Gérer ses références bibliographiquesavec Mendeley

Pôle Formation IST

Dominique Fournier, Inra, ERIST MontpellierApérodoc IRD, 26 juin 2012

Objectifs de la présentation� Découvrir les principales fonctionnalités du logiciel

� la collecte des références bibliographiques (import àpartir de différentes sources et/ou autres logiciels, saisie manuelle, …)

� la gestion des références (dossier, tag, …)� leur utilisation dans un document (citation, bibliographie,

style)� Le partage de références bibliographiques

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Caractéristiques de Mendeley

� Projet créé en 2008 par des chercheurs et pour des chercheurs

� Ce n’est pas un logiciel libre (open source), mais la version gratuite offre beaucoup de fonctionnalités

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Inspiré des outils collaboratifs

Mendeley, c’est …� Un outil de :

� gestion de références bibliographiques et d’aide à la publication

� lecture et annotation (pdf)

� découverte (plateforme web, papers, groups, tendance des

disciplines, …)

� … qui vous permet de :� Ajouter et organiser les résultats de vos recherches

bibliographiques (import de références bibliographiques et de pdf,

liens avec EndNote, Zotero, JabRef)

� Collaborer avec des collègues en partageant des références et

annotations

� Accéder à votre environnement de travail à partir de n’importe où

(accès web, mobile) 4

Mendeley, c’est aussi …

� Plateforme web de partage de références bibliographiques � + de 30 millions de Papers (références bibliographiques

avec lien vers le texte intégral et qqs OA). Possibilité de les sauvegarder vers Mendeley

� groupes thématiques publics (Groups) que l’on peut suivre (RSS), rejoindre (Join, Follow) et interagir (ask a question or comment)

� profils de scientifiques (People)

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Données 28/10/11

Données 25/06/12

Une communauté très active� Des développeurs qui répondent aux demandes des

utilisateurs (votes, …): Support / Feedback

� Blog, Upcoming Events & Webinars, Advisors, …

� Répartition des usagers et des formateurs

http://mapmyfield.com/ http://www.mendeley.com/advisors/

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Une version gratuite avec des limites …

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1 GB pour espace personnel sur le web (My Library)100 MB pour les espaces partagés (Groupes)

Avant 15/06/12 :

500 MB

Shared Web Space

Avant 15/06/12 :

5 groupes privés

avec 10 membres

Mendeley Institutional Edition� http://www.swets.com/mendeley

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Nouveauté

Pas encore testé à l’IRD et à

l’Inra

� Nécessité de se créer un compte (� People)

� Télécharger le logiciel

Mendeley Desktop My Library

Gestion basique des références

Fonctionnalités plus complètes

(doublons, annotations pdf, …),

Lien vers le traitement de texte,

Déclenchement de la synchronisation

avec le serveur

Paramétrage des transferts (pdf)

Gestion basique des références

(ajouts de références, création de

dossiers et de groupes)

Import direct des références à

partir des sites web

Pour utiliser Mendeley

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Collections, listes

de publications,

collections

partagées

Détail du contenu des

références (infos

bibliographiques, tags, notes)

Liste des références (documents)

Affichage des références sous forme de citations /

tableau (View Library as citation / table)

Filtrage des références par année, auteurs,

revues ou tags (= mots-clés)

Interface Mendeley DesktopMoteur de recherche

Barre d’outils

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Collecter des références� Ajouts de documents

� Add File (ou glisser déposer) d’un fichier pdf

� génération automatique de la référence bibliographique + PDF

� Add File d’un fichier contenant plusieurs références

bibliographiques (export RIS de ScienceDirect, Export

EndNote XML, …)

� Add Folder (dossier contenant plusieurs pdf)

� Watch Folder (créer une référence dès que nouveau pdf

dans le dossier « surveillé)

� Saisie manuelle assistée (index de termes existants,

Mendeley – 26/06/1211

Importer à partir du WebDans ce cas, les références sont sauvegardées dans My

Library (synchroniser pour les retrouver en local DeskTop)

�Sauvegarder des références de la plateforme Mendeley

(Papers, Groups)

�A partir d’un site « compatible », cliquer sur barre de

navigation personnelle

�Au préalable, Installer Web Importer

� Tools > Install web Importer

� Dashboard Mendeley – 26/06/1212

My library sur Mendeley Web� Onglet My Library� Dossiers permanents� Possibilité de créer des dossiers (Folder) dans lesquels

les références pourront être classées (multipositionnement possible).

� On retrouve le même contenu et le même classement que dans la version locale

Références les +

récentes

Références

nécessitant une

relecture

Mes publications

(que je peux afficher

dans mon profil)

Toutes les références

de ma bibliothèque

Mes références

que je préfère

Dossiers personnels

(Create Folders)13

My library sur iPhone, iPad et iPod

� Voir démo à la pause

14

Gérer les références

� Toutes les références ajoutées dans Mendeley sont

dans All Documents

� Créer des Folders (dossiers, collections)

� Les références peuvent être supprimées

du Folder (remove from collection) ou

définitivement (Delete)

� Elles peuvent être multipositionnées dans plusieurs

folders 15

Gérer les références (2)

� Détection de doublons (Tools > Chek duplicates)

� Recherche (par titre, mots clés, notes, revue)

� Recherche par filtre (auteurs, tags, mots clés,

revues)

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Personnaliser les références

� Favoris / à lire

� « Fiche de lecture » dans Notes

� « tags » : marqueurs personnels (classement, …)

� Annoter les pièces jointes (pdf)

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Sauvegarde et échanges avec d’autres applications

� Possibilité de sauvegarder toute la librairie ou collection(s) ou quelques documents sélectionnés

� File > Export � Format : RIS, BibTex, EndNote XML

� Help > Create Backup � Sauvegarde sur Mendeley Web par synchronisation

18

Sélectionner le format d’export

RIS � Zotero, EndNote

BibTex � JabRef

EndNote XML � EndNote X

Mendeley - 23/03/12

Lien avec les traitements de texte

� Application compatible avec les différents traitements de texte

� Windows Word 2003, 2007, 2010

� Mac Word 2008, 2011

� Open Office 3,2

� BibTex

� Installation d’un plug-in

19Mendeley - 23/03/12

Citer les références dans un fichier word 2010 (1)

� L’application Mendeley Desktop doit être ouverte

� La barre d’outils Mendeley Cite-o-Matic est accessible dans

l’Onglet References de Word 2010

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Insert Citation : pour

sélectionner les

références à insérer

dans le texte

Style : détermine le format

pour la mise en forme de la

citation et de la référence

dans la bibliographie

Insert Bibliography :

met en forme la

bibliographie du

documentMendeley - 23/03/12

Citer les r éférences dans un fichier word 2010 (2)

� Cliquer sur l’icône « Insert Citation »

� Recherche dans la base Mendeley (ou dans une collection spécifique)

� Aller dans Mendeley en cliquant sur « Go to Mendeley » ou en ouvrant

l’application

� Sélectionner la (ou les) référence(s) et cliquer sur « Send Citation to Word

Processor »

� Pas de possibilité d’insérer les références par un simple Glisser-

Déposer ou Copier-Coller

21Mendeley - 23/03/12

Le partage de références avec MendeleyCréation de groupes à partir de Mendeley Desktop ou de

Mendeley web Create group

Propriétés du groupe : Edit settings (Private, Public)

Invitation des invités par mail : Edit settings > Members

Droits des invités : admin (= owner), member, follower

Les membres ont tous le droit d’écriture et de lecture (travail

collaboratif)

Transfert du contenu des dossiers gérés localement avec Mendeley

Desktop Settings > Synchronisation des pièces jointes

Affichage de ses publis dans son profil personnel Mendeley

(People): se fait automatiquement à partir de la collection « My

Publications »

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Création d’un groupe� Dans la version gratuite : possibilité de créer 1 seul groupe

avec au maximum 3 membres (dont vous !)

Groupe sur invitation : seuls les

membres ont le droit

d’alimenter le contenu du

groupe

Private :

Groupe privé dans lequel on peut partager des

fichiers et dont le contenu n’est visible qu’aux

personnes que vous avez invitées

Adapté à un programme de recherche et un

travail à distance.

Public

Groupe public bénéficiant d’une grande

visibilité sur Mendeley Web (et sur les

moteurs de recherche)

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Gestion des références d’un groupe� Les références du groupe peuvent être ajoutées par:

� un ajout de document (Add documents) à partir de Desktop ou My

Library

� un simple glisser-déposer (Desktop) (1)

� un déplacement à partir d’un autre groupe (sélectionner la référence

puis Add to) à partir de My Library (2)

� un import sur le web (avec le plug-in Import to Mendeley) et classer ensuite la référence Recently Added dans le groupe 24

1 2

Accès aux références d’un groupe

� Le contenu du groupe est accessible à partir de leur espace

Mendeley sur le web (My library > Groups) et en local (Groups)

� Seuls les membres du groupe (member) peuvent y ajouter des

références au groupe

� Les followers peuvent copier les références dans leurs

dossiers personnels et les utiliser dans leur bibliographie

Accès au groupe à

partir de My

Library (web)

Accès au groupe à

partir de Mendeley

Desktop 25

Les options de Mendeley (Desktop)

� Tools > Options > General

� Paramétrage des options pour synchronisation des pièces

jointes des différents folders et groupes

� Visualisation de vos « espaces » alloués

Mendeley – 14/06/1226

Indiquer vos identifiants

Mendeley pour

synchronisation

Espace comparable à

celui offert par Zotero

Espace x 10 par rapport à

celui offert par Zotero

Nombre de groupes et

membres à inviter

Pour en savoir plus sur Mendeley

� Pour en savoir plus : http://www.mendeley.com/ Videos / Tutorials

� Pour se former http://www.mendeley.com/ Upcomings events & Webinars

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Des questions ?

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Merci pour votre attention

� Support réalisé par Dominique Fournier, 25 juin 2012

� Accessible avec les autres supports Apéro Doc

https://www.mpl.ird.fr/documentation/formation_historique.html

� Comparatif Zotero, EndNote X4, JabRef et Zotero

http://www.ist.agropolis.fr/images/PDF/grille-comparative-zotero-jabref-mendeley-endnote.pdf

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