modélisation moléculaire les outils de la librairie de molécules
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Modélisation moléculaire
Les outils de la librairie de molécules
Un bref historiqueO 1989 : RasMolO 1998 : ChimeO 2002 : RasTopO 2004 : Librairie de moléculesO 2005 : Jmol remplace Chime dans la
librairieO 2007 : MinUSc et fichiers CIFO 2010 : Librairie interactive (clé
concours)O 2012 : Scribmol (construction de
molécules)
Quelles nouveautés ?O Types de données utilisables et donc
objets étudiablesO Traitements applicables aux
moléculesO Ergonomie des outils, conception
des logiciels (interface Homme/Machine)
O Nouvelles déterminations (veille scientifique)
O Structures minéralesO « Petites » moléculesO Cryo-microscopie
électronique 3DO Conservation de
séquences et autres annotations (domaines, localisation des membranes…)
Utiliser de nouvelles données
Réaliser de nouveaux traitements
O Superposer automatiquement des modèles
O Démonter des modèles
O Calculer des surfaces
O Déterminer les interactions non covalentes (hydrophobes,…)
Ergonomie et interfaces
O Visualiser les actions de l’utilisateur : sélection, survol d’un résidu, calcul en cours
O Conserver le travail réalisé : cacher au lieu de restreindre
O Garder le sens de l’orientation : centrer les rotations sur l’affichage
O Donner du sens : informer sur la signification des représentations (légendes, informations)
L’informatique dans le nuage
O Les applications sont disponibles en ligne : pas d’installation, utilisation hors les murs possible
O Les données utilisables et le travail réalisé sont stockés sur le serveur. Pas de manipulation de fichiers.
O Les documents sont échangeables entre utilisateurs
O Les statistiques informent en direct sur les usages