génome, épigénome, signalisation - olivier bernard

Animateur: Claude PREUDHOMME, avec Olivier BERNARD, Valerie COMBARE, Olivier DELATTRE, Céline DELLOYE-BOURGEOIS, , Jacques GRILL, Isabelle JANOUEIX, Alain MAUVIEL

• Développer la conservation systématique des échantillons au diagnostic et à la rechute. • recueil de consentements

• Stimuler la constitution de banques de données cliniques et biologiques. (CNIL)

• Développer une stratégie de "biopsie" liquide. Peut-être difficile à mettre en place dans toutes les tumeurs, choisir d’abord quelques tumeurs ayant des anomalies génomiques relativement faciles à détecter.

• Pour les tumeurs neurologiques, évaluer la place de :• prélèvement du liquide céphalo-rachidien. • l’imagerie .

• Etude plus systématique des formes familiales, en recherchant systématiquement les principaux gènes connus et en analysant les parents.

• Effectuer de manière plus systématique une enquête familiale.

• Choisir quelques cancers à soumettre à des études génomiques• sarcomes, médulloblastomes, neuroblastomes, hémopathies myéloïdes

• Aborder l’étude de l’hétérogénéité tumorale. sur plusieurs prélèvements pour le même patient (comparaison tumeur primitive, métastases, adénopathies, moelle osseuse, sang …)

• Études poussées et comparatives sur des échantillons au diagnostic et en rechute

Aspects cliniques

• Nécessité de liens entre la pathologie et le fondamental (cancérologie et développement)

• Développement de modèles animaux et cellulaires pour • des études mécanistiques, • des voies de signalisation • La différenciation normale est à utiliser en référence pour l’analyse des tumeurs

• Aborder l’étude des marques épigénétiques, telles que méthylation ou acétylation des histones ou méthylation de l’ADN

• Soumettre quelques types de cancers à des études génomiques poussées • Exome, génome, RNA-seq, épigénétique,…

• Définir des guides pour une homogénéité des données (ex: techniques à utiliser, anticorps, "profondeur", méthodes d'analyse, échantillons, tissu germinal, pureté des échantillons tumoraux…)

• Ceci est important pour générer des données qui puissent être comparées• Études poussées et comparatives sur des échantillons diagnostic et rechute.

• Mécanismes de résistance au traitement ou de rechute

Aspects translationnels/fondamentaux

Animateur: Claude PREUDHOMME, avec Olivier BERNARD, Valerie COMBARE, Olivier DELATTRE, Céline DELLOYE-BOURGEOIS, , Jacques GRILL, Isabelle JANOUEIX, Alain MAUVIEL