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M. S. Yahia SIST 2016 : Séries Interopérables et Systèmes de Traitement 29-30 septembre 2016

DOI de DataCite : un système d'identification pour valoriser vos données de la recherche

1

Mohamed S. Yahia, Inist-CNRS


un identifiant pérenne, pourquoi ?

• les documents sont référencés sur le web par des URL qui sont des

mécanismes d’adressages

• si déplacement du document par changement : de serveur, de chemin, de

nom... le lien est brisé, le document n’est plus disponible. On obtient la

page 404

URL n’est donc pas stable

d’où la nécessité d’un identifiant pérenne qui fiabilise la localisation


identifiant pérenne ?

Chaine de caractères

unique

- Personne

- Institution

- Objet

Identifiants Pérennes

association

permanente

dans un

registre &

gestion par

institutions

La persistance est purement une question de service (gestion) et est ni inhérente à un objet, ni

conféré par une syntaxe de nommage particulier


Objectifs

• Accéder à la ressource sur le long terme

• Faciliter la découverte, le partage, la réutilisation des données

• Faciliter la Citation


Historique

Principaux systèmes d’Identifiants pérennes

- Handle(1994)

- PURL (Permanent URL),1995

- DOI (Digital Object Identifier),2000

- ARK (Archival Ressource Key), 2001

- ResearcherID (de Thomson Reuters )2008

- ISNI (International Standard Name Identifier) 2010

- ORCID(Open Researcher and Contributor ID) 2012

PID

Ressource

PID

Auteur, Contributeur


Lequel Choisir ?

ARK, PURL, DOI sont tous des choix valides pour identifier de

manière pérenne des ressources scientifiques sur le web.

• Pourquoi choisir le DOI ?

• 4 raisons principales* :

• DOI est une norme internationale – ISO26324:2012

• Très largement utilisé > de 100 millions

• Coopération entre plusieurs organisations (Crossref, Orcid, RDA…: synergies

• Même si les registres DOI disparaissent le Handle System prendra le relai

*http://www.crisp-fp7.eu/fileadmin/user_files/doc/Milestones/CRISP_MS7.pdf

le DOI s’appuie sur le système Handle pour construire

une infrastructure sociale qui garantit la pérennité


DOI

• Contrôlé et géré par IDF ( International DOI Foundation)

• IDF est composé de 10 agences d’enregistrement (RA)

• dont les plus importantes sont :

• CrossRef

• DataCite

DataCite et Crossref sont des RA bien développées, mais seule DataCite fournit les solutions les mieux adaptées pour les jeux de données scientifiques

Airiti, Inc.

CrossRef

China National Knowledge Infrastructure (CNKI)

DataCite

EIDR (Entertainment Identifier Registry)

ISTIC (The Institute of Scientific and Technical Information of China)

JaLC (Japan Link Center)

KISTI (Korea Instituteof Science and Technology Information)

mEDRA (Multilingual European DOI Registration Agency)

OP (Publications Office of the European Union)

Institution membre

Data CentreData CentreCentre données

DataCite

FondationInternationale DOI

ex : ILL,

Inist-CNRS


Consortium international à but non lucratif

Créé en décembre 2009 à Londres

Centré sur la valorisation des données de la recherche.

36 membres au 09/2016


Infrastructure technique de DataCite

Agence d’Enregistrement DataCite :

• support dl'infrastructure de résolution (Handle)

• mise en place des politiques et des bonnes pratiques

• coordination avec les parties prenantes ayant les mêmes objectifs

• création et mise à jour de schéma de métadonnées

• maintient une base de métadonnées consultable et moissonable

• gestion des identifiants sur le long terme

• gestion des services de découverte (moteur de recherche, annuaire de bases de

données)

• soutien et aide aux utilisateurs à la creation des fichiers de métadonnées et des DOI

les utilisateurs (centres de données, organismes de recherche,

producteurs de données) sont responsables de :

• assurance qualité des données

• maintien, persistance et mise à disposition du contenu scientifique doté de DOI

• création des identifiants

• création et mise à jour des métadonnées


En plus de l’infrastructure technique, DataCite s’appuie sur une infrastructure sociale

* https://blog.datacite.org ** https://groups.google.com/forum/?hl=en#!forum/datacite-metadata

10

Infrastructure Sociale de DataCite

composée de 3 Steering Groups ou groupes de pilotage:

• sustainability and business steering group (sbsg)

• services and technology steering group (stsg)

• community engagement steering group (cesg)

Chaque Steering Group pilote des groupes de travail (WG)

Une couche supplémentaire d’infrastructure sociale

renforce la réactivité de DataCite en remontant et

en rapportant les retours d’expérience des usagers.

(blog*,groupe de discussion**).

DataCite collabore également avec

plusieurs organisations à travers le monde

sur différents aspects de la valorisation des

données de la recherche (Crossref, ORCID,

RDA, Codata,…)

https://blog.datacite.org/

https://groups.google.com/forum/?hl=en#!forum/datacite-metadata


Services de DataCite

• DataCite Metadata Store (MDS)

Création DOI et enregistrement des métadonnées associées

https://mds.datacite.org

• DataCite Metadata Schema

Schéma de métadonnées DataCite

http://schema.datacite.org

• DataCite OAI Provider

Exposition des métadonnées de la base DataCite moissonables selon le

protocole OAI-PMH http://oai.datacite.org

• DataCite Metadata Search

Moteur de recherche des jeux de données enregistrées dans la base DataCite

http://search.datacite.org

https://mds.datacite.org/

http://schema.datacite.org/

http://oai.datacite.org/

http://search.datacite.or/

http://stats.datacite.org/


Attribuer des DOI

o Se renseigner sur les règles de propriété intellectuelle et sur le cadre

juridique en vigueur pour savoir si les données peuvent-être disséminées.

o Evaluer et sélectionner les données à conserver et à partager

o Déterminer et fixer la granularité de vos jeux de données en fonction des

besoins et de la citation

Réflexions préalables à mener sur les données à identifier par un DOI


Attribuer des DOI

La granularité décrit le degré d'agrégation de l'objet à enregistrer.

DataCite n’impose aucune restriction sur le niveau de granularité

il est possible d’attribuer des DOI à des entités de différents niveaux d’un même objet

les DOI sont principalement conçus pour la citation et la découverte de ressources.

Chaque entité devrait avoir un sens indépendant de l’ensemble plus large ou la

collection à laquelle il peut appartenir

le Schéma de métadonnées DataCite comprend un champ pour préciser les relations

entre les objets.

Quelle granularité adopter ?


Attribuer des DOI

Citer des données dynamiquesdonnées continuellement ou fréquemment mises à jour

3 approches sont possibles :

1.Citer une partie spécifique (la série de mises à jour effectuées au

cours d’une période donnée ou à un secteur particulier du jeu de

données)

2.Citer un instantané (snapshot) (copie du jeu de données entier à un

moment précis)

3.Citer le jeu de données continuellement mis à jour et incorporer à la

citation la date et l’heure de l’extraction du jeu de données



Cependant ces recommandations ne résolvent pas tous les

problèmes liés à l’accès et à la citation des données dynamiques.

Un groupe de travail de RDA a produit 14 propositions ( à

implémenter par les entrepôts de données) basées sur

l’identification et le stockage des requêtes. Ces propositions sont

en phase d’essai pilote https://rd-alliance.org/group/data-citation-wg/outcomes/data-citation-

recommendation.html

Le centre de données SAHFOS (Sir Alister Hardy Foundation for Ocean

Science) crée, identifie par des DOI et stocke des sous-ensembles

de jeux de données dynamiques à la demande de chercheurs. https://www.sahfos.ac.uk/data/our-data/

https://rd-alliance.org/group/data-citation-wg/outcomes/data-citation-recommendation.html

https://www.sahfos.ac.uk/data/our-data/


Critères spatiaux

Critères temporels


Exemple centre de données SAHFOS :


1- Nom du DOI

- Préfixe attribué par l’agence d’attribution

DataCite

- Suffixe choisi par le centre de données

DataCite recommande que le suffixe soit opaque et

court

longueur maximum du nom DOI: 255 caractères

Attribuer des DOI3 informations nécessaires à la création de DOI

10.xxxxx/abcd_x-x_efg

Préfixe Suffixe



2- URL stable permettant l’accès aux données via

Landing page ou Page de présentation

• des métadonnées descriptives

• les informations concernant les moyens et les conditions d’accès à

ressource (restriction, embargo….)

• les informations pour lire l’objet scientifique (logiciels, contexte,

formats, autres informations nécessaires à l’interprétation….)

• Le format de citation souhaité


Exemple de landing page

Description

des données


Utilisation

des données

Exemple de landing page(suite)



3- Fichier des métadonnées en xml

selon schéma DataCite 4.0 : https://schema.labs.datacite.org/meta/kernel-4.0/

6 éléments obligatoires

https://schema.labs.datacite.org/meta/kernel-4.0/


Schéma de métadonnéesformat de la citation

Kalaydjian Regis, Girard Sophie (2014). Civil marine research effort in

main French research organisations: data and estimates. SEANOE.

http://doi.org/10.17882/44428

Les 5 premières propriétés constituent les éléments de la citation :Creator (PublicationYear): Title. Publisher. Identifier

http://doi.org/10.17882/44428


Schéma de métadonnéesLes 13 propriétés optionnelles


Exemple de propriétéRelatedIdentifier : isCitedBy


Exemple de propriétéRelatedIdentifier : relationType : isPartOf

article

Métadonnées du data package


http://dx.doi.org/10.5061/dryad.bt963/1

data set 1

1122 1122http://dx.doi.org/10.5061/dryad.bt963/2

data set 2 1122


Exemple : lien jeu de données publication


Accessibilité aux ressources par le DOI

Résolution directe par navigateurs : ajouter les plug-in

Firefox : http ://addons.mozilla.org/fr/firefox/addon/10820

Internet Explorer : http://handle.net/resolver/index.html

Cliquable en citation

doi:10.1016/j.dsr.2008.08.009

Sur les site de IDF http://dx.doi.org/

Utilisation du moteur DataCite Metadata Search beta : https://search.datacite.org/ui

Ou en ajoutons le nom de domaine https://doi.org/ devant lenom du DOI dans le navigateur 10.1016/j.dsr.2008.08.009

http://oai.datacite.org/

https://addons.mozilla.org/fr/firefox/addon/10820

http://handle.net/resolver/index.html

http://doi.pangaea.de/10.1016/j.dsr.2008.08.009

http://dx.doi.org/

https://search.datacite.org/ui

https://doi.org/


Inist-CNRSAgence française d’attribution de DOI

Institution membre

Data CentreData CentreCentre données

DataCite

FondationInternationale DOI

ex : ILL

Inist-CNRS

• Lien fort avec le consortium (participation aux groupes de

travail, assemblée générale, stratégie…)

• Sensibilisation aux services DataCite

• Fourniture des préfixes DOI

• Assistance dans la création et la conversion des fichiers de

métadonnées

• Aide au paramétrage de l’API


Workflow d’attribution de DOI par l’Inist-CNRS


Partenariat

• Un contrat formalise les relations entre l’usager et l’Inist-

CNRS

(3 ans reconductible)

Modèle économique :

Membres ESR : cotisation annuelle de 180 € HT

pour un nombre illimité de DOI

Autres usagers : cotisation annuelle de 180 € /HT

pour 500 DOI.

Tarif dégressif au-delà


responsabilités des deux partenaires

• Veiller au respect des règles de bonne pratique édictées par

DataCite :

- qualité des métadonnées,

- URL pérenne,

- persistance des données.

• Accompagner et conseiller à l’utilisation des services DataCite

• Fournir un préfixe(s) de DOI unique(s)

• Fournir un login pour accéder à la plateforme Metadata Store

(MDS) de DataCite

Responsabilités de l’Inist-CNRS


• Qualité et pertinence des données

• Veiller à la conservation et la gestion des données de

manière à garantir leur accessibilité

• Page de présentation ou landing page accessible.

responsabilités des deux partenaires

Responsabilités de l’usager


Informations nécessaires pour créer un centre de données

Informations nécessaires pour créer un

centre de données

1. symbole de l’organisme

2. nom développé de l’organisme

3. nom de la personne contact et son

email

4. nom de domaine où sont stockées les

données

https://mds.datacite.org/?lang=fr

OMP

Observatoire Midi-Pyrénées

Paul Martin [email protected]

sedoo.fr,

obs-mip.fr,

aviso.altimetry.fr



Création de DOI

• Manuelle via Metadata Store (MDS)


• Automatique via l’API

https://mds.datacite.org/static/apidoc


https://mds.datacite.org/static/apidoc


Création de DOI


Mise à jour d’un jeu de données


Mise à jour d’un jeu de données(suite)


Mettre à jour

Ensemble de données



Mise à jour de l’URL


Mise à jour de l’URL

(suite)


Mise à jour des métadonnées


Contact

[email protected]

03 83 50 46 70

mailto:[email protected]


Merci de votre attention

mohamed s. yahia, inist-cnrs - sist 2016 - sciencesconf.org · 2016-10-04 · eidr (entertainment...

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