ingénieur en développement de logiciels de recherche en imagerie médicale et biologique

Ingénieur en développement de logiciels de recherche en imagerie médicale et biologique.

10 décember 2009

Eduardo E. DAVILA S.

Laboratoire : CREATIS Ville : Lyon France

CREATIS–LRMN Centre de recherche en imagerie médicale

180 personnes

Acquisition d’images

Traitementd’images

Interprétationclinique

CREATIS Eduardo E. Davila S.

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Acquisition d’images

Traitementd’images

Interprétationclinique

Chaîne detraitement

Dev.

logi

ciel

Chaîne de traitement vs besoin de développement logiciel

Développement d’applications Développement de librairies

Creatools (bbtk)

• Pérennisation • Mutualisation• Factorisation

Efficacité de développement

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Sources C++

CMakeFile

SLN-VisualMakefile

Executables .EXE

Libraries .LIB/DLLS

Documentations html/pdf

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Windows Linux MacOs

File C++ File.cxx/File.h File.cxx/File.h File.cxx/File.h

Static library Module.lib Module.a Module.a

Dynamic library

Module.dll(Module.lib)

Module.so Module.dylib

Executable file

App.exe App App.app / App

Compiler Visual C++ gcc gcc

Project sln (vc9) MakefileCodeBlock

MakefileXCodeBuilder

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App.EXE

file.cxx file.h

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App.EXE

main.cxx main.h

module.lib

module.cxx module.h

module.lib

file.cxx file.h

module.dll

1

2

3

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App.EXE

file.cxx

file.h module.lib

module.h

module.dll+

Ex. vtk, itk, wx,

qt

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App.EXE

Model.lib

Model.h

Model.dll

+

Filter.lib

Filter.h

Filter.dll

View.lib

View.h

View.dll

ReadWrite.lib

ReadWrite.h

ReadWrite.dll

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Read / Write Images Viewer 2D/3D..

Extract parameters (filter)

Interaction

BBTK

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BoxesRead / Write

Images

BoxesViewer 2D/3D..

BoxesExtract parameters

(filter)

Interaction

BBTK

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BoxesRead / Write

Images

BoxesViewer 2D/3D..

BoxesExtract parameters

(filter)

Interaction

Your Boxes bbtkPackage

Creatools

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App.EXE

module.lib

module.h

module.dll

+

bbPackage.dll(Boxes)

BBTK

module.dll

+

Problèmes:- Connexion entre les modules difficile - Maîtrise de l’informatique nécessaire

Avantages:- Capitalisation du travail du laboratoire- Génération des interfaces rapide & simple- Documentation automatique

Problématique

//

Application

withEx. script définition

Module A

Module B

Module C

Module C

Module A Box A Box B Box C

ApplicationEx. Maracas - Creatools Python BBTK

Module B

Avant Aujourd'hui

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Installer Description

ThirdParty_dlls Dlls (vtk,itk,wx,qt,boost)

ThirdParty_libraries Lib,h (vtk,itk,wx,qt,boost)

Developers_tools (Cmake, Doxygen, Graphviz, TortoiseCvs,FileZilla,Puty,etc.)

creaInstaller crea,BBTK,creaImageIO, creaMaracasVisu, creaContours, creaBruker,creaIRM, creaRecalage

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Sources C++

CMakeFile

SLN-VisualMakefile

Executables .EXE

Libraries .LIB/DLLS

Documentations html/pdf

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-newProject-doc-appli-src-bbNewPackage

-doc-src

-box1-box2

-newProjectBIN -sln/Makefile-debug/release-doc-appli-src-bbNewPackage

-doc-src

-box1-box2

CMakeCode source Project to be compiled

Compilervisual C++ / gcc

lib.dllbblibappli.exe