Structure et Fonction des Protéines 2

• 3 crédits• 24 heures de cours

– Amphi 2– 12 janvier-> 4 mars

• 8 heures de TP– Bio Cell : 8 / 26 mars– Bioch : 29 mars 23 avril

• Responsable – Jean-Pierre Duneau– jean-pierre.duneau@univmed.fr

Structure et Fonction des Protéines 2

• 3 crédits•24 heures de cours (12 jan-> 4 mars)

– I Modifications post-traductionnelles des protéines• Pr. Assou El-Battari • 14 heures• Les Mardi à 14h00 + jeudi 4/03 à 8h00

– II Relation Structure-Dynamique-fonction• Jean-Pierre Duneau• 10 heures• Les Jeudi à 8h sauf le 28/01 -> Mercredi 27/01

Maturation structurale et fonctionnelle des protéines

1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels2- Modifications co- et post-traductionnelles

La glycosylation2.1: Les glucides (Rappel)2.2: La N-glycosylation (modification co-traductionnelle)2.3: La O-glycosylation (modification post-traductionnelle)

3- Formation des protéoglycanes et glycosaminoglycanes Synthèse de l'héparine et de l'acide hyaluronique

4- Anchrage GPI des protéines membranaires (Glypiation)5- Autres modifications co- et post-traductionnelles

5.1: Formation des ponts disulfures5.2: Clivage protéolytique. Exemple des facteurs de coagulation 5.3: Amidation, acylation, sulfatation, phosphorylation

1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels

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GlcNAc-PP-Dol

GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol

Man1 - 4GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol

UDP-GlcNAc

UMP

Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase

UDP-GlcNAc

UDP

N-acétylglucosaminyl diphosphodolicholN-acétylglucosaminyltransférase

GDP

Dolichol diphosphochitobiosemannosyltransférase

GDP-Man

4GDP

Glycolipide -mannosyltransférases4(GDP-Man)

CY

TO

PL

AS

ME

PP-Dol

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3

Man1Man1 - 2Man1

Man1 – 2Man1 Dol-P-Man glycolipide-mannosyltransférase

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3

6Man13

Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Glycolipide -glucosyltransférase

RE

TIC

UL

UM

Flippase

P-Dol

GlcNAc-PP-Dol

GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol

Man1 - 4GlcNAc1- 4GlcNAc-PP-Dol

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3

Man1

Man1 - 2Man1 - 2Man1

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3

6Man13

Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 – 2Man1

Man1 - 2Man1

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-PP-Dol3

6Man13

Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

6Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc-Asn.peptide3

6Man13

Glc1 - 2Glc1 - 3Glc1 - 3Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

6Man1 - R3

6Man13

Glc1 - 3Man1 - 2Man1 -2Man1

Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man16Man1 - R3

6Man13

Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

6Man1 - R3

6Man13

Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1

UDP-GlcNAcUMP

Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase

UDP-GlcNAcUDP

N-acétylglucosaminyl diphosphodolicholN-acétylglucosaminyltransférase

GDPDolichol diphosphochitobiose

mannosyltransférase

GDP-Man

4GDPGlycolipide -mannosyltransférases4(GDP-Man)

4Dol-PDol-P-Man glycolipide-mannosyltransférase

4(Man-P-Dol)

3Dol-PGlycolipide -glucosyltransférase3(Glc-P-Dol)

PP-DololigosaccharidyltransférasePeptide-(Asn-X-Ser/Thr)

1 Glc

1 Glc

Mannosyl-oligosaccharide-glucosidase I

-glucosidase II

UDP-GlcUDP

Glc

UDP-Glc:1,3glucosyltransférase

-glucosidase II

1 Man Mannosyl-oligosaccharide1,2--mannosidase IA

cyto

pla

sme

lum

ière

Figure 1 : Biosynthèse des N-glycannes dans le RE

R

RE

P

ERp57(disulphide isomerase)protein foldingon/off calnexin

glucosyl-transferase

-glucosidase II

-glucosidase I & II

P

Glc

GlcMan

Man

Glc

other chaperones

P

G II

P

cx

ER

Golgi

P

EDEM

EDEM

proteasome

Sec61

mannosidase

ERGIC-53

64Man1 - 4GlcNAc1 - 4GlcNAc1 - Asn3

64 Man13

GlcNAc1

GlcNAc1

GlcNAc1

GlcNAc1

64 Man13

GlcNAc1

GlcNAc1

GnT V

GnT VI

GnT II

GnT III

GnT IV

GnT I

6Man1 - R3

6Man13

Man1

Man1

Man16Man1 R3

Man1

Man1

6Man1 - R3

6Man13

GlcNAc1-2Man1

Man1

Man1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

6Man13

GlcNAc1-2Man1

Man1

Man1 64GlcNAc1- 4GlcNAc-Asn-peptide

Fuc1

6Man1 - R,R ’3

Man1

GlcNAc1-2Man1

6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

Man1

GlcNAc1-2Man1

6Man1 - R, R ’3

GlcNAc1-2Man1

GlcNAc1-2Man1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

GlcNAc1-2Man1

GlcNAc1-2Man1

6Man1 R,R ’3

6Man12

GlcNAc1-2Man1

GlcNAc1

GlcNAc1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

6Man12

GlcNAc1-2Man1

GlcNAc1

GlcNAc1

6Man1 - R,R ’34

Man12

GlcNAc1- 2Man1

GlcNAc1

GlcNAc1

6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

4Man12

GlcNAc1-2Man1

GlcNAc1

GlcNAc1

6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

4Man12

GlcNAc1

GlcNAc1

6Man12

GlcNAc1

GlcNAc16Man1 - R,R ’34

Man12

GlcNAc1

GlcNAc1

6Man12

GlcNAc1

GlcNAc16Man1 - R,R ’34

Man12

GlcNAc1

GlcNAc1

6GlcNAc1 - 4Man1 2

GlcNAc1

GlcNAc1 6GlcNAc1 - 4Man1 - R,R ’ 3

4Man12

GlcNAc1

GlcNAc1

6GlcNAcb1 - 4Man1 2

GlcNAc1

GlcNAc1

R ’

GnT III

GnT III

GnT III

GnT III

GnT III GnT III

GnT III

GnT V

GnT IV

GnT VI

GnT IVGnT V

Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6--mannosidase II

GnT II

GnT I Glycoprotéine-6--L-fucosyltransférase

Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6--mannosidase III

GnT I

Figure 4 : Action des GnTs dans la biosynthèse des N-glycannes. R= 4GlcNAc1 -4GlcNAc-Asn.peptide, R ’=

6Man1 - R3

6Man13

Man1 - 2Man1 - 2Man1

Man1 - 2Man1

Man1

Mannosyl-oligosaccharide1,2--mannosidase IB

GnT IV

6Man1 - R,R ’34

Man12

Man1

GlcNAc1

GlcNAc1

64GlcNAc1- 4GlcNAc-Asn-peptide.

Fuc1

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