chevaliez s virus hcv+marqueurs2014
Post on 16-Jan-2015
290 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
Hépatite CVirus & Marqueurs
Stéphane Chevaliez
Centre National de Référencedes Hépatites Virales B, C et delta
Laboratoire de Virologie & INSERM U955Hôpital Henri Mondor
Université Paris-EstCréteil
• Découvert par Houghton en 1989
• 1ère cause d’hépatite chronique et de cirrhose en
Europe et en Amérique du Nord
• 1ère indication de transplantation hépatique dans les
pays industrialisés
Afdhal, NH. 2004; Sem Liv Dis, 24(Supp 2): 3-8.
Hépatite C : virus et marqueurs
Virus de l’Hépatite C
Virus de l’Hépatite C
• Famille : Flaviviridae
• Genre : Hepacivirus
Phylogénie de la région codant la protéine NS5B
Hépatite C : virus et marqueurs
Adapted from Simmonds et al., 1999; 2001.
• Famille : Flaviviridae
• Genre : Hepacivirus
• Hôte naturel : Homme
• Tropisme : Hépatocyte
Virus de l’Hépatite CHépatite C : virus et marqueurs
Organisation StructuraleHépatite C : virus et marqueurs
Catanese et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2013;110(23):9505-10.
Organisation StructuraleHépatite C : virus et marqueurs
Lindenbach BD, Rice CM. Nat Rev Microbiol 2013;11:688-700; Catanese et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2013;110(23):9505-10.
Organisation Génomique des Flaviviridae
Hépatite C : virus et marqueurs
0 1800 3600 5400 7200 9000 10800
C 4Ap7 NS5BNS5ANS4BNS3NS2E2E15’UTR 3’UTR
Hepatitis C virus
Npr
o
C E1 E2E0 NS2 NS3 NS4B NS5A NS5B4Ap7
5’UTR 3’UTR
Pestivirus
C prM E NS1 2A 2B NS3 NS5NS4A 4BCap5’UTR 3’UTR
Yellow fever virus
Organisation GénomiqueHépatite C : virus et marqueurs
Scheel TK, Rice CM. Nat Med. 2013;19(7):837-49.
Réseaux d’InteractionsHépatite C : virus et marqueurs
Park et al, BMC Bioinformatics 2010, 11(Suppl 1): S23.
Protéine de CapsideHépatite C : virus et marqueurs
Boulant et al, J Virol 2005, 79(17): 11353-11365.
Domaine d’interaction avec l’ARN viral Domaine d’interaction avec LD
Piodi et al., Hepatology 2008, 48(1): 16-27.
VHC G1b
Capside et LipidesHépatite C : virus et marqueurs
Bartenschalger et al., Trends Microbiol 2011 Feb;19(2):95-103.
Interaction entre la Capside et DGAT-1
Hépatite C : virus et marqueurs
Herker et al., Nat Med 2010, 16(11): 1295-1298.
*Diacylglycérol diacyltransférase-1
Glycoprotéine E2Hépatite C : virus et marqueurs
• Hétérodimère avec E1
• Régions hypervariables
– HVR1
– HVR2
– igVR
• Rôles
– HVR2 et igVR indispensables au “folding“ E1-E2
– Étapes précoces (interaction avec CD81, peptide de fusion)
Krey et al., PLoS Pathog. 2010, 6(2): e1000762; McCaffrey et al., J Gen Virol 2011, 92: 112-121.
Étape Précoce : Entrée du VHCHépatite C : virus et marqueurs
Lindenbach BD, Rice CM. Nat Rev Microbiol 2013;11:688-700.
HVR1
Région HVR1 (27 amino-acides) 80% de divergence nucléotidique entre génotypes Epitope majeur de neutralisation
Timm et al., World J Gastroenterol 2007; 13(36)4808-4817.
Hépatite C : virus et marqueurs
Transmission du VHCHépatite C : virus et marqueurs
6a_332b_JFH1Patient 1 (7/04)
5a_SA131b_HVR3812
S5 (7/05)Patient 3 (7/05)Patient 3 (9/05)Patient 2 (7/04)Patient 2 (9/04)Patient 3 (7/04)S4 (6/05)S3 (6/05)S2 (6/05)Patient 3 (01/05)S1 (6/05)
1a_HCT27X52a_Q2B
3a_CB1a_HCT18X5
Patient 61b_AWV2C33
Patient 8Patient 4
Patient 74a_ED43
0.2
100
Surfaces inertes
Girou et al., Clin Infect Disease 2008, 47(5): 627-633.
Patients VHC chroniquesSéroconversion VHC
Analyse Phylogénique
Région HVR1 (81 nt)CLUSTALXDNADist (PHYLIP 3.5)Matrice de distance: Kimura 2-parameter (Ts/Tv=2)Neighbor-JoiningBootstraping : 1000 replicatesNJPlot
Hépatite C : virus et marqueurs
Protéine p7Hépatite C : virus et marqueurs
• Viroporine dont la
structure 3D a été
récemment déterminée par
ME
• Rôle(s) in vivo ?
• Cible thérapeutique
potentielle
Luik et al., Proc Natl Acad Sci 2009, 4;106(31): 12712-6; Griffin S, Proc Natl Acad Sci 2009, 106(31): 12567-68.
Rôle in vivo ?Hépatite C : virus et marqueurs
Scheel TK, Rice CM. Nat Med. 2013;19(7):837-49.
Activité Antivirale du BIT225Hépatite C : virus et marqueurs
• IC50 de 314 nM dans le modèle du BVDV
• Activité synergique
Luscombe et al., Antiviral Res 2010 May;86(2):144-53.
Activité Antivirale in vivoHépatite C : virus et marqueurs
• Phase II
- Patients VHC
- Patients VIH (inhibiteur de Vpu)
- Patients coinfectés
• Activité antivirale chez les patients G1 naïfs de traitement
- 200 à 400 mg en combinaison avec SOC pendant 4
semaines suivi de la bithérapie pendant 44 semaines
- Réduction de l’ARN VHC
. S4 : -4 Log (400 mg) vs -3 Log (groupe contrôle)
. RVS : 100% (7/7) vs 75% (6/8)Tanwandee et al., AASLD 2012.
Protéine NS2Hépatite C : virus et marqueurs
• NS2 (région N-ter)– Rôle dans l’organisation
de la formation des
nucléocapsides
• NS2pro (région C-ter)
Jirasko et al., PLoS pathog 2010 Dec 16;6(12): e1001233; Ivo et al., Nature 2006, 442: 831-835.
Protéine NS3-4AHépatite C : virus et marqueurs
Raney et al., J Biol Chem 2010, 285(30): 22725-731.
Inhibition de la Production d’IFN par NS3
Hépatite C : virus et marqueurs
Rehermann B., J Clin Invest. 2009 Jul;119(7):1745-54.
Cycle Viral du VHC & Cibles des DAAs
Hépatite C : virus et marqueurs
Lange et al., EMBO Mol Med. 2013 Sep 16.
Lange & Zeuzem., J Hepatol 2011;55(3):692-701.
Caractéristiques des IPHépatite C : virus et marqueurs
Protéase NS3Hépatite C : virus et marqueurs
Raney et al., J Biol Chem 2010, 285(30): 22725-731.
TelaprevirHépatite C : virus et marqueurs
Kieffer et al. Hepatology 2007;46:631-639.
Telaprevir Dosing Telaprevir Dosing
0
2
4
6
8
0
2
4
6
8
Log 10
HCV
RN
A (IU
/mL)
Log 10
HCV
RN
A (IU
/mL)
HCV RNA (>100 IU/mL)Wild typeT54AV36A/M
R155K/T36/155A156V/T36/156
Days Days
Patient 1002Patient 1018
LODLOD
1 14 1 14
Telaprevir Approved First generation
Boceprevir Approved First generation
Simeprevir Approved* Second wave
Faldaprevir (BI1335) Phase 3 Second wave
Asunaprevir Phase 3 Second wave
ABT450/r Phase 2 Second wave
Sovaprevir Clinical hold Second wave
GS-9451 Phase 2 Second wave
IDX-320 Phase 2 Second wave
Vaniprevir Phase 2 Second wave
Danoprevir Phase 2 Second wave
MK-5172 Phase 2 Second generation
ACH-2684 Phase 2 Second generation*In US
Inhibiteurs de ProtéaseHépatite C : virus et marqueurs
Pawlotsky JM., Seminars in Liver Diseases, in press.
• Protéine essentielle à la formation des complexes de réplication
• Phosphoprotéine régulée par PI4KIII alpha (enzyme localisé au niveau du RE)– P56 et p58 (forme hyperphosphoryléee)
• Formée de 3 domaines
• Cible d’inhibiteurs spécifiques
Protéine NS5AHépatite C : virus et marqueurs
Reiss et al., PLoS Pathog. 2013 May;9(5):e1003359.
Cycle Viral du VHC & Cibles des DAAs
Hépatite C : virus et marqueurs
Lange et al., EMBO Mol Med. 2013 Sep 16.
Lange & Zeuzem., J Hepatol 2011;55(3):692-701.
Caractéristiques des IPHépatite C : virus et marqueurs
Daclatasvir Phase 3 First generation
Ledipasvir (GS-5885) Phase 3 First generation
ABT-267 Phase 3 First generation
ACH-2928 Phase 2 First generation
PPI-668 Phase 2 First generation
GSK 2336805 Phase 2 First generation
BMS 824393 Phase 2 First generation
Samatasvir Phase 2 First generation
MK-8742 Phase 2 Second generation
ACH-3102 Phase 2 Second generation
GS-5816 Phase 2 Second generation
Inhibiteurs de NS5AHépatite C : virus et marqueurs
Link et al,. J Med Chem. 2013 Dec 9; Degoey et al., J Med Chem. 2014 Jan 8; Pawlotsky et al., Seminars in Liver Disease, in press.
Lesburg et al., Nat struct Biol 1999, 6: 937-943; Bressanelli et al., Proc Natl Acad Sci USA 1999, 96: 13034-13039; Ago et al., Srructure Fold Des 1999, 7: 1417-1426.
Protéine NS5B: RdRpNouvelles Hépatite C : virus et marqueurs
Réplication
– Modèle du poliovirus. Virus à ARN monocaténaire de polarité positive
De Clercq., Nature Review Drug Discovery, 2007; 6: 1001-18
Réplication ViraleHépatite C : virus et marqueurs
Variabilité Génétique
• Erreurs au cours de la réplication– Fréquentes
• 10-4-10-4 mutations par nucléotide copié au cours de la réplication du VHC
– Spontanées– Au hasard
• Absence d’activité exonucléasique 3’5’ ("proofreading")– Accumulation de mutations
• A l’origine de : – La diversification des types et des sous-types– La distribution en quasi-espèces
Hépatite C : virus et marqueurs
Diversification des GénotypesHépatite C : virus et marqueurs
Smith et al., Hepatology 2014;59(1):318-27.
1a,
Adapted from Fang J., et al. J. Clin Liver Dis. 1997.
Distribution des GénotypesHépatite C : virus et marqueurs
Distribution en Quasi-espèceHépatite C : virus et marqueurs
Domingo, E. Cell 1978, 13 (4):735-744.
Copyright © 2006 Merck & Co., Inc., Whitehouse Station, New Jersey, USA
Cibles des Molécules Antivirales
Hépatite C : virus et marqueurs
Site A (Thumb/fingertips)(JTK-109)
Mutants: 495, 496, 499
Site B (Thumb)HCV-371
Mutants: 419, 423, 482
Site C (Palm) (A-837093)
Mutants: 411, 414, 448
Site Actif(R7128)
Mutants: 282
Site D (Palm)(HCV796)
Mutants: 316
AA
BBCC
DD
EE
Site E (Finger, hypothetical)GS-9190
Mutants: 445,448,452
Lange & Zeuzem., J Hepatol 2011;55(3):692-701.
Caractéristiques des IPHépatite C : virus et marqueurs
Sofosbuvir Approved Nuc
VX-135 Partial clinical hold Nuc
Deleobuvir Phase 2 NNuc
BMS-791325 Phase 2 NNuc
TMC-647055 Phase 2 NNuc
Lomibuvir Phase 2 NNuc
GS-9669 Phase 2 NNuc
ABT-333 Phase 3 NNuc
ABT-072 Phase 2 NNuc
Setrobuvir Phase 2 NNuc
Inhibiteurs de NS5BHépatite C : virus et marqueurs
Pawlotsky et al., Seminars in Liver Disease, in press.
0
1
2
3
4
5
6
7
-15 -10 -5 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70
Days
HCV
RN
A (L
og IU
/mL)
TMA + + + + - - - - - - - - + +
LOQ (20 IU/mL)
MK-0608 at 1mg.kg-1 orally
- 4,6 - 4,1
wt S282R/T/I wt S282
Activité Antivirale du MK-0608Hépatite C : virus et marqueurs
Activité Antivirale du Sofosbuvir
Hépatite C : virus et marqueurs
Population Treatment groups SVR12 rates (n/N)
NEUTRINO1 G1/4/5/6Treatment-naive SOF+RBV+P/R 12 wks 90% (295/327)
FISSION G2/3Treatment-naive
SOF+RBV 12 wkspegIFN+RBV 24 wks
67% (170/253)67% (162/243)
POSITRONG2/3
IFN intolerant, ineligible, unwilling
SOF+RBV 12 wksPlacebo
78% (161/207)0% (0/71)
FUSIONG2/3
Treatment-experienced
SOF+RBV 12 wksSOF+RBV 16 wks
50% (50/100)73% (69/95)
- 28 patients relapsed and no S282T amino acid substitution was found in any relapsers by deep-sequencing1
Lawitz et al., N Engl J Med 2013;368(20):1878-87; Jacobson et al., EASL 2013, Abstract 61; Nelson et al., EASL 2013 Abstract 6.
Cycle ViralHépatite C : virus et marqueurs
Lindenbach and Rice, Nature (2005), 436: 933-938.
"Membranous Web"
Paul et al., J Virol 2013;87(19):10612-27.
Quasi-espèces virales: exemple du VHC
top related