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Post on 03-Apr-2015
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ANNEXES
1. AG implémentation avancée2. Optimisation des hyper-paramètres de contrôle3. Distributions non-uniformes4. brins de cyclophiline B5. tournant de hPIN16. Optimisation du champ de forces
Annexe 1
Implémentation avancée
retour
B. Parent
Implémentation avancée
Évolution Taux de gradient conjugué
Taux de croisements/mutations
Population Taille de population
Nombre d’îles parallèles
Taux de migration
retour
B. Parent
Sélection : basée sur le rang
nombre d’élites
limite d’âge
dissimilarité minimale
Contrôle : apocalypses
arrêt global
nouvelle générationgénération temporaire
Implémentation avancéeretour
Annexe 2
Optimisation des hyper-paramètres de
contrôle
retour
B. Parent
Hyper-paramètres de contrôleretour
Annexe 3
Hybridation : distribution de probabilités non uniformes
retour
B. Parent
Distributions non uniformes
Statistiques sur une variable
retour
B. Parent
Distributions non uniformesretour
B. Parent
Distributions non uniformes
Fragmentation
mn +
Statistiques sur des n-uplets
retour
B. Parent
Distributions non uniformes
0%
20%
40%
60%
80%
100%
4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6
0%
20%
40%
60%
80%
100%
4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6
PIN
0%
20%
40%
60%
80%
100%
4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6
succ
ess
rate
Very High
High
Medium
Weak
Failed
0%
20%
40%
60%
80%
100%
4+4 4+6 5+4 5+6 6+4 6+6
But : retrouver la conformation native parmi les solutions proposées
retour
Annexe 4
Brins terminaux de la cyclophiline B
retour
B. Parent
Brins de cyclophiline B
Placement manuel
Prédiction de l’algorithme :
retour
Annexe 5
Tournant du domaine WW de hPIN1
retour
B. Parent
Tournant de hPIN1
PIN1 sauvage
retour
B. Parent
Tournant de hPIN1
PIN1 mutant 7
retour
Annexe 6
Optimisation du champ de forces
retour
B. Parent
modifier certains paramètres internes…
afin de maximiser l’avantage en énergie libre de la région native
MC AG
TOT
NATIFBTkG ln.
i B
i
Tk
Eexp
retourOptimisation du champ de forces
retour
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