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Introduction à l’informatique médicale Pr. F. Kohler [email protected] .fr

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Computer in medical field

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  • Introduction linformatique mdicalePr. F. [email protected]

  • Domaine de linformatique mdicaleLinformatique technologiqueEmbarque dans le matriel mdical : imagerie, traitement du signal, automate de laboratoire, chirurgie assiste (robot).Linformatique au service de la communicationTlmdecine, Tlsant, @Sant : patient/PS, PS/PSLinformatique au service de la documentation et de la connaissanceBase de donnes bibliographiques, systme daide la dcisionLinformatique au service de la prise en charge coordonne du patientDossier mdical partag, systme dinformationLinformatique au service de la sant publique Systme de surveillance pidmiologique et dalerteToutes ces applications de linformatique ncessitent lemploi dlments de langage mdical partag

  • Du langage naturel un langage standardisLe langage naturel est :Spcifique une langueSouvent ambigu :SynonymiePolysmieContextualit :La petite brise la glace

  • Le traitement et le partage de linformationNcessite une standardisation pour enlever toute ambigitCeci concerne les diffrents champs de la sant :Diagnostics, Actes, Mdicaments, Dispositif mdicaux, Etablissement de sant, Professionnel de santCeci est impratif pour les traitements :Traduction dans diffrentes langues, Facturation, Statistiques, Aide la dcision, Surveillance et Alerte.

  • Un exempleQuel est le mode dentre ?Quand a-telle t hospitalise ?

    douleurs thoraciques rtrosternales caractristiques irradiant dans le bras gauche : ANGOR

    OAP : dme aigu du poumonHTA : hypertension artrielle ou hystrectomie total par voie abdominale

    Bilan habituel ?.

    Madame X a t hospitalise en urgence pour des douleurs thoraciques rtrosternales caractristiques irradiant dans le bras gauche dont les premiers pisodes remontent 2 ans avec survenue l'effort ou au froid. Il n'y avait pas d'OAP. Les enzymes cardiaques taient leves avec un trac ECG perturb permettant d'affirmer le diagnostic d'infarctus postrieur du myocarde. Cette patiente, obse (120KG), est porteuse d'un diabte quilibr dont nous n'avons pas modifi le traitement insulinique. Elle prsente galement une hypercholestrolmie 3,2 g/l. Malgr nos recommandations, elle continue fumer environ 2 paquets de cigarettes par jour. Au niveau gyncologique, elle a un syndrome prmnopausique assez bien tolr pour lequel aucun traitement n'a t envisag. Dans les antcdents, on ne note pas d'IVG, mais une HTA en 86. Le bilan habituel et le traitement par angioplastie endoluminale de cet infarctus ont permis de laisser sortir la patiente au bout de 15 jours.

  • On peut faire mieuxHirarchisation et synthseMadame X ne le 10/03/1935 est hospitalise du 10/03/09 au 25/03/09 en provenance de son domicile et quittant l'entit pour un autre tablissement de soins de suite et de radaptationProblme actuel ayant motiv le plus les soinsInfarctus postrieur aigu du myocarde avec Angor ancien, trac ECG perturb caractristique Enzymes cardiaques levessans dme aigu du poumon ni insuffisance cardiaqueAutres problmes actuelsDiabte insulinodpendant sans complicationsHypercholestrolmieTabagisme - Obsit par excs caloriqueSyndrome prmnopausique avec mnorragiesProblme pass pouvant avoir des consquencesHystrectomie totale par voie abdominale en 1986Actes diagnostiques et thrapeutiques en Y:CoronarographieAngioplastie coronaire endoluminale

  • Et aprs ?Il faut coder Dictionnaire Dictionnaire des termes mdicauxClassification CIMNomenclature NGAPThsaurus MeSH

  • DictionnaireRecueil des mots d'une langue, des termes d'une science, d'un art, rangs par ordre alphabtique, avec leur signification.Un dictionnaire de la langue, indique la dfinition, l'orthographe, les sens et les emplois des mots d'une langue.Autres : dictionnaire de synonymes, un dictionnaire d'orthographe, un dictionnaire de conjugaisons, un dictionnaire d'homonymes, un dictionnaire de rimes, dictionnaires bilingues, voire multilingues.Ouvrages de type encyclopdique qui contiennent, class par ordre alphabtique ou thmatique, tout ce qui concerne une science, un art, des faits ou des noms :Un dictionnaire de mathmatiques, un dictionnaire de mdecine, un dictionnaire d'conomie, un dictionnaire d'informatique, un dictionnaire de noms propres.

  • ClassificationSystme organis et hirarchis de classification d' objets. *Suivant les objets considrs (les espces vivantes, les maladies, les produits ou services, les toiles, les documents dans une bibliothque...), se sont dvelopps diffrents systmes de classification.Les classifications sont utilises dans tous domaines d'activits humaines. Les classifications portant sur un domaine limit sont gnralement bien admises par les spcialistes du domaine. Les classifications vocation universelle ne peuvent faire abstraction d'un point de vue et sont, de ce fait, l'objet de nombreuses critiques. Elles apportent cependant un clairage sur la nature de la connaissance.DeweyLes classifications sont trs importantes pour organiser les connaissances et le travail de chacun au sein de l'ensemble. Classer les objets ou les connaissances, c'est dire comment ils/elles se situent les un(e)s par rapport aux autres. Plusieurs points de vue complmentaires peuvent tre considrs.Les classifications se distinguent en fonction du formalisme apport soit aux classes soit aux relations entre ces classes et l'arborescence qui en rsulte.

  • NomenclaturesDsigne une instance de classification (tableau, liste, rgles d'attribution d'identit...) faisant autorit et servant de rfrence une discipline donne. Le mot et l'ide viennent directement du latin nomenclatura (1559). Le nomenclator tait un esclave qui clamait les noms des plats d'un dner, annonait les personnes qui entraient. inventaire des termes propres un domaine dfini.

  • ThsaurusType particulier de langage documentaire. Constitu d'un ensemble structur de concepts reprsents par des termes, pouvant tre utiliss pour l'indexation de documents dans une banque de donnes bibliographiques ou dans un catalogue de centre de documentation, des fins de recherche documentaire.Deux types de termes composent un thsaurus:les descripteurs utiliss pour indexer un document;les non-descripteurs qui ne peuvent pas tre employs pour indexer un document, et qui renvoient au descripteur utiliser. Ils sont utiliss la recherche.MeSH

  • MeSH

  • Conditions dun bon codage :Codage bi-univoque :Un seul terme ne dsigne quun objetUn objet nest dsign que par un seul terme Pas d'ambiguitni par polysmieni par homonymie

  • Classification Mono-AxialeEnsemble d'objets classerClasses PrincipalesClassesFilles1er niveauClassesFilles2me niveauDans une classe, le critre donn sapplique tous les lments de la classe.Les critre se succdent dans un ordre dimportance dcroissante

    Classification Mono-Axiale

  • MultiaxialAxe 1(Nosologique)Axe 2(Topographique)3Combine des termes appartenant des classes diffrentes Connections des termes de catgories diffrentes par un langage ( type : est un ,a , traite, est caus par )

    Multiaxial

  • Fonction dadjectifs de la langue naturelle

    Degr de certitudeIntensit , volutionAssertionModificateurs

  • Classification statistique internationale des maladies et des problmes de sant connexe (CIM)W. Farr (1839)First annual report. London, Registrar General of England and Wales"Les avantages d'une nomenclature statistique uniforme, mme imparfaite, sont si vidents qu'il est surprenant qu'aucune attention n'ait t accorde sa mise en vigueur dans les tables mortuaires. En de nombreuses circonstances, chaque maladie a t dsigne par trois ou quatre termes, et chaque terme a t appliqu de nombreuses maladies diffrentes : des noms vagues et impropres ont t employs, ou bien des complications ont t enregistres la place des maladies primitives. Dans ce domaine de la recherche, la nomenclature est d'une importance aussi grande que les poids et mesures dans les sciences physiques, et elle doit tre tablie sans dlai."

  • Historique==> proposition en 1855 d'une nomenclature divise en 5 groupesmaladies pidmiques,maladies constitutionnelles (gnrales),maladies locales selon leur localisation anatomiquemaladies du dveloppementmaladies consquences directes d'un traumatisme

  • Classification statistique internationale des maladies et des problmes de sant connexe (CIM 10ime rvision)Historique1893 Jaques Bertillon. Nomenclature internationale des causes de dcslargissement progressif du domaine au-del des maladies et des traumatismesCIM 9 : 1975CIM 10 : Version actuelle utilise en FranceCIM 11 : Travaux prparatoires en cours

  • Prsentation de la CIM 10CIM 10 Mise en application 1/1/1993 version anglaise et 1/1/94 version franaise3 volumesVolume 1 : Table analytiqueClassification elle mmeClassification de la morphologie des tumeurs (anatomopathologie)Listes pour les mises en tableauxDfinitions, rglementVolume 2 : Mode d'utilisationIndications et instructions pour l'utilisation du volume 1Historique de la classificationVolume 3 : Index alphabtiqueIndex des chapitres I XIX et XXIIndex des causes de mortalit et de morbidit (Chapitre XX)Index des mdicaments et produits chimiquesEnrichissement nationaux (France : extension ATIH)

  • CIM 10 : Volume 1 AnalytiqueMono-axiale :tiologie (maladies infectieuses, tumeurs)systme (maladies cardio-vasculaires)21 Chapitres :19 chapitres pour coder la pathologiePlus :1 chapitre : Causes externes de morbidit et de mortalit1 chapitre : Facteurs influant sur l'tat de sant et motif de recours aux service de santUne classification supplmentaire : M "Morphologie" des tumeurs

  • CIM 10 : Volume 1 AnalytiqueCode alphanumrique1 lettre 3 ChiffresLettre U rserve des adjonctions, modifications, classifications provisoiresParois double code : Code (tiologique) * (manifestation)PrsentationTitre du chapitre avec limite des codesComprend (inclusion)A l'exclusion deListe des groupesPuis sous titre des groupes et limites des codesRubrique 3 caractres Subdivisions

  • CIM 10 : Volume 1 AnalytiqueLes 21 chapitres1 : certaines maladies infectieuses et parasitaires (A00-B99)2 : Tumeurs (C00-D48)3 : Maladies du sang et des organes hmatopotique et certains troubles immunitaires (D50-D89)4 : Maladies endocriniennes, nutritionnelles et mtaboliques (E00-E90)5 : Troubles mentaux et du comportement (F00-F99)6 : Maladies du systme nerveux (G00-G99)7 : Maladies de l'il et de ses annexes (H00-H59)8 : Maladies de l'oreille et de l'apophyse mastode (H60-H95)9 : Maladies de l'appareil circulatoire (I00-I99)10 : Maladies de l'appareil respiratoire (J00-J99)11 : Maladies de l'appareil digestif (K00-K93)12 : Maladies de la peau et du tissu cellulaire sous-cutan (L00-L99)13 : Maladies du systme osto-articulaire, des muscles et du tissu conjonctif (M00-M99)14 : Maladies de l'appareil gnito-urinaire (N00-N99)15 : Grossesses, accouchement et puerpralit (Ooo-O99)16 : Certaines affections dont l'origine se situe dans la priode prinatale (P00-P96)17 : Malformations congnitales et anomalies chromosomiques (Q00-Q99)18 : Symptmes, signes et rsultats anormaux d'examens cliniques et de laboratoire, non classs ailleurs (R00-R99)19 : Lsions traumatiques, empoisonnements et certaines autres consquences de causes externes (S00-T98)20 : Causes externes de morbidit et de mortalit (V01-Y98)21 : Facteurs influant sur l'tat de sant et motif de recours aux service de sant

  • CIM 10 : Volume 1 AnalytiqueUne classification hirarchique

    CIM 10Chapitre 1(Bornes des codes)Chapitre 21Catgorie 1Catgorie 2Catgorie n3 caractres1 lettre2 chiffresNotion de groupe(Bornes des codes)ExtensionsOMSATIH

  • Titre et bornes du chapitreContexte : exclusions / inclusions avec bornes des groupesExemple

  • ExempleDouble codage (dague astrisque)Classification

  • ExempleMme X, passagre d'un autobus est blesse lors d'un accident entre le bus et une mobylette, prsente l'entre l'hpital une fracture ouverte de la mallole externe ( S82 .6 .1).0 Ferme.1 ouverteOccupant d'un autobus bless dans un accident de transport (V70-V79) A l'exclusion de: minibus (V40-V49) Les subdivisions suivantes quatre caractres s'appliquent aux catgories V70-V78: .0 Conducteur bless dans un accident en dehors de la circulation .1 Passager bless dans un accident en dehors de la circulation .2 Personne l'extrieur du vhicule blesse dans un accident en dehors de la circulation .3 Occupant, sans prcision, d'un autobus, bless dans un accident en dehors de la circulation .4 Personne blesse en montant ou en descendant du vhicule .5 Conducteur bless dans un accident de la circulation .6 Passager bless dans un accident de la circulation .7 Personne l'extrieur du vhicule blesse dans un accident de la circulation .9 Occupant, sans prcision, d'un autobus, bless dans un accident de la circulation V70 Occupant d'un autobus bless dans une collision avec un piton ou un animal A l'exclusion de: collision avec un vhicule traction animale ou un animal mont (V76.-) V71 Occupant d'un autobus bless dans une collision avec un cycle V72 Occupant d'un autobus bless dans une collision avec un vhicule moteur deux ou trois roues V73 Occupant d'un autobus bless dans une collision avec une automobile ou une camionnette

  • Chapitre 21 : Facteurs influant sur l'tat de sant et motifs de recours aux services de sant (Z00-Z99)Contacts avec service de sant pour examens divers (Z00-Z13)exemple : Z00.6 Examen de comparaison et de contrle dans le cadre d'un programme de recherche cliniqueRisques lis des maladies transmissibles (Z20-Z29)exemple : Z20.6 Sujet en contact avec et expos au virus de l'immuno dficience humaine [VIH]Motifs lis la reproduction (Z30-Z39)exemple : Z30.0 Conseils et avis gnraux concernant la contraceptionRecours pour actes mdicaux et soins spcifiques (Z40-Z54)exemple : Z41.2 circoncision rituelleSant menace par conditions socio-conomiques et psycho-sociales (Z55-Z65)exemple : Z59.5 Pauvret extrmeAutres motifs de recours aux serv. de sant (Z70-Z76)exemple : Z71.1 Sujet inquiet de son tat de sant (sans diagnostic) "Bien portant inquiet"Antcdents personnels et familiaux et de certaines affections (Z80-Z99)exemple : Z85.0 Antcdents personnel de tumeur malignes des organes digestifs

  • Mise en tableauListe pour la mise en tableau en vue de statistique de morbidit et de mortalitStatistiques descriptives de mortalit et de morbiditSuivi de la mortalit et de la morbidit mondiale par lOMS

  • Principe du codageToujours utiliser les volumes alphabtique et analytiquesNe pas interprterToujours vrifier dans l'analytiqueToujours lire "Exclusion" et "Inclusion"Connatre les bornes de codes des chapitresFormation au codage

  • Utilisation de la CIM 10Statistiques internationales et nationales de mortalit et de morbiditCertificat de dcsMaladies dclaration obligatoireBilan dactivit des tablissements de santProgramme de mdicalisation des systmes dinformation (PMSI)Court sjour : RUM et RSSSSR : RHSPsychiatrie : RIS

  • La description des actesLa nomenclature gnrale des actes professionnels (NGAP)La classification commune des actes mdicaux (CCAM)Le catalogue des actes de rducation radaptation (CdARR)

  • La NGAPObjectif : TarificationReprer les actes raliss par sages femmes et auxiliaires mdicaux et les actes intellectuels des mdecins, chirurgiens dentistes pour leur attribuer une notation en lettre clLa valeur de chaque lettre cl est fixe lors de la ngociation de la conventionCommission de la nomenclatureEtat : Ministre de la santAssurance maladieProfession : syndicats mdicaux et paramdicaux

  • Les Lettres clExemples Coefficients : nombre indiquant la valeur relative de chaque acte

  • Codage de la CCAM Codes descriptifs de lacte codes supplmentaires 1 2 3 4 5 6 7 8

    1 code de lacte

    2 code activit 3 code extension documentaire4 code phase de traitement

    5 et 6 Modificateurs 7 Association non prvue 8 Remboursement exceptionnel CCAM : Codage, tarification et PMSI

  • Structure du code de lacteLe systme de codification : un code semi-structur de 7 caractres cal sur la structuration des libells AA AA NNNaction

    Accs et/ou techniquetopographiecompteurEvacuation de collection de la cavit pleurale, par thoracotomie sans rsection costale : GGJA002

  • Catalogue des actes de rducation radaptation : CdARRActivits de rducation-radaptation (CdARR BO N 97/6 bis)Les actes sont classs dans 12 catgoriesUn acte appartient une et une seule activitStructure du catalogue : code, libell et dfinitionUtilisation : PMSI champs SSR dans le recueil des activits de rducation, radaptation :Chaque acteur recueille pour chaque patient les actes quil ralise.Chaque semaine, par patient, il fait le cumul des temps des actes quil a ralis dans chacune des 12 activits

  • Typologie des aides au codageRecherche de mots dans les libellsParcours darbre et hypertexteSystmes documentairesSystmes multiaxiauxRseaux smantiques

  • Recherche de mots dans les libellsPrincipeRecherche dun texte littral dans un libellApplicationCodage dans le cadre dun catalogue simpleLimitesLe libell doit comporter lensemble de linformation utilePas de tolrance orthographiquePas de possibilit de prendre en compte diffrentes expressions dun mme conceptPas de possibilit de prendre en compte des inclusions ou exclusions

  • Exemple des limitesComment coder un protinurie orthostatique avec anomalies glomrulaires mineures ?Recherche Protinurie orthostatiqueRponse N39.2 Protinurie orthostatique, sans prcision : Codage imprcis => Consquence sur la tarificationImpossibilit de trouver N06- Protinurie isole avec lsions morphologiques prcise et le 5ime caractre .0 : N06.0 Codage qui doit tre utilisConclusionsIntrt limit dans le cadre de la CIM et de la CCAMCIM 10 et CCAM sur internet

  • Parcours darbre et hypertextePrincipeOrganisation hirarchique avec prsentation chaque niveau des sous niveauxPossibilit dtendre larbre des liens pour constituer un rseau de type hypertexteApplicationConsultation en ligne de la CIM ou de la CCAMLimitesNcessit de connatre les principes dorganisation des classifications et catalogue utilissPas de prise en compte des informations de lindex alphabtique pour la CIMExempleCIM 10 sur internet

  • Systmes documentairesPrincipeChaque code est index laide des mots dun thesaurus comprenant non seulement les concepts du libell mais galement ceux des inclusions et de lindex alphabtiqueDans le thesaurus possibilit de dfinir des synonymes (frres), des relations dappartenance (fils)Possibilit suivant le langage dinterrogation de prendre en compte les exclusions ApplicationToutes nomenclatures, classifications...Documentation scientifique

  • Systmes documentairesLimitesLies lindexation des codes par les analystes de la nomenclatureIndexation manuelle / full texteLies au thesaurus employ et aux relations existantes en son seinThesaurus personnel / MESHLies au langage dinterrogationInterface en langage formel type ESAQuest / Interface en langage naturelExempleAide au codage de certains logiciel commerciaux

  • ConclusionsNomenclatures et classifications imposes dans le cadre rglementaire :CIM 10, CdARR, CCAM, NGAPDifficults pour les nomenclatures et classifications imposes de :Rendre compte des hyperspcialitsTenir compte des volutions rapides des connaissances et techniques (actes)Apport de linformatique dans laide au codage

    ***********************************Globalement, sont reprsents :

    A gauche, les codes :- qui dcrivent lacte () et permettent de le tarifer (), - qui sont ncessaires au groupage dans le PMSI ()

    A droite, des codes supplmentaires qui peuvent tre ncessaires pour prciser les circonstances dans lesquelles lacte a t effectu. Les codes ont une incidence sur la tarification.

    Parmi tous ces codes, deux sont purement descriptifs et ninterviennent pas dans la tarification de lacte ( et ) , ils vous seront expliqus plus avant dans lexpos.

    *Vous avez vu, au dbut de cette formation , la mthode de construction des libells des actes.Les 4 premiers caractres du code sont alphabtiques et correspondent cette structuration du libell : topographie, action, accs et/ou techniqueUn dictionnaire a ainsi t constitu partir de 3 listes :- la liste des topographies- la liste des verbes daction- la liste des techniques et/ou accs********