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1 Ministère de l’Agriculture, de l’alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de l’aménagement du Territoire Ecole nationale supérieure des sciences agronomiques de Bordeaux Aquitaine 1 cours du Général de Gaulle CS 40201 33175 GRADIGNAN cedex Mémoire de stage de S8 dominante GIAP de Bordeaux Sciences Agro Aubergine et Verticilliose LE PAUL Sophie Etude réalisée à : Station expérimentale Invenio Sainte-livrade Maître de stage : Mr Henri CLERC

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Ministère de l’Agriculture, de l’alimentation, de la Pêche, de la Ruralité et de

l’aménagement du Territoire

Ecole nationale supérieure des sciences

agronomiques de Bordeaux Aquitaine 1 cours du Général de Gaulle – CS 40201 – 33175 GRADIGNAN cedex

Mémoire de stage de S8 dominante GIAP de Bordeaux Sciences Agro

Aubergine et Verticilliose

LE PAUL Sophie Etude réalisée à : Station expérimentale Invenio Sainte -l ivrade

Maître de stage : Mr Henri CLERC

2

Préface

J’ai effectué mon stage de fin de seconde année (semestre 8) au sein de l’entreprise INVENIO, située

dans le Lot et Garonne ou j’ai travaillé sur la station expérimentale de Sainte Livrade sur Lot.

INVENIO est le centre de recherche et d'expérimentation de la filière Fruits et Légumes d'Aquitaine. Il

est né de la volonté des acteurs de la filière de se doter de ses propres équipes de recherche et

d'expérimentation. INVENIO a pour mission de répondre aux besoins des producteurs de la filière,

de leur fournir des avantages concurrentiels par l'amélioration de leur production et des qualités de

leurs produits.

INVENIO est né en mai 2010 de la fusion d’Hortis Aquitaine (Station expérimentale spécialisée en

culture légumière et machinisme) et de Cirea (Centre Interrégional d’Expérimentation Arboricole).

Son directeur est Mr Pierre Gaillard et son président Mr Vincent Schieber.

L’entreprise est présente sur 7 sites dans le grand Sud Ouest au sein desquels on retrouve différents

pôles spécialisés. Sur le site de Sainte Livrade, on retrouve un pôle fraise, agroécologie et

melon/poivron, aubergine, courgette/salade sur lequel j’ai travaillé.

Remerciements

Je remercie l’entreprise INVENIO de m’avoir accueillie au sein de leur structure et plus

particulièrement Mr Henri Clerc qui a encadré mon stage, pour sa disponibilité et sa sympathie.

Je remercie également toute l’équipe présente sur la station avec qui j’ai pu travailler, pour avoir

contribué au bon déroulement de ce stage.

3

Résumé

Sur les cultures d’aubergine, l’utilisation du greffage et de la résistance variétale se généralise en

remplacement de la désinfection chimique dans la lutte contre le champignon tellurique Verticillium

dalhiae. Cette technique permet de lutter contre certains bioagresseurs telluriques mais apporte

aussi un gain de productivité. Or on observe depuis plusieurs années un contournement des

résistances avec notamment l’apparition de nouvelles races de Verticilliose. De nombreux essais ont

donc été menés afin de trouver des méthodes alternatives permettant de lutter contre le pathogène

V.dalhiae, méthodes qui associées au greffage, pourront permettre d’assurer la durabilité des

solutions génétiques. Les recherches menées depuis 2005 sur la station INVENIO ont portées sur

l’utilisation de champignons antagonistes, sur d’éventuelles interactions entre micro-organismes du

sol, mais aussi sur l’usage de méthodes de lutte chimique. Les différents essais n’ont pas permis de

mettre en évidence l’efficacité de ces méthodes face à V.dalhiae. L’utilisation du greffage risque

donc d’être remise en cause si de nouvelles techniques ne sont pas trouvées rapidement.

Abstract

On eggplant crop, the use of grafting and varietal resistance is becoming more and more general

instead of the use of chemical disinfection in the fight against the fungi Verticillium dalhiae. This

technique helps to fight against some terrestrial pests but also give more productivity. It can be

observed for several years a circumvention of resistance, especially with the emergence of new

strains of Verticilliose. That’s why numerous trials have been conducted, in order to find new

alternative methods to struggle the pathogen V.dalhiae, combined with grafting, these methods

should insure the durability of genetic solutions. The research conducted on the INVENIO station

since 2005 were focused on the use of antagonistic fungi, on the potential interactions of micro-

organisms into the soil, on finding new resistance but also on the use of chemical substances. The

different trials didn’t make it possible to highlight the efficiency of these methods facing V.dalhiae.

The use of grafting will become uncertain if new techniques are not find rapidly.

4

Sommaire 1 Introduction ......................................................................................................................................................................................................................... 4

1.1 Etat des lieux : Problème à résoudre ........................................................................................................................................................................ 6

1.2 Contexte filière aubergine ........................................................................................................................................................................................ 7

1.3 Enjeux scientifique ................................................................................................................................................................................................... 8

1.4 Synthèse bibliographique ......................................................................................................................................................................................... 9

1.4.1 Techniques existantes et limites .................................................................................................................................................................. 9

1.4.2 Développement de nouvelles méthodes de protection ............................................................................................................................. 10

2 Objectifs du travail ............................................................................................................................................................................................................. 13

3 Matériel et méthodes......................................................................................................................................................................................................... 14

3.1 Hypothèses ............................................................................................................................................................................................................ 15

3.2 Mise en place du protocole d’essai ........................................................................................................................................................................ 15

3.2.1 Différentes modalités ................................................................................................................................................................................ 15

3.2.2 Site d’implantation .................................................................................................................................................................................... 16

3.2.3 Dispositif expérimental .............................................................................................................................................................................. 17

3.2.4 Matériel végétal ......................................................................................................................................................................................... 18

3.2.5 Notations, observations et mesures .......................................................................................................................................................... 19

3.2.6 Conduite de l’essai ..................................................................................................................................................................................... 19

3.3 Analyse statistique des résultats ............................................................................................................................................................................ 20

4 Résultats............................................................................................................................................................................................................................. 20

4.1 Solutions génétiques .............................................................................................................................................................................................. 20

4.1.1 Hauteur de point de greffe et lutte contre V.dalhiae ................................................................................................................................. 20

4.1.2 Influence de la sensibilité du greffon et du caractère hétérozygote de la résistance des PG à V.dalhiae ................................................... 22

4.2 Etude des interactions possibles entre micro-organismes ..................................................................................................................................... 24

4.2.1 Interaction nématodes-V.dalhiae sur porte-greffes résistants ................................................................................................................... 24

4.2.2 Influence du parasitisme racinaire de 3 champignons telluriques sur la sensibilité du porte-greffes Beaufort à V.dalhiae ........................ 25

4.3 Méthodes de lutte alternatives .............................................................................................................................................................................. 27

4.3.1 Essai de champignons antagonistes et pellets de moutarde Vasculeg .................................................................................................. 27

4.3.2 Essai de champignons antagonistes contre V.dalhiae Trichoderma harzianum (Trianum) .................................................................... 29

4.4 Méthodes de lutte chimique .................................................................................................................................................................................. 32

4.4.1 Etude de l’efficacité préventive du Thiophanate-méthyl pour contrôler le développement de V.dalhiae (essai INVENIO 2007) ............... 32

5 Discussion .......................................................................................................................................................................................................................... 34

5.1 Méthodes alternatives ........................................................................................................................................................................................... 34

5.1.1 Essais T.harzianum ..................................................................................................................................................................................... 34

5.1.2 Essai champignons/bactéries antagonistes et apports de pellets de moutarde ......................................................................................... 34

5.2 Interactions entre micro-organismes du sol ........................................................................................................................................................... 37

5.3 Lutte chimique ....................................................................................................................................................................................................... 37

5.4 Solutions génétiques .............................................................................................................................................................................................. 38

6 Conclusion et perspectives ................................................................................................................................................................................................. 40

7 Références bibliographiques .............................................................................................................................................................................................. 42

8 Table des figures ................................................................................................................................................................................................................ 44

9 Annexes .............................................................................................................................................................................................................................. 44

1 Introduction

5

Le sujet à l’origine de mon stage est le suivant : « Assurer la durabilité des solutions génétiques vis à

vis de la Verticilliose en aubergine », avec un essai de méthodes alternatives (champignons

antagonistes et bactéries) pour lutter contre le pathogène Verticillium dalhiae. La mise en place de

l’essai ayant eu lieu avant mon arrivée sur le site et la fin de récolte de la culture se faisant après mon

départ, je n’ai pas pu obtenir des résultats suffisant pour tirer des conclusions sur cet essai. De plus,

le temps passé sur cet essai ne constitue qu’une infime partie des travaux réalisés au cours de mon

stage. Ainsi, ce mémoire portera sur l’état des connaissances vis-à-vis de la problématique

Verticilliose au travers de l’analyse de différents essais effectués au sein de la station, incluant le

sujet initial.

L’essai champignons antagonistes et pellets de moutarde, que j’ai pu suivre tout au long de mon

stage est coordonné par le Ctifl (Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes) dans le

cadre du programme national CasDar (Fonds national pour le développement agricole et rural). Ce

programme finance le projet Vasculeg, dont fait partie l’essai auquel j’ai pu participer.

Le projet Vasculeg intervient en réponse aux réductions d’usage des fumigants en cultures

légumières, l’utilisation de matériel végétal résistant se traduit par une adaptation des

bioaggresseurs et l’apparition de nouvelles races et de nouveaux parasites.

Ce projet s'articule autour de quatre actions complémentaires, chacune répondant à un objectif du

projet.

Action 1 : Parfaire la cartographie des maladies vasculaires dans les bassins de production légumiers

français et identifier les maladies et ravageurs émergeants suite à l’utilisation de techniques

alternatives comme le greffage

Action 2 : Approfondissement des connaissances sur la biologie de Verticillium dahliae et Fusarium

oxysporum f.sp. melonis et sur l’écologie microbienne du sol dans les parcelles maraîchères

Action 3 : Recherche de nouvelles sources de résistance : évaluation des ressources génétiques

Action 4 : Évaluation d’un itinéraire technique permettant une gestion durable des maladies

vasculaires

6

1.1 Etat des lieux : Problème à résoudre

Après le retrait du bromure de méthyle et malgré l’utilisation de matériel végétal résistant, les

maladies vasculaires des cultures légumières ont pris une importance nouvelle au cours de ces

dernières années dans les différents bassins de production. Certains producteurs se trouvent en

situation d’abandon de certaines parcelles faute de moyens de protection efficaces, ce qui se traduit

par une augmentation considérable des charges.

Pour les solanacées, l’utilisation du greffage et de la résistance variétale est une technique qui se

généralise dans tous les pays producteurs en remplacement de la désinfection chimique. Cette

technique est une solution à certains problèmes phytosanitaires telluriques et apporte également

des avantages en termes de productivité et de physiologie améliorée (vigueur, salinité, précocité…).

Toutefois, après quelques années d’expérimentations et de pratiques, des limites à l’utilisation du

greffage et de la résistance variétale sont apparues : contournement des résistances, gestion

partielle des problèmes telluriques, apparition de nouveaux bioagresseurs (Blancard et al., 2007 ;

Erard et Odet , 2008 ; King et al., 2008)…

La situation du greffage est particulièrement préoccupante pour les cultures d’aubergine, pour

laquelle Verticillium dalhiae constitue la principale menace en termes de champignons pathogènes

telluriques vasculaires, des cas de dépérissements ayant été observés dans des parcelles cultivées

avec des variétés greffées. Il apparaissait donc urgent de connaître précisément la situation en

production concernant la verticilliose et de mieux comprendre les phénomènes en cause, dans

l’objectif de définir les pratiques culturales permettant d’accompagner les résistances variétale et de

préserver durablement leur efficacité.

1.1.1 Le pathogène Verticillium dalhiae

Verticillium dalhiae est responsable de la Verticilliose sur aubergine, il s’agit d’un champignon

tellurique vasculaire appartenant à la division des Ascomycètes.

L’attaque se manifeste sur les feuilles basses par l’apparition de plages décolorées se nécrosant

progressivement. On peut également observer un flétrissement partiel ou total en particulier dans la

journée. Ces symptômes s’expriment souvent sur un seul coté de la plante ou de la feuille. La maladie

entraine des pertes de rendement non négligeables. (CTIFL, 2003)

La maladie sévit surtout au printemps et à l’automne en raison des températures fraiches favorable

au développement du champignon. On peut observer une régression des symptômes lorsque les

7

températures s’élèvent. Le champignon est capable de se maintenir plusieurs années dans le sol

grâce à des organes de résistance (microsclérotes). La transmission est possible par le terreau, les

outils et les débris végétaux. Le champignon peut aussi être disséminé par les courants d’air et les

éclaboussures (CTIFL, 2003)

Figure 2 Symptômes de Verticilliose sur feuille Figure 1 Symptômes de Verticilliose sur feuille

Figure 3 Symptômes de dépérissement sur plante entière

8

1.2 Contexte filière aubergine

La production légumière représente en France 273 000 ha, soit 1% de la SAU, pour 6,4% de la valeur

agricole (plein champ et abris, hors pomme de terre). Au cours de ces dix dernières années, les

producteurs de légumes ont vu les moyens de protection chimique se restreindre de manière

drastique (Plan ecophyto 2018, Grenelle de l’Environnement, plan interministériel de réduction des

risques liés aux pesticides…). Cette situation, conjuguée à la demande sociétale d’une meilleure prise

en compte de la protection de l’environnement et de la santé, a amené un regain d’intérêt des

producteurs pour les techniques alternatives dans le cadre de la Production Légumière Intégrée

(PLI).

Les systèmes de cultures légumiers/maraichers en plein champ et sous abris froids se caractérisent

souvent par un niveau élevé d'intensification des cultures, qui conduit à l'aggravation des problèmes

liés aux bioagresseurs telluriques. Certains, comme les champignons pathogènes ou nématodes

peuvent être communs aux différents types de systèmes. D’autres sont plus spécialisés, comme les

champignons vasculaires (trachéomycoses) qui, d’une part, ont développé des stratégies pour

pouvoir se maintenir plusieurs années dans le sol (microsclérotes pour les Verticillium, capacité

saprophytique élevée…), et d’autre part, n’ont pas besoin d’un inoculum primaire important pour

provoquer des dommages sévères à la culture.

1.3 Enjeux scientifique

Etant donné que la protection par des moyens chimiques s’est avérée très difficile, voire inefficace,

les efforts de recherche ont porté depuis de nombreuses années sur d’autres méthodes de

protection, en particulier la résistance variétale. Des résistances ont ainsi pu être mises en évidence

pour les principales cultures. Néanmoins, les pathogènes s’adaptent et régulièrement, de nouvelles

races apparaissent mettant à mal tout le travail de sélection. Il se pose un réel problème de

durabilité des résistances et de gestion des résistances variétales.

Des méthodes dites alternatives ont été étudiées avec pour objectif majeur la réduction des

inoculums primaires : utilisation de microorganismes antagonistes pour prévenir les infections

racinaires, solarisation du sol pour réduire la survie des microsclérotes, apports d’amendements

organiques pour stimuler l'activité microbienne, diversification et allongement des rotations

culturales afin de perturber le développement des pathogènes à spectres d’hôtes étroits et

9

compétences saprophytes limitées, … Cependant, bien que ces différentes techniques alternatives

puissent montrer une certaine efficacité, elles ne sont pas suffisantes à elles seules, pour prévenir

l’apparition et le développement de ces trachéomycoses.

Il apparaît aujourd’hui de plus en plus nécessaire de devoir combiner les techniques, en particulier

l’utilisation de matériel résistant avec ces techniques dites alternatives. Pour cela, il est nécessaire de

connaître le plus précisément possible la situation chez les producteurs, d’approfondir certaines

connaissances sur les bioagresseurs, de diversifier les résistances variétales et d’évaluer l’intérêt

pratique de différentes combinaisons de techniques de protection.

1.4 Synthèse bibliographique

Quasiment toutes les espèces légumières sont sensibles aux trachéomycoses, néanmoins elles n’ont

pas toutes la même importance, les cultures les plus sensibles et les plus atteintes sont les

cucurbitacées (melon, pastèque, concombre, courges…) et les solanacées (tomate, aubergine,

poivron/piment) ainsi que le fraisier. Jusqu’à un passé récent la protection contre les

trachéomycoses se faisait à l’aide des fumigants, en particulier le bromure de méthyle, même s’il ne

donnait pas entièrement satisfaction.

1.4.1 Techniques existantes et limites

Face à cette situation, les producteurs ont recours soit au hors sol, soit au greffage. Le hors sol ne

répond que partiellement au problème car, du fait des investissements nécessaires, il n’est pas

toujours rentable selon les productions, et des questions se posent quant à son avenir face à

l’augmentation du coût de l’énergie. En revanche, le greffage tend à se généraliser en France et dans

le monde (Cohen et al., 2007 ; Kubota et al., 2008 ; Rivard et Louws, 2008) pour répondre à différents

objectifs : résoudre des problèmes phytosanitaires telluriques, accroître la vigueur et le rendement

des plantes, permettre la culture en conditions limites (températures basses, salinité du sol, …).

Cette pratique représente la technique non chimique qui a le plus de potentiel, mais on assiste à une

augmentation de la pression des maladies vasculaires (Garibaldi et Minuto, 2003 ; Blancard et al.,

2007 ; Erard et Odet , 2008) et la mise en pratique du greffage a permis de mettre en évidence

certaines limites :

les porte-greffes disponibles ne présentent pas assez de résistances (aubergine, poivron,

concombre) et ne sont pas suffisamment caractérisés (pas d’inscription obligatoire au

catalogue officiel);

10

des problèmes phytosanitaires apparaissent après plusieurs années d’utilisation de cette

technique (ex : contournement des résistances, émergence de nouveaux agents pathogènes,

…);

le greffage, s’il répond aux besoins de la culture vis-à-vis de certains bioagresseurs

spécialisés, ne permet pas une gestion durable et globale des maladies et ravageurs

polyphages présents dans les parcelles

des ajustements dans les itinéraires techniques (fertilisation, densité, irrigation, etc.) doivent

être mis au point et validés pour mieux prendre en compte la physiologie des plantes

greffées (diffère d’une plante non greffée).

Ainsi, dans le cas de la culture d’aubergine, les producteurs se sont trouvés confrontés à des

dépérissements. Le greffage est utilisé principalement pour gérer les problèmes de Meloidogyne et

de Verticillium dalhiae. Des travaux (Blancard et al. 2007) ont montré qu’il y avait mise en place

d’une série de bioagresseurs spécifiques aux porte-greffes (Phytophthora nicotianae, Colletotrichum

coccodes, Rhizoctonia solani et Meloidogyne hapla), mais aussi adaptation des “anciens”

bioagresseurs, avec l’émergence de nouvelles races pour Verticillium dalhiae et Meloidogyne

arenaria.

1.4.2 Développement de nouvelles méthodes de protection

Face à ces constations, il apparaît clairement que la solution génétique ne doit pas être employée

seule, mais s’accompagner d’autres techniques comme la rotation des cultures, le respect de la

prophylaxie, la mise en œuvre de pratiques spécifiques visant à s’occuper de la santé du sol, telles

que les plantes de coupure, les agents de lutte biologique, les extraits de plante, la biodésinfection,

... Un certain nombre d'exemples récents montrent que le potentiel existe et doit être exploité :

Pour le V. dahliae, le recours à la rotation ne semble pas être une solution très efficace. Ainsi, V.

dahliae peut coloniser les racines de nombreuses plantes et par conséquent, maintenir la population

avec aucun impact apparent sur la culture comme par exemple sur les graminées, réputées non

hôtes (Krikun et Bernier, 1990).

L’incorporation des résidus de certaines cultures (ex : brocoli, ..) ou de certaines plantes, (ex : Cistus

alibudus, Lavandula stoechas) peut permettre de réduire les microsclérotes de V. dahliae (Xiao et al.,

1998 ; Lopez-Escudero et al., 2007) .

L’utilisation des micro-organismes a été largement étudiée. En particulier, le travail sur les souches

non pathogènes de F. oxysporum a montré leur potentiel d’utilisation dans la prévention des

maladies liées aux Fusarium (Alabouvette et al., 2007), mais pas seulement. En effet, si il y a

11

inoculation de souches de F.oxysporum non pathogènes à la surface des racines d’aubergine, on

observe une réduction du taux de V.dalhiae attaquant les plantes (baisse de l’indice de sévérité de la

maladie) et donc moins de pertes de rendement. Ces résultats s’expliquent par un phénomène de

compétition pour l’espace et les nutriments, les deux champignons partageant la même niche

écologique (Pantelides et al, 2009). Il n’y a pas ici de phénomène de stimulation des défenses de la

plante par le F.oxysporum. Néanmoins, et bien que les résultats au laboratoire montrent un bon

niveau d’efficacité, les réductions de maladie restent souvent insuffisantes en conditions de

production d’où l’intérêt de les associer au greffage.

Le champignon antagoniste Trichoderma harzianum a déjà été testé sur Fusarium oxysporum f. sp.

Radicislycopersici et montré des résultats encourageants (Hibar et al, 2005). Il aurait la capacité

d’attaquer les agents pathogènes via différents modes d’action. Il peut utiliser l’antibiose*

(production de substances qui agissent comme des « antibiotiques » et qui inhibent la croissance de

l’agent pathogène), la compétition* (aptitude de Trichoderma à utiliser les mêmes ressources du

milieu (aires d’alimentation, sites de développement) que les champignons pathogènes mais

Trichoderma emploie ce mode d’action surtout pour occuper les lieux avant l’arrivée des

indésirables) ou le parasitisme* (destruction de l’agent pathogène lorsque Trichoderma s’enroule

autour de celui-ci soit en l’étranglant, en pénétrant à l’intérieur et/ou en lui « injectant » des

substances (enzymes) qui le détruisent).

Trichoderma possède une batterie de mécanismes d’attaque potentiellement utilisables mais qui

demeurent toutefois complexes. Il peut employer un ou plusieurs modes d’action en même temps

pour maîtriser un agent pathogène. Le déploiement des modes d’action varie également selon les

partenaires en présence et les conditions physico-chimiques du milieu (températures, humidité,

etc…). Trichoderma est efficace lorsqu’on lui permet de s’installer avant l’arrivée des champignons

pathogènes. Son action est donc préventive. Il permet, au niveau des racines, de créer un manchon

protecteur autour de celles-ci et ainsi contrer l’entrée des agents pathogènes à l’intérieur des racines

(Hibar et al, 2005).

Le champignon Talaromyces flavus à également été testé (T.Fahima et al., 1995, Fravel et al., 1994)

en inoculation sur racines, et présente un très bon potentiel en tant qu’agent de lutte biologique

contre les attaques de V.dalhiae. Les mécanismes de cet effet antagoniste de T.flavus n’étant pas

bien connus, il s’agit certainement de mycoparasitisme, de compétition ou bien même de sécrétion

de substance antibiotique par ce champignon.

Malgré cela, l’introduction dans la rhizosphère d’un agent de lutte biologique n’est jamais sans

danger. En effet, des questions doivent être soulevées concernant les possibles effets sur les micro-

12

organismes non ciblés (toxicité, pathogenicité…) mais également sur les humains et autres animaux

(allergicité).

Ainsi, des essais se sont tournés vers l’utilisation de champignons endophytes (la plupart isolés à

partir de racines d’aubergines). Les jeunes plants d’aubergines se développent sur de la tourbe

inoculée avec les souches de champignons antagonistes qui vont coloniser rapidement les vaisseaux

de la plante, limitant ainsi l’impact sur la rhizosphère alentour et la flore microbienne du sol, les

risqué lies à l’introduction d’un agent de lutte biologique sont donc diminués. Leur efficacité est

également augmentée car il y a moins de phénomènes de compétition à l’intérieur de la plante que

de la rhizosphère. Différentes souches de champignons potentiellement antagonistes ont été testé

telle que Phialocephala fortinii et Heteroconium chaetospira. Cette technique montre des résultants

très encourageants avec des réductions considérables des attaques par V.dalhiae, mais les modes

d’actions de ces champignons antagonistes sont encore méconnus. (K.Narisawa et al, 2002)

Des essais ont également été menés (J.G Li et al., 2008) en testant l’utilisation de la bactérie

antagoniste B.cereus (extraite de la rhizosphère) dont les sécrétions de chitinase dégradent la paroi

du champignon pathogène V.dalhiae. les résultats de cette expérience sont très concluants, que ce

soit en utilisant directement l’extrait de chitinase produit par la bactérie ou bien une suspension

bactérienne, l’indice de sévérité de la maladie est réduit. Des bactéries endophytes (extraites depuis

l’aubergine) telles que B.subtilis ont également été testé (Lin et al., 2009) et présentent une activité

antifongique concluante, bien qu’une attention doit être portée à la bonne colonisation de la plante

par l’agent de lutte biologique endophyte.

L’usage de vers de terre peut également être envisagé dans la lutte biologique contre V.dalhiae

(Helmer et al., 2009). En effet, les essais plein champs montrent des résultats très concluants dans la

protection de l’aubergine contre la maladie lorsque le nombre de lombrics dans le sol est augmenté

par un apport extérieur (Lumbricus terrestris, 11 par m²). Tandis que, à l’inverse lorsque l’on réduit le

nombre de vers dans le sol (traitement chimique au carbaryl ou usage de moutarde), les taux

d’attaques du pathogène V.dalhiae augmentent. Cette méthode présente des limites de part son

cout élevé lorsqu’il y a apport extérieur de vers de terre, il s’agirait donc seulement pour les

agriculteurs de favoriser les itinéraires techniques favorisant la présence de lombrics dans le sol.

De même, des apports de divers composts et amendements organiques à base de déchets végétaux

(Hernandez et al, 2005 ; Yogev et al., 2006) montrent parfois des niveaux d’efficacité élevés en

conditions de laboratoire, mais leur transfert au champ s’avère délicat en pratique. Un essai

(Paplomatas et al., 2005) teste 11 composts et amendements organiques provenant de 5 pays

différents et présentant des compositions très variées (compost, fumier de cheval, …). Les essais sous

13

serre montrent des résultats encourageants (5 amendements organiques ont un effet sur la

réduction des symptômes causés par V.dalhiae). Mais lors des essais au champ, aucun des 11

amendements ne contribue à une réduction du taux d’attaque par le pathogène. Ces résultats

peuvent s’expliquer par la présence ou non de micro organismes bénéfiques dans les différents

amendements, mais aussi par le moment auquel l’apport de matière organique est effectué par

rapport à l’attaque de V.dalhiae. Cependant, ces travaux de recherche dégagent des pistes de travail

à explorer…

Les différents exemples d’essais présentés dans cette bibliographie révèlent que les questions

auxquelles ce projet souhaite apporter des réponses sont communes à tous les pays producteurs de

légumes (Grèce, Israël, USA…) et qu'elles nécessitent une démarche globale, systémique, combinant

les diverses stratégies testées individuellement dans chacune de ces régions productrices.

Néanmoins, ils font apparaître que des spécificités locales (sol, climat…) doivent être prises en

compte, d'où la nécessité d'une étape préliminaire visant à les identifier, à l'échelle nationale dans un

premier temps.

De plus, il apparait qu’un très grand nombre d’agent de lutte biologique ont pu être testé, chacun

présentant des modes d’actions différents et appartenant à des familles très diverses de micro-

organismes antagonistes. Ainsi, de nombreuses pistes semblent très prometteuses dans la lutte

biologique contre les maladies vasculaires telluriques. Or, bien qu’il soit fondamentale de tester

l’efficacité du produit, il est également nécessaire d’évaluer son impact potentiel sur la micro faune

alentour (rhizosphère) et sur les consommateurs de fruits et légumes. De plus, les aspects

économiques et de production (simple à produire, afin de limiter les coûts) du produit doivent être

pris en compte, l’agriculteur étant plus enclin à acheter un produit efficace, bon marché et facile

d’utilisation.

2 Objectifs du travail

L'objectif principal du travail réalisé au cours de ce stage est de pouvoir proposer aux producteurs de

légumes des solutions techniques pour une meilleure maîtrise des bioagresseurs telluriques

vasculaires, en sachant qu’il n’existe pas de moyens de protection chimique efficaces.

Depuis 2006, de nombreux essais ont été menés au sein de la station expérimentale sur la

problématique verticilliose de l’aubergine. Aucun résultat n’ayant été publiés à ce jour, il existe de

nombreux comptes rendus d’essais indépendants, fruits de plusieurs années de recherche. L’objectif

de ce stage sera donc de faire une synthèse de ces différents résultats afin mettre en évidence les

14

connaissances acquises sur le sujet et les pistes restant encore à explorer. Ce projet de stage pourra

aboutir à une éventuelle publication qui regrouperait les différents résultats obtenus au cours de ces

dernières années.

Dans un premier temps, il s’agira de regrouper tout les essais effectués sur le thème de la protection

de l’aubergine contre la verticilliose depuis 2005 et d’en effectuer un tri selon leur pertinence en

rapport à la problématique.

De plus, les comptes rendus d’essais n’ayant pas été rédigés dans le but d’être rendus publiques, les

tableaux, graphiques et commentaires devront être mis en forme afin de les rendre plus lisibles et

compréhensibles de tous. Enfin, certaines titres et légendes devront être mis aux normes

scientifiques.

La réalisation d’une synthèse du travail effectué sur cette problématique (par la station INVENIO) va

constituer la majeure partie du travail lors de ce stage. En effet, il va falloir regrouper tout les

résultats obtenus afin d’effectuer un état des lieux des connaissances sur le sujet. On pourra alors

faire ressortir de ce bilan les méthodes de protection de l’aubergine qui s’avèrent efficaces ou non

contre la verticilliose.

De plus, pour effectuer cette synthèse, il est nécessaire de comprendre le lien logique entre les essais

au fil des années. En effet, les résultats obtenus sur une année vont permettre d’émettre de

nouvelles hypothèses et ainsi de déterminer les essais qui seront effectués l’année suivante. Une

bonne appréhension de ce fil conducteur permettra de cerner la logique de l’ordre dans lequel sont

effectués les essais et ainsi de pouvoir proposer de nouvelles perspectives cohérentes.

Ce travail permettra donc d’avoir une vue d’ensemble sur la problématique et l’avancé des

recherches sur le sujet. On pourra ensuite proposer de nouvelles pistes de recherches en lien avec ce

qui a pu être concluant ou non dans le passé mais également et surtout proposer aux producteurs

des solutions concrètes et efficaces contre les problèmes de maladies vasculaires telluriques de

l’aubergine.

3 Matériel et méthodes

Je vais détailler le processus global de réalisation d’un essai qui peut s’appliquer à toutes les

expérimentations réalisées au sein de la station sur la problématique « lutte contre la verticilliose de

l’aubergine ». Il s’agit d’un schéma général de réflexion et de différentes questions qui doivent se

15

poser lors de la mise en place d’une expérimentation. Des exemples plus concrets et précis sont

donnés sur l’essai en cours Vasculeg 2012, que j’ai pu suivre personnellement.

3.1 Hypothèses

A l’origine d’un essai, il y a toujours une hypothèse que l’on va chercher à vérifier. En effet, il s’agit

d’un questionnement, d’une problématique à partir duquel vont pouvoir être formulé les différentes

modalités de l’essai. Il faudra alors mettre en pratique le protocole d’essai et observer les résultats

qui mèneront généralement à une autre hypothèse et ainsi de suite. L’hypothèse, dans le cadre de

notre problématique, peut porter sur l’efficacité d’un produit ou d’antagonistes, l’effet d’une

interaction possible entre micro-organismes, la comparaison de différents matériels végétaux…

L’hypothèse à l’origine du projet Vasculeg repose sur l’efficacité de méthodes alternatives de

protection contre la verticilliose à base de champignons antagonistes (Fusarium oxysporum FO47) et

bactéries (Pseudomonas fluorescens A6R6) combinées ou non à l’application de pellets de moutarde.

3.2 Mise en place du protocole d’essai

3.2.1 Différentes modalités

Les essais portant sur la verticilliose de l’aubergine peuvent comporter de 3 à 10 modalités selon les

thèmes d’essai. On retrouve toujours un témoin, individu qui sert de valeur de référence, de contrôle

et de repère tout au long de l’essai. Il s’agit généralement du témoin porte-greffe Beaufort non

inoculé par V.dalhiae et non traité dans le cas ou l’on teste un produit ou bien non greffé si l’on teste

différentes hauteurs de greffages. Chacune des autres modalités va intégrer un et un seul critère ou

valeur de l’essai : un type de porte-greffe, une dose de produits, une association de micro-

organismes…

Dans le cas de l’essai Vasculeg on teste deux modalités :

Modalité 1 Champignons et bactéries antagonistes avec 4 modalités à tester :

- F1 = FO47 seul

- F2 = A6R6 seul

- F3 = A6R6 + FO47

- F4 = Sans champignon ni bactérie

Modalité 2 (croisée avec la modalité 1), apport de tourteaux de moutarde et biodésinfection, 4

modalités à tester

16

T0 Témoin sans apport de pellets

T1 Apports de pellets à la dose forte (10 T/ha) amenée avant aubergine

T2 Apports de pellets à la dose faible (5 T/ha) amenée avant aubergine

T3

Apports de pellets à la dose forte (10 T/ha) amenée en 2 fois (avant salade et avant

aubergine)

3.2.2 Site d’implantation

La grande majorité des essais de lutte contre la verticilliose sur aubergine se font sur culture en pots

sous serre. Les essais se déroulent alors au sein même de la station, sur le site de Sainte-Livrade.

Dans ce cas, il y a inoculation artificielle du pathogène V.dalhiae. Ce type de culture est employé

lorsque l’inoculation d’un pathogène doit être maitrisée. En effet, certains essais nécessitent l’apport

de nématodes à galle ou d’autres champignons pathogènes, il est donc bien sur inenvisageable

d’inoculer le sol de producteurs avec ces différents pathogènes. Dans le cas de culture en pots, on

veille à la désinfection des solutions de drainage afin d’éviter toute contamination du site.

Les essais de lutte contre la verticilliose peuvent également être effectués directement chez les

producteurs, dans le cas ou les sols sont contaminés pas V.dalhiae et non désinfectés. Les essais sont

alors sont alors mis en place en plein champs sous tunnel ou serre multichapelle. On note que les

producteurs acceptant la mise en place d’essai sur leurs parcelles se font rares du fait des contraintes

générées.

On peut citer l’exemple de l’essai Vasculeg 2012 qui a été mis en place chez un producteur de la

région du Confluent (Aiguillon 47) sur des sols contaminés par la verticilliose.

17

Figure 4 Vue générale de l'exploitation

3.2.3 Dispositif expérimental

Le dispositif expérimental consiste à déterminer le nombre de répétitions de chaque modalité qui

vont être mise en place et la manière dont l’essai va être structuré. Il faut alors fixer un nombre de

plante par modalité et le nombre de répétitions de cette modalité. Sur l’essai Vasculeg 2012, il s’agit

de modalités croisées, on réalise donc un essai blocs split splot avec 8 plantes par modalité, chaque

modalité étant répétée 2 fois.

Une fois le dispositif mis en place, on réalise un plan de l’essai afin de visualiser ou se situeront les

différentes parcelles sur le terrain. Cela permet également de jalonner correctement l’essai (petits

piquets orange surmontés d’une étiquette portant le code de la parcelle) et ainsi de se repérer

facilement au moment des notations sur le terrain. L’essai Vasculeg est conduit sous un tunnel de

9,6m de large sur lequel sont implantés 5 mono rangs. On note que F1-1 et F1-2 sont les 2 répétitions

d’un même facteur et que dans chaque parcelle du traitement pellets, on retrouve à chaque fois le

sous facteur champignons.

18

Tableau 1 Plan de l'essai Vasculeg avec les différentes modalités

Rang 1 Rang 2 Rang 3 Rang 4 Rang 5 Modalités

pellets

T0

F3-2 F1-2

F5-2 F2-2 F4-2

T3

F2-1 F4-1 F3-2 F1-2

F1-1 F3-1 F2-2 F4-2

T2

F2-1 F4-1 F3-2 F1-2

F1-1 F3-1 F2-2 F4-2

T1

F2-1 F4-1 F3-2 F1-2

F1-1 F3-1 F2-2 F4-2

T0

F2-1 F4-1

F1-1 F3-1

3.2.4 Matériel végétal

Le matériel végétal qui sera utilisé lors de l’essai doit également être déterminé en amont lors de

l’élaboration du protocole. En effet, dans certains essais, l’objectif sera de comparer la résistance de

Figure 5 Vue générale du tunnel

Figure 6 2 rangs du tunnel

19

différents porte-greffes vis-à-vis de la verticilliose, il est donc fondamentale de sélectionner

efficacement ce matériel afin d’obtenir des résultats concluants.

Dans le cas de plants greffés, la nature du porte-greffe doit être renseignée tout comme celle de la

variété du greffon. On retrouve le plus couramment les variétés Monarca ou Cristal greffées sur des

porte-greffes Beaufort, sauf bien sur dans le cas d’essais sur le type de porte-greffes.

L’identité du fournisseur et réalisateur des plants greffés doit également être mentionnée.

Dans le cas de l’essai Vasculeg, on retrouve la variété Monarca greffée sur le porte-greffes Beaufort.

3.2.5 Notations, observations et mesures

Les différentes observations et mesures qui seront effectuées au cours de l’essai vont être axées sur

la résistance du plant d’aubergine à la verticilliose. Cette résistance peut être évaluée à l’aide de

différents critères. En effet, on peut observer l’état des racines, on note alors l’indice de nécrose

racinaire (INR) ou l’indice de volume racinaire(IVR). A l’échelle de la plante entière on note la vigueur,

le nombre de plantes mortes ou présentant des symptômes de verticilliose, mais aussi l’intensité

d’attaque de la maladie. Enfin, on peut prendre en compte la qualité et la quantité des fruits, reflet

de l’état général de la plante.

La fréquence des notations doit être également être déterminée (hebdomadaire, quotidienne…) tout

comme le stade auquel elles doivent être effectuées (début de la récolte, à l’arrachage..).

Dans le cas de l’essai Vasculeg, les notations portent l’évolution des attaques de verticilliose sur

plantes, on compte alors le nombre de plantes mortes par modalité tout les 15 jours environ.

Notation de, 0=saine, 1=touché, 2=très touché, 3=morte. Au moment de la récolte, il y aura

évaluation de la production avec suivi du nombre de fruits récoltés sur 2 plantes par modalité. Enfin,

en fin de récolte aura lieu l’arrachage de tous les plants et la notation de l’indice de nécrose racinaire

(INR) et l’indice de galles racinaires (IGR) sur une échelle de 0=sain à 10= complètement colonisé et

de l’indice de volume racinaire sur une échelle de 0=nul à 5=très développé.

3.2.6 Conduite de l’essai

La manière dont l’essai va se dérouler, depuis la plantation de la culture jusqu'à sa récolte, doit être

déterminée dès la mise en place de celui-ci. Il faut alors fixer les dates de semis, de plantation, les

doses de traitements et leurs fréquences, les inoculations de pathogènes ou antagonistes et leurs

20

provenance et enfin les dates de récolte puis d’arrachage. La plantation de l’essai Vasculeg a eu lieu

en S11 (15 mars) avec une densité de 1.2 plantes /m² sur 5 mono rangs à raison de 3 bras par plante.

L’inoculation par les bactéries A6R6 et le champignon FO47 aurait du avoir lieu au moment de la

confection des plants d’aubergine, directement mélangé au substrat pour une meilleur efficacité or

ceci n’a pu être mis en place a cause d’un délai trop court.

Les plants ont donc été inoculés avec la bactérie A6R6 à postériori, le 5 mars. Un flacon de 100ml

contenant un inoculum de Pseudomonas fluorescens A6R6 (concentration à 2,5 x1011 dans les

100mL de milieu liquide) a été dilué dans 5,6L d’eau. Sur chaque motte ont été épandu 40 ml de

cette solution diluée. Il est resté un solde de solution de non absorbée par motte de 1200Ml.

40 cc/motte * 140 mottes = 5600 ml

Le champignon FO47 a été apporté en fond de trou sous les mottes au moment de la plantation, le

15 mars. Un sac de sable de 3L inoculé avec F047 a été réparti équitablement entre les 128 plants de

la modalité, il restait 220ml.

Les pellets de moutarde ont été apportés le 7 mars, avant le travail du sol à raison de 10T/Ha pour la

modalité T1, soit au total 130kg, 5T/Ha pour la modalité T2 soit 65kg au total. Pour la modalité T3,

10T/Ha ont été apporté en 2 fois, soit 65kg avant la culture de salade puis 65kg avant l’aubergine le 7

mars.

3.3 Analyse statistique des résultats

L’analyse statistique des résultats s’effectue avec l’aide du logiciel Statbox.

4 Résultats

4.1 Solutions génétiques

4.1.1 Hauteur de point de greffe et lutte contre V.dalhiae

21

Site d’implantation

Essai réalisé en sols contaminés et non désinfectés de vallée de Garonne chez Mr Philippe Iachi,

Earl de Lompian à Damazan (47), sous serre multichapelle récente (2ième année de culture)

Matériel Végétal Porte greffe Beaufort, Variété Cristal,

Mise en place 2005

Objectifs

Tester 6 hauteurs de greffage en conditions de production pour vérifier l’importance de ce critère dans l’expression du pathogène sur plant greffé et comparer l’influence de la hauteur et

du positionnement de la greffe par rapport aux cotylédons ou la 1ière feuille

Figure 7 Effet de différentes hauteurs de point de greffe sur l'évolution des attaques de Verticilliose

Dans les conditions de cet essai, en sols présentant une forte pression de Verticilliose, il n’est pas

possible de démontrer l’intérêt de greffer plus haut les plants d’aubergine. En effet, les 3 modalités

NS NS

NS

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Greffage bas Greffage moyen Greffage haut

Hau

teu

r m

oye

nn

e m

esu

rée

en

cm

du

so

l au

po

int

de

gre

ffe

Po

urc

en

tage

mo

yen

de

pla

nte

s at

tein

tes

de

Ve

rtic

illio

se

Effet de la hauteur du point de greffe sur l'expression de V.dalhiae sur aubergines greffées

Hauteur du point de greffe

% de plantes atteintes par V.dalhiae

22

sont toutes aussi touchées par le pathogène V.dalhiae au 3 octobre, bien qu’une légère tendance se

dégage en faveur d’un greffage haut les résultats ne sont pas significatifs (Figure 7).

Ces résultats amènent un grand nombre de questions, et peuvent remettre en cause rapidement

l’intérêt du greffage, si des solutions ne sont pas trouvées rapidement. En effet, le nombre de

plantes greffées atteintes par ce problème dans cette parcelle est considérable.

4.1.2 Influence de la sensibilité du greffon et du caractère hétérozygote de la

résistance des PG à V.dalhiae

Site d’implantation

Essai réalisé en pots

Matériel Végétal

Cf. Tableau 2

Mise en place 2007

Objectifs

Etudier si les lâchers de résistances ne sont pas dus à une sensibilité du greffon (aubergine par rapport à de la tomate) mais aussi au caractère hétérozygote de la résistance Ve des porte-

greffes actuellement proposés

Tableau 2 Essai sur l'influence du génotype du greffon avec greffage sur le porte-greffes Beaufort ou non greffé

Indice d’attaque par V.dahliae au : *

Modalité Matériel végétal inoculé ou non par V. dahliae

Greffon Inoculation V.dalhiae

21-juin 12-juil

T1 Beaufort Cristal - 0,3 c 0,7 c

T2 Beaufort Tomate (homozygote Ve) x 0,95 bc 2,35 b

T3 Beaufort Tomate sensible x 0,8 bc 3,35 ab

T4 Beaufort Tomate (hétérozygote Ve) x 1,95 b 3,4 ab

T5 Non greffé Cristal plant franc x 4,7 a 5,2 a

T6 Beaufort Cristal x 3,95 a 4,65 a

T7 Beaufort Monarca x 3,84 a 4,3 a

NK : signification au seuil de 5%

S S

CV en % 16.3 12.3

23

Probabilité 0 0

Puissance en % 99 99

Si l’on analyse les comportements des greffons quand ils sont greffés sur Beaufort, avec inoculation

de la race 2 (sauf sur la modalité non inoculé), on remarque que le comportement d’un plant

d’aubergine non greffé est assez proche d’un plant d’aubergine greffé. Les attaques sont légèrement

plus précoces mais très vite les intensités d’attaque augmentent sur les plants greffés et se

rapprochent du non greffé (non différents à l’analyse statistique). De plus, la sensibilité du greffon

Monarca est identique à celle de Cristal. Enfin, les greffons de type tomate sont moins sensibles que

les types aubergine. Les symptômes sont plus faibles et il n’y a pas de différence quel que soit le type

de construction génétique de la résistance : homozygote sur le gène Ve, hétérozygote sur ce gène ou

sans résistance, le comportement est sensiblement identique. Mais toujours en se plaçant dans le

contexte de la race 2. On note que la parcelle non inoculée est légèrement attaquée avec une plante

touchée sur les 20 plantes, on peut supposer que des racines sont venues dans la rigole de drainage

(Tableau 2).

Tableau 3 Essai sur l'influence du génotype du porte-greffes avec le greffon Cristal ou non greffé

Indice d’attaque par V.dahliae au : *

Modalité Matériel végétal

inoculé ou non par V. dahliae

Greffon Inoculation V.dalhiae

21-juin 12-juil

T5 - Cristal plant franc x 3,95 ab 4,65

T6 Beaufort Cristal x 4,7 ab 5,2

T8 Tomate homozygote Cristal X 5,3 a 4,8

T9 Tomate hétérozygote Cristal X 6 a 4,9

T10 Solanum torvum Cristal X 3 b 3,8

NK : signification au seuil de 5% S NS

CV en % 10.3 8.3

Probabilité 0.01 0.22

Puissance en % 96 74

Lorsque l’on analyse le comportement de différents porte-greffes (avec un greffon d’aubergine de la

variété Cristal et une inoculation de la race 2 de V.dahliae), on observe que le porte-greffes Beaufort

24

se comporte d’une manière assez proche d’un plant non greffé et même légèrement mieux dans cet

essai par rapport aux 2 tomates (mais non différent). Encore une fois, les deux porte-greffes tomates

homozygote ou hétérozygote sur le gène Ve ont un comportement assez proche. Seul le porte greffe

de type Solanum torvum semble avoir un niveau d’attaque inférieur au 21/06 (mais non différent du

non greffé et de Beaufort). On note que toutes les modalités sont non différentes au 12/07 (Tableau

3).

Dans les conditions de cet essai, avec inoculation de la race 2, on démontre une moindre sensibilité

de la tomate par rapport au greffon d’aubergine, mais pas de différence en fonction du caractère

homozygote ou hétérozygote du gène de résistance Ve que ce soit en tant que greffon ou en tant

que porte-greffe. Solanum torvum a pu faire penser un moment qu’il avait un meilleur

comportement vis-à-vis de V.dahliae, mais ceci a été démenti au 12/07.

4.2 Etude des interactions possibles entre micro-organismes

4.2.1 Interaction nématodes-V.dalhiae sur porte-greffes résistants

Site d’implantation

Essai réalisé en pots sous serre en station à Montesquieu (47)

Matériel Végétal Variété 10-201 sur porte-greffes Beaufort

Mise en place 2006

Objectifs

Etudier s’il n’existe pas un lien entre les dégâts racinaires liés aux attaques de nématodes et les lâchers de résistance des porte-greffes constatés dans plusieurs exploitations

Tableau 4 Effet de l'interaction d'une infestation de nématodes et d'une infestation de V.dalhiae sur les symptômes de V.dalhiae (essai

porte-greffes Beaufort et greffon variété 10-201 sauf pour la modalité non greffée)

MODALITES Intensité d’attaque (*)

Témoin Beaufort 0.00 a

PG Beaufort + V.dalhiae 3.60 b

PG Beaufort + nématodes seuls 0.00 a

PG Beaufort + V.dalhiae + nématodes 3.95 b

Non greffé + V.dalhiae + nématodes 4.15 b

25

Test NK Signification au seuil de 5% HS

Probabilité en % 0

CV en % 30.4

Puissance en % 99

(*) 0=néant, 1=<10% surface foliaire, 3=11 à 30%, 5=31 à 60%, 7=>60%, 9=plante morte

Figure 8 Evaluation du niveau moyen de symptômes de verticilliose en fonction de la présence ou non de nématodes

On note que les témoins non inoculés sont indemnes de symptômes. La présence ou non de

nématodes ne semblent pas modifier la sensibilité des plantes à V.dahliae. De plus, l’aubergine non

greffée n’est pas plus attaquée, l’intensité d’attaque au 20/06 est identique (Figure 8)

L’hypothèse de travail de début n’a pu être vérifiée, la sévérité des attaques de V. Dahliae ne semble

pas liée à la présence de nématodes.

4.2.2 Influence du parasitisme racinaire de 3 champignons telluriques sur la

sensibilité du porte-greffes Beaufort à V.dalhiae

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

Témoin Beaufort

PG Beaufort + V.dalhiae

PG Beaufort + nématodes

seuls

PG Beaufort + V.dalhiae + nématodes

Non greffé + V.dalhiae + nématodes

a

b

a

b b

No

te d

'inte

nsi

té d

'att

aqu

e d

e V

.dal

hia

e (

0=s

ain

à 9

=trè

s to

uch

é)

Incidence de la présence de nématodes sur l'intensité d'attaque de V.dalhiae

26

Site d’implantation

Essai réalisé en pots sous serre

Matériel Végétal

Variété Cristal sur porte-greffes Beaufort

Mise en place 2007

Objectifs

Suite à l’omniprésence d’un complexe de bioagresseurs telluriques dans de nombreuses

cultures, il s’agit étudier si leurs agissements sur les racines pourraient expliquer les lâchers de résistance à la Verticilliose

Tableau 5 Effet de l'interaction de la présence de champignons telluriques et d'une infestation de V.dalhiae sur l'intensité d'attaque de

V.dalhiae

Modalités Intensité d'attaque de

V.dahliae au 21/06

P.parasitica seul 0,0 b

C.coccodes seul 0,0 b

R.solani seul 0,0 b

P.parasitica + V.dalhiae 4,3 a

C.coccodes + V.dalhiae 5,2 a

R.solani + V.dalhiae 4,0 a

V.dalhiae seul 4,0 a

Moyenne 2,5

Test Friedman S

CV en % 15.4

Probabilité 0.002

27

Figure 9 Intensité d'attaque de V.dalhiae en fonction de la présence ou non de différents champignons telluriques

Il n’y a pas d’attaque de V.dahliae dans les parcelles non inoculées, le dispositif a été suffisamment

fiables pour éviter les contaminations entre parcelles. On retrouve des attaques de V.dahliae dans les

parcelles inoculées mais on ne note aucune différence entre les parcelles avec inoculation d’autres

champignons (Tableau 5)

Ainsi, dans les conditions de cet essai, il n’est pas possible de prouver que la présence d’autres

pathogènes telluriques provoque des lâchers de résistance des porte-greffes à Verticillium dahliae.

4.3 Méthodes de lutte alternatives

4.3.1 Essai de champignons antagonistes et pellets de moutarde Vasculeg

0

1

2

3

4

5

6

V.dalhiae seul R.solani + V.dalhiae

P.parasitica + V.dalhiae

C.coccodes + V.dalhiae

b a a

a

No

te d

'inte

nsi

té d

'att

aqu

e d

e V

.dal

hia

e d

e 0

à 9

Incidence de la présence de champignons telluriques sur l'intensité d'attaque de V.dalhiae

28

Site d’implantation

Essai conduit sous tunnel 9.6 m chez M. Poncharreau, producteur de la région du

Confluent (Aiguillon 47) en sols contaminés

Matériel Végétal

Variété Monarca sur porte-greffes Beaufort

Mise en place 2012

Objectifs

Dans le but d’assurer la durabilité de solutions génétiques (greffage ou variétés) vis à vis de

champignons vasculaires (en l’occurrence V. dahliae dans le cas de l’aubergine) tester l’intérêt

d’appliquer d’une part des champignons antagonistes et d’autre part l’apport exogène de

moutarde sous forme de granulés pour réaliser une biodésinfection

Figure 10 Effet de différents apports d'antagonistes sur l'évolution des attaques de Verticilliose

Ces résultats ne permettent pas de démontrer une efficacité significative d’un apport

d’antagonistes, même dans le cas ou FO47 est associé à A6R6. On note une légère tendance en

faveur d’un apport de FO47 seul par rapport au témoin non traité avec une réduction du

pourcentage de plantes touchées. La modalité FO47 + A6R6 montre également de bons résultats,

(bien que non significatifs) lors des premières notations, puis le pourcentage de plantes touchées

dans cette modalité dépasse celui du témoin non traité à partir du 27 juin (Figure 10).

0,00

5,00

10,00

15,00

20,00

25,00

30,00

35,00

40,00

FO 47 seul A6R6 seul A6R6 + FO47 TNT F5

Po

urc

en

tage

de

pla

nte

s p

rése

nta

nt

de

s sy

mp

tôm

es

de

V

ert

icill

iose

Evolution des attaques de Verticilliose en pourcentage de plantes touchées en fonction de différents apports d'antagonistes

02-mai

15-mai

05-juin

27-juin

29

Figure 11 Effet de différents apports de pellets de moutarde sur l'évolution des attaques de Verticilliose

Il n’a pas été possible au cours de cet essai de démontrer un effet significatif d’un apport de pellets

de moutarde pour réduire les attaques de Verticilliose. En effet, toutes les modalités sont largement

touchées par le pathogène. Malgré cela, on remarque une réduction du pourcentage de plantes

touchées dans la modalité 10T/Ha par rapport au témoin non traité (Figure 11), ce qui peut suggérer

une certaine efficacité du traitement bien que non significative.

4.3.2 Essai de champignons antagonistes contre V.dalhiae Trichoderma

harzianum (Trianum)

Essais T.harzianum2008

0,00

5,00

10,00

15,00

20,00

25,00

30,00

35,00

0 apports 10 T/ha 5 T/ha 5 T + 5 T/ha

Po

urc

en

tage

de

pla

nte

s p

rése

nta

nt

de

s sy

mp

tôm

es

de

V

ert

icill

iose

Evolution des attaques de Verticilliose en pourcentage de plantes touchées en fonction de différents apports de pellets de moutarde

02-mai

15-mai

05-juin

27-juin

30

Site d’implantation

Essai réalisé chez Mr et Mme SAUDEL à Clairac (47), sous multi tunnel 5m en sols contaminés

Matériel Végétal

Variété Cristal sur porte-greffes Beaufort

Mise en place 2008

Objectifs

Etudier l’efficacité de l’introduction d’un champignon antagoniste (Trichoderma harzianum

souche T-22, Trianum-G ou -P) pour « protéger » ces systèmes racinaires en parcelle de production contaminée

Tableau 6 Différentes modalités de l'essai

Modalités Application en

pépinière Application à la plantation Application à + 10 semaines

G + P Poudre (1,5g/m²) Granulés (10g/m²) Poudre (15g/1000 plantes)

P Poudre (1,5g/m²) Poudre (30g/1000 plantes) Poudre (15g/1000 plantes)

Témoin non traité - - -

Tableau 7 Comparaison des effets de différents apports de Trianum sur les attaques de V.dalhiae et sur la vigueur des plantes en fin de

culture

Au 18/09

Modalités % de plantes mortes % de plantes avec V.

dahliae

Note globale vigueur parcelle (1= faible à

5=forte)

G+P 2 14 3.5

P 2 12 3.7

TNT 2 8 4

Toutes les modalités étant attaquées par V.dalhiae au 18/09 (Tableau 7), il n’est pas possible de

montrer un effet de l’introduction de Trichoderma harzianum sur les attaques de champignons sur le

système racinaire des aubergines greffées.

Essai T.harzianum 2011

31

Site d’implantation

Essai conduit sous tunnel 9.6 m chez M. Poncharreau, producteur de la région du

Confluent (Aiguillon 47) en sols contaminés

Matériel Végétal Variété Monarca sur porte-greffes Beaufort

Mise en place 2011

Objectifs

Tester des solutions alternatives pour assurer la durabilité des solutions génétiques actuelles

et futures de lutte contre ces champignons telluriques.

Tableau 8 Effet d'un apport de Trianum sur la fréquence et l'intensité d'attaque par la verticilliose en pourcentage de plantes touchées

14-sept

Modalité % saines % touchées % très touchées

Non Greffé 31 50 19

Greffé Non Traité 8 69 24

Greffé Traité Trianum 10 69 21

Signification au seuil de 5% NS

CV en % 160

Puissance à postériori au seuil de 5% 6

Il n’est pas possible de différencier les 2 modalités traitées et non traitées. Les attaques de V.dahliae

sont identiques dans les 2 modalités, avec peu de plantes saines en fin d’essai.

Les résultats sont un peu différents sur la modalité non greffée et non traitée : les attaques sont plus

tardives et plus faibles, mais comme nous l’avons indiqué plus haut, les plants ont eu une reprise plus

lente et n’ont pratiquement pas produit (Tableau 8).

32

Figure 12 Evolution des attaques de verticilliose en fonction du temps et de différents traitements Trianum

Les attaques sont précoces, dès le début mai en raison d’une climatologie chaude dès le mois d’avril

et des productions qui sont elles aussi précoces. Les attaques explosent au mois de septembre, avec

au final près de 90 % de plantes atteintes (Figure 12).

Dans les conditions d’essai en parcelle de production fortement contaminée par V. dahliae, C.

coccodes et par des nématodes à galles, il n’est pas possible de montrer un effet de 3 apports de

Trichoderma harzianum (Trianum P et Trianum G) sur les attaques de verticilliose.

4.4 Méthodes de lutte chimique

4.4.1 Etude de l’efficacité préventive du Thiophanate-méthyl pour contrôler le

développement de V.dalhiae (essai INVENIO 2007)

Site d’implantation

Essai Réalisé en pots

Matériel Végétal Variété Cristal sur porte-greffes Beaufort

Mise en place Plantation S 14, le 4/04

Objectifs

Tester une stratégie d’utilisation préventive du Thiophanate-méthyl (Topsin), en attendant de

trouver une solution plus respectueuse de l’environnement.

0

20

40

60

80

100

03-mai 03-juin 03-juil. 03-août 03-sept.

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Effet d'un traitement Trianum sur l'évolution des attaques de verticilliose en pourcentage de plantes avec symptômes

Non greffé

Greffé non traité

Greffé traité Trianum

33

Tableau 9 Intensité d'attaque de V.dalhiae sur aubergine en fonction de différentes stratégies de protection à base de Tiophanate

méthyl

Indice d'attaque de V.dalhiae

Modalité 21-juin 12-juil

Témoin non traité 5,9 a 4,5

Trait préventif 4,45 ab 5,2

Préventif + post 15J 2,45 bc 5,8

Préventif + post 15j + 15j 2,85 bc 4,8

Préventif + post 15j + 15j + 15j 1,4 c 4,9

Moyenne 3,4 5,06

NK : signification au seuil de 5% S NS

CV en % 12.1 6.7

Probabilité 0.0001 0.19

Puissance à postériori en % 99 37

Figure 13 Intensité d'attaque de V.dalhiae en fonction de différents traitements avec Tiophanate méthyl

Les attaques de V.dalhiae sur plant d’aubergine greffé sans traitement sont rapides et importantes,

l’inoculation a donc bien fonctionné. On remarque également que le traitement préventif a une

action mais de très courte durée et insuffisante. Seul la répétition du traitement tout les 15 jours

semble relativement efficace et permet de ralentir les attaques si 4 applications sont effectuées.

Malheureusement, on observe une explosion de la maladie au 12 juillet (Figure 13).

Dans les conditions de cet essai, on peut donc noter une certaine efficacité du Thiophanate méthyl

pour bloquer les attaques de V.dahliae en application précoce et préventive en conditions

0

1

2

3

4

5

6

Témoin non traité

Trait préventif

Préventif + post 15J

Préventif + post 15j +

15j

Préventif + post 15j + 15j + 15j

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à 9

Efficacité de différentes stratégies de protection contre V.dalhiae avec tiophanate méthyl avec inoculation artificielle

21-juin

12-juil

34

d’inoculation artificielle à des concentrations importantes. Cependant, nous verrons plus loin (Cf. 5.3

Lutte chimique) que ces résultats ne sont pas totalement satisfaisants.

5 Discussion

5.1 Méthodes alternatives

5.1.1 Essais T.harzianum

Comme le montrent les différents résultats obtenus, les essais de méthodes alternatives avec l’usage

de champignons antagonistes (T.harzianum) ne montrent pas de résultats permettant de prouver

leur efficacité. En effet, on teste généralement 2 formulations de l’agent antagoniste, soit en poudre,

granulés ou bien les 2 associées mais aucun effet positif contre V.dalhiae n’a pu être démontré. Ainsi,

même si ce champignon présente de bons résultats dans la lutte contre V.dalhiae in vitro en

laboratoire, il s’avère inefficace en conditions de production, même dans le cas ou il est associé à un

greffage.

Le pathogène V.dalhiae étant un champignon vasculaire, il pénètre dans la plante au niveau des

racines pour en coloniser les vaisseaux, bloquant l’alimentation de la plante qui dépérit. Ce mode

d’action du pathogène peut expliquer l’inefficacité de l’antagoniste. En effet, T.harzianum ne

colonise pas les vaisseaux de la plante, ce qui rend donc la lutte impossible une fois que la pathogène

a pénétré la plante. Malgré cela, T.harzianum est censé former un bouclier protecteur autour des

racines et prévenir l’apparition de nécroses racinaires par le biais d’un phénomène de compétition et

de mycoparasitisme. Or l’on sait qu’il suffit d’une infime quantité de propagules pour que V.dalhiae

colonise et se multiplie au cœur des vaisseaux de la plante, ce qui peut donc expliquer l’échec de

l’application de cet antagoniste, qui ne constitue pas un barrage suffisant contre l’attaque du

pathogène.

De plus, des hypothèses ont été émises quand à la souche de T.harzianum qui ne serait peut être pas

la plus efficace dans la lutte contre V.dalhiae. En effet, les souches fournies par l’entreprise Koppert

sont des souches T-22 qui ne sont peut être pas les plus adaptées pour lutter contre le pathogène

V.dalhiae.

5.1.2 Essai champignons/bactéries antagonistes et apports de pellets de

moutarde

35

Apport d’antagonistes

Dans le cas de l’essai Vasculeg, on teste le champignon F.oxysporum, déjà testé sur melon l’année

précédente et ayant montré des résultats minimes mais encourageants lorsqu’il est associé à la

bactérie A6R6. De plus, en conditions de laboratoire, l’application de Fusarium oxysporum non

pathogène sur des racines d’aubergine avait montré une réduction de sévérité de la maladie

(Pantelides et al, 2009).

Lors de cette essai Vasculeg 2012, nous n’avons pas pu démontrer une efficacité significative d’un

apport de FO 47, ni même lorsqu’il est associé à la bactérie A6R6. Malgré cela, on note une légère

tendance en faveur de cette technique avec un nombre de plantes touchées par V.dalhiae moindre

comparé à la modalité bactérie seul ou bien au témoin. On peut supposer que la pression de

Verticilliose sur ce site était importante, rendant l’efficacité du traitement moins visible.

De plus, l’application des bactéries et champignons antagonistes n’ayant pu se faire que sur ou sous

la motte et non mélangé directement au substrat lors de la confection des mottes peut également

expliquer une moindre efficacité des traitements.

Apport de pellets de moutarde

L’essai d’un apport de pellets de moutarde ne permet pas non plus de démontrer une efficacité

significative de cette méthode. Malgré cela, une tendance se dégage en faveur d’une application de

10T/Ha de pellets, on observe alors un nombre de plantes touchées inférieure à celui des autres

modalités.

L’apport de pellets de moutarde permet une biodésinfection des sols également appelée

biofumigation. Il s’agit d’une méthode biologique visant à réduire le nombre de pathogènes, de

ravageurs et de semences de mauvaises herbes dans le sol. Elle est basée sur l’utilisation de plantes

riches en glucosinolates, principalement des crucifères (ex : moutarde brune). Lors de la

décomposition de ces plantes, les glucosinolates sont transformés en isothio- et thiocyanates,

molécules volatiles et toxiques pour certains organismes du sol (Figure 14).

36

Figure 14 Mécanismes de la biofumigation

L’effet de la biofumigation contre la verticilliose a été testé dans une série d’essais au champ et en

pot. Les microsclérotes, forme de survie de la verticilliose dans le sol, ont pu être réduits de 19 à

74%. L’efficacité de la biofumigation dépend beaucoup de l’application correcte de cette méthode

(Michel et al, 2009).

De nombreuses raisons peuvent expliquer l’échec partiel de cette technique. En effet, on apporte ici

des pellets de moutarde, ce qui diffère de la méthode relatée dans la bibliographie ou l’on enfouit

une culture de moutarde. Ce choix s’explique par le fait que la culture de moutarde pourrait favoriser

le rhizoctone, champignon tellurique qui attaque les cultures de salade précédant généralement celle

d’aubergine.

Les faibles résultats obtenus au cours de cet essai, au niveau d’un apport d’antagonistes ou bien de

pellets de moutarde ne permettent donc pas de recommander cette méthode de lutte à des

producteurs. Cet essai ayant été mené en conditions de production sur un seul site, on peut supposer

que dans d’autres conditions et sous réserve du bon respect du protocole d’essai on puisse obtenir

de meilleurs résultats pour ces 2 méthodes.

37

Enfin, dans le cas d’essai menés en terre sous tunnel, certains résultats peuvent s’expliquer par le fait

que la présence de V.dalhiae n’est pas homogène dans les sols contaminés. En effet, une

cartographie de la présence du pathogène dans le sol à été effectué en 2011 à la fin de la culture (14

septembre) sur le site de l’essai Vasculeg et on remarque la présence hétérogène de V.dalhiae dans

le tunnel. On peut donc supposer que ce biais peut avoir une influence sur les résultats d’essais,

notamment dans le cas ou certaines zones sont nettement plus touchées que d’autres. La décision a

donc été prise pour l’essai 2012 de ne pas …

5.2 Interactions entre micro-organismes du sol

L’effet d’une interaction entre le pathogène V.dalhiae et d’autres micro-organismes présents dans le

sol n’a pu être démontré. La présence de nématodes ne peut être associée à une augmentation des

attaques de V.dalhiae sur la plante, tout comme la présence d’autres champignons telluriques. Ainsi,

le fait d’agir sur d’autres micro-organismes du sol ne permettrait pas de réduire les attaques de

V.dalhiae sur la plante, cette hypothèse peut être rejetée.

Mode d’action de ces nématodes et champi ??

Les essais réalisés en pots sont délicats à mettre en place du fait de l’inoculation artificielle de

V.dalhiae. En effet, il n’est pas évident de trouver le bon dosage de V.dalhiae permettant de

reproduire les conditions d’un sol contaminé. Ainsi, si le dosage du pathogène est trop important sur

les cultures en pots, cela peut impacté les résultats. Certains traitements, qui pourraient s’avérer

efficaces en conditions de productions ne montrent pas d’effets concluants dans ces conditions de

culture à très forte concentrations de V.dalhiae.

5.3 Lutte chimique

Les méthodes de lutte chimique ayant pu être testée (Tiophanate méthyl) présentent des limites non

négligeables en termes de coût et de respect environnemental ne permettant pas de les

recommander à des producteurs sauf si la stratégie d’application est revue. En effet, cette technique

nécessiterait des applications répétées et ceci peut s’avérer insupportable en termes de coût

financier mais aussi écologique et pose la question de revoir le délai avant récolte (DAR) du produit

qui est actuellement de 7 jours et qui est incompatible avec les rythmes de récolte (2 fois par

semaine) de l’aubergine. De plus, il s’avérerait que le produit est une incidence sur la culture

suivante, des résidus de Tiophanate méthyl ayant été retrouvé sur la culture de salade. Enfin, le

38

produit ne présente pas d’efficacité dans le cas d’un inoculum trop important de V.dalhiae et est

inutile une fois que la colonisation de la plante par le pathogène vasculaire a débutée.

Malgré cela, les résultats sont plus ou moins satisfaisants (dans le cas d’applications répétées) dans le

cadre d’un traitement préventif. Cet essai ayant été mené en conditions d’inoculation artificielle

(culture en pots), on peut émettre des doutes quand à son efficacité en conditions de sols

contaminés.

5.4 Solutions génétiques

Seules les solutions génétiques permettent donc de lutter partiellement contre le pathogène mais

l’avenir des porte-greffes résistants semble incertain face à l’apparition de nouvelle race de

verticilliose (race 2). En effet, on observe depuis quelques années des contournements des

résistances des porte-greffes.

On a pu constater que le critère hauteur du point de greffe n’impactais pas la résistance du plant

d’aubergine greffé contre V.dalhiae, malgré cela il reste important de ne pas greffer trop bas les

plants d’aubergine comme cela a pu être fait dans le passé (à 2 cm en dessous des cotylédons), car le

greffon est alors trop près du sol, le rendant vulnérable à l’attaque de champignon tellurique.

De même, le caractère hétérozygote de la résistance des porte-greffes ou la sensibilité du greffon

n’impacte pas la résistance du plant d’aubergine greffé contre V.dalhiae.

Sur aubergine, les porte-greffes les plus employés sont des porte-greffes hybrides interspécifiques

KNVF ou KNVFFr (Lycopersicum hiristum x Lycopersicum exulentum), identiques à ceux utilisés pour la

tomate : Beaufort, Brigéor, Maxifort… dotés d’un système racinaire puissant, avec peu d’exigence

thermique, ce qui permet une plantation précoce et un bon comportement même dans les sols à

structure compacte (CTIFL, 2010). Ces porte-greffes KNVFFr sont résistants au « corky root » (K)

provoqué par le champignon Pyrenochaeta lycopersici, tolérants aux nématodes (N) de type

Méloidogynes, résistant à V.dalhiae (V), à Fusarium (F) et Fusarium radici-lycopersici. Malgré cela, des

contournements de résistances ont été observés suite à l’apparition de la race 2 de V.dalhiae.

Le greffage sur Solanum torvum est aussi possible, bien qu’il reste très peu pratiqué. Ce porte-greffe

est une plante vivace spontanée des zones tropicales, d’une famille proche des aubergines d’où une

très bonne affinité avec l’aubergine. Sa levée est lente et les entre-noeuds courts d’où des difficultés

lors du greffage. Il est aussi plus exigeant en chaleur que l’aubergine, il faut donc éviter de l’utiliser

dans les conditions de sols froids car on risque alors des problèmes de blocage de végétation ou de

39

perte de résistance à la verticilliose. En culture, il faudra supprimer les rejets du porte-greffe, souvent

épineux, qui risquent de devenir envahissants (CTIFL, 2010)

Des essais ont donc été menés en 2008 et 2009 afin de trouver de nouveaux porte-greffes résistants

à la race 2 de V.dalhiae. Les porte-greffes suivants ont été testés pour leur comportement face à

V.dalhiae et comparés au témoin Beaufort de type KNVFFr (DRS) :

131 et 138 de type KNVFFr (DRS),

STT 3 de type Solanum torvum (Vilmorin)

V295 de type KNVFFr (Vilmorin)

ST90 type Solanum torvum (Vilmorin)

Intégro (Vilmorin)

E 28-33458 (Enza)

Zaralto (Enza)

Java (Takii)

Figure 15 Effet de différents porte-greffes sur l'intensité d'attaque de V.dalhiae

0,00

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3,00

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5,00

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8,00

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Beaufort Zaralto E 28 Java Integro Inte

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Porte-greffes

Intensité d'attaque de V. dahliae en fonction de différents porte-greffes

40

Figure 16 Effet de différents porte-greffes sur le pourcentage de plantes atteintes par V.dalhiae

Il n’a pas été possible de démontrer l’intérêt de ces porte-greffes pour leur comportement face à

V.dalhiae. Seul le porte-greffes Solanum torvum montre des résultats intéressants, avec une

réduction considérable du pourcentage de plantes touchées (Figure 15 et Figure 16). On peut donc

penser que malgré les quelques limites exposées ci-dessus ce porte-greffes pourrait avoir un avenir

prometteur sur les exploitations d’aubergine française, il semblerait qu’il déjà largement utilisé en

Italie.

Malgré cela, l’apparition de la race 2 de V.dalhiae remet vraiment en cause la stratégie de protection

contre V.dalhiae avec les porte-greffes actuels.

6 Conclusion et perspectives

Les solutions actuelles ne permettant de lutter contre le pathogène, il est nécessaire de trouver de

nouvelles méthodes qui pourront assurer durablement la résistance des solutions génétiques dont

nous disposons actuellement.

C’est pourquoi, tout laisse à croire qu’il faut se tourner non pas vers une méthode de lutte qu’elle

soit alternative ou chimique, mais plutôt vers une combinaison de plusieurs techniques. En effet, il

faut maintenant agir sur le système global de culture et non sur seulement un levier de ce système.

0

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Porte-greffes

Effet de différents porte-greffes sur les attaques de V.dalhiae en pourcentage de plantes touchées

41

On pense donc à faire évoluer les rotations, afin d’alterner des cultures hôte du pathogène et non

hôte. Or il semble que ce pathogène puisse affecter de nombreuses racines de plantes (large gamme

de plantes hôtes) et que sa durée de conservation dans le sol soit longue (environ 5 ans), on conseille

donc dans un premier temps d’éviter les rotations avec des cultures sensibles (tomate ou melon). De

plus, la pratique de la rotation présente des limites car de nombreux producteurs renouvelle leur

culture d’aubergine sous abri tout les ans car il s’agit de leur principale source de revenus, il n’est

donc pas envisageable d’alterner les cultures d’été.

Un projet a donc été mis en place en 2009 (PRABIOTEL), projet porté par le CTIFL dont l’objectif est la

gestion des bioagresseurs telluriques en cultures légumières par l’intégration de pratiques

améliorantes dans les systèmes de culture. De nombreuses solutions sont proposées avec

notamment une mise en place d’intercultures d’hiver un an sur 2 (avec une culture de salade d’hiver

l’année suivante), avec un engrais vert (sorgho, moutarde…) suivit d’une biofumigation en mars.

Une autre pratique proposée dans le cadre du programme Prabiotel est l’usage de la solarisation,

afin de désinfecter les sols à l’aide du rayonnement solaire. Il s’agit d’utiliser l’effet thermique d’un

film de polyéthylène posé sur le sol, il y a alors très forte élévation de la température du sol et un

effet sur le développement des adventices et des champignons telluriques. Cette technique encore

peu présente en France, est très développée dans des pays tels que l’Israël dont elle est originaire.

Malgré cela, cette méthode ne peut convenir à des producteurs dont la culture principale est

l’aubergine car la solarisation est mise en place entre le 15 juin et le 15 juillet et nécessite un

bâchage du sol pour une durée minimale de 45 jours sous abri et 60 jours en plein champs (Mazollier,

2009). Il faudrait donc conserver la culture d’aubergine un an sur 3 en alternance avec des pratiques

améliorantes d’été que sont la solarisation et la mise en place d’engrais verts de septembre. De plus,

la solarisation être réalisée que dans les régions présentant un fort ensoleillement (Sud de la France).

La recherche de nouveaux porte-greffes résistant à la race 2 de Verticilliose doit se poursuivre. On

peut pour le moment conseiller aux producteurs d’aubergine d’alterner les porte-greffes. En effet,

l’emploi continu du même porte-greffe sur une même parcelle peut conduire à des contournements

de la résistance par les parasites et/ou le développement d’un parasitisme spécifique du porte-greffe

(CTIFL, 2010).

Enfin, en dernier recours quelques producteurs opte désormais pour le hors sol, même si ce type de

culture reste minoritaire en raison de l’importance de l’investissement et des coûts de production

élevés. La production d’aubergine hors sol en France s’élèverait actuellement à 10 Ha soit environ

42

3000 T produites par an contre 20 000 T produites au total en France chaque année dont 4000 T dans

le Lot et Garonne.

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44

8 Table des figures

Figure 1 Symptômes de Verticilliose sur feuille ...................................................................................... 7

Figure 2 Symptômes de Verticilliose sur feuille ...................................................................................... 7

Figure 3 Symptômes de dépérissement sur plante entière .................................................................... 7

Figure 4 Vue générale de l'exploitation ................................................................................................ 17

Figure 5 Vue générale du tunnel ........................................................................................................... 18

Figure 6 2 rangs du tunnel ..................................................................................................................... 18

Figure 7 Effet de différentes hauteurs de point de greffe sur l'évolution des attaques de Verticilliose

............................................................................................................................................................... 21

Figure 8 Evaluation du niveau moyen de symptômes de verticilliose en fonction de la présence ou

non de nématodes ................................................................................................................................ 25

Figure 9 Intensité d'attaque de V.dalhiae en fonction de la présence ou non de différents

champignons telluriques ....................................................................................................................... 27

Figure 10 Effet de différents apports d'antagonistes sur l'évolution des attaques de Verticilliose ..... 28

Figure 11 Effet de différents apports de pellets de moutarde sur l'évolution des attaques de

Verticilliose ............................................................................................................................................ 29

Figure 12 Evolution des attaques de verticilliose en fonction du temps et de différents traitements

Trianum ................................................................................................................................................. 32

Figure 13 Intensité d'attaque de V.dalhiae en fonction de différents traitements avec Tiophanate

méthyl .................................................................................................................................................... 33

Figure 14 Mécanismes de la biofumigation .......................................................................................... 36

Figure 15 Effet de différents porte-greffes sur l'intensité d'attaque de V.dalhiae ............................... 39

Figure 16 Effet de différents porte-greffes sur le pourcentage de plantes atteintes par V.dalhiae ..... 40

9 Annexes

Résultats complets Vasculeg