

d'eaux de la ville de Béni-Abbes montre une charge microbienne qui varie de 00 à 140 105

ufc/ml. Les principales sources destinées à la consommation publique, la source de Sidi

Othmane contient 65 105 ufc/ml, le puit communale 140 105 ufc/ml et le Forage1 38 105

ufc/ml. Les foggaras source d'eau classique privé sont exploitées essentiellement pour

l'irrigation sont aussi utilisées comme eau de boisson pour les agriculteurs. Ces Foggaras ont

une densité microbienne qui varie de 35 à 140 105 ufc/ml. Nos résultats montrent aussi

l'absence totale de toutes sorte de microorganismes dans la Foggara 10. Kihal et al., (2002)

ont montré que 71,42 % des échantillons analysés des eaux de Foggaras d'Adrar représentent

une eau non potable.

La flore bactérienne identifiée par les techniques classiques de comptage sur gélose n'est

pas forcément représentative des bactéries effectivement présentes dans l'eau produite.

La numération de la microflore totale (bactéries hétérotrophes) peut être utilisée en tant que

l'une des nombreuses méthodes disponibles pour surveiller la qualité globale de l'eau, elle

n'indique pas sa salubrité ni par conséquent la présence possible de germes pathogènes pour

les consommateurs de cette eau. L'augmentation importante des concentrations de bactéries

hétérotrophes au dessus des concentrations normales des eaux traitées (20 ufc/ml), (JORA

35, 1998), indiquent des changements au niveau de la qualité de l'eau brute, du traitement

ou de la désinfection, une excroissance, une conception inadéquate ou un mauvais entretien

du réseau de distribution (Martiny et al., 2003, Zeng et al., 2005).

Les micro-organismes sont non seulement les organismes les plus abondants dans les

systèmes d'eau douce normaux, mais sont également les acteurs principaux dans des

processus écologiques, gérant aussi la purification et la qualité de l'eau. La connaissance

détaillée de la diversité et de la fonction des micro-organismes dans les écosystèmes

aquatiques d'eau douce est un prérequis essentiel à la gestion acceptable des ressources

d'eau douce ( Kell et a l. , 1 9 9 8 et Hahn, 2 0 0 6 ) . Plusieurs études ont démontré que la

composition bactérienne de la communauté (BCC) des eaux change temporairement dans

l'espace, les habitats, et aussi bien entre les habitats (Wadhwa et al., 2002 et Vaerewijck

et al., 2005).

Les indicateurs de contamination

Les coliformes totaux.

Le taux des coliformes totaux dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes varie de 00

à 140 104 ufc/ml. La source principale, Ain Sidi Othmane, contient un taux de 4 104

ufc/ml. Le taux de coliformes fécaux dans les deux puits,

communal et forage 1, est de 140 104 ufc/ml, et 160 103 ufc/ml respectivement.

Ce groupe hétérogène de coliforme appartient à la famille des entérobactéries et comprend

plusieurs genres bactériens qui représentent la flore intestinale normale. Cependant, la

plupart des espèces se retrouvent aussi naturellement dans le sol, la végétation et aussi dans

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l’eau (Williams et al., 2004 et Pozos et al., 2004). De ce fait, cette analyse n’est pas

considérée comme un indicateur de contamination fécale ou de risque sanitaire. La présence

de coliformes totaux dans un système de distribution d’eau potable peut avoir plusieurs

significations dont la recroissance bactérienne, une perte d’étanchéité du réseau, une

déficience ou une absence de traitement.

Une eau potable contenant des Entérobactéries totaux peut indiquer une incapacité à

maintenir un résiduel de chlore suffisant dans le système de distribution.

Les coliformes fécaux.

Le taux de coliformes fécaux suit la même allure que les coliformes totaux (Tab. III). Le

taux des coliformes fécaux dans les différents sources d'eau de Béni-Abbes varie de 00 à 140

104 ufc/ml. La source principale d'approvisionnement en eau potable de la ville de Béni-

Abbes contient un taux de 4 104 ufc/ml. En revanche, le puit communal son taux de

coliformes totaux est de 140 104 ufc/ml, et 16 104 ufc/ml ont été observé dans le forage1.

Les coliformes fécaux sont un sous-groupe de bactéries faisant partie des Entérobactéries.

La méthode d’analyse est optimisée pour sélectionner la croissance des bactéries d’origine

fécale. Escherichia coli est la première espèce bactérienne prise en compte comme

indicateur depuis 1893, pour témoigner une contamination fécale. En suite, en 1907 des

chercheurs ont observé qu'E. coli est la bactérie dominante de la matière fécale humaine

tandis que les autres espèces de Entérobactéries peuvent avoir une autre source (Davies et

al.,1995 ; Rompre et al., 2002).

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Tableau III . La charge microbienne et les autres paramètres microbiologiques des différentes sources d'eau de la ville de Beni-Abbes.

Point du prélèvement Flore

total

(x105)

Coliformes

totaux (x104)

Coliformes

fécaux (x104)

Streptocoques

fécaux (x104)

Vibrion

cholérique

Clostridium Salmonella Staphylococcus

Ain Sidi Othmane 65 ± 3,30 4 ± 0,20 4 ± 0.14 3 ± 0.15 Absence Absence Absence Absence

Puit communal 140 ± 7,50 140 ± 2.30 140 ± 6.02 15 ± 0.92 Absence Absence Absence Absence

Forage1 38 ± 2,30 1.6 ± 0,30 16 ±0.11 00 Absence Absence Absence Absence

Foggara 1 111 ± 6,60 140 ± 2.5 140 ± 6.63 15 ± 0.89 Absence Présence Présence Absence

Foggara 2 135 ± 6,30 110 ± 4.5 40 ±0.52 115 ± 3.01 Absence Présence Présence Absence

Foggara 3 67 ± 4,10 4 ± 0.44 3 ±0.11 3 ± 0.10 Absence Présence Présence Absence

Foggara 4 102 ± 7,50 4 ± 0.56 3 ±0.10 3 ±0.20 Absence Présence Présence Absence

Foggara 5 120 ± 8.40 140 ±3.10 40 ±0.67 30 ±1.84 Absence Présence Présence Absence

Foggara 6 140 ±11.30 140 ± 7.10 140 ±5.23 140 ± 3.21 suspecte Présence Présence Absence

Foggara 7 72 ± 5.50 40 ± 1.40 40 ±1.37 140 ±5.04 Absence Présence Présence Absence

Foggara 8 55 ± 5.40 16 ± 0.35 6 ±0.25 30 ±0.15 Absence Absence Présence Absence

Foggara 9 35 ± 0,45 30 ± 0.23 30 ±0.19 140 ±6.20 Absence Présence Présence Absence

Foggara10 00 00 00 00 Absence Absence Absence Absence

Foggara 11 100 ± 5.80 4 ± 0.12 6 ±0.21 20 ±0.12 Absence Présence Présence Absence

Foggara 12 86 ± 4.36 4 ± 0.22 110 ±4.42 140 ± 7.01 Absence Présence Présence Absence

NB Tous les prélèvements des robinets sont totalement négatifs

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E. coli est une espèce de Entérobactéries thermotolérantes capable de dégrader le

tryptophane en indole. E. coli est considérée comme germe dominant de la flore intestinal

des animaux à sang chaud et en particulier les humains, et représente 1% de la biomasse

microbienne totale (Larpent et Larpent-Gouraud, 1997 ; Rompre et al., 2002 et Leclerc

2003). Dans la matière fécale, le nombre d'E. coli est hautement supérieur à l'ensemble des

Entérobactéries.

Les Streptocoques fécaux.

Le taux des Streptocoques fécaux dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes varie de

00 à 140 104 ufc/ml. La source principale, Ain Sidi Othmane, contient un taux de 6 104

ufc/ml. En revanche, le puit communal le taux de Entérocoques totaux est de 15 104

ufc/ml, et 00 ufc/ml ont été observé dans le forage1. En étudiant la qualité sanitaire des

eaux de consommation de la suisse, Pruss (1998) a confirmé la corrélation étroite entre la

présence des Enterococcus et Escherichia coli et l'apparition des maladies d'origine

hydrique.

Les streptocoques fécaux se multiplient rarement dans l'eau polluée et leur persistance n'est

pas supérieure à celle d’E. coli et des Entérobactéries (Rompre et al., 2002 ; Emmanuel et

al., 2004; Leclerc 2003)..

Les bactéries pathogènes

Nos résultats indiquent l'absence totale des bactéries suivantes, Vibrion cholérique,

Clostridium,Salmonella et Shigella dans les différentes sources d'eau de Béni-Abbes. Ces

bactéries sont des agents provoquant de maladies gastro-intestinales et sont donc présents

dans les matières fécales des animaux et des humains. La présence de l’un de ces micro-

organismes dans l'eau découle en général d’une contamination fécale. Des travaux ont

signalé de nombreuses éclosions en relation avec l’eau de robinet contaminée. Dans la

plupart des cas, on les trouve dans l’eau du réseau de distribution contaminé qui n’était

pas traitée convenablement avant la consommation.

Des études réalisées sur des échantillons d’eau de consommation vendue en sachet à

Lubumbashi (République du Congo), ont révélé des contaminations soit par les

streptocoques soit par une association de streptocoques et des staphylocoques dorés (Mc

Killip et al., 1998). Les concentrations obtenues étaient respectivement de 32 102 ufc/ml et

22 102 ufc/ml.

Le risque bactérien d'origine hydrique a été historiquement le plus grave et le plus

fréquent. Au 19ème siècle, plusieurs épidémies mortelles dans le monde ont été transmises

par l'eau (typhoïde, choléra).

L'eau reste aujourd'hui à l'origine de la mort de 3 à 10 millions de personnes dans le monde,

contaminées par des bactéries d'origine hydrique (Miquel. 2003).

Le contrôle de la qualité microbiologique de l'eau repose sur la recherche d'indicateurs de

contamination fécale, qui est la contamination bactérienne la plus répandue. Les

contaminations de ce type se traduisent par des diarrhées, ou des gastro-entérites (diarrhées

+ vomissements + fièvre) plus ou moins graves, mais susceptibles d'engager le pronostic

vital pour les personnes les plus fragiles (Miquel. 2003).

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Identification des espèces dominantes.

Suite au résultats du dénombrement des différents groupes microbiennes des eaux de Béni-

Abbes, Il nous est apparu intéressant d'identifier les bactéries les plus dominantes en

particulier les indicateur de contamination des eaux. Sur la base des caractères

phénotypiques, les isolats représentatifs de chaque échantillon d’eau ont été choisis.

L'identification du genre est orientée par la croissance des isolats retenus et purs sur des

milieux spécifiques et suivis d’une observation microscopique par la coloration de gram

(Tab IV). A l'aide d'un logiciel de taxonomie sur feuille Excel nous avons pu classer nos

isolats en espèces correspondantes. Les espèces identifiées appartiennent au E. coli 1,

Enterobacter gergoviae, Salmonella arizonae, Salmonella paratyphi A, E. coli 2,

Citrobacter freundii, Vibrio vulnificus et Serratia liquefaciens (Tab. IV). Cette

identification a été vérifiée aussi avec d'autres sources bibliographiques de taxonomie

(Hahn, 2006, Ultee et al., 2004).

Répartition des espèces microbiennes.

Le tableau V indique la répartition des différentes bactéries dominantes au niveau des

sources d'eau.

L’espèce d'Escherichia coli est présente dans la totalité des sources excepté la foggara 10.

En revanche, les sources principales d'eau destinée à la consommation humaine (Ain Sidi

Othmane 80%, puit communal

15% et le forage 5%) ne contiennent pas de germes potentiellement pathogènes tels que

Salmonella, Vibrion et Clostridium.

En outre nous remarquons que l'eau de la foggara 10 est stérile et aucun microorganisme ne

supporte cette eau.

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Tableau IV . Illustre les caractères biochimiques, des espèces des entérobactéries dominantes des eaux de Béni-Abbes. Les plaques de galeries API 20

E sont utilisées pour leur identification.

E. coli 1 Enterobacter

gergoviae

Salmonella

arizonae

Salmonella

Paratyphi A

E. coli 2

Citrobacter

freundii

Vibrio

vulnificus

Serratia

liquefaciens ONPG + + + - - + + +

ADH - - + - - d - -

LDC + - + - + - + +

ODC - + + + - - + +

CIT - + + - - + - +

H2S - - + - - + - -

URE - + - - - - - -

TDA - - - - - - - -

IND + - - - + - + -

VP - + - - - - - +

GEL - - - - - - + +

GLU + + + + + + + +

MAN + + + + + + + +

INO - - - - - + - +

SOR + - + + + + - +

RHA + + + + + + - -

SAC - + - - - - - +

MEL + + + + - + - -

AMY - + - - - + + +

ARA d + + + - + - +

OX - - - - + - + +

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Tableau V. Représente la répartition les espèces bactériennes dominantes dans les différentes sources d'eau de la ville de Béni-Abbes.

E.coli 1

Enterobacter

gergoviae

Salmonella

arizonae

Salmonella

Paratyphi A

E.coli 2

Citrobacter

freundii

Vibrio

vulnificus

Serratia liquefaciens

Closteridium

Ain sidi Othmane X X X X

Puit communal X X X X X

Forage X X

Foggara 1 X X X X X X X

Foggara 2 X X X X X X X X

Foggara 3 X X X X X

Foggara 4 X X X X X X X

Foggara 5 X X X X X X X

Foggara 6 X X X X X

Foggara 7 X X X X X X X X

Foggara 8 X X X X

Foggara 9 X X X X X X

Foggara 10

Foggara 11 X X X X X X X

Foggara 12 X X X X X X X

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Néanmoins, de nombreux exemple dans le monde ont prouvé que les eaux

souterraines peuvent devenir rapidement souillées si les mesures de sauvegarde au

moment de la captation ne sont pas bien mainten ues.

Les données prouvent que la confiance accordée aux eaux souterraines change

considérablement d’un pays à l’autre; par exemple, la Norvège prend seulement 13% de

son eau potable des sources d'eaux souterraines, tandis que l'Autriche et le Danemark

dépendent presque totalement des ressources d'eaux souterraines (Christen, et al., 2006).

La présence relative des différents microbes pathogènes dans un réservoir spécifique

d’eau est déterminée par une combinaison de facteurs: le niveau de contamination de la

source, l'importance de cette source, la capacité de transport d’une source à une autre, la

résistance aux processus de traitement (El Garouani et Merzouk, 2004).

Les mesures préventives sont des techniques, des actions ou des activités qui sont utilisées

pour prévenir un danger microbiologique identifie, l'éliminer ou réduire sa gravite ou sa

probabilité d'apparition à un niveau acceptable. La qualité microbiologique de l'eau

distribuée, adaptée à l'usage de l'eau et au degré de risque du patient, repose sur une

maîtrise permanente du réseau de distribution d'eau, c'est-à-dire sur une conception

réfléchie, un entretien soigneux du réseau et une maintenance régulière des équipements

de distribution d'eau. Les mesures techniques ont pour but de concevoir, traiter,

nettoyer, rincer, désinfecter les composants du réseau de distribution d'eau afin de limiter

la prolifération microbienne et ainsi de réduire notablement la quantité de micro-

organismes véhiculée par l'eau (Squinazi et Gandré, 2006).

Bien que, les progrès accomplis en matière d’hygiène publique ont permis le recul des

grandes épidémies d’origine hydrique, toutefois, la maîtrise du risque microbiologique lié à

la consommation d’eau demeure une priorité universelle.

La plupart des non-conformités relevées au niveau des réseaux d’eau demeure d’origine

microbiologique, et des cas de gastroentérites sont encore actuellement imputables à

l’eau de boisson, en raison de traitements insuffisants ou absents, ou à la suite d’entrées

d’eaux parasites dans les réseaux de distribution.

Le contrôle de la conformité de la qualité de l’eau porte, dans le présent document, sur la

vérification de l’absence de coliformes thermotolérants ou d’Escherichia coli et de

streptocoques fécaux dans un échantillon de 100 mL d’eau prélevé dans le cadre du contrôle

sanitaire courant.

Les caractères biochimiques des espèces de bactéries dominantes dans les eaux de Béni-

Abbès sont présentés dans le tableau IV qui regroupe les genres suivants, Escherichia,

Enterobacter ; Salmonella, Citrobacter, Vibrio, Clostridium et Serratia. La répartition

des espèces microbienne indique que les analyses d’eau du forage1 ont révélé qu’une

seule espèce qui est Escherichia coli. L’absence totale des germes pathogènes tels que

Vibrio, Clostridium, Salmonella dans les eaux du Ain Sidi Othmane, Forage1 et le puit

municipale. Clostridium sp. a été révélé dans toute les eaux de Foggara excepté la foggara

10 qui a une eaux dépourvu de germes détectables. La foggara 10 doit être étudiée avec

beaucoup d’attention car l’absence de germes nous conduit à chercher l’élément

stérilisateurs.

La source de Ain sidi Othmane est caractérisée un taux faible de résidu secs, de sels

minéraux et l’absence totale des nitrates. En revanche la foggara1 représente le taux le plus

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élevé en résidus secs et en sels minéraux avec une concentration de nitrate de 26,1 µg/l. Le

puits communal et le forage1 leur eau contient des valeurs intermédiaires de sels minéraux.

CONCLUSION.

Cet étude de la qualité des eaux de consommation de la ville de Béni-Abbès rentre dans le

cadre de suivre et de comparer la qualité des la source principale de Ain Sidi Othmane avec

les nouveaux puits destinées à la consommation humaine. L’analyse physico-chimique et

microbiologique de sources d’eau principale de Ain Sidi Othmane, puits communal, forage1

et les eaux de foggara ont permis de clarifier la qualité de leurs eaux. Les résultats montrent

clairement que la source principale de Ain Sidi Othmane reste une source eaux de qualité

appréciable avec un taux de résidus secs le plus faible. Les nouveaux puits communal et

forage 1 présente aussi une eau contenant un taux de sel faible par rapport aux eaux

des Foggaras et aussi à celui cité dans la bibliographie. Les eaux de la Foggara 1

contiennent une concentration élevée en résidus secs qui est de 2,325 g/l. L’analyse de la

qualité microbiologique révèle que l’eau des Foggaras contient Clostridium, et elle est inapte

à la consommation

REMERCIEMENTS

Les remerciements des auteurs s’adressent aux responsables de la commune et de la Daira

de Béni-Abbès, ainsi

qu’au Directeur de l’hôpital de Béni-Abbès qui a autorisé la réalisation d’une partie de ce

travail dans le laboratoire d’analyse de l’hôpital.

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Conclusion générale

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102

Conclusion générale

Les eaux souterraines représentent une ressource précieuse très sollicitée par la

population urbaine et périurbaine de la région de Béni Abbés. Ce travail de thèse qui entre

dans le cadre de l’étude de la qualité microbiologique des eaux de consommation brute de la

région de Béni Abbes avait plusieurs objectifs.

Le premier était l’étude de l’évolution des différents paramètres de qualité physico-

chimique et microbiologique au niveau des six sources d’approvisionnement d’eaux

potables dans cette ville.

Les résultats démontrent que les eaux brutes des cinq sources ne sont pas trop chargées en

bactéries en particulier pour la source Ain Sidi Otmane , Foggara de Béni Abbés , Forage de

Béni Abbés et Forage de Zeghamra qui sont de l’ordre de 0,02x105

UFC/ml et 140

x105UFC/ml pour les coliformes totaux. Ce pendant pour les entérocoques oscillent entre

2x 104

et 15 x 104

UFC/ml. Tandis que la foggara d’Ougarta est la source la plus

charger en enregistre 140 x105

UFC/ml pour les coliformes totaux et de l’ordre de 160 x

104

UFC/ml.

Le second objectif de notre étude était l’isolement, l’identification des souches isolées

qui nous a amené a déterminé l’existence de sept genres de bactéries les plus dominant

parmi les 300 souches isolées des eaux brutes de Béni Abbés.(E.coli , Enterobacter,

Salmonella, Citrobacte, Serratia, Aéromonas, Closteridium ). La foggara d’Ougarta

exprime la présence des sept genres de bactéries identifier .ces résultats reflètent la situation

dégradé de la foggara est coïncide avec les résultats car le périmètre de protection des eaux

souterraines n’est pas respecte dans trois sources le puits communal, la source d’Ougarta

et la foggara de Béni Abbes peut être délimité autour de sources non captées présentant un

intérêt pour l’approvisionnement futur. L’utilisation du sol et les autres activités exécutées

dans ce périmètre doivent satisfaire à la quasi-totalité des exigences fixées pour la zone de

protection rapprochée. Une proposition de d’élimination du périmètre de protection (JORA

80/2007)

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103

Perspectives

Pour mieux protéger les eaux dans une zone subaride comme la région de Béni Abbés. Ou

l’eau jeu un rôle très important pour la stabilité des citoyens et pour préserver la qualité des

eaux il faut :

- Préconiser une zone de protection des sources d’eaux.

- Faire un suivi de contrôle de qualité continuellement pour relever le début de la

contamination, et son évolution dans le temps pour permettre de trouver des solutions

d’intervention afin de préserver la source d’eau.

- il est certain que les techniques de culture bactérienne traditionnelles ne suffisent pas

pour étudier les populations bactériennes complexes. Depuis une vingtaine d’années, une

quantité importante d’études ont démontré que la plupart des espèces ne sont pas

cultivables sur des milieux traditionnels et dans un même temps, ont approuvé l’utilisation

de la biologie moléculaire pour l’étude de ces populations complexes, qu’elles soient

digestives, aquatiques, des sols… Ces techniques sont nombreuses mais comprennent en

général un canevas semblable. Tout d’abord, l’ADN doit être extrait, puis amplifié, parfois

traité et enfin visualisé ou séquencé. la biomoléculaire est une méthode d’évaluation plus

récente, plus rapide, plus fiable et avec un prix bas.

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ANNEXE

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1-Recherche des germes totaux:

Gélose tryptophane glucose de levure agar (TGEA):

-Tryptone……………………………………………….5g

-Extrait de levure……………………………………….5g

-Glucose………………………………………………..1g

-Gélose…………………………………………………15g

2-Recherche des coliformes totaux:

Bouillon lactose au pourpre de bromocrésol (BCPL):

A-Double concentration:

-Extrait de viande de bœuf…………………………...6g

-Peptone……………………………………………...10g

-Lactose………………………………………………10g

-Pourpre de bromocrésol…………………………….0,06g

-Eau distillé…………………………………………1000 ml

B- Simple concentration:

-Extrait de viande de bœuf……………………..........3g

-Peptone……………………………………………...5g

-Lactose………………………………………………5g

-Pourpre de bromocrésol…………………………….0,03g

-Eau distillée……………………………………….1000 ml

3-Recherche d'Escherchia coli:

Milieu de mannitol (Schubert):

-Tryptophane……………………………………0,2g

-Acide glutamique………………………………0,2g

-Sulfate de magnésium…………………………0,7g

-Sulfate d'ammonium…………………………...0,4g

-Citrate de sodium………………………………0,5g

-Chlorure de sodium…………………………….2g

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116

-Tryptone………………………………………..10g

-Mannitol……………………………………….7,5g

-Tampon phosphate…………………………….500ml

-Eau distillée……………………………………1000 ml

4-Recherche de streptocoques fécaux:

Bouillon glucosé à l'azide de sodium (Rothe):

A-Double concentration:

-Tryptone………………………………………..40g

-Glucose…………………………………………10g

-Chlorure de sodium…………………………….10g

-Phosphate bipotassique………………………...5,4g

-Phosphate monopotassique…………………….5,4g

-Azide de sodium……………………………….0,4g

-Eau distillée…………………………...............1000 ml

-Ph: 6,8-7

B- Simple concentration:

-Tryptone……………………………………….20g

-Glucose………………………………………..5g

-Chlorure de sodium…………………………...5g

-Phosphate bipotassique……………………….2,7g

-Phosphate monopotassique…………………...2,7g

-Azide de sodium…………………...................0,2g

-Eau distillée………………………………….1000ml

-Ph: 6,8-7

Bouillon glucosé à l'éthyle violet et azide de sodium:

-Tryptone……………………………………….20g

-Glucose…………………………………………5g

-Chlorure de sodium……………….....................5g

-Phosphate bipotassique…………………………2,7g

-Phosphate monopotassique……………………..2,7g

-Azide de sodium………………………………...0,3g

-Éthyle violet …………………………………..0,0005g

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117

-Eau distillée………………………………………1000ml

4-Recherche de Salmonella :

Milieu SFB :

-Peptone de viande………………………………………5g

-Lactose………………………………………………….4g

-Sélénite de sodium………………………………………4g

-Phosphate dipotassique………………………………….3,5g

-Phosphate monopotassique…………………………..…6,5 g

Milieu de Salmonella-Shigella :

-Peptone………………………………………………10g

-Extrait de viande………………………………………5g

-Lactose………………………………………………...10g

-Citrate de sodium………………………………………8,5g

-Citrate de fer ammoniacal……………………………...1g

-Thiosulfate de sodium………………………………….8,5g

-Rouge neutre……………………………………………0,025g

-Vert brillant…………………………………………….0,0033g

- Eau distillée……………………………………………1000ml

Milieu d'Hecktoen:

-Peptone pepsique de viande……………………………..12g

-Extrait de levure…………………………………………3g

-Sels biliares………………………………………………9g

-Lactose…………………………………………………...12g

-Saccharose……………………………………………….12g

-Salicine……………………………………………………2g

-Chlorure de sodium……………………………………….5g

-Hyposulfite de sodium……………………………………5g

-Citrate de fer ammoniacal……………………………….1,5g

-Bleu de bromothymol……………………………………0,064g

-Fushine acide…………………………………………….0,04g

-Gélose……………………………………………………15g

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118

5-Recherche de clostridium sulfito-réducteur:

Gélose viande-foie (VF):

-Extrait viande-foie……………………………………...30g

-Glucose………………………………………………….2g

-Amidon…………………………………………………2g

-Gélose………………………………………………….12g

6-Recherche de vibrion cholérique :

Milieu eau peptonée alcaline ( EPA) :

-Bacto-protéose peptone…………………………………5g

-Bactapeptone……………………………………………5g

-Chlorure de sodium…………………………………….5g

-Eau distillée……………………………………………10ml

Milieu gélose nutritive alcaline biliée (GNAB) :

-Bactapeptone………………………………………….10g

-Extrait de viande………………………………………3g

-Chlorure de sodium……………………………………5g

-Agar…………………………………………………..20g

-Eau distillée…………………………………………1000ml

7-Recherche de Staphylococcus aureus:

Bouillon de Giolitti et Cantoni:

-Peptone de caséine…………………………………..10g

-Extrait de viande……………………………………..5g

-Extrait de levure……………………………………..5g

-Chlorure de lithium………………………………….5g

-Manitol………………………………………………..20g

-Chlorure de sodium…………………………………….5g

-Glycine…………………………………………………1,2g

-Pyruvate de sodium…………………………................3g

-Eau distillée………………………………………….1000ml

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Milieu de Baird Parker:

-Extrait de viande…………………………………..5g

-Peptone de caséine………………………………..10g

-Extrait de levure…………………………………..1g

-Pyruvate de sodium……………………………….10g

-Glycine……………………………………………12g

-Chlorure de lithium……………………………….5g

-Agar-agar…………………………………………15g

-A ajouter: 50 ml d'une émulsion de jaune d'œuf (elle est obtenue en diluant 5 ml de

jaune d'œuf prélévé aseptiquement dans 95 ml d'eau salée à 8,5%0); 0,105g de

tellurite de potassium; si besoin: 0,05 g de sulfaméthazine.

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