gérer ses références bibliographiques avec endnote

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Gérer ses références bibliographiques avec EndNote ominique Fournier [email protected] 4 février 2008 action pilote IST Agropolis

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action pilote IST Agropolis. Gérer ses références bibliographiques avec EndNote. Dominique Fournier [email protected] 14 février 2008. Déroulement de la journée. Matin 1 généralités sur les logiciels de gestion bibliographique 2 prise en main du logiciel Endnote - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Gérer ses références bibliographiques

avec EndNote

Dominique [email protected] février 2008

action pilote IST Agropolis

Page 2: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Matin1 généralités sur les logiciels de gestion bibliographique2 prise en main du logiciel Endnote3 typologie des références bibliographiques4 alimentation d’une base Endnote5 importation des références

Après-midi 6 rédaction d’un document scientifique en intégrant des références bibliographiques7 fonctions avancées (styles, term lists, openUrl, travelling library, …)8 Zotero : une alternative à Endnote ?

Déroulement de la journée

Page 3: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Généralités sur les logiciels de gestion de références

bibliographiques

Page 4: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Le chercheur utilise et produit de l’information scientifique et technique

Page 5: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Gestion informatisée de vos références bibliographiques: quels avantages ?

– Au niveau du stockage et de la gestion des références : facilités d’exploitation de gros corpus de références par la structuration en base de données

– Au niveau de la publication : récupération des références lors de l’écriture d’un texte, formatage automatique des références selon les normes d’écriture et conventions en vigueur ; saisie unique des données et choix d’un format d’édition

– Au niveau du suivi de la recherche documentaire : lien entre la recherche sur bases de données et la base personnelle

– Automatisation = gain de temps et facilités d’exploitation du corpus de références

Page 6: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Enregistrement & gestion des références

Gestion des documents en texte

intégral

Sources de donnéesPériodiques

électroniques

Bases de données bibliographiques

(portail Inra)

Autres sources

Bases bibliographiques

personnelles

Aide à la publicationscientifique

Edition de documents scientifiques avec liste

bibliographique

Stockage pdf, URL

La gestion bibliographique dans le processus de recherche et de publication

Page 7: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Conserver dans une base bibliographique les résultats de vos recherches documentaires

Par import de références / Par saisie manuelle

Retrouver facilement l’information en interrogeant ses bases bibliogain de temps considérable

Gérer sa propre documentation références bibliographiques + documents associés aux références (articles pdf, fichier word, …)

Ecrire une publication en gagnant du temps citations dans le texte et liste bibliographiquemodèles Word (Templates)

Exporter ses données sous d ’autres formats (SQL, Excel, …)

Editer des listes de références, « à la carte »en respectant les normes éditoriales (styles).

Un logiciel de gestion bibliographique: pourquoi faire ?

Page 8: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les grands classiques :

End Note

Reference Manager

Procite

Autres logiciels Biblioscape Bookends Plus (uniquement Macintosh)Bookwhere, Library Master, Papyrus

Thomson ISIhttp://thomsonisiresearchsoft.com/compare/

BibTex (lien avec LateX)

Quelques logiciels libres Bibus (groupe de travail Agropolis) : test 2007-2008Zotero (groupe de travail Agropolis) : formations prévues en 2008

Panorama de l ’offre commerciale

Page 9: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Caractéristiques d’EndNote

Page 10: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Library Bibliothèque, base de données de références biblio

Référence bibliographique identifiant unique : record number

format d’enregistrement correspondent à 1 type de documents : Reference type (Journal article, book, book section, …)

Informations spécifiques à un type de documents : champs (fields)

Champs et styles saisie des informations dans des champs séparés

édition « à la carte » selon un ordre et une mise en forme déterminés par le style bibliographique

Vocabulaire de base

Page 11: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Gestion de références biblio 32000 réf. / Bibliothèques (plus de limites à partir de v.8)Nbre illimité de bibliothèques

Grille standard prédéfinie: des types de documents (bibliographiques + multimédia)

des champs descriptifs (40-50 / type de document)64 000 caractères / document (16 p.)

Moteur de recherche:interrogation / champs tri, exportation,

Création d’une bibliographie (CWYW)lien direct avec Wordstyles (instructions / revues) 1300 différents (version 9)+ possibilité d’en créer des personnels

Récupération de références bibliographiques : bases externes filtres de conversion (Filters)

fichier de connexion (connection)

Caractéristiques d’EndNote

Page 12: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

(.enf)

(.ens)

(.enz)

(.dot)

Edit > Preferences… > Folder Locations

Les fichiers et répertoiresdu logiciel EndNote

Page 13: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Version 8 – 9 (et X)gestion du format unicode, taille des bases illimités, nouveaux types de références, nouveaux champs, gestion des préférences

Attention !Pas de « compatibilité descendante » / versions antérieures d’EndnoteRestriction de compatibilité (OS, traitement de texte)

Infos sur les versions plus récentes

Page 14: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Depuis décembre 2006, développement d’une version gratuite pour les utilisateurs du Web of Knowledge (INRA, IRD, CIRAD, CEMAGREF…)

Version complètement intégrée à la plateforme ISI Web of Knowledge

- possibilité de sauvegarder jusqu’à 10 000 réf. - plusieurs centaines de styles pour éditions - compatible avec Endnote et Word

Nécessité de créer un Profil sur WOK

Accès direct sur http://myendnoteweb.com

Présentation Audio : http://www.brainshark.com/brainshark/vu/view.asp?pi=908656274

EndNote Web Express

Page 16: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

• Installation (paramétrage du poste de travail + lien avec word)

W:\Biblio\EndNote7\Netsetup.exe Dans certains cas, fichiers .dll et .dot à copier dans le répertoire de démarrage de word (outils > options > répertoire par défaut)

• Lancement de l’application

W:\Biblio\EndNote7\EndNote7.exe

EndNote Program.lnk

• Version 6, 7, 9 et X (PC et Mac)

• Inscription préalable auprès de l’UIC formulaire à remplir en ligne

Le logiciel EndNote sur le campus Inra Montpellier SupAgro

Page 17: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Prise en main d’EndNote

Page 18: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Travail sur la librairie Paleo (exemple)

W:\Biblio\Endnote7\Examples\Paleo.enl

Ouverture - Fermeture - Personnalisation

Fermeture (sauvegarde)

Page 19: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Description d’une bibliothèque

W:\Biblio\Endnote7\Examples\Paleo.enl

Page 20: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Description d’une référence bibliographique

Nom de la référence (auteur, année, n°)

Type de document

ChampsNavigation entre références

Page 21: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Prévisualisation d’une référence bibliographiqueet notion de style

Écran de prévisualisation d’une référence, mise en forme avec un style par défaut (ou préalablement sélectionné)

Style

Style: fichier spécifique à Endnote, contenant la nature des champs et leurs caractéristiques de mise en forme dans Word, pour obtenir une certaine présentation des citations et des références bibliographiques

Page 22: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

STYLES - compléments

Ils sont localisés dans le répertoire W:/Biblio/Endnote7/Styles- 1012 styles dans la version 7- 1383 styles dans la version 9Ils utilisent des modèles qui déterminent pour chaque type de document quels champs sont utilisés, dans quel ordre et sous quelle forme

Pour sélectionner un style

Select Another Style ..

Auteur (nom prénom), Année. Titre. Revue, volume, page.

Page 23: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exercice : Prévisualiser une référence bibliographique avec différents styles

Écran de prévisualisation d’une référence, mise en forme avec un style par défaut (ou préalablement sélectionné)

Author-Date

Cell

Nature

Science

Sélectionner dans le Style Manager les styles correspondant aux revues Cell, Science et NaturePrévisualiser une référence avec ces 3 styles différents

Page 24: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Créer et alimenter une base de références

Type de référencesSaisie manuelleAide à la saisie

Page 25: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Créer une bibliothèque ( = une librairie)

Dans : C:\Bureau\EndnoteNom : formation Type: EndNote Library (*.enl)

Enregistrer

Create a new Endnote library

OK

Les fois suivantes :Open an existing EndNote library

Browse...

Astuce + rapide :CancelFile Open

Page 26: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Création d’une nouvelle référence

References > New Reference

Sélection du type de document

Page 27: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Sélection d’un type de Reference : Reference Types

Computer programElectronic sourceAudiovisual materialFilm or BraodcastArtworkMapPatentHearingBillStatuteCaseFigureChart or tableEquationUnused Unused2

GenericJournal ArticleBookBook sectionManuscriptEdited bookMagazine articleNewspaper articleConference proceedingThesisReportPersonnal communication

GenericJournal ArticleBookBook sectionManuscriptEdited bookMagazine articleNewspaper articleConference proceedingThesisReportPersonnal communication

Computer programElectronic sourceAudiovisual materialFilm or BraodcastArtworkMapPatentHearingBillStatuteCaseFigureChart or tableEquationUnused Unused2

Il existe 25 types de documents prédéfinis (34 dans version 9)

possibilité d’en créer des nouveaux (3 Unused)

Page 28: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les types de documents et les champs correspondants

Chaque type de documents peut être décrit par 40 champs (51 dans version 9)Les champs d’informations disponibles varient en fonction du type de document choisi, mais on retrouve une certaine logique sur une même ligne (auteur, date, lieu = de colloque, de soutenance, d’édition, …)

Edit > Preferences … > Reference Type > Modify Reference Types …

Ces modifications concernent la configuration d’Endnote sur votre ordinateur (ne sont pas attachées à la librairie !)

Possibilité de tout modifier sauf le type Generic qui sert de référence pour la dénomination des champs (dans les menus de recherche, …)

Page 29: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Principales règles de saisie manuelle

Auteur 1 auteur par ligneNom, Prénomsi collectivité mettre , (exple : INRA,)mentionner tous les auteurs connus

Année 4 chiffrespossibilité de spécifier si sous presse, etc…

Journal Entrer le titre complet du périodique(abréviation dans Alternate Journal)

Mot-clés 1 par ligneou séparé par 1 délimiteur ( , : ; /)(le préciser dans Tools > Define Term Lists >Keywords)

Page 30: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exercice : Saisie manuelle de références

Ouvrir votre librairie formation.enl

Saisir les différents types de documents proposés

Page 31: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Aide à la saisie - Correction orthographe

Endnote peut effectuer la vérification automatique d’orthographe d ’une notice ouverte

Tools > Spell Check

selon le dictionnaire choisi et la langueEdit >Preferences >Spell Check > Options

Page 32: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Gestion des PDF avec EndNote

Page 33: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Lien vers un document numérique (URL, DOI)

Information à renseigner dans le champ URL

Si DOI: Dans le champ URL : http://dx.doi.org/…

De + en + de revues demandent le DOI des articles cités dans la bibliographie. mettre l’information dans un champ (exemple : Label)

DOI : 10.1104/pp.103.029876

Page 34: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Lien avec un document (fichier pdf)

ReferencesLink To ….Select a file to link to the reference(URL, doc, pdf, xls, …) Lien relatif !

Pour accéder au document attaché :ReferencesOpen LinkOu clic-droit

Rque : Meilleure gestion des fichiers à partir de la version X

Page 35: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Importer des références

dans sa base EndNote

Page 36: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Sources de références bibliographiques

Méthodes :

Connexion directe sur BDD

Exportation directe depuis des BDD

Importation de fichiers (filtres)

Importer des références

Page 37: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Fichier texte structuréFile Import : Tab delimited (Import option)

faire précéder le type biblio par * (ex: *generic) et séparer les champs par <tab>attention : nécessité de préparer le document texte pour séparer les informations dans les champs . Bien estimer le coût-durée de la manip / saisie manuelle

Base EndnoteFile Import : endnote Library (Filter)

Sources externespériodiques électroniques,bases de données bibliographiquesImport du fichier sauvegardé pour export vers un logiciel bibliographique > File Import : sélection du Filtre correspond à la source interrogéeTéléchargement direct (Filtre & transfert automatique)Connection à la base de donnée à partir d’Endnote (Connexion)

A partir de quelles sources ?Par quelle méthode ?

Page 38: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Rechercher les publications 2007 des chercheurs INRA Montpellier en se connectant à PubMed à partir d’Endnote

ToolsConnect …

en utilisant fichier de connexion PubMed(NLM)

Importer des références en se connectant directement à la BDD à

partir d’Endnote

Page 39: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Faire la recherche dans la base de données bibliographiques

Sauvegarder les références dans un format lisible par Endnote (txt)

Importer les références dans la base Endnote en utilisant un Filtre d’import

FileImport

Importer des références par transfert de fichier

Page 40: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exemple : PubMedhttp://www.pubmed.com/

Display Medline Send to File pubmed-result.txt

Importation sous EndNote avec le filtrePubMed(NLM)

Recherche avancée

Page 41: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Comme les sites de périodiques, de nombreuses bases de données proposent l’export « automatique » des références vers Endnote (et/ou autres logiciels de gestion biblio)

Exemple : portail Inra : toutes les bases du WOK à l’exception de CAB (import indirect + filtre Cab_Wok)

Importer des références automatiquement

Page 42: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

En général, l’export se fait de façon quasi-automatique à partir des sites des éditeurs

Importer des références à partir de périodiques électroniques

Page 43: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Recherche dans ScienceDirect de 20 articles récents sur votre sujet de

recherche

http://www.sciencedirect.com

Page 44: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Récupération des références à partir des BDD de la plateforme Inra

Page 45: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Récupération des références à partir des BDD de la plateforme Inra (2)

Page 46: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Récupération dans le Web of Science des 20 publications les + citées sur

votre sujet de recherche

Dispositif revelec > WOS > GENERAL SEARCH

Page 47: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Autres sources …

Tableau récapitulatif - Documentation / Inra Montpellierhttp://www.montpellier.inra.fr/documentation/importation_endnote.htm

Biomed Central

Agricola

Google scholar

Alertes e-mail à partir du WoS, …

Page 48: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Gestion des références bibliographiques

dans une base EndNoterecherche

tricopie

impression

Page 49: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

1 – opérations sur les références

Suppression d’une référence ReferencesDelete references

Visualisation de toutes les référencesReferencesShow All

Recherche de doublons et suppressionReferencesFind DuplicatesReferences > Delete References

Page 50: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

2 - Recherche dans une librairie

References > Search References

Recherche multi-champs

Opérateurs logiques entre champs (And, Or, Not)Pas d’opérateurs logiques à l’intérieur d’une case de rechercheplusieurs mots = expression

Ajout possible de cases d’énoncés

Respect de la casse

Sauvegarde du profil de recherche

(Save)Rappel d’un profil

précédemment sauvegardé

(Load)

Recherche sur l’ensemble / sous-ensemble des références (recherche précédente)

Ctrl+1Recherche dans

une liste de termes

Page 51: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exercice : recherche dans une librairie

Rechercher dans Paleo.enl tous les articles écrits par Billoskientre 1990 et 1998

Page 52: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

4 - tri des références

References > Sort References

3 - sélection manuelle de références

choix multiple des noticesCtrl + click souris

Page 53: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Tri rapide des références double-clic ou References > Sort References

Affichage des champs (Auteur, Date, Titre par défaut)

Edit >Preferences>Display Fields

5 – Affichage des colonnes et tri des références

Page 54: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

6 – opérations sur les références (+ exercices)

Copier le contenu d’un champ autre champs ReferencesChange and Move Fields

Changement de champs Label custom1

Page 55: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

7 – opérations sur les références (+ exercices)

Ajout de termes pour un ensemble de références

References

Change and Move Fields

Ajouter dans le champ la source (TP) pour les références importées de Paleo

Page 56: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

8 – opérations sur les références (exercices)

Changement global : pour un ensemble de références

Edit

Change text

Dans le champs Notes, remplacer TP par TP n°4

Page 57: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

5 – Copier et Imprimer des références

Vers une autre base EndNote« copier - coller » classique Edit > Copy puis Edit > Paste

Vers une imprimanteFile > PrintSelected References

Vers un fichier texte (Word)Edit > Copy formattedpuis dans Word Edition > Coller

Exercice : Copier les références de Billoski (Paleo.enl) dans votre bibliothèque personnelle

Page 58: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE N°4 : Editer une liste de publications, la sauvegarder dans Word pour l’imprimer

Rechercher  les doublons dans votre baseRechercher les références depuis 2005Les trier par année décroissante, et auteurs (AZ)Les importer dans un fichier RTFReferences > Find Duplicates Delete Selected References

References > Search ReferencesYear « is greater or equal than » 2005

References > Sort ReferencesYear (ZA) and Author (AZ)

File > Export > format *RTFEdit > Copy formatted puis dans Word Edition > Coller

Remarque : dans word, les modalités de tri dépendent du style

Page 59: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Rédiger des documents scientifiques

intégrant des références bibliographiques

Page 60: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

1 - Utiliser un modèle (Template)

2 - Edition d’une liste bibliographique simple

3 – Edition de Bibliographie par sujet

4 – Module « Cite While you Write » CWYW

Rédiger des documents intégrant des références bibliographiques

Page 61: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Aide à la structuration de l’article, prédéfinition des marges, pagination, … selon règles éditoriales

Sous Endnote:ToolsManuscript Templates

Exercice - rédaction d’un article selon les normes éditoriales de la revue CELL

1 - Ecrire une publication en utilisant un modèle

Page 62: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

2 - Edition de liste de références bibliographiques

liste simple, non évolutive (sortie papier, …)

Exportation dans un fichier texte:- Sélection des références- Sélection du style (qui détermine l’apparence de la liste)

- Exporter au format TXT, RTF, HTML, XML,File Export

Copie des références / Coller dans Word ou envoi vers imprimante- Sélection des références- Sélection du style (qui détermine l’apparence de la liste) Copy Formatted ou File Print > selected references

Page 63: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

3 – Création de bibliographie par sujet

Une bibliographie par sujets est faite de petites listes de références apparaissant sous une entête distincte :

sujets : keywords auteurs = Authors titre de périodique = Journal Title équipe d’une unité = custom1

Sélectionner les références à inclure dans une biblio / sujetMenu Références … Search referencesou sélection manuelle

Identifier les sujets de la biblio / sujetMenu Tools … Subject BibliographySubject Fields : choisir 1 ou plusieurs champs

List each author separately : le nom de chaque auteur deviendra un sujetIn other fields, list each entry … : si on souhaite séparer un champ en plusieurs sujets (par défaut, les keywords sont toujours listés en entrées individuelles)

OK

Page 64: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Création de bibliographie par sujet (2)

Une fenêtre Subject terms affiche les termes trouvés et le nombre de références (records)

Sélectionner les termes que vous souhaitez inclure comme sujets(Select all, …)

Une fenêtre Subject Bibliography – nom de la base de donnée s ’ouvreOutput StyleLayout : options pour le formatage (Tri, Titre, Terms : accès à la liste de termes pour ajouter ou retirerPrint preview, Print, …

Page 65: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE - édition d’une bibliographie par titre de revue (pour les 7 principaux titres de revues dans lesquelles les chercheurs de l’Inra de Montpellier ont publié)

Tools … Subject Bibliography

Page 66: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE - édition d’une bibliographie classée par type de documents (cas d’un dossier d’évaluation), chapitres de thèse Tools … Subject Bibliography

Page 67: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

4 - Rédaction d’une publication avec des citations automatiques

Le principe : 1 ) Insertion de références brutes dans son texte à partir

de références de sa bibliothèque Endnote2 ) formatage à partir d’un style souhaité,

3 ) les références citées se trouvent automatiquement mises en forme à la fin du texte

références brutes : [Lauri, 1998#34]

Citation : (Lauri, 1998) ou [1]Référence citée : Lauri PE, 1998, Titre de l’article, Titre de la revue Vol(issue) : pagination.

Page 68: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Étape 1 : Insertion de citations dans un document Word

Dans Word, différentes commandes apparaissent dans le menu Outilsen pratique, il est commode de travailler avec les 2 applications ouvertes

Positionner le curseur à l ’endroit où vous désirez citer la/les référence(s)Insert selected citation

Astuce: « copier - coller » classique

1er auteur, année #N° de la référence dans la base EndNote

Possibilité d’effectuer une recherche pour retrouver la référence à citer

(recherche dans tous les champs)

Page 69: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Etape 2 : Formatage de la bibliographie

automatique Outils > Endnote7 > Cite While You Write

manuelle Outils > Endnote7 > Format Bibliography

Page 70: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les cas particuliers par rapport au texte

En fonction du style utilisé, il est possible de personnaliser le format des citations dans le texteEdit > Output StyleEdit Nature - CellCitations > Templates

(Dupond, 2002)

cette étude1 montre

En fonction du contexte de la phrase, il est possible d’ajouter du texte, avant ou après les champs auteurs et année, de supprimer les parenthèses….se positionner sur la citationEdit Citation(s)Préfix et Suffix

Lauri (2003) a montré …(Voir Lauri, 2003, p. 34)

Page 71: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Quelques recommandations

Insérer des citations à partir d’une seule bibliothèque Endnote

Ne faire aucune modification sur les références formatées (si nécessaire, déformater au préalable, modifier la référence dans Endnote puis reformater: les modifications seront alors prises en compte)

Supprimer les codes-champs introduits par Endnote dans le texte avant envoi à un tiers, à l’éditeur …(risque de non-lisibilité)Outils > Endnote7 > Remove Fields codes

Page 72: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE - Insérer des références biblio dans un article en cours de rédaction …

Travail sur le document

•       insérez les références à partir de la base formation.enl

• éditez la liste des références bibliographiques • (Format bibliography) en utilisant• le style Cell puis Science

Page 73: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

Fonctions avancéesPersonnalisation des stylesPersonnalisation de la grille de saisieListe de termesSCAN RTFLibrairie de voyageOpenURL

Page 74: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

1 - les STYLES

Les styles sont classés par grandes catégories:

NameCategory

Find : accès à la liste des catégories (exple Science)

More info : style info - style preview (journal, book, book section)

x pour activer un style: cliquer le nom du style

1 ) Pour sélectionner un style éditorial parmi les existants

Edit > Output StylesOpen Style manager

fichier spécifique à Endnote, contenant la nature des champs et leurs caractéristiques de mise en forme dans Word, pour obtenir une certaine présentation des citations et des références bibliographiques

Rappel :Aperçu du style disponible dans le panneau de prévisualisationdans le répertoire W:/Biblio/Endnote7/Stylespour pouvoir le personnaliser : C:/Endnote/Style (dans ce cas, modifier dans Preferences/Folder Location …)

Page 75: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les STYLES - caractéristiques

Les 4 premières options (about this style, anonymous works, page numbers, journal names) s ’appliquent à la fois aux citations, bibliographies et notes de bas de pages

Une option Template permet de définir les champs et la ponctuation à inclure dans le formatage

CitationsBibliography

2 - Comprendre la grille d’un style (Nature)

Edit > Output StylesOpen Style manager

NatureEdit

Page 76: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les STYLES - Bibliography

L ’option Templates définit pour chaque type de documents

- les intitulés des champs présents dans les références dont les contenus apparaîtront dans la bibliographie- la ponctuation- des signes conventionnels propres à Endnote et réservés au formatage

Style [Nature]Journal Article

Author. Title. Revue.°Volume|:°Pages|°(Year)|.

Caractères spécifiques

4 règles de base:la dépendance : Volume (Issue)

la prépondérance du champs précédent : Volume:Issue Pages

L ’espace et le champ : Author. Title

Le texte indépendant : Year, Publisher ed.

Page 77: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les STYLES - Bibliography

Style [Nature]Journal Article

Author. Title. Revue. °Volume|:°Pages|° (Year)|.

Les caractères spéciaux pour le formatage:texte dépendant de la présence d ’un champ :

° Alt+Ctrl+Space (Link adjacent text)vol. °Volume si pas de volume --->

Caractères spécifiques

séparation forcée : (séparer des infos dépendantes)| Alt Gr +6 (Forced Separation)

^ : séparer les versions singulier / pluriel des étiquettes qui sont liées à certains champs

Editor, Ed.^Eds.

Volume.Issue (Year) si pas d ’issue -----> 62. (2000)

Volume|. Issue| (Year) si pas d ’issue -----> 62 (2000)

Pages|. (. Final indépendant de la présence de l ’information Pages)

Page 78: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Les STYLES - Bibliography - autres options

Bibliography Layout :permet d ’insérer du texte avant et après chaque référenceInsert Field

Sort Order:instructions paramétrant l ’ordre des références dans la bibliographie

Les STYLES - Footnotes (bas de pages)

Templates :idem Bibliography

Repeated citations :Paramétrage des citations répétées dans le bas de page

Page 79: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Modification d’un style ou création d’un style personnel

Il vaut mieux modifier un style existant (copie cell+ nouveau nom = perso)

Edit > Output StylesEdit perso

BibliographyTemplates

Reference Type : pour ajouter un type de documentInsert Field : pour ajouter un champ

Page 80: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Sur le site de l’éditeur d ’Endnote ou de la revue

Mise à jour des stylessur le style de l ’éditeur http://www.endnote.com/support/enstyles.asp

Ne pas oublier dans quel répertoire EndNote va chercher les StylesEdit > Preference >Folder Location

Importation de nouveaux STYLES

Page 81: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exercices : modification de styles

création d’un style personnel pour une bibliothèque (exemple : fiche ouvrage)

Bibliothèque de l’UMR DAP

< 777 > - Abricot: les variétés mode d'emploi, guide pratiqueLichou, J., et al. (1998), Ctifl, 256 p.

insertion du résumé à la suite de la référence biblio (exemple : fiche de lecture)

Costes, E. and E. Garcia-Villanueva (2007). "Clarifying the effects of dwarfing rootstock on vegetative and reproductive growth during tree development: A study on apple trees." Annals of Botany 100(2): 347-357.

Background and Aims Despite the widespread use of dwarfing rootstocks in the fruit-tree industry, their impact on tree architectural development and possible role in the within-tree balance between growth and flowering are still poorly understood, in particular during the early years of growth. The present study addressed this question in apple trees, through a detailed analysis of shoot populations, i.e. both vegetative and flowering shoots, during tree development.

Page 82: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

2 - Personnalisation de la grille de saisie

Edit > Preferences … > Reference Type > Modify Reference Types …

Possibilité de :- modifier l’intitulé d’un champ ou d’un type de document,- supprimer un champ- masquer un type de document . .Manuscript

Ces modifications concernent la configuration d’Endnote sur votre ordinateur (ne sont pas attachées à la librairie !)

Page 83: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Ouverture de votre base formation.enl

Ne conserver que 6 types de documentsArticleOuvrageChapitreCommunication à des colloquesThèseBrevet

Simplifier la grille de saisie pour les articles(suppression de champs inutiles, termes en français)

Auteur, Année, TitreRevue, Volume, Issue, PagesMots-clés, Résumé

Créer 1 champ CSS (custom1)mots-clés « anglais » (custom2)

EXERCICE : Modification de la grille saisie

Page 84: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

3 - Les listes de termes (term lists)

Endnote complète automatiquement l’entrée des termes à l ’aide d ’index (Term Lists)

Par défaut: Authors, Journals, Keywords

Tools > Open Term Lists

Création d ’autres listes de contrôle à la saisie (UMR, équipe, etc…)

Tools > Define Term Lists

Create List… lui donner un nom (par exemple UMR)

Update List… choisir les champs qui vont alimenter cette liste (Custom1 = UMR)

Import List… importer une liste en format texte (. Txt)revues scientifiques 3 listes proposées (W:/)répertoire Term Lists: Medical.txt, chemical.txt, humanities.txtautres listes (format txt)

Link List … relier les champs à cette liste de termes

Page 85: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE : Importation de listes de termes

Ouvrir votre librairie formation.enl

- Importer une liste de journaux > Journal Term List Lists > Import list…liste_agro.txt

Évite de renseigner Alternate Journal

Page 86: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

EXERCICE - Importation de listes de termes

- Créer une liste (CSS) et importer le fichier CSS.txt (typologie des publications écrites pour l’évaluation des chercheurs INRA)

> Tools > Define Term List> Create List> Import List> Link Lists (custom1 CSS)

- Caractériser les publications que vous avez saisi manuellement

Page 87: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

4 - RTF Document Scan

La fonction "Scan" permet de mettre en forme des fichiers sauvegardés au format RTF afin de créer des bibliographies dans n’importe quel traitement de texte : StarOffice, OpenOffice, AppleWorks, FrameMaker. Il est également possible de copier/coller des références depuis une bibliothèque EndNote dans ces traitements de texte.

Dans Endnote : Tools > RTF Document ScanSélectionner le document .rtf et le style ad hoc

Page 88: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

5 – Travelling Library

Librairie de voyage Chaque citation formatée est enregistrée avec des codes spéciaux qui caractérisent la référence (sauf résumé, notes). Le document est associé à une sorte de bibliothèque de voyage comprenant l’ensemble des référénces citées. Si la bibliothèque source Endnote n’est pas ouverte ou indisponible, Endnote utilise les données de cette traveling library.

Ce fonctionnement permet à plusieurs auteurs de travailler sur le même document sans nécessairement utiliser la même bibliothèque Endnote et/ou de récupérer dans Endnote toutes les références citées dans un document word

Outils > Endnote7 > Export Traveling library

Attention : ne pas revenir au stade « citations non formatées » car cela nécessite l’ouverture de la bibliothèque endnote originale

Page 89: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Activation de l’Open URL (resolveur de liens)

Edit > Preferences > OpenURLX Enable OpenURL http://oasis.versailles.inra.fr:3210/sfxtst3 vider ou laisser vide la fenêtre "Arguments" (facultatif) valider en cliquant sur Appliquer ou OK Ouvrir une référenceReferences > OpenURL Link

6 – Open URL

Cette fonctionnalité vous permet de vérifier la disponibilité du texte intégral d'une référence bibliographique contenue dans votre base EndNote, dans les ressources documentaires conformes à la norme OpenURL (ressources électroniques Inra, catalogues de ressources papier, …)

Page 90: Gérer ses références bibliographiques  avec  EndNote

14 février 2008

Exercice - Accéder au texte intégral de l’article de Fourcroy et al.,2004