guide de l’étudiant-e 2018 – 2019 section de...

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Guide de l’étudiant-e2018 – 2019

Section de biologie

SEMESTRE D'AUTOMNE 2018 – 2019

Début des cours Lundi 17 septembre 2018

Dies academicus Vendredi 12 octobre 2018

Inscriptions aux cours Mardi 16 lundi 22 octobre 2018

Inscriptions aux examens Mardi 30 octobre lundi 5 novembre 2018

Cérémonie en l'honneur des diplômés Jeudi 15 novembre 2018

Fin des retraits aux examens Jeudi 6 décembre 2018

Fin des cours Vendredi 21 décembre 2018

Début des examens Lundi 21 janvier 2019

Fin des examens Vendredi 8 février 2019

SEMESTRE DE PRINTEMPS 2019

Début des cours Lundi 18 février 2019

Inscriptions aux cours Mardi 5 lundi 11 mars 2019

Candidature Bourses Master d'excellence Dernier délai : vendredi 15 mars 2019

Inscriptions aux examens Mardi 19 lundi 25 mars 2019

Fin des retraits aux examens Jeudi 16 mai 2019

Fin des cours Vendredi 31 mai 2019

Début des examens Mardi 11 juin 2019*

Fin des examens Vendredi 28 juin 2019*

Inscriptions aux examens Mardi 16 lundi 22 juillet 2019

Fin des retraits aux examens Jeudi 8 août 2019

Début des examens Lundi 26 août 2019

Fin des examens Vendredi 6 septembre 2019

JOURS FÉRIÉS/VACANCES DURANT LES PÉRIODES DE COURS/EXAMENS

Vacances de Pâques Vendredi 19 dimanche 28 avril 2019

Fête du Travail Mercredi 1er mai 2019

Ascension Jeudi 30 mai 2019

Pentecôte Lundi 10 juin 2019

Jeûne Genevois Jeudi 5 septembre 2019

RENTRÉE UNIVERSITAIRE 2019 – 2019 LUNDI 16 SEPTEMBRE 2019

Les dates importantes sont également disponibles en ligne sur www.unige.ch/sciences/Dates

* Sous réserve de modification

DATES IMPORTANTES

TABLE DES MATIERES SECTION DE BIOLOGIE PARTIE I : La Section Section de Biologie 1 Besoin d’un coup de main ? 2 - 4 AEB (Association des Étudiants en biologie) 5 Mobilité 6 PARTIE II : Le bachelor en biologie

Règlement et plan d’études 7 - 9 Grilles horaires & cours

- Grilles horaires de la 1ère année 13- 15 - Descriptifs des enseignements 1ère année 17 - 31

- Grilles horaires 2ème année 35 - 37 - Descriptifs des enseignements 2ème année 39 - 58 - Liste des cours à choix de 2ème année 59

- Grille horaire 3ème année 63 - Descriptifs des enseignements obligatoires 3ème année 65 - 67 - Liste des enseignements à choix restreint de 3ème année 69 - Dates des TP à choix restreint de 3ème année 71

Monographie du bachelor en biologie

- Règlement de la monographie 73 – 74 PARTIE III : Le master

Orientations du master en biologie & Annexe 1 au règlement 75 - 80

- Orientation libre (OL) 81 - Biodiversité et systématique (BDS) 82 - Bioinformatique et analyse des données en biologie (BIADB) 83 - Génétique, développement et évolution (GDE) 84 - Sciences moléculaires du végétal (MPS) 85

Liste des cours réservés au master en biologie 87 - 88 PARTIE IV : Les cours à choix Liste des enseignements à choix restreint et à choix libre 89 - 232 PARTIE V : Les formations rattachées Autres masters ouverts aux titulaires du bachelor en biologie 233 - 235 Formation approfondie et formation continue 236 - 237 Ecoles et programmes doctoraux 238 - 240

Section de biologie

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• La Section de biologie

• Besoin d’un coup de main ?

• AEB (Association des Etudiants en Biologie)

• Mobilité

Partie I La Section

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Section de biologie

Présidence Jusqu'au 31 décembre 2018 dès le 1er janvier 2019 Président : Professeur Didier PICARD

Sciences III – 1er - bureau 1013B T. 022.3796813 [email protected]

Professeur Michel MILINKOVITCH Sciences III – 4ème - bureau 4024B T. 022.3793338 [email protected]

Vice-présidente : Professeure Alicia SANCHEZ-MAZAS

Sciences III – 2ème - bureau 2002 T. 022.3796656 [email protected]

Professeure Françoise STUTZ Sciences III – 1er - bureau 1031C T. 022.3796729 [email protected]

Administration Administratrice : Madame Silvia BELLAY

Sciences III - 2ème - bureau 2004D T.022.3796664 [email protected]

Secrétariat de l'administration : Madame Tania CADORET Sciences III - 2ème - bureau 2004A T. 022.3796666 F. 022.3796748 [email protected]

Secrétariat des étudiants Secrétaire : Madame Sandra DIETHELM

Sciences III - 2ème - bureau 2004A T. 022.3796665 [email protected]

mailto:[email protected]


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BESOIN D’UN COUP DE MAIN ?

S’inscrire à l’UNIGE

Service des admissions UNI DUFOUR – Bureau 222 (2ème étage) Le service des admissions est ouvert du lundi au vendredi de 9h à 13h, hors jours fériés et horaire d’été (juillet/août/septembre) Consulter le site internet du service des admissions pour plus d’information :

• Conditions générales d'admission

• Délai et formalités d'inscription à l'UNIGE

Secrétariat des étudiants de la Section de biologie Madame Sandra DIETHELM Sciences III - 2ème - bureau 2004A T. 022.3796665 [email protected]

Accueil

- de lundi à jeudi : 8h à12h - lundi, mardi et jeudi après-midi : 13h à 15h

Le secrétariat est fermé les vendredis

* Prises de rendez-vous pour les étudiants avec la vice-présidente de la Section * Informations sur les études en biologie * Inscriptions aux travaux pratiques à choix restreint de 3ème année * Inscriptions à la monographie * Inscriptions au master et ses orientations * Guide de l'étudiant et programme des cours de la Section, renseignements

Informations complètes sur le site de la Section de biologie Les questions spécifiques à un cours donné sont à adresser aux enseignants respectifs

Conseil aux études & Coordination mobilité Pour toute question personnelle (orientations, équivalences, échecs, séjours mobilité, problèmes particuliers,…), veuillez contacter le secrétariat des étudiants de la Section de biologie pour prendre un rendez-vous avec la vice-présidente, en charge des étudiants de Biologie.

NE RECOIT QUE SUR RENDEZ-VOUS

http://www.unige.ch/admissions/sinscrire/conditions-admissions/

http://www.unige.ch/admissions/sinscrire/

http://biologie.unige.ch/

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Conseiller aux études de la Faculté des sciences

Le Dr Xavier CHILLIER reçoit toute l’année sur rendez-vous (inscription sur sa porte) dans le bureau 0001 au rez-de-chaussée du bâtiment Sciences III. En outre, durant les périodes de cours, une permanence (sans rendez-vous) est mise sur pied le lundi entre 17h à 18h et le mardi de 10h à12h.

Le conseiller aux études propose une orientation personnalisée sur les voies de formation offertes par la Faculté des sciences, présente les plans d’études et les matières, discute d’une éventuelle réorientation. En cas de difficultés quelconques dans les études (scolaires, matérielles, de santé, de langue, de compréhension ou autre), il convient d’en informer sans délai le conseiller aux études.

Pour plus de détails dans les cursus, l’étudiant peut s’adresser au conseiller aux études de sa propre section. T 022.3796715 – [email protected]

Secrétariat des étudiants de la Faculté des sciences Le secrétariat des étudiants de la Faculté des sciences se trouve au rez-de-chaussée du bâtiment Sciences III, bureau 0003. [email protected] T 022 3796661/62/63 Il est ouvert tous les matins de 9h30 à 12h et les mardi et jeudi de 14h à 16h. Le Secrétariat des étudiants gère les dossiers des étudiants de la Faculté des Sciences. Il a pour missions de :

• Résoudre les problèmes liés aux inscriptions aux cours et aux examens via le portail.unige.ch

• Organiser les examens

• Saisir les notes et envoyer les procès-verbaux en cours et finaux

• Réceptionner les courriers destinés au Vice-doyen en charge de l'enseignement (demandes de congé, demande de prolongation de diplômes, opposition aux éliminations, divers),

• Orienter et renseigner les étudiant

Plus d’info sur le site internet de la Faculté des sciences

Décanat de la Faculté des sciences

Doyen Professeur Jérôme LACOUR Sciences II - bureau 124 T. 022.3796062 [email protected] Vice-doyen en charge des étudiants Professeur Martin GANDER Acacias 2 (mathématiques) - bureau 611 2-4 rue du Lièvre T. 022.3791165 [email protected]

Service militaire

Veuillez-vous adresser à l’Office de liaison Armée-Université pour toute question relative au service militaire.



http://www.unige.ch/sciences/EspaceEtudiant/SecretariatEtudiants.html



http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/servicesauxetudiants/prestationsdelafaculte/armeeuni/

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Section de biologie

Site internet de la Section de biologie Sciences III, 30 quai Ernest-Ansermet Enseignements pour l’obtention des titres suivants :

• Bachelor en biologie

• Master en biologie (avec plusieurs orientations possibles)

• Masters et Certificats d’études avancées

• Doctorat ès sciences, mention biologie

• Doctorat ès sciences en sciences de la vie, Mentions : Biosciences moléculaires, Ecologie et évolution, Génomique et santé numérique, Physique du vivant, Sciences biomédicales, Sciences pharmaceutiques

• Doctorat ès sciences, mention anthropologie

La liste complète des titres est affichée sur le site internet de la Section de biologie Les quatre départements de la Section :

Département de biologie moléculaire (BIMOL) (2ème et 3ème étages de Sciences III) Directeur : Professeur Robbie Loewith Secrétariat : 022 379 61 97 http://www.molbio.unige.ch Département de génétique et évolution (GENEV) (3ème et 4ème étages de Sciences III et 4ème étage de Sciences II) Directeur : Professeur Ivan Rodriguez Secrétariat : 022 379 67 85 http://genev.unige.ch Département de botanique et biologie végétale (BIVEG)

(1er et 2ème étages de Sciences III) Directeur : Professeur Roman Ulm Secrétariat : 022 379 30 16 http://biveg.unige.ch Département de biologie cellulaire (BICEL) (1er et 2ème étages de Sciences III) Directrice : Professeure Françoise Stutz Secrétariat : 022 379 66 70 http://cellbio.unige.ch

http://biologie.unige.ch/

http://www.molbio.unige.ch/

http://genev.unige.ch/

http://cellbio.unige.ch/

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A E B (Association des Etudiants en Biologie)

L'AEB est ouverte à tout(e) étudiant(e) inscrit(e) à la Section de biologie qui souhaite prendre une part active dans la vie estudiantine de la Faculté. Elle est notre moyen d'expression, afin que nous puissions construire notre parcours universitaire plutôt que de le subir. Ses statuts l'engagent à défendre les intérêts des étudiants(e)s, ainsi qu’à se faire le porte-parole des problèmes estudiantins auprès de la Section. L’AEB permet aussi aux étudiant(e)s de se rencontrer dans un autre contexte que celui des cours et favorise l’échange de documents utiles pour la révision des examens (résumés de cours, anciennes questions d’examens, par exemple). Le Comité invite chaque semestre l’ensemble des étudiant(e)s en biologie à venir discuter des objectifs principaux de l’association lors de son Assemblée générale. Pour toutes vos questions : écrivez-nous à l’adresse suivante : « [email protected] ». Dans l’attente de vous rencontrer prochainement, nous vous souhaitons le meilleur dans l’accomplissement de vos études universitaires. Le Comité

Le Comité

E-mail : [email protected]

Site internet de l’AEB Local : Sciences III, en bas des escaliers qui descendent depuis le hall, tout au fond à droite ; l’heure de la permanence est affichée dans la vitrine de l’AEB et sur la porte du local.

http://cms.unige.ch/asso-etud/aeb/

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MOBILITE

Tout-e étudiant-e de la Section de biologie peut envisager d’effectuer une partie de ses études de bachelor ou de master dans une autre université, en Europe (séjours Swiss-European Mobility Programmes - SEMP) ou hors d’Europe (autres accords de mobilité). La durée d’un séjour peut être de 2 à 12 mois, et des bourses de mobilité peuvent être offertes par l’Université. Les enseignements ou stages pratiques effectués dans l’université d’accueil sont validés par un transfert d’ECTS si les examens sont réussis. Les avantages d’un séjour de mobilité sont multiples : - apprendre à maîtriser une autre langue dans un pays non francophone - approcher certaines disciplines sous un angle différent - suivre certains enseignements non dispensés à l’Université de Genève - vivre une expérience personnelle hors-murs, et cela sans interrompre les études de biologie à l’Université de Genève. C’est donc une expérience enrichissante aussi bien sur le plan des études que sur le plan humain.

Pour les étudiant-e-s en biologie, le moment le plus propice pour un séjour de mobilité est la 3ème année du bachelor. La 3ème année complète du bachelor peut être validée si le séjour de mobilité effectué est de 2 semestres et si un plan d’études adéquat a été préalablement validé par la vice-présidente de la Section. Dans le cadre du master, tout séjour de mobilité (par exemple un stage SEMP) doit faire l’objet d’un accord avec le directeur et/ou le responsable du master au sein de la Section de biologie.

Délais Attention, un séjour de mobilité doit être organisé au moins un an à l’avance, soit au début de la 2ème année du bachelor pour une possibilité de séjour pendant la 3ème année, et au début de la 3ème année pour une possibilité de séjour pendant le master. Il y a deux sessions de demandes de place d'échange par année académique. Le délai principal est le 1er décembre correspondant ! Où se renseigner ? Au Guichet mobilité Uni Mail - Rez-de-chaussée, local R055 Tél. +41 22 379 80 86 Ouverture : 10h -13h sans RDV (Le Guichet Mobilité est fermé durant les vacances universitaires d'été) Des informations détaillées concernant les séjours de mobilité peuvent être obtenues sur le site internet de l’UniGe INTERNATIONAL Démarches / Procédure d’inscription Un plan d’études doit être validé par la/le conseiller/ère aux études de la Section, de façon à ce que les crédits que vous aurez acquis à l’étranger soient reconnus dans le cadre de votre diplôme à Genève. Comment l’élaborer ? Choisir 3 destinations par ordre de priorité. Test d'anglais Important, si vous postulez pour une destination où l'enseignement est donné en anglais, il est nécessaire de fournir une preuve de votre niveau d'anglais (TOEFL ou autre). Si vous n'avez pas une certification de votre niveau d'anglais, il sera alors nécessaire (mais attention, pas forcément suffisant !) de passer un test interne à l'UNIGE, attestant un niveau B2 ou C1. Attention, il y a un seul examen par an ! Une inscription sera ouverte en septembre et l'examen aura lieu en octobre. Test d'anglais

http://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-europemonde/procedure-dinscription/les-delais/

https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinformer/ou-se-renseigner/

http://www.unige.ch/international/fr/

https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-europemonde/procedure-dinscription/validation-academique/

https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-europemonde/procedure-dinscription/choisir-3-destinations/

http://mdl.unige.ch/testsetexamens/testanglaismobiliteout/

Section de biologie

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Règlement et plan d’études Grilles horaires, cours* et monographie

• Grilles horaires du bachelor en biologie • Liste et descriptifs des enseignements obligatoires • Liste des cours à choix de 2ème année • Liste des enseignements à choix restreint de 3ème année

• Dates des TP à choix restreint de 3ème année

• Règlement de la monographie *Pour les cours à choix, voir Partie IV

Partie II Le bachelor en biologie

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Baccalauréat universitaire (bachelor) en biologie CONDITIONS GENERALES Art. A 8 – Baccalauréat universitaire en biologie 1. La Faculté décerne un baccalauréat universitaire en biologie, premier cursus de la formation de base. 2. L’obtention du baccalauréat universitaire en biologie permet l’accès au deuxième cursus de la formation de base, les études de maîtrise

universitaire en biologie, ainsi qu’aux études de maîtrise universitaire bi-disciplinaire. ADMISSION Art A 8 bis 1. L’admission aux études de baccalauréat universitaire en biologie est régie par l’Art. 2 du Règlement général de la Faculté. 2. Les admissions conditionnelles sont régies par l’Art. 3 du Règlement général de la Faculté. 3. Les étudiants qui ont quitté les études de baccalauréat universitaire en biologie sans en avoir été éliminés peuvent être réadmis sous

certaines conditions déterminées également dans l’Art. 3 du Règlement général de la Faculté. 4. Les étudiants en médecine humaine de la Faculté de médecine de l'Université de Genève peuvent être directement admis en

deuxième année du bachelor en biologie avec une équivalence de 60 crédits ECTS en bloc aux conditions cumulatives suivantes: - qu'ils aient réussi la première année du bachelor en médecine humaine de la Faculté de médecine de l'Université de Genève. - qu'ils aient réussi le premier module de ce bachelor en médecine humaine en ayant obtenu au minimum 55% des points. - qu'ils réussissent séparément les examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm à la session de rattrapage (août/septembre).

Une seule tentative par examen est admise.

Les étudiants qui échouent à l'un ou l'autre ou aux deux examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm à la session de rattrapage peuvent toutefois être admis au bachelor en biologie. Cependant, dans ce cas, ils sont admis à titre conditionnel conformémement à l’Art. 3 par analogie du Règlement général de la Faculté, en première année du bachelor en biologie (sans redoublement possible de la première année).

5. Des équivalences peuvent être accordées selon l’Art. 4 du Règlement général de la Faculté. DUREE ET PROGRAMME D’ETUDES Art. A 8 ter – Durée des études, congé et crédits ECTS 1. La durée réglementaire et le nombre de crédits obtenus pour le baccalauréat universitaire en biologie sont précisés dans l’Art. 5 du

Règlement général de la Faculté, soit une durée réglementaire de six semestres et l’obtention de 180 crédits ECTS. 2. La durée maximale pour l’obtention du baccalauréat universitaire en biologie est précisée dans l’Art. 19 du Règlement général de la

Faculté, soit une durée de dix semestres. 3. Les congés sont régis par l’Art. 6 du Règlement général de la Faculté. Art. A 8 quater – Examens de la première année L’examen de la première année porte sur les branches spécifiées dans le plan d’études. Art. A 8 quinquies – Examens de deuxième et troisième années 1. Les examens des deuxième et troisième années portent sur les branches spécifiées dans le plan d’études. 2. Les cours et travaux pratiques à choix restreint de la troisième année doivent être choisis dans la liste publiée chaque année sur le site

web de la Section de biologie. Le choix des travaux pratiques à choix restreint peut être limité par le nombre de places disponibles. Certains travaux pratiques requièrent de suivre un cours à choix restreint particulier.

3. Les cours et travaux pratiques à choix libre de la troisième année doivent en principe être choisis dans le Guide de l'étudiant publié sur

le site web de la Section de biologie. 4. Le règlement de la monographie est publié sur le site web de la Section de biologie. 5. La monographie et les cours et travaux pratiques à choix libre peuvent déjà être présentés en deuxième année. Leur évaluation fait

cependant partie des examens de troisième année. CONTRÔLE DES CONNAISSANCES Art. A 8 sexies – Réussite et admission dans l'année supérieure 1. La réussite de la première année, dite propédeutique, donne droit à 60 crédits ECTS selon les modalités de l’Art. 9, al.2 du Règlement

général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études approuvé par le Conseil participatif de la Faculté.

2. La première année peut être répétée selon les dispositions des Art. 10 et 14 du Règlement général de la Faculté. 3. L'étudiant doit avoir réussi la première année pour pouvoir poursuivre ses études en deuxième année.

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4. La réussite des examens de la deuxième et de la troisième années donne droit à un total de 60 crédits ECTS en bloc pour chacune des deux années, selon les modalités de l’Art. 9, al.2 du Règlement général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études.

5. L’obtention des 60 crédits ECTS de deuxième année est nécessaire à la poursuite des études en troisième année. Art. A 8 septies – Appréciation des examens 1. Les examens sont régis par les articles 8 et suivants du Règlement général de la Faculté.

2. Pour les branches comportant plusieurs parties (orale, écrite, pratique), une note séparée est attribuée pour chaque partie; la

moyenne, le cas échéant pondérée, de ces notes partielles constitue la note de la branche. Aucune note partielle en-dessous de 2 n’est admise.

3. Pour les cours, les jurys d'examens sont composés, au moins, d'un membre du corps professoral ou d’un MER, CC ou CE et d'un co-

examinateur (qui doit être un universitaire diplômé).

4. La première année est réussie si : - la note minimum de 4 est obtenue pour chacun des trois examens de Biologie Fondamentale I, II et III. - la moyenne des notes de toutes les autres branches atteint au minimum 4 et aucune note de branche n’est inférieure à 3.

5. La deuxième année est réussie si :

- la moyenne, pondérée en fonction du nombre d'ECTS, de toutes les branches, à l’exception des cours à choix, atteint au minimum 4. Deux notes de branche inférieures à 4, mais supérieures ou égales à 3 sont admises.

- un certificat est obtenu pour la formation documentaire de la deuxième année. - les cours à choix sont réussis avec une note d’au minimum 4 chacun.

6. La troisième année est réussie si :

- la moyenne des notes de tous les cours obligatoires et à choix restreint et de la monographie atteint au minimum 4. Une seule note de branche inférieure à 4, mais supérieure ou égale à 3 est admise, sauf pour la monographie et les cours à choix. Les notes de cours à choix restreint à 3 crédits ECTS ne comptent que pour moitié dans le calcul de la moyenne.

- un certificat est obtenu pour chacun des travaux pratiques. - un certificat est obtenu pour la formation documentaire associée à la monographie. - la note minimum de 4 est obtenue pour la monographie et pour chacun des cours à choix.

DISPOSITIONS FINALES Art A 8 octies – Procédures en cas d’échec 1. Est éliminé du titre l’étudiant qui se trouve dans une des situations précisées dans l’Art. 19 du Règlement général de la Faculté.

2. L’étudiant éliminé a la possibilité de faire opposition contre une décision de la Faculté, puis, si cette décision est confirmée après

l’opposition, de faire un recours, selon le règlement interne de l’Université du 16 mars 2009 relatif aux procédures d’opposition.

Art. A 8 novies – Entrée en vigueur et dispositions transitoires 1. Le présent règlement entre en vigueur avec effet au 17 septembre 2018. Il abroge le règlement d’étude du baccalauréat universitaire

en biologie du 14 septembre 2015.

2. Le nouveau règlement s'applique à tous les étudiants à l'exception des dispositions de l'Art. A 8 septies, alinéa 5, qui ne s'appliquent qu'aux étudiants qui commencent leur deuxième année à la rentrée 2018. Pour les étudiants ayant déjà commencé leur deuxième année avant la rentrée 2018, une seule note inférieure à 4 est admise selon l'Art. A 8 septies, alinéa 5, de l'ancien règlement du 14 septembre 2015.

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PLAN D'ETUDES DU BACCALAUREAT UNIVERSITAIRE EN BIOLOGIE

Automne Printemps CREDITS Première année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biologie fondamentale I 5 4 6.5 3 Biologie fondamentale II * 4 4 5 2.5 Biologie fondamentale III ** 4.5 4 5.5 2.5 Biostatistiques I 2 2 3 1 Chimie générale 4 3 5 2 Chimie organique 3 3 8 Mathématiques générales 2 2 3 1 Physique générale 6 3 6 10 2 Total détaillé 20 12 19.5 10 46 14 Total cours et TP 32 29.5 60

*, ** Les examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm pour les étudiants en médecine humaine, selon les conditions de l'Art. A 8 bis, alinéa 4, portent respectivement sur les contenus des cours de Biologie fondamentale II et III (sans les questions des travaux pratiques) et donnent 5 et 5.5 ECTS.

Automne Printemps CREDITS Deuxième année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biochimie pour biologistes 3 1 5 Bioinformatique 1 1 1 0.5 Biologie et Société 2 2 5 Biologie végétale 2 1 3 0.5 Biostatistiques II 1 1 1.5 0.5 Développement animal 3 4 Développement végétal 2 3 Génétique 3 2 4 2 9 2 Physiologie animale 3 3 4 1.5 Programmation 1 3 1.5 2 Systématique et Biodiversité 3 3 3 3 8 3 Cours à choix 2 2 5 Total détaillé 18 12 20 7 50 10 Total cours et TP 30 27 60

Automne Printemps CREDITS Troisième année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biologie moléculaire de la cellule 3 3 9 Evolution 2 2 6 Monographie 2 2 5 Cours à choix restreint 1 2 2 6 Cours à choix restreint 2 2 2 6 Cours à choix restreint 3 2 2 6 TP à choix restreint 1 1 1 3 TP à choix restreint 2 1 1 3 Cours à choix restreint 4* 2 2 6 ou Cours à choix restreint 5 et 6* (1+1) (1+1) (6) ou Cours à choix restreint 5 et TP à choix restreint 3* (1+ 1) (1+ 1) (6)

Cours à choix libre** 3 3 10 Total détaillé 16 4 16 4 49 11 Total cours et TP 20 20 60

* Ces 3 options sont à choix. Le cours à choix restreint 4 vaut 6 ECTS, les cours à choix restreint 5 et 6 valent 3 ECTS. ** Les cours à choix libre doivent être pris parmi les enseignements figurant dans le Guide de l’étudiant. Certains cours hors-Section, voire hors-Faculté, peuvent néanmoins être admis avec l’accord de la Section de biologie.

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Enseignements obligatoires Première année

Bachelor en biologie

Section de biologie

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SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-Ansermet 24, Genève

Colonne1 LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Chimie Générale 11C101

Chimie Organique 11C103

Mathématiques générales

11M000 TP intégrés

Biologie Fondamentale I 11B001

09:00SCII, salle A300 SCII, salle A300 SCII, salle A300 SCII, salle A150

09:15 Chimie Organique 11C103

10:00SCII, salle A300

10:15Biologie

Fondamentale I 11B001

Physique générale B 11P085

Chimie Générale 11C101

Mathématiques générales11M000


11:00 SCII, salle A150EPA SCII, salle A300 SCII, salle A300 EPA

11:15

12:00

12:15 Physique générale B 11P085

13:00 Répétitoire EPA

13:15Biologie

Fondamentale I 11C003 Biochimie I

Biologie Fondamentale I

11B001Travaux pratiques

14:00 (méthodes)

SCII, salle A150Répétitoire

SCII, salle A100Chimie Générale

11C901

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques(groupe II)

Travaux pratiques

15:00 Chimie Générale 11C901 (groupe I)


Biologie Fondamentale I

11B001

SCII, labo E+F Physique générale B 11P985

15:15 SCII, labo E+FPSI SCIII, salle 5050 PSI

16:00(mardi ou vendredi) (vendredi ou mardi)

16:15

17:00

17:15

18:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 1ère année

Semestre d'automne

15

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-Ansermet 24, Genève PA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-Ansermet 24, Genève



Biostatistiques I : Applications

Biologie Fondamentale III 11B003

09:00 SCII, salle A300 11M904 SCII, salle A150


PA, salle 119 au 1er étage

10:00 SCII, salle A300

10:15Biologie

Fondamentale II 11B002


Biologie Fondamentale II

11B002

Biostastiques I 11M004 Physique générale B

11P086

11:00SCII, salle A150 EPA SCIII, salle 1S059 SCII, salle A300 EPA

11:15

12:00

12:15 Physique générale B 11P086

13:00 Répétitoire EPA

13:15Biologie

Fondamentale III 14B037P

Biotatistiques I répétitoire 11B800

14:00(Introduction à la Génétique) SCII, salle A300

SCII, salle A100

14:15Biologie

Fondamentale III 11B003

Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques

15:00SCII, salle A150 Biologie

Fondamentale II 11B002


11B002


11B002

15:15 et/ou et/ou Biologie Fondamentale III

11B903

et/ou

16:00 Biologie Fondamentale III

11B903

SCIII, salle 5050 Biologie Fondamentale III

11B00316:15 SCIII, salle 5050 SCIII, salle 5050

17:00

17:15

18:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 1ère année

Semestre de printemps

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BIOLOGIE FONDAMENTALE I 11B001

Semestre

automne 5h/sem, total 65h

ECTS

9.5 (cours & TP intégrés)

Jours & lieux lundi 10h15-12h Sciences II, salle A150 lundi 13h15 – 14h (11C003X1 Biochimie I – méthodes*) Sciences II, salle A150 mardi 13h15 – 14h Répétitoire facultatif (4 séances min.) Sciences II, salle A100 vendredi 8h15-10h00 Sciences II, salle A150

Mode d’évaluation Questionnaire à choix multiples (QCM)

Sessions d'examens janvier-février + rattrapage août-septembre

Responsable Monsieur J. C. MARTINOU, 022.379.6443, jean-[email protected]

Enseignant(e)s Mesdames S. CITI (pas), F. STUTZ (po) Messieurs J.-C. MARTINOU (po), D. PICARD (po). Pour les enseignants du cours 11C003X1 Biochimie I, voir dans le programme des cours sur internet.

Divers * le cours 11C003X1 Biochimie I partie méthodes fait partie intégrante du cours de Biologie Fondamentale I Contenu Origines de la vie ;; cellule unité vivante ;; métabolisme énergétique (chloroplastes et mitochondries). Biologie moléculaire : ADN, réplication, transcription, traduction. Cellule animale : noyau, cytoplasme, membranes, compartiments, transport intracellulaire et sécrétion des protéines. Organisation des tissus et cytosquelette ;; jonctions cellulaires. Cycle cellulaire ;; mitose, méiose ;; transmission de signal. Objectifs 1. Distinguer entre “vivant” et "non-vivant”;; décrire les différences entre l’organisation (génomes et autres) des virus, bactéries et eucaryotes. 2. Définir les termes scientifiques de base (ex. gène, protéine, enzyme, hormone, etc). Acquérir les définitions du vocabulaire scientifique abordé dans le cours et listé dans un glossaire (ex: p53, actine, DNA polymérase, oxytocine, etc). 3. Utiliser et décrire les concepts et processus fondamentaux de biologie moléculaire et cellulaire (ex: transcription, traduction, cycle cellulaire, mitose, méiose, métabolisme énergétique, sécrétion, trafic, endocytose, exocytose, motilité, adhésion, barrière, signalisation, etc). 4. Décrire la composition, l’organisation, les propriétés, la fonction et les relations fonctionnelles dynamiques des structures cellulaires (ex. noyau, chromosomes, chromatine, ADN, ARN, membrane plasmique, compartiments membranaires, mitochondries, cytosquelette, jonctions, ribosomes, etc). 5. Comprendre et expliquer les méthodes de purification et d’analyse des acides nucléiques (ADN, ARN) et des protéines.

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BIOLOGIE FONDAMENTALE I - Travaux pratiques intégrés 11B001

Semestre automne 4h/sem, total 48h Jours & Lieux mercredi 14h15 – 18h00

Sciences III, salle TP 5050

Mode d’évaluation Questions intégrées au questionnaire à choix multiples (QCM) du cours correspondant

Responsables/ Enseignant(e)s

Madame A. BELLIER et Monsieur V. HUBER : formation documentaire ;; Madame E. DEMARSY (cc) : responsable de la salle des TP 5050. Madame V. HAMEL (ma) : coordinatrice des travaux pratiques en laboratoire de recherches ;; F. KARCH (po) et J. MONTOYA (ce) : TP en salle 5050.

Contenu Formation documentaire ;; bases de biologie moléculaire et cellulaire en laboratoire de recherche;; analyse informatique de séquences d’ADN. Microscopie : cellule animale et végétale, mitose, méiose, chromosomes spéciaux. Objectifs Chercher et localiser des documents scientifiques ;; évaluer leur fiabilité et connaître les risques liés au plagiat. Utiliser des programmes d’analyse de séquences et consultation de bases de données. Utiliser un microscope et observer les structures cellulaires. Représenter ces observations (dessins, graphiques). Utiliser des outils de bases du laboratoire (micropipettes, spectrophotomètre). Appliquer les techniques de biologie moléculaire et cellulaire de base. Synthétiser et présenter un sujet de recherche oralement.

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BIOLOGIE FONDAMENTALE II 11B002 Semestre

printemps 4h/sem, total 56h

ECTS

7.5 (cours & TP intégrés) 5 (cours – master bi-disciplinaire, mineure biologie)

Jours & lieux lundi 10h15 - 12h00 Sciences II, salle A150 mercredi 10h15 - 12h00 Sciences III, salle 1S059

Mode d’évaluation Questionnaire à choix multiples (QCM)

Sessions d'examens juin + rattrapage août-septembre Responsable Madame E. DEMARSY – 022 379 36 52 – [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames S. CITI (pas), E. DEMARSY (cc),

Messieurs D. DUBOULE (po), X. PERRET (mer), I. RODRIGUEZ (po).

Contenu Microbiologie : diversité des microbes, taxonomie, structure et développement des bactéries, génétique bactérienne, éléments de virologie et biotechnologies microbiennes. Organisme végétal : cycle de développement et alternance de générations (gamétophyte vs sporophyte), embryogenèse, rôle des méristèmes, croissance et organogenèse, contrôle du développement végétal par l’environnement. Organisme animal : gamétogenèse et fécondation;; embryologie expérimentale, des oursins aux mammifères;; biologie des tissus (épithéliaux, conjonctifs, musculaires et nerveux), des organes et des systèmes chez les mammifères, introduction à l’endocrinologie et l’immunologie;; neurobiologie. Objectifs Approcher la diversité et l’importance des microbes, reconnaître leurs particularités par rapport aux cellules eucaryotes. Connaître et distinguer les spécificités du développement animal et végétal. Décrire la structure et l’organisation des cellules dans les tissus et l’assemblage de différents types de tissus dans un organe. Expliquer l’intégration fonctionnelle entre différents organes. Maitriser les concepts de base en neurobiologie.

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BIOLOGIE FONDAMENTALE II –Travaux pratiques intégrés 11B002 Semestre printemps 4h/sem, total 56h Jours & lieux mardi et/ou mercredi et/ou jeudi 14h15 – 18h00 en alternance avec les

travaux pratiques de Biologie fondamentale III Sciences III, salle TP 5050

Mode d’évaluation Questions intégrées au questionnaire à choix multiples (QCM) du cours correspondant et/ou rédaction d’un rapport

Sessions d'examens

juin + rattrapage août-septembre

Responsable

Madame E. DEMARSY – 022 379 36 52 - [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames P. SOULIE (cs), E. DEMARSY (cc), Messieurs J. MONTOYA (ce), X. PERRET (mer), J. ZAKANY (mer).

Divers La participation aux travaux pratiques est obligatoire pour être validés. Les travaux pratiques enseignés par Monsieur X. Perret sont notés en contrôle continu (rapport), les étudiants redoublants sont tenus d’y participer même s’ils ont validé les TP l’année précédente. Contenu Culture et transformation de bactéries, résistance aux antibiotiques et coloration de gram;; histologie et physiologie végétale;; gamétogenèse, développement mosaïque et embryologie;; histologie animale générale, anatomie comparative. Objectifs Appliquer les techniques de base en bactériologie. Consolider les notions acquises dans les différentes parties du cours par des observations au microscope, des dissections et diverses manipulations.

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BIOLOGIE FONDAMENTALE III 11B003 Semestre printemps

4.5h/sem, total 56h

ECTS 8 (cours & TP intégrés)

Jours & Lieux lundi 13h15 – 14h00 (14B037P Introduction à la Génétique : Partie génomique*) Sciences II, salle A300 lundi 14h15 – 16h00 Sciences II, salle A150 vendredi 8h15-10h00 Sciences II, salle A150

Mode d’évaluation Examen écrit de 4 heures comprenant des questions théoriques à développer, des problèmes à résoudre et/ou des questions à choix multiples (QCM)

Sessions d'examens


Coordinateur Monsieur D. PAULI – 022 379 67 55 – [email protected] Enseignant(e)s Madame A. SANCHEZ-MAZAS (po),

Messieurs D. PAULI (ce), J. MONTOYA (ce), A. LANGANEY (ph), B. IBELINGS (po).

Cours 14B037P Introduction à la Génétique: Partie génomique: Monsieur V. OSSIPOW (cc).

Divers * Le cours 14B037P Introduction à la Génétique : Partie génomique (6 heures) fait partie intégrante du cours de Biologie Fondamentale III Contenu 1. Génétique des eucaryotes. - La transmission des gènes individuels. - La recombinaison par assortiment indépendant. - La recombinaison par crossing-over et la cartographie des chromosomes. - La complémentation. - Les relations génotype-phénotype. - Introduction aux différents types de mutations.

2. Evolution et Phylogénie. - Découverte des mécanismes de l’évolution : historique. - Génétique évolutive. - Spéciation. - Introduction à la phylogénie. - Biodiversité. Arbre du vivant. - Evolution humaine. - Evolution des comportements.

3. Ecologie. - Introduction à l’écologie. - Conditions et ressources. - Individus, populations, communautés et écosystèmes - Questions appliquées en écologie. Objectifs Les étudiants devront être capables de: - définir, expliquer et utiliser les concepts principaux. - à partir d’un problème ou de la description d’une situation expérimentale simple, identifier les informations importantes et émettre une hypothèse ou effectuer les déductions. Proposer un moyen de tester cette hypothèse et prédire ce qu’on peut attendre de ce test.

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BIOLOGIE FONDAMENTALE III – Travaux pratiques intégrés 11B003 Semestre printemps 4h/sem, total 56h Jours & Lieux mardi ou /et mercredi ou /et jeudi 14h15 – 18h00 en alternance avec les

travaux pratiques de Biologie Fondamentale II Sciences III, salle TP 5050

Mode d’évaluation Questions intégrées dans l’examen du cours Coordinateur

Monsieur D. PAULI – 022 379 67 55 – [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames A. TZIKA (ma) et E. DEMARSY (cc). Messieurs D. PAULI (ce), J. MONTOYA (ce).

Contenu Génétique Evolution Biodiversité Phylogénie Génomique comparative Objectifs Introduire les étudiants à divers aspects expérimentaux en lien avec certains chapitres du cours.

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BIOSTATISTIQUES I : Applications 11M904 Semestre


ECTS

1 (total 4 pour 11M004 + 11M904*)

Jour

jeudi 08h15 – 10h00

Lieux Pavillon Ansermet, salle 119 au 1er étage (et salle 0019 SCIII, en fonction du nombre d'étudiants)

Mode d’évaluation

un seul examen écrit de 2h pour les deux enseignements 11M004 et 11M904

Sessions d'examens


Responsable

Madame E. POLONI - 022.379.6977 - [email protected]

Enseignant(e)s Madame E. POLONI (cc), Monsieur M. MOUTERDE (ass), et collaborateurs.

Divers * Le cours Biostatistiques I (11M004, responsable Monsieur S. SARDY (pas), doit être suivi avec les travaux pratiques Biostatistiques I : Applications (11M904) au semestre de printemps pour l’obtention des 4 crédits ECTS. Contenu En coordination avec le cours de Biostatistiques I (11M004), les séances de ‘Biostatistiques I : Applications’ proposent une application à la biologie des concepts-clés en probabilités et statistiques. Les deux heures hebdomadaires seront dédiées à contextualiser l’utilité et l’utilisation de ces concepts pour aborder des connaissances dans le domaine des sciences du vivant. Ceci s’effectuera à travers la résolution, par les étudiants-es, de problèmes présentés sous forme d’exercices sur des exemples tirés exclusivement du domaine des sciences du vivant. Des corrections interactives (entre enseignants-es et étudiants-es) seront proposées. Le recours à l’utilisation du logiciel R sera aussi inclus dans les séances. Le programme comprend : 1. EDA: visualisation et représentation des données, échantillonnage(s) en biologie 2. Probabilités: lois de probabilités dans la génétique des familles et des populations, et lois de probabilités associées aux caractères à variation continue 3. Principes de l'inférence statistique de paramètres usuels en biologie, principe d’un test d’hypothèse et introduction aux tests usuels en biologie Objectifs Permettre à l'étudiant-e d’acquérir un degré d’autonomie suffisant pour pouvoir, à la fois : - s’orienter dans le choix de la littérature à consulter et les programmes statistiques à utiliser pour répondre à une question scientifique qu’elle/il pourra rencontrer dans le cadre de ses études ;; - porter un regard critique sur l’actualité scientifique dans le domaine de la biologie, à savoir être capable d’évaluer l’adéquation d'un plan expérimental pour répondre à une question scientifique donnée, la robustesse des résultats expérimentaux et la pertinence des conclusions qui en sont tirées. Ceci implique :

- d’identifier des types de variables, leurs distributions de probabilité et les paramètres de ces distributions ;;

- d’estimer des paramètres usuels (médiane, quartiles, probabilité, espérance, variance, covariance, corrélation) à partir de données expérimentales ;;

- de conduire un test d’hypothèse simple avec des données expérimentales ;; d’interpréter les résultats des estimations ou des tests dans le cadre d’un plan expérimental, et d’en tirer des conclusions.

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BIOSTATISTIQUES I 11M004 Semestre


ECTS

3 (total 4 pour 11M004 + 11M904*)

Jour

jeudi 10h15 – 12h00

Lieu

Sciences II, salle A300


un seul examen écrit de 2h pour les deux enseignements 11M004 et 11M904

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur S. SARDY – 022.379.1142 – [email protected]

Enseignant(e)s Monsieur S. SARDY (pas), et collaborateurs. Divers * Le cours Biostatistiques I (11M004) doit être suivi avec les travaux pratiques Biostatistiques I : Applications (11M904) au semestre de printemps pour l’obtention des 4 crédits ECTS. Contenu 1. Analyse exploratoire (statistiques simples et analyse graphique) et utilisation du logiciel

statistique R. 2. Calculs élémentaires de probabilités. 3. Variables aléatoires et distributions discrètes, leur espérance et variance. En particulier,

distributions Bernoulli, Binomiale et Poisson. 4. Variables aléatoires et distributions continues, leur espérance et variance. En particulier,

distributions Gaussienne et Student. 5. Introduction à la régression, au test statistique et estimateur. Objectifs Apprendre les concepts-clefs en statistiques et probabilités.

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BIOSTATISTIQUES I : Répétitoire 11B800 Semestre printemps 2h/sem, total 14h Jour

mardi 13h15-14h00

Lieu Sciences II, salle A100 Enseignante Madame E. POLONI (cc) Contenu Ce répétitoire complémente Biostatistiques I : Applications (11M904). Les notions abordées sont reprises ici avec de nouveaux exemples tirés de la recherche en biologie. Objectifs Les objectifs restent les mêmes : Permettre à l'étudiant-e d’acquérir un degré d’autonomie suffisant pour pouvoir, à la fois : - s’orienter dans le choix de la littérature à consulter et les programmes statistiques à utiliser pour répondre à une question scientifique qu’elle/il pourra rencontrer dans le cadre de ses études ;; - porter un regard critique sur l’actualité scientifique dans le domaine de la biologie, à savoir être capable d’évaluer l’adéquation d'un plan expérimental pour répondre à une question scientifique donnée, la robustesse des résultats expérimentaux et la pertinence des conclusions qui en sont tirées. Ceci implique :

- d’identifier des types de variables, leurs distributions de probabilité et les paramètres de ces distributions ;;

- d’estimer des paramètres usuels (médiane, quartiles, probabilité, espérance, variance, covariance, corrélation) à partir de données expérimentales ;;

- de conduire un test d’hypothèse simple avec des données expérimentales ;; d’interpréter les résultats des estimations ou des tests dans le cadre d’un plan expérimental, et d’en tirer des conclusions.

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CHIMIE GENERALE 11C101 Semestre automne

4h/sem, total 56h

ECTS 5 (pour les biologistes)

Jour

lundi 8h15-10h00 & mercredi 10h15-12h00

Lieu



questionnaire à choix multiples (QCM)


Responsable

Monsieur X. CHILLIER – 022.379.6715 – [email protected]

Enseignant Monsieur X. CHILLIER (cc). Contenu 1. Historique et concepts de base 2. L’atome et l’électron : naissance de la mécanique quantique 3. Chimie structurale, molécules, liaisons et états de la matière 4. Equilibres physico-chimiques 5. Equilibre et réactions chimiques 6. Cinétiques des réactions 7. Chimie nucléaire, isotopes, radiochimie et radioactivité Documentation et bibliographie Polycopié (sur Chamilo) Brown et al. (2012) Chemistry : the central science, 12th Edition, (ISBN 978-0-321-74983-3) P.W. Atkins, L. Jones (1998). Chimie : Molécules, Matière, Métamorphoses. De Boeck Université. ISBN 10-2-7445-0028-3. Hill & Petrucci, Chimie générale (2002), Pearson Press, (ISBN 2-84211-199-0) E-learning : https://chamilo.unige.ch/ Objectifs Dispenser aux étudiant-e-s une culture de base en chimie et les connaissances dont ils/elles auront besoin pour suivre ensuite des enseignements plus avancés. CHIMIE GENERALE exercices : intégrés dans le cours

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CHIMIE GENERALE – travaux pratiques 11C901 Semestre automne (semaines 6-14) 3h/sem, total 27h

ECTS

2 (pour les biologistes)

Jours

lundi 14h15-18h00 (groupe I) jeudi 13h15-17h00 (groupe II)

Lieu

Sciences II, laboratoires E + F

Mode d’évaluation contrôle continu Responsable

Monsieur C. PIGUET – 022 379 60 34 - [email protected]

Enseignants Messieurs H. NOZARY (Adj. S.), J. JIMENEZ (as), Contenu 1. Notions de base 2. La réaction chimique 3. Thermodynamique et équilibre 4. Structure atomique 5. Propriétés des solutions aqueuses 6. Réactions de transfert d’électrons 7. Chimie analytique Documentation et bibliographie : Polycopiés de Travaux Pratiques. P.W. Atkins, L. Jones (2011). Principes de Chimie. De Boeck Université. Bruxelles, ISBN 978-2-8041-6317-4. E-learning : https://chamilo.unige.ch/ Objectifs Introduction à la chimie pour les sciences de la vie et les sciences de la Terre.

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CHIMIE ORGANIQUE 11C103 Semestre automne/printemps

3h/sem, total 84h

ECTS 9.5 (cours & TP intégrés)

Jours mardi 9h15-10h00 mercredi 8h15-10h00

Lieu


Mode d’évaluation questionnaire à choix multiples (QCM)

Sessions d'examens juin + rattrapage août-septembre

Responsables

Monsieur J. LACOUR – 022.379.6062 – [email protected] Madame A. POBLADOR-BAHAMONDE – 022.379.6155 [email protected]

Enseignant(e)s

Monsieur J. LACOUR (po), Madame A. POBLADOR-BAHAMONDE (mer).

Divers Documentation et bibliographie :

• J. McMurry (2011). Fundamentals of Organic Chemistry, 7th edition. Belmont: Brooks/Cole, 2011. ISBN 978-4390-49730.

• J. McMurry, E. Simanek (2007). Chimie Organique, les Grands Principes, 2e édition. Dunod, Paris. ISBN 978-2100-505470.

E-learning : https://chamilo.unige.ch/ Contenu Semestre d’automne (Prof. J. Lacour) - Généralités (la liaison chimique) - Alcanes et cycloalcanes (hydrocarbures saturés) - Alcènes et alcynes (hydrocarbures insaturés) - Composés aromatiques (structure et réactivité) - Stéréoisomérie, chiralité, activité optique, énantiomérie, diastéréoisomérie - Halogénoalcanes (structure et réactivité) - Alcools, éthers et phénols (structure et réactivité) - Aldéhydes et cétones (structure et réactivité) - Acides carboxyliques et dérivés (esters, amides, nitriles) (première partie) Semestre de printemps (Dr A. Poblador-Bahamonde) - Acides carboxyliques et dérivés (esters, amides, nitriles) (deuxième partie) - Réactions de substitutions en d’un carbonyle et réactions de condensation - Amines et dérivés azotés - Hétérocycles azotés et produits naturels apparentés - Composés difonctionnels et polyfonctionnels - Glucides - biomolécules naturelles, mono- et polysaccharides - Acides aminés, peptides et protéines : macromolécules et polymères naturels - Corps gras, stéroïdes, phospholipides et acides nucléiques : l’ADN et l’ARN - Exercises et autoevaluation Objectifs Cours de base obligatoire pour les étudiant-e-s de 1e année du Bsc en biologie et du Bsc en sciences pharmaceutiques.

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MATHEMATIQUES GENERALES 11M000 Semestre


ECTS 4 (11M000 + TP - exercices) voir « Divers »

Jours

jeudi 10h15 - 12h00

Lieu Sciences II, salle A300

Mode d’évaluation examen écrit, 2h.


Responsable


Enseignant Monsieur S. SARDY (pas). Divers Le cours de mathématiques générales automne (11M000) et ses exercices doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir les 4 ECTS. Contenu 1. Analyse de fonctions univariées : graphe, limite, continuité, dérivation, intégration, Taylor. 2. Fonctions à plusieurs variables : graphes, limite, continuité, gradient, hessienne, Taylor. 3. Optimisation : concepts clefs, existence, unicité, convexité, algorithmes. 4. Algèbre linéaire : espace vectoriel, partie libre, partie génératrice, base, déterminant, norme, produit scalaire, produit vectoriel, matrice, vecteurs/valeurs propres. 5. Equations différentielles simples. Objectifs Le but de ce cours est de dégager les idées du calcul différentiel et intégral à une ou plusieurs variables qui sont importantes pour la pratique scientifique. On introduira également des éléments de base d’algèbre linéaire et d’équation différentielle. Exercices / travaux pratiques intégrés 11M000 Semestre automne 2h/sem, total 28h Jours

jeudi 8h00 - 10h00

Lieu



examen écrit, 2h.

Sessions d'examen offertes

janvier-février + rattrapage août-septembre

Responsable


Enseignant(e)s Monsieur S. SARDY (pas). Contenu Initiation au logiciel de calcul numérique et statistique R

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PHYSIQUE GENERALE B 11P085/086 Semestre

automne/printemps 4h/sem, total 112h

ECTS

10 (cours + répétitoire pour les biologistes)

Jours mardi 10h15-12h00 vendredi 10h15-12h00

Lieu EPA, Ecole de physique

Mode d’évaluation examens écrits

Sessions d'examens janvier-février / juin + rattrapage août-septembre

Responsabl(e)s

(automne) Madame PARUCH P. – 022 379 3546 - [email protected] Monsieur BONACINA Luigi – 022 379 0508 -[email protected] (printemps) Monsieur GIANNINI Enrico – 022 379 6076 - [email protected]

Enseignant(e)s Madame P. PARUCH (pa), Messieurs L. BONACINA (mer), E. GIANNINI (mer)

Divers Le cours de physique générale B (11P085/11P086) de 10 ECTS doit être suivi avec les travaux pratiques (11P985) de 2 ECTS pour l’obtention des 12 ECTS.

Bien que pas obligatoires, les séances d’exercices sont indispensables à la compréhension du cours et fortement conseillées.

Les laboratoires qui accompagnent le cours doivent permettre à l’étudiant de se familiariser avec les méthodes de mesures utilisées pour déterminer une grandeur physique. Ils font partie du champ d’examen. Contenu Semestre automne : (11P085) Introduction à la physique, cinématique, lois de Newton, dynamique, statique, gravitation, rotation, énergie mécanique, les solides, les fluides, oscillations et ondes mécaniques, le son, propriétés thermiques de la matière, chaleur et thermodynamique.

Semestre printemps : (11P086) Electrostatique, courant continu, circuits, magnétisme, induction électromagnétique, courant alternatif, ondes électromagnétiques, propagation de la lumière, optique géométrique, optique ondulatoire, lasers, applications biomédicales, relativité restreinte, origines de la physique moderne, théorie quantique. https://chamilo.unige.ch/home/courses/11P085/?id_session=0 Objectifs Le but du cours est de donner à l'étudiant les notions de base nécessaires à la compréhension des phénomènes physiques qui se passent dans la nature et dans le corps humain. L'objectif est atteint lorsque l'étudiant est capable de prévoir quantitativement les conséquences de ces phénomènes en utilisant aussi des outils mathématiques appropriés. Ouvrages de référence : - Physique, Eugène Hecht, DeBoeck Université ed. - Physique Générale, DC. Giancoli, 3 vols, De Boeck Université ed. - Fundamentals of Physics, D Halliday, 3 vols, R. Resnick, J. Walker, John Wiley & Sons, Inc.

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PHYSIQUE GENERALE B - Laboratoires de physique 11P985 Travaux pratiques Semestre

automne total 36h

ECTS 2

Jour

mardi ou vendredi 14h00 - 18h00

Lieu

pavillon Sciences I, Bd d’Yvoy 16, 3ème étage

Mode d’évaluation certificat (voir ci-dessous) Responsable Madame A. TAMAI – 022.379.6215 – [email protected] Divers Les Laboratoires de physique B, qui se déroulent en parallèle avec le premier semestre du cours de Physique générale B, doivent permettre aux étudiants de première année en biologie d'acquérir une connaissance de base des lois fondamentales de la physique et des méthodes de mesure utilisées pour déterminer une grandeur physique. Pour cela, il est essentiel que l'étudiant apprenne à utiliser les instruments de mesure les plus courants et à analyser les résultats avec des méthodes de calcul modernes. Lors de ces laboratoires, les étudiants travaillent en duo. Chaque étudiant doit réaliser les 12 expériences prévues au programme pour obtenir le certificat. Aucun rapport n'est à restituer, mais un résumé du travail effectué est présenté à la fin de la séance à l’assistant pour l’obtention de la signature. PHYSIQUE GENERALE B : Répétitoire 11P085/086 Semestre automne/printemps

2h/sem, total 56h

Jour & lieu vendredi 12h15-14h00 / EPA, Ecole de physique Responsables Madame P. PARUCH - 022.379.3546 - [email protected]

(automne) Monsieur GIANNINI Enrico – 022 379 3502- [email protected] (printemps)

Divers Les séances de répétitoire pendant lesquelles les exercices de physique distribués au cours sont corrigés sont fortement recommandées. Contenu Une série d’exercices est distribuée chaque semaine.

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!

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Enseignements obligatoires Deuxième année


Section de biologie

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SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-Ansermet 30, GenèveBaud-Bovy : salle informatique, passage Baud-Bovy, GenèvePA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-Ansermet 24, Genève


08:15Génétique

Génétique générale 12B017A

Physiologie animale12B014

GénétiqueGénétique générale

12B017A

Biochimie II 12C002A

09:00SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 SCII, salle A300

09:15 Biochimie II 12C002A


10:00SCII, salle A150 SCII, salle 223

10:15Systématique et Biodiversité 12B018A

Travaux pratiques Programmation

12X020

Systématique et Biodiversité 12B018A

11:00SCIII, salle 1S081 (séance rattrapage)

Baud-BovySCIII, salle 1S081

11:15

12:00

12:15Biologie et Société I

12B010 Programmation 12X020

Travaux pratiques Programmation

12X020

13:00SCII, salle A150 SCIII, salle A100 (séance rattrapage)

Baud-Bovy

13:15

14:00

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiquesBiostatistiques II

12B015 Travaux pratiques

15:00Systématique et Biodiversité 12B018A


SCIII, salle 1S059 GénétiqueGénétique générale

12B017A

15:15SCIII, salle 5050 SCIII, salle 5050 Travaux pratiques SCIII, salle 5050

16:00 Biostatistiques II12B015

16:15PA, salle 119 au 1er

étage

17:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 2ème année

Semestre d'automne

37

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-Ansermet 30, GenèvePA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-Ansermet 24, Genève

Horaires LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Génétique - Génétique moléculaire 12B017P

Développement animal 12B016

Développement animal 12B016

Génétique - Génétique moléculaire 12B017P

Bioinformatique 12B012

09:00SCIII, salle 1S081

SCIII, salle 1S081SCIII, salle 1S081

8h15 - 9h00 exercices et 9h15 - 10h00 cours

PA, salle 119 au 1er étage

09:15Biochimie II

Partie Méthodes 12C002P

Génétique - Génétique moléculaire 12B017P

SCIII, salle 1S081

Travaux pratiques Bioinformatique

10:00SCII, salle A150 SCIII, salle 1S081 PA, salle 119 au 1er

étage

10:15 Systématique et Biodiversité

Développement végétal

Formation documentaire 12B801

11:00

12B018P SCIII, salle 1S081

12B019 SCIII, salle 1S059

6.3.2019, introduction en présentiel,

SCIII salle 1S081 puis formation en ligne

11:15

12:00

12:15 Biologie et Société II 12B011

13:00 SCII, salle A150

13:15

14:00

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Biologie végétale 12B013 Travaux pratiques Travaux pratiques

14:15 - 17:00

15:00 Systématique et Biodiversité

Biologie végétale 12B013

SCIII, salle 1S059 Génétique - Génétique moléculaire

Biologie végétale 12B013

15:15 12B018P SCIII, salle 5050

SCIII, salle 0059 12B017P SCIII, salle 0035

SCIII, salle 0059 EN COORDINATION

16:00(voir descriptif du

cours)

16:15 Travaux pratiques 14:15 - 18:00

17:00Génétique -

Génétique moléculaire 12B017P

17:15 SCIII, salle 0035 EN COORDINATION

18:00 (voir descriptif du cours)

* Les travaux pratiques 12B016 Développement animal auront lieu fin mai, pour plus d'information voir le descriptif du cours.

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 2ème année

Semestre de printemps

39

Biochimie pour biologistes

Pour les biologistes, ce cours est composé de 2 parties : 1. Le cours 12C002A « Biochimie II », au semestre d’automne, 2. Le cours n° 12C002PX « Biochimie II, partie Méthodes » (inclus dans le cours Biochimie II printemps suivi par les chimistes et biochimistes), au semestre de printemps.

Ces cours doivent êtres suivis dans leur intégralité pour obtenir les 5 ECTS. La note finale est la moyenne pondérée de deux notes : 1) la note de l’examen de Biochimie II du semestre d’automne (qui compte pour 75%), et 2) la note de l'examen de « Biochimie II, partie Méthodes » au semestre de printemps (qui compte pour 25%).

BIOCHIMIE II 12C002A Semestre automne 3h/sem, total 42h Jours & lieux lundi 9h15-10h / Sciences II, salle A150

vendredi 8h15-10h / Sciences II, salle A300 début du cours vendredi 21 septembre 2018


examen écrit


Responsable

Monsieur Aurélien ROUX – 022 379 3532 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs A. ROUX (pas), O. SCHAAD (cc), V. OSSIPOW (ce), Madame E. DEMARSY (cc).

Contenu - Enzymologie - Catabolisme et anabolisme - Photosynthèse - Glycolyse - Respiration cellulaire

Objectifs Ce cours introduit les principes de base de l'enzymologie et du métabolisme Documentation et bibliographie J. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer (2006). Biochemistry, 6e edition, W.H. Freeman, New York. ISBN 10-7167-6766X. Compléments par des chapitres choisis. E-Learning https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/

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BIOCHIMIE II – partie Méthodes 12C002PX Semestre printemps 1h/sem, total 14h Jour & lieu lundi 9h15-10h / Sciences II, salle A150 Mode d’évaluation

examen écrit

Sessions d'examens Juin-juillet + rattrapage août-septembre

Responsable

Monsieur A. ROUX – 022 379 3532 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs Ch. BAUER (cc), J-M. MATTER (mer), I. XENARIOS (pt), T. SOLDATI (pas)

Contenu - Imagerie cérébrale - Optogénétique - Microscopie optique - Microscopie électronique - Fractionnement cellulaire - Bioinformatique

Objectifs Ce cours est consacré à la description des méthodes utiles pour la caractérisation des concepts abordés au semestre d'automne. E-Learning https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/

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BIOINFORMATIQUE 12B012 Semestre printemps 1h/sem, total 14h ECTS 1.5 (cours et TP intégrés)

2 (pour le master bi-disciplinaire, mineure: biologie) Jour vendredi 8h15 – 9h Lieu Pavillon Ansermet, salle 119 au 1er étage Mode d’évaluation

examen écrit

Sessions d'examens juin-juillet + rattrapage août-septembre

Responsable

Madame F. LISACEK – 022.379.0195 – [email protected]

Enseignant(e)s Madame F. LISACEK (mer) et intervenants, N.N Contenu 1. La place de la bioinformatique dans la biologie moderne et le rôle central de la notion de

séquence (1h) 2. Base de données des séquences de gènes et génomes (2h) 3. Séquences protéiques et protéomes (1h) 4. Comparaison et recherche dans les bases de données (1h) 5. Alignement des séquences (1h) 6. Comparaison et classification (1h) 7. Données d’expression et de transcriptomes (2h) 8. Données métaboliques (1h) 9. Annotation fonctionnelle des gènes et des protéines (2h) 10. Données structurales et tridimensionnelles (2h)

Objectifs Familiarisation avec les outils de bioinformatique les plus couramment utilisés en biologie moléculaire et leur utilisation raisonnée. BIOINFORMATIQUE – Travaux pratiques intégrés 12B012 Semestre printemps 1h/sem, total 14h Jour vendredi 9h15 – 10h Lieu Pavillon Ansermet, salle 119 au 1er étage Responsable

Madame F. LISACEK – 022.379 0195 – [email protected]

Enseignant(e)s Madame F. LISACEK (mer) et intervenants, N.N

Contenu • Navigation dans les serveurs génériques : NCBI, EBI • Rechercher des informations dans les bases de données de gènes (par ex : GenBank) • Utiliser les outils de visualisation des données de génomique (par ex : EnsEMBL) • Rechercher des informations dans UniProtKB • Rechercher/identifier des séquences avec BLAST ;; comprendre et interpréter les résultats • Utiliser les outils d’alignement de séquences (par ex : ClustalW) • Utiliser les ressources pour la classification des protéines (par ex : Pfam) • Rechercher des informations dans les bases de données d’expression (par ex : GEO) • Rechercher des informations dans les bases de données structurales (par ex : PDB) • Rechercher des informations dans les bases de données du métabolisme (par ex : KEGG) • Utiliser des combinaisons de logiciels et bases de données pour analyser des données de

biologie moléculaire Objectifs Compréhension et maîtrise des outils de bioinformatique les plus couramment utilisés en biologie moléculaire.

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BIOLOGIE ET SOCIETE I : Les enjeux actuels des sciences de la vie 12B010 Semestre automne 2h/sem, total 28h ECTS 2.5 Jour mardi 12h15-13h45 / début du cours mardi 25 septembre 2018 Lieu Sciences II, salle A150 Mode d’évaluation

examen écrit


Responsables

Messieurs B. STRASSER – 022.379.0712 - [email protected] & K. KAMPOURAKIS - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs B. STRASSER (po), K. KAMPOURAKIS (ce), et autres intervenants

Divers Biologie et Société I (semestre d’automne) donne accès au cours Biologie et Société II (semestre de printemps). Le cours 12B010 Biologie et société I : Les enjeux actuels des sciences de la vie du semestre d’automne et le cours 12B011 Biologie et Société II: Analyser les controverses scientifiques du semestre de printemps, doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir 5 ECTS.

La note finale est la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Objectifs à Identifier des enjeux de société posés par la recherche en biologie à Argumenter sur des enjeux éthiques et sociaux de la recherche biomédicale à Analyser des éléments clés des pratiques de recherche en biologie Contenu La biologie soulève nombre d’enjeux sociaux, éthiques et politiques qui influencent profondément le développement de la discipline. Ce cours propose une réflexion critique et une mise en perspective de ces enjeux pour mieux comprendre leurs effets sur la biologie contemporaine et le métier de biologiste. Nous aborderons notamment les révolutions intellectuelles (darwinisme, génétique, biologie moléculaire), les concepts clés (l'individu, la population, l'espèce), les controverses publiques (les races humaines, l'eugénisme, la biodiversité, le génie génétique), les questions éthiques (l'expérimentation animale;; l'intégrité scientifique), et les pratiques des biologistes (la publication scientifique, le "DIY Biology").

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BIOLOGIE ET SOCIETE II : Analyser les controverses scientifiques 12B011 Semestre printemps 2h/sem, total 28h ECTS 2.5 Jour jeudi 12h15-13h45 Lieu Sciences II, salle A150 Mode d’évaluation

travail de recherche et présentation orale et écrite d'une analyse de controverse publique


Responsables

Messieurs B. STRASSER – 022.379.0712 - [email protected] & K. KAMPOURAKIS - [email protected]

Enseignants Messieurs B. STRASSER (po), K. KAMPOURAKIS (ce) Divers Biologie et Société I semestre d’automne est un prérequis pour Biologie et Société II semestre de printemps. Le cours 12B010 Biologie et Société I: Les enjeux actuels des sciences de la vie du semestre d’automne et le cours 12B011 Biologie et Société II : Analyser les controverses scientifiques du semestre de printemps, doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir 5 ECTS.

La note finale est la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Objectifs Analyser des enjeux de société posés par la recherche en biologie Ø Identifier et évaluer des sources d'informations sur des controverses Ø publiques Ø Mettre en relation les différents arguments avec les identités des acteurs Ø Produire une analyse argumentée originale et convaincante pour expliquer Ø l’enjeu d’une controverse publique Ø Collaborer en groupe, répartir le travail et arriver à une conclusion commune Ø Présenter une analyse et des arguments par oral et par écrit Contenu Les résultats scientifiques donnent souvent lieu à des controverses publiques impliquant des acteurs très divers. Les téléphones portables sont-ils dommageables pour le cerveau? Les OGM présentent-ils un risque pour la santé? Les analyses génétiques disponibles sur internet sont-elles fiables? Dans ce cours, nous aborderons les différentes méthodes pour analyser ces controverses scientifiques et techniques. Nous discuterons les sources de l’incertitude dans ces controverses et leur place dans une “société du risque”. Les étudiant(e)s réaliseront un travail de recherche sur une controverse, l’analyseront dans un travail écrit et feront une présentation orale.

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BIOLOGIE VEGETALE 12B013

Semestre printemps 2h/sem, total 28h ECTS 3.5 / 3 (pour le master bi-disciplinaire, mineure : biologie) Jour & lieu mercredi 14h15-16h / Sciences III, salle 1S059 Mode d’évaluation examens écrits Sessions d'examens juin-juillet + rattrapage août-septembre

Responsabl(e)s Madame T. FITZPATRICK (po) – 022.379.3016

[email protected] Monsieur S. LOUBÉRY (cc) – 022.379.6568 – [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames T. FITZPATRICK (po), E. DEMARSY (cc), Monsieur S. LOUBÉRY (cc)

Divers Le cours de biologie végétale est structuré en deux parties (morphologie et anatomie ;; physiologie et biochimie). Le cours doit être suivi avec les TPs dans leur intégralité pour obtenir 3.5 ECTS. La participation aux travaux pratiques intégrés est obligatoire pour se présenter à l’examen. Contenu Partie morphologie et anatomie :

• les parois des cellules végétales • les tissus végétaux : types cellulaires, organisations et fonctions • les organes végétatifs : la racine, la tige et la feuille • croissance secondaire : le bois • adaptations morphologiques des plantes à leur environnement

Partie physiologie et biochimie : • transport de l’eau et des solutés dans les végétaux • les plastes et la mitochondrie : structure, fonctions et génomes • la photosynthèse : aspects physiologiques et écologiques • perception et adaptation aux conditions lumineuses • les hormones végétales • stress biotiques et abiotiques • nutrition végétale • métabolismes secondaires

Objectifs Le but de ce cours est de permettre aux étudiant(e)s d’acquérir une vue d'ensemble des concepts de morphologie et de physiologie végétale. La première partie vise à comprendre la composition et les caractéristiques des différents tissus végétaux. La seconde partie vise l’assimilation des bases de la physiologie végétale (notamment les principes du transport de l’eau, le métabolisme des plantes, la nature et les principaux rôles des hormones végétales et la réponse des plantes aux stress).

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BIOLOGIE VEGETALE – Travaux pratiques intégrés 12B013

Semestre printemps 3h/sem, total 15h Jour & lieu mardi et vendredi 14h15-17h15 – salle TP 0059 (Sciences III)

Les dates des séances de TP seront annoncées sur Chamilo et lors des premiers cours. Ces séances ont lieu en coordination avec les travaux pratiques de Génétique moléculaire (12B017P) ;; se référer aux calendriers et aux groupes A et B établis lors du premier semestre.

Responsables Partie morphologie et anatomie :

Monsieur S. LOUBÉRY (cc) – 022.379.6568 - [email protected] Partie physiologie et biochimie : Madame E. DEMARSY (cc) – 022.379.3652 – [email protected]

Divers La participation à ces travaux pratiques est obligatoire pour se présenter à l’examen. Contenu Morphologie et anatomie : 3 séances en rotation Physiologie et biochimie : 2 séances en rotation

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BIOSTATISTIQUES II 12B015 Semestre automne

2h/sem, total 28h

ECTS 2 (cours et TP intégrés)

Jour mercredi, cours 14h15-15h00 (avec TP 15h30-17h00, une semaine sur deux) début du cours mercredi 19 septembre 2018

Lieu

Sciences III – salle 1S059 (et TP – Pav. Ansermet 119)


contrôle continu (semestre d'automne) examen écrit sur ordinateur (session de rattrapage)


Responsable Monsieur J.M. NUNES – 022.379 (3683)/(6967), [email protected]

Enseignant Monsieur J.M. NUNES (ce)

Divers L’organisation du cours et le processus d’évaluation seront présentés en détail lors du premier cours. Contenu Une approche pratique des statistiques où, à l'aide de R et dans des contextes biologiques, seront abordés : + Types de variables, leurs distributions, leurs représentations et leur simulation + Modèles linéaires : variables et termes, paramètres et coefficients, ajustement et son interprétation, coefficient de détermination + Tests d'hypothèses, hypothèse nulle, taille d'effet, valeur de p + Validation du modèle et transformations de variables + Table d'analyse de variance + Tests classiques paramétriques et non paramétriques + Extension du modèle linéaire à variables binaires

Objectifs + Identifier les principaux types de variables et les représenter de façon appropriée + Décrire la variabilité d'une variable, identifier des distributions (lois de probabilité) convenables et les simuler. + Formuler explicitement des modèles décrivant des relations entre variables et des hypothèses de recherche et hypothèses nulles associées + Valider un modèle linéaire + Rapporter le résultat d'un modèle linéaire et l'interpréter dans le contexte de l'analyse + Identifier et utiliser des modèles linéaires équivalents aux tests classiques + Comparer des modèles linéaires + Distinguer corrélation et causalité + Identifier, formuler, estimer et décrire un modèle logistique + Présenter et commenter une analyse statistique

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BIOSTATISTIQUES II – Travaux pratiques intégrés 12B015 Semestre automne 1h/sem, total 14h Jour mercredi 15h15-17h

(une semaine sur deux, à convenir lors du 1er cours) Lieu Pavillon Ansermet, salle 119 au 1er étage Responsable & enseignent(e)s

Monsieur J.M. NUNES (ce) Monsieur J.M. NUNES et assistants

Contenu Ces sessions de travail sur ordinateur sont complètement intégrées au cours de Biostatistiques II (12B015) et font partie de l'évaluation.

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DEVELOPPEMENT ANIMAL 12B016 Semestre


ECTS

4

Jours & lieu mardi 8h15 – 10h & mercredi 8h15 – 9h Sciences III – salle 1S081

Mode d’évaluation examen écrit de 3 heures, aucun document autorisé.


Responsable Monsieur I. RODRIGUEZ - 022.379.3101 - [email protected]

Enseignant (e)s Mesdames W. CHRISTA BUZGARIU (cs sup), B. GALLIOT (pas), M. GOTTA (pas), E. NAGOSHI (pa) Messieurs J. DAL COL (adj. sci.), P. HERRERA (pas), F. KARCH (po), I. RODRIGUEZ (po)

Divers Programme 2019 des travaux pratiques. 28.05.2019 8h15 - 10h00 cours théorique - prof. Brigitte Galliot à la salle 1S081. Puis à la salle TP 5050 au 5ème étage, 29.05.2019 16h15 - 18h30 TP - session 1, 30.05.2019 14h15 - 16h30 TP - session 2, 31.05.2019 14h15 - 16h00 TP - session 3. Contenu Les grands principes dirigeant le développement d’invertébrés (mouche, hydre,…) et de vertébrés (des mammifères en particulier) seront discutés. Le cours couvre le développement précoce, embryonnaire, mais également celui de l’individu après la naissance. Un accent est mis sur les similitudes et les différences entre processus développementaux chez diverses espèces. Objectifs En dehors de l'intégration des données brutes du cours, il est attendu que les étudiants acquièrent la capacité de proposer des expériences pour répondre à des questions précises liées au développement.

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DEVELOPPEMENT VEGETAL 12B019 Semestre


ECTS

3

Jour mardi 10h15 – 12h00

Lieu Sciences III - salle 1S059

Mode d’évaluation examen écrit de 4 heures, aucun document autorisé.


Responsable Monsieur L. LOPEZ-MOLINA, - 022.379.3206 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs L. LOPEZ-MOLINA (pas), X. PERRET (mer), Madame M. BARBERON (pas).

Contenu Le cours suivra le cycle de vie d’une plante : germination de la graine, croissance et maturation (racines, feuilles, plastes, tiges et fleurs), gamétogenèse, fertilisation et embryogenèse, menant à la formation d’une nouvelle graine. Objectifs En dehors de l'intégration des données brutes du cours, il est attendu que les étudiants acquièrent la capacité de proposer des expériences pour répondre à des questions précises liées au développement.

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GENETIQUE – Génétique générale 12B017A Semestre automne 3h/sem, total 42h ECTS 11 (cours + TP + ex.), voir sous « Divers » Jours lundi 8h15 -9h

jeudi 8h15 -10h / début du cours jeudi 20 septembre 2018

Lieu Sciences III, salle 1S081

Mode d’évaluation examen écrit – la note finale est la moyenne des notes des examens de Génétique automne (12B017A) et Génétique printemps (12B017P) examen écrit pour les deux sessions


Responsable Monsieur D. PAULI – 022 379 67 55 – [email protected]

Enseignant Monsieur D. PAULI (ce). Divers Le cours de génétique générale (12B017A) dispensé au semestre d'automne est rattaché au cours de génétique moléculaire (12B017P) dispensé au semestre de printemps. Les cours 12B017A, 12B017P, les exercices et les TP intégrés doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir les 11 ECTS. Contenu Approfondissement de l’analyse mendélienne Relation génotype-phénotype. Interaction des gènes Liaison et cartographie des chromosomes eucaryotes Mécanisme et fonction des crossing-over chez les eucaryotes Mutations Eléments transposables des eucaryotes Effets épigénétiques Détermination du sexe. Objectifs Les étudiants devront être capables de: - définir, expliquer et utiliser les concepts principaux. - à partir d’un problème ou de la description d’une situation expérimentale simple, identifier les informations importantes et émettre une hypothèse ou effectuer les déductions. Proposer un moyen de tester cette hypothèse et prédire ce qu’on peut attendre de ce test. GENETIQUE – Génétique générale Travaux pratiques intégrés

12B017A

Semestre automne 3h/sem, total 30h Jour

jeudi 14h15 -17h

Lieu

Sciences III, salle de TP n° 5050

Mode d’évaluation intégré à l’examen du cours Responsable & Enseignant

Monsieur D. PAULI (ce).

Contenu Génétique et embryologie de la mouche Drosophila melanogaster.

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GENETIQUE – Génétique moléculaire 12B017P Semestre printemps

3h/sem, total 42h

ECTS 11 (cours + TP + ex.), voir sous « Divers »

Jours lundi 8h15 -9h mercredi 9h15 -10h jeudi 9h15 -10h


Mode d’évaluation examen écrit- la note finale est la moyenne des notes des examens de Génétique générale (12B017A) et Génétique moléculaire (12B017P) examen oral pour la session de rattrapage


Responsabl(e)s Monsieur D. SHORE - 022.379.6183 - [email protected] Madame C. GABUS - 022 379 65 90 - [email protected]

Enseignants

Messieurs D. BELIN (po), D. SHORE (po), F. STEINER (past)

Divers Le cours de génétique moléculaire (12B017P) dispensé au semestre de printemps est rattaché au cours de génétique générale (12B017A) dispensé au semestre d'automne. Les cours 12B017A, 12B017P, les exercices et les TP intégrés doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir les 11 ECTS. Contenu Bactéries et virus - Mutation - Structure fine du gène - Code génétique - La réplication - Les plasmides - La conjugaison - La transduction - Génomes (D. Belin). Régulation transcriptionnelle chez la bactérie - Circuit de régulation du bactériophage lambda - Les levures : le cycle de vie et la génétique - La recombinaison – Génie-génétique de la levure - Régulation transcriptionnelle des gènes GAL et du type conjuguant chez la levure (D. Shore). Objectifs 1. Un phénotype observé peut être déterminé par des génotypes différents et par des

environnements cellulaires différents. 2. Qu’est-ce qu’un gène ? Comment le définir expérimentalement. 3. Comprendre la nature moléculaire, l’origine et le mécanisme des mutations. 4. Une mutation peut provoquer une perte ou un gain de fonction. 5. Les organismes modèles sont utiles pour planifier des expériences qui permettent de tester

leurs prédictions. 6. Comprendre les mécanismes qui règlent la réplication de l’ADN. 7. Les propriétés de l’ADN ne sont pas uniformes le long de la séquence. 8. L’activité d’une séquence d’ADN est réglée par des facteurs diffusibles qui agissent en trans

et par séquences régulatrices qui agissent en cis.

9. Comment passer de la génétique moléculaire à la génomique.

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GENETIQUE – Génétique moléculaire Travaux pratiques intégrés

12B017P

Semestre printemps (6 séances) 4h/sem, total 24h Jour Jeudi ou Vendredi 14h15 -18h

1ère séance (7 et 8 mars 2019) 2ème séance (14 et 15 mars 2019) 3ème séance (21 et 22 mars 2019) 4ème séance (28 et 29 mars 2019) 5ème séance (4 et 5 avril 2019) 6ème séance (11 et 12 avril 2019)

Ces séances ont lieu en coordination avec les travaux pratiques de Biologie Végétale (12B013). Se référer aux calendriers et aux groupes A et B établis lors du premier semestre.

Lieu Sciences III – salle de TP n° 0035

Mode d’évaluation examen écrit (avec examen écrit du cours) La participation aux 6 séances de TP est obligatoire. Afin d’obtenir la signature nécessaire pour se présenter à l’examen de Génétique Moléculaire, tous les rapports exigés doivent être rédigés et 1 seul rapport insuffisant est toléré. Questions intégrées à l’examen écrit de Génétique moléculaire (12B017P)

Respondante

Madame C. GABUS - 022 379 65 90 - [email protected]

Enseignant Monsieur F. STEINER (past) Contenu Génétique microbienne et eucaryotique. GENETIQUE – Génétique moléculaire – Exercices 12B017P Semestre printemps 1h/sem, total 14h Jour jeudi 8h15 -9h chaque semaine Lieu Sciences III – salle 1S081

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PHYSIOLOGIE ANIMALE 12B014 Semestre automne

3h/sem, total 42h

ECTS 4

Jours & lieux mardi 8h15 -10h - Sciences III – salle 1S081 Début du cours mardi 18 septembre 2018 mercredi 9h15 -10h - Sciences II – salle 223


examen écrit – la note finale comprend aussi la partie sur les travaux pratiques

Sessions d'examens


Responsable

Madame M. FRIEDEN – 022.379.5198- [email protected]

Enseignante Madame M. FRIEDEN (mer) Contenu Etude des différents systèmes physiologiques principalement chez l’Homme. Les systèmes suivants seront étudiés : nerveux, musculaire, respiratoire, cardiovasculaire, digestif, excréteur, endocrinien. Quelques aspects de physiologie comparée seront aussi abordés. Objectifs L’objectif principal de ce cours est de donner aux étudiants une vue d’ensemble de la physiologie animale, essentiellement humaine. Au terme de ce cours, les étudiants doivent être capables : • D’expliquer le fonctionnement des différents systèmes physiologiques (respiration,

circulation, digestion, excrétion…) à l’aide d’un vocabulaire adéquat et précis. • D’expliquer l’importance des mécanismes du transport membranaire et de l’activité électrique

des cellules dans tous les systèmes physiologiques. • De mettre en relation le fonctionnement de différents organes qui participent à une fonction

commune (ou à une régulation commune) comme par exemple la régulation de la pression artérielle ou le maintient du pH sanguin.

• D’expliquer et d’illustrer par des exemples concrets la notion d’homéostasie.

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PHYSIOLOGIE ANIMALE – TRAVAUX PRATIQUES 12B914 (Histologie-Physiologie animale) Semestre


ECTS

1.5

Jours & lieux mardi 14h15-17h / Sciences III - salle de TP 5050 Début des travaux pratiques, mardi 25 septembre 2018


examen oral (qui aura lieu à la fin des TP), dont la note comptera dans la note finale de l’examen du cours de physiologie animale

Sessions d'examens


Responsable

Madame P. SOULIE – 022.379.5215 – [email protected]

Enseignante Madame P. SOULIE (CS) Contenu Histologie animale et physiologie animale : 14 séances, dont examen oral. Les systèmes étudiés en histologie sont : la peau et les systèmes respiratoire, cardiovasculaire, digestif, urinaire, endocrinien et génital. Les séances de physiologie portent sur le transport membranaire et le muscle squelettique. Objectifs L’objectif principal de ces TP est de comprendre l’organisation et la composition tissulaires des différents organes, pour la partie « histologie » et d’illustrer quelques fonctions physiologiques, pour la partie « physiologie ». Au terme de ces TP les étudiants doivent être capables de : • Faire le diagnostic des différents organes • Intégrer les structures histologiques avec les fonctions physiologiques

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PROGRAMMATION 12X020 Semestre


ECTS 3.5 (cours et TP intégrés)

Jour mercredi 12h15-13h

Lieu Sciences III – salle A100

Mode d’évaluation examens écrits


Responsable

Monsieur J.-L. FALCONE - 022.379.0204 – jean-[email protected]

Enseignant Monsieur J.-L. FALCONE (cs 2 et ce) Divers Les évaluations du cours se déroulent sur machine dans les mêmes conditions que les travaux pratiques. Tout matériel, papier ou informatique, est autorisé. Contenu Ce cours offre une introduction à la programmation, en utilisant le langage Python 3. L’accent est porté sur la rédaction de petits programmes visant à automatiser les tâches répétitives liées au traitement de données scientifiques. Objectifs En suivant ce cours, les étudiant-e-s devront acquérir les compétences suivantes : (1) Ecrire de petits programmes scientifiques utiles en laboratoire ;; (2) Utiliser les structures de contrôles et les structures de donnée les plus courantes;; (3) Interagir et collaborer avec des informaticiens ;; (4) Apprendre plus rapidement un second langage de programmation. PROGRAMMATION – Travaux pratiques intégrés

12X020

Semestre automne 3h/sem, total 42h Jours jeudi 10h -11h (séance de rattrapage)

vendredi 12h-14h (séance principale)

Lieu salle d’informatique au passage Baud-Bovy Responsable Monsieur J.-L. FALCONE - 022.379.0204 – jean-[email protected] Divers Les travaux pratiques ont lieu sur les ordinateurs à disposition des étudiant-e-s et sont parfois précédés d'une courte introduction orale de la part des assistants. Les exercices consistent en une mise en œuvre des concepts vus en cours. La participation aux travaux pratiques n'est pas soumise à un contrôle, mais est très vivement recommandée, la programmation ne pouvant réellement être acquise que par la pratique. La séance principale a lieu le vendredi de 12h00 à 14h00;; la séance du jeudi est éventuellement utilisée pour les personnes n'ayant pas pu terminer le travail pratique le vendredi.

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SYSTEMATIQUE ET BIODIVERSITE 12B018A/12B018P Semestre


ECTS 11 (12B018A+12B018P+TP)

Jours semestre d’automne : les lundis 10h15-12h et vendredis 10h15 -11h semestre de printemps : Début du cours lundi 18 février 2019. Les lundis 10h15-13h.


Mode d’évaluation examen écrit – la note finale est la moyenne des notes des deux cours 12B018A et 12B018P (parties animale et végétale)

Sessions d'examens janvier-février + juin-juillet - rattrapage août-septembre

Responsabl(e)s Partie automne Monsieur J. MONTOYA - 022.379.6786 - [email protected] Partie printemps Madame M.J. PRICE 022.418.5148 – [email protected]

Enseignant(e)s Partie automne Messieurs J. PAWLOWSKI (pas), J. MARIAUX (pt), J. MONTOYA (ce), L. MONOD (ce) Madame M. HOLZMANN (adj. scientifique) Partie printemps Madame M. PRICE (pt), Monsieur Ph. CLERC (cc)

Divers Participation obligatoire aux travaux pratiques. Le cours de systématique et biodiversité est structuré en deux parties (animale et végétale). Le cours doit être suivi dans son intégralité (12B018A + 12B018P) avec les TP pour obtenir 11 ECTS. Contenu La 1ère partie (semestre automne – 12B018A) comprend : Systématique phylogénétique, évolution et biodiversité des protistes et des animaux. Les bases de leur classification phylogénétique, présentation des caractères diagnostiques et interprétation de l'évolution de certain caractères. Présentation des principes expliquant et décrivant la biodiversité (radiation, extinction, biogéographie, indices de biodiversité). Modes d'évolution et de diversification impliquant des interactions entre organismes comme la symbiose, le parasitisme, la co-évolution. Introduction à la biologie de la conservation. La 2ème partie (semestre printemps – 12B018P) comprend : Systématique phylogénétique, évolution et biodiversité, des champignons, des bryophytes, des fougères, des gymnospermes et des plantes à fleurs.. La biodiversité et les tendances évolutifs (coevolution, convergence,…) sera expliquée par des thèmes transversaux. Objectifs 1: Connaître les fondamentaux de la taxonomie. 2: Identifier les grandes lignées phylogénétiques des eucaryotes. 3: Interpréter la morphologie de ces organismes. 4: Interpréter un arbre phylogénétique. 5: Identifier les principaux embranchements des animaux, champignoms et familles de plantes. 6: Expliquer la biodiversité fongique, végétale et animale et comprendre son organisation dans le temps et dans l'espace (biogéographie).

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SYSTEMATIQUE ET BIODIVERSITE Travaux pratiques intégrés

12B018A/12B018P

Semestre automne/printemps 3h/sem, total 84h Jour lundi 14h15-17h

semestre d’automne: Début des travaux pratiques lundi 17 septembre 2018. semestre de printemps: Début des travaux pratiques lundi 18 février 2019.

Lieu Sciences III – salle de TP 5050 au 5ème étage Mode d’évaluation

rapport et examen de détermination.

Répondant(e)s Partie automne

Monsieur J. MONTOYA - 022.379.6786 - [email protected] Partie printemps Madame M.J. PRICE 022.418.5148 – [email protected]

Enseignant(e)s

Semestre d’automne Madame M. HOLZMANN (adj. scientifique) Messieurs J. PAWLOWSKI (pas), J. MARIAUX (pt), J. MONTOYA (ce), L. MONOD (ce) Semestre de printemps Madame M. PRICE (pt), Monsieur P. CLERC (cc)

Objectif Reconnaître les caractères diagnostiques des grands groupes de protistes, d'animaux et des plantes. Savoir utiliser des clés de détermination. Connaître les principaux arbres (partie printemps). Contenu Partie automne : Observation et étude des protistes, examen et dissection d'animaux des principaux embranchements, morphologie comparée, utilisation de clés de détermination. Partie printemps : Etude de quelques exemples choisis de lichens, de champignons non lichénisés, de bryophytes, de fougères, de gymnospermes et d’angiospermes. Détermination et études des organes végétatifs, floraux et fructifères des espèces de plantes à fleurs appartenant aux principales familles de notre flore. 2 excursions prévues.

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FORMATION DOCUMENTAIRE 12B801 Semestre printemps total 5h ECTS certificat Dates introduction en présentiel (salle 1S081) :

mercredi 6 mars 2019 10h15-11h Formation en ligne : 6 mars – 7 avril 2019

Lieu Formation en ligne Mode d’évaluation QCM en ligne : 8 – 10 avril 2019

rattrapage : 6 – 8 mai 2019

Pré-requis Réservé aux étudiant(e)s inscrit(e)s en 2ème année de bachelor en biologie

Responsables & Enseignant(e)s

BELLIER A. 022.379.60.44 - [email protected] HUBER V. 022.379.61.15 - [email protected]

Divers La participation à la séance d’introduction est indispensable : toutes les informations pratiques sur le déroulement de la formation et de l’évaluation en ligne seront transmises lors de cette séance. La réussite de l’évaluation octroie un certificat nécessaire pour la réussite de la 2e année de bachelor en biologie. Contenu Cette formation en ligne permet aux étudiants d’acquérir les compétences informationnelles nécessaires à la poursuite de leurs études universitaires en biologie. Après avoir suivi cette formation, ils devront être en mesure de : - Préparer une recherche documentaire - Identifier les ressources disponibles pour mener à bien leurs recherches documentaires - Conduire des stratégies de recherche documentaire - Accéder à l’information - Evaluer la qualité et la pertinence de l’information - Organiser ses références et sa documentation - Communiquer efficacement - Eviter le plagiat - Citer ses sources et créer sa bibliographie Objectif - Appliquer une méthode pour obtenir des informations scientifiques pertinentes - Citer des références selon les normes et sans risque de plagiat

Ø Plus 5 ECTS de cours à choix. Une liste de cours à choix vous est proposée.

COURS A CHOIX

Les étudiants de 2ème année doivent obtenir un minimum de 5 ECTS de cours à choix. Dans le plan d’études, 2 heures par semestre sont consacrées à ces cours à choix mais la répartition des heures peut être adaptée selon les cours choisis.

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Suggestions de cours à choix pour les étudiants de 2ème année

N° cours

Titre du cours

Semestres

ETCS

14B701 Anthropologie biologique et culturelle – séminaire automne 3

10A001 Astronomie générale

automne 2

13B003 Bioéthique

annuel 6

14B007 Biogéographie

printemps 3

14B008 Flore et végétation : Cartographie, analyse et indicateurs

printemps 2

7414D CIVILISATIONS PREHISTORIQUES : Introduction aux civilisations préhistoriques

printemps 3

14B030 Evolution humaine: histoire des représentations…

printemps 3

14B033 Floristique : Chorologie. Histoire et connaissance de la flore

printemps 3

12T408 Géomatique I

automne 3

14B041 Hydrobiologie microbienne : Environnement naturel et construit, aspects écologiques, hygiéniques et sanitaires

printemps 3

14B641 Hydrobiologie microbienne - Ecologie microbienne et écologie alpine

printemps 4

14B043 Introduction à la biologie du comportement

annuel 3

14B053 Microbiologie moléculaire des milieux hydriques : Détection et typage des microorganismes

automne 3

14B651 Sciences citoyennes : des amateurs naturalistes aux bio-hackers

automne 3

14B668 Stage de botanique et Biogéographie Alpines printemps 2

Remarque: Il ne s'agit ici que de quelques suggestions de cours adaptés à votre niveau et plus ou moins compatibles avec votre horaire.

Cependant, vous pouvez choisir librement parmi l'offre de l'ensemble de l'Université (toutes facultés confondues), pour autant que vous obteniez un total de ≥ 5 ECTS.

Pour consulter les informations relatives aux divers enseignements veuillez vous référer au Programme des cours sur internet.

http://wadme.unige.ch:3149/pls/opprg/w_det_cours.debut?p_code_cours=14B651&p_mode=PGC

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Enseignements obligatoires Troisième année


Section de biologie

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SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-Ansermet 30, GenèveCMU : Centre Médical Universitaire, rue Michel-Servet 1, GenèveBatelle : Route de Drize 9, Carouge(*) à choix restreint : 2 travaux pratiques obligatoires. Une liste vous êtes proposée.

LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Ecologie 13B007

Biochimie III 13C008

Evolution 13B002

Biochimie III 13C008

Génétique moléculaire du développement 13B010

09:00Cours à choix restreint SCIII, salle 1S059

Cours à choix restreint Cours obligatoire SCIII, salle 1S059

Cours à choix restreint SCII, salle 1S059 Cours à choix restreint

09:15automne : SCII, salle A50A printemps SCII,

salle A150

Biologie moléculaire de la cellule 13B001

automne : SCIII, salle 0019

10:00 Cours obligatoire SCII, salle A150

printemps : SCIII, salle 1S081

10:15 Biologie moléculaire de la cellule 13B001

Microbiologie générale 13B011/14

Biologie humaine13B004/05

Physiologie végétale 13B012A/12P

10:30 Cours obligatoire SCIII, salle 1S059

Cours à choix restreint SCIII, salle 0019

Cours à choix restreint SCII, salle 457 Cours à choix restreint

Le système immunitaire 13B013

11:00automne : SCIII, salle 1S081 printemps : SCII,

salle A50A

Cours à choix restreint CMU, salle D60

11:15

12:00 (10:30-12:30)

12:15 Bioéthique 13B003 SCIII, salle 0019

Modélisation et simulation de phénomènes naturels 14X015

13:00 Cours à choix restrient et/ou Cours à choix restreint

13:15 Eléments d'endocrinologie moléculaire 14C003

printemps : Batelle, salle 405-407

14:00Cours à choix restrient SCIII, salle 1S081 (12:00-16:00)

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques

15:00 à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*)15:1516:0016:1517:0017:1518:00

18:15Comprendre la complexité et la

diversité biologiques

19:00 14B024

19:15Cours à choix restreint SCIII, salle 4059

20:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES ET A CHOIX RESTREINT – 3ème année

Semestres d'automne et de printemps

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BIOLOGIE MOLECULAIRE DE LA CELLULE 13B001 Semestre automne/printemps

3h/sem, total 84h

ECTS

9

Jours & lieux lundi 10h15-12h / Sciences III, salle 1S059 jeudi 09h15-10h / Sciences II, salle A150 Début du cours, jeudi 20 septembre 2018


examen écrit 4h

Sessions d'examens juin + rattrapage août-septembre Responsable

Monsieur T. HALAZONETIS - 022 379 6112 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs J.-C. MARTINOU (po), X. PERRET (mer), R. PILLAI (po),

D. PICARD (po), R. ULM (po), T, HALAZONETIS (po), R. LOEWITH (po).

Divers Cours en français, documentation partiellement en anglais Contenu Les cours BMC ont comme objectif l’acquisition par les étudiants des bases moléculaires du fonctionnement de la cellule, allant de la réplication et l’expression génétique, à la traduction et la transduction de signal. Ces concepts de base seront par la suite appliqués à l’étude de la carcinogenèse, l’apoptose, ainsi que la biologie des plantes. Les thèmes seront traités dans l’ordre suivant. T. Halazonetis: Structure et expression du génome, réplication et réparation de l’ADN Les mécanismes qui régissent la réplication et la transcription procaryotes et eucaryotes, la réparation de l’ADN endommagé, les points de contrôle, les conflits entre réplication et transcription et les implications cancérigènes du stress réplicatif et de l’endommagement d’ADN. R. Pillai: Biologie des ARNs : épissage, traduction et silencing Les mécanismes qui actionnent et régulent l'expression des gènes suivant la transcription (la structure et l’activité enzymatique des ARN, l’épissage, la maturation et les étapes de la traduction et la dégradation des ARN). R. Loewith: Transduction de signaux Les principes de base de la transduction de signal (les récepteurs et ligands, les kinases, les seconds messagers, les effecteurs, et l’implication des voies de signalisation liées à TOR (Target Of Rapamycin) en santé et pathologie. D. Picard: Cycle cellulaire et oncologie moléculaire L’épidémiologie et les types de cancer, les bases du cycle cellulaire et ses points de contôle, les oncogènes et suppresseurs de tumeurs, l’instabilité génomique, l’invasion, la métastase, les cellules souches de cancer, l’épigénétique et le cancer, et l’adaptation métabolique. J.-C. Martinou: Mécanismes moléculaires de l’apoptose Mécanismes moléculaires qui sous-tendent la mort cellulaire appelée apoptose, qui implique un programme d'autodestruction sophistiqué, bien conservé au cours de l’évolution. R. Ulm / X. Perret: Perception de - et réponse à - la lumière chez les plantes / Bases moléculaires des interactions entre plantes et bactéries Les mécanismes moléculaires permettant de distinguer les bactéries « ennemis » des « alliés » et les mécanismes de perception de - et réponse à - la lumière chez les plantes. Objectifs Connaissance approfondie des mécanismes moléculaires impliqués dans divers aspects de la biologie cellulaire chez les animaux et les plantes.

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BIOLOGIE MOLECULAIRE DE LA CELLULE 13B901 Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre automne – 3 semaines

4h/sem, total 60h

ECTS

3

Jour 12 novembre au 30 novembre 2018

Lieu Sciences III, salle 0035 de 14h15 – 18h00

Pre-requis participation au cours de biologie moléculaire de la cellule Mode d’évaluation

participation active et présentation, certificat


Responsables

Monsieur T. HALAZONETIS - 022 379 6112 - [email protected] Madame M. STANKOVA – 022 379 6131 - [email protected]

Enseignants Messieurs T. HALAZONETIS (po), R. LOEWITH (po), X. PERRET (mer), R. ULM (po).

Divers L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire.

1. Transmettre au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor, le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site internet de la Section de biologie.

2. Inscription obligatoire sur « Chamilo » une fois la validation interne de votre inscription par le secrétariat de la Section de biologie, indépendamment de l’inscription officielle en octobre. Attention à bien s’inscrire aux travaux pratiques 13B901 BMC et non au cours.

Cours en français, documentation partiellement en anglais Contenu Analyse moléculaire de différents systèmes expérimentaux choisis par les enseignants Objectifs Réalisation et interprétation d’expériences de biologie moléculaire.

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EVOLUTION 13B002 Semestre automne/printemps

2h/sem, total 56h

ECTS

6

Jour mercredi 8h15 -10h00 Début du cours mercredi 19 septembre 2018.

Lieu Sciences III, salle 1S059 Mode d’évaluation

examen écrit de 4h


Responsable

Madame A. SANCHEZ-MAZAS – 022.379.6984 alicia.sanchez-[email protected]

Enseignant(e)s

Mesdames S. EKSTRÖM (cs), M. HOLZMANN (adj.sc), E. POLONI (cc), A. SANCHEZ-MAZAS (po), A. TZIKA (ma) Messieurs G. MEYNET (po), J. MONTOYA (ce), J. PAWLOWSKI (pas), M.CURRAT (mer), M. MILINKOVITCH (po).

Divers Cours en français, documentation partiellement en anglais Contenu Le cours est structuré selon le plan suivant:

• Introduction générale (A.Sanchez-Mazas & M. Milinkovitch) • Les racines cosmiques de la vie (G. Meynet, S. Ekström) • Paléontologie et évolution des organismes et des environnements (J. Pawlowski,

M. Holzmann) • Evolution et développement (A. Tzika) • Modèles et mécanismes de l'évolution génétique des espèces et des populations

(A. Sanchez-Mazas & M. Currat) • Modèles et mécanismes de l’évolution moléculaire, évolution des génomes (E. Poloni) • Reconstruction phylogénétique (J. Montoya)

Des séances d’exercices et des discussions sur des articles d’actualité en lien avec les thèmes abordés sont intégrées au cours. Objectifs Acquérir, d’une part, les connaissances essentielles sur l'évolution des êtres vivants et ses mécanismes et, d’autre part, les compétences méthodologiques nécessaires à la compréhension, à l'analyse des données et à la modélisation des processus évolutifs. Les diverses parties du cours aborderont l’ensemble des phénomènes naturels liés à l'origine de la vie et à l'évolution des organismes vivants, et permettront à l’étudiant-e de comprendre de manière approfondie les multiples mécanismes gouvernant l’évolution des espèces, des populations au sein des espèces et des patrimoines génétiques. Dans ce but, l'étudiant-e apprendra aussi à maîtriser les principales méthodes permettant d'analyser ces mécanismes et, le cas échéant, de les appliquer dans divers domaines fondamentaux de la biologie.

ØPlus 10 ECTS de cours à choix libre doivent être pris parmi les enseignements figurant dans le guide de l’étudiant sur notre site internet de la biologie. Certains cours hors-Section, voire hors Faculté, peuvent néanmoins être admis avec l’accord de la Section de biologie.

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LISTE DES COURS ET TRAVAUX PRATIQUES

A CHOIX RESTREINT DE 3ème ANNEE DU BACHELOR EN BIOLOGIE

N° cours Titre du cours à choix restreint Semestres ECTS 13C008A/08P Biochimie III annuel 6 13B003 Bioéthique annuel 6 13B004/05 Biologie humaine I & II annuel 6 13B007A/07P Ecologie I & II annuel 6 14C003 Eléments d’endocrinologie moléculaire annuel 6 13B010 Génétique moléculaire du développement annuel 6 13B011/14 Microbiologie générale I & II annuel 6 14X015 Modélisation et simulation de phénomènes

naturels printemps 6

13B012A/12P Physiologie végétale annuel 6 13B013 Système immunitaire (le) annuel 6 14B024 Comprendre la complexité et la diversité

biologiques printemps 3

Note : une fois les quatre cours à choix restreint choisis, d’autres cours à choix restreint peuvent aussi être pris en choix libre. N° TP Titre des travaux pratiques à choix restreint Semestres ECTS 13C908X Biochimie III automne 3 13B901 Biologie moléculaire de la cellule automne 3 13B907 Ecologie printemps 3 13B909 Génétique moléculaire du développement automne 3 13B911 Microbiologie générale printemps 3 13B906 Physiologie végétale printemps 3 Le formulaire d’inscription aux travaux pratiques à choix restreint de 3ème année est à télécharger sur le site internet de la Section de biologie.

Il est à retourner au secrétariat des étudiants de la Section de biologie, Sciences III, 2ème étage, bureau 2004A, d'ici la fin avril de la deuxième année du bachelor, dernier délai.

11.07.18

DATES DES TRAVAUX PRATIQUES

A CHOIX RESTREINT DE 3ème ANNEE

(après-midi)

Travaux pratiques

Dates

lieu

Responsable

13C908X Biochimie III

du 1er octobre au 19 octobre 2018

Sciences II, 1

er étage, labo 104A

M. Thierry Soldati

thierry.soldati@

unige.ch

13B901 Biologie moléculaire de la

cellule

12 novembre au 30 novembre 2018

Sciences III, salle 0035

M. Thanos Halazonetis

[email protected]

13B909 Génétique moléculaire

du développement

du 3 décembre au 21 décembre 2018


M. François Karch

francois.karch@

unige.ch

13B911 Microbiologie générale

du 18 février au 08 mars 2019


M. Karl Perron

karl.perron@

unige.ch

13B907 Ecologie

du 11 mars au 29 mars 2019

SCIII 0059

Atelier informatique, Batelle

bâtiment D, 2

ème étage.

M. Bastiaan Ibelings

[email protected]

13B906 Physiologie végétale

du 1er avril au 18 avril 2019

Sciences III laboratoires

Mme Emilie Demarsy

[email protected]

Veuillez, vous renseigner auprès des responsables au début des travaux pratiques susmentionnés pour obtenir des renseignements plus précis.

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MONOGRAPHIE DU BACHELOR EN BIOLOGIE

La monographie du bachelor est un travail personnel écrit devant être effectué pendant la 3ème année (5 ECTS). Voir le règlement détaillé au verso. Le formulaire d’inscription de la monographie est à télécharger au format A4 et recto-verso sur le site internet de la Section de biologie.

Il est à retourner au secrétariat des étudiants de la Section de biologie :

Sciences III - 2ème étage - bureau 2004A

au plus tard fin novembre de la troisième année du bachelor.

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REGLEMENT DE LA MONOGRAPHIE DU

BACCALAUREAT UNIVERSITAIRE (BACHELOR) EN BIOLOGIE Direction de la monographie :

La monographie du baccalauréat universitaire en biologie se fait sous la direction d’un professeur, chargé de cours, maître d’enseignement et de recherche, chargé d’enseignement, biologiste, collaborateur scientifique ou maître-assistant de la Section de biologie. C’est l’étudiant lui-même qui prend contact avec des enseignants pour trouver un directeur de monographie selon son intérêt pour une discipline. Ces contacts se font dans le courant de la 2ème année ou au début de la 3ème année. L’inscription définitive se fait au plus tard le 15 novembre de la 3ème année. Le directeur supervisant le travail peut aussi être choisi hors-Section, mais l'étudiant doit alors trouver un professeur responsable au sein de la Section. La direction de monographie inclut la validation ou la proposition d’un sujet (voir ci-dessous), une discussion préalable, la suggestion de lectures (chapitres de livres, articles de revue), la supervision régulière du travail si nécessaire, des propositions de modifications et de corrections, et l’évaluation. L’évaluation (note sur 6) doit être validée par une attestation portant deux signatures (celles du directeur et d’un deuxième juré, titulaire au minimum d'un master, choisi par le directeur), et communiquée à la Section par le directeur de monographie. La note sera enregistrée et les 5 ECTS validés dès que l’étudiant aura envoyé une copie électronique (pdf) de son travail à l'adresse e-mail secretariat-[email protected] et remis le certificat de la formation documentaire (voir ci-dessous) au secrétariat de la Section. Le dernier délai de remise de la monographie est le jour précédant la rentrée d’automne de manière à assurer sa validation pour l'année académique précédente.

Co-requis (formation documentaire) : L’étudiant doit s’inscrire aux séances de « Formation documentaire » obligatoires à la Bibliothèque Ernst et Lucie Schmidheiny (BELS, Sciences II) qui ont lieu chaque année entre les mois d’octobre et de décembre. Cette formation est validée par un certificat que les étudiants devront obligatoirement joindre à leur travail de monographie au moment de rendre cette dernière au secrétariat de la Section de biologie.

Objectif et contenu de la monographie : La monographie du baccalauréat universitaire en biologie est un travail personnel basé sur une recherche bibliographique, sans travail pratique d'analyse ou d'expérimentation. Elle doit être présentée sous forme d'un mémoire écrit d’environ 4000 (minimum) à 6000 (maximum) mots (soit environ 12 à 20 pages) sans compter la page de titre, le résumé, la table des matières, les illustrations et la bibliographie. Elle représente un effort de 5 crédits ECTS, soit environ 150 heures de travail personnel, et peut être réalisée dès la 2ème année du baccalauréat universitaire en biologie.

Présentation de la monographie :

La monographie se fait sur un sujet choisi en concertation avec le directeur de monographie (et validé, le cas échéant, par le répondant). Elle introduit le sujet, fait un état documenté de la recherche de manière synthétique et se termine sur une conclusion dans laquelle seront également soulevées les questions non encore résolues dans le domaine considéré. Dans tous les cas, les citations bibliographiques seront intégrées au texte et les références complètes présentées dans une bibliographie soignée tant dans son actualité que dans sa présentation.

Critères d'évaluation de la monographie :

Indépendance dans la recherche bibliographique et dans le tri des sources consultées ;; compréhension du sujet ;; pertinence et actualité des thématiques présentées ;; qualité de la rédaction et de la présentation (format et contenu) ;; qualité des illustrations et de leur légende ;; qualité de la bibliographie (actualité des sources mais aussi références aux sources primaires, et présentation complète et correcte des références) ;; présentation des questions non encore résolues et des perspectives possibles.

Section de biologie

!

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Orientations du master en biologie :

• Orientation libre (OL) • Biodiversité et systématique (BDS) • Bioinformatique et analyse des données en biologie (BIADB) • Génétique, développement et évolution (GDE) • Sciences moléculaires du végétal (MPS)

Liste des cours réservés au master en biologie

Partie III Le master

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MASTER EN BIOLOGIE & ses orientations

Voir l’Annexe 1 au règlement du master au verso. Les étudiants peuvent s'inscrire à l’une ou l’autre des 5 orientations de master suivantes :

− OL : Orientation Libre

− BDS : Biodiversité et Systématique

− BIADB : BioInformatique et Analyse des Données en Biologie

− GDE : Génétique, Développement et Evolution

− MPS : Sciences moléculaires du végétal / Molecular Plant Sciences

Les formulaires d’inscription au master en biologie & ses orientations sont à télécharger sur le site internet de la Section de biologie.

Le formulaire d’inscription rempli est à retourner au secrétariat des étudiants de la Section de biologie (Sciences III - 2ème étage - bureau 2004A) au plus tard à la rentrée du semestre auquel le master débute.

N’hésitez pas à consulter le site internet de la Section de biologie vous y trouverez des informations détaillées sur l’organisation, la rédaction et les délais du master.

http://biologie.unige.ch/fr/

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ANNEXE 1 AU REGLEMENT DE MASTER EN BIOLOGIE Inscription au master :

L'inscription n'est possible qu'après avoir trouvé un directeur de travail de master.

C’est l’étudiant lui-même qui prend contact avec un potentiel directeur de master qui lui proposera

un sujet selon son intérêt pour une discipline et les possibilités d’encadrement. Certaines places de

master sont aussi proposées sur les sites web de la Section et des Départements.

Le directeur du travail de master doit être un membre du corps professoral de la Section de

biologie ou un MER. Les CC et CE titulaires d'un doctorat peuvent aussi être autorisés par le

président de la Section de biologie à diriger des travaux de master ou à fonctionner en tant que

répondants (voir ci-dessous). Si le master se fait selon une orientation, le choix du directeur ou du

répondant peut être restreint.

La réalisation d’un travail de master en dehors de la Section de biologie est possible avec l’accord

de la présidence de la Section. Elle requiert néanmoins la désignation d’un répondant, membre du

corps professoral ou MER (ou CC/CE) de la Section de biologie, qui agit comme responsable. Le

répondant de la Section s’assure du niveau académique de la structure d’accueil et de l’adéquation

du sujet proposé aux exigences de la Section de biologie. Le répondant ou son département

peuvent exiger la présentation d'un projet préalable par écrit. Le répondant vérifie et cosigne

l’évaluation finale du travail de master. Le formulaire d'inscription au travail de master doit parvenir au secrétariat des étudiants de la Section de biologie avec toutes les signatures au plus tard à la rentrée du semestre auquel le master débute. Le formulaire est contrôlé au secrétariat des étudiants de la Section (crédits, cours en relation avec le travail de master, etc.) et signé par la présidence de la Section. Des copies seront retournées à l’étudiant, dont une pour le directeur et/ou le responsable du travail. Selon l'Art. 19 - alinéa 1c du "Règlement d'études général" de la Faculté des sciences, un minimum de 20 ECTS doivent être obtenus sur les deux premiers semestres du master. Si l'étudiant ne les a pas encore obtenus pour des cours, une attestation pourra être établie par le directeur du travail de master (et le responsable, s'il y a lieu) afin de valider une équivalence d'au moins 20 ECTS pour le travail de master pour cette période. Un formulaire ad hoc sera transmis à cette fin au terme de la 1ère année au directeur de travail par le Secrétariat des étudiants de la Section de biologie. But du travail de master :

• Répondre à une question de biologie par l'expérimentation et/ou l’analyse de données.

• Se familiariser avec la démarche scientifique pratique et théorique.

• Acquérir des compétences expérimentales/analytiques par l'apprentissage d'un large éventail de techniques.

• Apprendre à rendre compte de résultats dans des séminaires de groupe et par écrit (mémoire de master).

Durée du travail de master : Le travail de master vaut 60 ECTS. Cela correspond à 45 semaines à plein temps (sans compter les vacances).

77

Rédaction du mémoire de master : Le travail de master devra être présenté sous forme d’un mémoire de master écrit. Voir les consignes dans le Guide de l'étudiant ou sur le site de la Section (http://biologie.unige.ch). Obtention du master en biologie : délais et conditions Pour obtenir le master en biologie, l’étudiant doit acquérir un total de 90 crédits ECTS 60 ECTS pour le travail de master et 30 ECTS pour des cours de master. La durée réglementaire d’études est de 3 semestres, mais une prolongation est possible (maximum de 6 semestres au total). Pour plus d’information sur les délais et conditions, merci de consulter le site web de la Section de biologie, lien Master en Biologie. Évaluation et dépôt du mémoire de master : Le travail de master est noté par deux évaluateurs, le directeur du master et un juré, titulaire au minimum d'une thèse doctorale, selon les critères mentionnés ci-après. Pour les travaux dirigés par un professeur ne faisant pas partie de la Section, le répondant au sein de la Section agit comme juré. Une soutenance orale, en présence des deux évaluateurs, peut être organisée en accord avec l'étudiant. La note est transmise par le directeur de master, avec les deux signatures, au moyen du formulaire officiel de la Section de biologie. La note peut aussi être attribuée par le collège des professeurs du département concerné. Critères d'évaluation : Réflexion personnelle / Compréhension / Indépendance, créativité / Engagement personnel / Compétences pratiques / Contenu du travail : état de la recherche, résultats, interprétation / Rédaction et présentation écrite du travail / Le cas échéant, qualité de la soutenance orale. Une fois que le travail de master a été accepté par le directeur du travail, le déroulement est le suivant : 1.) Une version pdf doit être transmise au secrétariat des étudiants de la Section de biologie

(p.ex. envoyée par e-mail à [email protected]).

2.) Après validation du mémoire et réception de la note, le secrétariat enverra une confirmation à l'étudiant par e-mail.

3.) L'étudiant devra alors déposer le mémoire (en version électronique) dans l'Archive Ouverte (http://archive-ouverte.unige.ch) et envoyer la confirmation officielle (comprenant le lien) du dépôt dans l'Archive Ouverte au secrétariat des étudiants de la Section de biologie.

4.) Le secrétariat des étudiants de la Section de biologie transmettra la note à la Faculté. Pour que le master puisse être formellement accordé, il faut que ce processus aboutisse avant la fin de la session d'examens du dernier semestre du master. Selon les modalités du département concerné, des copies en version papier peuvent aussi être requises pour le directeur (et répondant s'il y a lieu) et/ou le département.

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MASTER IN BIOLOGY & its options

Please see below the Annex to the bylaws of the master. The students may enroll in one of the five following options:

− OL : Free option

− BDS : Biodiversity and Systematics

− BIADB : BioInformatics and Data Analysis in Biology

− GDE : Genetics, Development and Evolution

− MPS : Molecular Plant Sciences

Registration forms for the master in biology and its orientations are downloadable on the Section of Biology’s website.

Once filled, the form must be returned to the "Secrétariat des étudiants" of Biology

(Sciences III - 2nd floor - office 2004A) before the academic start of the first term of the master

Detailed information on the organization, writing and deadlines of the master is available on the website of the Section.

http://biologie.unige.ch/en/

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ANNEX 1 TO THE REGULATIONS OF THE MASTER IN BIOLOGY

Registration to the master's program:

Registration to a master's degree is only possible after having found a master's work adviser.

The student has to get in touch him/herself with a potential adviser according to his/her interest for a

given discipline and the possibilities of supervision. Some master’s positions are also proposed on

the web sites of the Section of Biology and of its individual departments.

The master’s work adviser must be a professor or MER of the Section of Biology. CC and CE with

PhD degree can also be authorized by the president to supervise or sponsor (see below) a master’s

work. If the master in biology is done with a particular option, the choice of the thesis adviser or

sponsor may be restricted.

Students are allowed to perform their master’s work in a laboratory outside the Section of Biology

with the agreement of the president. In that case, a sponsor acting as responsible for the Section of

Biology has to be found. This sponsor must be a professor or MER (or CC or CE as indicated above)

of the Section of Biology. The sponsor of the Section of Biology ensures both that the academic

environment of the host laboratory is appropriate and that the subject proposed to the student for

his/her master’s work fulfills the criteria of the Section of Biology. The sponsor or his/her Department

can request a written project description before accepting the sponsorship. The sponsor checks and

cosigns the final evaluation of the master’s thesis. The registration form for the master’s work must be brought to the Secretariat for students of the Section of Biology with all signatures by the official start of the 1st semester of the master, at the latest. The registration form is checked by the Secretariat for students (credits, courses in relation to the master’s work, etc) and signed by the presidency of the Section. Copies of the registration form are returned to the student, including one for the master’s adviser and/or sponsor. According to the Art. 19-1c of the "Règlement d'études général" of the Faculty of sciences, a minimum of 20 ECTS must be obtained for the first two semesters of the master. If the student has not successfully obtained them yet with courses, the master's thesis adviser (and the sponsor, if required) can provide a certificate attesting that the student's work on the master's thesis is equivalent to at least 20 ECTS for this period. To this end, an official form will be sent to the master's thesis adviser at the end of the first year by the Secretariat for students of the Section of Biology. Objectives of the master's work:

• To answer a question related to biology through experimentation.

• To become familiar with the practical and theoretical aspects of the scientific process.

• To acquire a wide range of experimental skills involving a variety of techniques.

• To learn how to present scientific results in group seminars and in a written form (e.g. master’s thesis).

Time investment for the master's work: The master’s work is credited 60 ECTS. This corresponds to 45 weeks of full-time work (without counting vacation).

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Writing the master’s thesis: The master’s work must be presented in the form of a written master's thesis. See guidelines on the website of the Section of Biology (http://biologie.unige.ch). Duration and conditions for obtaining a master's degree in Biology To obtain a master’s degree in Biology, students must obtain a total of 90 ECTS credits: 60 ECTS for the master’s work and 30 ECTS for master’s courses. The normal duration of the master’s studies is 3 semesters, but an extension can be obtained (maximum 6 semesters in total). For more information on deadlines and conditions, please visit the website of the Section of Biology, link Master in Biology. Evaluation and submission of the master’s thesis: The master’s thesis is evaluated by two examiners, the thesis supervisor and another member of the jury who holds at least a PhD, according to the criteria mentioned hereafter. If the master’s work is performed in a laboratory outside the Section of Biology, the sponsor from the Section acts as the second examiner. With the agreement of the student, an oral defense in the presence of the two examiners can be organized. The final grade is transmitted by the thesis director on the official form to the Secretariat for students of the Section of Biology, with the two signatures. The grade can also be given by the College of principal investigators of the corresponding Department. Evaluation criteria: Intellectual contribution / understanding / independence, creativity / personal commitment / practical skills / contents of the master's thesis: current state of research, results, interpretation / writing and presentation of the thesis / when applicable, quality of oral presentation. Once the master’s thesis has been accepted by the master’s supervisor, the procedure is as follows: 1) A pdf version must be sent to the Secretariat for students of the Section of Biology (e.g. sent

by e-mail to [email protected]).

2) After validation of the thesis and receipt of the grade from the supervisor, the Secretariat will send a confirmation to the student by e-mail.

3) The student then needs to file an electronic copy of the master’s thesis in the Open Archive (http://archive-ouverte.unige.ch) and send the official confirmation (including the link) from the Open Archive to the Secretariat for students of the Section of Biology.

4) The Secretariat for students of the Section of Biology can then forward the grade to the Faculty. In order for the master’s to be formally granted, this process must be completed before the end of the exam session of the last semester of the master’s. According to the terms of the relevant department, paper copies may also be required for the director (and supervisor if applicable) and /or the department.

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Master en biologie Orientation Libre (OL) Master in Biology Free option

Responsables / Persons in charge :

Didier Picard (po) - [email protected], président de la Section de biologie

Alicia Sanchez-Mazas (po) - [email protected], vice-présidente

Descriptif : Ce type de master offre la possibilité d'intégrer n’importe quel domaine de la biologie sans l’imposition d’une spécialisation particulière. Il permet à l'étudiant de choisir sa propre spécialisation à la carte ou de maintenir une formation large. L’orientation libre reste ouverte sur tous les débouchés après le master, y compris le Doctorat ès sciences. D'entente avec le responsable du travail de master, tous les cours sont à choix (30 ECTS) parmi les enseignements proposés dans le Guide de l’étudiant de la Section de biologie. D’autres cours (hors-Section ou hors-Université de Genève) peuvent également être choisis avec l'accord de la présidence de la Section. Le travail de master (60 ECTS) peut se faire dans n'importe quel laboratoire de la Section de biologie, notamment les laboratoires non proposés comme laboratoires d'accueil par les masters avec orientation, ainsi que dans des laboratoires hors-Section (par exemple un laboratoire de la Faculté de médecine). Notez qu’un même sujet de master peut faire l’objet d’un master avec orientation libre ou d’un master avec orientation spécifique, selon recommandation ou accord du directeur de master. Pour trouver un sujet et une place de master (que ce soit pour l’orientation libre ou une orientation spécialisée), l’étudiant devra s’adresser lui-même directement aux enseignants / chefs de groupes de recherche selon son intérêt pour une discipline. Il pourra aussi consulter le site web de la Section de biologie et les sites des différents départements. Description : This type of master gives access to any field of biology without any particular specialization being imposed. It allows the student either to choose his/her own specialization or to follow a broad orientation. The free orientation still allows all options after the master, including a PhD in Science. In agreement with the master work adviser, all courses (30 ECTS) can be chosen among those proposed in the Guide for Students. Other courses (outside the Section or outside the University of Geneva) can also be chosen in agreement with the presidency of the Section of biology. The master work (60 ECTS) can be performed in any laboratory of the Section of biology including laboratories not proposed as host laboratories for specific master options, as well as other laboratories outside the Section (e.g. laboratories of the Faculty of Medicine). Note that one and the same research topic can be chosen for a master with free option or for a master with specialized option, depending on the recommendation or with the agreement of the master advisor. To find a research topic and position for a master (either with free or specialized option), the student must contact himself/herself a possible adviser according to his/her research interests. He/she can also consult the web site of the Section of biology and those of the different Departments.



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Master en Biologie : Orientation Biodiversité et Systématique (BDS) Master in Biology : Option Biodiversity and Systematics (BDS)

http://www.unige.ch/bds Responsables / Persons in charge :

Juan Montoya (ce) - [email protected], Département de génétique et évolution

Jean Mariaux (pt) - [email protected], Muséum d’Histoire Naturelle Michelle Price (pt) - [email protected], Conservatoire et Jardin Botaniques

Cours obligatoires / Compulsory courses (15 ECTS) : ECTS

14B005 Biodiversité: origine et évolution 3 14B013 Advanced studies in systematics 2 14B637 Génétique moléculaire des populations/ Molecular Population Genetics 5 14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and molecular evolution 5

+ Cycle de conférences en biodiversité (CJB, MHN, GENEV, AGP)

Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (9-15 ECTS): ECTS 14B016 Botanique tropicale 5

14B021 Exploitation des collections botaniques 5

14B033 Floristique 3

14B070 Systématique, phylogénie et écologie des lichens et des bryophytes 5

14B669 Stage de botanique tropicale 5

14B668 Stage de botanique alpine 2

14B951 Statistique appliquée 1

14B012 Scientific writing and communication 2

14B056 Parasitologie générale et systématique 5

14B642 Faune genevoise 4

14B667 Stage de biologie marine 6

14B701 Anthropologie biologique et culturelle 3

14B030 Evolution humaine - Histoire des représentations scientifiques des origines et de la diversité des humains

3

14F001 Elements of bioinformatics 5

14B672 Computer skills for biological research 4

14F006 Programming for bioinformatics 7

14B007 Biogéographie 3

14E150 Climat et changement climatiques 3

14E159 Ecologie des systèmes fluviaux – stage 2

12T408 Géomatique I 3

14E074 Espace-Ecologie: analyses spatiales en écologie 3

14E155 Menaces et conservation de la biodiversité 3

14B008 Floristique et végétation: distribution, dynamique et analyses 2

14B009 Stage de Floristique et végétation 3

Cours à choix libre / Courses with free choice (0-6 ECTS) :

A choisir dans la liste des cours à choix du Guide de l’étudiant ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du directeur du travail de master et d'un responsable de l’orientation BDS.

To be chosen among the list of optional courses proposed in the Guide for students, or outside the University of Geneva, in agreement with the supervisor of the master's research project and one of the persons in charge of the option BDS.




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Master en Biologie : Orientation BioInformatique et Analyse des Données en Biologie (BIADB) Master in Biology : Option BioInformatics and Data Analysis in Biology (BIADB)

http://biadb.unige.ch

Responsables / Academic contacts :

Alicia Sanchez-Mazas (po) – [email protected], Département de génétique et évolution, Unité d’Anthropologie

Frédérique Lisacek (mer) – [email protected], Centre Universitaire d’Informatique (CUI), Département d’Informatique. Cours obligatoires / Compulsory courses (19 ECTS) : ECTS 14F001 Elements of Bioinformatics 5 14B637 Molecular Population Genetics 5 14B057 Statistics and Probability 5 14B672 Computer Skills in Biological Research 4

Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (5-11 ECTS) : ECTS 14F006 Programming for Bioinformatics 7 14B751 Méthodologie de la Recherche en Biologie 3 14F016 Data Mining for Protein Function Prediction 5 14F012 Elements of proteomics 3 14F004 Protein expression and interaction 4 14F018 Introduction to systems biology 3 14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and molecular evolution 5

Cours à choix libre / Courses with free choice (0-6 ECTS) :

A choisir dans la liste des cours à choix du Guide de l’étudiant ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du responsable de l’orientation. To be chosen among the list of optional courses proposed in the Guide for students, or outside the University of Geneva, in agreement with the professor in charge of this option.



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Master en Biologie : Orientation Génétique, Développement et Evolution (GDE)

Master in Biology : Option Genetics, Development and Evolution (GDE) http://gde.unige.ch

Responsables / Academic contacts:

Brigitte Galliot (pas) – [email protected], Département de génétique et évolution

Marcos Gonzalez (po) – [email protected], Département de biochimie

Cours obligatoires / Compulsory courses (13 ECTS): ECTS

14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution 9 & at least one course of the series « Selected Chapters » 4

Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (11-17 ECTS): ECTS

14B038 Molecular Genetics in Development and Evolution « Selected Chapters » 4 14B034 Landmark Papers in Yeast Biology « Selected Chapters » 4 14B023 Milestones in Plant Molecular Biology « Selected Chapters » 4

14CB01 Currrent Topics in Chemical Biology and Biochemistry 8 14B010 Principles of Cellular and Molecular Biology 8 14C003 Elements of Molecular Endocrinology 6 14F001 Elements of Bioinformatics 5 14B637 Molecular Population Genetics/ Génétique moléculaire des populations 5 14B657 Phylogeny and Molecular Evolution / Phylogénie et évolution moléculaire 5 14B063 Microscopy and Imaging Course 3 14B024 Understanding Biological Complexity and Diversity 3 13B010 Génétique Moléculaire du Développement – cours principal 6 13B909 Génétique Moléculaire du Développement – travaux pratiques 3 14B640 Histologie et imagerie des tissus 3 14B044 Travaux pratiques Microscopie générale module B : Microscopie électronique 5 14B020 Classiques de la Génétique Moléculaire (les) 5 14B951 Statistiques appliquées 1

Cours à choix libre / Courses with free choice (0-6 ECTS):

A choisir dans la liste des cours à choix du Guide de l’étudiant ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du responsable de l’orientation.

To be chosen among the list of optional courses proposed in the Guide for students, or outside the University of Geneva in agreement with the professor in charge of this option.



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Master en Biologie : Orientation Sciences moléculaires du végétal (MPS) Master in Biology : Option Molecular Plant Sciences (MPS)

http://biveg.unige.ch/teaching/master/

Responsables / Academic contacts: Département de botanique et biologie végétale

Teresa B. Fitzpatrick (po) – [email protected]

Roman Ulm (po) – [email protected]

Cours obligatoires / Compulsory courses (13 ECTS) : ECTS

Cours de base / Basic courses : 14B035 Molecular Plant Sciences – Basic Research - alternately 14B037 14B037 Molecular Plant Sciences – Applied Aspects - alternately 14B035

4 4

At least one of these « Selected Chapters » courses: 14B023 Milestones in plant Molecular Genetics « Selected Chapters »

4

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux 4 Research seminars of the Department : 14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars

1

Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (09-17 ECTS) : ECTS

Biologie moléculaire et biologie cellulaire végétales / Plant Molecular and Cellular Biology : 14B059 Phytopathologie et lutte contre les maladies 3 14B023 Milestones in plant molecular genetics - Selected chapters 4 14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux 4

Physiologie végétale / Plant physiology 14B018 Chronobiologie 3 14B058 et 14B912 Physiomatique et TP Biologie des systèmes intégrés 6

Cours à options du Bachelor en Biologie / Free choice from Bachelor in Biology 13B012 Physiologie végétale (Fr.+ Engl.) 6 13B906 Physiologie végétale, travaux pratiques (Fr.+ Engl.) 3

Systématique et biodiversité / Systematics and Biodiversity 14B005 Biodiversité végétale 3 14B007 Biogéographie générale et écologie végétale I 3 14B008 Biogéographie générale et écologie végétale II 2

Cours à l’Université de Lausanne / Courses at the University of Lausanne (UNIL) See http://biveg.unige.ch/enseignement/master/program.html for the current list 1.5

Microscopie et imagerie / Microscopy and Imaging

14B640 Histologie et imagerie des tissus 3 14B044 Introduction à la microscopie électronique 5 14B063 Imaging workshop 3

Bioinformatique et statistiques / Bioinformatics and Statistics 14F001 Elements of bioinformatics 5 14B057 Statistics and probability 5 14B672 Computer skills for biological research 4 14B951 Statistique appliquée 1

Autres aptitudes / Other Skills 14B012 Scientific writing and communication 2 Cours à choix libre / Courses with free choice (0-8 ECTS) : A choisir dans la liste des cours à choix du Guide de l’étudiant ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du responsable de l’orientation. Can be chosen among the list of optional courses proposed in the guide for students, or outside the University of Geneva, in agreement with the professor in charge of this option.

http://biveg.unige.ch/teaching/master/



http://wadme.unige.ch:3149/pls/opprg/w_det_cours.debut?p_code_cours=14B023&p_plan_is=0&p_langue=1&p_frame=N&p_mode=PGC&p_annee=2010&p_suffixe=&p_grtri=

http://biveg.unige.ch/enseignement/master/program.html

Liste des cours réservés au MASTER EN BIOLOGIE * List of courses reserved for the MASTER IN BIOLOGY * (sous réserve de modifications / Subject to modifications)

* Ouverts à d'autres étudiants avec accord des responsables / Open to other students upon agreement with professor in charge

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N° cours

Titre du cours

Semestres

ECTS

14B013 Advanced Studies in systematics Autumn 2

14B005 Biodiversité : origine et évolution automne 3

14B047 Cell Biology Journal Club Autumn/ Spring 3

14B020 Classiques de la génétique moléculaire (les) printemps 5

14B672 Computer Skills for Biological research : an introduction to GNU/Linux and bash scripting Autumn 4

14CB01 Current Topics in Chemical Biology and Biochemistry Autumn 8

14F016 Data mining for protein function prediction Spring 5

14F001 Elements of Bioinformatics Spring 5

14F012 Elements of Proteomics and Metabolomics : Translation to human Diseases Autumn 3

14B028 Ethnoarchéologie automne 3

14B642 Faune Genevoise printemps 4

14B637 Génétique moléculaire des populations - Molecular Population Genetics

janvier/ January 5

14B038 Génétique moléculaire du développement et de l'évolution - chapitres choisis

annuel tous les 15 jours 4

14B071 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique automne 2

14B771 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique - séminaire automne 1

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux annuel 4

14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution

Autumn/ Spring 9

14B063A Microscopy and imaging course Autumn 3

14B778 Molecular Biology journal club and progress reports

Autumn/ Spring 5

14B035 Molecular Plant Sciences - Basic Research Autumn 4

88

14B037 Molecular Plant Sciences - Applied Aspects Autumn 4

7312D Neurobiologie de la représentation spatiale (la) printemps 3

14N12 Neurosciences : Chemical senses Autumn 3

14B062 Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

automne 6

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire - stage annuel 5

14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars

Autumn/ Spring 1

24N01 Principles of neurobiology I Autumn 3

14N11 Principles of neurobiology II Autumn 3

14F006 Programming for bioinformatics Autumn 7

14B010 Principles of cellular and molecular biology - Biologie cellulaire et moléculaire approfondie

Autumn/ Spring 8

14B773 Progress report in Cell Biology - seminar Autumn/ Spring 3

14B048 Protohistoire de l'Afrique : de l'apparition du métal à la mise en place des grands empires automne 6

14B748 Protohistoire de l'Afrique : de l'apparition du métal à la mise en place des grands empires - séminaire

automne 3

14B012 Scientific writing and communication Spring 2

14B669 Stage de botanique tropicale 2 semaines en

région tropicale

5

14B057 Statistics and probability Autumn 5

14B951 Statistiques appliquées - travaux pratiques printemps 1

14B067 Technologie préhistorique automne 3

14B767 Technologie préhistorique - séminaire automne 3

Pour consulter les informations relatives aux divers enseignements.

Veuillez, vous référer aux programmes des cours sur internet.

http://wadme.unige.ch:3149/pls/opprg/w_det_cours.debut?p_code_cours=14B651&p_mode=PGC

Section de biologie

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!

• Liste des enseignements à choix libre & à choix restreint

Partie IV Les cours à choix

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ADVANCED STUDIES IN SYSTEMATICS 14B013 Compulsory Master course for option « Biodiversity and Systematics » Cours obligatoire pour l’orientation « Biodiversité et systématique » du master

Period Autumn

year 24h

ECTS 2

Day 29, 30, & 31 October 2018 8h-12h, 13h-17h

Place

Conservatoire et Jardin botaniques, salle de séminaire de la Console (192 rue de Lausanne, 1202) & Muséum d’Histoire Naturelle (1 Route de Malagnou, 1208)

Evaluation mode Written report / rapport écrit

Exam sessions January/February + catch-up August-September Person in charge

NACIRI Yamama – 022 418 5165 – yamama.naciri@ville-ge.ch ou [email protected]

Teachers Mrs : A. CIBOIS (chargée de recherche), Y. NACIRI (cc), M. PRICE (cc),

Ph. CLERC (cc), J. MARIAUX (pt), P. SCHUCHERT (cc), M. PERRET (conservateur), A. SCHMITZ (cc), F. STAUFFER (cc).

Miscellaneous This course is taught in English. We reserve the right to cancel the course if it fails to reach the minimum number of students.

Please register with Yamama Naciri in early September 2018. The course is based on both theoretical lectures and applied exercises (visits, exercises, article reviews, etc…). Students should come with their own computers. Contents This course covers the fundamentals of the science of systematics and allows students to familiarise themselves with the processes of and tools involved in modern taxonomy. The importance of taxonomy and systematics in the description and management of biodiversity is explored alongside new approaches to the description, definition, classification and understanding of life on Earth, and the processes that shaped it. The course addresses three main topics: (1) theoretical and practical aspects of taxonomy, systematics and nomenclature in plants, fungi and animals;; (2) the description, delimitation and classification of species with a special focus on molecular techniques;; (3) techniques in plant and animal systematics. Objective Upon conclusion of the course, the students are expected to be able to -understand the basics of naming and nomenclature -use an identification key -explore the definition of species and species concepts. -have a critical understanding of species delimitation and be able to analyse species from a morphological and molecular perspective -be aware of and explain the importance of modern taxonomy

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ANTHROPOLOGIE BIOLOGIQUE ET CULTURELLE Séminaire

14B701

Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestre


ECTS

3

Jour 1ère séance le vendredi 21 septembre 2018 à 11h15. Puis horaire à déterminer avec les étudiants

Lieu Sciences II, salle 449 Mode d’évaluation exposé oral et rapport écrit Responsables et Enseignant(e)s

Madame A. SANCHEZ-MAZAS (po) - 022.379.6984/67 alicia.sanchez-[email protected] Madame N. BORDESSOULE GILLERON (ce) [email protected] Monsieur N. HUBERT Van BLYENBURGH (cc) [email protected]

Divers Une première séance d’information et d’organisation du séminaire aura lieu le vendredi 21 septembre 2018 à 11h15 dans la salle 449, à Sciences II. Ce séminaire s’articule avec le cours 14B030 « Evolution humaine, histoire des représentations scientifiques des origines et de la diversité des humains ». Il propose de revenir plus longuement sur les textes historiques et actuels fondateurs de l’anthropologie biologique et culturelle. Il s’adresse aux étudiant-e-s l’ayant suivi comme à celles et ceux intéressé-e-s par l’anthropologie et sa construction. Il réunit des étudiant-e-s de la faculté des Lettres et de la faculté des Sciences. Les étudiant-e-s de la faculté des lettres suivent le séminaire « Regards sur l’interculturalité » proposé par cette faculté. Contenu

Comment se fabrique le regard sur l’Autre ? Comment la science a-t-elle contribué à construire la culture depuis le début du 18e siècle ? Comment s’est élaborée la question de l’altérité, à travers le temps comme à travers l’espace ? Quels sont les enjeux fondamentaux articulés dans des textes ayant pour particularité d’avoir l’humain, son origine et sa diversité comme objets de réflexion ?

Les étudiant-e-s participant à ce séminaire sont invité-e-s à choisir un ouvrage, un article ou un film dans une liste d’auteurs historiques et contemporains importants comme Bensa, Buffon, Blumenbach, Darwin, Gobineau, Kropotkine, Latour, Leach, Lévi-Strauss, Mucchielli, Rouch ou Rousseau. Au moyen d’une grille d’analyse proposée par les enseignant-e-s, le texte ou le document est analysé, puis présenté à l’ensemble des participant-e-s au séminaire.

Les premières séances seront consacrées au rappel et à la discussion de quelques concepts-clefs en anthropologie biologique et culturelle. Pour développer certaines thématiques, des spécialistes d’un domaine pourront être invités à intervenir.

Par l’appropriation de textes fondateurs, le séminaire d’anthropologie biologique et culturelle développe une meilleure compréhension des enjeux fondamentaux de cette discipline. Objectifs Par la présentation et la discussion de textes scientifiques historiques importants et de documents représentatifs de l’évolution de la pensée dans ce champ disciplinaire, ce séminaire propose de développer la capacité de réflexion et d’analyse des participant-e-s sur les thématiques-clés de l’anthropologie biologique et culturelle.

91

ARCHEOLOGIE ET HISTOIRE DE L'AFRIQUE 14B702 Séminaire obligatoire pour le bachelor ès Lettres mention Archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3

Jour jeudi 15h -17h

Lieu

Sciences II, salle 449

Mode d’évaluation présentation orale Responsables

Monsieur E. HUYSECOM - 022.379.6973/67 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs E. HUYSECOM (pas), J. AYMERIC (as), Mesdames M. TRUFFA GIACHET (as), M. LORENZO MARTINEZ (as)

Contenu Sujets en relation avec le cours n° 14B002. Objectifs Acquisition des outils nécessaires à la conduite d’une recherche personnelle et à la rédaction d’une monographie.

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ARCHEOLOGIE ET HISTOIRE DE L'AFRIQUE

14B002

Semestre


ECTS

6

Jour jeudi 10h15 - 13h

Lieu



exposé oral

Sessions d'examens janvier-février + rattrapage août-septembre Responsables


Enseignant(e)s Monsieur E. HUYSECOM (pas), et collaborateurs. Contenu Ce cours est une introduction générale à la géographie, à l'histoire et à la pratique de la recherche archéologique en Afrique. La première partie traite des interactions Homme - Nature, soit des mécanismes climatiques et des principales variations environnementales ayant affecté le continent africain depuis le Pléistocène, de l’impact du climat sur le peuplement humain, des interventions humaines au cours de l'histoire visant à modifier ou maîtriser l'environnement, ainsi que des types économiques actuels tirant parti de la variété des milieux naturels. La deuxième partie du cours est consacrée aux sources à disposition des chercheurs pour reconstituer le passé africain, à l’histoire de la découverte du continent africain par les Européens et à l’évolution du regard et des relations entre Africains et Occidentaux, de l’Antiquité classique à nos jours. Ce volet traite également de la question du pillage archéologique, du marché de l’art et de la protection du patrimoine culturel en Afrique. Objectifs Acquisition des connaissances élémentaires dans le domaine de l’Archéologie et de l’Histoire de l’Afrique.

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ARCHEOZOOLOGIE II - La domestication des animaux 14T010 Cours obligatoire - Master en archéologie préhistorique Semestre printemps 2h/sem, total 28h ECTS 3 Jour lundi 13h-15h

Lieu Muséum d’histoire naturelle, Malagnou

Mode d’évaluation examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Madame J. STUDER - 022 418.6361 - jacqueline.studer@ville-ge.ch

Enseignant(e)s Madame J. STUDER (cc) Monsieur J.-C. CASTEL (chargé rech)

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. N'A PAS LIEU EN 2018/2019.

Contenu Histoire des premiers élevages et présentation des processus qui ont permis à certains animaux de passer du statut de gibier à celui d'animaux domestiques.

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ARCHEOZOOLOGIE II : Etude d’un ensemble faunique préhistorique

14T900

Travaux pratiques II obligatoire - Master en archéologie préhistorique Semestre automne/printemps 40h/sem, total

40h ECTS 3 Jour une semaine à convenir

Lieu Muséum d’histoire naturelle, Malagnou

Mode d’évaluation participation active aux séances et remise d’un rapport

Pré-requis

avoir suivi avec succès les travaux pratiques I : ostéologie comparée

Responsable


Enseignant(e)s Mesdames J. STUDER (cc), P. CHIQUET (as), Monsieur J.-C. CASTEL (chargé rech)

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. N'A PAS LIEU EN 2018/2019.

Contenu Analyse d'un lot d'ossements provenant d'un site préhistorique (identifications, traces, mesures, rédaction).

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ARCHEOZOOLOGIE LA CHASSE 14T014 Semestre


ECTS

3

Jour

lundi de 13h00 – 15h00

Lieu

Museum d’Histoire Naturelle


Oral

Responsable


Enseignant(e)s

Madame J. STUDER (cc), Monsieur J.-C. CASTEL (chargé rech)

Divers A lieu tous les deux ans. A LIEU EN 2018/2019

Contenu Ce cours relate la chasse lorsque l'homme était encore chasseur-collecteur ou agriculteur-éleveur, avec la présentation des animaux chassés et les différentes stratégies développées.

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ARCHEOZOOLOGIE : OSTEOLOGIE COMPAREE 14T015 Travaux pratiques Semestre


ECTS

2

Jour

lundi de 15h00 – 17h00

Lieu

Museum d’Histoire Naturelle


Certificat

Responsable

Madame J. STUDER - 022 418.6361 jacqueline.studer@ville-ge.ch

Enseignante

Madame J. STUDER (cc).

Contenu Cet enseignement, de niveau bachelor, offre l'apprentissage des critères morphologiques permettant la détermination des espèces communes de la faune préhistorique. Divers

A lieu tous les deux ans.

A LIEU EN 2018/2019

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ASTRONOMIE GENERALE 10A001 Cours à choix de 2ème année

Semestre


ECTS

2

Jour mardi 17h45

Lieu


Mode d’évaluation Travail de recherche examen oral

Sessions d'examens janvier/février + rattrapage août-septembre

Responsable

Prof. C. CHARBONNEL - 022 379 5484 - [email protected]

Enseignante Prof. C. CHARBONNEL (pas) Contenu Dessine-moi une galaxie. De la Voie Lactée aux galaxies primordiales Objectifs L’Univers renferme quelques centaines de milliards de galaxies qui se différencient par leur morphologie, leur couleur, leur composition, leur activité, leur âge, leur environnement. La compréhension de leur formation et de leur évolution constitue l’un des grands enjeux de l’Astrophysique moderne. Ce cours nous emmènera à la découverte de la nature de ces objets complexes et variés, depuis la Voie Lactée jusqu’aux galaxies les plus lointaines. Après un rappel des connaissances de base dans le domaine, nous décrirons les techniques d’observation qui permettent de décortiquer les différents composants des galaxies et de comprendre les processus physiques qui gèrent leurs interactions et modifient leurs propriétés. Nous ferons le point sur les développements théoriques récents et visualiserons les simulations numériques qui permettent de lever le voile sur leur origine et leur distribution dans le tissu cosmique. Ce cours d’astrophysique générale s’adresse à un large public et ne requiert pas de connaissances préalables en astronomie. Il est dispensé par Corinne Charbonnel, Professeure au Département d’Astronomie de l’Université de Genève.

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BACTERIOLOGIE GENERALE 14B004 Semestre


ECTS

2

Jour lundi 15h15 - 17h sur 5 semaines vendredi 14h15 - 16h sur 4 semaines

Lieu

lundi, Sciences II, salle A300 vendredi, Sciences III, salle 1S059

Mode d’évaluation examen écrit d’une durée maximum de 2h (conjointement avec l’examen de microbiologie pour les étudiants en pharmacie)

Sessions d'examens janvier-février + rattrapage août-septembre pour les étudiants en biologie juin + rattrapage août-septembre pour les étudiants en pharmacie

Responsable

Monsieur Karl PERRON - 022.379.3127 – [email protected]

Enseignant Monsieur K. PERRON (ce). Divers Ce cours est obligatoire pour les étudiant(e)s du 3ème semestre en pharmacie, mais est aussi proposé aux étudiant(e)s en biologie et du MUSE. Le polycopié est disponible sur Chamilo. Contenu Quatre thèmes sont traités : 1. Connaissance des micro-organismes (principaux groupes de bactéries, nutrition, paramètres

physico-chimiques de la croissance, régulation du métabolisme, croissance, estimation de la croissance, bactéries sans paroi, symbiose).

2. Notions d'asepsie (méthodes de stérilisation, désinfectants), tests d'antibiose.

3. Analyses et contrôles microbiologiques (analyse de l'eau, des denrée alimentaires, contrôle microbiologique des produits pharmaceutiques, efficacité de la conservation antimicrobienne).

4. Productions industrielles (principales productions microbiennes, bactéries lactiques, fermentation alcoolique, bactéries acétiques).

Objectifs Acquérir les connaissances théoriques de bactériologie générale et les concepts de bactériologie liés aux tests microbiologiques préconisés par la pharmacopée. Comprendre et connaitre l’importance de la microbiologie dans les secteurs environnementaux, médicaux, humains, industriels.

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BACTERIOLOGIE GENERALE – travaux pratiques 14B904 Semestre


ECTS

6

Jours mardi et jeudi 13h15 - 17h / 2 séries (7 semaines)

Lieux

Sciences III, Topo salle A50A de 13h15 – 14h00, puis TP salle 0016 de 14h15 – 17h00

Mode d’évaluation questionnaires et rapport Responsable


Enseignant(e)s Monsieur K. PERRON (ce), Mesdames V. DUCRET (lab), E. SUBLET (lab).

Divers Ces travaux pratiques sont prioritairement destinés aux étudiant(e)s du 3ème semestre en pharmacie. Les biologistes ne sont admis que s’il y a de la place. Le polycopié est disponible sur Chamilo. Cours donné en français. Contenu Sécurité microbiologique, techniques de base en bactériologie (inoculations, colorations, observations), contamination, stérilisation, micro-organismes de l'environnement, estimation de la croissance, identification, analyse de l'eau, contrôles microbiologiques selon la pharmacopée, tests d'antibiose, détermination de CMI, désinfectants, efficacité de la conservation antimicrobienne, immunofluorescence, démonstration de bactériologie médicale, phagothérapie, expériences de génétique et moléculaire. Objectifs Savoir manipuler des microorganismes selon des normes de sécurité appropriées. Pourvoir déterminer un germe bactérien. Etre capable d’effectuer des contrôles microbiologiques préconisés par la pharmacopée.

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BES MESURES DE LA DIVERSITE 14E156 Semestre

printemps 5 jours total 28h

ECTS

3

Jour

mardi 14h15-18h Cours bloc, semaine 1 à 7 7 séances (dates 2019 à préciser, voir planning du master MUSE)

Lieu

Uni Carl Vogt salle CV004


Examen pratique sur ordinateur.

Pré-requis

Notions de base en écologie des communautés, pratique de base du logiciel R.

Responsable

Monsieur E. CASTELLA - 022.379.0485 - [email protected]

Enseignant Monsieur E. CASTELLA (mer).

Contenu Ce cours et les exercices associés abordent l'analyse de la diversité biologique et des notions associées à partir d'exemples concrets (jeux de données) et de procédures d'analyse. Il est destiné à fournir des outils de description et de mesure de la diversité des communautés vivantes. Le cours est construit sur un certain nombre de choix préalables : - C'est la diversité spécifique (diversité des espèces au sein d'assemblages) qui est abordée. - Le logiciel R est employé comme outil de base dans les analyses. Objectif - Acquérir la pratique de techniques d'exploration, de description et d'analyse de la diversité

d'assemblages d'espèces à différentes échelles spatiales (diversités alpha, beta, gamma) et en intégrant la notion de diversité fonctionnelle.

- Utiliser des informations relatives à la biologie et l'écologie des espèces afin de mener une analyse fonctionnelle de la diversité

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BIOCHIMIE III 13C908X Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre

automne 4h/jour sur 3 sem, total 60h

ECTS

3

Jours & lieu lundi au vendredi 13h30 - 17h30, salle 105A - Sciences II du 1er octobre au 19 octobre 2018 Sciences II, 1er étage, labo 104E

Mode d’évaluation rapports d'expériences - certifiés

Pré-requis Biochimie, 2ème année

Responsable

Monsieur Th. SOLDATI – 022.379.6496 - [email protected]

Enseignants Assistants du département de biochimie Divers L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire. Le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site Internet de Biologie et devra être remis au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor. IMPORTANT : Les protocoles de Travaux Pratiques sont disponibles au Secrétariat du Département de biochimie (Mme C. Heymans, Sciences II, bureau 347A, 3e étage) le vendredi avant le début des Travaux Pratiques. Objectifs Ces Travaux Peatiques mettent l’accent sur la découverte et l’application de techniques de base utilisées dans les laboratoires de biologie et biochimie. Contenu 1. Isolation de l’ADN génomique de Dictyostelium discoideum 2. Protéines membranaires I 3. Extraction des lipides et analyse CCM 4. Protéines membranaires II 5. Chromatographie d'affinité E-learning : https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C908X/ Documentation et bibliographie : Protocole de Travaux Pratiques (partiellement en anglais;; disponible sur Chamilo).

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BIOCHIMIE III 13C008A Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

*3 (en choix restreint) **4.5 (en choix libre)

Jours & lieux mardi 8h15 -10h Sciences II, salle A50A jeudi 8h15 - 9h Sciences II, salle 1S059

Mode d’évaluation écrit;; l'examen de janvier-février porte sur la partie de l'enseignement dispensée en automne

Pré-requis Biochimie II – automne (12C008A) et printemps (12C008P)

Sessions d'examens février + rattrapage août-septembre

Responsable


Enseignant(e)s Messieurs Th. SOLDATI (pas), M. KAKSONEN (po), A. ROUX (pas), B. WEHRLE- HALLER (pas), J. MONTOYA (ce), Madame M.-C. BLATTER (ce).

Divers Préparation pour le BSc en biochimie, le BSc en biologie et le MSc en sciences pharmaceutiques. Cours ex-cathedra. **Etudiants en chimie/biochimie: 9 ECTS, acquis lorsque la moyenne des examens d'automne (13C008A) et de printemps (13C008P) est égale ou supérieure à 4.0 * / ** Etudiants en biologie: 6 ECTS en choix restreint et 9 ECTS en choix libre, acquis lorsque la moyenne des examens d'automne et de printemps est égale ou supérieure à 4.0. Objectifs Ce cours met l'accent sur les processus dynamiques de motilité, morphogénèse, traffic intracellulaire, communication et signalisation cellulaire;; il présente les concepts fondamentaux (cours du mardi) et les techniques associées (cours du jeudi). Contenu - Cytosquelette - Adhésion et communication cellulaires - Transport cellulaire - Sécrétion - Endocytose - Techniques de biophysique et biologie cellulaire du cytosquelette, du transport cellulaire et de bioinformatique. E-learning : https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C008A/ Documentation et bibliographie : J. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer (2006). Biochemistry, 6e édition, W.H. Freeman, New-York. ISBN 10: 0-7167-8724-5: Alberts et al. (2007). Molecular Biology of the Cell, 5e edition, Garland Press: ISBN.10 0-8153-4106-7

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BIOCHIMIE III 13C008P Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

*3 (en choix restreint) **4.5 (en choix libre)

Jours & lieux mardi 8h15 -10h Sciences II, salle A50A jeudi 8h15 - 9h Sciences II, salle 1S059

Mode d’évaluation écrit;; l'examen de juin porte sur la partie de l'enseignement dispensée au printemps.

Pré-requis Biochimie III – automne (13C008A)

Sessions d'examens Juin + rattrapage août-septembre

Responsable


Enseignant(e)s Messieurs Th. SOLDATI (pas), M. BROCHET (past), M. GONZALEZ GAITAN (po), R. LOEWITH (po), J.-M. MATTER (mer), O. SCHAAD (ce), P. GUICHARD (past).

Divers Préparation pour le BSc en biochimie, le BSc en biologie et le MSc en sciences pharmaceutiques. Cours ex-cathedra;; les heures d'enseignement du Prof. R. Loewith seront dispensées en anglais. **Etudiants en chimie/biochimie: 9 ECTS, acquis lorsque la moyenne des examens d'automne (13C008A) et de printemps (13C008P) est égale ou supérieure à 4.0 */** Etudiants en biologie: 6 ECTS en choix restreint et 9 ECTS en choix libre, acquis lorsque la moyenne des examens d'automne et de printemps est égale ou supérieure à 4.0. Objectifs Ce cours met l'accent sur les processus dynamiques de motilité, morphogénèse, traffic intracellulaire, communication et signalisation cellulaire;; il présente les concepts fondamentaux (cours du mardi) et les techniques associées (cours du jeudi). Contenu - Communication cellulaire - Transduction du signal - Signalisation intracellulaire et intercellulaire - Techniques de biologie structurale et de communication cellulaire E-learning : https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C008P/ Documentation et bibliographie : J. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer (2006). Biochemistry, 6e édition, W.H. Freeman, New-York. ISBN 10: 0-7167-8724-5: Alberts et al. (2007). Molecular Biology of the Cell, 5e edition, Garland Press: ISBN.10 0-8153-4106-7

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BIODIVERSITE : origine et évolution 14B005 Chapitres choisis Cours obligatoire pour l’orientation de master « Biodiversité et systématique» Semestre

automne 3-6h/sem, total 28h

ECTS

3

Jours jeudi 14h15 - 17h, en novembre & décembre mercredi 14h15 - 17h en décembre

Lieu Sciences III, salle 0019


examen écrit, rapports

Sessions d'examen offertes


Responsables

Monsieur M. PERRET - 022.418.5195 – mathieu.perret@ville-ge.ch Monsieur J. MONTOYA BURGOS - 022.379.67.86 [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames A. CIBOIS (cr), Y. NACIRI (cc), A. SANCHEZ-MAZAS (po), Messieurs L. CAVIN (cons.), J. MONTOYA BURGOS (ce), M. PERRET (cons.), X. PERRET (mer), M. RUEDI (cons.).

Divers Inscription par e-mail auprès des responsables du cours. Ce cours peut être suivi quelle que soit l'option du master choisie. Ce cours n'a lieu que s'il y a au moins 3 étudiants inscrits. Objectifs Ce cours a pour but de former l'étudiant(e) de manière théorique et pratique aux divers thèmes de la biodiversité en tant que discipline des sciences biologiques. Il est orienté sur la compréhension des processus et mécanismes à l'origine de la diversité des organismes. Pour mieux appréhender les concepts théoriques, l'étudiant(e) apprendra à utiliser des outils bioinformatiques d'analyse au moyen d'exercices pratiques. Des présentations et discussions d'articles compléteront l'enseignement. Les capacités et compétences qui devront être acquises au terme de ce cours sont:

• Connaître les changements majeurs de biodiversité dans le temps géologique. • Expliquer les processus menant à la formation des espèces et à la diversification des

lignées. • Interpréter des données de répartition des espèces dans un cadre de biogéographie

historique. • Proposer des hypothèses pouvant expliquer l'histoire de la diversification d'un groupe

taxonomique au vu d'une série d'observations. • Identifier le type et la quantité de données nécessaires pour évaluer la vraisemblance

d'un processus de diversification ou de répartition spatiale. Identifier et utiliser la méthode d'analyse ou l'outil bioinformatique le plus approprié à un cas particulier. Contenu - Evolution de la biodiversité, vision paléontologique - Processus de spéciation, hybridation - Radiations évolutives, diversifications, évolution phénotypique - Phylogéographie, dynamique spatiale, refuges climatiques - Biogéographie historique, dispersion, vicariance - Mesure de biodiversité phylogénétique, hotspots de biodiversité - Biodiversité microbienne: coévolution, intégrité-identité génomique, métagénomique - Menaces, conservation de la biodiversité.

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BIOETHIQUE 13B003 Cours à choix de 2ème année / Cours à choix restreint de 3ème année Semestres


ECTS 6 Jours

jeudi 12h30 - 14h


Mode d’évaluation examen écrit


Responsables

Madame S. HURST – 022 379.4601 – [email protected] Madame C. CLAVIEN - 022 379.4609- [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames S. HURST (Prof as), C. CLAVIEN (mer), C. MORET (as), A. DALLE AVE (Cheffe de Clinique, Unil) Messieurs Ph. DUCOR (Prof as), S. ROMAGNOLI (chargé d’enseignement), G. HESS (mer, Unil), C. FOPPA (chargé d’enseignement), F. COVA (maître as)

Contenu Semestre automne • Origines de la bioéthique • Bases philosophiques • Objectivité morale • Éthique de la recherche sur l'être humain • Déontologie du chercheur • Expérimentation animale • Procréations médicalement assistées • Statut de l’embryon et de la personne • Génétique médicale • Thérapie cellulaire, cellules souches

Semestre printemps • Du naturel au moral • Impact des données scientifiques sur les moralistes • Altruisme biologique et psychologique • Explications évolutionnaires de nos facultés morales • Principe de précaution • Ethiques environnementales et éthique du développement durable • Tragédie des communs • Transplantation • Fin de vie • Biobanques et protections des données • Justice, médicaments et allocation des ressources • Propriété intellectuelle • Enhancement, neuroenhancement, dopage Objectifs Ce cours a pour objectif de développer une réflexion critique sur les implications éthiques de la recherche scientifique et des pratiques médicales. On y enseigne les outils conceptuels nécessaires pour

• aborder les questions de déontologie de la recherche en général et de la pratique médicale en particulier.

• traiter les problèmes éthiques engendrés par les progrès scientifiques. • évaluer l’impact des données scientifiques (notamment issues de la biologie

évolutionnaire et des neurosciences) pour une meilleure compréhension de la moralité humaine.

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BIOGEOGRAPHIE 14B007 Cours à choix de 2ème et 3ème années

Semestre


ECTS

3

Jour Mardi 12h15-14h



Pré-requis Notions de base en biologie.


Responsable

Monsieur M. PERRET – 022.7418.5195 – mathieu.perret@ville-ge.ch

Enseignant(e)s Monsieur M. PERRET (cc) Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève, 192 Chemin de l’Impératrice 1292 Chambésy

Contenu Facteurs abiotiques et biotiques déterminant la distribution des espèces. Stratégies et adaptations des plantes à leur environnements: type biologique, convergence, adaptation au stress et à la perturbation, mode de dispersion. Distribution des communautés: biomes, étages de végétation. Paléogéographie et paléoclimat de la terre au cours du Cénozoïque et son impact sur l’évolution de la végétation (origines des angiospermes, forêts tropicales, plantes C4, glaciation et refuges). Tectonique des plaques et échanges biotiques. Processus biogéographiques à l’origine de la biodiversité: vicariance, dispersion et extinction. Biogéographie historique: centre d’origine, méthodes phylogénétiques. Biogéographie des îles: relation espèces-aire, théorie de l’équilibre. Géographie de la biodiversité: le gradient de biodiversité latitudinal et ses causes. Conservation et conséquences des activités humaines sur la biodiversité (hotspot mondial de biodiversité, modifications climatiques, déforestation, eutrophisation, invasions). Divers Prière de s'inscrire au cours également par email : mathieu.perret@ville-ge.ch Ce cours est ouvert au public Objectifs Comprendre les causes de la distribution actuelle des organismes, en particulier des végétaux. Connaître les formes de la biodiversité terrestre et comprendre leur origine et déterminisme. Connaître les méthodes permettant de reconstruire l’histoire des lignées. Prévoir les conséquences sur la biosphère des changements globaux résultant des activités humaines.

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BIOLOGIE HUMAINE I Diversité biologique et moléculaire des populations humaines actuelles

13B004

Cours à choix restreint de 3ème année (1er semestre) Semestre


ECTS

3

Jour mercredi 10h15 - 12h00 Début du cours mercredi 19 septembre 2018.

Lieu Sciences II, salle 457

Mode d’évaluation examen écrit de 3h

Sessions d'examens février + rattrapage août-septembre

Responsable

Madame A. SANCHEZ-MAZAS - 022.379.6984/67 alicia.sanchez-[email protected]

Enseignant(e)s

Madame A. SANCHEZ-MAZAS (po), Monsieur T. GOEURY (as).

Divers Le cours de biologie humaine est structuré en deux parties;; l'une au semestre d'automne (13B004 Diversité biologique et moléculaire des populations humaines actuelles) et l'autre au semestre de printemps (13B005 Evolution du genre humain, des origines à nos jours). Le cours pris par les étudiant(e)s en biologie comme cours à choix restreint de 3ème année doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Chaque semestre peut également être choisi comme cours à choix libre comptant pour 3 ECTS. Contenu Caractéristiques du génome humain / Diversité des caractères moléculaires (polymorphismes génétiques) / Diversité des caractères morphologiques (stature, etc..), pigmentaires (couleurs de peau, etc..) et physiologiques (taux d’hémoglobine, etc..) / Tolérances ou intolérances à certains aliments et médicaments / Résistances ou susceptibilités à certaines maladies / Adaptations biologiques aux environnements (ensoleillement, altitude, etc) / Similarités et différences biologiques entre populations / Mécanismes évolutifs expliquant la diversité biologique humaine / Us et abus du profilage génétique. Aspects méthodologiques : modèles et tests d'hypothèses en génétique des populations / Introduction à la génétique quantitative / Modélisation en génétique évolutive. Objectifs Ce cours aborde la diversité biologique des humains actuels du point de vue des divers caractères phénotypiques et moléculaires qui la caractérisent ainsi que des mécanismes évolutifs qui l’ont façonnée. Chaque chapitre inclut une partie descriptive (état des connaissances), une partie méthodologique (modes actuels d’analyse des données) et une partie pratique (exercices, y compris sur ordinateur, appliquant les connaissances et les modes d’analyse sur des données réelles). Au terme de cet enseignement, l’étudiant-e aura ainsi acquis les bases nécessaires à la compréhension et à l’étude de cette discipline.

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BIOLOGIE HUMAINE II Evolution du genre humain, des origines à nos jours

13B005

Cours à choix restreint de 3ème année (2ème semestre) Semestre


ECTS

3

Jour mercredi 10h15 - 12h Début du cours mercredi 20 février 2019.

Lieu Sciences II, salle 457

Mode d’évaluation examen écrit de 3h


Responsable

Madame A. SANCHEZ-MAZAS-022.379.6984/67 alicia.sanchez-[email protected]

Enseignant(e)s Madame A. SANCHEZ-MAZAS (po), Messieurs N. HUBERT Van BLYENBURGH (cc), M. CURRAT (mer), T. GOEURY (as).

Divers

Le cours de biologie humaine est structuré en deux parties;; l'une au semestre d'automne (13B004 Diversité biologique et moléculaire des populations humaines actuelles) et l'autre au semestre de printemps (13B005 Evolution du genre humain, des origines à nos jours). Le cours pris par les étudiant(e)s en biologie comme cours à choix restreint de 3ème année doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Chaque semestre peut également être choisi comme cours à choix libre comptant pour 3 ECTS. Contenu Place de l’humain parmi les primates / Evolution biologique pré-humaine et humaine d’après les données de la paléontologie (étude des fossiles, avec séance de TP) / Evolution d’Homo sapiens et ses liens avec d’autres humains aujourd’hui disparus (Neandertal, Denisova, ..) d’après les données de l’ADN actuel et ancien / Histoire planétaire des peuplement des continents par les populations humaines anatomiquement modernes d’après des hypothèses basées sur l’étude de leurs traits biologiques (diversité phénotypique et moléculaire) et culturels (diversité linguistique, diversité des modes de vie déduits des vestiges archéologiques) et sur leurs adaptations à divers environnements / Discussion : que peut-on dire aujourd’hui sur la diversité et l’évolution humaines d’après les connaissances scientifiques ? Objectifs L’objectif de cet enseignement est de permettre à l’étudiant-e d’acquérir des connaissances fondamentales sur l’évolution de l’espèce humaine et l’histoire du peuplement des divers continents par les humains anatomiquement modernes, et de l’initier à quelques autres disciplines, non biologiques, qui s’intéressent aussi à ces questions. Ces thématiques sont abordées par une approche multi-disciplinaire confrontant les résultats des diverses disciplines de l’anthropologie biologique et culturelle. Au terme de cet enseignement, l’étudiant-e saura lire les articles et ouvrages spécialisés dans le domaine de manière éclairée, tout en sachant identifier les limites de chaque approche et les pièges de l’inter-disciplinarité.

109

BIOPHOTONIQUE 14P017 Semestre


ECTS

4

Jours cours mercredi 10h-12h, exercices mercredi 9h-10h

Lieu Sciences I, salle 306

Mode d’évaluation examen oral


Responsable

Monsieur L. BONACINA - 022.379.0508 – [email protected]

Enseignant

Monsieur L. BONACINA (mer).

Divers L’enseignement sera donné en français ou en anglais selon l’audience. Contenu La biophotonique traite des interactions entre la lumière et la matière biologique. Ce cours est ouvert aux étudiants de physique et de biologie qui ont un intérêt dans l'état de l'art de la photonique et ses applications aux sciences de la vie. Après une courte introduction de la physique moléculaire (mouvements électroniques, vibrationnels et rotationnels, l'approximation de Born-Oppenheimer, le principe Frank-Condon) la réponse optique des molécules à l'excitation optique dans différentes régions spectrales (ultraviolet, visible, infra-rouge, therahertz) seront discutés. Ces bases nous permettront d'aborder différentes techniques d'imagerie incluant la microscopie en champ clair, la microscopie confocale, la microscopie non linéaire, les techniques de super résolution (PALM, STED, etc.), l'imagerie vibrationnelle (Raman), la tomographie en cohérence optique, etc. Le cours parcourra ensuite le champ de la nano-photonique dans les sciences de la vie en décrivant des approches telles que les boites quantiques (quantum dots), les nanoparticules plasmoniques ainsi que leurs applications dans l'imagerie et la bio-détection. Dans la dernière partie, après une présentation approfondie des propriétés optiques des tissus (absorption, diffusion, propriétés de polarisation) une sélection de techniques optiques biomédicales sera discutée. Les travaux dirigés prendront la forme d'un "journal club" sur la littérature spécialisée. Ainsi, les présentations réalisées par les étudiants seront suivies d'une discussion critique. Objectifs Connaissance approfondie des techniques actuelles d’imagerie, détection et diagnostic optique. Développement des instruments pour la compréhension et la lecture critique des écrits scientifiques dans ces domaines.

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BOTANIQUE TROPICALE 14B016 Semestre

printemps 5jours, + 1 répétitoire facultatif, total 40h

ECTS

5

Jour Une semaine pleine, début juillet (la semaine qui suit les examens). En 2019 : du 1er au 5 juillet

Lieu Conservatoire et Jardin Botaniques

Mode d’évaluation examen écrit L'examen écrit porte pour 2/3 sur la partie systématique : les étudiants doivent reconnaître les familles tropicales enseignées sur la base d'images;; ils ont droit à une documentation sommaire (une feuille A4). Le 1/3 restant est une question à développer qui porte sur la partie végétation ou sur les conférences données dans le cadre du cours.

Pré-requis Systématique et Biodiversité de 2ème année ou équivalent

Sessions d'examens août-septembre + rattrapage janvier

Responsable

Monsieur L. GAUTIER - 022.418.5147 – laurent.gautier@ville-ge.ch

Enseignant(e)s Monsieur L. GAUTIER (cc) et collaborateur(trice)s.

Contenu Etude des familles de plantes tropicales les plus importantes avec effort principal sur l’identification dans le terrain. Présentation des principaux types de végétation de la zone intertropicale, illustrés par des conférences données par des spécialistes. Un travail pratique en botanique tropicale peut être effectué en complément, par le biais du cours « exploitation des collections botaniques (14B021) ». Objectifs Etre à même de déterminer les familles des plantes de la zone tropicale et de reconnaître les principaux types de végétation.

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BOTANIQUE SYSTEMATIQUE ET PHARMACEUTIQUE 14B015 Semestre


ECTS

4 (3 pour pharmaciens)

Jours & lieux lundi 10h15 - 12h Sciences II, salle A100 vendredi 8h15 - 10h Sciences III, salle 1S081 un vendredi sur deux



Responsable

Monsieur F. STAUFFER – 022.418.5100 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs F. STAUFFER (cc) ,P.-A. LOIZEAU (cc), à désigner (ass/etu).

Divers Ce cours est destiné aux étudiant(e)s en pharmacie et biologie. Contenu Les grandes étapes évolutives sont présentées comme cadre d'une systématique moderne. Une première partie s'attache à la morphologie de la fleur et des inflorescences avant de développer plus longuement la systématique des familles présentant un intérêt pharmaceutique par le nombre ou l’importance de leurs représentants fournissant la matière médicinale: plantes sources de médicaments et plantes médicinales. Les familles tropicales sont mentionnées, mais une place particulière est donnée aux plantes de notre région. Ouvrage de référence : SPICHIGER, R. & al. (2016) : Botanique systématique des plantes à fleurs (éd. 4). Ed. PPUR, Lausanne. Objectifs Donner les bases de la classification phylogénétique des végétaux et des plantes à fleurs. Comprendre la systématique de ces dernières et permettre la reconnaissance des grandes familles de plantes, notamment celles renfermant des plantes médicinales importantes. Savoir utiliser des clés de détermination afin d’être capable d’identifier des spécimens.

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BOTANIQUE SYSTEMATIQUE ET PHARMACEUTIQUE 14B915 Travaux pratiques / excursion Semestre

printemps 4h/sem, total 36h +2 excursions dont une d’une journée (8h)

ECTS

2

Jour vendredi 14h - 18h sur la deuxième moitié du semestre

Lieu Sciences III, salle TP 5050 Mode d’évaluation Attestation de présence et évaluation des rapports de travaux pratiques

Responsable

Monsieur F. STAUFFER – 022.418.5100 [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs F. STAUFFER (cc), P.-A. LOIZEAU (cc), à désigner (ass/etu).

Divers Ces travaux pratiques sont obligatoires pour les étudiant(e)s en pharmacie. Plus 2 excursions dont une d’une journée (8h). Objectifs Compléter les connaissances de botanique du cours par l'observation et l'analyse de plantes fraîches, par des exercices de détermination et par des excursions sur le terrain.

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CAMP DE GEOLOGIE 13T513 Stage terrain Semestre

printemps

ECTS

5 (3 ECTS pour les biologistes)

Jour 12 jours

Lieu Le stage a lieu alternativement dans le bassin de Sorbas (Sud Espagne), dans les Apennins et Elbe (Italie), et dans le bassin de Tremp-Graus (Nord Espagne). Contacter le responsable pour plus d’informations.

Mode d’évaluation rapport

Responsable

Monsieur S. CASTELLTORT – 022 379 6616 [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs S. CASTELLTORT (pas), K. KOUZMANOV (cc), A. MOSCARIELLO (po), L. CARICCHI (pas).

Contenu Le camp a lieu chaque année au semestre de printemps dans une zone d’intérêt géologique fondamental et appliqué, et qui est étudiée à travers les différentes disciplines abordées pendant les cours de Bachelor STE (ressources minérales, minéralogie, pétrologie, sédimentologie, stratigraphie, etc…), permettant aux participants d’avoir une vision globale sur les processus géologiques fondamentaux. Les lieux habituellement visités incluent la chaîne des Apennins (Italie), les Pyrénées (Espagne), la zone d’Almeria et le bassin de Sorbas (Espagne).

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CELL BIOLOGY JOURNAL CLUB 14B047 Seminar Period Autumn/Spring 1h/week, year 28h ECTS 3

Day Thursdays 9h

Place

Sciences III, room 2024

Evaluation mode presentation of a publication and questions for department members;; presentation of a publication with questions or oral exam for external students

Exam sessions June Person in charge

S. CITI - 022.379.6182 – [email protected]

Teachers S. CITI (pas), J.-C. MARTINOU (po), D. PICARD (po), F. STUTZ (po), P. GUICHARD (past).

Miscellaneous This course is intended for fourth-year Master students, graduate students and postdocs in the Cell Biology Department. Others interested please contact Prof. S. Citi. The course consists of presentations and discussion of publications by Master and graduate students, post-docs and other members of the department. The course is given in English. Contents Current subjects of the literature in cell biology. Objective The objective of the course is to develop and demonstrate the ability to read, understand, critically analyze and present journal articles published in the field of cell biology.

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CIVILISATIONS PREHISTORIQUES 14T003 Semestre

printemps total 40h

ECTS

4

Jour

N’A PAS LIEU EN 2018-2019

Lieu

à Uni Carl Vogt


Présentation orale

Sessions d'examens


Responsable

Madame M. BESSE - 022.379.6915 - [email protected]

Enseignante

Madame M. BESSE (pas)

Divers Enseignement à choix pour les étudiant-e-s intéressé-e-s par la démarche scientifique en archéologie. Objectif Cet enseignement de niveau bachelor vise à donner une introduction générale à l'étude de sites préhistoriques, des débuts de la fouille archéologique à sa publication. Ce cours s'inscrit dans les projets de recherche dirigés par la Professeure Marie Besse et ses collaborateurs autour de plusieurs fouilles archéologiques en cours (Albanie, Bulgarie, France, Italie, Suisse). Des visites de sites archéologiques sont également organisées.

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CLASSIQUES DE LA GENETIQUE MOLECULAIRE (LES) CLASSICAL PAPERS IN MOLECULAR GENETICS

14B020

Semestre


ECTS

5

Jour jeudi, horaire à préciser, 2h pleines entre 14 et 20 heures

Lieu

CMU, salle D02.1754


participation continue et exercices, ou examen oral


Répondant

Département de biologie moléculaire - 022.379.6197

Enseignant Monsieur D. BELIN (ph) – 079 664 43 46

Divers Ce cours est principalement destiné aux étudiant(e)s en biologie et en biochimie de master, aux étudiant(e)s du master de neurosciences et aux étudiant(e)s en médecine (options du bachelor). Le cours est donné en français, ou en anglais si les participants le désirent (étudiants Erasmus/ étrangers). The course “classical papers in molecular genetics” has been given in English in the last few years to allow Erasmus and foreign students to participate Inscription avant la rentrée de printemps: [email protected] Please send an email to register before the beginnin of the spring semester Un sondage Doodle sera organisé avant la rentrée pour choisir la tranche horaire qui convient au plus grand nombre. Contenu La relation gènes-enzymes L'ADN comme matériel génétique Origine des mutations Les mutants conditionnels Définition moléculaire du gène Le code génétique Mutations et suppresseurs Mutations conditionnelles : génomes et développement Régulations négative (opéron lactose) et positive (régulon arabinose) de l'expression des gènes. Les PDF des articles sont sur le site Chamilo du cours Objectifs Découvrir des articles classiques qui ont fondé la biologie moléculaire. Exercices liés au cours 1h/sem, total 14h

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CLIMAT ET CHANGEMENT CLIMATIQUES 14E150 Period Autumn 9h/week, year 28h ECTS 3

Day Tuesdays 9-14 weeks from 8:15 - 10:00 and 14:15 - 16:00

First course November 13, 2018 Wednesday 20 December from 8:15 am to 12 pm Uni Carl-Vogt, salle CV001

Pré-requis

good foundations in mathematics and physics are needed

Evaluation mode written examination - 2 hours, no material / books / documents available

Exam sessions June + August-September Person in charge

Catherine CORNUT - 022.379.0797 - [email protected]

Responsable

M. STOFFEL - 022.379.0689 – [email protected]

Teacher M. STOFFEL(po) Miscellaneous Good basic background in physics and mathematics, although the course is in principal accessible to non-specialists. This course is given in English only Contents The course will cover the following topics : • Governing mechanisms of the climate system • Natural causes of climatic change, including internal modes of variability (e.g., El Niño) • Anthropogenic causes of climatic change: the enhanced greenhouse effect. • Paleoclimate: indicators of natural climate variability • Observed climate, from the global to the regional scales • Introduction to climate models: functioning, possibilities and limits • Climate projections into the future as a function of greenhouse gas emissions • Problems of regional climate predictions and solutions

Objective This course will enter into one of the major environmental topics of the 21st century. Issues of climatic change will be addressed through a survey of natural climate variability and global warming resulting from the enhanced greenhouse effect. Different types of models capable of simulating the evolution of the climate system at various spatial and time scales will be introduced.

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COGNITION COMPARÉE: AUX ORIGINES DE L'ESPRIT 7414D Cours dispensé par la Faculté de psychologie et des sciences de l'éducation Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestre


ECTS

3

Jour

mercredi 8h15-9h45

Lieu

Uni Mail, salle R150 (sous réserve : voir site du cours, indiqué ci-dessous)


examen oral


Responsable

Monsieur R. MAURER - 022.379.9120 - [email protected]

Enseignant Monsieur R. MAURER (mer).

Divers La page web http://ethologie.unige.ch donne accès aux ressources du cours et aux informations pratiques. Contenu Le cours explorera les similitudes et différences entre la cognition des êtres humains et celle des autres animaux. Pour cela, une première partie du cours résumera l'évolution des cerveaux depuis les débuts de l'évolution jusqu'à nos jours. La seconde partie du cours montrera, au travers de compétences de base en orientation spatiale, l'analogie de traitement qui existe même entre arthropodes (notamment insectes hyménoptères) et vertébrés (dont l'être humain);; chez les uns et les autres, le traitement du mouvement propre, lors des trajets d'exploration, est un élément crucial de la construction des représentations spatiales, comme il l'était chez les marins lors de la navigation à l'estime. La troisième partie du cours, la plus importante, mettra l'accent sur la comparaison entre l'être humain et les primates non humains (avec des incursions chez les corvidés, les cétacés, et aussi les chiens), que ce soit en ce qui concerne la compréhension du monde physique (théorie de la causalité physique), la compréhension du monde social (théorie de l'esprit), ou bien même la conscience, considérée comme un phénomène biologique. L'évolution des hominidés et de leurs compétences, telles que l'on peut se les représenter, sera également abordée dans le même chapitre. Objectif Pouvoir situer le traitement de l'information chez l'humain dans la continuité de ce qu'il est chez l'animal. Mieux comprendre les mécanismes cognitifs humains à la lumière de ce qu'ils sont chez l'animal.

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COMMUNICATION SCIENTIFIQUE ET MEDICALE : acteurs et moyens

10S010

Cours obligatoire ou à choix selon la filière, pour la Biologie et pour le bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3

Jour mardi 8h15 - 10h

Lieu

Uni Mail, salle 3220


examen oral

Pré-requis

2ème année universitaire

Responsable

Madame B. PELLEGRINI - 079.201.83.50 Beatrice.pellegrini@ville-ge.ch

Enseignant(e)s Madame B. PELLEGRINI (cc).

Contenu L’objectif du cours est de familiariser les étudiants aux enjeux et à la pratique de la communication scientifique et médicale. L’essentiel du cours sera basé sur une description concrète des interactions qui lient - ou séparent - les différents acteurs de la communication scientifique, les trois principaux étant : les chercheurs, le médiateurs et les publics. Les canaux de diffusion de la communication scientifique seront ensuite détaillés : l’écrit, le parler, l’image, ainsi que des combinaisons de ces trois moyens (médias, musées, Internet, méthodes participatives, événementiels, etc.). Enfin, nous choisirons des thèmes qui ont été traités par différents canaux pour comparer les approches et les influences des acteurs. Objectif Le but de ce cours est de favoriser soit une entrée sur un terrain d’étude (futurs chercheurs dans ce domaine), soit une entrée dans le monde professionnel de la communication scientifique.

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COMPRENDRE LA COMPLEXITE ET LA DIVERSITE BIOLOGIQUES 14B024 Cours à choix restreint 3ème année Semestre


ECTS

3

Jour

mardi 18h15 - 20h

Lieu



Examen oral


Responsable

Monsieur M. MILINKOVITCH - 022.379.33 38 [email protected]

Enseignant Monsieur M. MILINKOVITCH (po)

Divers S’annoncer par email au responsable est demandé, indépendamment de l’inscription officielle. Le cours est ouvert aux 3èmes années en biochimie, ou en physique comme cours à choix, et pour les étudiants de master et étudiants diplômés. Contenu La cellule, l’embryon en développement, le cerveau, les colonies d’organismes, et les écosystèmes sont quelques exemples de « systèmes complexes adaptatifs » : ils comportent de nombreux éléments qui interagissent de manière non-linéaire et ils ont la capacité de calculer et d’apprendre. Nous discuterons les concepts majeurs responsables de l’émergence de l’ordre, de la complexité et de la diversité dans les systèmes biologiques : théorie de l’information, mécanique statistique, thermodynamique, paysages adaptatifs, algorithmes génétiques, auto-organisation, intelligence distribuée, modularité, etc. Nous discuterons aussi des outils utilisés pour étudier ces concepts : modélisation mathématique, simulations numériques, vie artificielle, etc Objectif Faire prendre conscience aux étudiants de l’importance centrale des processus auto-organisationnels dans l’émergence de la complexité et de la diversité du vivant.

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COMPUTER SKILLS FOR BIOLOGICAL RESEARCH : an introduction to GNU/Linux and bash scripting

14B672

Compulsory cours for the option « BioInformatics and Data Analysis in Biology» of the master Period Autumn

30h/week, year 30h

ECTS 4

Day August 28, 29, 30, September 2, 3 2018

Place

Anthropology Unit, Sciences II, room 4-419, 30 quai Ernest Ansermet, 1205 Genève

Evoluatin mode Written report + oral examination on the basis of the exercises. Persons in charge

M. CURRAT (mer) - 022.379.69.79/67, [email protected] J.M. NUNES (ce) – 022.379.36.83/ 67, [email protected]

Teachers M. CURRAT (mer), J.M. NUNES (ce), T. GOEURY (as), M. MOUTERDE (as) J. RIO (as).

Miscellaneous This course is given in english. The number of places is limited (max. 20, priority is given to master and PhD students) This course is part of the CUSO Inter-University doctoral program in Ecology and Evolution. Please register by sending an e-mail to: [email protected] Contents This course intends to present useful computer tools and techniques for young researchers in biology that substantially extend basic computer knowledge acquired at undergraduate levels. The course concentrates on GNU/Linux environment and tools because it is powerful, free and easy to install in any kind of computer. Moreover, most of the computer clusters available for scientists run Linux.

The course is intended for beginners and for more advanced people, its level of complexity increasing through the four days. Basic knowledge in computing and programming is a plus but is not mandatory. The first part of the course will consist in learning the basic of GNU/Linux: installation of the environment, useful shell commands to work with text files, simple command lines and the use of regular expressions, pipes, and short scripts. The second part will consist in developing more complex scripts, as well as exercises using a computer cluster.

The training will provide a minimal theoretical basis in each of the topics listed below and concentrate on practical aspects through numerous applications. It will confer a working autonomy to solve problems while handling data and conducting data analyses pertinent to the researcher in biology.

Topics: 1.GNU/Linux workstation, shell and command line utilities 2. Programming in the shell 3. Regular expressions 4. Working with computer clusters Objective Upon conclusion of the course the attendees are expected to be able to: - use comfortably GNU/Linux workstations environments - work with shells and write shell scripts, - manipulate data files and perform file format conversions, - be able to read and write simple regular expressions, - use GNU/Linux computer clusters.

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CURRENT TOPICS IN CHEMICAL BIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

14CB01

Compulsory lecture and article discussion course for the master in Chemical Biology Period Autumn 6h/week, year

84h ECTS 8

Day & place Monday 13:15 -15:00 – Sciences II, salle 352

Wednesday 13:15 - 15:00 - Sciences II, salle 174

Evaluation mode Oral exam in Geneva. Grades will be assessed based on the quality of the oral paper presentations as well as the discussion related to the papers.

Coordinator Ph. SIMITSEK – 022 379 64 07 - [email protected] Persons in charge

R. LOEWITH – 022 379 61 16 - [email protected] M. GONZALEZ GAITAN - 022 379 6461 - [email protected]

Teachers Experts in Chemical Biology and Biochemistry from the Lemanic area Contents - Biochemistry of biological membranes - Membrane biogenesis and composition - Small molecule and other library screening approaches - Quantitative mass spectrometry - Quantitative and Physical Cell Biology - Chemical Probes and tags - Super resolution microscopy The courses are given in English E-Learning: https://chamilo.unige.ch/home/courses/14CB01 Objective In this lecture and article discussion course, lecturers will share with students the cutting edge ideas and technologies being developed in the fields of Chemical Biology and Biochemistry.

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DATA MINING FOR PROTEIN FUNCTION PREDICTION 14F016 Training course + practical work Period Spring ECTS 5

Day/place

Please contact [email protected]

Evaluation mode Written exam The students will write a report detailing what they did in terms of analysis tools and resources mined, and summarizing their findings on their assigned protein. Due date of the report: end of May.

Person in charge

A. BAIROCH - 022.379.5860 – [email protected] L. LANE – 022.379.58.41 - [email protected]

Teachers A. BAIROCH (po), L. LANE (suppl. collab. Sc.)

Contents - Use of a wide palette of sequence analysis tools to predict sequence features as well as secondary and 3D structure elements. - Use of data mining predictive tools (co-expression analysis, STRING, etc). - Extraction of information from repositories (micro-array, proteomics, protein/protein interaction, etc). - As we will select proteins that are conserved more or less deeply in evolution, it will also be useful to look up different model organism databases (MODs) to find information pertinent to the orthologs or paralogs of these proteins. Objective The students will be each assigned a human protein sequence entry from neXtProt with no functional characterization and no trivial way to predict its function from its sequence. The goal of the assignment is to use both sequence analysis tools and on-line resources to predict and extract as much clues as possible that could help unravel the function of these proteins.

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ECO-ETHOLOGIE : EVOLUTION PHYLOGENETIQUE DES COMPORTEMENTS

74144

Cours dispensé par la Faculté de psychologie et des sciences de l'éducation Semestre


ECTS

3

Jour

mercredi 8h15 - 9h45

Lieu

Uni Dufour, U600 (sous réserve: voir site du cours, indiqué ci-dessous)


examen oral

Sessions d'examens

janvier + rattrapage août-septembre (et juin si le règlement d'études de l'étudiant le permet)

Responsable

Monsieur R. MAURER - 022.379.9120 - [email protected]

Enseignant Monsieur R. MAURER (mer).

Divers La page web http://ethologie.unige.ch donne accès aux ressources du cours et aux informations pratiques. Contenu D'où viennent nos comportements ? Sont-ils uniquement dus aux influences socioculturelles à l'œuvre durant le développement de l'individu ? Ou sont-ils aussi colorés par la biologie de l'être humain ? Le cours apporte en réponse des éléments généraux de biologie du comportement (animal et humain), mais son accent principal porte sur l'éco-éthologie (étude de l'influence du milieu, en particulier du milieu social, sur l'évolution du comportement). Il y sera question de sélection naturelle, de sélection sexuelle (pourquoi certains oiseaux ont-ils des comportements de cour si complexes ? et quel lien avec certaines préférences des humains lorsqu'il s'agit de trouver un partenaire?), de stratégies reproductrices (certains singes pratiquent l'infanticide: est-ce une pathologie? et quel lien avec la maltraitance dans nos sociétés?), d'égoïsme et d'altruisme… On y verra donc quels sont les mécanismes qui ont agi sur les comportements lors de l'évolution (darwinienne) des espèces, mécanismes dont les effets persistent à ce jour, même chez l'être humain. La compréhension de ces mécanismes chez l'animal nous donnera au passage les clés nécessaires pour aborder, chez l'humain, les mécanismes qui sont l'objet d'étude de la psychologie évolutionniste. Objectif Comprendre d'où viennent les comportements et les cerveaux qui les permettent. Maîtriser suffisamment les concepts de base de l'évolution biologique pour comprendre la raison d'être de certains comportements chez l'animal et l'humain.

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ECOLOGIE I 13B007A Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

3 (3ème année bachelor en biologie)

Jour & lieu

lundi 8h15 – 10h / Sciences III, salle 1S059


examen écrit

Sessions d'examens Janvier-février + rattrapage août-septembre

Responsable

Monsieur B. IBELINGS –022.379.0313 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs B. IBELINGS (po), E. CASTELLA (mer), A. LEHMANN (pas), P. VENAIL (ma)

Divers Etudiants en biologie. Egalement pour les étudiants en sciences de la Terre et de l’environnement bachelor 3e année. Le cours pris par les étudiants en biologie comme cours à choix restreint de 3ème année, doit être suivi dans son intégralité (semestre d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Contenu Introduction - Qu’est-ce que l’écologie ? (écologie = écologisme) - Concepts clés: niche, habitat, écosystème etc.

Conditions et ressources - Disponibilité des ressources - Compétition - Espace géographique, distribution des espèces

Individus, populations, communautés et écosystèmes - Naissance et mort, reproduction - Compétition interspécifique - Prédation, broutage et parasitisme - Dynamique des populations - Succession - Réseau trophique - Biodiversité (gènes, espèces, traits, écosystèmes)

Questions appliquées en écologie - Développement durable - Transitions critiques - Pertes de diversité - Changements globaux - Dégradation des habitats - Services écosystémiques - Conservation de la nature Objectif Le but de ce cours est l’enseignement des bases théoriques de l’écologie.

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ECOLOGIE II 13B007P Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

3 (3ème année bachelor en biologie)

Jour & lieu lundi 8h15 – 10h Sciences III, salle 1S059



Responsable

Monsieur B. IBELINGS –022.379.0313 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs B. IBELINGS (po), E. CASTELLA (mer), A. LEHMANN (pas), P.VENAIL (ma)

Divers Le cours pris par les étudiants en biologie comme cours à choix restreint de 3ème année, doit être suivi dans son intégralité (semestre d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps. Contenu Conditions, ressources et les communautés du monde

- Biomes terrestres - Environnements aquatiques

Naissance, mort et mouvement - Cycles de vie - Compétition intraspécifique - Migration et dispersions - Connectivité dans la nature

Compétition interspécifique - Principe d`exclusion compétitive - Coexistence - Niche fondamental vs réalisée - Lotka Volterra - Structure spatiale

Prédation - Consommateurs - Symbiose - Prédateurs, brouteurs, parasites - Largeur du régime alimentaire - Cycles prédateurs - proies - Metapopulations

Objectif Le but de ce cours est l’enseignement des bases théoriques de l’écologie, avancé par rapport à Ecologie 1

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ECOLOGIE 13B907 Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre

Printemps 3 semaines 4h/sem, total 60h

ECTS

3

Jour

11 mars au 29 mars 2019

Lieu Sciences III, salle 0059 et Atelier informatique Bâtiment Carl Vogt, 66 Blvd Carl Vogt, Genève


Présentations orales durant les TP et/ou rapport de stage écrit

Pré-requis

Suivre le cours d’écologie (13B007)

Responsable

Monsieur B. IBELINGS - 022 379 0313 [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs B. IBELINGS (po), A. LEHMANN (pa), E. CASTELLA (mer), D. McCRAE (att rec), P. VENAIL (ma), P. MARLE (ass), Madame E. HONECK (ma)

Divers L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire. Le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site internet de Biologie et devra être remis au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor. Contenu Chacune des trois semaines correspond à une thématique différente, permettant de prolonger par la pratique certains aspects développés dans le cours: Thème 1 (responsable P : Venail) : Evolution et diversité biologique. Ce thème comporte trois activités. 1) Radiation adaptative, 2) Mesures de biodiversité et applications en conservation, 3) La sélection naturelle, les ingrédients nécessaires. En 1) nous explorerons la capacité de l'évolution à engendrer de la diversité biologique à partir d'un point de départ homogène. L'évolution en action devant vos yeux! Des expériences d'évolution expérimentale seront menées à partir de la bactérie Pseudomonas fluorescens. Ces expériences permettent de visualiser le rôle de concepts clefs (niche, exclusion compétitive, hétérogénéité environnementale) dans le maintien de la diversité. Elles permettent également d'enseigner aux étudiants les bases d'études microbiologiques. En 2) les étudiants calculeront des indices de diversité basés sur des communautés virtuelles. En 3) nous explorerons les ingrédients nécessaires pour l’évolution par sélection naturelle. Thème 2 (responsables A. Lehmann) : L'écologie et la modélisation sur ordinateurs Nous nous pencherons sur l'analyse spatiale des données écologiques qui permet d'appréhender sous forme de cartes les grands enjeux de l'écologie. Nous explorons la source et les enjeux autour des données biotiques et abiotiques à différentes échelles, puis comment nous pouvons modéliser la distribution potentielle des espèces, pour enfin informer les décideurs sur les meilleurs sites à mettre en protection pour préserver la biodiversité. Thème 3 (responsable E. Castella) : Des relevés de terrain à l'évaluation écologique Ce thème sert à illustrer la diversité des mesures de diversité en écologie: richesse, indice de diversité, diversité fonctionnelle. Les communautés d’invertébrés aquatiques de deux stations appartenant à deux cours d’eau du bassin genevois sont utilisées comme exemples. Quelques techniques d’analyse de données appliquées à l'écologie sont également introduites.

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ECOLOGIE MOLECULAIRE MICROBIENNE 14B026 Chapitres choisis Semestre

printemps Nbre d’heures par année 40h

ECTS

4

Jour 5 jours à fixer

Lieu

Centre de Biologie Alpine de Piora


rapport de stage

Responsable

Monsieur M. TONOLLA - 058 666 62 69 [email protected] et [email protected] Ecologie microbienne, Unité de microbiologie, Dép. Biologie végétale, Université de Genève, 30 Quai Ernest-Ansermet, 1211 Genève 4, Suisse, et Laboratory of applied microbiology, University of Applied Sciences Southern Switzerland (SUPSI), Via Mirasole 22A, 6500 Bellinzona

Enseignant(e)s A. BRUDER (coll.), M. TONOLLA (cc)

Divers Le cours sera donné par des experts d’universités Suisses et internationales. Inscription auprès du secrétariat des étudiants de la faculté des sciences Contenu Les progrès récents des connaissances et techniques en biologie moléculaire permettent actuellement d’étudier les communautés et les réseaux trophiques d’une manière détaillée sans précédent. Cela donne l’opportunité de mieux comprendre les effets des changements environnementaux sur les écosystèmes des cours d’eaux alpins. Ce programme couvre l’écologie des microorganismes et des invertébrées des divers types de petits cours d’eaux alpins. Des exemples des effets de changements environnementaux sur ces communautés et écosystèmes seront utilisé comme études de cas. Objectif Le programme apporte une connaissance de base théorétique et pratique pour étudier, interpréter et comprendre les communautés principales des algues, champignons et invertébrés et leurs rôles fonctionnels dans les écosystèmes des cours d’eaux alpins.

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ECOSYSTEMS SERVICES : A NEW TOOL FOR SUSTAINABLE DEVELOPMENT

14E187

Semestre

Autumn 2h/week, year 28h

ECTS

3

Day

Thursday 14h15 – 16h

Place

Sciences II, room 457

Evaluation mode

Many small quizzes, works, presentations.

Person in charge

M. SCHLAEPFER – 022 379 0801 – [email protected]

Teachers A. LEHMANN (pas), M. SCHLAEPFER (cc), J. FALL (po)

Contents Ecosystem Services: a tool for sustainable development is a Master-level course open to all students of the University of Geneva. Ecosystem services are a way of thinking about - and evaluating - the goods and services provided by nature that contribute to the well-being of humans. Examples include marketable goods such as timber and fish, as well as non-market services like the natural purification of water by wetlands, the inherent value of species, and cultural value of traditional landscapes. In the last decade there has been a surge of interest in managing natural resources according to what is now called the ecosystem services approach. Two significant benefits of this approach include the ability to formally integrate non-market values into cost-benefit analyses, and to predict how services will be affected under future management. Numerous organizations and governments (including Switzerland's) are exploring this approach as a way to reduce negative externalities and promote intra- and intergenerational fairness. This course seeks to provide an introduction of the ecosystem services method through a mixture of theory and applied case-studies. Objective Students who diligently read assigned articles, complete assignments, and participate in laboratory exercises will be able to: 1. Put into practice the ecosystem services approach, including the ability to identify and value the ecosystem services associated with a given perimeter;; 2. Appreciate the socio-historic context from which this method emerged, as well as the strengths and limitations of the method;; 3. Analyse and translate information pertaining to ecosystem services into a Geographical Information System (GIS) platform;; and 4. Identify situations in which the ecosystem services method is likely to provide added-value to current management approaches.

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ELEMENTS D’ENDOCRINOLOGIE MOLECULAIRE 14C003 Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

6

Jour

jeudi 12h30 - 14h

Lieu

Sciences III, salle 1S081


examen oral

Niveau cours à option pour biochimistes de 3ème année et de master cours à choix restreint pour biologistes de 3ème année et de master cours à option pour médecins de 2ème et 3ème années


Responsables

M. Michel ROSSIER - 027.603.48.20 – [email protected] (Fac. Sciences) Mme Ariane DE AGOSTINI – 022.372.49.10 [email protected] (Fac. Médecine)

Enseignant(e)s Mesdames Ariane DE AGOSTINI (pd), Valérie SCHWITZGEBEL (pas), Laurence BAYER (ma), Charna DIBNER (ma), Marie COHEN (pas),

Messieurs Michel ROSSIER (pd), Serge NEF (pas), Serge FERRARI (pas), Michelangelo FOTI (pas), Serge RUDAZ (pas), Bernhard WEHRLE-HALLER (pas)

Contenu Les chapitres suivants sont traités dans le cours: - Les bases générales de l’endocrinologie et de l’hormonologie - Les récepteurs hormonaux et la signalisation intracellulaire - La structure et la biosynthèse des hormones stéroïdes et peptidiques - Le contrôle hormonal de la reproduction et la différentiation sexuelle - La fonction thyroïdienne - Les surrénales et l’homéostasie de l’eau et des électrolytes - Le contrôle hormonal du métabolisme phosphocalcique - Le contrôle hormonal du métabolisme du glucose et des lipides - Les tumeurs endocriniennes - Les perturbateurs endocriniens - La chronobiologie des hormones et le comportement - Le contrôle du dopage

Documentation and bibliography: Syllabus. E-learning : https://chamilo.unige.ch/ Objectif Ce cours traite de la biochimie des hormones, de leur biosynthèse, de leur métabolisme, de leur régulation et de leur mode d’action au niveau des récepteurs et des messagers intracellulaires. Si l’accent est mis sur les aspects biochimiques et moléculaires de l’action des hormones, ce cours traite également des aspects généraux de l’endocrinologie et des techniques couramment utilisées en hormonologie. Les divers systèmes endocriniens sont présentés systématiquement, et différents contextes physiologiques et physiopathologiques sont discutés. Par exemple, les conséquences de certaines mutations génétiques responsables de pathologies endocriniennes sont traitées et les phénotypes associés chez l’homme ou l’animal sont discutés.

131

ELEMENTS OF BIOINFORMATICS 14F001 Compulsory course for the option « Bioinformatics and Data Analysis in Biology» of the master Period Autumn 3h/week, + 1h exercises,

year 24h ECTS 5

Day Monday 8:15 – 12:00

Place

CMU – room > please see the website to get information: https://chamilo.unige.ch/home/courses/14F001/

Evaluation mode Oral exam

Exam sessions January-February, June + August-September Persons in charge

A. BAIROCH - 022.379.5860 – [email protected] M.-C. BLATTER - 022.379.4931 - marie-[email protected]

Teachers M.-C. BLATTER (coll. scientifique), A. BAIROCH (po), and collab.

Miscellaneous Course given in English. The purpose of this course is to give an overview of the principal bioinformatic tools and databases which are used in genomics, transcriptomics and proteomics. A special emphasis will be given to biological databases and in silico protein sequence analysis (theory and practical work). Contents Biological databases. Introduction to genomics and transcriptomics. Gene prediction. Protein primary sequence analysis. Domain detection: patterns and profiles. Post-translational modifications: description and prediction. Similarity searches (pairwise alignment, BLAST). Multiple sequence alignments. Introduction to 3D structure analysis. Introduction to system biology.

132

ELEMENTS OF PROTEOMICS AND METABOLOMICS : Translation to human diseases

14F012

Period


ECTS 3

Day

Thursday 14:15 – 16:00

Place

CMU – room E09.2753.a

Evaluation mode

Oral exam

Exam sessions January-February + catching August-September Persons in charge

J.-C. SANCHEZ - 022.379.5486 – Jean-[email protected] S. RUDAZ – 022.379.6572 – [email protected]

Teachers J.-C. SANCHEZ (pas), S. RUDAZ (pas) and collaborators. Miscellaneous Course given in English. The purpose of this course is to give an overview of the principal tools, which are used in proteomics and metabolomics. A special emphasis will be given to methods to discover new disease biomarkers as well as applications of proteomics and metabolomics to unravel multifactorial diseases. Contents Electrophoretic separation (SDS-PAGE, IEF, 2-DE, CE) Chromatographic separation coupled to mass spectrometry (MS) MS-based detection and quantitation methods MS profiling and identification methods Statistics and bioinformatics Different diseases will exemplified the analytical strategy (Diabetes, Neurodegenerative Diseases, Stroke).

133

ETHNOARCHEOLOGIE 14B028 Cours obligatoire pour le master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

3

Jour

lundi 10h – 12h

Lieu



examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Madame A. MAYOR – 022 379 69 49 – [email protected]

Enseignante Madame A. MAYOR (mer).

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS.

N’A PAS LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018

Contenu L’ethnoarchéologie est une stratégie expérimentale de compréhension des faits archéologiques qui repose sur l’analyse de ces faits dans des cultures vivantes et qui permet, grâce au concept d’analogie comportementale, de résoudre certains problèmes d’interprétation. Ce cours comprend une première partie théorique présentant un historique du comparatisme ethnographique et l'évolution de la démarche interprétative en archéologie, les mécanismes de l'interprétation et l'opposition entre scénarios, mécanismes et régularités permettant d’articuler l’approche du général et du particulier. La seconde partie présente des études de cas illustrant la méthode, tels que l'interprétation de la métallurgie du fer, des habitats palafittiques, de la céramique tournée ou de l'art rupestre. La dernière partie détaille à titre d'exemple les recherches de l'équipe africaniste du Laboratoire Archéologie et Peuplement de l’Afrique (APA) sur les relations entre traditions céramiques et identités au Mali. Objectif L’objectif du cours vise à familiariser les étudiants à la démarche ethnoarchéologique et à la question de l’interprétation en archéologie, à l’aide de présentations théoriques et méthodologiques et d’illustrations à l’aide d’études exemplaires dans le domaine.

134

ETHNOARCHEOLOGIE - séminaire 14B728 Séminaire obligatoire pour le master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

3

Jour

lundi 12h00 – 13h00 + 1h consacrée à du travail personnel

Lieu


Responsable


Enseignant(e)s Madame A. MAYOR (mer) Monsieur Th. PELMOINE (as)

A LIEU TOUS LES DEUX ANS.

N’A PAS LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018

Contenu Les sujets traités sont en relation avec le cours n°14B028. Objectif L’objectif est de mettre en pratique les bases méthodologiques présentées au cours par l’étude d’objets, de documentation de terrain ou de données bibliographiques. Les thèmes proposés varient d’une année à l’autre.

135

ETHNOLOGIE 14B029 Semestre


ECTS

3

Jour

lundi 10h15 – 12h

Lieu



examen oral


Responsable


Enseignant(e)s Madame A. MAYOR (mer), Monsieur N. HUBERT Van BLYENBURGH (cc), et Madame Elizabeth REICHEL (coll. Ext.).

Divers Ce cours est principalement destiné aux étudiants en bachelor de biologie, d'archéologie préhistorique et de Lettres, et ouvert aux étudiants d’autres facultés.

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. A LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018

Contenu Cet enseignement constitue une introduction à l'anthropologie culturelle. Il présente les divers modes de subsistance et organisation socio-politique des sociétés humaines, puis introduit les courants généraux de l’anthropologie culturelle, l’histoire de leur élaboration, ainsi que ses principaux acteurs et domaines d’étude. Il propose une analyse critique de concepts tels que la race et l’ethnie et développe la relation entre cultures matérielles et identités. Il introduit enfin l’enquête de terrain, qu’il illustre à l’aide de plusieurs exemples concrets. Objectif L’objectif du cours est d’offrir aux étudiants de tous horizons une initiation aux concepts, aux courants de pensée et aux grands domaines de l’ethnologie.

136

ETHNOLOGIE - séminaire 14B729 Bachelor Lettres orientation archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3


travail personnel

Responsable


Enseignant(e)s Madame A. MAYOR (mer), et collaborateurs.

Divers Contacter la responsable pour définir un sujet.


Contenu Travail personnel sur un sujet en relation avec le cours. Objectif L’objectif du séminaire est d’offrir la possibilité aux étudiants d’approfondir un sujet choisi en accord avec les enseignants par un travail personnel.

137

EVOLUTION HUMAINE : histoire des représentations scientifiques des origines et de la diversité des humains

14B030

Cours à choix de 2ème et 3ème année Semestre


ECTS

3

Jour

vendredi 10h15 -12h

Lieu


Mode d’évaluation examen oral, répondre de manière structurée et synthétique à une question d’ordre général portant sur des aspects conceptuels fondamentaux de l’ensemble du cours.

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur N. HUBERT Van BLYENBURGH - 022.379.6978 [email protected]

Enseignant

Monsieur N. HUBERT Van BLYENBURGH (cc).

Divers Ce cours ne nécessite pas de niveau préalable en biologie ou mathématiques. Il est ouvert au public. Contenu Cet enseignement propose un parcours à travers l’histoire de la construction de la connaissance scientifique sur notre espèce. Il discute les obstacles épistémologiques, les préceptes « moraux » et les préjugés qu’il a fallu dépasser pour parvenir aux représentations scientifiques actuelles sur notre propre espèce. Organisé en « 7 Leçons », il explore l’élaboration des savoirs dans des disciplines comme l’histoire naturelle, la paléontologie, la préhistoire, la génétique des populations, la neurobiologie, la linguistique, la démographie, la psychologie sociale et l’anthropologie culturelle afin de montrer comment, avec le temps, les sciences humaines et de la nature ont progressivement élaboré un corpus de connaissance essentiel pour comprendre l’origine de notre espèce, sa spécificité, sa variabilité biologique, sa diversité culturelle et l’organisation de sa vie en société. Formant un ensemble de connaissances de bases sur notre propre espèce, ce corpus est essentiel pour structurer notre pensée sur nous-mêmes, nos semblables et sur les relations que nous entretenons les uns avec les autres. Il permet de substituer un savoir construit à l’ignorance, les préjugés, les stéréotypes et les idées fausses. Le fait que ce corpus devrait faire l’objet d’un enseignement systématique, autrement dit, de toute « culture générale », est également discuté. Ce parcours à travers l’histoire des représentations de nos semblables permet encore de prendre conscience que de tous les sujets qui ont fait l’objet d’un questionnement scientifique, celui de l’étude de notre propre espèce est le sujets qui a connu les controverses les plus dures et les dérives les plus terrifiantes. A ce titre, il est également démonstratif de la manière dont la pensée scientifique peut être soumise aux préjugés, aux dogmes et aux mythes, anciens ou récents. C’est pourquoi ce cours se veut aussi instructif de la manière dont le savoir scientifique se construit. Objectif Comprendre la construction des connaissances scientifiques actuelles sur l’origine et la diversité biologique et culturelle de notre espèce. Identifier les conceptions-clé de l’anthropologie biologique et culturelle. Comprendre la place des conceptions scientifiques, et plus particulièrement celles de la biologie, dans l’élaboration des connaissances de base sur notre propre espèce. Comprendre les enjeux de société de ces connaissances et leur influence sur l’élaboration des représentations collectives à propos de notre espèce.

138

EXPLOITATION DES COLLECTIONS BOTANIQUES 14B021 Semestre


ECTS

5

Jour

travail individuel, horaire à fixer avec l’étudiant(e)

Lieu

Conservatoire et jardin botaniques


rapport

Pré-requis

Systématique de 2ème année

Responsables

Messieurs Ph. CLERC (cryptogames) - 022 418 51 28 - [email protected]ge.ch et L. GAUTIER (phanérogames) - 022 418 51 47 - [email protected]ge.ch

Enseignant(e)s

Madame M. PRICE (cc), Messieurs Ph. CLERC (cc), L. GAUTIER (cc), F. STAUFFER (cc).

Contenu Identification, détermination et gestion des plantes et des champignons conservés en herbier. Approche pratique dans le domaine de la flore suisse, méditerranéenne et tropicale, à déterminer en accord avec les enseignants. Objectif Apprendre à extraire et utiliser les données contenues dans un herbier.

139

FAUNE GENEVOISE 14B642 Semestre


ECTS

4

Jour

bloc, du 24 au 28 septembre 2018 (y compris une soirée)

Lieu

Muséum d’histoire naturelle et extérieur


rapport écrit

Pré-requis

cours « 14B005 Biodiversité » (recommandé)

Responsables

Monsieur M. RUEDI - 022 418 6320 – manuel.ruedi@ville-ge.ch & Monsieur J. MARIAUX - 022 418 6343 – [email protected]

Enseignant(e)s

M. RUEDI (cc) et collaborateurs du Muséum

Divers Inscription par email auprès des enseignants requise la semaine avant le début du cours.

Le nombre de places est limité à 10. La priorité sera donnée aux étudiants qui sont inscrits en Master orientation Biodiversité et Systématique et qui ont suivi le cours 14B005 Biodiversité. Contenu Introduction à la biodiversité régionale - des méthodes d’échantillonnage et la détermination jusqu’à l’incorporation de spécimens dans les collections du Muséum - à travers l’étude de quelques grands groupes zoologiques représentatifs de la faune locale qui correspondent aux spécialités des enseignants (p.ex. arachnides, hémiptères, papillons de nuits, poissons, coléoptères, micromammifères). Une importante partie du cours sera donnée sur le terrain. L’enseignement sera donné en français ou en anglais. Objectif Initiation à la systématique de la faune locale. Initiation à la rédaction d’un article scientifique.

140

FLORE ET VÉGÉTATION : Cartographie, analyses et indicateurs 14B008 Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestre


ECTS

2

Jours

Cinq cours de 3h entre mai et juin, dates et horaires à convenir. Une journée d'excursion entre mai et juin, date à convenir.

Lieu

Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève, salle de séminaire de la Console (192 rue de Lausanne à Genève)


rendu de travaux écrits + évaluation continue

Responsable

Madame M. PRICE – 022.418.41.48 (CJB), [email protected]

Enseignant

Monsieur P. MARTIN (Adj sc) – 022.418.52.322 (CJB), pascal.martin@ville-ge.ch Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève, 192 Chemin de l’Impératrice 1292 Chambésy

Divers Prière de s'inscrire au cours également par email : pascal.martin@ville-ge.ch Ce cours est ouvert au public. Contenu Concepts clefs en écologie spatiale

-‐ patrons et modèles de distributions -‐ notions d’échelles et gradients -‐ niches fonctionnelles et niches réalisées

Structure et dynamique des formations végétales -‐ évolution spatio-temporelle -‐ relation sol-végétation-environnement

Analyses de la végétation, de la biodiversité et des paysages -‐ outils quantitatifs et qualitatifs -‐ outils cartographiques -‐ richesse et diversité -‐ espèces indicatrices, espèces invasives -‐ indicateurs et monitorings

Outils scientifiques de suivi et d’expertise pour la conservation et l’aménagement des espaces naturels et semi-naturels

Objectif Comprendre l'organisation spatio-temporelle des communautés végétales, leur agencement et leur dynamique. Utiliser des outils d’analyses, de suivi et de cartographie de la végétation pour répondre à des questions d’aménagement de conservation.

141

FLORE ET VEGETATION (STAGE DE) 14B009 Stage à choix de 2ème et 3ème années, master Semestre

printemps 5 jours

ECTS

3

Jour stage en avril-mai-juin (dates à convenir)

Lieu Région genevoise

Mode d’évaluation rapport de stage

Pré-requis cours 14B008

Responsable

Madame M. PRICE (pt) – 022.418.41.48, [email protected]

Enseignant Monsieur P. MARTIN (adj sc) – 022.418.52.322, pascal.martin@ville-ge.ch Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève, 192 Chemin de l’Impératrice 1292 Chambésy

Divers Le stage est ouvert au public. Contenu Inventaires de terrain (lichens, bryophytes, plantes vasculaires) ;; Notions espèces indicatrices et espèces invasives (expérience du terrain - relevés en présence, en abondance ou en fréquence) ;; Outils et techniques (relevés de la végétation, facteurs biotiques / abiotiques, cartographique) ;; Analyses et synthèse de la biodiversité et des paysages. Objectifs Apprendre à :

- réaliser des inventaires de terrain - choisir les techniques de mesures et d’analyses de données - synthétiser et mettre en valeur ces résultats

142

FLORISTIQUE : chorologie, histoire et connaissance de la flore 14B033 Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestre

printemps Nbre d’heures par semaine 3.5 Nbre d’heures par année 48

ECTS

3

Jour

les lundis 18 et 25 février, 4,11,18 et 25 mars 2019 de 8h30 à 12h, potentiellement modifiable, en accord avec les participants.

Lieu

Conservatoire et Jardin botaniques, salle de séminaire de La Console (192 rue de Lausanne 1202)


Examen oral et présentation d’articles

Sessions d'examens


Responsable

Madame Y. NACIRI - 022.418.5165 – [email protected] et yamama.naciri@ville-ge.ch

Enseignant(e)s Monsieur L. NUSBAUMER (cc) Madame Y. NACIRI (cc).

Divers Inscription obligatoire sur « Chamilo » avant le 15 janvier, vous devez également vous annoncer par email à la responsable, indépendamment de l’inscription officielle. Cinq excursions sont prévues en dehors des heures de cours listées ci-dessus durant le semestre de printemps. Les dates des excursions et d’examen sont fixées d’entente avec les étudiant(e)s. Contenu Ce cours comprend les bases théoriques de la floristique. Il aborde les thèmes suivants :

-aires, cortèges floristiques, histoire de la flore -éléments de floristique suisse et alpine -problématique des néophytes en Suisse -notions de spéciation -apports de la caryogéographie et la phylogéographie pour l’histoire de la flore

Ce cours illustre les éléments théoriques au moyen d’exemples pratiques généralement tirés de la flore suisse (présentation d’articles, excursions et travaux pratiques de reconnaissance d’espèces). Objectif Savoir reconnaître les principales espèces de la flore régionale et comprendre leur signification écologique et historique.

143

FOUILLES ARCHEOLOGIQUES 14B635 Stage - obligatoire - Master en archéologie préhistorique Semestre

Automne (4 semaines)

ECTS

6

Jour & lieu

janvier-mars / Afrique (Sénégal, Ghana, Côte d’Ivoire)


Rapport de stage

Responsable

Monsieur E. HUYSECOM - 022.379.6973/67 [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs E. HUYSECOM (pas) et D. GENEQUAND (cc), Mesdames A. MAYOR (cc) et K. DOUZE (AdjSc3)

Divers Contenu Fouilles archéologiques sur un site africain en cours d’étude et /ou participation à des recherches ethnoarchéologiques Objectif Apprentissage du terrain africain.

144

FOUILLES ARCHEOLOGIQUES, stage d’initiation 13T601 Stage obligatoire pour le bachelor en Archéologie préhistorique et anthropologie Semestre

Printemps (4 semaines)

ECTS

6


participation active et rapport de stage

Responsable


Enseignant(e)s Mesdames M. BESSE (pas) et collab.

Contenu Cet enseignement, de niveau bachelor, se déroule pendant 4 semaines dans une « fouille-école » où un encadrement spécifique est destiné aux étudiants débutants. Il s'agit en effet de les initier à la pratique de la fouille archéologique : comprendre les différentes étapes à mener sur le terrain, les techniques de fouilles et d'enregistrement des données, le traitement des objets, des sédiments et de la documentation (fiches, dessins, photographies). Il est demandé à l'étudiant un rapport de stage présentant le site archéologique, les raisons de la fouille et les activités qu'il a effectuées. Il s'agit d'une phase d'apprentissage de la fouille archéologique sur un site en cours d'étude.

145

GENETIQUE MOLECULAIRE DU DEVELOPPEMENT 13B010 Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

6

Jours & lieux

vendredi 8h15 - 10h - Sciences III, salle 0019 automne vendredi 8h15 - 10h - Sciences III, auditoire 1S081 printemps


examen écrit de 4h / contrôles continus

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur F. KARCH - 022.379.6331 - [email protected]

Enseignant(e)s Madame B. GALLIOT (pas), W. BUZGARIU (scs), Messieurs, F. KARCH (po), J. ZAKANY (mer).

Contenu Comme son nom l’indique, la Génétique Moléculaire du Développement (GMD) étudie les processus complexes qui gouvernent le développement des organismes multicellulaires en associant intimement trois disciplines : l’embryologie, la génétique et la biologie moléculaire. La GMD a pris son envol à partir du milieu des années 70, lors de l’émergence des techniques de l’ADN recombinant. La drosophile a joué un rôle prépondérant dans cet essor car non seulement son développement embryonnaire est bien connu mais en plus les généticiens, depuis le début du 20ème siècle, ont identifié de nombreuses mutations qui interrompent ou perturbent ce développement. Grâce à la biologie moléculaire, il est devenu possible d’isoler les gènes du développement et d’identifier les processus moléculaires qu’ils contrôlent. Vers le début des années 80, l’observation selon laquelle bon nombre de ces gènes du développement sont conservés au cours de l’évolution, a donné un point d’entrée pour étudier les processus similaires chez d'autres invertébrés ainsi que chez les vertébrés et mammifères. Cette conservation des molécules (mais pas nécessairement des processus) permet également de corréler l’évolution et le développement, une nouvelle discipline intitulée « évo-dévo ». La première partie du cours sera consacrée à la drosophile avec François Karch. Dans la deuxième partie, Brigitte Galliot abordera les méthodes moléculaires utilisées en évo-dévo et les bases moléculaires et cellulaires de la régénération, en prenant l'hydre, la planaire, le triton et le poisson-zèbre comme modèles. Finalement dans la troisième partie, Jozsef Zakany abordera la biologie du développement chez la souris avec l’exposé des techniques qui permettent d’inactiver des gènes spécifiques par recombinaison homologue. Objectif Le but du cours est de faire comprendre aux étudiants les mécanismes moléculaires et cellulaires qui permettent à un organisme de se développer harmonieusement. Pour atteindre ce but, les étudiants doivent connaître et comprendre les principales techniques de biologie cellulaire et moléculaire appliquées aux processus de développement. La pédagogie et l’évaluation sont centrées sur l’analyse et la compréhension de contextes expérimentaux. A partir d’une situation expérimentale donnée, les étudiants doivent être capables d’identifier et d’analyser les informations importantes, d’effectuer des déductions sur les mécanismes impliqués dans le ou les processus biologiques en cause, éventuellement de proposer une stratégie pour confirmer ou compléter la compréhension du processus en cause.

146

GENETIQUE MOLECULAIRE DU DEVELOPPEMENT 13B909 Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre

Automne 3 semaines 4h/sem, total 60h

ECTS

3

Jours

3 décembre au 21 décembre 2018

Lieu

Sciences III – salle 0059

Pré-requis

suivre en parallèle le cours Génétique moléculaire du développement (13B010)


obtention d’un certificat

Responsable

Monsieur F. KARCH - 022.379.6331 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs F. KARCH (po), R. MAEDA (coll. sci).

Divers L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire. Le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site internet de Biologie et devra être remis au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor. Contenu L'analyse d'individus mosaïques, c'est-à-dire formés de cellules génétiquement différentes est une méthode très performante pour l'étude du développement d'un organisme. Ces travaux pratiques abordent les techniques de génétique moléculaire qui permettent de produire des individus mosaïques chez la drosophile, soit en éliminant soit en activant l'expression de différents gènes d'identité cellulaire (gènes sélecteurs) ou de signalisation intercellulaire dans un petit nombre de cellules ("analyse clonale"). Les clones de cellules mutantes seront induits à différents stades du développement et leurs effets sur la morphogenèse (ailes, pattes, segments etc) seront ensuite évalués par inspection des drosophiles adultes. Les effets sur l'expression au cours du développement de différents gènes seront également mis en évidence par immunohistologie et observation au microscope (en fonds clair et fluorescence).

147

GENETIQUE MOLECULAIRE DU DEVELOPPEMENT ET DE L’EVOLUTION : CHAPITRES CHOISIS

14B038

Semestre automne/printemps

tous les 15 jours 2h/sem, total 28h + 2h travaux à la maison

ECTS

4

Jour

mercredi 17h15 – 19h (une semaine sur deux)

Lieu



examen oral / contrôles continu

Pré-requis

bachelor en biologie ou biochimie

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur J. ZAKANY - 022.379.6788 - [email protected]

Enseignant(e)s B. GALLIOT (po) / M. VOGG (postdoc), F. KARCH (po), R. KOCH (cs), D. PAULI (ce), I. RODRIGUEZ (po), E. RODRIGUEZ-CARBALLO (postdoc), A. TZIKA (ma), J. ZAKANY (mer)

Divers Ce cours traite de chapitres spécialisés dans le domaine de la génétique moléculaire du développement appliquée à une série de modèles tels que l’hydre, la mouche du vinaigre, les reptiles, les mammifères. Il est réservé aux étudiant(e)s de master en biologie ou en biochimie et est basé sur l'étude de publications récentes dans ce domaine. Ce cours, donné en anglais, est l’occasion pour les étudiant-e-s d’analyser puis de présenter oralement et de discuter des articles scientifiques. Ce cours nécessite donc une bonne connaissance de l'anglais. Par ailleurs ce cours est l’occasion pour les étudiant-e-s de développer leurs talents de communicateurs scientifiques.

148

GEOLOGIE GENERALE I 11T003 Semestre


ECTS

5

Jour

mardi 10h15 - 12h et vendredi 14h15 – 16h

Lieu

salle 001, Sciences de la Terre, 13 rue des Maraîchers


examen écrit (examen oral ou écrit au rattrapage)

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. MOSCARIELLO – 022.379.6610 [email protected] Section des sciences de la Terre et de l’environnement

Enseignant(e)s

Monsieur A. MOSCARIELLO (po).

Contenu Le système Terre: formation, minéraux, roches ignées, roches sédimentaires et roches métamorphiques. Processus de surface: mouvements de terrain, cycle hydrologique, eaux souterraines, rivières, vent, déserts, glaciers, océans et évolution des paysages. Processus internes et effets externes: volcanisme, tremblements de terre, tectonique des plaques, déformations de la croûte. Préserver le système Terre: ressources énergétiques et minérales, systèmes et cycles terrestres. Cours en polycopié et slides en format digitale disponibles sur Chamilo. GEOLOGIE GENERALE I 11T903 Semestre


ECTS

2

Jour

lundi 10h00 - 12h00

Lieu

salle 201, Sciences de la Terre, 13 rue des Maraîchers


examen pratique/certificat

Sessions d'exames


Responsable

Monsieur A. MOSCARIELLO – 022.379.6610 [email protected] Section des sciences de la Terre et de l’environnement

Enseignant

Monsieur M. CHIARADIA (mer).

Contenu Reconnaissance à vue des principaux minéraux et roches magmatiques, sédimentaires et métamorphiques, avec références au cours de Géologie.

149

GEOLOGIE GENERALE II 11T005 Semestre


ECTS

2.5

Jour

mardi (le jour et lieu doivent être confirmés par leur secrétariat.)

Lieu

Maraîchers, salle 102


examen écrit

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur U. SCHALTEGGER - 022 379 66 38- [email protected]

Enseignant(e)s

Monsieur U. SCHALTEGGER (po).

Contenu La formation et la distribution des différentes roches et leurs minéraux dans la croûte et le manteau terrestre. Systématique des minéraux importants au point de vue géologique.

150

GENETIQUE MOLECULAIRE DES POPULATIONS - MOLECULAR POPULATION GENETICS

14B637

Cours obligatoire pour le master en biologie orientations « bioinformatique et analyse des données en biologie» et « biodiversité et systématique » Compulsory course for the master in biology options « bioinformatics and data analysis in biology » and « biodiversity and systematics » Semestre/Period automne / Autumn

ECTS

5 (3 pour les doctorants / 3 for PhD students)

Jour/Day une semaine à plein temps, du jeudi 10 au mercredi 16 janvier 2019 inclus One week full time, from Thursday 10 to Wednesday 16 January 2019 inclusive

Lieu/Place

Sciences II, 4ème étage, Unité d’anthropologie salle 419

Mode d’évaluation Evaluation mode

rapport de stage écrit et présentation orale training course report and oral presentation

Pré-requis Prerequisite

3ème année de biologie acquise / 3rd year of bachelor acquired Stage ouvert aux doctorants, notamment dans le cadre du programme doctoral en Ecologie et Biologie évolutive de la CUSO. Training course open to PhD students, namely students following the doctoral program in ecology and evolution of the CUSO.

Responsable Person in charge

Madame A. SANCHEZ-MAZAS – 022.379.6984/67 alicia.sanchez-[email protected]

Enseignants Teachers

Mesdames E. POLONI (cc), A. SANCHEZ-MAZAS (po), Messieurs M. CURRAT (mer), D.DI (ma), T. GOEURY (as), M. MOUTERDE (as), J.M. NUNES (ce), J. RIO (as)

Divers Miscellaneous Cours donné en anglais / Course given in English

Pré-inscription par e-mail à alicia.sanchez-[email protected] avant Noël 2019 Please register to alicia.sanchez-[email protected] before Christmas break 2019 Contenu Contents Ce stage permet aux étudiant(e)s d’acquérir les connaissances de base en génétique des populations par l’analyse sur ordinateur de jeux de données moléculaires fournis par les enseignants. Le travail pratique consiste à effectuer les diverses étapes d’une étude de la structure génétique des populations: manipulation des données, analyses à l'aide des logiciels couramment utilisés en génétique des populations, représentations graphiques, interprétation des résultats. Les notions théoriques sont introduites au début de chaque séance et approfondies au cours du travail pratique. Une ou plusieurs conférences sont également données pendant le stage par des chercheurs invités. Le stage est destiné aux étudiants du master en biologie et aux doctorants (cet enseignement est inscrit au programme doctoral inter-universitaire en Ecologie et Biologie évolutive de la CUSO http://biologie.cuso.ch/ecologie-evolution).

This training course provides students with basic knowledge in population genetics through computer-assisted analyses of different molecular datasets provided by the teachers. The practical work consists in carrying out the different steps of a study aiming at defining the genetic structure of populations: data management, data analysis using usual computer programs in population genetics, graphical representations, interpretation of the results. The theoretical concepts are introduced at the beginning of each course and trained during the practical sessions. One or several scientific conferences are also given by invited speakers. This training course is for students following the master in biology but also for PhD students (it is part of the doctoral program in Ecology and Evolution of the CUSO - http://biologie.cuso.ch/ecologie-evolution).

151

GEOMATIQUE I 12T408 Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestre


ECTS

2 (cours + TP intégrés) 3 (biologistes)

Jour

vendredi après-midi (10x) (Semaines 5 à 14)

Lieu

13h15-14h Cours : Sc. III, salle 1S059 14h15-17h TP : Carl Vogt, salles info


examen écrit

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LEHMANN – [email protected] Uni Carl Vogt

Enseignant(e)s Messieurs A. LEHMANN (pas), Y. GUIGOZ (CE)

Contenu Le cours s’articule autour des chapitres suivants : 1. Introduction : de l'Erudit de Séville, au Capitaine Cook,' à Google Earth 2. Modéliser notre monde : mode vecteur ou raster ? 3. Analyses en mode vecteur : base de données et réseaux 4. Analyses en mode raster : analyses locales, focales, zonales et globales 5. Introduction à la télédétection : la Terre vue de l'espace ! 6. Type et qualité des données, topologie 7. Sources de données, géoréférençage et projection 8. Métainformation : l’information sur la donnée 9. Software Objectif Introduction aux systèmes d’information géographique (SIG) en tant qu’outils d’analyse de l’environnement à diverses échelles, du bassin versant à la planète entière. Contenu - Travaux pratiques intégrés Le cours et les travaux pratiques associés visent à transmettre les bases théoriques et pratiques aux étudiants en suscitant leur curiosité afin qu’ils puissent commencer à utiliser les SIG et/ou la télédétection dans leurs travaux de diplôme et de thèse. Les travaux pratiques sont réalisés avec ArcGIS 10.3 de ESRI (www.esri.com).

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HISTOLOGIE ET IMAGERIE DES TISSUS 14B640 Cours et stage pratique Semestre

printemps 40h au total

ECTS

3

Dates

Plusieurs créneaux (40h de cours au total) répartis entre le 12 et le 23 août 2019

Lieu

Sciences III, Salle TP 0016


rapport noté

Pré-requis

Ce cours est destiné aux étudiants de troisième année de bachelor et de master.

Responsable

Monsieur S. LOUBÉRY (cc) – 022.379.65.68 [email protected]

Enseignant Monsieur S. LOUBÉRY (cc)

Divers Modalités et date limite d’inscription : par e-mail à l’adresse [email protected],

avant le 17 mai 2019. Le nombre de participants étant limité à 10, il est demandé de joindre une lettre de motivation à la demande d’inscription. S’il y a des participants non francophones au cours, la partie théorique du cours pourra être donnée en anglais ;; la partie pratique, elle, sera principalement donnée en français. Contenu Avec quelles méthodes peut-on analyser l’organisation d’un tissu ? Comment peut-on étudier la localisation d’une protéine ou d’un ARN dans un organe, voire dans un organisme entier ? En se basant sur quelques exemples concrets, le cours présente des techniques couramment utilisées en biologie pour l’imagerie des tissus. Le cours est centré autour des méthodes d’histologie classiques : préparation des échantillons en vue de la réalisation de coupes, microtomie, colorations histochimiques, immuno-localisation, observation. L’histologie classique sera comparée aux autres moyens usuels permettant l’imagerie des tissus (microscopie à fluorescence à champ large et microscopie confocale). Pour chacun de ces types d’imagerie les étudiants vont recevoir des rappels théoriques, préparer des échantillons et les observer en petits groupes au microscope. Par ailleurs, les techniques d’histologie modernes seront discutées pendant le cours (microscopie à feuille de lumière, clearing, etc.). Enfin, le cours donnera aussi des outils (théoriques et pratiques) pour manipuler et analyser des images de microscopie. Objectif Les objectifs sont les suivants :

• connaître les différentes méthodes de préparation et de coupe des échantillons en histologie et expliquer leurs caractéristiques ;;

• apprécier les avantages et les limites de chaque méthode, ainsi que les difficultés relatives à leur mise en œuvre en pratique ;;

• comparer les avantages de coupes histologiques classiques et de coupes optiques issues de diverses méthodes de microscopie à fluorescence ;;

• étant donné un nouvel échantillon à étudier, pouvoir proposer un projet d’histologie/imagerie adapté en fonction des caractéristiques du tissu d’intérêt.

153

HYDROBIOLOGIE MICROBIENNE : Environnement naturel et construit, aspects écologiques, hygiéniques et sanitaires

14B041


printemps 3 jours Nbe d’heures par année 28

ECTS

3

Jour

à fixer : été 2019

Lieu

Centre de Biologie Alpine de Piora


rapport

Responsable

Monsieur M. TONOLLA – 058.666.62.69 – mobile 079.380.69.96 [email protected] et [email protected] Ecologie microbienne, Unité de microbiologie, Dép. Biologie végétale, Université de Genève, 30 Quai Ernest-Ansermet, 1211 Genève 4, Suisse et Laboratory of applied microbiology, University of Applied Sciences (SUPSI), Via Mirasole 22A,6500 Bellinzona

Enseignant(e)s Madame A. DEMARTA (coll). Messieurs M. TONOLLA (cc), N. STORELLI (coll), A. BRUDER (coll), R. PEDUZZI (pas) -retraité).

Divers Ce cours sera donné en annexe au stage14B641 au Centre de Biologie Alpine du val Piora dans le Massif du Saint-Gothard aux bords du Lac de Cadagno (www.cadagno.ch). Enseignement en français et anglais. Inscription auprès du secrétariat des étudiants de la faculté des sciences Contenu Le cours traite les microbes, l'eau et la santé dans une perspective globale, depuis les agents pathogènes d'origine hydrique (Legionella, Aeromonas, Yersinia, Pseudomonas,..) jusqu’à la problématique des résistances aux antibiotiques induite par la présence de micropolluants. Des sujets réels liés à l'hygiène de l'eau, au traitement des eaux usées et à la biosécurité dans l'environnement naturel et construit seront traités ainsi que la problématique de l'eau en milieu urbain et la présence de vecteurs d'agents pathogènes. En particulier, le problème de la transmission de virus dangereux (Dengue, Chikungunya, West Nile ou Zika) par les moustiques (par exemple moustique tigre) vivant dans l'eau des zones urbanisées, ainsi que leur monitorage et contrôle en utilisant d’agents biologiques, sera discuté sur la base des expériences concrètes acquises pendant 30 ans d’activité en Suisse. Objectif Transmettre les bases pour la compréhension des connexions entre environnement, microorganismes et santé sur la bases d’examples concrets.

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HYDROBIOLOGIE MICROBIENNE : Ecologie microbienne et écologie alpine

14B641

Stage à choix de 2ème et 3ème années Semestre

printemps 5 jours Nbe d’heures par année 40h

ECTS

4

Jour

à fixer : été 2019

Lieu

ce stage a lieu en été au Centre de Biologie Alpine du val Piora dans le massif du Saint-Gothard au bord du lac de Cadagno (www.cadagno.ch).


rapport de stage

Responsable

Monsieur M. TONOLLA - 058 666 62 69 [email protected] et [email protected] Ecologie microbienne, Unité de microbiologie, Dép. Biologie végétale, Université de Genève, 30 Quai Ernest-Ansermet, 1211 Genève 4, Suisse, et Laboratory of applied microbiology, University of Applied Sciences Southern Switzerland (SUPSI), Via Mirasole 22A, 6500 Bellinzona

Enseignant(e)s Madame A. DEMARTA (coll), Messieurs M. TONOLLA (cc), N. STORELLI (coll.), A. BRUDER (coll.), M. BUECHE (coll.), D. BOUFFARD (coll.), X. PERRET (mer), S. ROMAN (coll.)

Divers Enseignement en français/anglais. Inscription auprès du secrétariat des étudiants de la faculté des sciences Contenu Excursions sur le terrain et prélèvements d’échantillons de divers écosystèmes alpins (lacs, marais, sols). Analyses physico-chimiques et application de méthodes classiques et moléculaires pour la détection et le typage des microorganismes. Ecologie microbienne du lac de Cadagno : Relations chimisme de l’eau et populations microbiennes, pollutions, écologie, biodiversité microbienne. Travail sur le lac et analyse des échantillons. Le cours donne un aperçu sur les mécanismes de base soutenant la vie des microbes dans des environnements hydriques (les lacs, les cours d'eau, la neige, ...), en particulier dans la zone alpine, et sur les interactions entre les communautés microbiennes et entre microbes et organismes supérieurs (par exemple les symbioses dans les racines des plantes). Les exemples sont choisis sur le site. Objectif Acquisition des techniques de travail sur le terrain, échantillonnages dans des milieux hydriques et terrestres. Compréhension des approches moléculaires pour l’analyse de la structure de la communauté microbienne et de sa fonction. Compréhension du rôle de la vie microbienne dans les cycles biogéochimiques. Etude des dynamiques des populations microbiennes lacustres des interactions abiotiques et biotiques au sein des communautés microbiennes.

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INTRODUCTION A LA BIOLOGIE DU COMPORTEMENT 14B043 Cours à choix de 2ème et 3ème années Semestres

automne/printemps (12 séances le jeudi, selon calendrier donné à la rentrée + mémoire écrit)

2h/sem, total 28h

ECTS

3

Jour

jeudi 10h15 - 11h50 dès le jeudi 20 septembre 2018 (puis, 4 dates d’octobre à décembre 2018 et 7 dates de février à juin 2019, calendriers donnés à la rentrée et à la fin du semestre d’automne).

Lieux

Semestre automne : Sciences III, salle 1S059 Semestre printemps : Sciences III, salle 1S081


examen écrit, 2h + mémoire interactif.

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LANGANEY - 022.379.69.68 /67 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs A. LANGANEY (ph), D. ROESSLI (coll. sci).

Divers Ce cours d'initiation destiné aux étudiant(e)s en Biologie et en Psychologie est ouvert aux étudiants des autres Facultés et au public. Contenu Ce cours a pour objectif de comprendre les principaux mécanismes qui déterminent les comportements animaux (humains compris) et de reconstituer les étapes de leur apparition et de leur différenciation au cours de l’histoire du monde vivant. Un intérêt particulier est porté aux interactions entre des facteurs génétiques et la mise en œuvre physiologique du comportement, ainsi qu’aux apprentissages éventuels. L’émergence des comportements humains et les limites de leurs spécificités sont évoquées ou abordées au cours des chapitres successifs.

1. Les comportements animaux dans l’histoire du monde vivant, 2. Les mécanismes de l’évolution animale, implications pour les comportements ;; 3. Genèse d’un comportement animal ;; 4. Génétique, sexe et comportement ;; 5. La mise en œuvre physiologique des comportements : 6. Les comportements dits « innés » ;; 7. L’apprentissage, dans la nature et en expérimentation ;; 8. Comportement, territoires, structures sociales ;; 9. Les comportements des primates ;; 10. Les spécificités humaines 11. Biologie du comportement humain 12. Répétitoire.

Objectif Sensibiliser les étudiants en biologie, en psychologie et les autres auditeurs à l’importance des comportements dans l’histoire de la vie et à celle de la biologie, dans leur histoire comme dans leur réalisation. Montrer comment la plupart des comportements humains sont issus d’une longue histoire du vivant et non des seules particularités de notre espèce. Mettre en valeur ce que l’histoire du monde animal nous apprend sur notre vie et notre quotidien.

156

INTRODUCTION A L’EARCHOLOGIE ISLAMIQUE : MOYEN-ORIENT ET AFRIQUE

14B071

Cours de master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

2

Jour

mercredi 14h00 – 15h00

Lieu



examen oral

Sessions d'examens


Responsable & enseignant

Monsieur D. GENEQUAND (cc) - [email protected]

Contenu Ce cours de master porte sur l’archéologie de la période islamique et des groupes humains ayant adopté l’Islam comme religion principale au Moyen-Orient et en Afrique. Né dans la Péninsule Arabique au 7e siècle de l’ère chrétienne, l’Islam a connu une expansion rapide au Moyen-Orient et en Afrique du Nord, puis plus lente en direction de l’Afrique subsaharienne, et a induit des changements importants dans les sociétés concernées. Ce cours est conçu comme une introduction à un domaine de l’archéologie encore peu connu et rarement enseigné, mais bénéficiant d’un fort potentiel de développement. Ce sont en particulier les processus d’islamisation et l’impact de l’Islam sur les formes de peuplement qui seront examinés. Les nouvelles formes d’établissements, les lieux de culte, la culture matérielle et le développement de relations commerciales à longue distance seront également présentés à la lumière des connaissances archéologiques. INTRODUCTION A L’ARCHEOLOGIE ISLAMIQUE : MOYEN-ORIENT ET AFRIQUE - séminaire

14B771

Séminaire du master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

1

Jour

mercredi 15h00 – 16h00

Lieu



travail écrit

Sessions d'examens


Responsable & enseignant

Monsieur D. GENEQUAND (cc) - [email protected]

Divers Le séminaire permet aux étudiants de mener et de présenter des travaux personnels. Contenu Les sujets traités sont en relation avec le cours n° 14B071

157

INTRODUCTION A LA BIOINFORMATIQUE POUR BIOLOGISTES 12C902X Travaux pratiques Semestre

printemps 20h/sem

ECTS

1

Jour

13h30 -17h30 du 29 avril 2019 au 3 mai 2019

Lieu

salle définie selon disponibilité (annonce dans le fascicule de protocoles des TP)


rapport d’expériences, certifié

Responsable


Enseignante Madame M.-C. BLATTER (ce)

Divers Liaison avec d'autres cours : Biochimie II (12C002) Préparation pour Biochimie III (13C008) et les Travaux Pratiques de Biochimie III pour biologistes (13C908X), ainsi que pour le BSc en biologie. Remarques : L'inscription à ces Travaux Pratiques à option est à effectuer obligatoirement avant fin février, auprès du responsable ([email protected]), de l’enseignante (Marie-[email protected]) et du Secrétariat du Département de biochimie ([email protected]). Le nombre de participants pour ces Travaux Pratiques est limité. Contenu La semaine de Travaux Pratiques est dédiée à l'introduction aux outils de la bioinformatique;; elle est dispensée dans le cadre des Travaux Pratiques de biochimie pour biochimistes de 2ème année. Protocole de Travaux Pratiques (partiellement en anglais;; disponible sur Chamilo https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C902X/ou auprès de l'enseignant (Marie-Claude.Blatter@isb-sib.ch)) Objectif Ces Travaux Pratiques enseignent les techniques bioinformatiques majeures ainsi que l’interrogation des bases de données utilisées dans les laboratoire de biochimie et biologie.

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INTRODUTION A LA GENETIQUE 14B037P Semestre


ECTS

*8 ECTS (chimistes + biochimistes) *5 ECTS (pharmaciens)

Jours

lundi 13h15 -14h mardi 14h15 -16h

Lieu

Sciences II, A300


examen écrit (4h)

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur D. PAULI - 022.379 67 55 – [email protected]

Enseignant(e)s Monsieur D. PAULI (ce), V. OSSIPOW (ce)

Divers * Etudiants en chimie/biochimie: 8 ECTS, acquis lorsque la moyenne des enseignements 11C003 (Biochimie I - Automne) et 14B037P (Introduction à la génétique / Biochimie I - Printemps) est égale ou supérieure à 4.0. * Etudiants en sciences pharmaceutiques: 5 ECTS, acquis lorsque la moyenne des enseignements 11C003 et 14B037P est égale ou supérieure à 4.0. Contenu La génétique : - Introduction et historique - Cycle cellulaire, mitose, méiose - Génétique mendélienne - Recombinaison - Interaction des gènes - Types et mécanismes de mutations - Régulation de l'expression génique - Régulation de la prolifération cellulaire et cancer - Les bases génétiques du développement - Génétique des populations et évolution Objectif Griffiths, Gelbart, Miller, Lewontin (2001). Analyse génétique moderne. De Boeck Université.

159

INTRODUCTION A L’HISTOIRE ET A LA PHILOSOPHIE DES SCIENCES

10S003

Semestre


ECTS

6

Jour

jeudi 16h15 - 18h

Lieu

Sciences III – salle 1S059


examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur J. LACKI – 022.379.6385 – [email protected]

Enseignant Monsieur J. LACKI (pt).

Contenu La nécessité de préciser les cadres théoriques et pratiques de l’activité scientifique a attiré l’attention des savants de toutes les périodes. Depuis l’avènement de la science moderne au XVIIe siècle, jusqu’aux révolutions de la théorie de la relativité et de la théorie quantique du XXe siècle, en passant par la théorie de l’évolution et les problèmes spécifiques posés pas les sciences de la vie, on examinera comment la science s’est constituée pour devenir cette grande aventure de l’humanité que nous connaissons aujourd’hui. Le cours discutera aussi comment, tout en se construisant, la Science a modifié nos conceptions philosophiques de ce qu’est la réalité et comment l’homme peut la connaître. S’appuyant sur des épisodes remarquables de l’histoire des sciences, il servira ainsi d’introduction aux grands problèmes de la philosophie des sciences en montrant comment ces derniers trouvent leur racine directement dans la pratique scientifique. Le cours, qui évoque aussi bien les problèmes internes à la science, que ceux touchant sa place dans la société et dans la culture, s’adresse non seulement aux étudiants de la Faculté des Sciences mais aussi à ceux de la Faculté des Lettres, de Sciences Economique et Sociales, de Droit, etc. Le matériel didactique épaulant chaque séance est disponible sous forme électronique sur la plateforme Chamilo de l’Université.

160

INTRODUCTION A LA RECHERCHE EN BIOLOGIE MOLECULAIRE DES VEGETAUX

14B045

Travaux pratiques à choix pour le bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie

Semestre


ECTS

4

Jour & lieu

Ce cours sera donné une semaine sur deux Une séance d’information sera fixée à la rentrée, contacter : [email protected]


examen oral

Sessions d'examens


Responsable

M. HOTHORN - 022 37 93013 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs R. ULM (po), M. HOTHORN (pas), L. LOPEZ MOLINA (pas), Madame M. BARBERON (past).

Divers Ce cours est destiné aux étudiant(e)s en biologie et en biochimie de 3ème ou 4ème année et en master de biologie. Cours en français et en anglais;; documentation en anglais. Contenu Ce cours à choix propose des lectures et discussions en rapport avec des problèmes actuels en biologie moléculaire végétale. Objectif Exercer une lecture critique de la littérature scientifique contemporaine. Etudier des développements récents dans le domaine de la biologie moléculaire végétale. Comprendre des nouvelles technologies et méthodes expérimentales. Apprendre comment concevoir un projet de recherche. Développer des aptitudes pour la présentation orale de sujets scientifiques.

161

INTRODUCTION AU DESSIN ARCHOLOGIE 14T019 Travaux pratiques à choix pour le bachelor en Archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3

Jour

mardi 8h15 – 12h

Lieu

Uni Carl Vogt


travail personnel

Responsable


Enseignant(e)s Mesdames M. BESSE (pas), E. GUTSCHER (dess.).

Divers Ce cours a lieu tous les ans. Contenu Cet enseignement a pour objectif un apprentissage des bases pratiques et théoriques du dessin archéologique : dessins d’objets et dessins de structure, plans/stratigraphies avec les outils adaptés. Le cours permettra à l’étudiant(e) d’apprendre et de faire l’expérience du dessin archéologique. Mise en pratique de l’illustration traditionnelle : relevé et mise au net de dessins d’objets ainsi que la réalisation de dessins plans/stratigraphies avec l’apprentissage du logiciel Illustrator.

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INTRODUCTION AUX METHODES DE RECHERCHE EN DIGITAL HUMANITIES

14B779

Semestre


ECTS

3


Compte-rendu écrit d’un travail de recherche publié sur un carnet de recherche en ligne ouvert spécialement pour le cours

Sessions d'examens


Responsables

Messieurs B. STRASSER – 022.379.0712 - [email protected] J. BAUDRY – 022.379.3375 - [email protected] Madame E. TANCOIGNE – 022.379.3390 - [email protected]

Enseignant(e)s

Madame E. TANCOIGNE (postdoc), Messieurs J. BAUDRY (postdoc);; B. J. STRASSER (po);; intervenants externes

Divers

N’AURA PAS LIEU EN 2018-2019 Ce cours s’adresse principalement aux étudiants en master ou en doctorat en sciences naturelles, humaines ou sociales, ainsi qu’aux chercheurs Contenu & objectif L’objectif de ce séminaire est d’explorer les nouvelles méthodes de recherche en “Digital Humanities”, en particulier pour la recherche sociologique et historique. La production croissante de sources numériques (blogs, tweets, forums, emails) et la numérisation extensive de corpus anciens (Gallica, Digital Public Library of America, Venice Time Machine) présente des opportunités et des défis nouveaux pour les chercheurs. L’analyse thématique de larges corpus de textes (“topic modeling”), l’utilisation de médias sociaux comme sources historiques, le recours aux infographies géolocalisées, ou la production collective de textes représentent autant de pratiques susceptibles de transformer le métier de chercheur.

163

INTRODUCTION TO SYSTEMS BIOLOGY 14F018 Course and exercises Period

Spring year 40h

ECTS 3

Day & place Monday 9h30-11h30 Information : https://chamilo.unige.ch/home/courses/14F018/ Please contact [email protected] for further details.


Exam sessions June + catching August-September Person in charge

F. LISACEK – 022.379.5988 – [email protected]

Teacher F. LISACEK (mer) Contents 1.Background - The origin(s) of systems biology - The -omics landscape 2.Methods and tools - Network biology - Network analysis - Standards for data representation 3.Examples of modelling and simulation - Classical examples - Towards synthetic biology Objective This course gives an overview of issues in bioinformatics applied to the analysis and integration of -omics data. It also covers basics in underlying modelling approaches, illustrated with some applications and highlighting recent trends.

164

LA GENETIQUE DANS LA PRATIQUE MEDICALE AU QUOTIDIEN : DU LABORATOIRE AU CHEVET DU PATIENT

223O305

Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 14h - 16h

Lieu

CMU, salle à confirmer


examen écrit

Sessions d'examens

décembre

Responsables

Monsieur J.-L. BLOUIN - 022 379.5692 - jean-[email protected] Madame F. SLOAN-BENA - 079 553 4172 - [email protected] Monsieur M. GUIPPONI - 022 379 5809 - [email protected] Département de Médecine Génétique et Développement, CMU (9ème étage)

Enseignant(e)s Monsieur J.-L. BLOUIN (PhD, privat-docent, FAMH génétique médicale), Madame F. SLOAN-BENA (PhD, privat-docent, FAMH génétique médicale), Monsieur M. GUIPPONI (PhD, Privat-docent) et collaborateur(trice)s.

Divers Inscription auprès du secrétariat des étudiants de la Faculté de Médecine. Contenu Proposé dans les cours à option des la Faculté de médecine, ce cours est également ouvert aux étudiants de la Faculté des sciences et des autres facultés.

La médecine génétique (génétique humaine et médicale) et ses outils technologiques connaissent un développement fulgurant ces dernières années. Les nouvelles possibilités diagnostiques transportent désormais les biologistes, les médecins et les patients vers les nouveaux défis de la médecine personnalisée.

La médecine génétique interagit avec toutes les spécialités médicales pour aider au diagnostic de maladies fréquentes ou rares permettant d’améliorer la surveillance médicale et le traitement des patients.

Ce cours à option se propose de fournir les outils indispensables pour la compréhension de la médecine génétique au quotidien. Les diverses approches cliniques et analytiques illustrant la pratique courante seront ainsi présentées à travers de situations concrètes

Des spécialistes dans différents domaines (oncologie, neurologie, cardiologie et hémostase) viendront présenter leur expérience et l’apport grandissant de la génétique dans la prise en charge de leur patient

165

LA GENETIQUE DANS LA PRATIQUE MEDICALE DE DEMAIN: DE LA RECHERCHE VERS LES NOUVEAUX CONCEPTS DE DIAGNOSTIC niveau avancé

223O321

Semestre


ECTS

2

Jour

jeudi 14h - 16h

Lieu

CMU, salle à confirmer


examen écrit

Sessions d'examen

juin

Responsables

Monsieur J.-L. BLOUIN - 022 379.5692 - jean-[email protected] Madame F. SLOAN-BENA - 079 553 4172 - [email protected] Monsieur M. GUIPPONI - 022 379 5809 - [email protected]

Département de Médecine Génétique et Développement, CMU (9ème étage)

Enseignant(e)s Monsieur J.-L. BLOUIN (PhD, privat-docent, FAMH génétique médicale), Madame F. SLOAN-BENA (PhD, privat-docent, FAMH génétique médicale), Monsieur M. GUIPPONI (PhD, Privat-docent) et collaborateur(trice)s.

Divers Inscription auprès du secrétariat des étudiants de la Faculté de médecine. Pour des raisons d’organisation le cours ne sera pas donné si le nombre d’inscriptions est inférieur à 10 étudiants (date limite d’inscription 15 décembre). Contenu Proposé dans les cours à option de la Faculté de médecine, ce cours est également ouvert aux étudiants de la faculté des Sciences et des autres facultés.

Ce cours, qui suit et complète le cours de médecine génétique proposé lors de la session d’automne (223O305, La génétique dans la pratique médicale de demain : de laboratoire au chevet du patient) propose une revue des concepts les plus avancés dans le décryptage de l’exome, du génome, et des mécanismes liés à sa régulation ou au maintien de son intégrité. Les dernières stratégies et leurs applications en diagnostic pour isoler les mutations pathogènes à partir des données de séquençage massif, les mécanismes épigénétiques, et de réparation de l’ADN y seront aussi discutés. Quelques cours spécifiques seront dispensés en langue anglaise.

166

MASTER COURSE IN GENETICS, DEVELOPMENT AND EVOLUTION

14B017

Period

Autumn/Spring 3h/week, year 84h

ECTS 9

Day Thursdays, from 9.15 to 12.00 Place

Sciences III, Room 4059

Evaluation mode

Written exam

Exam sessions June + catching August-September Persons in charge

E. NAGOSHI – 022 379 6346 – [email protected] M. GONZALEZ GAITAN – 022 379 64 61 – [email protected]

Teachers L BECCARI (ma), B. GALLIOT (pas), M. GONZALEZ GAITAN (po), F. KARCH (po), R. LOEWITH (po), M. MILINKOVITCH (po), E. NAGOSHI (pas), R. PILLAI (po), I. RODRIGUEZ (po), A. SANCHEZ-MAZAS (po), D. SHORE (po), F. STEINER (past), T. HALAZONETIS (po), J. ZAKANY (mer), M. VOGG (ma), E. POLONI (biol,cc), M. CURRAT (mer).

Miscellaneous Course given in English, open to 3rd year Biology or Biochemistry students (« cours à choix »), master students and graduate students.

Contents The research group leaders (PI) offering master projects in the Genetics, Development and Evolution Master program give 6 hours teaching in two successive sessions. In the first session each of them provides an introduction to his/her field of research and in the second the students will organize a mini-symposium to discuss a central paper of the field. For the written exam students will have to answer a series of short questions related to the reference document given by each PI.

Compulsory course for the master in biology option «Genetics, Development and Evolution»

167

MEDECINS ET SCIENTIFIQUES AU CINEMA 223O122 Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 14h15 – 16h (exceptionnellement jusqu’à 18h selon projections de films)

Lieu

CMU


rédaction d’un dossier de présentation d’un film (données factuelles, synopsis, analyse thématique et formelle, appréciation personnelle)

Responsables

Monsieur A. WENGER – 022.379.4602 – [email protected] Monsieur B. STRASSER – 022.379.0712 - [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs A. WENGER (pas), Bruno J. STRASSER (po) et intervenants invités.

Divers

N’EST PAS DONNE EN 2018/2019

Ce séminaire est ouvert aux étudiants de 2ème et 3ème années. Important: le nombre de places pour le séminaire étant limité, une pré-inscription par e-mail est demandée : [email protected] Contenu Ce séminaire propose une réflexion sur la représentation des figures du médecin et du scientifique dans le cinéma de fiction. L'évolution des représentations du scientifique et du médecin reflète le changement des conditions dans lesquelles s’exercent leurs activités. Elle témoigne également des espoirs et des craintes associées au progrès scientifique et médical. Au cours du 20e siècle, le cinéma a étoffé le répertoire identitaire à partir duquel s'est construit l’image du médecin et du scientifique contemporains. C’est en repérant les différentes figures de ce répertoire, dans leurs contextes historiques, que l’on peut comprendre la recomposition actuelle des identités du médecin et du scientifique dans la société. Thèmes abordés : Figures du médecin (le médecin humanitaire ;; le grand patron ;; l’expérimentateur fou ;; etc.). Figures du scientifique (scientifique fou, diabolique, génial, sacrifié, etc.) Genres cinématographiques (fiction, documentaire, caricature, pamphlet, etc.) Modalités des représentations cinématographiques du progrès des connaissances scientifiques et médicales au long du 20e siècle. Liens entre les représentations cinématographiques et le contexte historique (progrès, découvertes et/ou émergence de nouvelles disciplines scientifiques ;; période de guerre ;; etc.) Construction d’une mémoire collective des disciplines médicales et scientifiques à travers la biographie de grands hommes ou de figures emblématiques. Objectif Savoir analyser une séquence de film. Savoir identifier les différents composants des figures de scientifiques et du médecin. Savoir remettre les représentations cinématographiques dans leurs contextes historiques, scientifiques et médicaux.

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MENACES ET CONSERVATION DE LA BIODIVERSITE 14E155 Semestre

printemps total 7X4 28h

ECTS

3

Jour

Cours bloc, 7 après-midis, mardi 14h – 17h 19, 26 avril, 3, 10, 17, 24, 31 mai 2019

Lieu

Uni Carl Vogt


examen écrit

Pré-requis

aucun

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LEHMANN - 022.379.0021 – [email protected]

Enseignant Monsieur A. LEHMANN (pas).

Contenu Sept thèmes principaux sont abordés : - Impacts des changements climatiques sur la biodiversité - Fragmentation du territoire et réseaux écologiques - Espèces envahissantes - Relation entre agriculture et biodiversité - Pollutions et surexploitation - Renaturation des écosystèmes et réintroduction d’espèces - Politique de la conservation Finalement, des lectures d'articles scientifiques sont proposées afin d'accompagner le cours.

Objectif Ce cours est organisé autour de présentations d'intervenants externes pour illustrer les menaces et les mesures de conservations à différentes échelles (UNEP, IUCN, WWF, Pro Natura, Services cantonaux, Services Fédéraux,...).

169

METHODOLOGIE DE LA RECHERCHE EN ARCHEOLOGIE PREHISTORIQUE

14T004

Cours obligatoire bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie

Semestre


ECTS

6

Jour

mardi 8h15 – 10h

Lieu

Uni Carl Vogt


examen oral

Sessions d'examens

juin + rattrapage août-septembre et février

Responsable

Madame M. BESSE - 022.379.6915 - [email protected].

Enseignant(e)s T. STEIMER (ce) et collab.

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS. Ce cours a lieu en 2018-2019. N’aura pas lieu en 2019-2020. Contenu Cet enseignement de niveau bachelor présente les procédés de l'analyse archéologique, de la planification d'une fouille à la publication des résultats scientifiques à travers la mise en forme de l'information recueillie. Nous présentons un tour d'horizon des domaines de recherches (sciences naturelles, physiques et chimiques) mis à contribution à différents moments et niveaux de la démarche (stratigraphique, étude spatiale, sériation typologique, environnement, sédimentologie, etc.). Le cours est largement illustré par des cas concrets.

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METHODOLOGIE DE LA RECHERCHE EN ARCHEOLOGIE PREHISTORIQUE Travaux pratiques

14T005

Travaux pratiques bligatoire bachelor en archéologie préhistorique et antrhropologie

Semestre


ECTS

6

Jour

vendredi 8h00 - 12h00

Lieu

Uni Carl Vogt


recherche personnelle et rapport écrit

Sessions d'examens


Responsable

Madame M. BESSE - 022.379.6915 - [email protected].

Enseignant Monsieur F. COUSSEAU (postdoc).

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS. Ce cours a lieu en 2018-2019. N’aura pas lieu en 2019-2020. Contenu Cet enseignement de niveau bachelor offre aux étudiant.e.s l'opportunité d'analyser une collection d'objets préhistoriques et de les interpréter dans leur contexte archéologique, ou de participer à l’organisation d’un événement autour de la préhistoire (exposition notamment)

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METHODOLOGIE DE LA RECHERCHE EN ARCHEOLOGIE PREHISTORIQUE : CARTOGRAPHIE, TOPOGRAPHIE ET STATISTIQUE

14B068

Obligatoire pour le bachelor ès Lettres mention archéologie préhistorique et anthropologie Semestre

automne total 18h

ECTS

2

Jour

à fixer (cours bloc)

Lieu



examen oral

Sessions d'examens

janvier/février + rattrapage août-septembre

Responsable


Enseignant(e)s Messieurs E. HUYSECOM (pas), J.-M. NUNES (ce), Madame A. SANCHEZ-MAZAS (po), et collaborateurs.

Divers


Contenu Méthodes de cartographie en archéologie, éléments de topographie et de planimétrie, introduction aux méthodes statistiques en Préhistoire. Objectif Acquisition des notions élémentaires de cartographie, de topographie et de statistique dans le domaine de la Préhistoire ;; maîtrise du maniement des instruments topographiques

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METHODOLOGIE DE LA RECHERCHE EN BIOLOGIE 14B751 Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 10h - 12h

Lieu



exposés oraux

Pré-requis

niveau minimum 3ème année de biologie acquise.

Responsable en 2018-2019

Monsieur M. CURRAT – 022.379.6979/67 - [email protected]

Enseignant(e)s Mesdames E. POLONI (cc), A. SANCHEZ-MAZAS (po) Messieurs M. CURRAT (mer), D. DI (ma), T. GOEURY (as), M. MOUTERDE (as), J.M. NUNES (ce), J. RIO (as).

Divers Important: le nombre de places pour le séminaire étant limité,

une pré-inscription par e-mail est demandée : [email protected], Lectures d’articles en anglais. Enseignement en français (étudiants : possibilité de présentations en anglais) Objectif - contenu Ce séminaire consiste en une présentation critique par les étudiant(e)s de travaux de recherche publiés dans la littérature scientifique. Les étudiants doivent se mettre dans la peau des experts scientifiques qui évaluent les articles soumis pour publication! Les exemples sont choisis par les enseignants de manière à illustrer toutes les démarches qui conduisent de l’idée d’une recherche à sa publication, à savoir: construction d'hypothèses, plan d'expérience, analyse de données, rédaction et mise en forme. Les domaines de recherches abordés concernent la biologie générale et humaine, l'évolution, la biologie du comportement et d'autres sujets d’intérêt choisis en concertation avec les participant(e)s. Ce séminaire est une initiation fondamentale à la lecture scientifique et au développement d’un esprit critique, indispensables à la recherche (déjà au niveau du travail de monographie de bachelor et du travail de master).

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MICROBIOLOGIE GENERALE I – automne 13B011 Cours à choix restreint de 3ème année (1er semestre) Semestre


ECTS

3

Jour

mardi 10h15-12h

Lieu



Présentation orale et rapports sur les différents sujets. Examen écrit conjoint avec l’examen de microbiologie II pour la partie virologie

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s Messieurs F. BARJA (cc), M. TONOLLA (cc), Madame C. TAPPAREL (pa).

Divers Le cours de microbiologie générale est structuré en deux parties ;; l'une au semestre d'automne (13B011) et l’autre au semestre de printemps (13B014). La note annuelle est la moyenne des 2 notes obtenues. Le cours doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. Il n’est pas possible de prendre uniquement un semestre comme cours à choix libre. Contenu Présentation des micro-organismes du point de vue de leur structure, physiologie, écologie, fonctions et applications industrielles. Bactéries (physiologie et fonctions). Facteurs exogènes et croissance microbienne. Méthodes classiques et moléculaires d’analyse des micro-organismes. Notions de phylogénie, taxonomie et typage des procaryotes. Métabolismes énergétiques et changements de voies métaboliques selon la source de carbone. Biotechnologie : généralités sur les fermentations, biotransformations, microorganismes impliqués. Lecture et analyse critique d’articles en relation avec les sujets spécifiques choisis pour une présentation orale. Mycologie (moisissures, levures, champignons filamenteux et oomycètes). Les virus, leurs particularités et leurs fonctions. Objectif Distinguer et comparer les différents microorganismes Décrire, reconnaître et expliquer le rôle des facteurs exogènes sur la croissance microbienne, ainsi que les concepts de phylogénie, taxonomie, typage et les métabolismes des procaryotes. Faire ressortir l’importance et les fonctions des microorganismes impliqués dans les fermentations. Développer et intégrer leur rôle socio-économique. Concevoir une présentation orale et écrite en intégrant les données de la littérature. Développer et argumenter le rapport écrit et la présentation orale. Argumenter, articuler et critiquer l’implication des fermentations bactériennes dans les secteurs environnementaux et industriels. Acquérir les notions de base en virologie à l’aide d’exemples : diversité des virus, cycle de réplication, variabilité, défense innée contre les infections et stratégies virales d’échappement

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MICROBIOLOGIE GENERALE II – printemps 13B014 Cours à choix restreint de 3ème année (2ème semestre) Semestre


ECTS

3

Jour

mardi 10h15-12h

Lieu



examen écrit de 4 heures, présentation orale pour la partie « protiste »

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s Mesdames F. STUTZ (po), V. DUCRET (lab), Messieurs J. PAWLOWSKI (pas), K. PERRON (ce).

Divers Le cours de microbiologie générale est structuré en deux parties;; l'une au semestre d'automne (13B011) et l’autre au semestre de printemps (13B014). La note annuelle est la moyenne des 2 notes obtenues. Le cours doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. Il n’est pas possible de prendre uniquement un semestre comme cours à choix libre. Contenu Mécanismes moléculaires de la croissance et reproduction des levures utiles et pathogènes. Ecologie moléculaire des protistes. Lecture, analyse et présentation orale d’articles. Bactéries (antibiotiques, bactériophage, communication bactérienne, bactériologie médicale). Lecture et analyse d’articles. Documentation et bibliographie sur Chamilo.unige.ch Objectif Enumérer, illustrer et comparer les modèles théoriques de mécanismes moléculaires de croissance et de reproduction des microorganismes. Nommer et identifier les différents types de bactéries. Développer et argumenter l’importance de la microbiologie dans les secteurs : environnementaux, médicaux, humains.

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MICROBIOLOGIE GENERALE 13B911 Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre

printemps – 3 semaines 4h/sem, total 60h

ECTS

3

Jour

18 février au 08 mars 2019 de 14h00 -18h00

Lieu

Sciences III – salle 0016


Présence obligatoire avec une participation active aux séances. Rapports notés (exposé oral ou rapport écrit).

Co-requis

Suivre en parallèle le cours de Microbiologie générale (13B011 semestre d'automne et 13B014 semestre de printemps).

Responsable


Enseignant(e)s Mesdames F. STUTZ (po), M. HOLZMANN (adj-sc), V. DUCRET (lab) Messieurs F. BARJA (cc), J. PAWLOWSKI (pas) K. PERRON (ce) et collaborateur(trice)s.

Divers Nombre de participants : minimum 5 - maximum 20. L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire. Le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site internet de Biologie et devra être remis au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor. Contenu Yeast two-hybrid, une méthode pour chercher des partenaires moléculaires. Fermentation acétique (bactéries acétiques - production de vinaigre). Suivi des paramètres physico-chimiques de la fermentation, détermination de la biomasse totale et du nombre de bactéries viables/non viables et cultivables, extraction des acides nucléiques de ces bactéries. Production de cellulose par les bactéries acétiques dans différentes conditions de culture. Analyse microbiologique de l’eau, antibiogramme, détermination de bactéries. L'ADN environnemental et la diversité des protistes. Protocoles, diapositives et articles de référence disponibles sur Chamilo.unige.ch Objectif Illustrer, découvrir et d’explorer certaines méthodes moléculaires et d’analyses microbiologiques, ainsi que déterminer, mesurer, calculer et illustrer les différents paramètres physico-chimiques indispensables pour effectuer une fermentation microbienne en interprétant les données et tirer les conclusions des expériences. Concevoir et planifier les protocoles expérimentaux. Expliquer les changements de métabolisme des bactéries selon leur source de carbone.

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MICROBIOLOGIE MOLECULAIRE DES MILIEUX HYDRIQUES : Détection et typage des microorganismes

14B053


automne total 28h

ECTS

3

Jour

3 jours consécutifs pause inter-semestres

Lieu

A déterminer


rapport écrit

Responsable

Monsieur M. TONOLLA - 058 666 62 69– [email protected] [email protected] Ecologie microbienne, Unité de microbiologie, Dép. Biologie végétale, Université de Genève, 30 Quai Ernest-Ansermet, 1211 Genève 4, Suisse et Laboratory of applied microbiology, University of Applied Sciences Southern Switzerland (SUPSI), Via Mirasole 22A, 6500 Bellinzona

Enseignant Monsieur M. TONOLLA (cc).

Divers Enseignement en français/anglais. Contenu Utilisation des méthodes moléculaires pour la détection et le typage des microorganismes, applications dans les domaines de l’écologie microbienne, microbiologie médicale et biosécurité. Phylogénie et étude de la biodiversité microbienne, structure et dynamique des populations microbiennes dans l'environnement, des activités biologiques et des interactions. Caractéristiques et dynamiques des écosystèmes hydriques stratifiés en relation avec les communautés microbiennes. Interactions entre conditions physico-chimiques du milieu et les populations microbiennes et entre ces dernières et les autres organismes. Site internet : https://chamilo.unige.ch/ La page internet permet l'accès au polycopié de base du cours et de communiquer avec l'enseignant. Lors des leçons, des commentaires complémentaires seront donnés ainsi qu'un fascicule. Objectif Compréhension du rôle de la vie microbienne dans l'évolution et l'écologie de la biosphère. Application des concepts écologiques classiques aux populations et communautés microbiennes. Principes sous-jacents qui conduisent à la structure de la population microbienne. La dynamique de la communauté à la fois au niveau moléculaire et de l’organismique. Interactions abiotiques et biotiques au sein des communautés microbiennes. Métabolismes microbiens et cycles biogéochimiques. Approches moléculaires pour examiner la structure de la communauté microbienne et sa fonction.

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MICROBIOLOGIE 22H002 Semestre

automne/printemps 4h/puis 2 sem, total 56h

ECTS

5

Jours & lieux

début du cours le vendredi 19 octobre 2018 Enseignement le vendredi et le lundi du 19 octobre au 16 novembre 2018 pendant 4 semaines puis uniquement le vendredi à partir du 23 novembre 2018. lundi 15h15 - 17h00– CMU vendredi 14h15 - 16h00 – CMU Semestre de printemps : le vendredi, du 22 février au 1er juin 2019.


examen écrit (pour les étudiants en sciences pharmaceutiques: examen conjoint avec le cours de bactériologie 14B004)

Sessions d'examens


Responsable

Professeur P. LINDER - 022 379 5484 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs P. LINDER (po), L. FANTAO, L. KAISER (po) Mesdames C. TAPPAREL (past), M BROCHET (PAST), C.-A. SIEGRIST (po).

Divers Cours obligatoire pour le baccalauréat universitaire en sciences pharmaceutiques 2ème année. Acquérir des connaissances de base des principaux agents infectieux, de leurs mécanismes de pathogénicité et de moyens de lutte à disposition (antibiotiques, agents chimiothérapeutiques, vaccin, etc.) Contenu Microbiologie générale : structure de la cellule bactérienne, des champignons et des virus ;; génétique, génie génétique, thérapie génique ;; antibiotiques, antifongiques, antiviraux (modes d’action et résistance). Microbiologie médicale : relations hôte-parasite bactéries, virus, champignons, parasites. Bibliographie • Brock: Biologie des micro-organismes;; M. Madigan et J. Martinko, 11ème édition • Fundamentals of Molecular Virology, N.H. Acheson • Virology Molecular Biology and Pathogenesis, L.C. Norkin • Flint Principles of Virology 3rd ed 2009 • Polycopié, diapositives et articles de référence sur Chamilo

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MICROSCOPIE ELECTRONIQUE 14B044 Cours et stage pratique Semestre

printemps – 9 jours 63h/ 2 semaines, total 63h

ECTS

5

Jour

26 mars au 05 avril 2019 (6h par jour)

Lieu

Sciences III, salle TP 0016

Pré-requis Ce cours est destiné aux étudiant(e)s en 3ème année de bachelor, ou en master/ doctorat.


examen oral (présentation des résultats)

Sessions d'examens juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsable

Monsieur Ch. BAUER - 022.379.66.32 - [email protected]

Enseignant(e)s

Messieurs Ch. BAUER (cc), J. BOSSET (Adj sc), S. LOUBERY (cc), Madame R. MARTINI (pas).

Divers Inscription : du 30 août au 15 décembre de chaque année.

Le nombre de participants étant limité à 12, merci de joindre une lettre de motivation. Inscription obligatoire : [email protected]

Pour toute information, veuillez contacter Christoph Bauer, Centre de Bioimagérie, Science II Contenu La partie pratique est consacrée à : l’ultramicrotomie, la coloration de coupes, le negative staining, la cryo-microscopie électronique, l’immunomarquage à l’or, la préparation d’échantillons pour la microscopie à balayage et l’observation au microscope électronique à transmission et à balayage. Bibliographie et documents seront sur Chamilo.unige.ch Objectif L’objectif de ces travaux pratiques est que chaque étudiant acquière des connaissances sur les méthodes de préparation et coupes de différents types d’échantillons (tissu végétal, animal et micro-organismes), ainsi que la manipulation du microscope électronique à transmission et à balayage.

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MICROSCOPY AND IMAGING COURSE 14B063A Intermediate level course with priority for master and PhD students Period Autumn

36h/ 2weeks, year 35h

ECTS 3 (2 for PhD students)

Day Workshop over nine days (4 hours per day)

Place

Sciences II, room 245 02. - 12. October 2018

Requirements Interest in microscopy

Examen sessions February + catching August-September Person in charge

Christoph BAUER - 022.379.66.32 – [email protected]

Teachers Ch. BAUER (cc), J. BOSSET (Adj sc), S. LOUBERY (cc), D. MOREAU (scs)

Miscellaneous Course given in English, « cours à choix » open to 3rd year Biology or Biochemistry or Pharmacy students. In order to be accepted students interested to take this course need to send a letter of motivation (by e-mail) at least six weeks before its start. The course gives priority to master and PhD students. Contents a) Physical basis of microscopy b) Bright field microscopy c) Fluorescence microscopy d) Confocal microscopy e) Imaging of live samples, f) High content microscopy g) Advanced methods (FRAP, FRET, super-resolution) h) Qualitative and quantitative image analysis. i) ImageJ theoretical and practical (hands-on) sessions Objective The objective of this course combining theory and hands-on is to give students a theoretical and practical introduction into different microscopes and microscopical techniques. At the end of this course students should have an overview and broadened knowledge on using microscopy for their research projects.

180

MILESTONES IN PLANT MOLECULAR GENETICS SELECTED CHAPTERS

14B023

Open to 3rd year Biology and Biochemistry students, and to Master students. Period


ECTS 4

Time The course is scheduled every other week An initial meeting will be scheduled at the beginning of the autumn semester, please contact : [email protected]

Place


Evaluation mode Certificate, continuous evaluation, active participation in the course Person in charge

M. HOTHORN - 022 37 93013 - [email protected]

Teachers M. HOTHORN (pas), L. LOPEZ MOLINA (pas), R. ULM (po). Miscellaneous Course given in English, open to 3rd year Biology or Biochemistry students (cours à choix), master students and graduate students Contents Students read, present and discuss important classical papers describing significant breakthroughs in plant genetics and plant molecular biology. Objective Understand how different fields of plant biological research have developed and evolved. Exercise critical reading of the scientific literature. Understand experimental methods and the importance of technical innovations. Develop oral presentation skills.

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MODELISATION ET SIMULATION DE PHENOMENES NATURELS 14X015 Cours à choix restreint de biologie 3ème année Semestre


ECTS

4 (6 pour les biologistes)

Jour

vendredi 12h - 16h

Lieu

Batelle 405-407, Carouge


examen oral + travaux pratiques

Pré-requis

Systématique de 2ème année

Responsable

Monsieur B. CHOPARD – 022 379 02 19 – [email protected]

Enseignant(e)s Messieurs B. CHOPARD (po), J.-L FALCONE (col. Scientifique I & II), J. LATT (mer).

Contenu Concepts de modélisation informatique de processus naturels Les systèmes dynamiques La dynamique moléculaire et méthode de Monte-Carlo Les simulations à événements discrets Systèmes multi-agents Les Automates Cellulaires La méthode de Boltzmann sur réseau Les réseaux complexes Objectif Introduction à des méthodes de modélisation et de simulations de phénomènes naturels et de systèmes complexes. Mise en oeuvre informatique de modèles qui illustrent le cours en utilisant le langage python.

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MOLECULAR BIOLOGY JOURNAL CLUB AND PROGRESS REPORTS

14B778

Seminar for PhD students and postdocs Period


ECTS 5

Day

Friday 11:00 – 12:00

Place


Prerequisites Master in Biology or equivalent Person in charge

HALAZONETIS Thanos – 022.379.6112 – [email protected]

Coordinator HALAZONETIS Thanos (po) Miscellaneous The language of the seminars is English. Contents This course consists of a series of seminars presented by the PhD students and post-doctoral fellows of the Department of Molecular Biology In the Autumn semester, each PhD student presents a research paper, chosen in agreement with one of the course coordinators. In the Spring semester, the PhD students present a progress report on their research project. Once per year, the postdoctoral fellows present a progress report.

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MOLECULAR PLANT SCIENCES - Basic Research 14B035 Period Autumn 2h/week, year

28h ECTS 4

Day Friday 11:15 – 13:00 Place



Exam sessions February + catch-up/repeat August-September Persons in charge

FITZPATRICK Teresa - 022.379.3016 - [email protected] ULM Roman – 022.379.3650 - [email protected]

Teachers T. FITZPATRICK (po), Y. NACIRI (cc), M. HOTHORN (pas), L. LOPEZ-MOLINA (pas), X. PERRET (mer), R. ULM (po).

Miscellaneous

Course taught in English (will take place in 2019) The course Molecular Plant Sciences is taught every Autumn alternating between Basic Research (this course) in one year and Applied Aspects (14B037) the other year. Detailed information on the program can be found under: http://www.unige.ch/sciences/biologie/biveg/enseignement/master/program.html. Contents All life on earth depends on plants. The courses being offered in “Molecular Plant Sciences – Basic Research” and “Molecular Plant Sciences – Applied Aspects” are designed to provide a broad understanding into the rapid advances that are occurring in the field of plant biology at the molecular level. The individual courses are taught on alternating years. “Molecular Plant Sciences” will showcase selected basic research programmes currently being conducted in the Department of Botany and Plant Biology. Topics include light perception and signalling, chloroplast biogenesis and light acclimation, signal perception and transduction by membrane-integral receptor proteins, vitamin metabolism and environmental stress responses, control of seed germination, and symbiotic nitrogen fixation. In the first of two sessions, each research group leader provides an introduction to his/her field of research. In the second session, the research group leader discusses in more detail his/her current research and the students present papers related to the field. Objective Understand plant science at the molecular level through an integrative approach combining developmental processes, genetics, cell biology, biochemistry, physiology and the response to environmental factors as well as learn how to orally present research findings. Leads to improvement of fundamental skills for scientific work in the modern field of plant science and its related areas.

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MOLECULAR PLANT SCIENCES – Applied Aspects 14B037 Compulsory course for the option « Molecular Plant Sciences» of the master Period Autumn 2h/week, + readings +

visits year 28h

ECTS 4

Day

Friday 11:15 – 13:00

Place


Evaluation mode

Research work

Exam sessions February + catch-up/repeat August-September Persons in charge

FITZPATRICK Teresa - 022.379.3016 - [email protected] ULM Roman – 022.379.3650 - [email protected]

Teachers T. FITZPATRICK (po), J.-L. WOLFENDER (po), invited speakers from industry.

Miscellaneous

Course taught in English (will take place in 2018) The course Molecular Plant Sciences is taught every Autumn alternating between Basic Research (14B035) in one year and Applied Aspects (this course) the other year. Detailed information on the programme can be found under : http://www.unige.ch/sciences/biologie/biveg/enseignement/master/program.html. Contents All life on earth depends on plants. The courses being offered in “Molecular Plant Sciences – Basic Research” and “Molecular Plant Sciences – Applied Aspects” are designed to provide a broad understanding into the rapid advances that are occurring in the field of plant biology at the molecular level. The individual courses are taught on alternating years. “Molecular Plant Sciences – Applied Aspects” is designed to highlight current applied aspects of plant biology, agronomy and biotechnology. Lectures will be presented by members of Swiss agricultural research stations as well as major players from the industrial sector. Site visits to research stations or companies will also form part of the program. The course also includes presentations by the students of current topics in applied plant sciences. Objective Understand the application of molecular aspects of different agronomical and biotechnological plant science research. Examples and emphasis is placed on players from the Swiss industrial sector and agricultural research stations and provides insight into the real working requirements of applied research.

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NEUROSCIENCES : CHEMICAL SENSES 14N12 Period Autumn

2h/week, year 28h

ECTS 3

Day Tuesday 17 :15 – 19 :00

Place


Evaluation mode Written exam Person in charge

I. RODRIGUEZ – 022.379.3101 – [email protected]

Teachers M.C. BROILLET (mer) A. CARLETON (pas), S. LACROIX (pas), B. LANDIS (phd), J. DAL COL (adj. Sci). C. MARGOT (cc), R. MAURER (mer), I. RODRIGUEZ (po).

Miscellaneous

N’AURA PAS LIEU EN 2018/2019

Course taught in english. Contents - odors and pheromones - mammalian olfactory subsystems - taste - chemosensory signal transduction - integration of olfactory signals - from chemistry to perfumery - smell versus sight in rodents - olfaction and reproduction - olfaction in insects - parosmias, phantosmias, anosmias... human olfactory pathologies

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NEUROBIOLOGIE DE LA REPRESENTATION SPATIALE (LA) 7312D Cours dispensé par la Faculté de psychologie et des sciences de l’éducation. Semestre


ECTS

3

Jour

lundi 12h15 – 13h45

Lieu

Uni Mail, salle R070 (sous réserve : voir site du cours, indiqué ci-dessous)


travaux évalués en cours de semestre

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur R. MAURER – 022.379.9120 – [email protected]

Enseignant

Monsieur R. MAURER (mer).

Divers A lieu tous les deux ans

N'aura pas lieu cette année (2018-2019);; aura lieu en 2019-2020. La page web http://ethologie.unige.ch donne accès aux ressources du cours et aux informations pratiques. Suivant le nombre d'étudiants, le cours peut prendre la forme d'un séminaire certaines semaines Contenu En 1971, on découvrait dans l'hippocampe du rat (une structure du lobe temporal profond impliquée dans la mémoire) des cellules de lieu : des neurones qui déchargent quand l'animal est en un certain point de sa surface de locomotion, indépendamment de l'orientation dans laquelle il se trouve;; en 1984, on découvrait près de l'hippocampe des cellules de direction de la tête, qui déchargent en fonction de l'orientation de l'animal dans le plan, indépendamment de sa position sur celui-ci. Position et orientation sont les primitives de la représentation spatiale : on avait donc identifié, au niveau neuronal, des éléments constitutifs de cette représentation. Plus récemment, les cellules "de grille" du cortex entorhinal sont venues compléter ce tableau, en y ajoutant les mécanismes liés à la prise en compte des déplacements. Ces découvertes ont généré une fructueuse ligne de recherche en neurosciences cognitives, chez le rongeur (cf. prix Nobel de physiologie ou médecine 2014) mais aussi chez les primates non humains et à un niveau plus macroscopique, chez l'humain, qui a permis une analyse à tous les niveaux, du comportemental (au travers des paradigmes spatiaux actuels les plus importants comme l'open-field, le labyrinthe radial ou la "piscine" de Morris) au neuronal (par des méthodes d'électrophysiologie et d'imagerie cérébrale), d'une fonction cognitive essentielle et complexe. Le cours passe ces travaux en revue, jusqu'aux plus récents, et abordera la question plus générale des mécanismes neuronaux de la mémoire et du lien entre mémoire spatiale et mémoire épisodique. Objectif Comprendre les mécanismes et représentations (jusqu'au niveau neuronal) sous-jacents à l'orientation spatiale, une fonction cognitive de première importance présente chez toutes les espèces mobiles et cruciale pour les humains, bien que peu décrite dans les manuels de psychologie cognitive.

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OPTIQUE ET LASER 14P021 Semestre

automne 2h/sem, total 42h + 1heure d'exercice

ECTS

5

Jour

jeudi 14h - 17h

Lieu

salle 306 à Sciences I


examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur H. ZBINDEN - 022.379.0504 – [email protected]

Enseignant

Monsieur H. ZBINDEN (pas).

Contenu L'optique est appliquée aujourd'hui dans presque tous les laboratoires scientifiques. Ce cours s'adresse aux étudiants de 3ème et 4ème années, qui souhaitent apprendre les bases de l'optique. Le cours devrait aider l'étudiant à appliquer l'optique et les instruments d'optique au laboratoire. Il y a une heure d’exercices et de démonstrations dans le laboratoire. A la fin du cours des examens oraux auront lieu. · Polarisation, biréfringence, sphère de Poincaré · Interférence, cohérence, interféromètre de Mach-Zehnder, Sagnac et Fabry-Perot · Diffraction de Frauenhofer, diffraction de Fresnel, monochromateur à réseau. · Le mode, loi de Planck, amplification optique · Le résonateur, le faisceau gaussien · Le laser · Les fibres optiques · Quelques expériences de l'optique quantique

188

PALEOANTHROPOLOGIE I 14T018 Travaux pratiques Semestre


ECTS

6

Jour


Lieu

Uni Carl Vogt


évaluation écrite en cours d’année et rapport écrit

Responsable

Madame J. DESIDERI (cc) - 022.379.79.47 - [email protected]

Enseignante

Madame J. DESIDERI (cc).

Contenu Cet enseignement de niveau bachelor vise

- un apprentissage approfondi de l’ostéologie humaine (adultes et immatures)

- une acquisition des méthodes de détermination de l’identité biologique (diagnose sexuelle et estimation de l’âge-au-décès des adultes et estimation de l’âge-au-décès des immatures)

- une introduction à l’étude des populations (recrutement funéraire, NMI, morphoscopie, morphométrie)

Une application concrète à travers l’étude d’une série archéologique sera réalisée au cours des TP

189

PALEOBIOLOGIE ET PALEONTOLOGIE 11T007 Semestre


ECTS

5

Jours

automne: mercredi 13h15 - 15h printemps: jeudi 13h15 - 15h

Lieu

Sciences de la Terre et de l’environnement, 13 rue des Maraîchers, salle 203


examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Madame R. MARTINI - 022.379.6612 – [email protected]

Enseignante

Madame R. MARTINI (pas).

Contenu Le but de ce cours est de mettre en évidence que l’étude de l’histoire géologique et paléontologique de la Terre ne peut, en aucun cas, faire abstraction de la compréhension des milieux actuels. C’est en se basant sur l’observation et l’étude des communautés vivantes que nous pouvons, dans le cadre de la paléobiologie, expliquer le mode de vie des invertébrés marins du passé et comprendre leur évolution. Le cours se propose également de souligner le rôle géologique du fossile dans les datations des roches (biostratigraphie), ainsi que dans les reconstitutions paléoenvironnementales et paléoclimatiques. Le cours s’articule en deux parties :

1. La Paléobiologie : Principales subdivisions du monde organique, systématique et taxonomie, Théorie de l’évolution, Biostratigraphie, Modes de vie des divers organismes, Traces fossiles.

2. La Paléontologie systématique : Étude des phyla suivants : Eponges, Archaeocyathes, Cnidaires, Brachiopodes, Bryozoaires, Arthropodes, Mollusques, Gastéropodes, Céphalopodes, Echinodermes. De chaque groupe seront examinées : l’anatomie, les caractéristiques morphologiques, les stratégies évolutives, la distribution stratigraphique et leur signification paléoécologique.

PALEOBIOLOGIE ET PALEONTOLOGIE 11T507 Camp Semestre

Printemps – 2 jours

ECTS

0.5 (1 pour le bachelor en archéologie préhistorique)


certificat

Responsable


Enseignante


Contenu Ces travaux auront pour but d’apprendre aux étudiants les bases du travail sur le terrain, depuis les observations géologiques, sédimentologistes et biostratigraphiques, jusqu’à l’échantillonnage des roches. Des affleurements remarquables du point de vue de la fossilisation seront également visités.

190

PALEOBIOLOGIE ET PALEONTOLOGIE 11T907 Travaux pratiques Semestre


ECTS

2

Jours

automne: mercredi 15h15 - 17h printemps: jeudi 15h15 - 17h

Lieu

Sciences de la Terre et de l’environnement, 13 rue des Maraîchers, salle 203


contrôles oraux (à la fin de chaque semestre)

Sessions d'examens

en décembre et en mai, dans le cadre du cours

Responsable


Enseignante


Contenu Les travaux pratiques seront consacrés à la description et à la reconnaissance des restes fossiles, des phyla traités dans le cours, c’est-à-dire : Eponges, Archaeocyathes, Cnidaires, Brachiopodes, Bryozoaires, Arthropodes, Mollusques, Gastéropodes, Céphalopodes, Echinodermes.

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PALEOLITHIQUE ET NEOLITHIQUE DE L'AFRIQUE : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

14B062

Cours obligatoire du master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

6

Jour

mercredi 10h - 13h

Lieu



examen oral

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s

Monsieur E. HUYSECOM (pas), et Madame K. DOUZE (AdjSc3).

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. N'A PAS LIEU EN AUTOMNE 2018

Contenu Ce cours aborde les grands mouvements de populations liés aux variations climatiques pléistocènes et holocènes, et les interactions entre l’Homme et son environnement. Dans une première partie, nous exposerons l’état actuel de nos connaissances concernant les origines du peuplement sur le continent africain et régions avoisinantes, la naissance de l’outil, et les principales industries du Paléolithique. Dans une seconde partie, nous discuterons du concept de «néolithisation africaine» et de l’apparition de l’élevage et de l’agriculture, et présenterons un panorama des différentes cultures néolithiques africaines à la lueur des découvertes récentes. Les recherches archéologiques de l’équipe du Laboratoire Archéologie et Peuplement de l’Afrique (APA) sur le gisement d’Ounjougou, au Mali, et dans la vallée de la Falémé, au Sénégal, seront détaillées à titre d’illustration. Objectif Acquisition des principales connaissances dans le domaine concerné.

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PALEOLITHIQUE ET NEOLITHIQUE DE L'AFRIQUE : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

14B762

Séminaire Semestre


ECTS

3

Jour

mercredi 15h - 17h

Lieu



présentation orale et travail écrit

Responsable


Enseignant(e)s

Monsieur E. HUYSECOM (pas), et Madame K. DOUZE (AdjSc3).

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS.

N'A PAS LIEU EN AUTOMNE 2018

Contenu Sujets en relation avec le cours n° 14B062. Objectif Approfondir certains sujets abordés dans le cours n° 14B062, notamment au travers d’un travail personnel.

193

PARASITOLOGIE GENERALE ET SYSTEMATIQUE 14B056 Semestre


ECTS

5

Jour

mercredi 14h15 - 17h

Lieu

Sciences II, 2ème étage, salle 229


examen oral

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur J. MARIAUX – 022.418.6343 – [email protected]

Enseignant(e)s

Monsieur J. MARIAUX (pt).

Divers Une inscription par email est souhaitée dès le semestre d’automne si possible et jusqu’au 18 février 2019 au plus tard. NB : Le cours est donné à partir de 3 participants. Cours en français (examen en anglais possible) Contenu 1) Parasitologie : principes et définitions, associations hétérospécifiques, cycles parasitaires,

vecteurs ;; 2) Diversité des parasites ;; 3) Principaux parasites humains et animaux : sporozoaires, flagellés, monogènes, digènes,

cestodes, acanthocéphales, nématodes, arthropodes ;; 4) Parasitoses humaines importantes : amibiases, malarias, schistosomiases, echinococcoses,

filarioses ;; Notions de diagnostic parasitaire ;; 5) Ecologie des parasites, biologie évolutive des parasites. 6) Chapitres choisis Démonstrations et travaux pratiques inclus. Objectif Apprécier la diversité et le rôle des parasites dans les écosystèmes et leur impact sur leurs hôtes Comprendre la biologie des cycles parasitaires Connaître et reconnaître les principaux groupes de parasites animaux Connaître les principaux parasites humains, leur mode de transmission et leur impact.

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PENSER LES SCIENCES : Nouvelles Perspectives de la Recherche

14B650

Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 12h15 – 14h

Lieu

Uni Carl-Vogt, C308


examen oral ou travail de recherche écrit / Oral exam or written research paper

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur B. STRASSER - [email protected]

Enseignant

Monsieur B. STRASSER (po).

Divers Ce séminaire de recherche est en principe enseigné en français sauf demande contraire des participants. Il s’adresse aussi bien aux étudiants avancés en sciences naturelles, qu’en sciences humaines et sociales, et à toute personne intéressée, notamment doctorants et chercheurs. Il ne requiert aucune connaissance préalable en science, en histoire, en sociologie ou en anthropologie, mais la lecture de l’anglais est nécessaire.

**************

This course is open to all advanced students in the natural, social, and human sciences, as well as any interested person, such as doctoral students and researchers. It does not require any specific knowledge in science, history, sociology, or anthropology, but reading skills in English are necessary. Contenu L‘objectif de ce séminaire est d’identifier les nouvelles perspectives de recherche dans l’étude des sciences (“science studies”). Ces dernières années, de nouveaux thèmes de recherches ont émergé, notamment dans le champ de l'histoire de l'environnement, de l'histoire globale, de l'histoire des catégories épistémologiques, de la sociologie de l'expertise, de la sociologie de la participation publique, et de l'anthropologie des sciences de la vie. Pour identifier et développer un regard critique sur ces développements, les participants discuteront plusieurs ouvrages récents en histoire, sociologie et anthropologie des sciences, ainsi que les dernières publications des revues dans le domaine. Le programme des lectures sera déterminé en fonction des intérêts spécifiques des participants.

************** The purpose of this course is to identify new research perspectives in science studies. In the last few years, new research themes have emerged, for example in environmental history, global history, historical epistemology, the sociology of expertise and public participation, and the anthropology of the life sciences. In order to identify and gain a critical understanding of these themes, participants will discuss several recent books and survey the current literature in the field. The exact readings list will be determined depending on the specific interests of the participants.

195

PHYLOGENIE ET EVOLUTION MOLECULAIRE / PHYLOGENY AND MOLECULAR EVOLUTION

14B657

Stage (cours + travaux pratiques) Cours obligatoire pour l’orientation « Biodiversité et systématique» du master Semestre


ECTS

5 (doctorants 3)

Jour & lieu

contacter le responsable


rapport

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur J. MONTOYA – 022.379.6786– [email protected]

Enseignant(e)s

Messieurs J. MONTOYA et collaborateur(trice)s.

Divers Inscription par e-mail à Juan MONTOYA : [email protected].

Les places sont limitées. Ce cours est donné en anglais et a pour objectif de comprendre comment évoluent l’ADN et les protéines et comment cette information est utilisée pour reconstruire les relations phylogénétiques entre organismes. Le cours comporte une partie théorique et une partie pratique destinée à familiariser les étudiants avec les programmes d’analyses phylogénétiques ainsi qu'à apprendre à utiliser un serveur de calcul distant. Contenu Modèles d’évolution de l’ADN. Modes de sélection moléculaire. Taux d’évolution et horloge moléculaire. Méthodes de reconstruction phylogénétique: distance et probabiliste. Application des phylogénies moléculaires dans la reconstruction de l’arbre du vivant, l’étude de la biodiversité, l’étude de la spéciation et la phylogéographie. Phylogénies multigéniques et phylogénomiques. Test de comparaison d'hypothèses évolutives alternatives. La partie pratique comporte une présentation des bases de données, alignement des séquences nucléotidiques et protéiques, utilisation des programmes d’analyses phylogénétiques (MrBayes, RaxML, Paml, BEAST,...), tests statistiques appliqués aux reconstructions phylogénétiques, estimations des temps de divergence.

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PHYSIOLOGIE VEGETALE - automne Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes

13B012A

Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 10h15 - 12h

Lieu

Sciences III, salle 1S081


examen écrit (3h)

Pré-requis notions de biologie végétale acquises durant les deux premières années (en particulier : 12B019 Développement végétal).

Sessions d'examens


Responsable

Madame T. FITZPATRICK – 022.379.3016 [email protected]

Enseignant(e)s

Mesdames T. FITZPATRICK (po), M. BARBERON (past). Messieurs R. ULM (po), L. LOPEZ-MOLINA (pas).

Divers Le cours de physiologie végétale est structuré en deux parties;; l'une au semestre d'automne (13B012A) et l’autre au semestre de printemps (13B012P). La note annuelle est la moyenne des 2 notes obtenues. Le cours doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. Cours en français et en anglais. Contenu Méthodes expérimentales (Exemple de I’utilisation d’Agrobacterium tumefaciens) (R. Ulm). Les hormones des plantes (R. Ulm, M. Barberon et L. Lopez-Molina). Les stress abiotiques (salinité, sécheresse, inondation, température) (T. Fitzpatrick). La nutrition des plantes (T. Fitzpatrick) Objectif En tant qu’organismes sessiles, les plantes doivent être en mesure de percevoir les conditions environnementales défavorables pour leur survie et d’y apporter une réponse appropriée. La compréhension de ces processus a des implications importantes pour améliorer la croissance et le rendement des plantes cultivées. Dans ce cours, vous allez développer une connaissance approfondie des mécanismes moléculaires impliqués dans divers aspects de la perception de l’environnement par les plantes.

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PHYSIOLOGIE VEGETALE - printemps Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes

13B012P

Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 10h15 - 12h

Lieu

Sciences II, salle A50A


examen écrit (3h)

Pré-requis notions de biologie végétale acquises durant les deux premières années (en particulier : 12B019 Développement végétal).

Sessions d'examens


Responsable

Madame T. FITZPATRICK – 022.379.3016 [email protected]

Enseignant(e)s

Messieurs R. ULM (po), M. HOTHORN (pas), T. TURLINGS Université de Neuchâtel (po), P. REYMOND Université de Lausanne (po), Madame T. FITZPATRICK (po).

Divers Le cours de physiologie végétale est structuré en deux parties;; l'une au semestre d'automne (13B012A) et l’autre au semestre de printemps (13B012P). La note annuelle est la moyenne des 2 notes obtenues. Le cours doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS. Cours en français et en anglais. Contenu Interactions plantes-plantes (R. Ulm). Les réponses aux insectes (P. Reymond). Interactions tritrophiques (T. Turlings). Le système immunitaire de la plante, les hormones peptidiques des plantes (M. Hothorn). Objectif En tant qu’organismes sessiles, les plantes doivent être en mesure de percevoir les conditions environnementales défavorables pour leur survie et d’y apporter une réponse appropriée. La compréhension de ces processus a des implications importantes pour améliorer la croissance et le rendement des plantes cultivées. Dans ce cours, vous allez développer une connaissance approfondie des mécanismes moléculaires impliqués dans divers aspects de la perception de l’environnement par les plantes.

198

PHYSIOLOGIE VEGETALE 13B906 Travaux pratiques à choix restreint de 3ème année Semestre

Printemps – 3 semaines

4h/jour, total 60h

ECTS

3

Jour

1er avril au 18 avril 2019

Lieu

Sciences III, laboratoires


participation active et présentation orale, certificat

Pré-requis Avoir suivi ou suivre en parallèle le cours de Physiologie végétale (13B012A & 13B012P)

Responsable

Madame E. DEMARSY – 022 379 36 52 [email protected]

Enseignant(e)s

Mesdames T. FITZPATRICK (po), M. BARBERON (pa) Messieurs M. HOTHORN (pas), LOPEZ MOLINA (pas), R. ULM (po) et assistant(e)s.

Divers L'inscription aux travaux pratiques à choix restreint est obligatoire. Le formulaire d'inscription est à télécharger sur le site Internet de Biologie et devra être remis au secrétariat de la Section de biologie, SCIII, 2ème étage, bureau 2004A, avant la fin avril de la deuxième année du bachelor.

Contenu Les étudiants, par groupes de 2 et sous la direction d’un assistant, mènent au sein d’un des 5 laboratoires du département un projet de recherche actuelle liée à la thématique du laboratoire d’accueil. Les thèmes de recherche des différents laboratoires sont décrits sur les sites web respectifs présentés sur le site du département de Botanique et Biologie végétale : http://www.unige.ch/sciences/biologie/biveg/labs.html Objectif Se familiariser en situation réelle avec les techniques et les outils utilisés dans un laboratoire de recherche. Décrire le projet et les résultats obtenus dans une présentation orale.

199

PHYTOPATHOLOGIE ET SYSTEMES CULTURAUX 14B059 Semestre


ECTS

3

Jour & lieu

mardi 14h-16h, Sciences III salle 0019


examen oral

Co-requis suivre le cours de Microbiologie générale I et II #13B011 et #13B014

Sessions d'examens


Répondant

Monsieur F. BARJA - 022.379.3754 – [email protected]

Enseignant

Monsieur R. BEFFA (cc) – [email protected]

Divers Ce cours s'adresse aux étudiant(e)s de 3ème et 4ème années. Contenu Le cours est une introduction aux maladies causées par les micro-organismes (Virus / Bactéries / Champignons) et les méthodes de contrôles du développement de ces organismes pathogènes. Le cours abordera les mécanismes d’infection des plantes, les réactions de l’hôte, les techniques de lutte contre les maladies (utilisation de composés antifongiques, sélection variétale, biotechnologies, rotation des cultures, travail des sols, etc.) et les méthodes de diagnostics. Dans une seconde partie le développement épidémiologique des maladies au niveau du champ sera traité ainsi que le rôle de différents vecteurs comme les mauvaises herbes ou les insectes. Dans une troisième partie les principes caractérisant les systèmes de production agricoles modernes seront discutés dans une perspective de développement sur le long terme. Le cours abordera les principes de bases des différents sujets traités et donnera à l’étudiant les éléments nécessaires pour approfondir ses connaissances par des lectures personnelles recommandées. Le cours de Microbiologie offre de bonnes bases pour suivre le cours de « Phytopathologie et Systèmes Culturaux ». Objectif Identifier et reconnaître les maladies des plantes causées par les micro-organismes. Associer les processus d’infection et les réactions de l’hôte. Déterminer et explorer le développement épidémiologique ainsi que les principaux principes de luttes contre les maladies. Articuler et argumenter la gestion des systèmes culturaux.

200

PLANT SCIENCE SYMPOSIUM (PSS) AND GENEVA PLANT SEMINARS (GPS)

14B648

Compulsory course for the option « Molecular Plant Sciences» of the master Periods Autumn/Spring year 60h ECTS 1

Language English

Day & place Autumn semester

PSS: Every Monday 13:00 – 14:00 / Sciences III, room 1S081 GPS: Wednesdays 11:15 – 13:00 / Sciences III, room 1S059 (see bioseminars.unige.ch for schedule and content) Spring semester PSS: Every Monday 13:00 – 14:00 / Sciences III, room 1S081 GPS: Wednesdays 12:15 – 14:00 / Sciences III, room 1S059 (see bioseminars.unige.ch for schedule and content)

Evaluation mode No examination. Participation is mandatory for students of the Master in Biology, option Molecular Plant Sciences.

Prerequisite

Bachelor in Biology or Biochemistry or equivalent

Exam sessions January-February, June + August-September Persons in charge

T. FITZPATRICK – 022 379 3016 - [email protected] R. ULM – 022 379 3650 - [email protected]

Teachers T. FITZPATRICK (po), M. HOTHORN (pas), L. LOPEZ-MOLINA (pas), X. PERRET (mer), R. ULM (po), MSc students, PhD students and postdocs, invited researchers.

Contents The Plant Science Symposium seminars (PSS) are presented by the MSc students, PhD students and postdocs of the Department of Botany and Plant Biology, who give progress reports on their own research activities. The PSS are organized on a weekly basis (Mondays at 13:00). The Geneva Plant Seminars (GPS) feature invited speakers and cover all aspects of current research in Plant Biology. They are organized on a case-by-case basis, usually on Wednesday at either 11.15 or 12:15 (please refer to the announcements on bioseminars.unige.ch for schedule and content). Please note some are in the context of the Life Science Seminar Series (LSSS) and take place on Tuesdays 16:15. Objective Learn about the most-up-to-date scientific questions and methods in Plant Biology. Be able to transfer this knowledge to the benefit of your own research, if appropriate.

201

PREHISTOIRE GENERALE 11T009 Cours obligatoire pour le bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

6

Jour

mardi 16h15 - 18h

Lieu

Uni Carl Vogt


examen écrit

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s

Mesdames M. BESSE (pas), P. CHIQUET (cs), J. DESIDERI (cc), L. MARTIN (post-doc), A. SANCHEZ-MAZAS (po), T. STEIMER (ce)

Messieurs A. AL QADI (postdoc), F. COUSSEAU (postdoc), N. HUBERT VAN BLYENBURGH (cc), E. HUYSECOM (pas), P.-Y. NICOD (cs).

Contenu Cet enseignement de niveau bachelor présente l’évolution humaine du point de vue de son mode de vie, de son organisation sociale, de ses réalisations techniques et de ses peuplements sur la base des vestiges archéologiques découverts dans les différents continents. L’aventure culturelle humaine est ainsi racontée depuis ses origines jusqu’à l’aube de l’urbanisation. Ce cours se propose de répondre aux questions : qui sommes-nous ? d’où venons-nous ? quelles en ont été les étapes et à quels moments ? comment pouvons-nous mettre cela en évidence ? Cet enseignement peut être complété par des travaux pratiques. PREHISTOIRE GENERALE 11T909 Travaux pratiques obligatoires pour le bachelor Archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3

Jour

mardi 13h15 - 16h

Lieu

Uni Carl Vogt

Mode d’évaluation examen oral Responsable


Enseignant(e)s Mesdames E. DERENNE (ass.), T. STEIMER (ce) et collab. Contenu Ces travaux pratiques de niveau bachelor permettent aux étudiant.e.s de voir et de manipuler le matériel archéologique. Il s'agit d'apprendre à reconnaître les matières premières, les techniques de taille et de façonnage utilisées dans la fabrication des objets préhistoriques. Des visites de sites archéologiques sont également prévues.

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PREHISTOIRE REGIONALE 14T006 Cours obligatoire bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

6

Jour

jeudi 15h - 17h

Lieu

Uni Carl Vogt


examen oral

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s

Madame M. BESSE (pas) et collab.

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS Ce cours n’a pas lieu en 2018-2019. Aura lieu en 2019-2020. Contenu Cet enseignement de niveau bachelor présente la préhistoire du Plateau suisse et des régions avoisinantes, des derniers chasseurs à l'aube de l'histoire. Plusieurs aspects sont abordés : paléo-environnements, peuplements, habitats, économie, technologie, typologie et chronologie des productions matérielles. Il s'agit ici d'offrir une vision diachronique de l'évolution des sociétés humaines préhistoriques d'une région singulière. PREHISTOIRE REGIONALE 14T017 Séminaire obligatoire bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre


ECTS

3

Jour

à fixer

Lieu

Uni Carl Vogt


présentation orale

Responsables

Monsieur Lionel PERNET (cc) - [email protected]

Contact: Marie BESSE - 022.379.6915 - [email protected]

Enseignant

Monsieur J. ANASTASSOV (postdoc)

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS N'A PAS LIEU EN 2018-2019.

Contenu Cet enseignement de niveau bachelor offre à l'étudiant la possibilité d'étudier un site préhistorique du Plateau suisse et des régions avoisinantes. Il s'agit d'analyser le contexte de sa découverte, les méthodes de fouilles mobilisées et les résultats interprétatifs proposés.

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PREHISTOIRE REGIONALE 14T016 Travaux pratiques obligatoire bachelor en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

6

Jour

vendredi 8h15 – 12h00 + une semaine de voyage d'études

Lieu

Uni Carl Vogt

Responsable


Enseignant(e)s

M. BESSE (pas) et collab.

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS Ce cours n’a pas lieu en 2018-2019. Aura lieu en 2019-2020. Contenu Pendant cet enseignement de niveau bachelor, les étudiantes et les étudiants mèneront une recherche sur une thématique de la préhistoire régionale. Un voyage d'étude sera organisé par les étudiant.e.s. Toutes les contributions seront rassemblées dans un volume qui servira de guide scientifique pendant le voyage d'étude.

204

PRINCIPES DE SEDIMENTOLOGIE 12T019

Semestre

automne total 33h

ECTS

2.5

Jour & lieu

CONTACTER OBLIGATOIREMENT LE RESPONSABLE AVANT LE DEBUT DES COURS POUR SIGNALER VOTRE PARTICIPATION. Commence le 9 octobre 2018


examen écrit

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur S. CASTELLTORT – 022 379 6616 [email protected] Département des sciences de la Terre

Enseignant(e)s

S. CASTELLTORT (pas).

Contenu Principales lois physiques intervenant dans la sédimentation. Structures sédimentaires érosives, dépositionnelles et liées à l'activité biologique. Description des principaux modèles de faciès relatifs aux environnements de dépôt principaux sédimentaires siliciclastiques et des différentes séquences de dépôt qui les caractérisent (cônes alluviaux, dépôts éoliens, rivières en tresse et méandriformes, deltas, dépôts littoraux, cordons littoraux, estuaires, cônes turbiditiques). Un stage de terrain relatif à ce cours a lieu en 3ème année (13T513, camp de géologie). Main physical laws behind sedimentary processes. Depositional, erosional and biological sedimentary structures. Main sedimentary facies models of the principal depositional environments (alluvial fans, deserts, glacial, braided and meandering fluvial systems, deltaic and nearshore environments, shelf, slope and deep sea turbiditic systems). A field camp twinned with this course takes place in the 3rd year of the Bachelor (13T513, Geology field camp). Divers Les étudiants hors cursus du BSc Sciences de la Terre et de l'environnement doivent impérativement s'annoncer auprès du Prof. Catelltort avant le début des cours. The students outside the Bachelor of Earth and Environmental Sciences program are required to get in contact with Prof. Castelltort before the course begins.

205

PRINCIPLES OF CELLULAR AND MOLECULAR BIOLOGY Biologie cellulaire et moléculaire approfondie

14B010

Period Autumn/Spring (2h class + 1h

exercise) 3h/week, year 84h

ECTS 8

Time Wednesday 10:15 - 12:00

Place


Evaluation mode Oral exam: Presentation of a publication selected by the teachers (10 min) followed by questions (2 x 15 min). The publications will be communicated three weeks before the exam. Note: Active participation is compulsory for this class. To obtain the credits, students have to present a minimal number of publications as set by the course organizer (usually 3-4). Attendance for 1 semester: minimal number of publications: 2

Requirements No mandatory requirements. However, a basic knowledge in molecular and cellular biology is necessary to follow the course. For local students: Biologie moléculaire de la cellule (13B001) and/or Biochimie II (13C008) are highly recommended.

Exam sessions Primary session: June;; secondary session: August-September. An additional session in February is possible for Erasmus students.

Person in charge

F. STUTZ - 022.379.6729 – [email protected]

Teachers S. CITI (pas), M. KAKSONEN (po), J. C. MARTINOU (po), D. PICARD (po), P. GUICHARD (past), T. SOLDATI (pas), F. STUTZ (po).

Miscellaneous The course is intended for students preparing a master in biology or biochemistry. The aim of this course is to acquire a deeper knowledge of the molecular mechanisms governing cellular functions. The teachers will give short overviews on recent developments in the fields specified below. The students will present and discuss selected publications chosen by the teachers. The class includes two hours of teaching/presentation and 1 hour of individual reading and preparation of publications by the students per week. Contents Cell structure and function: Membrane biogenesis and vesicular transport;; intracellular pathogen interference with membrane trafficking pathways. Signaling mechanisms: Cell-cell junctions in tissue physiology, differentiation and signaling;; cellular stress responses. Cell division, centrosome and cilia. Mechanisms of regulation of gene expression: Chromatin biology and epigenetics;; mRNA biogenesis and quality control;; small RNAs, mitochondrial RNA metabolism. Objective Learn how to read, interpret and present scientific publications. Learn how to ask questions and discuss science with colleagues and teachers. Acquire in-depth understanding of molecular mechanisms controlling cell function as well as of the experimental approaches used to study these fundamental processes.

206

PRINCIPLES OF NEUROBIOLOGY I 24N01 Period


ECTS 3 (lectures)

Day Tuesday 16:15 – 18:00

Place

Auditorium C150, CMU

Evaluation mode Written test

Exam sessions January 2019. Resit examination in September 2019 Person in charge

J.-M. MATTER – 022 379.6195 – jean-[email protected]

Teachers J.-M. MATTER (mer) and other teachers of the Medical School. Contents This course covers the principles of the central nervous system organization, the mechanisms involved in the development of cortical circuits and functional specificities of the major anatomical regions of the brain. Basic knowledge in neurobiology is required to attend this course. Students are advised to take the joint course “Principles of Neurobiology II”. Supplementary information on the module can be found in the courses program of the University of Geneva or on Dokeos https://dokeos.unige.ch/home/courses/24N01/. PRINCIPLES OF NEUROBIOLOGY II 14N11 Period Autumn 2h/week, year 28h ECTS 3 (lectures)

Day Wednesday 16:15 – 18:00

Place

Auditorium C150, CMU

Evaluation mode

Written test

Exam sessions January 2017. Resit examination in September 2018 Person in charge

D. HUBER – 022 379.5347 – [email protected]

Teachers D. HUBER (prof) and other teachers of the Medical School. Contents This course addresses the main aspects of the functioning of a neuron and ion channels, the synaptic transmission and the network activity, and puts into perspective the role of these properties as part of the major functions of our brain. Basic knowledge in neurobiology is required to attend this course. Students are advised to take the joint course “Principles of Neurobiology I”. Supplementary information on the module can be found in the courses program of the University of Geneva or on Dokeos https://dokeos.unige.ch/home/courses/24N01/.

207

PROGRAMMING FOR BIOINFORMATICS 14F006 Course - Practicals Period Autumn

2+4h/week, year 28+56h

ECTS 6 (7 for biologists)

Evaluation mode Written exam + Pratical works

Exam sessions January-February, June + August-September Person in charge

B. CHOPARD – 022 379 02 19 – [email protected]

Teacher B. CHOPARD (po). Miscellaneous

N’A PAS LIEU EN 2018/2019

Contents Practical works and exercises will consist of implementing in Python programs which illustrate the notions seen in the course. Objective To present the basic concepts of programming and algorithms through the Python language. Python is frequently used in bioinformatics and allows implementing important data structure and algorithms.

208

PROGRESS REPORT IN CELL BIOLOGY 14B773 Seminar Periods Autumn/Spring 1h/week, year 28h ECTS 3

Day Thursdays 10:00

Place


Evaluation mode Oral presentation

Exam sessions June Person in charge

S. CITI - 022.379.6182 – [email protected]

Teachers S. CITI (pas), J.-C. MARTINOU (po), D. PICARD (po), F. STUTZ (po), P. GUICHARD (past).

Miscellaneous This course is intended for fourth-year Master students and graduate students in the Department of Cell Biology. Other interested students please contact Prof. S. Citi. The course consists of presentations of current research (Progress Report) by Master and graduate students, post-docs and other members of the Department. The course is given in English. Objective The objective of the course is to develop and demonstrate the ability of students to present the results of their own experimental work clearly, logically and critically, in an oral presentation.

209

PROTEIN EXPRESSION AND INTERACTION 14F004 Course and exercises Period

Autumn year 40h

ECTS 4

Day

Friday 14:15 – 17:00

Place

CMU (see https://chamilo.unige.ch/home/courses/14F004/ for details)

Evaluation mode

Oral exam

Exam sessions January-February + catching August-September Persons in charge

O. HARTLEY - 022.379.5475 – [email protected] F. LISACEK 022.379.5988 [email protected]

Teachers O. HARTLEY (pas), F. LISACEK (mer). Contents 1. Protein Expression: - Prokaryotic expression systems - Eukaryotic expression systems - Isolation and characterization of recombinant proteins

2. Antibody production and engineering: - Hybridoma technology - Surface display technologies - Antibody engineering

3. Protein/peptide chemical synthesis 4. Protein arrays 5. Protein Interactome - Methodology - Protein-protein interactions - Protein-polynucleotide interactions - Interaction with other biomolecules

6. Mapping the interactome : - High throughput methods - Example : yeast interactome

7. Interactome databases: - Interaction databases - Database query and information extraction

8. Introduction to network biology - Basic principles - Visualisation tools

9. Interaction prediction and curation

210

PROTOHISTOIRE DE L’AFRIQUE : de l’apparition du métal à la mise en place des grands empires

14B048

Cours obligatoire du master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

6

Jour

mercredi 10h - 13h

Lieu



examen oral

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s

Monsieur E. HUYSECOM (pas), Madame A. MAYOR (cc) et collaborateurs.

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. AURA LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018

Contenu Ce cours est consacré, dans une première partie, au développement de la métallurgie. Il aborde les questions historiques, telles que l’apparition des métaux dans la vallée du Nil et les relations avec le Proche-Orient, les contacts entre l’Afrique du nord et la péninsule Ibérique, et l’invention de la métallurgie du fer en Afrique subsaharienne. La seconde partie du cours présente le développement des grands royaumes ouest-africains, les échanges commerciaux à longue distance, notamment le commerce entre l’Afrique et l’Asie et l’essor des cités swahili ou de Great Zimbabwe, ainsi que l’émergence de l’islam et ses conséquences socio-économiques à l’époque précoloniale. Certaines recherches archéologiques de l’équipe du Laboratoire Archéologie et Peuplement de l’Afrique (APA), menées en Afrique de l’Ouest, seront détaillées à titre d’illustration. Objectif Acquisition des principales connaissances dans le domaine concerné.

211

PROTOHISTOIRE DE L’AFRIQUE : de l’apparition du métal à la mise en place des grands empires

14B748

Séminaire Semestre


ECTS

3

Jour

mercredi 15h - 17h

Lieu



présentation orale et travail écrit

Responsable


Enseignant(e)s

Monsieur E. HUYSECOM (pas), Madame M. TRUFFA GIACHET (as) et collaborateurs.

Divers

A LIEU TOUS LES DEUX ANS. AURA LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018

Contenu Sujets en relation avec le cours n° 14B048. Objectif Approfondir certains sujets abordés dans le cours n° 14B048, notamment au travers d’un travail personnel

212

RESSOURCES NATURELLES 14T080 Semestre


ECTS

3

Jour

lundi 14h15 - 16h, début des cours 25 février 2019

Lieu

Sciences de la Terre, salle 001 Rue des Maraîchers 13


examen écrit et présentation d’un séminaire

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur R. MORITZ – 022 379 6633 – [email protected] Département des sciences de la Terre

Enseignant(e)s

Monsieur R. MORITZ (pas) et collaborateur(trice)s.

Contenu Inventaire des principales ressources naturelles, problèmes posés par leur exploration, exploitation et leur traitement : cycles de vie et écobilan, ressources énergétiques et minérales, gemmes, matériaux industriels, ressources en eau et en espace.

213

SCIENCES DE L’ATMOSPHERE 14E139 Semestre


ECTS

3

Jour & lieu

jeudis de 10h15 – 12h;; ISE – Carl-Vogt - salle B003


examen écrit

Pré-requis

de bonnes bases en mathématiques et en physique sont nécessaires

Sessions d'examens

février + rattrapage août-septembre

Responsable

Monsieur S. GOYETTE – 022.379.0757 – [email protected]

Enseignant

Monsieur S. GOYETTE (mer).

Contenu Ce cours est une approche scientifique nécessaire à la compréhension, à l’analyse et à la modélisation des phénomènes dynamiques et physiques se manifestant dans l’atmosphère de notre planète. Le cours aborde les sujets suivants : - Structure de l'atmosphère - Dynamique de l'atmosphère - La thermodynamique en air sec et en présence d'humidité - La turbulence - Les échanges entre la surface et l’atmosphère - La circulation atmosphérique à différentes échelles spatio-temporelle - Techniques de prévisions numériques du temps et du climat Objectif Poser les bases scientifiques de la mécanique des fluides, de la thermodynamique, des changements de phase de l’eau, et des échanges radiatifs qui explique un bon nombre de processus atmosphériques. On y analyse plusieurs éléments de l'atmosphère à des échelles spatio-temporelles variables, depuis la turbulence jusqu'à la circulation générale planétaire. On aborde aussi quelques notions de la prévision numérique du temps et du climat.

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SCIENCES CITOYENNES:DES AMATEURS NATURALISTES AUX BIO-HACKERS

14B651



ECTS

3

Jour

Jeudi 12h15 – 14h

Lieu

Uni Carl Vogt, salle C308


Travail de recherche écrit et présentation orale. Les étudiant(e)s seront évalués sur leur capacité à analyser des projets de science citoyenne contemporains, à les replacer dans leurs contextes scientifiques et historiques, et à utiliser la littérature sur le sujet.

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur B. STRASSER – 022.379.0712 - [email protected]

Enseignant

Monsieur B. STRASSER (po).

Divers Ce séminaire de recherche est en principe enseigné en français sauf demande contraire des participants. Ce séminaire de recherche s’adresse aux étudiants en bachelor et en master en sciences naturelles, humaines ou sociales, ainsi qu’aux doctorants et aux chercheurs. Il ne requiert aucune connaissance préalable en science ou en histoire. Contenu L’essor des “sciences citoyennes” à la fin du XXe siècle constitue une transformation majeure dans les relations entre les sciences et le public. De la biologie de garage (“DIY-bio”) à l’analyse de signaux extraterrestres sur des ordinateurs personnels (“crowdsourcing”) ou la création de cartes urbaines de qualité de l’air, les sciences citoyennes offrent des possibilités variées aux amateurs de contribuer à des projets scientifiques. Alors que les amateurs ont été longtemps associés à des délibérations sur l’impact des connaissances scientifiques et technologiques, les sciences citoyennes promettent de les associer à la production de nouvelles connaissances. Ce séminaire explore l’histoire de la participation publique aux sciences, des amateurs naturalistes victoriens aux bio-hackers contemporains, afin de mieux comprendre l’originalité des sciences citoyennes. Nous tenterons de situer les sciences citoyennes dans un mouvement historique plus large: l’importance croissante des amateurs dans la production culturelle et intellectuelle. Nous examinerons également le rôle des technologies (internet, smartphones, et médias sociaux) dans la participation publique à la recherche scientifique. Finalement, nous interrogerons les notions d’ “amateur” et d’ “expert”, de “scientifique” et de “citoyen”, et évaluerons ce que les sciences citoyennes peuvent apporter à la démocratisation des sciences. Objectif • Analyser les enjeux de société posés par les sciences citoyennes. • Situer les sciences citoyennes dans leur contexte historique de la participation publique. • Identifier et évaluer des sources d'informations et les mettre en relation avec la littérature. Produire une analyse argumentée originale et convaincante pour situer un projet actuel de science citoyenne dans son contexte scientifique et historique.

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SCIENTIFIC WRITING AND COMMUNICATION 14B012 Period Spring

4h/week, 20h/year

ECTS 4

Day Thursday afternoon: 7, 14, 21, 28 March, 4 April 2019

Place

Conservatoire et Jardin botaniques (192 Rue de Lausanne)

Evaluation mode Evaluation of the exercises completed.


M. PRICE - 022.418.5148 - michelle.price@ville-ge.ch

Lecturer M. PRICE (cc). Miscellaneous Course given in English. Number of participants: minimum 5 - maximum 12. Complete an official registration and contact the lecturer directly by email.

Contents This course provides an introduction to the practice and processes involved in scientific writing and communication in biology. It is aimed at motivated third-year Bachelors, Masters or early PhD students. The course will cover the following topics: 1) the planning, structuring and writing of scientific articles and scientific works (thesis, project reports), 2) the preparation of scientific posters, 3) giving presentations at conferences, and 4) the preparation and submission of scientific research proposals. Students will participate in a poster session, a proposal review panel and a conference during the course as well as in group activities and discussions on each of the topics covered. Objective Acquisition of fundamental skills in scientific writing and communication in the biological sciences.

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SELECTED CHAPTERS IN BIOINFORMATICS 14F015 Course and exercises Period

Spring year 40h

ECTS 3

Day

Monday 14h15 – 17h00

Place

Information : https://chamilo.unige.ch/home/courses/14F015/ Please contact [email protected] for further details



F. LISACEK – 022.379.5988 – [email protected]

Teacher F. LISACEK (mer). Miscellaneous

Will not be given in 2018/2019

Contents 1. Introduction to algorithms (complexity, recursivity, sorting, trees

and graphs) 2. Alignment: - dynamic programming - scoring matrices - application to sequences, mass spectra, etc.

3. Optimisation and search methods for bioinformatics: - classification - data mining - pattern matching

- examples of implementation Objective This course will give an overview of the most representative algorithms and methods commonly applied in bioinformatics.

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SEMIOLOGIE GRAPHIQUE EN ARCHEOLOGIE 14T020 Travaux pratiques à choix pour le master en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre

automne 3 jours, total 18h

ECTS

1

Jour

à fixer (3 jours)

Lieu

Uni Carl Vogt


travail personnel

Pré-requis connaissances de bases en Illustrator. Pour celles et ceux qui n’ont aucune connaissance d’Illustrator, une mise à niveau est exigée. Contacter Eva Gutscher ([email protected])

Responsable


Enseignant(e)s

Mesdames E. GUTSCHER (dess.), M. BESSE (pas),

Contenu Cet enseignement a pour objectif un apprentissage des bases pratiques et théoriques de la sémiologie graphique. Durant les Travaux pratiques, l’étudiant.e. créera différentes variantes, conceptions et réalisations d’illustrations, ainsi qu’un travail de mise en pages en lien avec la communication (mise en scène graphique, hiérarchisation des informations, introduction théorique pour la construction et la réalisation d’illustrations avec des thématiques différentes).

218

SPACE-CLIMATE (CIG) 14E142 Semestre

printemps 4X8h/sem, total 32h

ECTS

3

Jour

cours-bloc, jeudi 9h -17h dates à confirmer

Lieu

Uni Carl Vogt, salle informatique


examen écrit, exercices associés aux 4 thèmes proposés.

Pré-requis

Connaissances géomatique et statistique bienvenues

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LEHMANN – [email protected]

Enseignants

Messieurs A. LEHMANN (pas), S. GOYETTE (mer)., G. GIULIANI (ce)

Contenu Introduction aux Analyses Spatiales des Environnements Complexes : - Pyramide de l'information - Changements globaux Analyse de données météorologiques : - Extraction de données des stations météo - Analyse de séries temporelles - Représentations graphiques des tendances moyennes et des extrêmes Interpolation spatiale: - Inverse distance weighting - Trends - Krieging Analyse des données des modèles climatiques globaux et régionaux : - Le format NetCDF - Outils de visualisation et d'extraction des données - Le NetCDF dans les SIG Analyses de bassins versants avec SWAT : - Délimitation des bassins versants - Définition des « Hydrological Response Units » - Insertion des données climatiques - Modélisation de la quantité et de la qualité des eaux des rivières Objectif Le cours et les travaux pratiques associés visent à transmettre les idées générales derrière les méthodes modernes utilisées pour l'analyse spatiale de l'environnement. Ils visent à susciter la curiosité des étudiants afin qu'ils puissent commencer à utiliser les analyses spatiales dans leurs travaux de diplôme et de thèse.

219

SPACE-ECOLOGY : ANALYSES SPATIALES EN ECOLOGIE 14E075 Semestre


ECTS

3

Jour

cours-bloc, jeudi 9h-17h dates à confirmer

Lieu

Uni Carl Vogt



Pré-requis Connaissances géomatique et statistique bienvenues

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LEHMANN - [email protected]

Enseignants

Messieurs A. LEHMANN (pas), N. RAY (ce).

Contenu - Introduction aux Analyses Spatiales des Environnements Complexes - GRASP : Generalized Regression Analyses and Spatial Predictions - prédire la distribution potentielle des espèces - DOMAINS : Classification du territoire en domaines environnementaux par analyse de clustering - SWAT : Soil and Water Assessment Tool - modélisation hydrologique de bassins versants - CORRIDOR : Analyse des corridors écologiques pour le déplacement de la faune. Objectif Introduction aux analyses spatiales en tant qu'outils d'étude et de représentation de la complexité de l'environnement.

220

SPACE-WATER: Hydological modeling with SWAT 14E183 Semestre


ECTS

3

Jour

cours-bloc, jeudi 9h- 17h dates à confirmer

Lieu

Uni Carl Vogt



Pré-requis Connaissances et géomatique de statistique bienvenues

Sessions d'examens


Responsable

Monsieur A. LEHMANN - 022 379 00 21- [email protected]

Enseignant

Monsieur A. LEHMANN (pas)

Contenu Le cours se déroule selon le programme général suivant : 1. Introduction à la modélisation hydrologique 2. Construction du modèle SWAT dans ArcGIS 3. Analyses de sensitivité et calibration des paramètres du modèle 4. Validation du modèle et scénarios de changement 5. Interprétation et visualisation des résultats de SWAT Le cours est organisé avec de brève séance d'introduction théorique au début de chaque session puis des exercices pratiques sur ordinateur. Objectif Ce cours (en anglais) a pour objectif de présenter les différentes étapes de la modélisation hydrologique avec l'outil Soil and Water Assessment Tool (SWAT).

221

STAGE DE BIOLOGIE MARINE 14B667 Semestre

printemps - 14 jours 8h/sem, total 80h

ECTS

6


rapport écrit

Pré-requis cours de systématique et biodiversité conditions préalables : avoir suivi le cours et avoir réussi l'examen de systématique.

Coordinatrice

M. HOLZMANN - 022 379 30 84 - [email protected]

Responsable

Monsieur J. PAWLOWSKI - 022.379.3069- [email protected]

Enseignant(e)s

Madame M. HOLZMANN (adj sci.) - [email protected] Monsieur R. COVAIN (adj. sci.) - raphael.covain@ville-ge.ch

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS

LE STAGE AURA LIEU EN 2019

Ce stage a habituellement lieu en juillet/août, pendant 14 jours dont 3 de cours théoriques dispensés à Genève. Il traite de l'étude systématique des communautés animales de divers milieux marins;; ce stage est un complément au cours obligatoire de Systématique animale. Pour tout renseignement vous pouvez contacter les enseignants pendant le premier trimestre du semestre de printemps. Le nombre de places est restreint à 16 participants. Contenu Ce stage aborde des notions théoriques diverses liées à l’écologie, à la diversité du milieu marin côtier et au traitement de données biologiques. Les collectes sur le terrain (sorties en mer, excursions,…) permettront de se familiariser avec divers aspects méthodologiques de la recherche en biologie: collectes sur différents faciès en se centrant sur certains groupes d’intérêt, prises de données environnementales, identification des spécimens et prise de données biologiques, analyses statistiques des données. L’ensemble de la formation sera centré sur un projet personnel qui fera l’objet d’un rapport scientifique écrit. Objectif Acquérir une expérience de terrain dans le domaine de la systématique animale et biologie marine.

- Savoir mettre en œuvre sur le terrain les connaissances théoriques acquises (prospection, identification, prises de données…).

- Savoir analyser les données récoltées (maîtrise des bases statistiques et logiciels nécessaires).

- Savoir synthétiser et présenter ses résultats face à un auditoire. Savoir rédiger un rapport scientifique.

222

STAGE DE BOTANIQUE ET DE BIOGEOGRAPHIE ALPINES 14B668 Stage à choix de 2ème et 3ème années Semestre

printemps Nbre de jours par année 5

ECTS

2

Jour

7 au 12 juillet 2019

Lieu

Champex-Lac (VS) et région Excursions incluant des rappels théoriques à partir du lieu d’hébergement Centre alpien de Phytogéographie, Fondation J.-M. Aubert, 1938 Champex-Lac


examen oral de 15 minutes sur le terrain directement à la suite du stage;; reconnaissance d'une vingtaine de plantes;; si examen à une autre session: reconnaissance de plantes sur images et matériel d'herbier

Responsable

Monsieur Louis NUSBAUMER - 022.418.5226 [email protected] et loui.nusbaumer@ville-ge.ch

Enseignant(e)s

Madame Y. NACIRI (cc). Monsieur L. NUSBAUMER (cc)

Divers Nombre de participants : minimum 5 - maximum 15. Prière de s'inscrire au cours également par email : [email protected] ou louis.nusbaumer@ville-ge.ch Contenu Connaissance de la flore et de la végétation alpines au moyen d'excursions en montagne réalisées à partir du jardin botanique alpin de Champex-Lac. Objectif Apprendre à : -reconnaître les principales espèces de la flore alpine et comprendre leur signification écologique -connaître les caractéristiques du milieu alpin et comprendre son fonctionnement -connaître l'organisation de la végétation en fonction de l'altitude -comprendre l'importance des hautes montagnes pour la biodiversité

223

STAGE DE BOTANIQUE TROPICALE 14B669 Stage à choix de 2ème et 3ème années Semestre

2 semaines 6h par jour/ total 56h

ECTS

5

Pré-requis

Cours 14B016 de botanique tropicale

Responsable

Monsieur L. GAUTIER - 022.418.5147 – laurent.gautier@ville-ge.ch

Enseignant(e)s

Monsieur L. GAUTIER (cc) et collaborateur(trice)s.

Divers Le stage a lieu en région tropicale. Il est réservé aux étudiant(e)s inscrit(e)s à un master en botanique tropicale et s’effectue dans le cadre de leur travail de terrain. Objectif Familiarisation avec les techniques de terrain, mise en pratiques de notions acquises au cours.

224

STAGE DE LABORATOIRE 14B670 ECTS

Variables selon le stage effectué

Descriptif Tout-e étudiant-e inscrit-e au bachelor ou au master de biologie peut réaliser des stages de laboratoire de durée variable, dont les ECTS peuvent être validés par la Section.

C’est à l’étudiant-e d’entreprendre les démarches nécessaires auprès des professeurs ou chercheurs de la Section, ou hors Section (Faculté de médecine, autre institution, entreprise privée), pour trouver une possibilité de stage (par exemple pendant les vacances).

Un stage de laboratoire peut être validé selon les règles suivantes :

- un seul stage par titre (bachelor, master) peut être validé ;; - au niveau master, l’accord préalable du directeur de master ou du responsable de l’orientation

est exigé ;; - la demande de validation de crédits ECTS doit être adressée au secrétariat de la Section de

biologie AVANT le début du stage (un formulaire ad hoc de « pré-attestation » de stage est à télécharger sur le site Internet de la Section de biologie);;

- APRES le stage, la validation de crédits ECTS nécessite une attestation écrite du responsable du stage contenant un descriptif sommaire du travail effectué, une appréciation du travail de l’étudiant-e, et l’indication du volume réel de travail investi (dates de début et fin de stage et nombre d’heures total).

Le calcul des ECTS se fait par la conseillère aux études de la Section sur la base de 6 ECTS pour un stage d’un mois à plein temps (160 à 180 heures). Ces crédits peuvent être pris en compte dans les crédits des cours à choix libre du bachelor ou du master en biologie.

Toutefois, la Section attribue un maximum de 6 ECTS par stage, même si la durée du stage se prolonge au-delà d’un mois.

Attention : les enseignants ou chercheurs de la Section de biologie ne sont pas tenus d’offrir des places de stage.

225

STAGE EN ARCHEOLOGIE, première approche métier 13T040 Cours à choix Bachelor en archéologie préhistorique et anthropologie Semestre

4 semaines, à fixer

ECTS

6


participation active

Responsable


Enseignant(e)s

Mesdames M. BESSE (pas). J. DESIDERI (cc), et collab.

Contenu Il est parfois possible d'intégrer une équipe de recherche ou une institution (Musée, Université, Service d'archéologie, bureau d'archéologie...) pour une durée de 4 semaines afin de découvrir et d'exercer les premières facettes du métier d'archéologue. Il s'agit de valider un stage qui initie une première approche du métier d'archéologue.

226

STATISTICS AND PROBABILITY 14B057 Compulsory Master course for option « BioInformatics and Data Analysis in Biology» and for Neuroscience Period Autumn

4 (2.5) h/week, year 52 (33)

ECTS 5 (3 for Neuroscience)

Day Monday 14:15 – 18:00 (precise schedules for 5 and 3 ECTS presented druing the first course)

Place

Sciences III, salle 1S081 et Pavillon Ansermet, salle 119

Evaluation mode Computer based written exam and project report for 5 ECTS (to be presented in detail during the first course)

Exam sessions January-February + catching in August-September Person in charge

J. M. NUNES - 022.379 3683 - [email protected]

Teacher J. M. NUNES (ce).

Miscellaneous Course taught in English. This course presents a unified view of common biostatistical methods through the use of statistical modelling. It takes a practical an applied approach to statistical data analysis and provides a refresher and an overview of common methods used to analyse biological data. Besides the statistical theory, the course is also an introduction to the statistical computing environment R, with an emphasis on the exploratory data analysis and the reproducible research paradigms. Contents (Subject to change) – Exploratory data analysis Numerical and graphical data summaries p-values: Significance and Hypothesis Testing – Basic techniques, from a modelling point of view: Linear Models: correlation and regression, analysis of variance Multivariate analysis Non Parametric Tests - Extending the general linear model The generalised linear model Maximum Likelihood Methods Survival analysis Classification Objective Upon successful conclusion, the students are expected to be able to perform and to comment on statistical analyses using basic and intermediate statistical methods. In particular, they should be able to use statistical modelling to describe and analyse data sets including interactions between variables and models ranging from simple linear models to generalised linear (logistic) and survival analysis models. The students should be able to comment on the appropriateness of an experiment and its statistical analyses from a technical point of view and about the relevance of the statistical results for the question of interest, i.e., they should become critical users of statistics.

227

STATISTIQUES APPLIQUEES/ APPLIED STATISTICS 14B951 Travaux pratiques Cours à choix pour l’orientation « Biodiversité et systématique » du Master Semestre


ECTS

1

Jour

TP bloc sur deux jours et demi sur ordinateur personnel mercredi 29 mai 2019 à 13h au vendredi 31 mai 2019 à 17h

Lieu

Conservatoire et Jardin botaniques, salle de séminaire de La Console (192 rue de Lausanne 1202)


Rapport sur la base d’exercices donnés en fin de travaux pratiques

Responsable

Madame Y. NACIRI - 022.418.5165 – [email protected] et yamama.naciri@ville-ge.ch

Enseignant

Madame Y. NACIRI (cc).

Divers Nombre d’étudiants plafonné à 15. S’annoncer à l’enseignante indépendamment de l’inscription officielle. Les étudiants sont vivement incités à proposer leurs jeux de données. Contenu Analyses univariées (liste non exhaustive):

-Tests paramétriques (test-T, F, Khi-2, Fmax...) et conditions d’utilisation (normalité, homoscédasticité, etc). -Tests non paramétriques appliqués à différents cas de figure.-Analyses de variance (simples, hiérarchiques, croisées) et conditions d’utilisation, méthodes alternatives. -Régressions simples et multiples. -Analyses de fréquences.

Analyses multivariées (liste non exhaustive):

-Analyses en Composantes Principales -Analyse Factorielle des Correspondances -Analyses discriminantes

Objectif Ce module est orienté vers la pratique. Il est entièrement bâti sur des jeux de données fournis par l’enseignante ou les étudiants, et nécessite que les participants travaillent sur leur ordinateur personnel. Le but de ce module est de donner aux étudiants les moyens et les connaissances de base pour leur permettre de poser des hypothèses claires puis de s’aiguiller vers les analyses statistiques univariées et multivariées adaptées à leurs questions, tout en évitant les erreurs les plus grossières. Les ressources d’internet, d’Excel et du logiciel R sont utilisées.

228

SYSTEMATIQUE ET ECOLOGIE DES LICHENS ET DES BRYOPHYTES

14B070

Semestre

printemps total 56h

ECTS

5

Jour

juin 2019 (Lu-ve : 5 journées dont une d’excursion). Dates à fixer d’un commun accord avec les étudiants intéressés

Lieu

Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève Ch. de l’Impératrice 1, 1292 Chambésy/GE


sous la forme d’une présentation orale d'un article dans le cadre d'un séminaire et d’un rapport final à rendre après le cours

Responsables

Monsieur Ph. CLERC - 022.418.5128 - [email protected] Madame M. J. PRICE - 022.418.5148 - michelle.price@ville-ge.ch

Enseignant(e)s

Monsieur Ph. CLERC (cc), Madame M. J. PRICE (cc).

Divers Inscription avant la fin mars par e-mail : [email protected] Ouvert au public. Contenu Les lichens et les bryophytes (mousses au sens large) vivent souvent dans des endroits ou des régions où les plantes à fleurs atteignent leurs limites physiologiques et n'exercent que peu de pression compétitive. Organismes poïkilohydriques doués de reviviscence, ils ne sont physiologiquement actifs que lorsqu'ils sont hydratés, ce qui leur permet de survivre à des conditions environnementales extrêmes. D'autre part, ces organismes sont parmi les premiers à avoir colonisé la terre ferme et sont donc d'un intérêt tout particulier pour comprendre l'évolution des plantes terrestres. Nous aborderons principalement l’identification des espèces de lichens et de bryophytes du bassin lémanique. Au travers de l'observation au microscope, de séminaires, de lectures et du terrain, nous nous proposons d'étudier la morphologie et l'écologie de ces organismes. Excursions Des excursions dans le canton introduiront à l'étude sur le terrain, à la récolte et à l'identification des espèces de lichens et de bryophytes. Objectif Acquérir les connaissances taxonomiques nécessaires permettant d’identifier et de placer dans l’arbre de la vie les principaux groupes de bryophytes et de lichens. Acquérir les connaissances physiologiques et écologiques nécessaires permettant de comprendre l’adaptation et la réussite des bryophytes et des lichens dans leurs habitats respectifs. Acquérir les connaissances morphologiques et anatomiques nécessaires permettant d’identifier les bryophytes et les lichens les plus communs.

229

SYSTEME IMMUNITAIRE (LE) 13B013 Cours à choix restreint de 3ème année Semestre


ECTS

6

Jour


Lieu

CMU, salle D60


contrôle continu écrit début novembre/fin décembre/fin mai choix des questions français/anglais examen oral (en juin pour remplacement contrôle continu, en septembre pour rattrapage)

Responsables

Mesdames Pascale ROUX-LOMBARD – 022 372 94 10 pascale.roux-[email protected] Stéphanie HUGUES – 022 379 58 93 - [email protected]

Enseignant(e)s

Mesdames, P. ROUX-LOMBARD (pas), S. HUGUES (pas), A. SANCHEZ-MAZAS (po), V. DUTOIT (ma), M.-L. SANTIAGO-RABER (cs), C.-A. SIEGRIST (po) Messieurs, N. BREMBILLA, P. EIGENMANN (pas), T. McKEE (pas), J. BERTRAND (pas), W. REITH (po), J. SEEBACH (po), J. VILLARD (pas), P. WALKER (mer), P. LALIVE (pas), C. GABAY (po), O. HARTLEY (pas).

Contenu Comment nous défendons-nous contre les incessantes infections des pathogènes qui nous entourent? Grâce à notre système immunitaire! Notre système immunitaire nous permet en effet de résister aux virus et bactéries environnants grâce à un mode d’action d’une étonnante spécificité. Dans la première partie du cours, nous détaillerons les différents composants moléculaires et cellulaires du système immunitaire. Ensuite, nous décrirons les phases d’activation et de régulation du système immunitaire. Enfin, dans une dernière partie, nous étudierons les pathologies associées à un mauvais fonctionnement du système immunitaire. Nous verrons ainsi les mécanismes impliqués dans les réactions auto-immunes, les allergies et les immunodéficiences. La transplantation et la possibilité de réaliser un vaccin contre le cancer seront également abordées dans cette partie. Ce cours est dispensé en français. Objectif Connaître les composants du système immunitaire. Comprendre les mécanismes essentiels de fonctionnement physiologique du système immunitaire (au repos, infections, vaccins). Comprendre les conséquences d’un dysfonctionnement du système immunitaire au cours de différentes pathologies (immunodéficiences, allergie, auto-immunité).

230

TECHNOLOGIE PREHISTORIQUE 14B067 Cours obligatoire du master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 14h15 – 16h00

Lieu


Pré-requis

suivre le séminaire 14B767 Technologie préhistorique


examen oral

Sessions d'examens


Responsable


Enseignant(e)s

Mesdames A. MAYOR (mer), K. DOUZE (ad. Sc.) Monsieur V. SERNEELS (prof. externe Fribourg)

Divers Ce cours est destiné aux étudiants de biologie et d'archéologie et ouvert aux étudiants d’autres facultés.


Contenu Les approches actualistes et cognitives montrent que les techniques sont des éléments de la culture particulièrement révélateurs de l’identité et l’histoire des producteurs. Ce cours propose d’aborder de façon approfondie les techniques et modalités de fabrication des objets préhistoriques. L’accent sera mis sur les chaînes opératoires dans le domaine des industries lithiques, céramiques et métalliques. Les référentiels seront tirés tant des observations ethnographiques que des expérimentations. Objectif L’objectif du cours vise à donner les bases théoriques et méthodologiques nécessaires pour aborder un travail de recherche dans le domaine de la technologie en archéologie préhistorique.

231

TECHNOLOGIE PREHISTORIQUE 14B767 Séminaire obligatoire du master en archéologie préhistorique Semestre


ECTS

3

Jour

jeudi 16h15 – 18h

Lieu


Pré-requis

suivre le séminaire 14B767 Technologie préhistorique


Présentation orale et travail écrit

Responsable


Enseignant(e)s

Mesdames A. MAYOR (mer), K. DOUZE (ad. Sc.), Monsieur V. SERNEELS (prof. externe Fribourg)

Divers A LIEU TOUS LES DEUX ANS.

AURA LIEU AU SEMESTRE D’AUTOMNE 2018 Contenu Approfondissement du cours par des exercices pratiques, expérimentations, visites de collections ou labos, et analyse d’articles. Objectif L’objectif du séminaire vise à mettre en pratique les bases données au cours à partir de l’observation de matériel et d’analyse critique d’articles.

232

VULNERABILITY OF THE CENTRAL NERVOUS SYSTEM IN AGING AND IN NEURODEGENERATIVE DEMENTIA : MOLECULAR BASIS

14B077

Period


ECTS

3

Day

vendredi 12h15 - 14h

Place


Evaluation mode

examen écrit, en anglais et en français, 2 heures

Pré-requis

formation de base en biologie et biochimie

Exam session

January-February + August-September

Person in charge

Monsieur A. SAVIOZ - 022.305.5310 - [email protected] Département de Psychiatrie

Teacher

Monsieur A. SAVIOZ (privat docent).

Miscellaneous Ce cours est destiné aux étudiant(e)s en biologie, en biochimie et neurosciences de 3ème et 4ème années. Le cours est ouvert aux étudiants des autres Facultés. L'enseignement sera dispensé en anglais. The course will be taught in English. Contents The course addresses the dysfunction of nerve cells and neural networks of the central nervous system in aging and in neurodegenerative diseases, such as vascular dementia, Alzheimer’s disease, frontotemporal and Lewy body dementia. Bibliographie Chamillo (in English) + Livre: Savioz et coll. 2010, Introduction aux réseaux neuronaux: de la synapse à la psyché, De Boeck, Bruxelles. Objective Acquisition of knowledge in neurobiology of the central nervous system and more particularly in the neurobiology of aging and dementia.

Section de biologie

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• Autres masters ouverts aux titulaires du bachelor en biologie

• Formation approfondie et formation continue

• Ecoles et programmes doctoraux

Partie V Les formations rattachées

233

AUTRES MASTERS OUVERTS AUX TITULAIRES DU BACHELOR EN BIOLOGIE

(en plus du master en biologie)

MASTER EN ARCHEOLOGIE PREHISTORIQUE Ce master de la Faculté des sciences présente une spécificité dans le paysage universitaire suisse et européen, notamment par le caractère scientifique des enseignements qui font largement appel à des disciplines appartenant au domaine de la biologie, des sciences de la Terre et de l'environnement.

Il offre un programme d’enseignements original, mêlant cours méthodologiques et cours thématiques, portant aussi bien sur la préhistoire en général, et plus particulièrement sur celle de l'Europe, de l’Orient et de l'Afrique. Une part importante est réservée au terrain, avec l’apprentissage de la fouille archéologique. Enfin, le plan d’étude de ce master laisse aussi à l’étudiant une certaine souplesse, avec la possibilité de s’orienter vers de nombreux domaines de la préhistoire, comme la paléoanthropologie, l’archéozoologie ou l’ethnoarchéologie. Durée 4 semestres (120 crédits ECTS) au minimum et 8 au maximum

Plan d'études Le programme d’études du master en archéologie préhistorique

comporte deux axes. Un axe d’enseignements obligatoires et à choix (60 crédits ECTS) et un travail de recherche (60 crédits ECTS).

Responsables

Madame Marie BESSE – 022.379.6915 [email protected] Monsieur Eric HUYSECOM – 022.379.6973/67 [email protected]

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE du Master en archéologie préhistorique

MASTER EN SCIENCES DE L'ENVIRONNEMENT (MUSE)

Le Master en Sciences de l’Environnement (MUSE) est proposé dans le cadre de l’Institut des sciences de l’environnement (ISE) de l’Université de Genève par la Faculté des sciences, la Faculté des sciences de la société et la Faculté d’économie et de management. Cette formation universitaire a pour vocation l’enseignement et la recherche interdisciplinaires dans les domaines très actuels et porteurs de l’environnement que sont le climat, l’énergie, l’eau, la biodiversité, l’écologie humaine, l’urbanisme et la gouvernance, ou encore la santé. La volonté de bâtir des passerelles entre ces domaines est à la base du cursus MUSE qui propose aux candidats se destinant aux métiers de l’environnement ou à la formation approfondie une approche interdisciplinaire des sciences de l’environnement basée sur les sciences naturelles et les sciences économiques et sociales. Au terme du MUSE, les étudiants sont capables de traiter des problèmes environnementaux dans un contexte interdisciplinaire loin de l’approche sectorielle habituelle. Cette large compréhension des disciplines des sciences naturelles et des sciences économiques et sociales impliquées dans la gestion de l’environnement est une offre unique en Suisse.

Durée 4 semestres (max. 6 semestres) 120 crédits

Plan d'études Interdisciplinarité et immersion 16 crédits Fondamentaux 18 crédits Méthodes 8 crédits Enseignements spécialisés 27 crédits Enseignements à choix 18 crédits Travail de fin d’études 33 crédits

Renseignements Mme Catherine Cornut 022 379.07.97 - [email protected] (secrétariat étudiants) – UNI CARL VOGT Mme Nicole Efrancey-Dao 022 379.08.76 - [email protected] (conseillère aux études) – UNI CARL VOGT

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet du MUSE de l’UNIGE.



http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/archeo/

http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/archeo/



http://www.unige.ch/muse/

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MASTER IN NEUROSCIENCE The Master in Neuroscience is an interdisciplinary neuroscience program awarded jointly by three faculties from the University of Geneva (Sciences, Psychology and Educational Sciences and Medicine). The master program placed under the responsibility of the Geneva University Neurocenter will provide students with: a) a broad theoretical knowledge in the domain of neuroscience as well as technical skills specific to this field; b) a research training c) an introduction to scientific communication. The master is intended for students with a bachelor degree in Sciences, Medical Sciences, Psychology or any other equivalent degree, willing to pursue a career in neuroscience through research or/and education bodies at the university or the hospital. The degree gives access to the Lemanic Doctoral School in Neuroscience as well as other advanced studies at the associated faculties (subject to the acquisition of the prerequisite of the chosen faculty).

Study duration A minimum of 90 credits must be obtained for the master degree. The

minimum study duration is three semesters and the maximum is five semesters.

Language No French exam is required for the master in neuroscience admission. All the compulsory courses and half of the optional courses are given in English. A B2/C1 level in English is highly recommended.

Admission requirements The student can be enrolled in the master if she/he fulfills two conditions:

1. The student holds a bachelor of Sciences, Medical Sciences, Psychology or any other degree considered equivalent by the faculties and the Geneva University Neurocenter committee. Information regarding the equivalence cannot be obtained before the documents submission to the student administrative center. 2. The student is accepted by a research lab for the master project before the beginning of the master. 3. The student has been selected based on the quality of his/her application.

Contact Director of the Centre: Monsieur D. JABAUDON –022.379.5387

[email protected] Information: Madame D. JOCHAUT – 022 379.5228 [email protected] Biologist Member of the Committee : Madame E. NAGOSHI - 022.379.6346 [email protected]

For more information veuillez consulter le site internet de l’UNIGE Master in Neuroscience

http://neurocenter.unige.ch/master.php

235

MASTER BI-DISCIPLINAIRE EN SCIENCES (pour l’enseignement)

Le Master bi-disciplinaire en sciences offre la possibilité aux étudiants ayant effectué leur bachelor en mathématiques, informatique, physique, chimie, biochimie, biologie ou sciences de la terre et de l’environnement, de poursuivre leur cursus dans une autre branche d’étude (la mineure) que celle choisie lors du bachelor (la majeure). L’objectif visé est d’adapter le cursus d’études aux besoins croissants de la recherche scientifique qui touche souvent à plusieurs domaines et nécessite des compétences élargies. L’obtention du master bi-disciplinaire en sciences donne en principe accès à l’Institut Universitaire de Formation des Enseignants du secondaire genevois (IUFE).

Durée 4 semestres (max. 8 semestres) 120 crédits ECTS en fonction (ou encore parfois) 3 semestres (max. 6 semestres) 90 crédits ECTS du plan d’études de la mineure considérée.

Plan d'études Ce cursus se déroule sur 4 semestres (120 ECTS) ou parfois 3semestres (90 ECTS), mais ce délai peut être prolongé jusqu’à 8 semestres, respectivement à 6 semestres. Le programme comprend des enseignements obligatoires, des enseignements à option, des travaux pratiques et un travail de recherche à réaliser dans la discipline majeure en tenant compte des différentes notions abordées dans la mineure.

Renseignements Directeur Xavier CHILLIER – 022.379.6715 - [email protected]

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE du Master Bi-disciplinaire en Sciences.


http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/bi-disciplinaire/

http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/bi-disciplinaire/

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FORMATION APPROFONDIE ET FORMATION CONTINUE

Les programmes universitaires de formation approfondie et de formation continue permettent de mettre à jour et d’acquérir de nouvelles connaissances, afin d’obtenir des qualifications supplémentaires. Ils ouvrent de nouvelles perspectives professionnelles ou accompagnent le développement personnel.

MASTER D’ETUDES AVANCEES (MAS) EN MICROBIOLOGIE Ce programme d’études offre une formation à caractère professionnalisant et permet d’acquérir des compétences pratiques et théoriques de haut niveau dans des domaines de la microbiologie médicale, industrielle et environnementale. Il offre l’occasion de se familiariser avec des thématiques aussi diverses que les méthodes d’isolement et d’identification des bactéries de l’environnement, les processus de fermentation, les mécanismes de résistance croisée entre métaux lourds et antibiotiques, les bases moléculaires des interactions entre humains et micro-organismes pathogènes ou plantes et bactéries fixatrices d’azote, en étant complètement intégré à des laboratoires de recherche accrédités, ou encore d’approfondir ses connaissances, par exemple avant une thèse de doctorat. Renseignements Monsieur P- LINDER - [email protected] – 022 379 5484

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE MAS en microbiologie

FORMATION CONTINUE (MAS) IN TOXICOLOGY

Provide specialist education and training in toxicological sciences and risk assessment with a focus on human toxicology, leading to a recognized academic qualification. Fulfill the educational requirements of national and international professional bodies towards registration as a toxicologist.

Renseignements Dr Marc FATHI & Dr Caroline SAMER, Department of Anesthesiology,

Pharmacology and intensive Care Faculty of Medicine/Geneva University 022.372 9947 [email protected]

Pour plus d’information veuillez consulter le site internet de l’UNIGE MAS in Toxicology

tel:+41223795484

http://www.unige.ch/formcont/cours/mas-microbiologie-2018


http://www.unige.ch/formcont/cours/mas-toxicology-2018

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CERTIFICAT COMPLEMENTAIRE EN GEOMATIQUE Durée

2 semestres 30 crédits ECTS (18 en cours et TP, 12 en travail de recherche personnel).

Modes d’évaluation : examens (sessions de juin et septembre) et mémoire avec soutenance. Ce certificat permet d’approfondir des connaissances de base en géomatique du point de vue théorique et pratique. Il est organisé de la manière suivante :

- un enseignement obligatoire introductif sur les géodonnées, les sources de données et les géotraitements (3 ECTS) ;

- trois enseignements méthodologiques à choisir parmi cinq proposés : télédétection et traitement d’images ; modélisation de bases de données spatiales ; méthodes statistiques et géostatistiques appliquées à la géomatique ; automatisation des géotraitements ; infrastructures de données spatiales (3 x 3 = 9 ECTS) ;

- deux enseignements spécialisés à choisir parmi dix proposés : application de la géomatique en géologie, géographie humaine, urbanisme, aménagement, gestion des risques, climatologie, énergie, géo-énergie, écologie, hydrologie (2 x 3 = 6 ECTS) ;

- un travail de mémoire - éventuellement réalisé dans le cadre d’un stage - qui fait l’objet d’une soutenance orale (12 ECTS).

Admission : sur dossier. Tout titulaire d’un bachelor ou d’un master, prioritairement de Sciences ou de Sciences de la Société, motivé à se former dans ce domaine de spécialisation, peut être candidat. Toutefois, sont considérés comme prioritaires les étudiants en cours de formation de master désireux de se donner une formation complémentaire en géomatique. Pré-requis : les étudiants doivent avoir déjà suivi dans leur cursus un cours d’introduction aux SIG (ou cours jugé équivalent). Prestations requises : 6 examens + 1 mémoire réussis Directeur du programme : Pr Hy DAO – [email protected] Comité de direction (autres membres) : Pr Bernard DEBARBIEUX, Pr Andrea MOSCARIELLO, Pr Anthony LEHMANN, Pr Hy DAO Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE certificat complémentaire en géomatique.

CERTIFICATE IN INDUSTRIAL LIFE SCIENCES

Academics from the Faculty of Science, Life Sciences employers and the Career Center of the University of Geneva (Uni-Emploi) have put together the Certificate in Industrial Life Sciences (CILS). This Certificate aims at improving the employability of graduates who hold a university degree in Life Sciences and the program has been designed to bridge the gap between Academic and Industrial Life Sciences (ILS). The deadline for application is September 30.

Renseignements : Dr. Xavier CHILLIER Sciences III, office 0001 Office hours: Mondays from 5 p.m. to 6 p.m. and Tuesdays from 10 a.m. to 12, or by appointment. Tel: ++41 22 37 96715 - [email protected]

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE Certificate in Industrial Life Sciences See :

http://www.unige.ch/cgeom/

http://www.unige.ch/cgeom/


http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/cils/cilsprogram/

http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/cils/cilsprogram/

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ECOLES ET PROGRAMMES DOCTORAUX

PhD school in Life Sciences from the Faculty of Medicine and the Faculty of Science

A new Doctoral School in Life Sciences shared between the Faculties of Medicine and Science, launched in June 2018, will jointly award a Doctorate of Science. The doctoral school proposes six specific programs:

• Biomedical Sciences

• Ecology and Evolution

• Genomics and Digital Health

• Molecular Biosciences

• Pharmaceutical Sciences

• Physics of Biology

Website of the PhD school

http://lifesciencesphd.unige.ch/

239

MOLECULAR BIOSCIENCES PHD COURSE 19B001 Period Autumn/Spring No of hours per week 3

No of hours per year 90 (30 weeks)

ECTS 12

Day Every Monday morning (starts at 9.15 : 2-3 hours depending on activity) from the beginning of October to the beginning of June.

Place

Sciences III, seminar room 3079

Evaluation • Continuous course attendance is compulsory. Students who miss a course must inform the course coordinator (ahead of time when absence can be anticipated) and the current teacher if they have an assignment. • Knowledge and skills will be implicitly examined at the end of the first year through the doctoral exam (1st TAC).

Person in charge

D. PICARD (po) - 022.379.6813 - [email protected]

Contents This course is primarily for the students enrolled in the program "Molecular Biosciences" of the doctoral school in "Life Sciences from the Faculties of Medicine and Science". It is taught by PIs participating in the program. Teaching modules consist in scientific lectures (objective 1 ; see below) and sessions addressing the other teaching objectives (2-4). The latter will include two sessions on the ethical conduct of science and sessions with paper discussions. It could also include the following types of topics : designing and assessing a project ; judging and reviewing papers ; writing/structuring a manuscript/poster/grant application ; basic teaching skills ; statistics refresher ; academic and non-academic career pathways ; emerging technologies ; presentation of local platforms and services. Students can start the class twice a year, either in October or in March (see detailed program for exact dates), and just need to make sure that they complete one full cycle. Objectives & Miscellaneous (1) Get a sense of the local scientific environment with a focus on concepts, methods,

knowledge frontiers and gaps.

(2) Introduce available platforms and services.

(3) Complement scientific knowledge with additional skills. (4) Forge a class and a sense of belonging to a common program.

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NEUROSCIENCES LEMANIQUES

The Lemanic Neuroscience Doctoral School (LNDS) organizes student training both in theoretical and experimental aspects of neuroscience. Research projects take place at affiliated laboratories in Geneva and Lausanne. About 130 PhD students receive their training through comprehensive coursework within the LN Program and by attending seminars, journal clubs and workshops. They are also encouraged, and often sponsored, to present their research at national and international neuroscience conferences. Facilitating interaction between students and senior researchers helps the students build a network for future collaboration and employment. Our graduates have successful careers in a variety of areas including academia, teaching, research foundations, industry and scientific editing.

Renseignements : Monsieur A. HOLTMAAT - [email protected] Monsieur J.-P. HORNUNG - [email protected] Lieu : UNIGE, UNIL, EPFL.

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet Lemanic Neurosciences Doctoral School.


http://www.unil.ch/ln/en/home/menuinst/ln-doctoral-school.html

Section de biologie

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• Index alphabétique des cours

Partie VI Les index

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres

Répondant(e)s / Responsables Pages

14B013 Advance studies in Systematicsà choix master & master oblig. orient. BDS

2 automne Mme Naciri Y. 89

14B701 Anthropologie biologique et culturelle - séminaire

à choix 3 automne Mmes & M.

Sanchez-Mazas A. & Bordessoule Gilleron N. & Hubert Van Blyenburgh N.

90

14B002 Archéologie et histoire de l'afrique à choix 6 automne M. Huysecom E. 92

14B702 Archéologie et histoire de l'Afrique - séminaire à choix 3 automne M. Huysecom E. 91

14T015 Archéozoologie : ostéologie comparée à choix 2 printemps Mme Studer J. 96

14T900 Archéozoologie II Etude d'un ensemble faunique préhistorique master préhist. 3 annuel Mme Studer J. 94

14T010 Archéozoologie II La domestication des animaux master préhist. 3 printemps Mme Studer J. 93

14T014 Archéozoologie La chasse à choix 3 printemps Mme Studer J. 95

10A001 Astronomie générale à choix 2ème 2 automne Mme Charbonnel C. 97

14B004 Bactériologie générale à choix 2 automne M. Perron K. 98

14B904 Bactériologie générale - travaux pratiques à choix 6 automne M. Perron K. 99

14E 156 Bes mesures de la diversité à choix 3 printemps 5 jours M. Castella E. 100

12C002A Biochimie II - Biochimie pour biologistes 2ème 4 automne M. Roux A. 35

12C00PX Biochimie II - Méthodes 2ème 1 printemps M. Roux A. 36

13C008A/08P Biochimie III à choix 9 annuel M. Soldati T. 102/103

13C008A Biochimie III à choix r. 3 automne M. Soldati T. 102

13C008P Biochimie III à choix r. 3 printemps M. Soldati T. 103

13C908X Biochimie III - Travaux pratiques à choix r. 3 automne M. Soldati T. 101

14B005 Biodiversité : origine et évolutionà choix master & master oblig. orient. BDS

3 automne Mrs Perret M. & Montoya J. 104

13B003 Bioéthique à choix r. 6 annuel Mmes Hurst S. & Clavien C. 105

14B007 Biogéographie à choix 3 pritnemps M. Perret M. 106





12B012 Bioinformatique + travaux pratiques intégrés 2ème 1.5 printemps Mme F. Lisacek 37

12B010 Biologie et société I : Les enjeux actuels des sciences de la vie 2ème 2.5 automne Mrs Strasser B. &

Kampourakis K. 38

12B011 Biologie et société II : Analyser les controverses scientifiques 2ème 2.5 printemps Mrs Strasser B. &

Kampourakis K. 39

11B001 Biologie fondamentale I 1ère 9.5 automne M. Martinou J.-C. 13

11B001 Biologie fondamentale I - travaux pratiques intégrés 1ère automne Mme Demarsy E. 14

11B002 Biologie fondamentale II 1ère 7.5 printemps Mme Demarsy E. 15

11B002 Biologie fondamentale II & travaux pratiques intégrés 1ère printemps Mme Demarsy E. 16

11B003 Biologie fondamentale III 1ère 8 printemps M. Pauli D. 17

11B003 Biologie fondamentale III & travaux pratiques intégrés 1ère printemps M. Pauli D. 18

13B004Biologie humaine I : Diversité biologique et moléculaire des populations humaines actuelles

à choix r. 3 automne Mme Sanchez-Mazas A. 107

13B005 Biologie humaine II : Evolution du genre humain, des origines à nos jours

à choix r. & master 3 printemps Mme Sanchez-Mazas A. 108

13B001 Biologie moléculaire de la cellule 3ème 9 annuel M. T. Halazonetis 59

13B901 Biologie moléculaire de la cellule - travaux pratiques à choix restreint de 3ème année à choix r. 3 automne M. &

MmeT. Halazonetis & Stankova M. 60

12B013 Biologie végétale 2ème 3.5 printemps Mme & M.

Fitzpatrick T & S. Loubéry 40

12B013 Biologie végétale + travaux pratiques intégrés 2ème printemps Mme & M.

Demarsy E. & S. Loubéry 41

14P017 Biophotonique à choix 4 printemps M. Bonacina L. 109

11M004 Biostatistiques I 1ère 3 printemps M. Sardy S. 20

11M904 Biostatistiques I : Applications 1ère 1 printemps Mme Poloni E. 19

11B800 Biostatistiques I : Répétitoire 1ère printemps Mme Poloni E. 21

12B015 Biostatistiques II 2ème 1.5 automne M. Nunes J. M. 42

12B015 Biostatistiques II + TP intégrés 2ème 0.5 automne M. Nunes J. M. 43

14B015 Botanique systématique et pharmaceutique à choix 4 automne M. Stauffer F. 111





14B915 Botanique systématique et pharmaceutique travaux pratiques/excursions à choix 2 printemps M. Stauffer F. 112

14B016 Botanique tropicale à choix 5 printemps M. Gautier L. 110

13T513 Camp de géologie à choix 3 printemps M. Castelltort S. 113

14B047 Cell Biology Journal Club à choix master 3 annuel M. Citi S. 114

11C101 Chimie générale 1ère 5 automne M. Chillier X. 22

11C901 Chimie générale - travaux pratiques 1ère 2 automne M. Piguet C. 23

11C103 Chimie organique 1ère 8 annuel M. & Mme

Lacour J. & Poblador-Bahamonde A.

24

14T003 Civilisations préhistoriques à choix 4 printemps Mme Besse M. 115

14B020 Classiques de la génétique moléculaire (les) Classical papers in molecular genetics à choix master 5 printemps M. Belin D. 116

14 E150 Climat et changement climatiques à choix 3 automne Mme Cornut C. 117

7414D Cognition comparée: aux origines de l'esprit à choix 3 printemps M. Maurer R. 118

10S010 Communication scientifique et médicale : acteurs et moyens à choix 3 printemps Mme Pellegrini B. 119

14B024 Comprendre la compléxité et la diversité biologiques à choix 3 printemps M. Milinkovitch M. 120

14B672 Computer Skills for Biological research : an introduction to GNU/Linux and bash scripting

à choix master & master oblig. orient. BIADB

4 automne Mrs Currat M. & Nunes J.M. 121

14CB01 Current Topics in Chemical Biology and Biochemistry à choix master 8 automne Mme Simitsek Ph. 122

14F016 Data mining for protein function prediction à choix master 5 printemps M. & Mme Bairoch A. & Lane L. 123

12B016 Développement animal 2ème 4 printemps M. Rodriguez I. 44

12B019 Développement végétal 2ème 3 printemps M. Lopez-Molina L. 45

74144 Eco-Ethologie : Evolution phylogénetique des comportements à choix 3 automne M. Maurer R. 124

13B907 Ecologie - travaux pratiques à choix r. 3 printemps M. Ibelings B. 127

13B007A Ecologie I à choix r. 3 automne M. Ibelings B. 125

13B007P Ecologie II à choix r. 3 printemps M. Ibelings B. 126





14B026 Ecologie moléculaire microbienne à choix 4 printemps M. Tonolla M. 128

14 E187 Ecosystems services : A new tool for sustainable development à choix 3 automne M. Schlaepfer M. 129

14C003 Eléments d'endocrinologie moléculaire à choix r. 6 annuel M. & Mme

Rossier M. & De Agostini A. 130

14F001 Elements of Bioinformaticsà choix master & master oblig. orient. BIADB

5 automne M. & Mme

Bairoch A. & Blatter M.-C. 131

14F012 Elements of proteomics and Metabolomics : Translation to human Diseases à choix master 3 automne Mrs Sanchez J.-C. &

Rudaz S. 132

14B028 Ethnoarchéologie master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 133

14B728 Ethnoarchéologie - séminaire à choix 3 automne Mme Mayor A. 134

14B029 Ethnologie à choix 3 automne Mme Mayor A. 135

14B729 Ethnologie - séminaire à choix 3 automne Mme Mayor A. 136

13B002 Evolution 3ème 6 annuel Mme Sanchez-Mazas A. 61

14B030Evolution humaine : histoire des représentations scientifiques des origines et de la diversité des humains

à choix 3 printemps M. Hubert Van Blyenburgh N. 137

14B021 Exploitation des collections botaniques à choix 5 annuel Mrs Clerc Ph. & Gautier L. 138

14B642 Faune Genevoise à choix master 4 automne Mrs Ruedi M. & Mariaux J. 139

14B008Flore et végétation :Cartographie, analyses et indicateurs

à choix, 2ème & 3ème 2 printemps Mme Price M. 140

14B009 Flore et végétation (stage de) à choix, 2ème & 3ème

3 printemps Mme Price M. 141

14B033 Floristique : Chorologie Histoire et connaissance de la flore

à choix, 2ème & 3ème 3 printemps Mme Naciri Y. 142

14 E150 Climat et changment climatiques à choix 3 automne M. Stoffel M. 117

12B801 Formation documentaire 2èmecertificat printemps Mme &

M. Bellier A. & Huber V. 54

14B635 Fouilles archéologiques bachelor & master préhist. 6 automne M. Huysecom E. 143

13T601 Fouilles archéologiques, stage d'initiation bachelor en archéologie 6 printemps Mme Besse M. 144

12B017A Génétique - génétique générale + travaux pratiques intégrés 2ème 11 automne M. Pauli D. 46

12B017P Génétique - génétique moléculaire + travaux pratiques intégrés 2ème printemps M. & Mme Shore D. & Gabus C. 47/48





14B637 Génétique moléculaire des populations / Molecular Population Genetics

à choix master & master oblig. orient. BDS &

5 automne Mme Sanchez-Mazas A. 150

14B637 Génétique moléculaire des populations / Molecular Population Genetics doctorat 3 automne Mme Sanchez-Mazas A. 150

13B010 Génétique moléculaire du développement à choix r. 6 annuel M. Karch F. 145

13B909 Génétique moléculaire du développement - travaux pratiques à choix r. 3 automne M. Karch F. 146

14B038 Génétique moléculaire du développement et de l'évolution - chapitres choisis à choix master 4 annuel M. Zakany J. 147

11T003 Géologie générale I à choix 5 automne M. Moscariello A. 148

11T903 Géologie générale I - travaux pratiques à choix 2 automne M. Moscariello A. 148

11T005 Géologie générale II à choix 2.5 printemps M. Schaltergger 149

11T905 Géologie générale II - travaux pratiques à choix 2 printemps M. Chiaradia M. 149

12T408 Géomatique I à choix, 2ème & 3ème 3 automne M. Lehmann A. 151

14B640 Histologie et imagerie des tissus à choix 3 printemps M. Loubéry S. 152

14B641 Hydrobiologie microbienne - Ecologie microbienne et écologie alpine

à choix, 2ème & 3ème 4 printemps

5 jours M. Tonolla M. 154

14B041Hydrobiologie microbienne : Environnement naturel et construit, aspects écologiques, hygiéniques et sanitaires

à choix, 2ème & 3ème 3 printemps

3 jours M. Tonolla M. 153

14B071 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique à choix master 2 automne M. Genequand D. 156

14B771 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique - séminaire à choix master 1 automne M. Genequand D. 156

10S003 Introduction à l'histoire et à la philosophie des Sciences à choix 6 annuel M. Lacki J. 159

12C902X Introduction à la bioinformatique pour biologistes - travaux pratiques à choix 1 printemps M. Soldati T. 157

14B043 Introduction à la biologie du comportement à choix, 2ème & 3ème 3 annuel M. Langaney A. 155

14B037P Introduction à la génétique à choix printemps M. Pauli D. 158

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux

à choix master & master oblig. orient. MPS

4 annuel M. Hothorn M. 160

14T019 Introduction au dessin archéologie à choix 3 printemps Mme Besse M. 161

14B779 Introduction aux méthodes de recherche en digital humanities

à choix master & doctorat 3 printemps Mrs Strasser B. & Baudry

J. 162





14F018 Introduction to systems biology à choix 3 printemps Mme Lisacek F. 163

223O305 La génétique dans la pratique médicale au quatidien : du laboratoire au chevet du patient à choix 3 automne M. &

Mme

Blouin J.-L. & Guipponi M. & Sloan-Bena F.

164

223O321La génétique dans la pratique médicale de demain : de la recherche vers les nouveaux concepts de diagnostic

à choix 2 printemps M. & Mme

Blouin J.-L. & Guipponi M. & Sloan-Bena F.

165

14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution

à choix master & master oblig. orient. GDE

9 annuel Mme & M.

Nagoshi E & Gonzalez Gaitan M. 166

11M000 Mathématiques générales 1ère 4 automne M. Sardy S. 25

223O122 Médecins et scientifiques au cinéma à choix, 2ème & 3ème 3 printemps Mrs Wenger A. & Strasser

B. 167

14 E155 Menaces et conservation de la biodiversité à choix 3 printemps M. Lehmann A. 168

14T004 Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique

bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 169

14T005 Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique - travaux pratiques

bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 170

14B068Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique : cartographie, topographie et statistique

bachelor préhist lettre 2 automne M. Huysecom E. 171

14B751 Méthodologie de la recherche en biologie - séminaire à choix 3 printemps M. Currat M. 172

22H002 Microbiologie à choix 5 annuel M. Linder P. 177

13B911 Microbiologie générale - travaux pratiques à choix r. 3 printemps M. Perron K. 175

13B011 Microbiologie générale I à choix r. 3 automne M. Perron K. 173

13B014 Microbiologie générale II à choix r. 3 printemps M. Perron K. 174

14B053 Microbiologie moléculaire des milieux hydriques : Détection et typage des microorganismes à choix 3 automne M. Tonolla M. 176

14B044 Microscopie électronique à choix 5 printemps 9 jours M. Bauer Ch. 178

14B063A Microscopy and Imaging Course à choix/master 3 automne M. Bauer Ch. 179

14B023 Milestones in Plant Molecular Genetics - selected Chapters à choix 4 annuel M. Hothorn M. 180

14X015 Modélisation et simulation de phénomènes naturels à choix r. 6 printemps M. Chopard B. 181

14B778 Molecular Biology journal club and progress reports

à choix master & doctorat 5 annuel M. Halazonetis T. 182

19B001 Molecular biosciences PhD course doctorales 12 annuel M. Picard D. 239





14B037 Molecular Plant Sciences - Applied Aspectsà choix master & master oblig. orient. MPS

4 automne Mme & M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 184

14B035 Molecular Plant Sciences - Basic Researchà choix master & master oblig. orient. MPS

4 automne Mme & M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 183

7312D Neurobiologie de la représentation spatiale (la) à choix master 3 printemps M. Maurer R. 186

14N12 Neurosciences : Chemical senses à choix master 3 automne M. Rodriguez I. 185

14P021 Optique et laser à choix 5 automne M. Zbinden H. 187

14T018 Paléoanthropologie I à choix 6 annuel Mme Desideri J. 188

11T007 Paléobiologie et paléontologie à choix 5 annuel Mme Martini R. 189

11T507 Paléobiologie et paléontologie - camp à choix 0.5 printemps 2 jours Mme Martini R. 189

11T907 Paléobiologie et paléontologie - travaux pratiques à choix 2 annuel Mme Martini R. 190

14B062Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

master préhist. 6 automne M. Huysecom E. 191

14B762Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes - séminaire

à choix 3 automne M. Huysecom E. 192

14B056 Parasitologie générale et systématique à choix 5 printemps M. Mariaux J. 193

14B650 Penser les Sciences : Nouvelles Perspectives de la Recherche à choix 3 printemps M. Strasser B. 194

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire - stage doctorat 3 annuel M. Montoya J. 195

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and moleculair evolution- stage

à choix master & master oblig. orient. BDS

5 annuel M. Montoya J. 195

12B014 Physiologie animale 2ème 4 automne Mme Frieden M. 49

12B914 Physiologie animale - histologie-Physiologie animale - travaux pratiques 2ème 1.5 automne Mme Soulié P. 50

13B012P Physiologie végétale - Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes à choix r. 3 printemps Mme Fitzpatrick T. 197

13B906 Physiologie végétale - travaux pratiques à choix r. 3 printemps Mme Demarsy E. 198

13B012A Physiologie végétale Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes à choix r. 3 automne Mme Fitzpatrick T. 196

11P085/86 Physique générale B 1ère 10 annuel Mme &

M. Paruch P. & Bonacina L. 26

11P985 Physique générale B - travaux pratiques 1ère 2 automne Mme Tamai A. 27





14B059 Phytopathologie et systèmes culturaux à choix 3 printemps M. Barja F. 199

14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars à choix master 1 annuel Mme &

M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 200

11T009 Préhistoire générale Bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 201

11T909 Préhistoire générale - travaux pratiques Bachelor en archéologie 3 annuel Mme Besse M. 201

14T006 Préhistoire régionale Bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 202

14T017 Préhistoire régionale - séminaire Bachelor en archéologie 3 printemps M. Pernet L. 202

14T016 Préhistoire régionale - travaux pratiques Bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 203

12T019 Principes de Sédimentologie Bachelor en archéologie 2.5 automne M. Castelltort S. 204

14B010 Principles of cellular and molecular - Biology Biologie cellulaire et moléculaire approfondie à choix master 8 annuel Mme Stutz F. 205

24N01 Principles of neurobiology I à choix master 3 automne M. Matter J.-M. 206

14N11 Principles of neurobiology II à choix master 3 automne M. Huber D. 206

12X020 Programmation + TP intégrés 2ème 3.5 automne M. Falcone J.-L. 51

14F006 Programming for bioinformatics à choix master 7 automne M. Chopard B. 207

14B773 Progress report in Cell Biology - seminar à choix master 3 annuel Mme Citi S. 208

14F004 Protein expression and interaction à choix 4 automne M. & Mme

Hartley O. & Lisacek F. 209

14B048 Protohistoire de l'Afrique : de l'appartition du métal à la mise en place des grands empires à choix master 6 automne M. Huysecom E. 210

14B748Protohistoire de l'Afrique : de l'appartition du métal à la mise en place des grands empires - séminaire

à choix master 3 automne M. Huysecom E. 211

14T080 Ressources naturelles à choix 3 printemps M. Moritz R. 212

14B651 Sciences citoyennes : des amateurs naturalistes aux bio-hackers

à choix, 2ème & 3ème 3 automne M. Strasser B. 214

14 E139 Sciences de l’Atmosphère à choix 3 automne M. Goyette S. 213

14B012 Scientific writing and communication à choix master 4 printemps Mme Price M. 215

14F015 Selected chapters in bioinformatics à choix 3 printemps Mme Lisacek F. 216





14T020 Sémiologie graphique en archéologie à choix 1 automne Mme Besse M. 217

14 E142 SPACE-Climate (CIG) à choix 3 printemps M. Lehmann A. 218

14 E075 SPACE-Ecologie : Analyses spatiales en écologie à choix 3 printemps M. Lehmann A. 219

14 E183 SPACE-Water : Hydological modeling with SWAT à choix 3 printemps M. Lehmann A. 220

14B667 Stage de biologie marine à choix 6 printemps M. Pawlowski J. 221

14B668 Stage de botanique et de biogeographie alpines

à choix, 2ème & 3ème 2 printemps M. Nusbaumer L. 222

14B669 Stage de botanique tropicale à choix, 2ème & 3ème 5 2

semaines M. Gautier L. 223

14B670 Stage de laboratoire bachelor & master annuel

Conseillère aux études de la Section de biologie

224

13T040 Stage en archéologie, première approche métier

bachelor en archéologie 6 4

semaines Mme Besse M. 225

14B057 Statistics and probabilityà choix master & master oblig. orient. BIADB

5 automne M. Nunes J.M. 226

14B951 Statistiques appliquées / Applied statistics travaux pratiques à choix master 1 printemps Mme Naciri Y. 227

12B018A/12B018P Systématique et biodiversité 2ème 8 annuel M. &

Mme Montoya J. & Price M. 52

12B018A/12B018P

Systématique et biodiversité+ travaux pratiques intégrés + TP intégrés 2ème 3 annuel M. &

Mme Montoya J. & Price M. 53

14B070 Systématique et écologie des lichens et des bryophytes à choix 5 printemps Mme & M.

Price M. J. & M. Clerc Ph. 228

13B013 Système immunitaire (le) à choix r. 6 annuel Mmes Roux-Lombard P. & Hugues S. 229

14B067 Technologie préhistorique - cours master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 230

14B767 Technologie préhistorique - séminaire master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 231

14B077Vulnerability of the central nervous system in aging and in neurodegenerative dementia : molecular basis

à choix 3 automne M. Savioz A. 232

Situaon des principaux bâmentsconcernant la Faculté des sciences

La publicaon, la reproducon et l'ulisaon de ce plan est soumise à une autorisaon préalable de l’auteur.

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Quai

Bd Carl - Vogt

Av. du Mail

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Rue De - Candolle

Prom. des Basons

Av. de Champel

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Centre Sportifdes Vernets

Hôpitalcantonal

MaternitéClinique

Clinique

Jardin Anglais

Plaine dePlainpalais

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Rue François - Dussaud

Micheli-du-Crest

Lombard M.-Servet

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La Queue d'Arve

La Jonction

Carouge

Rue des Maraîchers

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Pont Coulouvrenière

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Seujet

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Quai Charles - Page

Quai du Cheval - Blanc

Rue Dancet

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CMU(Rue Michel-Servet 1)

Uni Carl Vogt(Boulevard Carl-Vogt 66)8

7 Sciences de la Terre(Rue des Maraîchers 13)

5 Pavillon des Isotopes(Boulevard d’Yvoy 20)

6 Pavillon Ansermet(Quai E.-Ansermet 24)

Secon de mathémaques(Rue du Lièvre 2-4)9

10

Uni Basons(Place de l'Université 3)12

Uni Dufour(Rue Général-Dufour 24)11

Sciences I(Boulevard d’Yvoy 16)1

Sciences III(Boulevard d’Yvoy 32)3Ecole de physique(Quai E.-Ansermet 24)4

2 Sciences II(Quai E.-Ansermet 30)

Hors-Plan :BaelleRoute de Drize 9 - 1227 Carouge

PinchatRoute de Pinchat 22 - 1227 Carouge

Observatoire Astronomique UniGEChemin des Maillees 51 -1290 Sauverny

Instut F.A. ForelRoute de Suisse 10 - 1290 Versoix

Integral Science Data Centre (ISDC)Chemin d'Ecogia 16 - 1290 Versoix

Conservatoire et Jardin Botaniques (CJB)Chemin de l'Impératrice 1 - 1292 Chambésy

SciencesFACULTÉ DES SCIENCES30 quai Ernest-AnsermetCH - 1211 Genève 4www.unige.ch/sciences

Atelier de reprographie ReproMailLe papier recyclé contribue au développement durable

guide de l’étudiant-e 2018 – 2019 section de...

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