recherche d’articles scientifiques pubmed et cochrane · 1 février 2016 recherche d’articles...

Marie-Claude Laferrière

1 février 2016

Recherche d’articles scientifiques PubMed et Cochrane

PHT-U001 Introduction à la recherche clinique

appliquée à la physiothérapie manuelle orthopédique

2BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL

Plan de la présentation

Les opérateurs booléens

Méthodes de recherche

> Mots-clés et Descripteurs

Interroger PubMed et Cochrane Library



• Définissent les relations entre les termes ou les groupes de termes.

• Très utiles afin de raffiner une requête : inclusion ou exclusion d’éléments précis.

Rappel

AND OR NOT



Rappel

AND (ET)

Limite la recherche à

l’intersection des

concepts

OR (OU)

Unit les différents

concepts

NOT(SAUF)

Exclut un ou plusieurs

concepts non souhaités

Précise la recherche,

mais ATTENTION

Exercices Activité

physique

AdultesPersonnes

âgées

Cancer Douleur


Méthodes de recherche• Mots-clés • Descripteurs


Recherche par mots-clés

Rappel

• Peut s’effectuer dans tous les mots ou expressions de la notice d’un article scientifique.

• Lors d’une recherche par sujet, il est recommandé de limiter celle-ci au titre et au résumé.


Recherche sujet ou par descripteurs

Rappel

• S’effectue uniquement dans les mots ou les expressions inscrits dans le champ Sujets de la notice d’un article scientifique.

• Les termes ou les expressions présents dans le champ Sujets sont choisis à partir d’une liste préétablie de termes (thésaurus).– Plusieurs descripteurs par référence.– Peu importe le vocabulaire utilisé par les auteurs, les

descripteurs attribués pour les mêmes sujets sont identiques.


Recherche sujet ou par descripteurs

Rappel

• La plupart des bases de données publient un thésaurus qui est intégré au logiciel de la base.

Medline

MeSH (MedicalSubject

Headings)

CINAHL

Descripteurs CINAHL

Cochrane

MeSH (même que

Medline)

SPORTDiscus

Sports Thesaurus

PsycINFO

Thesaurus (sous

l’onglet « Term

Finder »)

Embase

Emtree

Interroger PubMed

et Cochrane Library


Accès

Clic sur PubMed


Medline

• Dépouille et indexe plus de 5 600 revues biomédicales provenant d’environ 80 pays pour un total de plus de 25 millions de références d’articles.

• Références des années 1940 à aujourd’hui.

• Documents principalement en anglais (environ 40 langues).

• Interrogation uniquement en anglais

– Titres, résumés et descripteurs toujours en anglais, même si l’article est en langue étrangère.

Base de données bibliographiques


PubMed vs Medline

• Medline (articles avec les MeSH).

+

• Articles publiés dans les périodiques qui n’ont pas encore été acceptés dans Medline (As supplied by publisher).

• Articles en prépublication qui ne sont pas encore indexés ou publiés (PubMed in-process).

• Articles provenant de revues indexées sans toutefois couvrir un sujet en santé (ex. : astrophysique).

• Articles provenant de journaux faisant partie de PubMedCentral, mais sans être inclus dans Medline.

PubMed comprend Medline et bien plus


Trouver et traduire du vocabulaire

• Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)

• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)

• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)

Dictionnaires

• Notes de cours

• Manuels

• Articles scientifiques

Autre documentation

Vous!

http://www.hetop.eu/hetop/

http://www.granddictionnaire.com/

http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra


Règles d’écriture dans PubMed

• Par défaut, accentuations supprimées.

• Les opérateurs booléens en anglais et en majuscules.

– Deux ou plusieurs termes séparés d’une espace = AND.

– Utiliser OR pour rechercher des synonymes et NOT pour exclure des termes.

• Expression exacte encadrée de guillemets anglais = « cystic fibrosis ».

• Tronquer (*) un terme pour repérer l’ensemble de ses variantes = child* child, children, childhood, etc..


Raffiner la requête

• Grâce aux filters (à gauche de la liste de résultats)– Date de publication

– Type d’articles

– Langues

– Âge

– Genre

– Etc.

2016

2016

20002010


1. Recherche simple

Recherche par termes ou expressions dans toute la notice

(donne souvent beaucoup trop de résultats)

2. Recherche avancée

Recherche par auteur, journal, date de publication, etc.

3. Recherche par le MeSH Database

Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à

chaque article

4. Clinical Queries

Interface spécialement désignée pour la recherche d’études

sur le pronostic et le diagnostic

Modes d’interrogation


Recherche simple

Vous cherchez des articles sur l’étourdissement chez les adolescents.

Dans la boîte de recherche simple, écrire Dizziness et cliquer

sur la limite Adolescent: 13-18 years.

Attention ! Regardez en bas à droite la boîte Search Details


Recherche simple - Exercice

Combien trouvez-vous de méta-analyses sur

le syndrome du canal carpien?

49

Boîte de recherche : "carpal tunnel syndrome"

Article types : meta-analysis


Recherche avancée

Vous cherchez des articles de l’auteur B.E. Gibson parus dans

Physiotherapy Canada.

Rechercher la revue Physiotherapy Canada dans le champ Journal et l’auteur Gibson BE dans le champ Auteur.


Recherche avancée - Exercice

Combien trouvez-vous d’articles publiés dans

le Journal of bodywork and movement

therapies en 2015?

99 Journal : Journal of bodywork and movement therapies

AND

Filter Publication Dates : From 2015/01/01 to 2015/12/31


Recherche MeSH

• Recherche uniquement dans le champ MeSH.

• Utilise le vocabulaire contrôlé de la base de données.

• Recherche plus précise et résultats plus pertinents.


Définition

Subdivisions

(qualifier un MeSH)

Transformation du MeSH

en concept majeur

Explosion du MeSH par défaut

(inclusion des MeSH plus précis)

Synonymes

Recherche MeSH


Recherche MeSHStructure arborescente

« explosée »

MeSH plus généraux

MeSH plus spécifiques

Suggestion de MeSH


Recherche MeSH - Exemple

Vous cherchez des articles dont le sujet principal est la

chirurgie de la spondylose.

1

2

34


Dans la notice les MeSH s’affichent:

MeSH suivi d’un astérisque → Concept majeur

Terme suivant une barre oblique

après un MeSH → subdivision


Recherche MeSH - Exemple

Vous cherchez des articles dont le sujet porte sur la

réadaptation des patients atteints de parésie.

1

23


Recherche MeSH - Exercices

Combien trouvez-vous de revues

systématiques sur la chirurgie de

l’épicondylite latérale?4

MeSH : Tennis Elbow

Subheading : Surgery

Article types : Systematic Reviews

Combien trouvez-vous d’articles dont le

sujet est l’utilisation de l’électrothérapie

pour traiter les douleurs abdominales?

51

MeSH : Abdominal Pain AND

MeSH : Electric Stimulation Therapy


Clinical Queries

Un ensemble de stratégies de recherche conçues par PubMed pour les

questions touchant le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et l'étiologie.

Très utile pour ceux qui ont besoin d'identifier des articles portant sur la

médecine factuelle (Evidence-Based Medicine).


Clinical Queries

Une seule recherche, trois listes de résultats


Clinical Queries

Critères de sensibilité et spécificité :

• Narrow / specific search : recherche étroite, seuls les

articles les plus pertinents sont retenus

OU

• Broad / sensitive search: recherche plus large, les

articles pertinents et articles connexes

Équations de recherche (ou Filters) réalisées et

utilisées par PubMed pour interroger la base

selon la catégorie de recherche clinique

désirée.


Clinical Queries - Exemple

Vous cherchez des articles (narrow) portant sur la thérapie

des fractures du crâne.


Clinical Queries - Exercice

Combien trouvez-vous d’articles

(narrow) sur le diagnostic d’une

dislocation de l’épaule?

"shoulder dislocation" : 62 résultats

shoulder dislocation : 73 résultats

shoulder* AND dislocat* : 83 résultats

Plus d’une possibilité!


Obtenir le texte de l’article

Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à l’Université Laval.

• Ce dernier est visible avec le Display Settings: Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice.

Si la Bibliothèque n’est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l’article est disponible gratuitement sur le Web.

Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$.

Possibilité de configurer Google Scholar : Obtenir@ULaval


Gestion des résultatsSend to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:

File : enregistrer les notices sélectionnées.

E-mail : envoyer les notices par courriel.

Clipboard : permet de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu’à 500 notices.

Les options File et E-mail sont aussi disponibles dans le Clipboard.

ATTENTION: les notices mises sur le Clipboard seront effacées après 8 heures d’inactivité.


Sauvegarde vos stratégies de recherche

Avec Search details : possibilité d’enregistrer vos requêtes ou stratégies de recherche sous forme d’URL permanente (adresse internet) et les mettre en bookmark (favoris).

Avec un fil de votre recherche.

Avec My NCBI : service de veille de PubMed.• Permet de sauvegarder des stratégies de recherche.

• Permet d’obtenir des alertes par courriel.

• Permet de personnalisé l’interface de PubMed.

• Service simple et gratuit, mais nécessité de s’inscrire et de définir des codes d’accès.

Créez votre compte My NCBI


Pour plus d’information!

• PubMed

– Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm

– Guide d’utilisation : • PubMed : http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline

• MeSH : http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh

– PubMed help – Guide exhaustif de la NLM http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp.html

http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm

http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline

http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh

http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp.html


The Cochrane Library

• Ressource à privilégier dans la recherche de revues systématiques et de méta-analyses.

– Producteur : Initiative du groupe Cochrane (regroupement de chercheurs provenant de partout dans le monde).

– Objectif : Aider les professionnels de la santé à prendre de bonnes décisions lors de leurs interventions cliniques.

– Contenu : Six bases de données différentes, la plus importante étant la Cochrane Database of SystematicReviews (Cochrane Reviews).


Contenu

Nom de la base ContenuNombre d’articles

Cochrane Database of Systematic ReviewsLes revues systématiques produites par un

groupe Cochrane (texte intégral).9 143

Database of Abstracts of Reviews of EffectsLes revues systématiques autres que Cochrane

(Surtout DARE).36 795

Cochrane Central Register of Controlled TrialsLes études cliniques à la base des revues

systématiques.901 197

*The Cochrane Methodology Register(pas de nouveauté depuis juillet 2012)

Les études sur les méthodologies employées pour les revues systématiques.

15 764

Health Technology Assessment DatabaseLes études sur l’évaluation de la technologie

médicale.15 417

The NHS Economic Evaluation DatabaseLes études sur le coût/avantage des

interventions cliniques.15 015


1. Parcourir

Permet de bouquiner pour un article par sujet, par groupe

Cochrane ou par base de données.

2. Recherche simple

Recherche dans toutes les bases de données de la

Cochrane Library.

3. Recherche avancée (Advanced Search)

Recherche par auteur, titre, résumé, etc.

4. Recherche MeSH

Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à

chaque article.

Modes d’interrogation


Parcourir

• Vous pouvez naviguer dans les menus pour trouver un article par sujet, par groupe Cochrane ou par base de données.


Recherche simple

Une boîte de recherche.

Recherche dans toutes les bases de données Cochrane.

Troncature et guillemets anglais fonctionnent.

Écrire les termes en anglais.


Recherche avancée

• Semblable à la recherche simple sauf qu’il est possible de:– sélectionner un champ de recherche spécifique dans le menu

déroulant;– ajouter des boîtes de recherche et de les relier avec les opérateurs

booléens.• Limitation selon la base de données se fait une fois les résultats

obtenus, tout comme pour la recherche simple.


Recherche MeSH

Accès par la recherche avancée

Le vocabulaire contrôlé est celui des MeSH, comme dans Medline.


Recherche MeSH

Explosion du MeSH Résultats par base de données

Combinaison de recherches

Définition

Liste de

résultats

de MeSH


Search Manager

L’historique de recherche n’est pas automatique dans Cochrane. Les recherches doivent être ajoutées au SearchManager (Add to Search Manager).

Permet de combiner plusieurs recherches.

• Ex: (#1 and (#2 OR #3))


Notice détaillée

MeSH

Titre

Résumé

Tableaux


Est-ce que la physiothérapie est bonne pour les personnes souffrant

de fatigue chronique?

« Les patients atteints de syndrome de fatigue chronique peuvent généralement bénéficier d'une thérapie par l'exercice et se sentir moins fatigués après celle-ci, et

rien n'indique que la thérapie par l'exercice pourrait aggraver leurs résultats ».

Référence: Exercise therapy for chronic fatigue syndrome, Février 2015

Quel type de physiothérapie a un meilleur rapport coût-efficacité pour

réduire la lombalgie chronique?

“All three interventions for low back pain improved quality of life, time off work, and

health service utilisation. However, from the perspective of the National Health Service (NHS), pain management is likely to be the most cost‐effective strategy because of a

marginally greater effectiveness and lower health care costs”.

Référence: Effectiveness and cost‐effectiveness of three types of physiotherapy used to reduce chronic low back pain disability: a pragmatic randomized trial

with economic evaluation, 2007

Trouvez un Cochrane Review. Trouvez une Economic Evaluation.

Recherche Cochrane - Exercices


Marie-Claude LaferrièreConseillère à la documentationBibliothèque scientifiqueBureau 1018-C418 656-2131, poste [email protected]

Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité.

Service de clavardage de la BibliothèqueOffert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche.

Obtenir de l’aide

mailto:[email protected]

http://www.bibl.ulaval.ca/heures-ouverture/heures-ouverture-services-aide#heures-aide-recherche


Merci!