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Laurent Toubiana
INSERM U444 « Epidémiologie et Sciences de l’Information »
Faculté de Médecine Saint Antoine27, rue Chaligny
75571 Paris
13H30 - 14H15 : SIG et STIC en Santé INSERM CNRS
STIC en Santé INSERM/CNRS
Aide à la décision et optimisation de l’offre de soin pour l’insuffisance rénale terminale.
Système d’Information Géographique en Santé :
Approche spatio-temporelle des déterminants de santé.
STIC en Santé INSERM/CNRS
Grenoble Du
12-13 Février 2003
au21-22 Décembre 2004
22 mois
Réseau collaboratifProjet STIC Santé INSERM/CNRS
Paul LandaisLBIM SIMS-REIN Hôpital NeckerParis
Michel SimonetTIMC-CNRSGrenoble
Philippe MosséLEST – CNRSAix en Provence
Laurent ToubianaINSERM U444 Paris
Christian JacquelinetEtabl. Français des GreffesParis
Christophe TufferyESRI-FranceParis
Rappel : Réseau collaboratif
Objectifs
Répondre aux besoins de représentations, d’analyses et de prédictions nécessaires à la prise de décision
Répondre à la question de l’adéquation de l’offre à la demande de soins.
Améliorer la maîtrise des coûts et d’anticiper les évolutions du système de soin.
Le retour d’InformationLe retour d’Informationclientsuniverselsclients
universels
serveur web dynamique serveur web dynamique
donnéesdonnées
Base d’évènementsBase d’évènements
Base d’identitéBase d’identité
Datamart REINDatamart REIN
VUESEntrepôt
Outilstableaux
debord
SIG
Analysesstatistiques
Une architecture n-tiersUne architecture n-tiers
REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie)
Données
Support cartographique et Système d’Information Géographique
La représentation cartographique au centre de l’interface du système d’information
MapoFlash : Une boîte à outils cartographique Web
MapoFlash : Accueil
MapoFlash : chargement de données
MapoFlash : représentation de données
MapoFlash : Manipulation cartes
MapoFlash : échelles et couleurs
MapoFlash : Krigeage
Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb
Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb
PaGeom : Annuaire cartographique
Intégration du module de cartographie interactive sur le site SarsNet
GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux
GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux
MetaSurv : Création de plateformes de surveillance incluant un SIG interactif
MetaSurv
La surveillance des maladies transmissibles émergentes nécessite la mise en place rapide d’outils efficaces pour
la collecte de données, le retour d’information pour l’aide à la décision en cas de crise
Le projet MetaSurv : un outil de création rapide de plateforme de surveillance à la disposition de non‑spécialistes de l’informatique.
MetaSurv : 2 Aspects Principaux du projet
La souplesse d’adaptation du système à de nouvelles surveillances comportant :
la possibilité de mettre en place de nouvelles surveillances de pathologie sans effort de développement important.
la possibilité « cloner » le système pour créer rapidement de nouveaux systèmes complets de surveillance.
La restitution graphique et cartographique interactive des données observées.
MetaSurv : Initialisation de la plateforme
Nous appelons « Administrateur » la personne qui met en place et gère un réseau de surveillance.
Le statut d’administrateur ouvre tous les droits de gestion du site
tant du point de vue de la création des surveillances que de celui de l’animation du réseau de collaborateurs de surveillance.
MetaSurv : Mise en place des surveillances
Pour créer une nouvelle surveillance, il suffit de remplir quelques champs :
1) Le nom de la pathologie 2) L’espace sur lequel opère la surveillance (Monde, pays, ou tout autre lieu d’intérêt)
3) Un texte qui sera affiché pendant la saisie des cas.
Validation Les tables de la bases de données relatives à cette nouvelle maladie sont automatiquement crées.
Il faut maintenant définir les variables à surveiller
MetaSurv : Mise en place des surveillancesEtape 2 :création des variables
Créer les champs relatifs aux variables à surveiller est très facile il suffit de renseigner :
1) Le nom de la variable2) Le type de cette variable (numérique liste, radiobox texte date…)3) le cas échéant des valeur de contrôle du champ
Cette procédure est itérative tant qu’il y a de nouvelles variables pour la surveillance de cette maladie
C’est tout : La nouvelle surveillance est disponible.
MetaSurv : Inscriptions et création du réseau
MetaSurv : Fonction d’animation du réseau
Serveur de NewsForumFiches personnellesPartage de documentStatistiques de connexionAide contextuelle
Visualisations : Graphiques interactifs
SCEPID : Remerciements
Tous mes remerciements aux étudiants qui au cours de leur stage se sont relayés depuis un an pour la réalisation de ce projet :
Alexandre Herer (UTT)
Elodie Dusch (MST-ISASH)
Romain Rousselin (UTT)
Carole Chapoy (UTT)
Gaetan Bonnard (UTC)
Stéphane Moreau(UTC)
http://www.scepid.org
Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM »
Revues à comité de lecture
Toubiana L, Richard JB, Landais P. A Geographical Information System for End-Stage Renal Disease : the SIGNe. Nephrol Dial Transplant 2004 (in press)Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a
Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Stud Health Technol Inform 2003;95: 95-100. Landais P. Supply of care and prevention. Presse Med. 2002 Feb 2; 31(4): 176-85.Landais P. Epidemiology of care demand. Presse Med. 2002 Feb 2; 31(4): 167-75. Autres communications
Richard JB, Toubiana L, Ben Said M, Le Mignot L, Jais JP, Mugnier C, Landais P. Projet SIGNe : Intégration d’un Système d’Information Géographique pour la Néphrologie Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122
Ben Said M, Mugnier C, , Le Mignot L, Richard JB, Jais JP, Le Bihan C, Toubiana L, Landais P. Multi sources InformationSystem and Epidemiologic Follow-up of Chronic DiseasesCongrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122
Flahault A., Vibert JF, Thomas G, Toubiana L, Hanslik T, Boelle PY, Dorleans Y, Blanchon T, Viboud C, Vergu I, Alvarez F, Le Menac’h A., Legrand J, Sarter H, Jacob S, Carrat F, Massari V, Le Pont, Gropetis G, Valleron AJ, Le réseau Sentinelles 1984-2004 : 20ans d’expérience en France. Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S37.
Duny Y, Landais P, Ben Saïd M,de Cornelissen F, Marty L, Daurès JP. Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau R.E.I.N en Languedoc-Roussillon. ADELF Bordeaux, septembre 2004.
Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. Dédoublonnage d'identités dans des bases web dynamiques multi-sources. ADELF Bordeaux, septembre 2004.
Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. MEDINFO. San Francisco, september 2004.
Richard J-B, Toubiana L, Ben saïd M, Le Mignot L, Jais J-P, Mugnier C, Landais P. GIS Integration in Nephrology : a SIGNe. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September 2004. Journal of Epidemiology and Community Health. 2004 Aug; vol 58; A47-A48
Ben saïd M, Mugnier C, Le Mignot L, Richard J-B, Jais J-P, Landais P. Multi Sources Information System and Epidemiologic Follow-up of Chronic Disease. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September 2004.
Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. A patient identification web server for avoiding doublons in web dynamic databases. Porto Portugal September 2004.
Toubiana L, Herer A, Rousselin R, Chapoy C ,Dusch E, Flahault A MetaSurv : Un outil téléchargeable pour la création rapide de plateformes de surveillance sur Internet incluant un système d’information géographique interactif. Congrès MEDEC 2004 16-19 mars 2004 Paris
Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM » (suite)
Autres communications (suite)
Crépey P, FP Alvarez, M Barthélémy, L Toubiana. Étude de la variabilité d'un modèle de réseau "scale-free" de taille finie. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004).
Alvarez FP, P Crépey, L Toubiana, M Barthélémy. Dynamique de la propagation d'une maladie infectieuse sur un réseau "scale free" à liens fluctuants. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004).
Simonet M, Toubiana L, Simonet A, Ben Saïd M , Landais P Ontology and Geographical Information System for End-Stage Renal Disease: the SIGNe. COSIT’03 Conference on Spatial InformationTheory 24-28 September2003, Ittingen, Switzerland
Toubiana L "Utilisation des SIG et des NTIC en Epidémiologie" Colloque RISE Réseau International Santé Environnement (INVS) ‑ Bierville (16-17 mai 2003) Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a
Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Medical Informatics in Europe. Saint Malo, 2003.Toubiana L "Système d’Information Géographique en Santé pour l’Insuffisance Rénale Terminale" 15eme rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2003 »
‑ Paris (4, 5, 6 mars 2003) Guillon D, Landais P. for the SIMS@REIN working Group. A multi-source information system for End-Stage Renal Disease. EDTA registry meeting Berlin 2003.Ben Saïd M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Mugnier C, Taupin P, Jais JP, Simonet M, Landais P. Interface web dynamique et architecture n-tier pour
l’insuffisance rénale terminale. E-Colloque® Interrégional 3ème édition Télémédecine 2002, 27-28 septembre 2002. Landais P, pour le groupe SIMS REIN. Un Système d’Information Multi-Sources pour l’Insuffisance Rénale terminale. Colloque Technologies pour la santé. Ministère de la
Recherche et de la Technologie. Paris, Juin 2002.Guillon D, Ben Saïd M, Gaspoz F, Simonet A, Jacquelinet C, Mugnier C, Simonet M, Landais P. Fusion d’un environnement de développement : du client à l’entrepôt de
données. 1ères Journées de l’Information Médicale et de Santé – Stratégie Qualité Paris, 23-24 mai 2002Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe SIMS@REIN Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau
Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Colloque AIM. Paris, 2001. Toubiana L, "Système d’Information Géographique et Internet pour la surveillance des épidémie " SIG2002 Conférence Francophone ESRI ‑ Issy-les-Moulineaux (2-3 octobre
2002) Toubiana L, Flahault A, Vibert JF, Valleron AJ "A customizable internet-based system with geographic representation for health surveillance" IEA XVI World Congress of
Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002)Tuckwell HC, Hanslik T, Flahault A, Toubiana L, Valleron AJ "Neisseria Meningitidis: Dynamical Models for its Evolution and Control under Various Vaccination Schedules"
IEA XVI World Congress of Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002)Massari V, Toubiana L "A significant decrease in volontary HIV testing in general population in France" AIDS2002 XIV International AIDS Conference, Barcelone Spain (7-12
Juillet 2002) Landais P. Evolution of the care procedures for end-stage renal disease. Colloque Franco-allemand. La greffe en 2001. Strasbourg, 24 juin 2002.Toubiana L, "Intégration de la Géostatistique au SIG : de nouveaux horizons pour l'Information Géographique. L’exemple du Réseau SENTINELLE - INSERM " 14eme
rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2002 » ‑ Paris (9-11 avril 2002)
Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM »
(suite)
Mémoires d'étudiant
Gaetan Bonnard "MapoFlash : Développement d'un système d'information géographique interactif sur le Web" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004
Stéphane Moreau "MetaSurv : Développement d'un site de surveillance épidémiologique paramétrable en technologie Flash." Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004
Carole Chapoy "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004
Romain Rousselin "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003
Benoist J, Poulain C, Lobo D, Klepper C, Crémieu H, Labescat AL."Développement d’un algorithme de lissage par potentiel fondée sur les voisinages spatiaux de portée variable sous Matlab » Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2003
Dutsch E "Implémentation d’algorithmes d’analyse spatiale et de leur représentation graphique en technologie interactive « swf » sur internet" Mémoire de stage de MST Informatique et Statistique Appliquée aux Sciences de l’Homme, Université René Descarte, Paris V - 3 mois (Dir. Toubiana L) 2003
Diouf ML "Approche spatio-temporelle des déterminants de santé, aide à la décision et optimisation des l’offre de soin : le cas de l’insuffisance rénale terminale dans la région du Limousin" DESS Geomarketing université de Créteil - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003
Nguyen Sothavy " Création d’un portail Web sur les ressources documentaires concernant les thèmes « Géographie de la Santé » et «Epidémiologie et Environnement » en France et dans le monde. " Mémoire de stage de DESS en sciences de l'information et de la documentation spécialisée de L'Institut National des Techniques de la Documentation - 2 mois (Dir. Toubiana L) 2003
Herer A "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003
Grech G "Système d’Information Géographique sur Internet pour la surveillance des épidémies" Mémoire de stage de DESS de Géomatique de l’Université d’Orléans - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2002
Elluard M, Miel M, Piel B "Effet spatial de la mortalité au USA" Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2002
Livres
Hiesse C, Jacquelinet C, Landais P. Insuffisance rénale chronique. Traité de Santé Publique. F. Bourdillon, G. Brücker, D. Tabuteau Edit. Med Sciences Flammarion Publ. Paris 2004. pp 239-244.
Toubiana L, Viboud C. Flahault A. Valleron AjV. Geography and Health Edition INSERM 1-228, Paris 2003Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe SIMS@REIN: Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau
Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). AIM 2001.
Développements à venir
Développer l’interface entre Data Warehouse du système d’information REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie) et un SIG-Internet.
Proposer des simulations et envisager des scénarios d’optimisation Offre/Demande de soins.