Séminaire suisse des petits fruits 2018Résistance aux fongicides du pathogène de la pourriture griseChristian Wohler, Carole Werdenberg, Hagen Thoss, Marilena Palmisano, Max Kopp, Michael Mannale, Vincent Michel

Résistance aux fongicides du pathogène de la pourriture grise des fraisiers

04.12.2018 2

Source : Vincent Michel

Contenu

• Brève présentation du projet• Bases du développement de résistances• Résultat du monitorage

04.12.2018 3

Source : Vincent Michel

Fondements du projet• La pourriture grise est la maladie

principale dans les fraisières • Pertes estimées par année en Suisse : 10 à 15 %• Retours subjectifs : Les botryticides ne sont pas assez

efficaces• Augmentation mondiale des souches MDR les cinq

dernières années • Plan d’action national Protection phytosanitaire CH ->

Diminution 50 %

04.12.2018 4

Source : Vincent Michel

04.12.2018 5

Source : MUCF (http://minoruses.eu/ )

Les dix principaux « usages mineurs » en culture fruitière et maraîchère

Pourquoi ?

• S’agit-il d’un problème de résistance et/ou d’application ?

• Comment analysons-nous la problématique?

• Quelle suite à l'échelon national ?

04.12.2018 6

Source : Vincent Michel

Partenaire de projet

04.12.2018 7

Ce qui a été fait

• Monitorage pendant deux ans (étude de faisabilité) sur dix fraisières dans quatre cantons

• Resp. septante et cent échantillons de botrytis ont été collectés chaque année entre mai et juin

• Chaque année, des analyses microbiologiques et de génétique moléculaire ont été pratiquées sur septante souches

• Une publication a eu lieu ; une autre suivra• Perspectives : Le projet sera étendu au plan national04.12.2018 8

04.12.2018 9

Types de résistance

Résistance quantitative

Résistance qualitative

• Perte d’efficacité subite totale, presque toujours irréversible, par exemple de la strobilurine

• Absorption et transport de substance active moindres

• Désactivation renforcée=> Perte d’efficacité lente et réversible, par exemple de l’iprodione

Bases du développement de résistances

04.12.2018 10

Types de résistance

Résistance quantitative

Résistance qualitative

Supposition/Cause : • Dose sublétale=> Technique d’application, dose

Suppositions/Cause :• Des mutants existent• Ils émergent indépendamment de

l’application par mutagenèse induite non dirigée

• La mutagenèse induite directement par la substance peut être exclue

04.12.2018 11

Types de résistance

Résistance quantitative

Résistance qualitative

• Perte d’efficacité totale simultanément par plusieurs substances actives

=> Renforcement du métabolisme à l’avantage des pompes efflux

Résistances multiples (MDR)

Résistances multiples à botrytis• MDR1

Résistance partielle au fludioxonil et au cyprodinil (groupe 2 WS)

• MDR1 hRésistance plus importante au fenhexamid, boscalide, pyraclostrobine, fludioxonil ou cyprodinil (groupe 5 WS)=> uniquement sur fraisier !

• MDR2Résistance partielle au fenhexamide, cyprodinil et iprodione (groupe 5 WS)

• MDR3Contient le spectre de résistances de MDR1 et MDR2

04.12.2018 12

Résultats résistances au botrytis dans les fraisiers 2017/18

04.12.2018 13

Source : Vincent Michel

Source : Vincent Michel

Substances actives analyséesSubstance active

Produit Mode d’action

Boscalide Cantus C2 : Inhibition de la chaîne respiratoireFluopyram Moon Privilege C2 : Inhibition de la chaîne respiratoireFenhexamide Teldor G3 : Inhibition de la synthèse d’ergostérolFenpyrazamine Prolectus G3 : Inhibition de la synthèse d’ergostérolCyprodinil Switch, Play, Avatar D1 : Inhibiteur de la synthèse de méthionine

et bloqueur de la sécrétion d’enzymeMépanipyrim Frupic SC D1 : Inhibiteur de la synthèse de méthionine

et bloqueur de la sécrétion d’enzymePyriméthanil Pyrus 400 SC, Papyrus D1 : Inhibiteur de la synthèse de méthionine

et bloqueur de la sécrétion d’enzymeIprodione Baldo E3 : Perturbation de la régulation de la

chaîne de signauxFludioxonil Saphire, Switch, Play, Avatar E2 : Perturbation de la régulation de la

chaîne de signaux04.12.2018 14

Résultats du monitorage de botytis 2017/18 par la biologie moléculaire (test de croissance)

04.12.2018 15

2017Ø 4.31 résistances par souche

de botrytis

Médiane 5.00

55 % des souches de botrytis présentent plus de cinq

résistances

2018Ø 4.14 résistances par souche

de botrytis

Médiane 4.00

43 % des souches de botrytis présentent plus de cinq

résistances

Source : Vincent Michel

Nombre moyen de résistances par parcelle en 2018

04.12.2018 16

Nomb

re de

ré

sistan

ces

Parcelles

Biologie moléculaireModification des résistances à botrytis entre la première et la deuxième feuille

04.12.2018 17

Source : Vincent Michel

Résistance multiplesMicrobiologie

04.12.2018 18

Toutes les souches de botrytis dans les champs analysés (n = 70) présentent en 2018 43 % (56 % l’année précédente) plus de cinq résistances pour une concentration de substance active de ≥100 ppm.

1R = 1 résistance

Source : Vincent Michel

Résultats du monitorage de botrytis 2017/18 par la biologie moléculaire

04.12.2018 19

2017Le potentiel de résistance est d’Ø

72 % pour toutes les sections génétiques analysées

Le potentiel de résistance génétique est de 69 % sur les

fraisiers âgés d’une année

2018Le potentiel de résistance est d’Ø

59 % pour toutes les sections génétiques analysées

Le potentiel de résistance génétique est de 61 % sur les

fraisiers âgés d’une année

04.12.2018 20

Résistances mises en évidence génétiquement

En po

ur

cent

E3E2G3C2C3

Biologie moléculaireModification des résistances à botrytis entre la première et la deuxième feuille

04.12.2018 21

Poten

tiel d

e ré

sistan

ces

Test de croissance

Résistances multiples (MDR)Biologie moléculaire

04.12.2018 22

MDR1 : fludioxonil et cyprodinil

Présence dans les vignes et dans les fraisières

MDR1h: Fenhexamide, boscalide, pyraclostrobine, fludioxonil ou cyprodinil

Présence dans les fraisières

Influence de la dose de substance active

04.12.2018 23

• Le sous-dosage entraîne la formation de résistances quantitatives (réversible). ⇒ Attention : Même en cas de dosage total, on observe par

endroits des effets de raréfaction dans les cultures ! Technique d'application !

• L’émergence de la résistance qualitative (irréversible) est indépendante du dosage. Les hautes doses tendent plutôt à accélérer la sélection disruptive.

=> Il faut impérativement appliquer les dosages préconisés selon l’homologation !

Influence de la forme sur la résistance

04.12.2018 24

Mauvaise forme Résistance plutôt réversible dans une population

Par exemple pause

d’application de la substance

active

Bonne formeRésistance en général irréversible dans une

population

Substance active inefficace

Les MDR ne présentent pas de perte de forme

Le champignon perd en vivacité lorsque la pression fongicide est

faible.

Directives FRAC (extrait)Fungicide Resistance Action Committee

En cas d’application d’anilinopyromidines (AP) contre botrytis(WS Cyprodinil, Mepanipyrim und Pyrimethanil / MoA = D1) observer ce qui suit :

• Quand trois maxi de traitements sont effectués par saison, il faut limiter les applications de produits contenant des AP à une par saison.

• En situation avec quatre à six traitements contre botrytis par culture et par saison, deux applications maxi de produits contenant des AP sont préconisées.

04.12.2018 25

• En situation nécessitant sept ou plus de traitements contre botrytis par culture et par saison, trois applications maxi de produits contenant des AP et deux applications consécutives maxi sont préconisées.

• Pour que la gestion des résistances soit cohérente, il serait nécessaire d’appliquer les bonnes pratiques agricoles y compris les mesures et la protection phytosanitaires, pas que dans la pratique commerciale mais aussi dans la production de jeunes plants.

=> Respectez les préconisations d’application.

Sources : http://www.frac.info/working-group/ap-fungicides/general-use-recommendationshttp://www.frac.info/docs/default-source/publications/frac-code-list/frac_code_list_2018-final.pdf?sfvrsn=6144b9a_2

04.12.2018 26

Perspective

• Des stratégies de lutte contre botrytis seront mises au point d’après l’étude de faisabilité ; l’efficacité et les résidus seront vérifiés par monitorage.

• Des moyens d’aide seront créés et la formation à une technique d’application prometteuse sera étudiée.

• Le but est d'étendre le programme à tout le pays au travers d’un projet d’utilisation durable des ressources.

04.12.2018 27

La connaissance des résistances existantes est condition préalable pour une stratégie efficace contre botrytis.

04.12.2018 28

Littérature• Leroch, M., Plesken, C., Weber, R. W. S., Kauff, F., Scalliet, G., & Hahn, M. (2013). Gray Mold

Populations in German Strawberry Fields Are Resistant to Multiple Fungicides and Dominated by a Novel Clade Closely Related to Botrytis cinerea. Applied and Environmental Microbiology, 79(1), 159–167. https://doi.org/10.1128/AEM.02655-12

• Mosbach, A., Edel, D., Farmer, A. D., Widdison, S., Barchietto, T., Dietrich, R. A., Scalliet, G. (2017). Anilinopyrimidine Resistance in Botrytis cinerea Is Linked to Mitochondrial Function. Frontiers in Microbiology, 8. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.02361

• Rupp, S., Weber, R. W. S., Rieger, D., Detzel, P., & Hahn, M. (2017). Spread of Botrytis cinerea Strains with Multiple Fungicide Resistance in German Horticulture. Frontiers in Microbiology, 7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.02075

• Weber, R. W. S., & Entrop, A.-P. (2011). Multiple Fungicide Resistance in Botrytis: A Growing Problem in German Soft-Fruit Production,. In Fungicides - Beneficial and Harmful Aspects (pp. 45–60). INTECH Open Access Publisher. Retrieved from http://www.intechopen.com/books/fungicides-beneficial-and-harmful-aspects/multiple-fungicide-resistance-inbotrytis- a-growing-problem-in-german-soft-fruit-production

04.12.2018 29

• FRAC Code List 2018-final v2. http://www.frac.info/publications/downloads • J. Hallmann, A. Quadt-Hallmann, A. von Tiedemann, 2007, Phytomedizin, Grundwissen

Bachelor, Ulmer UTB.• Bent J. Nielsen (2017): Fungicidresistens i gråskimmel i danske jordbærmarker, Aarhus

Universitet• Arne Stensvand (NIBIO/NMBU), Gunn Mari Strømeng (NIBIO), Jørn Haslestad (NLR), Rune

Vereide (NLR) (2017): Fungicidresistens hos gråskimmel-soppen i jordbær og bringebær.• Roland W. S. Weber (2017): Fungicide resistance in Botrytis on strawberries and other soft-fruits,

Esteburg – Obstbauzentrum Jork, Dept. of Food Science, Aarhus University • R. Jung (2018): Integrierte Produktion. Am Beispiel der Grauschimmelfäule. Spargel & Erdbeer

Profi 2/2017• U. Henser (2018): Botrytis Fruchtfäulen in Erdbeeren, Spargel & Erdbeer Profi 2/2018

04.12.2018 30