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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 1 Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT) Syllabus LICENCE SCIENCES, TECHNOLOGIES ET SANTE Mention Ecologie, Organismes et Biosphère (EOB) Habilitation septembre 2007 à juin 2011 (MAJ : août 2007)

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Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus

LICENCE SCIENCES, TECHNOLOGIES ET SANTE

Mention Ecologie, Organismes et Biosphère (EOB)

Habilitation septembre 2007 à juin 2011

(MAJ : août 2007)

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SOMMAIRE Parcours Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes (BOPE) Licence 2ème année BOPE…………. …….. Page 05 Licence 3ème année BOPE……………….. …. Page 23 Parcours Biologie Générale et Sciences de la Terre et de l’Univers (BGSTU) Licence 2ème année BGSTU………………… Page 49 Licence 3ème année BGSTU………………… Page 63 Licence Pluridisciplinaire Orientation Professorat des Ecoles ………………………. Page 79

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Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus

L2 Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes

(BOPE)

Habilitation septembre 2007 à juin 2011 (MAJ : août 2007)

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Licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère 2ème année, parcours : BOPE Biologie des Organismes des Populations et des Ecosystèmes

Enseignant Responsable : Christian CAYROL Secrétariat pédagogique : Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 05 61 55 77 92 [email protected] Coordonnées de l'Enseignant Responsable : : Bât 4R3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 : 05 61 55 65 09; : [email protected]

CONDITIONS D'ADMISSION :

Accès de plein droit aux étudiants titulaires d'une première année de Licence Sciences de la vie. Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation.

SCHEMA DES ETUDES

11 Modules obligatoires 3L3BP01M 6 ECTS Anatomie comparée des vertébrés - physiologie des vertébrés 1er semestre

3L3BP02M 6 ECTS Biologie des végétaux - Métabolisme des végétaux 1er semestre

3L3BP03M 6 ECTS Paléontologie-Géologie 1er semestre

3L3BP04M 6 ECTS Traitement des données biologiques - méthodologie expérimentale 1er semestre

3L3BP09M 3 ECTS Biologie cellulaire 1er semestre

3 ECTS Langues 1er semestre

3L4BP05M 6 ECTS Génétique - Microbiologie 2ème semestre

3L4BP06M 6 ECTS Biologie moléculaire - Biologie du Développement 2ème semestre

3L4BP07M 6 ECTS Ecologie - Physiologie végétale 2ème semestre

3L4BP08M 3 ECTS Biochimie des substances naturelles 2ème semestre

3 ECTS Langues 2ème semestre 1 Module d’ouverture

3 ECTS U E d’ouverture 2ème semestre

1 Module optionnel à choisir

3L4OP1M 3 ECTS Introduction au comportement animal 2ème semestre

3L4OP2M 3 ECTS Symbiose et parasitisme chez les végétaux 2ème semestre

3L4OP3M 3 ECTS Hominisation 2ème semestre

3L4OP4M 3 ECTS Cytophysiologie des vertébrés 2ème semestre

3L4OP5M 3 ECTS Une approche des agricultures métropolitaines 2ème semestre Débouchés à l'U.P.S.: poursuite en Licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère 3ème année, en particulier parcours : BOPE Biologie des Organismes des Populations et des Ecosystèmes.

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3L3BP01M ex 3L3BO0M ANATOMIE COMPAREE et PHYSIOLOGIE DES VERTEBRES Secrétariat pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignant(s) responsable(s) : Sithan LEK et Colette DENIS Biologie animale : Sithan LEK, Bât 4R3 05 61 55 64 74 [email protected] Physiologie animale : Colette DENIS, Bât 4TP1 05 61 55 65 37 [email protected] Equipe pédagogique : Biologie animale : Sithan LEK, A. RIBERON, G. LOOT, Sovan LEK et R. BON Physiologie animale : V. BOURLIER, F. CRAMPES, C. DENIS, D. LARROUY Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 3 – 6ECTS Matière Cours TD : TP : Total

Biologie animale 16h 4h 16h 36h Physiologie animale 16h 10h 4h 30h BIOLOGIE ANIMALE ANATOMIE COMPAREE DES VERTEBRES PROGRAMME DES COURS ET TRAVAUX DIRIGES ET TRAVAUX PRATIQUES : A partir des structures présentes chez les premiers Vertébrés, on montrera comment se sont progressivement mis en place les principaux appareils des groupes actuels en insistant sur l’importance des grandes étapes évolutives et notamment la « sortie des eaux » et la transition Reptiles – Mammifères.

- Présentation des principaux groupes de Vertébrés actuels à la lumière des apports des nouvelles méthodes d’investigations et des grandes étapes de l’histoire évolutive de ce groupe

- Anatomie comparée o Les objectifs et les méthodes de l’anatomie comparée des Vertébrés o L’évolution du crâne : le devenir des arcs branchiaux, la formation et le perfectionnement de l’organe acoustique, l’acquisition progressive de la mastication et l’augmentation de la capacité crânienne. o Les membres et les ceintures : de la nageoire au membre des Vertébrés tétrapodes. Adaptations au vol, à la course, à la marche… o Evolution et régionalisation du squelette axial (tronc, queue) o Evolution du système circulatoire o Grandes étapes de l’évolution du système nerveux. o Mise en place et évolution des appareils génitaux et excréteurs o Evolution des téguments et ses annexes Travaux pratiques : observations et dissections de spécimens zoologiques. Utilisation des diaporamas. Les séances de TP sont illustrées par des échantillons. PHYSIOLOGIE ANIMALE - nutrition chez les mammifères et les oiseaux : équilibre nutritionnel et dépense énergétique, digestion et absorption des nutriments, stockage et mobilisation des réserves énergétiques, contrôle de la prise alimentaire. - respiration et milieu de vie (aérien, aquatique).

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit

Matière 1 BA : Matière 2 Phy A:

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Enseignements pratiques Matière1 BA : Matière 2 Phy A:

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3L3BP02M ex 3L3BO2M BIOLOGIE ET METABOLISME DES VEGETAUX Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignants responsables : Biologie des végétaux (BV): Angélique Quilichini & Loïc Ten-Hage Angélique Quilichini : UMR 5174 EDB, Bât 4R3 b2, UPS 118 route de Narbonne

05 61 55 74 86 [email protected] Loïc Ten-Hage : UMR LEH Bât 4R3 b2, UPS 118 route de Narbonne

05 61 55 67 27 [email protected] Métabolisme des végétaux (Phy V) : Catherine Digonnet, UMR CNRS UPS 5546 Pôle de Biotechnologie Végétale, Chemin de Borde Rouge, Auzeville, BP42617 31326 Castanet Tolosan 05 62 19 35 59 [email protected] Equipe pédagogique : Biologie des végétaux (BV): A. Quilichini , L. Ten-Hage , L. Civeyrel , H. Gryta, P. Jargeat, S. Maumont. Métabolisme des végétaux (Phy V) : D. Aldon , G. Becard , V. Cotelle , C. Digonnet , E. Gaulin, L. Hoffmann, T. Lamaze, V. Pacquit, P. Sivadon. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 3 – 6 ECTS Cours TD TP Total Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie Végétale 12 h 4 h 8 h 24 h Programme Biologie des végétaux (BV): L'objectif de l’enseignement consiste à poser les bases de la biologie végétale permettant d’acquérir une vision globale du monde végétal et les connaissances nécessaires aux différentes filières de la L3. Après une introduction phylogénétique et la description des principaux cycles de développement, l'approche développée dans le module est basée sur la description morpho-anatomique des structures végétales. Ainsi seront décrits l’organisation de l’appareil végétatif (structures et fonctions des différents organes et tissus, architectures) ainsi que l’organisation et le fonctionnement de l’appareil reproducteur chez les végétaux (cycle de développement, diversité des structures impliquées dans la reproduction et biologie de la reproduction). A travers l’étude d’exemples précis, l'objectif des TP est de compléter, expliciter et illustrer le cours en suivant au plus près sa progression, l’objectif des TD étant d’étendre les notions de systématique et d’architecture des végétaux abordées en cours. Programme Métabolisme des végétaux (Phy V) : L’objectif de cet enseignement est de présenter les bases de l’autotrophie des végétaux en développant les aspects physiologique et biochimique.

• Nutrition carbonée : pigments de la photosynthèse, phase photochimique, transformation du dioxyde de carbone en glucides, photorespiration et impact des facteurs de l’environnement sur la photosynthèse

• Nutrition azotée minérale et symbiotique. • Circulation de l’eau et Transport des sèves brute et élaborée.

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit

Biologie Végétale Physiologie Végétale :

N1 40% N2 40%

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40% ou RC si (N2*0,8+N4*0,2)>=10/20)

Enseignements pratiques Biologie Végétale Physiologie Végétale :

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Page 10: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 10

3L3BP03M ex 3L4BO8M GEOLOGIE Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC 05 61 55 77 92, bât. 4TP4, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse [email protected] Enseignant Responsable : Bernard ANDREU, [email protected], 05 61 33 26 29 Equipe pédagogique : Bernard ANDREU, Pierre-Olivier ANTOINE [email protected], José DARROZES [email protected], Carine LEZIN [email protected]. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 3 – 6 ECTS Cours (2h) TD (2h) TP (2h) Total

24 14 22 60 Paléontologie évolutive (10h cours, 8h TD et 8h TP)

Cours

Organismes vivants et fossiles ; Taxinomie, classification et systématique phylogénétique ; Histoire de la biosphère ; Quelques grandes crises biologiques ; Rythmes de l‘évolution et modalités de la spéciation.

Travaux Dirigés Lignées évolutives, clades et macroévolution (exercices sur les ammonoidés, les éléphantiformes) ; l’évolution continue, discontinue et/ou ponctuée (exercices appliqués aux ostracodes, aux mollusques, aux mammifères et aux hominidés) ; les grandes crises biologiques au cours des temps géologiques (exercices : caractères généraux des crises ; crise K/T). Travaux Pratiques La vie au Paléozoïque, au Mésozoïque, au Cénozoïque : classification, caractéristiques morphologiques, milieu et mode de vie, distribution stratigraphique de quelques représentants des principaux groupes végétaux et animaux. Géomorphologie (4h cours, 6h TP)

Cours et Travaux Pratiques

Géomorphologie côtière, fluviale, glaciaire, et karstique. Du minéral aux séries sédimentaires (10h cours, 6h TD, 8h TP) Cours Logique du monde minéral : des éléments chimiques à la roche ; Géodynamique interne : introduction au magmatisme et au métamorphisme ; Géodynamique externe : altération, transport, sédimentation ; Enregistrement du temps dans les séries sédimentaires : définition, démarche et méthodes de la stratigraphie, échelle stratigraphique internationale.

Travaux Dirigés Exercices portant sur les thèmes suivants : nature et agencement des minéraux, érosion-transport-sédimentation ; datations.

Travaux Pratiques Caractérisation, macroscopique et microscopique, des roches sédimentaires détritiques, des roches sédimentaires carbonatées, des autres roches. Modalités de contrôle des connaissances Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 60% 60% Enseignements pratiques 40% RS

40%

Oral Total 40% 60% 40% 60%

C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen terminal

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3L3BP04M ex L3BO1M ANALYSE DES DONNEES EN BIOLOGIE & INTRODUCTION A LA METHODE EXPERIMENTALE EN BIOLOGIE Secrétariat pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected]

Enseignants responsables : Matière 1 : Emmanuelle CAM 05 61 55 67 53 [email protected] Matière 2 : Alexandra SEVERAC CAUQUIL 05 62 17 28 35 [email protected]

Distribution horaire :

ENSEIGNEMENT DE SEMESTRE 3 – 6 ECTS TOTAL 60 h COURS TD

TD SPECIFIQUES EN SALLE INFORMATIQUE

(DEDOUBLES : 18 ETUDIANTS) TOTAL

ANALYSE DES DONNEES EN BIOLOGIE 14H 16H 10H 40H

INTRODUCTION A LA METHODE EXPERIMENTALE EN BIOLOGIE

6H 14H 20H

Equipe Pédagogique : - Analyse des données en Biologie : E. CAM, C. JOST, M. GERINO, G. GRENOUILLET - Introduction à la méthode expérimentale : A. SEVERAC CAUQUIL, C. JOST, J.M. DEVAUD, F. RÉMY EL BOUSTANI.

PROGRAMME

Matière 1 : ANALYSE DES DONNEES EN BIOLOGIE (Matière dépendant de la Commission Pédagogique d’Ecologie)

Cours (12h) Nature des données en biologie et écologie, sources d’incertitude (caractéristiques des données de terrain et des données expérimentales), et sources de variation contrôlées (conception des approches expérimentales). Description des données, représentations visuelles. Distributions. Hypothèses biologiques, formulation, rôle du test d’hypothèse en biologie, relation avec les tests statistiques, inférence, et interprétation biologique des résultats.

Travaux Dirigés (14h) et Travaux Dirigés spécifiques dédoublés en salle informatique (10h) Les approches développées en cours seront illustrées par des exercices basés exclusivement sur des exemples issus de la biologie et de l’écologie à traiter « sur table » et avec des logiciels d’analyse de données (groupes dédoublés en salle informatique). Matière 2 : INTRODUCTION A LA METHODE EXPERIMENTALE EN BIOLOGIE (Matière dépendant de la Commission Pédagogique de Neurosciences)

L’objectif de cet enseignement est de décrire comment des nouvelles connaissances biologiques sont acquises. Les démarches de recherche, qu’il s’agisse d’observation ou d’expérimentation, comportent une série d’étapes telles que la définition des hypothèses, les différentes variables, le protocole, les aspects éthiques, le recueil des données, l’élaboration des résultats et l’interprétation. Ces concepts seront décrits et discutés à l'aide d’exemples de questions biologiques concrètes. On abordera en particulier le lien entre les dispositifs expérimentaux et l'analyse des données.

En travaux dirigés il s’agira de mettre en pratique les connaissances acquises en cours en élaborant des mini projets de recherche et des analyses d’articles (lecture, compréhension et présentation de publications scientifiques récentes et provenant de différentes thématiques en biologie : physiologie, biochimie, cognition, écologie, ....).

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit Matière 1 Matière 2

N1 : 40%

40%

Enseignements pratiques Matière 1 Matière 2

N2 :30% N3 :30%

RS RS

Total 60% 40%

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3L3BP09M BIOLOGIE CELLULAIRE Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC, 05 61 55 77 92 UFR SVT, Bât. 4R3b3 118 route de Narbonne, 31062 Toulouse [email protected] Enseignant(s) responsable(s) : MAZARS Raoul , e-mail: [email protected] Equipe pédagogique :

Biologie Cellulaire: R. MAZARS; I. LEGER ; L. ARNAUNE; J. NOAILLAC-DEPEYRE Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 3 – 3 ECTS Cours TD TP Total

Biologie Cellulaire: 14 h 10 h 6 h 30 h BIOLOGIE CELLULAIRE a) Noyau cellulaire et expression génique b) Synthèse et adressage des protéines dans la cellule eucaryote c) Prolifération cellulaire : cycle cellulaire, mitose, méïose, contrôle de la prolifération d) Notions de différenciation cellulaire Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère session 2ème session C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 16% 64% 80% Enseignements pratiques 20% RS 20% Total 20% 16% 64% 20% 80%

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3L4BP05M : Ex 3L4BO5M GENETIQUE ET MICROBIOLOGIE Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignant(s) responsable(s) : ROUSSEAU Philippe [email protected] CASTANIE Marie-Pierre [email protected] Equipe pédagogique : ROUSSEAU Philippe, CASTANIE Marie-Pierre

Enseignement de Semestre 4 – 6 ECTS Cours TD TP Total

Matière 1 Génétique : 14h 12h 4h 30h Matière 2 : Microbiologie 14h 8h 8h 30h Matière 1 : Génétique Rappels des notions de L1. Génétique mendélienne : indépendance et liaison génétique, cartographie ; interaction génique (épistasie). Génétique bactérienne : échanges de gène par transformation, transduction ou conjugaison. Les notions de mutations seront abordées en TP Matière 2 : Microbiologie Cours : Cellule procaryote : organisation, particularités. Archées et microorganismes eucaryotes. Métabolisme particulier des microorganismes. Relation microorganismes /environnement. TD : Analyses de documents TP : Techniques de base en microbiologie Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit Génétique N1

15% N2

35% RS N1

15% 35% ou RC si ((N1*0,7)+ (N2*0,3)) >10/20

Microbiologie N1 15%

N2 35%

RS N1 15%

35% ou RC si ((N1*0,7)+ (N2*0,3)) >10/20

Total 30% 70% 30% 70%

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3L4BP06M Ex3L4BO6M BIOLOGIE MOLECULAIRE ET BIOLOGIE DU DEVELOPPEMENT

Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC, 05 61 55 77 92 UFR SVT, Bât. 4R3b3 118 route de Narbonne, 31062 Toulouse [email protected]

Enseignants responsables : Christian FAUCHER 05 61 55 87 48 [email protected] et Christian CAYROL 05 61 55 65 09 [email protected]

Equipes pédagogiques : Biologie moléculaire :M BRIET, F. DAHHOU, C. FAUCHER Biologie du Développement : C BIERKAMP, C. CAYROL, P. DUFOURC, M. FERNANDEZ, B. GLISE.

Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 4 – 6 ECTS Cours TD TP Total

Biologie Moléculaire 14h 12h 4h 30h

Biologie du Développement 18h 4h 8h 30h

Biologie moléculaire :

Programme CM TD - Les acides nucléiques - Les outils du génie génétique - Technologies de l’ADN recombinant

- Transcription – Traduction

TRAVAUX PRATIQUES Analyse d’un ADN plasmidique : purification, digestion par des enzymes de restriction, réalisation d’une électrophorèse en gel d’agarose. Biologie du développement

Description et analyse du développement embryonnaire précoce de la drosophile, des amphibiens, des oiseaux et des mammifères.

L’accent sera mis sur les adaptations et sur certains mécanismes conservés au cours de l’évolution. • L’œuf : mise en place des réserves nutritives et des molécules informationnelles.

• La fécondation et ses conséquences.

• Les grandes étapes du développement de l’embryon (segmentation, gastrulation, organogenèse) et de ses annexes dans le cas des oiseaux et des mammifères.

• Les grands concepts de la biologie du développement et leurs fondements expérimentaux : *- Notions d’induction (induction du mésoderme, induction neurale, inductions en « cascade » dans l’organogenèse), de champ morphogénétique et d’information de position.

*- Mise en place des polarités antéro-postérieure et dorso-ventrale : Le contrôle génétique et mécanismes moléculaires.

Travaux Pratiques

Outre la projection de films, les cours seront illustrés par l’observation de préparations histologiques et d’embryons in toto (Drosophile - Batraciens – Oiseaux).

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit Biologie Moléculaire

N1 40%

40%(RC) si(N1*0,8)+ (N3*0,2)≥10/20

Biologie Développement

N2 40%

40%(RC) si(N2*0,8)+ (N4*0,2)≥10/20

Enseignements pratiques Biologie Moléculaire

N3 10%

RS 10%

Biologie Développement

N4 10%

RS 10%

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Total 20% 80% 20% 80%

3L4BP07M ex3L4BO5M ECOLOGIE – PHYSIOLOGIE DE LA REPRODUCTION DES PLANTES A FLEURS Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC, 05 61 55 77 92

UFR SVT, Bât. 4R3b3 118 route de Narbonne, 31062 Toulouse [email protected]

Enseignants co-responsables du module Ecologie : Magali GERINO et Sithan LEK UMR ECOLAB, 21 Rue J. Marvig 31055 Toulouse 05 62 26 99 96 [email protected]

Enseignant responsable du module : Physiologie de la Reproduction des Plantes à fleurs : Didier ALDON UMR CNRS-UPS 5546 Pôle de Biotechnologie Végétale BP42617 Auzeville – 31326 Castanet-Tolosan 05 62 19 35 43 [email protected]

Equipe pédagogique : Matière 1 Ecologie : V. Demarez, M. Gérino, S. Lek-Ang, A.M. Tabacchi, M. Tackx, E. Buffan-Dubeau Matière 2 Physiologie : D. Aldon, G. Becard, V. Cotelle, C. Digonnet, E. Gaulin, A. Graziana, L. Hoffmann, C. Jacquet, R. Pont-Lezica, P. Sivadon. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 4 – 6 ECTS

Cours TD TP Enseignement délocalisé (1 journée = 6 h)* Total

Matière 1 : Ecologie 24h 9h 3 h - 1 enseignant pour 8 étudiants (car travail sur le terrain) 36 h

Matière 2 : Physiologie de la Reproduction des Plantes à fleurs

14h

6h

4h 24 h

Ecologie : programme des cours et des TD

Il s'agit dans ce module d'acquérir les bases (définitions et concepts) nécessaires à une approche scientifique de l'écologie.

I - COURS Définition de l'écologie, facteurs biotiques et abiotiques, les niveaux d’organisation de l’espèce à l’écosystème, les cycles biogéochimiques, la pollution et quelques exemples de problèmes écologiques actuels.

II - Travaux dirigés Communautés, Chaînes trophiques, Climatologie et carte de la végétation, Travaux de groupe sur un sujet d’écologie au choix III Enseignement délocalisé Une sortie sur le campus pour illustrer 2 types d’écosystèmes et leurs méthodes d’échantillonnage Physiologie de la Reproduction des Plantes à fleurs :

Le cours a pour but d’aborder quelques aspects fondamentaux du développement reproducteur chez les plantes à fleurs. Les contrôles physiologiques et génétiques de la mise en place des organes floraux, de la double fécondation et de l’embryogenèse seront illustrés en utilisant les apports combinés des approches de biologie cellulaire et l’utilisation des mutants de développement. Ces processus jouent un rôle central dans le cycle de développement des plantes supérieures (Reproduction sexuée et dispersion des espèces) et dans la vie de l’homme par ses applications multiples (fleurs, graines fruits et tous les dérivés agro-industriels).

Les travaux dirigés et pratiques illustreront certains aspects de la reproduction comme : la floraison ; la fécondation et l’embryogenèse ; les contrôles de la formation des graines et du fruit.

Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit Ecologie N1 35 % 50% ou RC si (N1>=10/20)

Physiologie N2 40% 40% ou RC si (N2*0,8+N3*,02)>=10/20 Enseignements pratiques Physiologie

N3 10%

RS 10%

Oral Ecologie

N4 15 %

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Total 25% 75% 10% 90%

3L4BP08M BIOCHIMIE DES SUBSTANCES NATURELLES Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC, 05 61 55 77 92 UFR SVT, Bât. 4R3b3 118 route de Narbonne, 31062 Toulouse [email protected] Enseignant responsable: LECOMPTE Marie-France , e-mail : [email protected] Equipe pédagogique : M.F. LECOMPTE

Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 4 – 6 ECTS Cours TD TP Total

Matière 1 Biochimie des Substances Naturelles:

20 h 10 h 30 h

BIOCHIMIE DES SUBSTANCES NATURELLES

L’accent sera porté sur les substances naturelles d’intérêt en biologie des organismes. a) Relations structure - fonction b) Leur rôle dans les communications et interactions intra ou interspécifiques:

- alimentation - reconnaissance - défense - attaque

c) Exemples de biosynthèses différenciées, adaptatives, selon les espèces (alcaloïdes, terpènes, caroténoïdes, lipides...). Différents métabolites impliqués et leurs transformations. d) Applications thérapeutiques et environnementales. Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère session 2ème session

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Biochimie Sub. Nat. N1 24% N2 76% 24% RC N1 >= 10/20 76% Total 24% 76% 0% ou 24% 76% ou 100%

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3L4OP1M INTRODUCTION AU COMPORTEMENT ANIMAL Enseignants Responsables : Richard BON - Christian JOST Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Bât. 4TP4

05 61 55 77 92 [email protected] Coordonnées des Enseignants Responsables :

UMR Centre de Recherches sur la Cognition Animale, Bât. 4R3-B3, 118 route de Narbonne : 05 61 55 69 13 ou -64 37 [email protected] [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 3 ECTS (optionnel)

Cours TD TP Total

Eco-Ethologie 24h 12 h 36 h Equipe Pédagogique : R. BON, C. JOST, P. ROULLET Objectifs : Cet enseignement repose sur une introduction de concepts et de théories en relation avec l’expression du comportement. L’enseignement distingue les mécanismes des hypothèses évolutives qui sous-tendent le comportement, en montrant la complémentarité des niveaux d’études. Des travaux pratiques permettront d’introduire des aspects méthodologiques liés à l’observation, l’expérience et l’analyse des données. Cours : - Bref historique de l’étude du comportement et les 4 niveaux d’analyse (2h) - Le développement du comportement : rôle des gènes et de l’environnement interne et externe (2h) - L’exploitation des ressources, modèles d’optimalité (4h) - Apprendre dans son habitat (4h) - Se comporter dans un habitat : l’interface neurobiologique (4h) - La communication (4h) - Du solitaire au social (4h) TRAVAUX PRATIQUES - Présentation des méthodes d’échantillonnage et d’enregistrement - Tester des hypothèses et des concepts à partir d’expériences Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 70% 70% TD/TP 30% RS 30% Total 30% 70% 30% 70%

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3L4OP2M SYMBIOSE ET PARASITISME CHEZ LES VEGETAUX Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne

05 61 55 77 92 [email protected] Enseignants responsables : Patricia Jargeat : UMR 5174 EDB, Bât 4R3 b2, UPS 118 route de Narbonne

05 61 55 67 55 [email protected] Nathalie Séjalon-Delmas UMR5546 Auzeville, BP42617, 31326 Castanet Tolosan

05 62 19 35 04 [email protected] Equipe pédagogique : H. Gryta, P. Jargeat, C. Roux, N. Séjalon-Delmas, L. Ten-Hage Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 4 - 3 ECTS (optionnel) Cours TD TP Total

Matière 1 : 15 h 6 h 15 h 36 h Objectifs : L'enseignement propose une initiation et une découverte des associations à bénéfices réciproques et parasites qui peuvent exister entre organismes végétaux Eucaryotes et Procaryotes. L’établissement et le fonctionnement de ces associations aboutissent à la formation de structures nouvelles et originales. L'approche développée dans le module est basée sur la description morpho-anatomique de ces structures. Des notions de signalisation entre les organismes sont aussi abordées. Programme des cours : Les interactions mutualistes sont étudiées au travers de différents modèles d’associations entre organismes eucaryotes tels que champignons-algues (lichens), algues-algues et plantes-champignons (mycorhizes) ainsi qu’entre organismes eucaryotes et procaryotes : champignons-bactéries, plantes-bactéries telles que cyanobactéries, Rhizobium, et Frankia. L’étude des interactions parasites entre organismes eucaryotes est basée sur des modèles d’associations entre plantes et champignons phytopathogènes, entre plantes et plantes parasites (Gui, Striga, Orobanche). Les interactions parasites entre organismes eucaryotes et procaryotes sont abordées avec l’exemple des associations plantes-bactéries phytopathogènes. Travaux dirigés : Les travaux dirigés consistent en des analyses de documents (résultats de travaux scientifiques, photographies,...) où quelques associations modèles sont étudiées en détail. Les associations étudiées en TD sont choisies par rapport à l'impact qu'elles ont dans les activités humaines (gain de croissance des plantes cultivées, parasites de cultures,...). Travaux pratiques : Les travaux pratiques proposent d'illustrer le cours par des observations macroscopiques des structures générées et par des analyses microscopiques, après réalisation de coupes anatomiques de ces structures. Afin d'illustrer la diversité et la fréquence de ces associations en milieu naturel, une séance de TP est aussi consacrée à l'exploitation d'échantillons récoltés par les étudiants lors d’une sortie sur le campus. Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 60 % 60 % Enseignements pratiques 40 % RS

40 %

Total 40 % 60 % 40 % 60 %

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3L4OP3M HOMINISATION Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne

05 61 55 77 92 [email protected]

Enseignant responsable : Eric CRUBEZY et José BRAGA, UPS/CNRS 39 allées Jules Guesde 05 61 14 59 80 [email protected], [email protected]

Equipe pédagogique : E. Crubézy, J. Braga, M. Gibert, A.-M. Grimoud, A. Sevin, N. Telmon Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 4 - 3 ECTS (optionnel) Cours TD TP Total 12 h 12 h 12 h 36 h

Cet enseignement donne les bases de l’hominisation tant en ce qui concerne les « scénarios » actuels que les différentes théories. Sur le plan pratique les étudiants manipuleront des moulages de fossiles humains et une à deux sorties seront organisées pour la visite de grottes ornées et/ou de sites préhistoriques.

Cet enseignement est conseillé pour s’inscrire au Master 2R « Anthropobiologie, délimitation des populations et santé »

Enseignements théoriques et dirigés Paléontologie et hominisation. La systématique des primates Les grandes étapes de la préhistoire Avant le genre Homo Aux origines du genre Homo Aux origines de l’espèce Homo sapiens Homo sapiens et neandertal.

Enseignements pratiques Etude de moulages de fossiles de la lignée humaine, commentaires d’articles sur l’hominisation, visites de grottes ornées et/ou de sites préhistoriques.

Mots clés : anthropologie, évolution, préhistoire, squelette crânien Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 80% 80%

Enseignements pratiques 20% RS Total 20% 80% 80%

Page 20: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

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3L4OP4M CYTOPHYSIOLOGIE DES VERTEBRES

Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac IV TP 4 UPS, 118, route de Narbonne, 31062 TOULOUSE Cedex 09, 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignants responsables : LEGER-SILVESTRE Isabelle et BARICAULT Laurent COORDONNEES DES ENSEIGNANTS RESPONSABLES:

LBME/IBCG DU CNRS 31062 TOULOUSE CEDEX 09 05 61 33 59 50 [email protected] LBCMCP UMR5088, BAT 4R3 B1,118 ROUTE DE NARBONNE 05 61 55 65 74 [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 3 ECTS (optionnel)

Cours TP TOTAL

16h 20h 36H Equipe pédagogique :

L. ARNAUNE, L. BARICAULT, I. LEGER-SILVESTRE, J. NOAILLAC-DEPEYRE Syllabus :

L’analyse des fonctions biologiques est faite sous l’angle de la biologie comparée des vertébrés. Cet enseignement montre l’adaptation des organismes à leurs conditions de vie et donne un aperçu, d’un point de vue cytophysiologique, de la biodiversité.

1) Des cellules aux tissus - Matrice extracellulaire et tissus conjonctifs - Polarité fonctionnelle des cellules épithéliales - Tissus musculaires 2) Relations structures/fonctions en biologie cellulaire - Organisation fonctionnelle des appareils digestif, excréteur et respiratoire

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère session 2ème session C. C. E.P. C.T. C. C. E.P. C.T.

Ecrit N1 40%

RC si N1�10/20 40%

Enseignements pratiques N2 40%

RC si N2≥10/20

Oral 20% 20%

Total 100% 100%

Si l'étudiant le souhaite, la note d’oral est la note d’écrit ramenée à 20%.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 21

3L4OP5M UNE APPROCHE DES AGRICULTURES METROPOLITAINES Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne

05 61 55 77 92 [email protected] Enseignants responsables : Blanche Bousquet, Nadia Cancian (E.N.F.A.)

Blanche Bousquet BP 22687 31126 Castanet Tolosan cedex 05 61 75 34 68 [email protected] N. Cancian 05 61 75 32 33

Equipe pédagogique : Blanche Bousquet, N. Cancian, J-L. Hemptinne, A. Magro, J. Metge, Aude Ridier (E.N.F.A.). intervenants extérieurs : responsables d’exploitation agricole Distribution horaire :

ENSEIGNEMENT DE SEMESTRE 4 - 3 ECTS (OPTIONNEL)

COURS TD TP TOTAL

18H 10H 8H 36H Objectifs :

1. Faire acquérir un vocabulaire de base en productions végétales, animales et en économie rurale 2. Acquérir quelques éléments de compréhension des pratiques agricoles 3. Être sensibilisé aux enjeux économiques et agri-environnementaux 4. Connaître le contexte changeant des politiques agricoles dans lequel l'agriculteur exerce son métier

Être sensibilisé aux applications pratiques de l'écologie dans les processus de production agricole. Contenu du cours :

- définition et explicitation de quelques termes pertinents utilisés en agronomie - logique de la pratique de l’agriculture :

le panorama des types d’agricultures métropolitaines (conventionnelle, paysanne, biologique, intégrée,…)

protection biologique des cultures les systèmes de productions végétales (sol et agriculture, climat et agriculture, déroulement d’un

itinéraire technique) compétition entre plantes et densités de semis les systèmes de productions animales

- conséquences sur le milieu des pratiques agricoles - contexte économique : la P.A.C., les C.A.D.., etc. - visite d’exploitations agricoles ( conventionnelle, biologique)

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 60 % 60 %

Enseignements pratiques 40 % 40% Total

Contrôle terminal : travail personnel sur une étude de cas concret

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 22

Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus L3 Biologie des Organismes,

des Populations et des Ecosystèmes (BOPE)

Habilitation septembre 2007 à juin 2011

(MAJ : août 2007)

Page 23: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 23

Licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère 3ème année, parcours : BOPE Biologie des Organismes des Populations et des Ecosystèmes

Enseignant Responsable : Stéphan MAUMONT Secrétariat pédagogique : I. Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cx 9 05 61 55 77 92 [email protected] Coordonnées de l'Enseignant Responsable : : Bât 4R3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cx 9 : 05 61 55 64 39 : [email protected] CONDITIONS D'ADMISSION : Accès de plein droit aux étudiants titulaires d'une seconde année de Licence EORB ou ou L2 SVS filière préparation concours agronomiques. Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation.

SCHEMA DES ETUDES

6 Modules obligatoires

3L5AB1M 6 ECTS Classification et identification des métazoaires 1er semestre

3L5EB1M 6 ECTS Biologie Evolutive et Génomique 1er semestre

3L5EB2M 6 ECTS Ecologie biologie quantitative 1er semestre

3 ECTS Langues 1er semestre

3L6VB1M 6 ECTS Systématique des plantes 2ème semestre

3 ECTS Langues 2ème semestre 1 Module d’ouverture

3 ECTS U E d’ouverture 2ème semestre L’étudiant doit choisir un de ces 3 axes. L’ensemble des modules de l’axe optionnel doit être pris dans son ensemble AXE 1 BIOLOGIE ANIMALE (l’ensemble des 4 modules doit être pris par l ‘étudiant)

3L5AB2M 6 ECTS Entomologie 1ème semestre

3L6AB3M 6 ECTS Les grandes fonctions animales - anatomie fonctionnelle 2ème semestre

3L6AB4M 6 ECTS Ecologie comportementale 2ème semestre

3L6AB5M 3 ECTS Interactions hôtes-parasites 2ème semestre ou AXE 2 BIOLOGIE VEGETALE (l’ensemble des 4 modules doit être pris)

3L5VB2M 6 ECTS Mycologie 1ème semestre

3L6VB3M 6 ECTS Floristique 2ème semestre

3L6VB4M 6 ECTS Biologie et phylogénie des algues 2ème semestre

3L6VB5M 3 ECTS Biologie de la reproduction des plantes 2ème semestre ou AXE 3 ECOLOGIE DES AGROSYSTEMES (l’ensemble des 4 modules doit être pris)

3L5GB1M 6 ECTS Ecologie appliquée à la conduite des agrosystèmes 1ème semestre

3L6GB2M 6 ECTS Agriculture et environnement 2ème semestre

3L6GB3M 6 ECTS Sols et plantes cultivées 2ème semestre

3L6GB4M 3 ECTS Territoires filière agricole et qualité des produits 2ème semestre 2 Modules optionnels à choisir parmi une liste un au premier semestre l’autre au second

3L5UO1M 3 ECTS Biogéographie évolutive 1ème semestre

3L5UO3M 3 ECTS Outils pour l'aménagement du territoire 1ème semestre

3L5UO4M 3 ECTS Les sociétés d'insectes 1ème semestre

3L6UO2M 3 ECTS Phytopathologie de terrain 2ème semestre

3L6UO5M 3 ECTS Diversité humaine et adaptation 2ème semestre

3L6UO6M 3 ECTS Diversité évolution et écologie des oiseaux 2ème semestre

3L6UO7M 3 ECTS Impact des contraintes biotiques et abiotiques chez les plantes 2ème semestre

Débouchés à l'U.P.S.: poursuite en Master Ecologie à Toulouse ou tout autre Master après discussion avec l'équipe de formation.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 25

3L5EB1M ex 3L5BEGM

BIOLOGIE EVOLUTIVE ET GENOMIQUE

Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC 4TP4 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected]

Enseignant responsable : Christophe THEBAUD bât. 4R3 B2, 118 route de Narbonne [email protected] 05 61 55 82 18

Annie CONTER bât.4R3 B3, 118 route de Narbonne [email protected] 05 61 55 74 54

Equipe pédagogique : Biologie Evolutive : C Andalo, A Riberon, C. Thébaud Génomique : A. Conter, F Pasta, JP Gelugne, C. Gutierrez

Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 1 – 6 ECTS Matière Cours TD TP Total

Biologie Evolutive 18h 10h 2h 30h Génomique 10h 14h 6h 30h

Cours de Biologie évolutive L’objectif du module est de présenter les concepts et les principes de la biologie évolutive. L’aspect historique de l’évolution étant largement couvert par les modules de Biologie Animale et Biologie Végétale de 1ère année et celui de paléontologie en 2ème année, l’accent est mis sur la cohérence de la théorie de l’évolution et porte donc essentiellement sur les mécanismes qui sous-tendent l’histoire et la diversité du vivant. - Principes fondateurs de la théorie de l’évolution - Evolution, sélection et adaptation - Mécanismes du changement évolutif - Concepts d’espèce et spéciation - Sélection de parentèle et évolution de l’altruisme - Microévolution et macroévolution Travaux Dirigés Les TD seront consacrés à des exercices d’application des notions vues en cours

Cours de Génomique Le cours suppose que les concepts de base de la génétique mendélienne sont acquis. -Du génotype au phénotype, les mutations et leurs conséquences, le multiallélisme, les relations alléliques. Notions de

suppression phénotypique et informationnelle. -Les mutations chromosomiques numériques et structurales et leurs conséquences. -Déterminisme sexuel, hérédité liée au sexe. Inactivation de l’X. -Contribution différente des génomes dans l’expression génique : hérédité à effet maternel, génome extranucléaire et hérédité,

empreinte génomique. -Dynamique des génomes : éléments génétiques mobiles, transfert de gènes, transgénèse… Travaux Dirigés : certains aspects théoriques (interactions phénotypiques, cartographie et outils moléculaires….) seront abordées à partir d’exercices d'application.

Travaux Pratiques : les TP en partie communs à la biologie évolutive et à la génomique sont consacrés à l’analyse de documents relatifs à certains grands problèmes de société (biodiversité et sa préservation, amélioration génétique, évolution et santé publique, génomique évolutive, thérapie génique, dynamique des génomes ….).

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit

Biologie Evolutive Génomique

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Enseignements pratiques Biologie Evolutive Génomique

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 26

3L5AB1M EX 3L5BA1M CLASSIFICATION ET IDENTIFICATION DES METAZOAIRES Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac 4TP4 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected]

Enseignant responsable : Sébastien BROSSE, 05 61 55 67 47 [email protected] Equipe pédagogique : S. Brosse, S. Lek, S. Lek-Ang, G. Loot

Enseignement de Semestre 5 – 6 ECTS Cours TD TP Total 30h 30 h 60 h

L’objectif principal de ce module, faisant suite aux enseignements de Biologie animale en L1 et L2 est de fournir aux étudiants :

- Une connaissance approfondie des différents plans d’organisation et de la diversité des métazoaires, - Une approche pratique et concrète de la diversité animale : La classification phylogénétique des

métazoaires est illustrée par la manipulation et l’identification d’échantillons sur la base de caractères morphologiques.

Cours Les cours magistraux constituent une approche détaillée de l’évolution et de la classification des métazoaires.

1- Les diploblastiques : Spongiaires, Cténaires et Radiés. 2- Les triploblastiques protostomiens : Plathelminthes, Mollusques, Annélides, Arthropodes. 3- Les triploblastiques deutérostomiens: Echinodermes, Chordés. 4- Les groupes peu representés et incertae sedis : Chaetognathes, Nématomorphes, Echiuriens, Sipunculiens,

Lophophoriens, Pararthropodes, Pycnogonides. Travaux Pratiques : L’ensemble des TP est basé sur l’observation et l’identification d’animaux. Ces observations ont pour but de donner aux étudiants des moyens pratiques et concrets d’identification et de classification des organismes. Ils permettent également d’illustrer : - Les grands principes de la classification - Les principaux types structuraux du règne animal - Les plans d’organisation des groupes systématiques majeurs - l’utilisation et la construction de clés de détermination Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 50% 50%

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 27

3L5EB2M ECOLOGIE ET BIOLOGIE QUANTITATIVE

Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac IV TP 4 – UPS 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected]

Enseignantes Responsables : Micky TACKX* et Sergine PONSARD**

Coordonnées des Enseignantes Responsables : * ECOLAB 29 rue Jeanne Marvig, 31055 Toulouse 05 62 26 99 90 [email protected] ** EDB, Bât. 4R3 b2 225 UPS 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 09 05 61 55 61 97 [email protected].

Equipe Pédagogique : C. Andalo, E. Cam, E. Ceschia, V. Demarez, M. Gerino, G. Grenouillet, V. Le Dantec, Sovan Lek, S. Ponsard, A.-M. Planty-Tabacchi et M. Tackx.

ENSEIGNEMENT DE SEMESTRE 5 -

Cours TD

TD SPECIFIQUES DEDOUBLES EN SALLE

INFORMATIQUE (18 ETUDIANTS)

TOTAL

ECOLOGIE 26H 3H 29

BIOLOGIE QUANTITATIVE 4H 18H 9H 31

TOTAL 30H 21H 9H 60H

Mot clés : Cycles biogéochimiques, Bioclimatologie, Pédologie, Diversité spécifique, Histoires de vie, Dynamique des populations, ANOVA, ANCOVA, Régression, Matrices, Equations différentielles, Capture-recapture

Objectifs : L’objectif de ce module (faisant suite aux modules d’écologie et d’analyse des données de L2 et préparant les enseignements de M1 Ecologie) est l’acquisition intégrée de connaissances fondamentales en écologie et des outils correspondants en Analyse de données, Statistiques et Modélisation.

COURS Cycles biogéochimiques Energétique, Cycle du carbone, de l’eau, de l’azote, du soufre et du phosphore. Perturbations anthropiques.

BIOCLIMATOLOGIE Dynamique historique du climat, bilans radiatifs, circulation atmosphérique, biomes. Pédologie Présentation et définition des sols, désagrégation et altération, formation des argiles, enrichissement en matière organique et formation de l’humus. Biodiversité Diversité spécifique ; diversité des histoires de vie. Dynamique des populations Populations isolées, métapopulations, introduction à la dynamique des populations en interaction (compétition et prédation : modèles de Lotka Volterra).

TRAVAUX DIRIGES:

Approches pratiques en Ecologie : taille d’échantillonnage et précision de la mesure. Capture – Marquage – Recapture Diversité spécifique : méthodes de mesure et de comparaison Introduction au calcul matriciel ; application à la dynamique des populations structurées Introduction aux modèles simples de dynamique des populations isolées et en interaction Equations différentielles, analyse d’isoclines, notion d’équilibre stable ou instable, cycles limites. ANOVA, ANCOVA, Régression, Introduction aux méthodes de bootstrap.

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 60% 100%

Enseignements pratiques 40%

Total 40% 60% 100%

Page 28: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 28

3L5AB2M ENTOMOLOGIE Secrétariat pédagogique : Isabelle Bressac, 118 route de Narbonne, Bât 4TP4 31062 Toulouse

05 61 55 77 92 [email protected] Enseignants responsables : S. Ponsard* & E. Campan** Contact : * UMR EDB, Bâtiment 4R3 2ème etage 05 61 55 61 97 [email protected] ** UMR Ecolab, Bâtiment 4R3 2ème etage 05 61 55 67 22 [email protected] Equipe Pédagogique : E. Campan, S. Ponsard, JP Suzzoni, L. Legal, A. Dejean, M. Lambin ou M. Giurfa Distribution horaire :

ENSEIGNEMENT DE SEMESTRE 5 – 6 ECTS COURS TD TP TOTAL 28 H 8 H 24 H 60H

Objectif : acquérir une connaissance avancée de la taxonomie des hexapodes et de leurs particularités morphologiques, anatomiques, physiologiques, comportementales, phylogénétiques et écologiques.

Cours

1. Diversité des hexapodes: la part importante qu’elle a dans la biodiversité du monde vivant, les grandes lignes de ce que l’on sait de leur histoire évolutive (p. ex. relations avec les angiospermes, gènes de développement, apparition du vol, …). Leur importance dans la biosphère.

2. Grandes fonctions chez les hexapodes: sans revenir sur les généralités sur les arthropodes (qui seront vues dans le module « Classification et identification des métazoaires »), le cours présentera, en s’appuyant sur des exemples, les particularités des hexapodes en matière de : système nerveux, vision, olfaction, production de phéromones, reproduction, ovogenèse, embryogenèse, développement, tégument, diapause, circulation, respiration, digestion et excrétion.

Travaux Dirigés et Travaux Pratiques

1. Travaux pratiques consacrés chacun à un ou quelques Ordres d’hexapodes avec des observations et des expériences sur des insectes vivants (développement, étude des mutations, nutrition, apprentissage, oviposition…), ou sur des échantillons et préparations (mimétisme, défense, pièces buccales, ailes, types larvaires, …), établissement et utilisation de clés dichotomiques, récolte d’échantillons sur le terrain (sortie), observation d’échantillons et de caractères diagnostiques, reconnaissance d’espèces très communes, classification d’échantillons inconnus.

2. Travaux dirigés consacrés à la taxonomie ; L’acquisition du vocabulaire décrivant la morphologie externe des hexapodes ; Travail personnel : recherche bibliographique sur une espèce commune et exposé oral au cours de la séance consacrée à l’ordre correspondant. Une séance sera consacrée à la découverte des métiers utilisant des compétences en entomologie.

Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 50% 70%

Enseignements pratiques 50% RS 30%

Total 50% 50% 30% 70%

Page 29: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

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3L5VB2M Ex3L5BV2M MYCOLOGIE Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne

05 61 55 77 92 [email protected] Enseignante responsable : Monique Gardes , UMR 5174 EDB, Bât 4R3, UPS, 118 route de Narbonne, Bât. 4R3 [email protected]

Equipe pédagogique : Monique Gardes, Hervé Gryta, Patricia Jargeat, Nathalie Séjalon-Delmas. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 5 – 6 ECTS Cours TP ENSEIGNEMENT DELOCALISE STAGE Total 21 h 21h 18h 1 x 1j et 1 x 2j 60h

Syllabus : L’objectif de ce module est de présenter une vision synthétique de la diversité des champignons

(micro- et macro-mycètes) et des relations que ces organismes entretiennent avec leur environnement biotique et abiotique. Les développements récents et importants dans le domaine de la conservation et de l’utilisation agro-industrielle des champignons seront également abordés.

Enseignement théorique: Les thèmes abordés en cours concernent: 3. la biosystématique des champignons, taxonomie, phylogénie et spéciation 4. l’organisation de l’appareil végétatif: structure et fonctions du thalle, notion d’individu 5. la reproduction : production et la dissémination des spores végétatives et des gamètes, les différents

systèmes de reproduction et de fécondation, la diversité des cycles 6. les modes de vie des champignons 7. l'utilisation pratique des champignons par l'Homme: mycophagie, production industrielle de métabolites et

d'enzymes, lutte biologique, biofertilisants. Enseignements pratiques / sorties et stage de terrain

Les enseignements pratiques illustreront les différents thèmes du cours théorique sous forme de démonstrations et de manipulations en salle, de sorties et d’un stage de terrain (3 jours au total). Les sorties et le stage seront consacrés à la reconnaissance d'espèces (plus particulièrement de macromycètes) et à l’observation des principaux modes de vie des champignons. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 50% 50% Enseignements pratiques 50% RS (50%) Total 50% 50% 50% 50%

Page 30: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

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3L5GB1M ECOLOGIE APPLIQUEE A LA CONDUITE DES AGROSYSTEMES Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 4 TP 4 UPS, 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant Responsable : J-L. HEMPTINNE ENFA, BP 22687, 31326 Castanet-Tolosan Cedex

05 61 75 32 95 [email protected] Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 5 – 6 ECTS COURS TD TP Total

30 h 15 h 15 60 h Equipe Pédagogique : J-L. Hemptinne et A. Magro (E.N.F.A.)

Mots clés : écologie, agrosystèmes, entomologie, lutte biologique, population, communauté

Objectifs/Généralités : L'objectif de ce cours est de montrer, à travers quelques exemples, aux étudiants la manière dont les grands concepts de l'écologie s'appliquent aux agrosystèmes. Cet enseignement comportera des cours magistraux ainsi que des travaux pratiques. Cours/Enseignements théoriques :

5. Entomologie appliquée à la lutte biologique - identification de quelques familles d'insectes d'importance économique pour la régulation des insectes herbivores - le comportement de recherche et de sélection des proies - les relations prédateurs-proies

6. La régulation de l'abondance démographique des insectes ravageurs dans les agrosystèmes

- une approche théorique de l'abondance de la régulation démographique - la régulation top-down et bottom-up : application aux systèmes cultivés - les facteurs suceptibles de modifier l'abondance des insectes : une approche de l'écologie du paysage; la gestion de la diversité biologique.

7. Les communautés dans les agrosystèmes - l'amplification anthropique du cycle de l'azote; conséquences écologiques - les cycles de l'eau et de l'azote dans des écosystèmes représentatifs de divers stades d'évolution des successions écologiques; enseignements pour la gestion des agrosystèmes - l'évolution des systèmes agraires interprétés à la lumière du cycle de l'azote.

8. La plante cultivée dans un contexte écologique. - présentation de l'état actuel des connaissances sur les relations existant entre les

espèces biologique de la rhizophère, les plantes et la dynamique des communautés d'insectes vivant sur ces plantes.

Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 60% 60% Enseignements pratiques 40% RS Total 40% 60% 60%

Page 31: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 31

3L5UO3M OUTILS POUR L’AMENAGEMENT DU TERRITOIRE (SYSTEMES D’INFORMATION GEOGRAPHIQUE) (SIG) Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 118 route de Narbonne Bât. 4TP4 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignant Responsable : Eric CESCHIA UMR CESBIO, 13 Avenue du Colonel Roche

05 61 55 85 77 [email protected] Equipe Pédagogique : E. CESCHIA, V. DEMAREZ, V. LE DANTEC, P. MORDELET Distribution horaire :

Enseignement de semestre 5 - optionnel

Cours TD TD en salle informatique en effectif

dédoublé Total

SIG 10 h 6 h 20 36 h − dont 20h sur machine en effectif dédoublé

Les systèmes d’information géographique (SIG) sont des outils incontournables dans de nombreux domaines dont l’aménagement du territoire. Ce module a pour objectif de familiariser les étudiants avec les concepts et l’utilisation de ces outils ; ils apprendront à exploiter des données spatialisées dans un logiciel de SIG. Programme des Cours

- Bases de la Cartographie, Systèmes de Projections et de Coordonnées Cartographiques, Principes des SIG.

Travaux dirigés

- Cartographie générale et thématique , Utilisation de logiciels de SIG (Mapinfo) pour suivre la dynamique du paysage en lien avec l’écologie et les question d’environnement, l’aménagement du territoire dans une perspective de développement durable. Introduction aux SIG, utilisation de données spatialisées sous forme de tables et de cartes, géoréférencement d’images, digitalisation, élaborations de cartes d’occupation du sol, utilisation de requêtes, mise en page.

Evaluation : CC sur Machine à la fin des TD (60% de la note), CT sous forme d’épreuve écrite ; partie cours (20% de la note), partie TD (20% de la note). Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 60% % 40% RC 60% % 40% ou Total 60% % 20% % % %

Page 32: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 32

3L5UO1M BIOGEOGRAPHIE EVOLUTIVE Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC 4 TP 4 UPS 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected]

Enseignant Responsable : James GAGNEUR UMR LADYBIO, Bât. 4R3 B2 118, route de Narbonne 05 61 55 84 19 [email protected]

Equipe Pédagogique : J. GAGNEUR, N. GIANI, AM TABACCHI

Distribution horaire : Enseignement de semestre 6 - 3 ECTS

Cours TD TP Total Biogéographie 14 h 4 h 12 h 30 h Objectifs: A partir des mécanismes et de phénomènes tels que l’évolution, la spéciation, les extinctions, la colonisation, la dispersion, la dérive des continents, l'orogenèse, il s'agit d'expliquer l'origine et l'histoire des peuplements végétaux et animaux des différentes parties du globe.

Programme des Cours - Les modes de dispersion des espèces ; Les aires de répartition ; les migrations ; les

introductions et les espèces invasives, - Théorie de McArthur & Wilson, le peuplement des îles et le problème de l'insularité - Les grandes régions biogéographiques, leurs peuplements et leurs frontières (lignes de Weber

et de Wallace) - Les cas de l'Australie et de Madagascar. Travaux Dirigés: Recherches de documentation sur des thèmes concernant la biogéographie, la répartition ou l'histoire d'un taxon ou les traits biogéographiques d'une région. Les résultats seront présentés sous forme de commentaires de quelques transparents. Travaux Pratiques: - Exercices de biogéographie - Les méthodes utilisées en biogéographie

- Illustration des migrations : sortie baguage d’oiseaux. Contrôle des connaissances: La note d’exposé compte comme contrôle continu (30%) et l’examen terminal pour 70%. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 0 70% 0 70% Enseignements pratiques 30% RS 30% Total 30% 0 70% 30 0 70%

Page 33: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 33

3L5UO4M LES SOCIETES D’INSECTES Secrétariat pédagogique : Isabelle BRESSAC 4 TP 4 UPS 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignants responsables : A. DEJEAN* & E. CAMPAN** Contact : * UMR EDB, Bâtiment 4R3 3ème etage 05 61 55 67 23 [email protected] ** UMR Ecolab, Bâtiment 4R3 2ème etage 05 61 55 67 22 [email protected] Equipe pédagogique : E. Campan, A. Dejean, Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 – 3 ECTS Cours TD TP Total 18 h 6 h 12 h 36 h

Objectifs : Approfondir certaines connaissances approchées lors du module d’Entomologie. Evaluer quels avantages adaptatifs la vie en société peut procurer pour expliquer le succès de certains Insectes. Connaître les mécanismes de fonctionnement de la société y compris les communications entre individus.

Programme des cours : La sélection de parentèle et la vie sociale. Les pré-requis à la vie sociale (du grégarisme à l’eusocialité). Cycles biologiques et apparition de l’eusocialité chez les Hyménoptères (Fourmis, Abeilles,

Guêpes) et chez les Isoptères (Termites). Le polymorphisme et la distribution des tâches dans les sociétés d’Insectes. La communication chimique, la danse des abeilles. L’impact écologique des sociétés d’Insectes (Termites : recyclage des minéraux ; Abeille :

pollinisation; Fourmis arboricoles : défense biotique des végétaux). Les avantages adaptatifs et les coûts de la vie en groupe. Présentation de plusieurs modèles (y compris celui des Araignées sociales). Introduction aux sociétés de vertébrés.

Travaux Dirigés & Travaux Pratiques :

Illustration des modèles et application des concepts présentés en cours. Rédaction d’un mini mémoire sur un thème proposé reposant sur l’analyse d’articles

scientifiques avec présentation orale des étudiants. Sortie sur le terrain, identification des espèces. Manipulation de colonies de fourmis : mise en évidence de la communication chimique

(appartenance à la même colonie, phénomène de recrutement alimentaire) ; comportement agressif, polyéthisme.

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 60% 60% Enseignements pratiques 20% RS 20% Oral 20% RS 20% Total 40% 60% 40% 60%

Page 34: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

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3L5UO5M DIVERSITE HUMAINE ET ADAPTATIONS

Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 4 TP 4– UPS, 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected]

Enseignant responsable : Eric CRUBEZY & José BRAGA UPS/CNRS 39 allées Jules Guesde 05 61 14 59 80 [email protected] FRE 2960 CNRS, Anthropobiologie et Imagerie Anatomique, 39 Allées Jules Guesde, 31000

Toulouse 05 61 14 59 80 [email protected]

Equipe pédagogique : E. Crubézy, J. Braga, M. Gibert, A.M. Grimoud, A. Sevin, N. Telmon

Distribution horaire : Enseignement de Semestre … - … ECTS

Cours TP TP Total 12 h 12 h 12 36 h

Mots clés : anthropologie, démographie, variabilité génétique, squelette humain, identification

Objectif du cours Cet enseignement décrit et tente d’expliquer la diversité humaine et ses adaptations depuis le Paléolithique moyen/supérieur, les premières sociétés néolithiques jusqu’à l’heure actuelle. Il insiste donc sur la distribution des allèles dans les différentes populations mondiales, sur celle des morphotypes, sur la variabilité physiologique mais aussi sur celle des comportements (alimentaires, sociaux, etc.). Les processus (acclimatation, adaptation, peuplements) ayant conduits à cette variabilité sont envisagés. Sur le plan pratique, la variabilité est envisagée via les variations du squelette humain. Les étudiants manipuleront donc les différentes pièces du squelette humain et apprendront à déterminer l’âge et le sexe sur le squelette mais aussi à reconnaître certains caractères qui relèvent de données génétiques ou d’habitudes de vie. Une à deux sorties seront organisées sur le terrain. Elles porteront sur des sites susceptibles d’illustrer l’adaptation humaine ou l’étude des squelettes.

Cet enseignement est conseillé pour s’inscrire au Master 2R « Anthropobiologie, délimitation des populations et santé »

Enseignements théoriques et dirigés Les populations humaines et leurs évolutions Démographie et écologie humaine Croissance et variabilité humaine Des Chasseurs cueilleurs aux agriculteurs La distribution des gènes dans les populations humaines Adaptation et acclimatation chez l’homme. Exemples :l’origine des populations européennes et méditerranéennes, pygmées, esquimaux, adaptation au milieu haute altitude et au milieu équatorial.

Enseignements pratiques Etude de squelettes, identification médico-légale, détermination de l’âge et du sexe sur le squelettes, modes de vie. commentaires d’articles sur le peuplement. Visites de sites sur l’histoire récente de l’humanité.

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 80% 80% Enseignements pratiques 20% 20% RS

Total 20% 80% 20% 80%

Page 35: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

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3L6VB1M SYSTEMATIQUE DES PLANTES Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignant responsable: Stéphane Maumont Patricia. Jargeat UMR 5174 EDB, Bât 4R3 b2, UPS 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 64 39 [email protected] [email protected] Equipe pédagogique : L. Civeyrel, H. Gryta, P. Jargeat, S. Maumont. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 3 –6 ECTS

Cours TD TP Enseignement délocalisé (1 journée = 6 h)* Total

22 h 8 h 24 h 6h (1 x 1j) 60 h Les cours magistraux rendent compte des connaissances actuelles sur la biodiversité des plantes (embryophytes, archégoniates) par l'étude de l'histoire phylétique et des caractères généraux des taxons les plus représentatifs. Une comparaison y est abordée des anciennes classifications linéennes et des nouveaux concepts taxonomiques, à la lumière des résultats des analyses cladistiques de séquences nucléotidiques. Programme des cours :

1. Les groupes reliques : 1.1 Grade des plantes non vasculaires : Marchantiophytes (hépatiques), Anthocérotophytes et Bryophytes s.s. (mousses) ; 1.1 Grade des cryptogames vasculaires : Lycophytes, Sphénophytes (prêles) et

Ptéridophytes s.s. (fougères) ; 1.2 Grade des plantes à graines nues : Cycadophytes, Ginkgophytes, Pinophytes

(conifères) et Gnétophytes (Clamydospermes). 2. Les Angiospermes :

2.1 Grade des Paléodycotylédones (dicotylédones uni-aperturées) 2.2 Eudicotylédones (dicotylédones tri-aperturées) 2.3 Monocotylédones

Les travaux dirigés traitent de l'apparition de l'évolution et des intérêts adaptatifs de caractères majeurs pour la biologie des espèces, concernant par exemple la vascularisation, la dissémination et la pollinisation.

Les travaux pratiques consistent en manipulations et démonstrations en salle, illustrant les différents thèmes traités dans les cours théoriques.

Les herborisations permettent d'observer in situ différents aspects de la biodiversité végétale ainsi que d'aborder la floristique régionale.

Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit N1 60 % 60% Enseignements pratiques N2 : 40% RS 40%

Total 40 % 60% 40% 60%

Page 36: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 36

3L6UO7M IMPACTS DES CONTRAINTES BIOTIQUES ET ABIOTIQUES CHEZ LES PLANTES Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 4 TP4 UPS 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant responsable : Pr Thierry LAMAZE Cesbio (UMR 5126) 18 Av. E. Belin, BP 2801, Toulouse cedex 4 05 61 55 85 14 [email protected]

Dr Elodie Gaulin, UMR 5546 CNRS-UPS INRA 31320 Castanet Tolosan 05 62 19 35 03 [email protected]

Distribution horaire :

Enseignement de semestre 6 – 3 ECTS Cours TD TP Total Matière 1 : 12 h 6 h 18 h Matière 2: 6 h 4 h 8 h 18 h 18 h 10 h 8 h 36 h Cet enseignement vise à sensibiliser et à former les étudiants aux impacts de l’environnement sur le fonctionnement des plantes dans leur milieu: 1- contraintes abiotiques (matière 1) et contraintes biotiques (matière 2). Matière 1 Cours et Travaux dirigés L’accent sera mis sur la capture et la transformation des ressources du milieu pour la production de la biomasse par les plantes. Les effets des contraintes de l’environnement sur l’acquisition des éléments seront tout particulièrement analysés. La productivité des écosystèmes terrestres sera évaluée à la lumière des conséquences des changements globaux actuels et à venir de l’environnement (teneur en CO2 de l’atmosphère, température, précipitation, etc.). Matière 2 Cours Les cours viseront à donner un aperçu des mécanismes de perception et de réponses des plantes lors de contraintes biotiques. L'accent sera mis plus particulièrement sur les interactions plantes-microorganismes en se focalisant sur: - la perception des signaux de l’environnement et l’intégration de l’information - la mise en place de la défense vis à vis des pathogènes (défenses constitutives, défenses induites) Travaux Dirigés Analyses de problèmes tirés de publications scientifiques récentes ou importantes permettant d’illustrer le cours. L’accent sera mis sur les démarches expérimentales et techniques utilisées afin de permettre l’analyse et l’interprétation des résultats expérimentaux. Travaux Pratiques Ils viseront par différentes méthodes expérimentales à illustrer les concepts présentés dans le cours. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 80% 80% Enseignements pratiques 20% RS 20% Total 80% 80%

Page 37: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 37

3L6GB4M TERRITOIRES, FILIERES AGRICOLES et QUALITE DES PRODUITS Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 4TP 4 UPS 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant Responsable :Jean METGE ENFA BP 22687 31326 Castanet Tolosan Cedex 05 61 75 32 34 [email protected] Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 –3 ECTS Cours TD TP Total 16 h 10 h 10 36h

Equipe Pédagogique : J. METGE , L. SIMONNEAUX, F.DASCON (E.N.F.A.) et intervenants extérieurs Mots clés : agriculture-élevage-filière-qualité-territoire

Objectifs/Généralités : Etudier l’activité agricole dans son territoire Réaliser un diagnostic d’une filière agricole de qualité Pré-requis : différents systèmes de production : description et analyse critique notions d’agronomie et de zootechnie Cours :

1) Territoires - Les notions de territoire et de terroir

- Agriculture et terroir : les enjeux, les différents aspects (techniques, économiques, sociaux)

2) Les filières agricoles - Concept - Méthodologie d’études

3) La qualité des produits agricoles - Le concept qualité - Les composantes de la qualité - Les signes de qualité : AOC, AOP, IGP, AB, labels, produits fermiers, …

TD Etude de cas réalisée sur le terrain : Analyse d’une filière agricole de qualité et de sa contribution au développement territorial Méthode d’évaluation

Contrôle continu : rédaction d’un rapport Contrôle terminal : épreuve écrite. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 50% 50% 50 RS 50% Total 50% 50% 50 RS 50%

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3L6GB2M AGRICULTURE ET ENVIRONNEMENT Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC IV TP 4 UPS 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant Responsable : Blanche BOUSQUET, Nadia CANCIAN (E.N.F.A.)

BP 22687 31326 Castanet-Tolosan cedex B. Bousquet 05 61 75 34 68 [email protected] N. Cancian 05 61 75 32 33 [email protected] Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 – 6 ECTS COURS TD TP Total

30 h 18 h 12 60 h

Équipe Pédagogique : B. BOUSQUET, N. CANCIAN, J. METGE (E.N.F.A.) et intervenants extérieurs Mots clés : agronomie ; milieux sensibles ; pollution ; dégradation ; remédiation ; diagnostic agri-environnemental Objectifs/Généralités :

- Sensibiliser aux relations agriculture et qualité des milieux - Proposer des solutions pour préserver la qualité de ces milieux - Initier à la réalisation d’un diagnostic agri-environnemental d’exploitations agricoles

Cours/Enseignements théoriques : - Les différents milieux (sol, air et eau) et leur sensibilité à la dégradation * caractéristiques de chaque milieu * les mécanismes de dégradation * les conséquences de ces dégradations - Part et impacts des pratiques agricoles dans la dégradation de ces milieux * gestion de la fertilisation * gestion des effluents d’élevage * gestion de l’eau dans le système de culture * la protection des cultures * inter-cultures * le travail du sol - Les remèdes * aspects réglementaires * modifications des pratiques *aménagements et autres solutions - Méthodologie de réalisation d’un diagnostic agri-environnemental d’exploitation agricole Étude d’un cas concret

Contrôle continu : réalisation d’un diagnostic agri-environnemental d’exploitation Contrôle terminal : épreuves écrites. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Écrit 60% 60 % Enseignements pratiques 40% 40%RS Total 40 % 60 % 40%RS 60 %

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3L6GB3M SOL et PLANTES CULTIVEES Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac 4TP 4 – UPS, 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax : 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant Responsable : André GOUREAU Ecole Nationale de Formation Agronomique BP 22687 31326 CASTANET TOLOSAN CEDEX

O5 61 75 32 30 [email protected]

Enseignement de Semestre 6 – 6 ECTS COURS TD TP Total

30 h 18 h 12 60 h Equipe Pédagogique : Christiane BORIN, Christine DUCAMP, André GOUREAU, (E.N.F.A.) intervenants extérieurs

Mots clés : biologie du sol, nutrition minérale des plantes, biodynamique des sols

Objectifs/Généralités : Connaissance de la structure et du fonctionnement de l’écosystème sol

- Sensibiliser aux relations entre pratiques agricoles et fonctionnement de cet écosystème - Conséquences sur la physiologie des plantes cultivées

Cours/Enseignements théoriques : - Les acteurs de l’écosystème sol * Bactéries, champignons, animaux unicellulaires * Nématodes * Micro- et macro-arthropodes * Annelides, mollusques - Caractéristiques physico-chimiques et mécaniques de l’écosystème sol - Biodynamique des sols * Enzymes du sol * Apport et transformation des matières organiques dans le sol * L’humus - Impact des pratiques agricoles sur l’écosystème sol * Dégradations * Agradations - Evaluation de l’activité biologique des sols (travaux pratiques) * Les techniques * Comparaison de l’activité biologique entre sols agricoles - Nutrition minérale des plantes cultivées * Systèmes racinaires * Rhizosphère et symbioses * Mobilisation et absorption des éléments minéraux - Réaction des plantes aux stress (hydrique, thermique et salin) et aux composés toxiques - La phytoremédiation Modalités des contrôle des connaissances : Contrôle continu : étude pratique de l’activité biologique des sols dossier bibliographique Contrôle terminal : épreuve écrite (étude de cas).

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 20 % 60 % RS 20 % 60 % Enseignements pratiques 20 % RS 20 %

Total 40 % 60 % RS 40 % 60 %

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3L5AB3M EX 3L6BA2M LES GRANDES FONCTIONS ANIMALES : ANATOMIE FONCTIONNELLE Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse

05 61 55 77 92 [email protected]

Enseignant(s) responsable(s): Narcisse. GIANI UMR LEH, Bât. 4R3 B2 porte 110 118, route de Narbonne 31062 Toulouse [email protected] Equipe pédagogique : J. BRAGA, N. GIANI, S. MASTRORILLO, F. SANTOUL Matière 1 : Les grandes fonctions animales : anatomie fonctionnelle. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 – 6 ECTS Cours TD TP Total 28 h 8 h 24 h 60h

Cette unité d’enseignement nécessite une bonne connaissance du monde Animal acquise au cours des Unités d’enseignement de Biologie Animale de 1ère année de licence pour les plans structuraux, de 2ème année de licence pour l’anatomie comparée des vertébrés et du 1er semestre de la 3ème année pour la bio systématique animale.

Objectifs: Mise en évidence de l’évolution progressive des organismes animaux au travers de leurs adaptations aux contraintes physiques (locomotion, et respiration) et/ou biologiques (nutrition) de l'environnement.

Programme des Cours 1 - La locomotion - La locomotion dans les milieux fluides. Les principaux types de nage et de vol et l'adaptation des structures. - La locomotion en milieu terrestre : progression quadrupède, saut... Une place particulière sera accordée à la bipédie et à ses conséquences dans la lignée humaine. 2 - La respiration - Les bases physiques des échanges gazeux. - Les grands types d'appareils respiratoires 3 - La nutrition - Les principales modalités nutritionnelles dans le règne animal. - Structure et évolution de l'appareil digestif. - Adaptation de divers systèmes enzymatiques. Travaux Dirigés Recherche multimédias bibliographique et documentaire sur un thème proposé qui fera l'objet d'une présentation écrite et orale. Travaux Pratiques - Exploitation pédagogique de documents audiovisuels - Etude, par dissection, des mécanismes locomoteurs, respiratoires et digestifs de groupes zoologiques représentatifs. - Analyse fonctionnelle des structures locomotrices des Vertébrés et des Arthropodes.

Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit N4 50% 50%

Enseignements pratiques N1 10%

N3 30%

RC : N1 ≥ 10/20

30% si N1 ≥ 10/20 ou 40% si N1<10/20

Oral N2 10% RS N2

Total 20% 0% 80% 10 ou 20% 0% 80 ou 90%

C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen terminal Exprimer les chiffres en % RS :report systématique RC : report conditionnel (préciser les conditions)

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3L5VB3M ex3L6BV3M FLORISTIQUE

Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac IV TP 4 – UPS, 118, route de Narbonne, 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignant Responsable : Laure CIVEYREL Coordonnées de l’ Enseignant Responsable: 118, route de Narbonne, Bât. 4R3 B2 porte 203

05 61 55 67 50 [email protected] Equipe Pédagogique : L. CIVEYREL, P. JARGEAT et AM. TABACCHI

Enseignement de semestre 6 - 7.5 ECTS (à choix restreint)

Cours TD TP Enseignement délocalisé (1 j = 6 h)* Total

12 h 15 h 24 h 9 h (3X 1/2j) 60 h Objectif :

L’objectif de ce module est de donner une formation de base en botanique de terrain à de futurs écologistes ou botanistes. Cet enseignement doit permettre à l‘étudiant de se familiariser avec les techniques classiques de botaniques de terrain : utilisation de flores, collecte d’échantillons, constitution d’un herbier et reconnaissance des principales familles de plantes ainsi que des principaux taxa de la flore locale. Programme des Cours Principes de la taxonomie et de la nomenclature botanique. Caractéristiques des principales familles de plantes. Importance des collections d’échantillons en herbier et leur rôle en systématique. Protection des espèces végétales par les conventions internationales etc… Programme des TP et sorties - Les travaux pratiques en salles permettront d’aborder la détermination des plantes à l’aide de

diverses flores et de se familiariser avec les principales familles de la flore française. - Les sorties sur le terrain permettront d’explorer différents milieux autour de la région toulousaine flore méditerranéenne flore de bord de mer et de montagne et de collecter le matériel pour la réalisation d’un herbier.

L’examen s’articule en trois parties - Détermination de plantes à l’aide de flores en temps limité (TP) - Constitution d’un herbier (TP) - Rédaction d’une clé de détermination (cours) Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 50% 30% 80% Enseignements pratiques 20% 20% RS

Total 20% 50% 30% 20% 80%

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3L5VB4M Ex 3L6BV3M BIOLOGIE ET PHYLOGÉNIE DES « ALGUES »

(= Diversité des organismes photosynthétiques – except. Embryophytes) Secrétariat pédagogique: Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected]

Enseignant responsable : Ten-Hage Loïc, LEH/CNRS, 118 route de Narbonne, Toulouse

[email protected] Equipe pédagogique : S. Maumont, C. Roux, L. Ten-Hage Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 – 6 ECTS

Cours TD TP Enseignement délocalisé (1 journée = 6 h)* Total

24 h 18 h 18 h (3 x 1 j) 60 h Cet enseignement a deux objectifs :

-Présenter les caractères utilisés dans la reconnaissance des algues marines, d'eau douce et terrestre. Au delà de l'intérêt taxonomique, cette partie permettra de présenter les hypothèses actuelles sur l'évolution des organismes photosynthétiques. -Définir les adaptations morphologiques et physiologiques qui conditionnent la répartition écologique des algues benthiques et phytoplanctoniques. Un intérêt tout particulier sera porté aux observations sur le terrain pour illustrer les deux points précédents. Plan du cours :

Biologie et Phylogénie des « Algues » Systématique et classification des « Algues » (Cyanophyta, Glaucophyta, Rhodophyta, « Algues Vertes » au sein de la Lignée Verte, Cryptophyta, Euglenophyceae, Chlorarachniophyceae, Haptophyta, Dinophyta, Ochrophyta) Adaptations morphologiques et physiologiques conditionnant la répartition écologique des « Algues » Valorisation des « Algues » Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 65 % 65% Enseignements pratiques 15 % RS Oral 20 % RS Total 15 % 20 % 65 % 15 % 20 % 65 %

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3L6AB4M 3L6EEPM ECOLOGIE COMPORTEMENTALE Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC 118 route de Narbonne Bât. 4TP4 31062 Toulouse 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignants Responsables : Christian JOST-Richard BON

UMR Centre de Recherches sur la Cognition Animale, Bât. 4R3-B3, 118 route de Narbonne 05 61 55 64 37 ou -69 13 [email protected] - [email protected]

Equipe Pédagogique : R. BON, V. FOURCASSIE, C. JOST, P. ROULLET Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS (à choix restreint)

Cours TD TP Total

Ecologie comportementale 31 h 8 h 21 h 60 h Objectifs : introduire dans une perspective historique les diverses approches couvertes par l’étude du comportement animal, principalement au niveau individuel. Cet enseignement repose sur une introduction des concepts et des théories de l’écologie comportementale. Des travaux dirigés permettront d’introduire des aspects méthodologiques et d’approfondir certains concepts essentiels. Les travaux pratiques donneront l’occasion de réaliser des expériences et de se familiariser à l’analyse quantitative des données en comportement. Thèmes abordés : - Les 4 niveaux d’analyse dans l’étude du comportement - Le développement du comportement - Les concepts d’optimalité et valeur marginale, stratégies stables, théorie des jeux, interférences sociales - Ecologie cognitive - Introduction à la migration et navigation animale - Egoïsme ou mutualisme : les cris d’alarme - Comportements reproducteurs et systèmes reproducteurs. Travaux Dirigés et Pratiques : Les méthodes propres à l’analyse du comportement seront abordées en TD. Les TPs permettront de se confronter à des expériences en laboratoire sur des modèles animaux divers se rapportant à des thèmes introduits en cours. Nous apprendrons à tester des hypothèses comportementales et à analyser les données expérimentales recueillies. Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C.C. E.P. E.T. Ecrit 60% 60% TD/TP 40% RS 40% Total 40% 60% 40% 60%

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 44

3L6AB5M LES INTERACTIONS HÔTES-PARASITES Semestre : 4 ECTS : 3 Secrétariat Pédagogique : Isabelle Bressac, Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 05-61-55-77-92 [email protected] Enseignant Responsable : Géraldine LOOT UMR CNRS/UPS, EDB, 118 route de Narbonne Bât. 4R3-b1 05 61 55 85 81 [email protected] Equipe Pédagogique : Géraldine Loot, Gaël Grenouillet, Sébastien Brosse, Sovan Lek

Cours TD TP 20 h 12 h 4 h

COURS : L’objectif de ce module est d’apporter aux étudiants une connaissance générale sur les associations hôte-parasite.

- Acquisition du mode de vie parasitaire (définition association du vivant, caractères prédisposants, notion de filtre, notion d’équilibre dynamique)

- Diversité des cycles parasitaires (cycles complexes, séquences d’hôtes, hôtes paraténiques, stratégie de transmission)

- Pouvoir pathogène des parasites (sensibilité de l’hôte, l’immunité et ses compromis, virulence optimale du parasite, adaptation vs inadaptation, impact sur les populations hôtes)

- Co-évolution hôte-parasite (notion de spécificité hôte-parasite, « course aux armements », théorie de la Reine Rouge)

- Les parasites et l’écosystème (contrôle naturel des populations, régulation des compétitions, parasite « ingénieur de l’écosystème », parasite « espèce-clef »)

TRAVAUX DIRIGES : Les travaux dirigés illustreront le cours théorique sous forme d’une recherche bibliographique suivi d’une synthèse et discussion. Les thèmes abordés concernent :

- la favorisation de la rencontre hôte-parasite dans les cycles complexes - la spécificité hôte-parasite, expl : la ligule intestinale des poissons - notion d’épidémiologie, expl : le virus de la grippe aviaire H5N1 - le parasitisme dans les réseaux trophiques, expl : les trématodes de mollusques

gastéropodes marins - les parasites et l’homme, expl : le paludisme et le réchauffement climatique - les parasites insolites, expl : les éléments transposables et les génomes parasites

TRAVAUX PRATIQUES : Les travaux pratiques seront consacrés à l’étude du parasite dans son hôte. L’effort sera mis sur l’acquisition par les étudiants des méthodes de dissection de l’hôte, d’extraction et d’identification des parasites. Le modèle hôte utilisé sera les poissons d’eau douce. Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 80 % 100 %

Enseignements pratiques 20 % Total 20 % 80 % 100 %

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 45

3L6VB5M BIOLOGIE DE LA REPRODUCTION DES PLANTES Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC IV TP 4 – UPS, 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignantes Responsables : Nathalie Escaravage et Monique Burrus Equipe pédagogique : Monique Burrus, Erick Campan, Laure Civeyrel, Nathalie Escaravage, André Pornon, Angélique Quilichini. Distribution horaire :

Enseignement de Semestre …. - … ECTS

Cours TD TP Enseignement délocalisé STAGE Total

16 h 10 4 h 6h (1 x 1 j) 36 h Programme des Cours - Déterminisme génétique et environnemental de l’appareil reproducteur : Formation des fleurs, ovule et pollen ; répartition des sexes ; contrôle génétique et environnemental ; compatibilité/incompatibilité chez les plantes ; sénescence de la fleur. - Syndromes de pollinisation : Traits impliqués dans la pollinisation, comportement des pollinisateurs - perception des odeurs, nectars, couleurs des fleurs - ; Traits reproductifs des plantes ; Généralisation vs. spécialisation. - Reproduction sexuée vs. asexuée : Modalités, fréquences dans les milieux naturels. - Reproduction, populations et communautés : flux de pollen, de graines, conséquences sur le fonctionnement des populations et les processus évolutifs. Enseignements pratiques : - Etude pratique du système de reproduction : autocompatibilité vs. autoincompatibilité, autogamie vs. allogamie, efficacité de la pollinisation, flux de pollen… - Syndromes de pollinisation : observations morphologies florales et des pollinisateurs - Interaction des systèmes de reproduction dans les communautés végétales - Mise en place d’une expérience de pollinisation à réaliser lors du stage de terrain - Reproduction et conservation d’espèces : étude de cas Stage : 6h : - Caractérisation du mode de reproduction asexuée/sexuée chez les plantes

Modalité de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème

C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 50% 50% Enseignements pratiques 50% RS % Total 50% 50% 50% 50%

Page 46: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 46

3L6UO2M PHYTOPATHOLOGIE DE TERRAIN Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC IV TP 4 – UPS, 118, route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex09 05 61 55 77 92 Fax 05 61 55 81 75 [email protected] Enseignante Responsable : Nathalie SEJALON- DELMAS

N. Séjalon-Delmas UMR 546 BP 42617 31326 Castanet-Tolosan 05 62 19 35 04 [email protected] Equipe Pédagogique : Christophe Roux, Nathalie Séjalon-Delmas Distribution horaire :

Enseignement de Semestre …. - … ECTS

Cours Enseignement délocalisé STAGE TP Total

12 h 12 h (1 x 2 j) 12 h 36 h Objectifs : A partir d'observations sur le terrain, cet enseignement illustrera la diversité des parasites fongiques des végétaux. Programme des Cours : Symptomatologie et caractères d'identification des parasites Etiologie et épidémiologie des maladies fongiques des végétaux Enseignements pratiques : Sorties sur le terrain (herborisation, visite de champs d'essais) Observation des symptômes et identification des agents pathogènes par des caractères structuraux. Modalités de contrôle des connaissances : Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T. Ecrit 30% 30% Enseignements pratiques 70% RS 70% Total 70% 30% RS 70% 30%

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 47

3L6UO6M DIVERSITE, EVOLUTION et ECOLOGIE DES OISEAUX Secrétariat Pédagogique : Isabelle BRESSAC Bât 4TP4, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 05 61 55 77 92 [email protected] Enseignant responsable : Christophe THÉBAUD

UMR 5174 EDB CNRS-UPS, Bât 4R3, UPS, 118 route de Narbonne, Bât. 4R3 [email protected] Distribution horaire :

Enseignement de Semestre 6 - 3 ECTS

COURS TD TP Enseignement délocalisé (stage de terrain) 14h 4h 6h 12 h (1 x 2 j)

Equipe pédagogique : C. Thébaud et E. Cam Des intervenants professionnels et des chercheurs sont associés à l’enseignement Objectif du cours : Ce module aborde dans une approche intégrée la biologie et l’écologie des oiseaux. Il a pour but d’exposer les faits et les théories concernant l’évolution et la classification des oiseaux, l’origine et l’évolution du vol, l’évolution des signaux de communication (visuels et vocaux), la migration dans une perspective écologique et évolutive, les stratégies biodémographiques, la diversité des communautés aviennes, la conservation des oiseaux menacés, et le rôle des oiseaux dans l’épidémiologie des maladies émergentes. Les TD comprennent l’analyse de publications en langue anglaise et leur présentation orale. Ces articles apporteront des éléments complémentaires au cours. Les TP seront consacrés à la reconnaissance des oiseaux du Sud de la France et à la mise en place de projets personnels. Une approche concrète des oiseaux sera menée sur le terrain (stage de 2j) afin d’illustrer les connaissances acquises dans le cours et de se familiariser avec des techniques d’échantillonnages et d’analyse simples. Modalités de contrôle des connaissances :

Session 1ère 2ème C. C. E.P. E.T. C. C. E.P. E.T.

Ecrit 65% 100% Enseignements pratiques 35% Total 35% 65% 100%

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 48

Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus L2 Biologie Générale et Sciences de la

Terre et de l’Univers (BGSTU)

Habilitation septembre 2007 à juin 2011 (MAJ : août 2007)

Page 49: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 49

Licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère 2ème année, Parcours : BG&STU Biologie générale & Sciences de la Terre & de l'Univers

Enseignant Responsable : Christian CAYROL Secrétariat pédagogique : Bât 4R3b3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 05 61 55 60 56 [email protected] Coordonnées de l'Enseignant Responsable : : Bât 4R3b3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 : 05 61 55 65 09; : [email protected]

CONDITIONS D'ADMISSION :

Accès de plein droit aux étudiants titulaires d'une première année de Licence Sciences de la vie. Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation.

SCHEMA DES ETUDES

12 Modules obligatoires

3L3VT1M 6 ECTS Minéralogie - Pétrologie 1er semestre

3L3VT2M 6 ECTS Biochimie I et Biologie moléculaire 1er semestre

3L3VT3M 6 ECTS Biologie et Physiologie animales 1er semestre

3L3VT4M 6 ECTS Biologie et Physiologie végétales 1er semestre

3L3VT5M 3 ECTS Système éducatif et développement de l’individu 1er semestre

3L3VTLM 3 ECTS Langue vivante 1er semestre

3L4VT1M 6 ECTS Géologie sédimentaire 2ème semestre

3L4VT2M 6 ECTS Génétique – Microbiologie 2ème semestre

3L4VT3M 6 ECTS Biologie cellulaire – Immunologie 2ème semestre

3L4VT4M 6 ECTS Développement animal et végétal 2ème semestre

3L4VT5M 3 ECTS Structuration des écosystèmes 2ème semestre

3L4VTLM 3 ECTS Langue vivante 2ème semestre Débouchés à l'U.P.S.: poursuite en Licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère 3ème année, en particulier parcours :BG&STU Biologie générale & Sciences de la Terre & de l'Univers

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3L3VT1M - MINERALOGIE ET PETROLOGIE

Enseignant responsable : Jean-Jacques DELVOLVE LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE : 05 61 33 25 91 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 3 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Minéralogie et Pétrologie 24 h 12 h 24h - 60 h

Equipe pédagogique : J-J. Delvolvé, D. Guillaume, A-M. Seydoux

Programme du cours et des TD

Eléments d’optique cristalline. Les minéraux et la lumière. Le microscope polarisant.

Logique du monde minéral : des éléments chimiques à la roche. Les cristaux et la croissance cristalline. Diversité des substances minérales (modalités d’assemblages, substitutions). Agencement des minéraux en roches.

Processus de géodynamique interne. Magmatisme et métamorphisme. Notions de thermodynamique. Etude des principaux systèmes binaires et ternaires. Caractéristiques générales du manteau et de la croûte. Les magmas (composition chimique, propriétés physiques, différenciation magmatique). Les roches magmatiques. Le métamorphisme. Facteurs fondamentaux. Modifications structurales et minéralogiques. Notions de minéral index, isograde, faciès métamorphique, gradient métamorphique. L’anatexie.

Magmatisme et métamorphisme dans le contexte de la tectonique des plaques. Magmatisme des zones en extension, des zones intraplaques, des zones en compression. Métamorphisme de gradient franciscain (HP-BT), dalradien (MP-MT), Abukuma (BP-HT). Métamorphisme thermique. Métamorphisme océanique. Métamorphisme d’impact.

Programme des TP Etude macroscopique et microscopique :

- des principaux minéraux - des principales roches magmatiques et métamorphiques dans le contexte de la tectonique

des plaques.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 52

3L3VT2M – BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE

Enseignantes Responsables : Nathalie EYNARD* et Françoise DAHHOU**

* IPBS, 205 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 17 55 75 : [email protected]

** LMGM - IBCG, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04

: 05 61 33 25 77 : [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 3 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Biochimie 14h 12h 4h - 30h

Biologie moléculaire 18h 12h - - 30h

Equipes pédagogiques :

Biochimie : N. EYNARD, J.-N. GENTHON et I. MULLER Biologie moléculaire : F. DAHHOU, C. FAUCHER

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Programme CM TD - Les acides nucléiques - Les outils du génie génétique - Technologies de l’ADN recombinant - Transcription – Traduction TRAVAUX PRATIQUES Analyse d’un ADN plasmidique : purification, digestion par des enzymes de restriction, réalisation d’une électrophorèse en gel d’agarose.

BIOCHIMIE Enseignement intégré des notions de physicochimie nécessaires à la compréhension du métabolisme, de l’enzymologie et de l’énergétique cellulaires.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 53

3L3VT3M – BIOLOGIE ET PHYSIOLOGIE ANIMALE : Anatomie comparée et Physiologie des Vertébrés

Enseignants Responsables : Colette DENIS* et Narcisse GIANI** * BAT. 4TP1, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 32 30 90 : [email protected]

** UMR LEH, BAT. 4R3 B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 61 37 : [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 3 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Physiologie animale 14h 12h 4h - 30h

Biologie animale 17h 4h 15h - 36h

Equipes pédagogiques : Physiologie animale : C. DENIS, V. BOURLIER, F. CRAMPES, D. LARROUY Biologie animale : N. GIANI, E. CAMPAN, G. LOOT, F. SANTOUL Physiologie des Vertébrés : - physiologie des muscles lisses et des muscles striés - nutrition : équilibre alimentaire, dépense énergétique, digestion, absorption des nutriments,

stockage et mobilisation des réserves, chez les mammifères. - respiration et milieu de vie (aérien, aquatique) Anatomie comparée et évolution des Vertébrés (Crâniates)

Objectifs : Cet enseignement est consacré à l’étude de l’évolution des Vertébrés telle qu’elle peut être mise en évidence par l’anatomie comparée des principaux appareils dont la formation et le fonctionnement seront étudiés dans d'autres unités d’enseignement. A partir des structures présentes chez les premiers Vertébrés on montrera comment se sont mis en place progressivement les principaux appareils des Vertébrés actuels en insistant sur les grandes étapes évolutives. Programme des Cours Présentation de l’anatomie comparée, ses objectifs et ses méthodes. 1. Structure et évolution du squelette - L'évolution du crâne : devenir des arcs branchiaux, formation et perfectionnement de l'organe acoustique, acquisition progressive de la mastication et augmentation de la capacité crânienne. - Evolution et régionalisation du squelette axial. - Les membres et les ceintures : de la nageoire au membre des Tétrapodes. Les adaptations du membre. 2. Evolution du système circulatoire. 3. Mise en place et évolution du système nerveux central. 4. Mise en place et évolution des appareils génitaux et excréteurs. Evolution de la relation entre ces deux appareils. 5. Tégument et phanères. Travaux Dirigés Présentation des principaux groupes de Vertébrés actuels à la lumière des apports des nouvelles méthodes d'investigation et des grandes étapes de l'histoire évolutive de ce groupe. Travaux Pratiques

Etude par dissection de la structure des Vertébrés (exemple d’un Mammifère). Illustrations, à l’aide d’échantillons ou de moulages, des notions vues en cours.

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3L3VT4M – BIOLOGIE ET PYSIOLOGIE VEGETALE

Enseignants Responsables : Anne-Marie TABACCHI* et Catherine DIGONNET**

* LMGM - IBCG, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 33 59 16 : [email protected]

** UMR CNRS UPS 5546 POLE DE BIOTECHNOLOGIE VEGETALE, CHEMIN DE BORDE ROUGE, AUZEVILLE, BP42617 - 31326 CASTANET-TOLOSAN

: 05.62.19.35.59 : [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 3 - 6 ECTS

Matière CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Biologie végétale 12h 4h 14h - 30h

Physiologie végétale 18h 4h 8h - 30h

Equipes pédagogiques : Biologie végétale : A.-M. TABACCHI, A. ELGER, L. CIVEYREL, H. GRYTA, N. ESCARAVAGE Physiologie végétale : D. ALDON, D. BECARD, V. COTELLE, C. DIGONNET, E. GAULIN,

L. HOFFMAN, C. JACQUET, T. LAMAZE, P. SIVADON Biologie végétale : Morphologie, Anatomie et Adaptation des Végétaux Les notions vues en Cours, Td et TP sont à connaître pour l’examen terminal de cours et sont indissociables les unes des autres.

• Morphologie de l'appareil végétatif des embryophytes (cours et TP associés) • Architecture chez les spermaphytes (TD et TP associés) : constitution de l'architecture

d'une plante, notion de réitération, les modèles architecturaux. • Anatomie comparée des embryophytes (cours et TP associés) • Adaptations morphologiques et anatomiques de l’appareil végétatif aux contraintes

environnementales (cours et TP associés) : xérophytes, orophytes, macrophytes aquatiques, plantes carnivores, ....

• Morphologie florale et reproduction des Angiospermes (cours et TP associés) Le contrôle des connaissances sera basé sur un examen de TP (note de contrôle continu) et un examen terminal de cours qui portera sur les notions vues en cours, TD et TP. Physiologie Végétale : Métabolisme Des Végétaux L’objectif de cet enseignement est de présenter les bases de l’autotrophie des végétaux en développant les aspects physiologique, biochimique et biophysique Nutrition carbonée : Principes de thermodynamique, transfert d’énergie et transfert d’électrons, pigments de la photosynthèse, phase photochimique, transformation du dioxyde de carbone en glucides, photorespiration Nutrition azotée minérale et symbiotique Circulation de l’eau et Transport des sèves brute et élaborée

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 55

3L3VT5M – SYSTEME EDUCATIF ET DEVELOPPEMENT DE L’INDIVIDU

Enseignant Responsable : Christian CAYROL* * CBD, BAT. 4R3B3, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 65 09 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 3 - 3 ECTS

Matière CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Système éducatif et Développement de l’Individu

30h - - - 30h

Cet enseignement a pour objectif de permettre aux étudiants de comprendre le fonctionnement des établissements scolaires et la place qui y est donné à chaque élève. Programme des cours : 1 Le système éducatif :

- Qu'est-ce qu'un établissement scolaire ? - Le référentiel de compétences du professeur - Le référentiel de compétences des élèves - Les finalités du système éducatif - Valeurs et éducation

2 Connaître le jeune pour comprendre l'élève :

- les différentes conceptions sur le développement du jeune -son développement affectif et social -son développement cognitif - A propos de l'intelligence humaine - L'échec scolaire - Les comportements de dérégulation (phobie scolaire, refus scolaire, violence, etc. ...)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 56

3L4VT1M - GEOLOGIE SEDIMENTAIRE (STRATIGRAPHIE, SEDIMENTOLOGIE et GEOPHYSIQUE)

Enseignants responsables : Carine LEZIN, Bernard ANDREU, Agnès MAILLARD

LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE : 05 61 33 26 10 [email protected] : 05 61 33 26 29 [email protected] : 05 61 33 26 09 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 2 - 6 ECTS

Matière CM TD TP Enseignement délocalisé Total

30 h 22 h 8 h - 60 h

Equipe pédagogique : C. LEZIN, B. ANDREU, A. MAILLARD

Cours (30h)

Analyse stratigraphique (10h): Définition, démarche et méthodes ; stratigraphie géométrique ; lithostratigraphie ; stratigraphie séquentielle ; biostratigraphie ; géochronologie ; chimiostratigraphie ; magnétostratigraphie ; stratigraphie évènementielle ; chronostratigraphie; synthèse stratigraphique.

Analyse sédimentologique (10h) : Notion de cycle sédimentaire ; altération : désagrégation mécanique, altération chimique ; transport : transport par l'eau, transport éolien, transport par la glace, écoulement et glissements gravitaires ; la diagenèse : les grands mécanismes impliqués dans la diagenèse, les différents stades de la diagenèse ; les différentes catégories de roches sédimentaires (détritiques, résiduelles, carbonatées, salines, siliceuses, phosphatées et carbonées) ; exemples de milieux de sédimentation.

Analyse géophysique (10h) : Structure du globe ; rappels sur la propagation des ondes en milieu élastique. Présentation des principaux outils de la géophysique : sismologie, sismique réfraction et réflexion, tomographies, gravimétrie, magnétisme. Application à l’étude de la structure et de la dynamique terrestre. Travaux dirigés (12h)

Stratigraphie, sédimentologie (12h): Exercices portant sur les thèmes suivants : altération ; érosion-transport-sédimentation ; datations ; analyse séquentielle ; séquence paysage ; échelles stratigraphiques ; corrélations.

Géophysique (10h): Exercices portant sur les thèmes développés en cours : sismologie ; gravimétrie et magnétisme ; sismologie et sismique réfraction ; sismique réflexion (méthodes, interprétation de profils, stratigraphie sismique).

Travaux pratiques (8 heures)

Caractérisation, macroscopique et microscopique, des roches sédimentaires détritiques, des roches sédimentaires carbonatées, des autres roches ; analyses de faciès.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 57

3L4VT2M – GENETIQUE ET MICROBIOLOGIE

Enseignants Responsables : Philippe ROUSSEAU* et Marie-Pierre CASTANIE**

* LMGM - IBCG, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04

: 05 61 33 59 16 : [email protected]

** LMGM - IBCG, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04

: 05 61 33 59 41 : [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 6 ECTS

CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Génétique 14h 16h - - 30h

Microbiologie 14h 8h 8h - 30h

Equipes pédagogiques :

Génétique : Ph. ROUSSEAU Microbiologie : M.-P. CASTANIE

Génétique

Rappels des notions de L1. Génétique mendélienne : indépendance et liaison génétique ; cartographie ; interaction génique (épistasie). Génétique bactérienne : échanges de gène par transformation, transduction ou conjugaison. MICROBIOLOGIE Cours : Cellule procaryote : organisation, particularités. Archées et microorganismes eucaryotes. Métabolisme particulier des microorganismes. Relation microorganismes /environnement. TD : Analyses de documents TP : Techniques de base en microbiologie

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 58

3L4VT3M – BIOLOGIE CELLULAIRE – IMMUNOLOGIE

Enseignants Responsables : Raoul MAZARS* et Cécile DEMEUR**

* IPBS, 205 RTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 17 55 31 [email protected] ** INSERM U.563 CHU PURPAN, BP 3028 - 31062 TOULOUSE CEDEX

04 : 05 62 74 83 04 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Biologie cellulaire 18h 12h - - 36h

Immunologie 18h 6h - - 24h Equipe pédagogique :

Biologie cellulaire : R. MAZARS, K. BYSTRICKY, P.-E. GLEIZES, L. PELLOQUIN-ARNAUNE, J. DEPEYRE, G. RATOVO

Immunologie : C. DEMEUR, E. EPINOSA, D. HUDRISIER

Biologie cellulaire

- Noyau cellulaire et expression génique - Synthèse et adressage des protéines eucaryotes - Prolifération cellulaire : cycle cellulaire, mitose, méïose, contrôle de la prolifération - Notions de différenciation cellulaire

Immunologie Cours :

- Présentation générale du système immunitaire - Immunité innée et adaptative - Immunoglobulines et lymphocytes B - Organisation du système immunitaire et organes lymphoïdes - Régulation de la réponse immune et lymphocytes - Immunologie appliquée et techniques de base

Travaux dirigés : - Exercices d’application.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 59

3L4VT4M - DEVELOPPEMENT ANIMAL ET VEGETAL

Enseignants Responsables : Maria FERNANDEZ* et Didier ALDON**

* CBD, BAT. 4R3B3, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 69 52 : [email protected] ** SCSV, POLE DE BIOTECHNOLOGIE VEGETALE, 24, CHEMIN DE BORDE ROUGE, BP

42617 AUZEVILLE – 31326 CASTANET- TOLOSAN : 05 62 19 35 43 : [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 6 ECTS

CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Développement animal 20h 8h 8h - 36h

Développement végétal 14h 6h 4h - 24h

Equipe pédagogique :

Développement animal : C. BIERKAMP, C. CAYROL, P. DUFOURCQ, M. FERNANDEZ , B. GLISE Développement végétal : D. ALDON, G. BECARD, C. DIGONNET, A. GRAZIANA, R. PONT-

LEZICA, P. SIVADON.

DEVELOPPEMENT ANIMAL :

Programme des Cours et Travaux Dirigés Description et analyse du développement embryonnaire précoce de la drosophile, des amphibiens, des oiseaux et des mammifères.

L’accent sera mis sur les adaptations et sur certains mécanismes conservés au cours de l’évolution. • L’œuf : mise en place des réserves nutritives et des molécules informationnelles.

• La fécondation et ses conséquences.

• Les grandes étapes du développement de l’embryon (segmentation, gastrulation, organogenèse) et de ses annexes dans le cas des oiseaux et des mammifères.

• Les grands concepts de la biologie du développement et leurs fondements expérimentaux : *- Notions d’induction (induction du mésoderme, induction neurale, inductions en « cascade » dans l’organogenèse), de champ morphogénétique et d’information de position.

*- Les gènes du développement : approche des mécanismes moléculaires impliqués dans la mise en place des polarités antéro-postérieure et dorso-ventrale. Les gènes homéotiques (drosophile – vertébrés).

Travaux Pratiques Développement de la drosophile, des amphibiens et des oiseaux : observation de préparations histologiques et d’embryons vivants - projection de films.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 60

DEVELOPPEMENT VEGETAL :

Programme du Cours

Le cours a pour but d’aborder quelques aspects fondamentaux du développement reproducteur chez les plantes à fleurs. Les contrôles physiologiques et génétiques de la mise en place des organes floraux, de la double fécondation et de l’embryogenèse seront illustrés en utilisant les apports combinés des approches de biologie cellulaire et l’utilisation des mutants de développement. Ces processus jouent un rôle central dans le cycle de développement des plantes supérieures (Reproduction sexuée et dispersion des espèces) et dans la vie de l’homme par ses applications multiples (fleurs, graines fruits et tous les dérivés agro-industriels). Travaux Dirigés : La floraison - Fécondation et Embryogenèse - Graines & formation du fruit Travaux Pratiques 1 TP illustrera la physiologie de la reproduction chez les plantes.

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 61

3L4VT5M - STRUCTURATION DES ECOSYSTEMES

Enseignantes Responsables : Anne-Marie TABACCHI* et Evelyne BUFFAN-DUBAU**

* LADYBIO, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04

: 05 62 26 99 71 [email protected] ** LEH, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE

CEDEX 04 : 05 61 55 65 76 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 4 - 6 ECTS

Matière CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Structuration des écosystèmes 18h 10h - 6h 34h Equipe pédagogique : A.-M. TABACCHI, E. BUFFAN-DUBAU L’enseignement du module porte principalement sur l’étude de la structure des écosystèmes. Les aspects fonctionnels seront abordés en L3. COURS * Définitions * Répartition actuelle des organismes. Facteurs écologiques, hiérarchie des facteurs, facteurs limitants ; valence écologique des espèces, notion de niche écologique ; * Caractéristiques des communautés : composition et diversité spécifiques, structure trophique, structure en taille. Notion de Biodiversité. * Facteurs structurants des communautés : facteurs abiotiques : conditions climatiques générales, hétérogénéité spatiale, écotones, perturbations ; facteurs biotiques : ressources nutritives globales, interactions trophiques spécifiques (spécialisation trophique, parasitisme, symbiose), compétition et partage des ressources, prédation. - Les espèces clés -prédateurs, ingénieurs-. * Dynamique des communautés Colonisation : théorie des îles (Mac Arthur et Wilson), successions. TP-TD Climatologie. Techniques de relevés ; construction de bases de données. Utilisation des bases de données : Valence écologique des espèces, caractérisation des populations et des communautés. Cartographie Relations interspécifiques, un exemple de parasitisme

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 62

Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus L3 Biologie Générale et Sciences de la

Terre et de l’Univers (BGSTU)

Habilitation septembre 2007 à juin 2011 (MAJ : août 2007)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 63

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 64

Licence EOB Ecologie, Organismes et Biosphère 3ème année, Parcours : BG&STU Biologie générale & Sciences de la Terre & de l'Univers

Enseignant Responsable : Christian CAYROL Secrétariat pédagogique : Bât 4R3b3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 05 61 55 60 56 [email protected] Coordonnées de l’enseignant responsable : : Bât 4R3b3, 118 route de Narbonne 31062 Toulouse cedex 9 : 05 61 55 65 09

: [email protected]

CONDITIONS D'ADMISSION :

Accès de plein droit aux étudiants titulaires d'une seconde année de la licence EORB Ecologie, Organismes et Biosphère, parcours : BG & STU Biologigénérale & Sciences de la terre et de l’univers ou L2 SVS filière préparation concours agronomiques. Pour tout autre cas, inscription soumise à la décision de l'équipe de formation (pré-inscription sur le site web de l'Université : www.ups-tlse.fr).

SCHEMA DES ETUDES

12 Modules obligatoires

3L5VT1M 6 ECTS Paléontologie – Evolution de la biosphère 1er semestre 3L5VT2M 3 ECTS Tectonique analytique 1er semestre 3L5VT3M 6 ECTS Histologie fonctionnelle – Biochimie II 1er semestre 3L5VT4M 6 ECTS Physiologie animale – Neurosciences 1er semestre 3L5VT5M 6 ECTS Préprofessionnalisation – Bio pédagogie 1er semestre 3L5VTLM 3 ECTS Langue vivante 1er semestre

3L6VT1M 6 ECTS Géochimie générale – Pétrologie endogène 2ème semestre 3L6VT2M 6 ECTS Tectonique et sédimentation – Géophysique 2ème semestre 3L6VT3M 3 ECTS Fonctionnement des écosystèmes 2ème semestre 3L6VT4M 6 ECTS Evolution et diversité animales 2ème semestre 3L6VT5M 6 ECTS Evolution et diversité végétales 2ème semestre 3L6VTLM 3 ECTS Langue vivante 2ème semestre

Débouchés : - Entrée à l’IUFM pour la préparation du PLPA2

- Concours de recrutement de l’Enseignement secondaire (CAPES)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 66

3L5VT1M – PALEONTOLOGIE – EVOLUTION DE LA BIOSPHERE

Enseignant responsable : Pierre-Olivier ANTOINE LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE 05.61.33.25.98 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

20h 20h 20h 0h 60h

Equipe pédagogique : B. ANDREU ( [email protected] ), P.-O. ANTOINE

Cours :

Organismes vivants et fossiles ; Taxinomie, classification et systématique phylogénétique ; Histoire de la biosphère ; Quelques grandes crises biologiques ; Mécanismes de l’évolution ; Rythmes de l ‘évolution et modalités de la spéciation ; Processus ontogénétiques de l’évolution ; Fossiles et milieux de vie ; Paléobiogéographie ; Des grands singes à l’Homme ; Quelques étapes fondamentales dans l’histoire de la biosphère.

Travaux dirigés :

Lignées évolutives, clades et macroévolution ; l’évolution continue, discontinue et/ou ponctuée ; les grandes crises biologiques au cours des temps géologiques ; les stratotypes ; milieux de vie et de dépôt ; l’évolution des Hominoidea.

Travaux Pratiques : La fossilisation ; la vie au Paléozoïque inférieur, au Paléozoïque supérieur, au Mésozoïque (Trias - Jurassique et Crétacé), au Cénozoïque : classification, caractéristiques morphologiques, milieu et mode de vie, distribution stratigraphique des grands groupes fossiles végétaux et animaux.

Page 67: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 67

3L5VT2M – TECTONIQUE ANALYTIQUE

Enseignant responsable : Joachim DERAMOND LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE 05.61.33.26.68 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Tectonique Analytique 18 h 6 h - 6 h 30 h

Equipe pédagogique : J. DERAMOND, G. BESSIERE, J.-C. SOULA, M. RODDAZ.

Syllabus :

Comportement des matériaux naturels ; Déformation à toutes les échelles (2D et 3D) ; Description des principales structures tectoniques (en extension, raccourcissement, cisaillement) ; Représentation (cartes, projection stéréographique, diagramme de Mohr) ; Contrainte - déformation. Démonstration sur le terrain (1 jour).

Page 68: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 68

3L5VT3M – HISTOLOGIE FONCTIONNELLE et BIOCHIMIE II

Enseignantes Responsables : Isabelle LEGER-SYLVESTRE* et Isabelle MULLER**

* LBME - IBCG, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04

: 05 61 33 59 26 [email protected] ** CRCA, BAT. 4R3B1, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE

CEDEX 04 : 05 61 17 54 20 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Histologie fonctionnelle 16h - 24h - 40h

Biochimie II 12h 8h - - 20h Equipes pédagogiques : Histologie fonctionnelle : L. ARNAUNE, L. BARICAULT, I. LEGER-SILVESTRE, J. NOAILLAC-

DEPEYRE Biochimie : F. BARDOU, N. EYNARD, J.N. GENTHON , I. MULLER. Histologie Fonctionnelle.

Programme des cours : - Exploration des différents niveaux d’organisation (des cellules aux tissus) et analyse des relations structures/fonctions.

- Polarité fonctionnelle des cellules épithéliales – Matrice extracellulaire et tissus conjonctifs –Tissus musculaires.

- Organisation fonctionnelle des différents appareils (digestif, excréteur, circulatoire, respiratoire).

Travaux Pratiques : Entraînement à la reconnaissance et à l’analyse déductive de préparations et de documents histologiques ou cytologique en vue de l’utilisation en « leçon de démonstration » ou en TP d’agrégation. Biochimie Organisation et mécanismes de régulation des processus métaboliques :

Métabolisme glucidique : glycolyse/gluconéogenèse ; métabolisme du glycogène. Devenir du pyruvate (métabolisme mitochondrial, cycle de Krebs) Oxydations Phosphorylantes Métabolisme lipidique : β-oxydation des acides gras

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 69

3L5VT4M – PHYSIOLOGIE ANIMALE et NEUROSCIENCES

Enseignantes Responsables : Bénédicte BUFFIN-MEYER* et Catherine ARMENGAUD**

* BAT. 4TP1, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 32 30 90 BENEDICTE.BUFFIN-

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CEDEX 04 : 05 61 55 64 36 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Physiologie animale 18h 10h 4h - 32h

Neurosciences 16h 6h 12h - 34h Equipes pédagogiques :

Physiologie Animale : V. BOURLIER, B. BUFFIN-MEYER, F. CRAMPES, P. FRITSCH, D. LARROUY

Neurosciences : C. ARMENGAUD, J.-M. DEVAUD, M. GAUTHIER

Physiologie Animale : Programme des Cours et Travaux dirigés * Circulation * Osmorégulation, Excrétion Travaux Pratiques * Electrocardiogramme et adaptations cardiovasculaires à l’effort

Neurosciences : Programme des Cours et Travaux dirigés

* Physiologie sensorielle (somesthésie, vision) * Motricité (mouvements réflexes, mouvements volontaires) * Electrophysiologie de la synapse

Travaux Pratiques *Mécanismes ioniques du Potentiel d’action (sur ordinateur), * Histologie du système nerveux * Organisation du Système Nerveux-Anatomie de l’encéphale

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 70

3L5VT5M - PREPROFESSIONALISATION – BIOPEDAGOGIE

Enseignants Responsables : Christian CAYROL* et Gilbert BESSIERE** * CBD, BAT. 4R3B3, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 65 09 [email protected] ** LMTG, 14 AVENUE EDOUARD BELIN, 31400 TOULOUSE : 05 61 33 25 92 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Préprofessionalisation 22h 23h dont 15hTD spécifiques* - 45h

Biopédagogie 3h 12h TD spécifiques° - 15h *Ces 15h de TD spécifiques incluent le stage en établissement de 5 jours.

° Ces séances de TD d’une durée de3h se déroulent en salle machine dont la capacité d’accueil est limitée à 18 étudiants.

Equipes pédagogiques :

Préprofesionalisation : G. BESSIERE, C. CAYROL, N. DELVOLVE (IUFM), H. DEL-PUP (IUFM).

Biopédagogie : E. GAULIN, S. MASTRORILLO.

PREPROFESSIONALISATION

L'objectif général de cet enseignement, en complémentarité avec l'enseignement donné sous l'intitulé "Système éducatif et développement de l'individu" en Licence 2, est de donner des outils aux futurs enseignants afin qu'ils maîtrisent les savoirs indispensables pour permettre à tous les élèves d'apprendre. Programme des cours et travaux dirigés :

1 Des théories de l'apprentissage aux pratiques d'enseignement 2 Les différentes façons d'apprendre 3 Apports des neurosciences à la compréhension des mécanismes de l'apprentissage 4 Pour une pédagogie de la métacognition 5 Les raisonnements humains 6 Démarche scientifique, démarche d'investigation. 7 Préparer ses cours - les textes institutionnels dont les programmes - définir des objectifs - organiser les différentes activités - guider les élèves - prendre en compte l'hétérogénéité du groupe classe 8 Evaluer les élèves 9 Animer une équipe pédagogique Les thèmes abordés en cours seront travaillés en TD à partir d'études de cas.

Page 71: Syllabus Licence EOBl2l3bopeups.free.fr/Files/8_syllabus_licence_eob.pdf · C.C. : contrôle continu E.P. Examen partiel E.T. : examen ... Biologie Végétale 15 h 6 h 21 h 42 h Physiologie

- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence ST Mention Ecologie, Organismes et Biosphères (E.O.B.) (Habilitation 2007/2011) - 71

Le stage en établissement Il a pour objectif d'analyser des pratiques de professeurs en établissement afin d'identifier les différents enjeux auxquels ils doivent faire face pour arriver à atteindre les objectifs de réussite de tous les élèves. Il donnera lieu à un mémoire qui devra être soutenu devant un jury. Ce travail correspond à la modalité d'évaluation de ce module.

BIOPEDAGOGIE Cet enseignement a pour but de faire découvrir aux étudiants les différents outils pédagogiques disponibles dans les métiers d’enseignant en Sciences de la Vie et de la Terre. Trois thèmes sont abordés : * Découverte des principaux outils pédagogiques disponibles en SVT et élaborer leur exploitation. * Mise en œuvre d’une démarche logique dans la conception d’un support pédagogique ou d’un oral. * Renforcement de la qualité de la communication scientifique. Après une base conceptuelle, les étudiants devront réaliser une simulation d’un cours de biologie avec utilisation d’outils multimédias.

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3L6VT1M – GEOCHIMIE GENERALE - PETROLOGIE ENDOGENE

Enseignante responsable : Anne NEDELEC : LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE : [email protected] ; : 05.61.33.25.76

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

1. Géochimie générale 18 h 14 h - - 32 h

2. Pétrologie endogène 18 h - 10 h - 28 h Equipe pédagogique :

Géochimie générale : Kevin BURTON, Martin RODDAZ, Pieter VAN BEEK Pétrologie endogène : Anne NEDELEC

Géochimie générale (CM + TD) - Cosmochimie ; classification des éléments - Composition et origine des différentes enveloppes terrestres - Cristallochimie ; règles de substitution et calcul de formules structurales : réactions

d’échanges et applications thermométriques - Intérêt des éléments majeurs et traces en pétrologie magmatiques ; corrélations

élémentaires ; notion de coefficient de partage ; eléments compatibles et incompatibles - Isotopes radioactifs et radiogéniques : intérêt comme chronomètres et comme traceurs - Isotopes stables : intérêt paléoenvironnemental et paléoclimatique - Les grands cycles biogéochimiques et leur évolution au cours de l’histoire du globe

Pétrologie endogène Métamorphisme (CM) - Les facteurs du métamorphisme ; notion de faciès métamorphique - Réactions métamorphiques discontinues et continues ; chemins P-T-t - Types de métamorphisme et contextes géodynamiques

Magmatisme (CM): - Origine des magmas (fusion du manteau, fusion crustale) - Ascension et mise en place des magmas ; types de dynamismes éruptifs - Cristallisation et évolution des magmas (cristallisation fractionnée ; contamination ;

mélanges) - Types de magmatisme et contextes géodynamiques

TP de Pétrographie : échantillons macroscopiques et lames minces

- Reconnaissance des faciès métamorphiques - Structures et microstructures de déformation ductile - Roches mantelliques et ophiolites - Granitoïdes - Roches volcaniques (Massif Central)

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3L6VT2M – TECTONIQUE ET SEDIMENTATION - GEOPHYSIQUE Enseignants responsables : Joachim DERAMOND et Martin RODDAZ

: LMTG, 14 AVENUE E. BELIN 31400 TOULOUSE : [email protected] ; : 05.61.33.26.68 : [email protected] ; : 05.61.33.25.99

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected] ;

Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Tectonique / Sédimentation 24h 4h 16h 6h (1x1jour) 50h

Géophysique 10h - - - 10h Equipe pédagogique :

Tectonique / Sédimentation : Joachim Déramond, Martin Roddaz Géophysique : Agnès Maillard-Lenoir

Objectif : l’objectif de ce module est de donner à l’étudiant une compréhension globale des mécanismes qui contrôlent la création et l’évolution des bassins sédimentaires. Pour chaque contexte tectonique, on montrera comment l’utilisation conjointe des outils géophysiques et les relations entre la tectonique et la sédimentation permettent de mieux contraindre l’évolution géodynamique des bassins sédimentaires.

Pré-requis : Bases de géologie sédimentaire, stratigraphie sismique et tectonique analytique. COURS (34 H) TECTONIQUE ET SEDIMENTATION (MATIERE 1) : 24 HEURES

METHODES (6 HEURES) Outils tectoniques : Formation des structures tectoniques. Contrôle chronologique. Outils sédimentologiques : Analyse de faciès. Notion d’espace disponible. Contrôles et relations avec les apports. Stratigraphie séquentielle.

MARGES PASSIVES, GEODYNAMIQUE DES BASSINS EN EXTENSION (6 HEURES) Les structures tectoniques Organisation et évolution sédimentaire (Faciès et géométrie des dépôts) Etude de cas (Golfe du Lion)

MARGES ACTIVES, GEODYNAMIQUE DES BASSINS D’AVANT-PAYS (6 HEURES) Les structures tectoniques Organisation et évolution sédimentaire (faciès et géométrie des dépôts), stade sous alimenté à suralimenté Etude de cas (les Alpes)

MARGES ACTIVES, GEODYNAMIQUE DES BASSINS EN DECROCHEMENT (6 HEURES) Les structures tectoniques Organisation et évolution sédimentaire (faciès et géométrie des dépôts) Etude de cas (les bassins houillers)

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GEOPHYSIQUE (MATIERE 2) : 10 HEURES

Utilisations des outils géophysiques pour l’étude de cas : application aux différents domaines géodynamiques (divergence, convergence et décrochement), étudiés à partir de données géophysiques à différentes échelles : imagerie acoustique (sondeurs multifaisceaux, chirp), données sismiques (sismique haute résolution à sismique multitrace et grand-angle, réfraction, tomographies), gravimétriques (cartes sandwells ou détails de données de campagnes), magnétisme.

TD (4 H)

Stratigraphie séquentielle Etude d’un bassin d’avant-pays

TP (16 H)

Cartographie géologique : schémas structuraux, coupes et histoires géologiques

ENSEIGNEMENT DELOCALISE (6 H) Relation tectonique - sédimentation (vallée de l’Aude)

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3L6VT3M - ECOLOGIE : FONCTIONNEMENT DES ECOSYSTEMES I

Enseignantes Responsables : Anne-Marie TABACCHI* et Evelyne BUFFAN DUBAU**

* LADYBIO, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 62 26 99 71 [email protected]

** LEH, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 65 76 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected] ;

Enseignement de Semestre 6 - 3 ECTS

CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Fonctionnement des écosystèmes

18h 16h - - 34h

Equipe pédagogique : E. BUFFAN-DUBAU, M. TACKX, A.-M. TABACCHI, P. LAVANDIER

L’enseignement porte principalement sur l’aspect dynamique et fonctionnel des écosystèmes et de leurs constituants. Il s’appuie sur les concepts et les connaissances vus en L2 qui seront considérés comme acquis. Cours : *Dynamique des populations constitutives des biocénoses : -le système population-environnement ; croissance exponentielle et logistique des effectifs; taux de mortalité ; croissance en taille et en poids ; production. - Interrelations entre espèces : modèle logistique de compétition interspécifique ; modèle exponentiel proies-prédateurs.;

- Régulation bottom up/top down. * Cycle de la matière et de l’énergie au sein de l’écosystème - L’approche systémique, notion de feed-back, rendements… - Production I, autotrophie ; production secondaire, hétérotrophie, réseaux trophiques ; microorganismes, dégradation de la matière organique et recyclage des éléments minéraux. - Comparaison de différents types fonctionnels d’écosystèmes. - Cycles biogéochimiques : C et N. Imbrication avec le cycle de l’eau et rôle des organismes. * Relations entre structure des biocénoses et fonctionnement des écosystèmes - Dynamique fonctionnelle des écosystèmes, variations saisonnières, maturation - Biodiversité, production et recyclage des nutriments - Biodiversité et stabilité de l’écosystème TD : Cycles biologiques. Suivi des cohortes, mortalité, augmentation des effectifs, croissance pondérale. Compétition interspécifique Production primaire, production secondaire. Réseaux trophiques. Intégration des différents niveaux : modélisation.

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3L6VT4M - EVOLUTION ET DIVERSITE ANIMALES Enseignant Responsable : Régis CEREGHINO

** LEH, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 84 36 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT : 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05.61.55.60.56 : [email protected]

Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

Matière CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Evolution et Diversité animales 32h 10h 18h - 60h

Equipe pédagogique : R. CEREGHINO, G. LOOT, S. MASTRORILLO, A. RIBERON

COURS : Les connaissances acquises au cours des deux années précédentes seront approfondies sous l’angle de l’histoire évolutive des principaux phylums unicellulaires et métazoaires. La diversité, le succès évolutif et écologique des principaux groupes, seront analysés à la lumière de l’anatomie et de la biologie fonctionnelle des organismes :

- Eucaryotes unicellulaires hétérotrophes : phylogénie, principaux types de cycles vitaux, importance du parasitisme et de la symbiose.

- Eponges et Radiés : notion d’individu, polymorphisme, reproduction, développement embryonnaire et cycles de vie.

- Lophotrochozoaires : principaux types structuraux, morphologie, anatomie, radiations adaptatives. - Cuticulates : Nematodes et Nématomorphes – plan d’organisation et diversité, formes libres et parasites,

cycles de vie. Pan-Arthropodes – diversité, histoire évolutive, métamérie, vie en milieu aquatique et milieu terrestre, retour au milieu aquatique : passage de la nage à la marche, saut, vol, développements post-embryonnaires.

- Deutérostomiens : principaux types structuraux, morphologie, anatomie, radiations adaptatives. TRAVAUX DIRIGES : Les TD se déroulent sous forme d’exercices et d’analyse de documents (publications, films). Les thèmes traités sont : - Classification du vivant : méthodes phénétique et cladistique - Analogie, Homologie, Convergence évolutive - La faune de Burgess : une interprétation de l’Histoire du vivant - Analyse de sujets du CAPES, traités sous forme de plan TRAVAUX PRATIQUES : - Illustration, à l’aide de manipulations (dissections, montages) réalisées par les étudiants, des principaux volets

traités en cours.

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3L6VT5M - EVOLUTION ET DIVERSITE VEGETALES

Enseignante Responsable : Nathalie ESCARAVAGE

* EDB, BAT. 4R3B2, 118 ROUTE DE NARBONNE - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 67 52 [email protected]

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE : SYLVIE RENAULT 118, ROUTE DE NARBONNE, BAT. 4R3B3 - 31062 TOULOUSE CEDEX 04 : 05 61 55 60 56 [email protected] Equipe pédagogique : N. ESCARAVAGE, A. ELGER, V. TRICHON, N.SEJALON-DELMAS, Ch. ROUX, A.-M.

TABACCHI

Algues/Champignons : CM : 12h, TD : 2 h; TP : 6 h

- Evolution, biologie et écologie des algues marines - Phylogénie et cycle de vie des Eumycota et groupes associés - Les champignons dans la biospères : saprophytisme, parasitisme et symbiose.

Embryophytes : CM : 21 h, TD : 4 h, TP ; 15 h - Reproduction sexuée et asexuée chez les plantes : différentes modalités - Modalités de la pollinisation, incompatibilité pollen-pistil - Déterminisme génétique de la floraison, édification de la fleur, formation du fruit et de la graine - Diversité et classification des embryophytes. Les bases de la classification, passage de la classification phénétique à la classification phylogénétique. - Adaptations liées à la reproduction et à la dissémination des espèces Travaux pratiques. Indissociables des enseignements théoriques, ils s'appuient sur des démonstrations, des manipulations et d'une demi journées d'herborisation sur le terrain.

Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

Matières CM TD TP Enseignement délocalisé Total

Evolution et Diversité végétales 33h 6h 21h - 60h

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Université Paul Sabatier UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Syllabus

Licence Pluridisciplinaire Orientation Professorat des Ecoles

Habilitation septembre 2007 à juin 2011

(MAJ : août 2007)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence Mention EOB parcours LPDE (Habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 80

Présentation générale

UE

Matières et Contenu des

enseignements

Mots-clés / Objectifs Ventilation Horaire

CM - TD - TP

UE 1

Pédagogie et Didactique des Mathématiques

Approfondissement des notions mathématiques fondamentales pour l’enseignement primaire

36 - 36 - 0

UE 2

Connaissance du

Système Educatif

Connaissances institutionnelles, historiques et sociologiques du système éducatif français et

européen

24 - 30 - 18

UE 3

Langage et

Didactique 1

Connaissances de la langue et de son

fonctionnement Processus et enjeux du Dire-Lire-Ecrire- à

l’école Littérature jeunesse 1

0 - 48 – 0

UE 4

EPS 1

Pédagogie et Didactique des APSA 1° partie

Approche interdisciplinaire

0 - 0 - 24

UE 5

Stage d’observation en Ecole primaire

Compréhension et analyse du contexte scolaire Projet d’intervention pour le second semestre

2 - 30 - 0

UE 6

Didactique des

Langues 1

Pratique d’une langue vivante (anglais ou espagnol)

0 - 24 – 0

UE 7

Sciences et Technologie

Pédagogie, historique de l’enseignement des

sciences Fonction du vivant, écologie, Etat de la matière et changement d’état, Energie, Système solaire,

Réalisations technologiques

34 - 38 - 0

UE 8

Connaissance de l’enfant

Matière 1 : Psychologie Matière 2 : Pédagogie

Matière 3 : Physiologie

Psychologie du développement

Les courants et les paradigmes de recherche actuels sur l’enseignement

Supports physiologiques et pathologies de l’enfant

16 - 8 - 0

16 - 8 - 0

16 - 8 - 0

UE 9

Langage et

Didactique 2

Didactique de la langue orale et écrite

Littérature jeunesse 2

4 - 20 - 0

UE 10

EPS 2

Pédagogie et Didactique des APSA 2° partie Pratique physique

2 - 4 - 42

UE 11

Stage

d’intervention en école primaire

Réinvestissement des connaissances acquises

dans la conduite de séances aux trois cycles de l’Ecole Primaire

2 – 34 - 0

UE 12

Didactique des

Langues 2

Didactique de l’enseignement des langues

à l’école primaire

4 - 20 – 0

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence Mention EOB parcours LPDE (Habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 81

MODALITES DE CONTROLES DES CONNAISSANCES HABILITATION 2007-2010 - MCC DIPLOME

Année universitaire 2007/2008 CODE APOGEE DU DIPLOME: 3LPDE0 RESPONSABLE: Jean-Claude TOUGNE

INTITULE DU DIPLOME: ORGANISMES ET BIOSPHERE MENTION Licence Pluridisciplinaire Orientation Professorat des Ecoles

Règle d'obtention du diplôme:

Code Apogée Libellé Type UE Nom du ECTS PREMIERE SESSION SECONDE SESSION

UE Unité Enseignement (1) Responsable (2) CC (%) CP (%) CT (%) TOTAL CC (%) CP (%) CT (%) TOTAL

Semestre 5 (3LPD05I)

3L5PE1M Pédagogie et Didactique des Mathématiques

Ob. A. ANTIBI 7 100 100 100 100

3L5PE2M Connaissance du Système éducatif Ob. G. FERNANDEZ 7 40 60 100 25 75 100 3L5PE3M Langage et Didactique 1 Ob. E. SANZ-LECINA 4 100 100 100 100 3L5PE4M Education Physique et Sportive 1 Ob. H. BRUNAUX 4 100 100 100 100

3L5PE5M Stage d'Observation en Ecole Primaire

Ob. J.C. TOUGNE 5 100 100 100 100

3L5PE6M Didactique des Langues 1 Ob. E. CROSNIER 3 100 100 100 100 Semestre 6 (3LPD06I)

3L6PE1M Sciences et Technologie Ob. S. SOULA 7 40 60 100 40 60 100 3L6PE2M Connaissance de l'Enfant Ob. M. ALLES-JARDEL 7 100 100 100 100 3L6PE3M Langage et Didactique 2 Ob. E. SANZ-LECINA 3 100 100 100 100 3L6PE4M Education Physique et Sportive 2 Ob. H. BRUNAUX 4 50 50 100 25 75 100

3L6PE5M Stage d'Intervention en Ecole Primaire

Ob. J.C. TOUGNE 5 100 100 100 100

3L6PE6M Didactique des Langues 2 Ob. M.-P. RIC 4 100 100 100 100 Remarques:

Le responsable Le Président du diplôme de l'Université Paul Sabatier

Professeur Jean-François SAUTEREAU

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence Mention EOB parcours LPDE (Habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 82

3L5PE1M – PEDAGOGIE ET DIDACTIQUE DES MATHEMATIQUES

Enseignant responsable : André ANTIBI Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 5 - 7 ECTS CM TD TP 36 36 -

Equipe pédagogique : André ANTIBI (DiDIST, UPS) ; Hervé DEPECKER IREM-IUFM Midi-Pyrénées ; Valérie FREDE IREM-IUFM Midi-Pyrénées , MCF Labo. ECCD Mirail et UFE OBS.Paris ; Madeleine VAULTRIN, IREM-IUFM Midi-Pyrénées MOTS CLES : Approfondissement des notions mathématiques fondamentales. Eléments de didactique des mathématiques pour l’enseignement primaire

COURS

1) Approfondissement de quelques notions mathématiques fondamentales pour l’enseignement primaire

2) Etude de l’évolution d’une notion mathématique et de son enseignement du Primaire à l’Université

3) Initiation à la didactique de l’enseignement des mathématiques de l’école primaire

4) Méthodes usuelles de résolution des problèmes

5) La place de la résolution de problèmes dans les programmes de mathématiques de l’école primaire

TRAVAUX DIRIGES Illustration des différentes notions traitées par :

- des exercices théoriques - l’analyse de situations de classe - l’analyse d’extraits de manuels de mathématiques du primaire

Modalités d’Evaluation

1ère Session 2ème Session C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal

-

100 % (écrit 2h00)

-

100 % (écrit 2h00)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence Mention EOB parcours LPDE (Habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 83

3L5PE2M - CONNAISSANCE DU SYSTEME EDUCATIF

Enseignant Responsable : Gilles FERNANDEZ Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 5 – 7 ECTS

CM TD TP

24h 30h 18h

Equipe pédagogique : Jean-Claude. TOUGNE et Gilles FERNANDEZ (ainsi que des professionnels sur les séminaires thématiques)

Le système éducatif et l’école primaire G. Fernandez : connaissance générale du système éducatif : approches historique, politique, institutionnelle et sociologique

Evolution et constitution du système éducatif de la fin du XIX° s. à nos jours : les processus de massification et de démocratisation. Le processus de décentralisation et ses effets sur le fonctionnement du système : autonomie,

ouverture, partenariat, rôle des acteurs… Echecs scolaires et inégalités des parcours de formation des élèves. Les réflexions sur la nature et la formalisation des savoirs scolaires et de leur apprentissage. Les violences scolaires, les perspectives de lutte et l’éducation à la citoyenneté.

J.C. Tougne : spécification des données au niveau de l’enseignement et de l’école primaire L’évolution de l’école primaire en France au XX°s. L’organisation de l’école primaire : ses structures et ses acteurs. Le fonctionnement de l’école primaire : les programmes, les cycles, les différents conseils, les

projets et l’organisation générale de la classe. Textes et règlements officiels Les problématiques et thèmes d’actualité - enjeux : Laïcité, l’autorité…

APPROCHE THEMATIQUE ET PROFESSIONNELLE : SOUS FORME DE SEMINAIRES ET DE CONFERENCES METHODOLOGIE DE L’ORAL : SIMULATION D’ORAUX A PARTIR DE SYNTHESE DE DOCUMENTS SUR DES THEMES ABORDES DANS LE CADRE DE CET ENSEIGNEMENT

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal

40 % (oral)

60 %

(écrit 3h00)

25 % RS

(oral)

75 %

(écrit 3h00)

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- UPS-UFRSVT-SYLLABUS Licence Mention EOB parcours LPDE (Habilitation septembre 2007 à juin 2011) - 84

3L5PE3M - LANGAGE ET DIDACTIQUE 1

Enseignante Responsable : Eliane SANZ-LECINA Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 5 – 4 ECTS COURS TD spécifiques TP

- 48 h - Equipe pédagogique : Karine DUVIGNAU (MCF Sciences du Langage, Labo. Gridife ERTe 64 Université Toulouse 2), Michel GANGNEUX (PIUFM), Eliane SANZ-LECINA (MCF Sciences du Langage, Labo. Gridife ERTe 64 Université Toulouse 2) OBJECTIFS et PROGRAMMES : Permettre aux étudiants de : Comprendre les processus et les enjeux liés au dire-lire-écrire à l’école : Lecture : apprentissage et pratiques culturelles Littérature de jeunesse 1 Production d’écrits de la maternelle au cycle 3 Evaluation des écrits

Repérer et analyser les problèmes posés par la didactique de la discipline : Place et rôle de l’enseignant dans ces apprentissages Dispositifs et organisation de séquences Maîtrise de la langue et autres champs disciplinaires : quelles articulations,

quels apprentissages, quelle organisation ?

Développer leurs connaissances sur la langue et son fonctionnement :

Fonctionnement des textes : typologie des écrits, phénomènes de substitution, règles de cohérence/cohésion, système des temps et formes verbales

Fonctionnement des phrases : types de phrase, structures et transformations, classe de mots fonctions grammaticales, système orthographique.

Modalités d’Evaluation

1ère Session 2ème Session C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal

-

100 % (écrit 2h00)

-

100 % (écrit 2h00)

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3L5PE4M et 3L6PE4M - Education Physique et Sportive 1 & 2

Enseignante Responsable : Hélène BRUNAUX Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 - [email protected]

Semestre 5 – 4 ECTS / Semestre 6 – 4 ECTS CM TD TP 2 4 66 0

Equipe pédagogique : UFR-STAPS : Valérie BAZIN,Marie-Claude BESANCON, Hélène BRUNAUX, Caroline DUCES, Martine FAUX, Cécile LONGIS, Nicole SOR, Jean-Luc TELLIER, Jean-Claude TOUGNE Cette UE se décompose en trois parties :

1. Travail de préparation relatif aux quatre compétences spécifiques propres à l’E.P.S. à l’école primaire. (4 X 12 heures TP)

Les activités traitées aborderont une progression des situations du cycle 1 au cycle 3 en insistant sur la prise en compte des caractéristiques propres aux enfants dans chaque cycle. MOTS CLES : Logique interne des activités, enjeux de formation, situations d’apprentissage Les activités abordées sont les suivantes :

Semestre 5 • CS 1 : Activités aquatiques, activités athlétiques. • CS 2 : Course d’orientation, escalade.

Semestre 6 • CS 3 : Activités d’opposition individuelle, activités d’opposition collective. • CS 4 : Activité d’expression corporelle, activité gymnique.

2. Prolongement interdisciplianire avec l’éducation musicale (2h CM, 4h TD) 3. Pratiques physiques : course (1500m), danse (18 heures TP). Les étudiants suivront un programme d’entraînement visant à les préparer à l’épreuve de pratique physique.

Modalités d’Evaluation 3L5PE4M 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal -

100 % (écrit 2h00)

-

100 % (écrit 2h00)

Modalités d’Evaluation 3L6PE4M 50 %

Pratique physique (danse ou 1500m)

50 % (écrit 2h00)

25 % Report systématique

75 % (écrit 2h00)

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3L5PE5M - STAGE D’OBSERVATION EN ECOLE PRIMAIRE

Enseignant Responsable : Jean-Claude TOUGNE Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 5 – 5 ECTS COURS TD TP STAGE

2h 30h 34h Equipe pédagogique : Inspecteurs Education Nationale et équipes de circonscription, professeurs d’écoles, Gilles FERNANDEZ, Jean-Claude TOUGNE

OBJECTIFS Compréhension et analyse du contexte de l’école : projets, acteurs ,

partenariat, aide aux élèves en difficultés Préparation d’un projet d’intervention dans une ou plusieurs disciplines

pour le second semestre

PROGRAMME et MODALITES

Stage d’observation d’une semaine (courant novembre) . Les terrains de stages sont proposés par le responsable de cet enseignement en collaboration avec les Inspecteurs de l’Education Nationale de 4 circonscriptions. Les étudiants sont répartis en binôme sur les différentes écoles. Le lieu de stage proposé par l’université doit impérativement être identique lors des 2 semestres. Le suivi de stage et l’évaluation sont réalisés par un enseignant de l’université (G. Fernandez, J.C. Tougne).

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal

100 % Rapport de stage

écrit

100 % Rapport de stage avec

les corrections apportées

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3L5PE6M - DIDACTIQUE DES LANGUES 1

Enseignante Responsable : Elisabeth CROSNIER Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 5 – 3 ECTS COURS TD TP STAGE

- 20 h - Equipe pédagogique : Henri AVRIL, Elisabeth CROSNIER, Jacqueline RUSSON, Fiona SCANLON

LANGUES L’enseignement de l’anglais et de l’espagnol vise à développer essentiellement les compétences de communication orale selon deux axes. 1 – Conversation dans une langue étrangère sur des sujets courants, culture et connaissance. Les thèmes sont des sujets de société, d’actualité et de culture générale inhérents aux pays anglophones et hispanophones, d’un intérêt particulier pour des futurs enseignants. 2 – Conversation de la vie quotidienne en langue étrangère. Acquisition des fonctions langagières, des structures grammaticales de base et du vocabulaire nécessaires à la communication en situations courantes. Les étudiants s’entraînent à comprendre des articles et à s’exprimer oralement. Ils sont préparés directement à l’épreuve de langue du concours en matière de compréhension écrite et d’expression orale. Ils vont également développer des compétences d’expression et d’interaction par le biais de mise en situation réelle.

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal -

100 % (oral)

-

100 % (oral)

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3L6PE1M – SCIENCES ET TECHNOLOGIE

Enseignant Responsable : Serge SOULA Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 6 – 7 ECTS COURS TD TP STAGE

34h 38h Equipe pédagogique : Sylvie BERKES-BROT (SVT), Michel GALAUP (IUFM Midi-Pyrénées), Stéphane RESPAUD (IEN), Serge SOULA (Laboratoire d’Aérologie, OMP)

OBJECTIFS

Cette formation permet aux étudiants d’acquérir une culture scientifique pluridisciplinaire. Elle est également orientée vers la professionnalisation, notamment pour la formation des étudiants à être des acteurs du système éducatif.

PROGRAMME ET REPARTITION HORAIRE

- Pédagogie, historique et mise en situation de l’enseignement des Sciences à l’Ecole (Stéphane Respaud).

- Les êtres vivants : fonctions du vivant (nutrition, reproduction et cycles de développement, fonctions de relation), écologie (Sylvie Berkès-Brot).

- Etats de la matière et changements d’état, énergie et transformation d’énergie, la lumière et sa propagation, rotation de la Terre et ses conséquences, système solaire, points cardinaux et boussole (Serge Soula).

- Réalisations technologiques : circuits électriques, leviers, transmission et transformation de mouvements (Michel Galaup).

- Didactique des Sciences (démarche d’investigation et application pédagogique)

Modalités d’Evaluation

1ère Session 2ème Session C. Continu 40% C. Terminal 60% C. Continu 40% C. Terminal 60%

2 épreuves de 1 h :

1 en Biologie 1 en

Physique/Technologie Test de connaissances

Ecrit de 2 h

Test de connaissances synthèse de documents

et perspective didactique

Report

note 1ère session

Ecrit de 2 h

Test de connaissances synthèse de documents

et perspective didactique

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3L6PE2M - Connaissance de l’enfant

Responsable : Monique ALLES-JARDEL Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 6 – 7 ECTS COURS TD TP

48h 24 h - Equipe pédagogique : Monique ALLES-JARDEL (Laboratoire SOI, STAPS), Chantal AMADE-ESCOT, Nathalie MONNIER (DiDIST, UPS) , Corinne. CALBA (Psychologue scolaire), Gilles FERNANDEZ (STAPS), Sandra.JOFFROY (Laboratoire CEOPS, Toulouse)

Partie 1 « Approche psychologique : Le développement normal et troublé» (Mme Allès-Jardel) 16h CM 1 Les médiations sociales et culturelles du développement

2 De la naissance à l’entrée à l’école maternelle

3 Le développement des enfants d’âge scolaire

T.D. : La psychologie et le psychologue dans le cadre scolaire 3 x 2 h de TD réservés aux psychologues scolaires 1 TD de 2 h Les troubles du comportement alimentaire (M. ALLES JARDEL) Partie 2 « Approche pédagogique » ( C. AMADE ESCOT et/ou N. MONNIER et G. FERNANDEZ) 16h CM Etudes des courants et des modèles pédagogiques : 6h CM : G. Fernandez DEFINITION, ACQUISITION ET REGULATION DES COMPETENCES : 4H CM : G. FERNANDEZ Les courants de recherche sur l’activité enseignante : 6 h CM (N. MONNIER / C. AMADE ESCOT) TD 4 TD de 2 h : Travail de synthèse de documents à partir de textes pédagogiques reprenant les thèmes des CM (G. FERNANDEZ) Partie 3 « Approche physiologique : les rythmes biologiques et impact sur le système scolaire» 16h CM ( S. JOFFROY ) TD Etude des pathologies de l’enfant ayant des conséquences sur la scolarité TD Les rythmes scolaires TD Diététique et lutte contre l’obésité TD Le rôle de l’activité physique (EPS à l’école)

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal -

100 % (écrit : 3h00)

-

100 % (écrit : 3h00)

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3L6PE3M - LANGAGE ET DIDACTIQUE 2

Enseignante Responsable : Eliane SANZ-LECINA Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 6 – 3 ECTS COURS TD TP

4h 20 h - Equipe pédagogique : Karine DUVIGNAU (MCF Sciences du Langage, Labo. Gridife ERTe 64 Université Toulouse 2), Michel GANGNEUX (PIUFM), Eliane SANZ-LECINA (MCF Sciences du Langage, Labo. Gridife ERTe 64 Université Toulouse 2) OBJECTIFS ET CONTENUS : Approfondir les connaissances et la réflexion sur l’enseignement du langage autour de trois axes :

- enseignement du langage à l’école - troubles du langage - littérature de jeunesse 2 (support d’enseignement)

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal -

100 % (oral)

-

100 % (oral)

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3L6PE5M - STAGE D’INTERVENTION EN ECOLE PRIMAIRE

Enseignant Responsable : Jean-Claude TOUGNE Secrétariat pédagogique : Mme ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 6 – 5 ECTS COURS TD TP STAGE

2h 34h 54 H Equipe pédagogique : Inspecteurs Education Nationale et équipes de circonscription, professeurs d’écoles, J.C. TOUGNE

OBJECTIFS Il s’agit d’un stage d’intervention avec : Préparation, conduite et analyse de leçons sur un même classe à raison d’un jour par semaine durant un trimestre ( de janvier à mars ). Ce stage permet :

De donner du sens et de réinvestir les contenus théoriques abordés lors des différentes UE

De s’impliquer dans la conduite de séances et de réguler son intervention sur les plans pédagogiques et didactiques

De confronter ses représentations du métier avec la réalité de l’enseignement…

PROGRAMMES / MODALITES L’école d’affectation reste la même qu’au 1°semestre. Le suivi de stage est réalisé par un Inspecteur de l’Education Nationale (IEN) et son équipe de circonscription. L’évaluation ( soutenance orale à partir d’un compte-rendu écrit ) est faite par un IEN.

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ère Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal

100 % Soutenance orale du rapport de stage 10 minutes d’exposé 20 minutes d’entretien

100 % Soutenance orale du rapport de stage 10 minutes d’exposé 20 minutes d’entretien

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3L6PE6M - DIDACTIQUE DES LANGUES 2

Enseignante Responsable : Marie-Pilar RIC Secrétariat pédagogique : Mme Sylvie ORTHLIEB

UFR SVT – Bât 4R3 b3 – Porte 108 bis – 1er étage 118 route de Narbonne – 31062 TOULOUSE CEDEX 04

05 61 55 69 08 [email protected]

Semestre 6 – 4 ECTS COURS TD TP

4h 20 h - Equipe pédagogique : Marie-Pilar RIC (IUFM Midi-Pyrénées)

OBJECTIFS ET CONTENUS

Connaissance des nouveaux programmes : • Objectifs langagiers et mise en œuvre de chaque cycle • Aperçu de la politique des langues

L’approche communicationnelle :

• Les compétences : écouter et comprendre, s’exprimer à l’oral, s’exprimer à l’écrit • Les outils pour comprendre et parler la langue • Didactiser un document au regard des objectifs communicationnels

Langue et langage :

• Renforcer la maîtrise de la langue et inscrire cet enseignement dans une réflexion sur le langage

Approche culturelle et interdisciplinarité :

• L’enseignement de la culture à l’école primaire • Des projets interdisciplinaires au service de l’ouverture sur le monde et sur les

autres

Modalités d’Evaluation 1ère Session 2ème Session

C. Continu C. Terminal C. Continu C. Terminal -

100 % (écrit)

-

100 % (écrit)

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