charge virale hcv comparaisons techniques … edouard tuaillon laure ottomani a marie mondain...
Post on 03-Apr-2015
108 Views
Preview:
TRANSCRIPT
Charge virale HCVcomparaisons techniques …
Edouard TuaillonLaure Ottomani A Marie Mondain Laurent RouviereJacques Ducos
Unité HépatitesCHU LAPEYRONIEMontpellier
Pourquoi une étude comparative
Appel d’offre biannuel CHU Montpellier
Recherche d’une technique sensible pour projet de traitement à la carte
AO denrée récente des CHU
Cahier des charges :
1- Test sur site de la qualité des réactifs et des automates
(notion de praticabilité technique et de rapidité)
2- Le meilleur rapport coût / efficacité(le prix patient)
Charge virale HCV
Mesure de la charge virale HCV
• Amplification du signal bDNA– Limite inférieure 615 UI/ml– Excellente linéarité entre 615 UI/ml et 7 106
UI/ml
• Amplification de la cible en temps réel– Amélioration de la sensibilité : 15 UI/ml– Bonne linéarité entre 25 UI/ml et 24 106 UI/ml
Hépatite C ChroniqueDétermination du génotype
Génotype 2 ou 3
Génotype 1,4,5 ou 6
PEG IFN Ribavirine
PBF ou Fibrotest
PEG IFN Ribavirine
24 s
48 s
ARN HCV
ARN HCV
Charge virale
12 s
Conférence de consensus
Faut-il mesurer la charge virale de nos patients traités (ARN HCV ou CV)
Ifn Ribavirine
Ifn Ribavirine
48
24
12S4S
Génotypes 1 et 4
Génotypes 2 et 3
Ifn Ribavirine 48Génotypes 3Avec charge virale élevée
RECHUTEUR (5-18%)
Faut il mesurer la charge virale de nos patients traités?
Non répondeurs
Seuil de détection
S12
Peg Interferon Ribavirine
Faut il mesurer la charge virale de nos patients traités ?
Non répondeurs
Seuil de détection
Peg Interferon Ribavirine
Rechuteurs
Répondeurs
Faut il mesurer la charge virale de nos patients traités ?
Non répondeurs
Seuil de détection
Peg Interferon Ribavirine
Rechuteurs
Répondeurs
Faut il mesurer la charge virale de nos patients traités ?
Seuil de détection
Peg Interferon Ribavirine à la carte
S12NR
Je crains le pire…
Design de l’étude
200 sérums HCV (ARN HCV positif) recrutement habituel de l’Unité (naïfs, traités, rechuteurs, répondeurs ou non)
Contraintes
– quantité de sérum > 3 ml
(certaines repasses ont été diluées)
– absence de « gold standard »
(technique de routine bDNA)
Méthodes
Recrutement n= 165 (200)
Abbott LaboratoriesRealTime HCV Abbott
Bayer DiagnosticsVersant HCV RNA 3.0
Roche DiagnosticsTaqman HCVAmpliprep Cobas
n= 165
Sex ratio (M/F): 1.34 ( 95M/ 71F)Alcool 15.2%ALAT81.3%ARN HCV +
Génotypes 1= 108 ( 65% vs 66*)2= 15 ( 9% vs 10*)3= 22 ( 13% vs 14*)4= 17 ( 11% vs 10*)5= 3 ( 2% vs 1*)
Traités n= 25 ( 15.7%)
* Sur 5173 génotypes
Bayer vs RocheCorrelation Bayer Roche
y = 1,0729x + 0,0194
R2 = 0,9018
0
1
2
3
4
5
6
7
8
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Bayer Log UI/mL
Ro
che
Lo
g U
I/mL
n=151n'=13
Correlation Bayer Roche par génotype
y = 1,0729x + 0,0194
R2 = 0,9018
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8
Bayer Log UI/mL
Ro
che
Lo
g U
I/mL
gen1 gen2 gen3 gen4 gen5
n1=102n2=13n3=19n4=15n5=2
Correlation Bayer Roche Génotype 1 (n=102)
y = 1,049x + 0,2236
R2 = 0,9524
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8
Bayer
Ro
che
Correlation Bayer Roche Génotype 3 (n=19)
y = 1,1625x - 0,4522
R2 = 0,9124
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8
Bayer
Ro
che
Correlation Bayer Roche Génotype 2 (n=13)
y = 1,1294x - 0,175
R2 = 0,9667
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8
Bayer
Ro
che
Correlation Bayer Roche Génotype 4 (n=15)
y = 1,0209x - 0,3591
R2 = 0,8444
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8
Bayer
Ro
che
Bland Altman
y = -0,1333x + 0,3474-1,50
-1,00
-0,50
0,00
0,50
1,00
1,50
2 3 4 5 6 7 8
Moyenne des Log UI/mL
Lo
g B
ayer
- L
og
Ro
che
- 2 Std. Dev.
+ 2 Std. Dev.
n=151
Génotypes4
Bayer vs Abbott
Correlation Bayer Abbott
y = 1,0912x - 0,3222
R2 = 0,9389
0
1
2
3
4
5
6
7
8
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Bayer Log UI/mL
Ab
bo
tt L
og
UI/m
Ln=148n'=12
Correlation Bayer Abbott par génotype
y = 1,0912x - 0,3222
R2 = 0,9389
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Bayer Log UI/mL
Ab
bo
tt L
og
UI/m
L
gen1 gen2 gen3 gen4 gen5
n1=101n2=12n3=18n4=15n5=2
Bland Altman
y = -0,1316x + 0,5268
-1,50
-1,00
-0,50
0,00
0,50
1,00
1,50
2 3 4 5 6 7 8
Moyenne des Log UI/mL
Lo
g B
ayer
- L
og
Ab
bo
tt
- 2 Std. Dev.
+ 2 Std. Dev.
n=148
Génotypes 1
Roche vs AbbottCorrelation Roche Abbott
y = 0,9301x + 0,1569
R2 = 0,917
0
1
2
3
4
5
6
7
8
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Roche Log UI/mL
Ab
bo
tt L
og
UI/m
Ln=159
Correlation Roche Abbott par génotype
y = 0,9301x + 0,1569
R2 = 0,917
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Roche UI/mL
Ab
bo
tt U
I/mL
gen1 gen2 gen3 gen4 gen5
n1=106n2=14n3=21n4=15n5=2
Correlation Roche Abbott Génotype 1 (n=106)
y = 1,0013x - 0,3818
R2 = 0,9389
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Roche
Ab
bo
ttCorrelation Roche Abbott Génotype 2 (n=14)
y = 0,9708x - 0,1335
R2 = 0,9452
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Roche
Ab
bo
tt
Correlation Roche Abbott Génotype 3 (n=21)
y = 0,9118x + 0,471
R2 = 0,958
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Roche
Ab
bo
tt
Correlation Roche Abbott Génotype 4 (n=15)
y = 0,8175x + 1,4034
R2 = 0,7602
2
3
4
5
6
7
8
2 3 4 5 6 7 8Roche
Ab
bo
tt
Bland Altman
y = 0,0209x + 0,0636
-1,50
-1,00
-0,50
0,00
0,50
1,00
1,50
2 3 4 5 6 7 8
Moyenne des Log UI/mL
Lo
g R
och
e -
Lo
g A
bb
ott
- 2 Std. Dev.
+ 2 Std. Dev.
n=159
+ 0.5 logGénotypes 1
Conclusion (1)
Versant HCV RNA 3.0 (Bayer Diagnostics)
Praticabilité +++Excellente linéaritéDéfaut de sensibilité
seuil : 615 UI /ml13 sérums sur 165 (7.8%)valeurs de 115 à 250
UI/ml
Conclusion (2)
RealTime HCV (Abbott) Praticabilité moyenne +-Sensibilité excellente : 20 UI/mlSous évaluation de certains génotypes 1 (8%)Coût trop élevé
Taqman HCV (Roche Diagnostics)Praticabilité bonne ++Sensibilité excellente : 25 UI/mlSous évaluation des génotypes 4
top related