epidémiologie du choléra en sierra léone et guinée · 2018-03-12 · préparation &...
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Epidémiologie du choléra en Sierra Léone et Guinée
Contexte
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 2
Contexte géographique
Littoral vs Inland
Climat
Population
Capitale littorale
Voie de communications
Plateau guinéen
Activités commerciales
2 ou 4 ?
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 3
0
5000
10000
15000
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30000
35000x
x
0
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100001500020000250003000035000
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1970
1972
1974
1976
1978
1980
1982
1984
1986
1988
1990
1992
1994
1996
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2000
2002
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2006
2008
2010
2012
x
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 4
Synthèse
Nombre de cas Nombre de décès Nombre de cas Nombre de décès
1970 Oui Guinée 2000 60 293 731971 0 0 211 131977 Juillet Guinée 0 0 12 01978 Juillet 13251 59 0 01986 Janvier Oui Kabak/Kakossa 9222 78 8957 6691987 Sierra Leone 0 0 557 301994 Juin Oui Sierra Leone Kambia 31415 671 9709 6261995 Oui 6506 565 10285 4471996 287 17 0 01998 Juillet Oui Forecariah 881 53 2096 571999 Septembre Oui Kambia/Forecariah 599 28 863 52000 519 32 0 02001 392 22 0 02002 61 11 0 02003 6 1 0 02004 S 30 Oui Guinée Forecariah 1516 117 1747 472005 Oui Kambia/Forecariah 3821 107 6 02006 Aout Oui Guinée 3242 219 2699 1242007 S 4 Oui Sierra Leone Kambia 8546 311 2219 842008 S 16 Oui Guinée Guinée forestière 513 32 62 12009 42 0 0 02012 S 1 Oui Sierra Leone Kambia 7227 128 22495 293Total 90046 2511 62211 2469
75488 2369 61431 2426Sous-total épidémie transfrontalières
Année
Guinée Sierra Leone
Relais de diffusionPays de
déclanchementDebut (semaine)
Epidémie transfrontalière
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 5
Historique
Diffusion littorale
Saisonnalité
Amplitude
Inter-connexion
1970
1978
1986
1994
2004-07
x
0
5000
10000
15000
20000
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35000
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20000
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x19
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9820
0020
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1020
12
x
2012
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 6
2003-2012
0
250
500
750
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2002
w40
2003
w1
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w13
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w26
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w1
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w1
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2007
w1
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2009
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w13
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w26
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w1
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w1
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1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40
2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012
Wee
kly
num
ber o
f cho
lera
cas
e
Week / Year
Conakry
Maritime Guinea
Others Prefectures
Guinea
Metastabilité littorale
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 7
Semaine 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 522003 Conakry ← →
Coyah ← →Dubréka ↔Kindia ← →
SeptembreJuin MarsJanvier
2004 Boffa ← →
Kindia ← →Lélouma ← →Dalaba ← →Télémélé ← →Coyah ← →Dubréka ← →Conakry x ← →Forécariah x ← →
2005 Conakry ← → … ?Dubréka ← →Forécariah ← → ← →Coyah ← →Kindia ← →Pita ← →Boffa ← → … ?Boké ← → … ?
Semaine 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 522006 Conakry ← →
Coyah ← →Kindia ← →Dubréka ← →Forécariah ← →
Boké x x
Janvier Mars Juin Septembre
2007 Forécariah ← →Dubréka ← →Conakry x ← →Coyah ← →Boffa ← →Boké ← →Fria ← Kindia ← →Télémélé xDalaba ← →Dabola ← →
2008 Boké ← →Boffa ← →Gaoual x
Conakry (Dixinn) x
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 8
Saisonnalité
Lien écologique
n’ est pas causalité.
Cependant utile pour la préparation
Facteurs macro vs micro
0
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100
150
200
250
300
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400
450
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…
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…
0
…
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…
0
…
Somme de précipitation Somme de cas
2003 2004 2005 2006 2007Precipitation Cas
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 9
2012: Courbe épidémique Guinée vs Sierra Leone
0
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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52
Guinée Sierra LéoneSemaines
N cas
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 10
2012: Courbe épidémique Conakry vs Freetown
0
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1500
2000
2500
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52
Conakry FreetownSemaines
N cas
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 11
Sem 1-4
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 12
Sem 5-21
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 13
Sem 22-28
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 14
Sem 29-34
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 15
Sem 35-40
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 16
Sem 40-45
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 17
2012 : Exemple de démarrage
Prefecture Date Hisoitre du premier cas
Forecariah 02/02/2012Un jeune homme de 15 ans provenant du village de Bailó (Sierra Léone) était arrivé a Khounyi le 2 février pour rendre visite a son père qui travaillait a…. Il est resté a khouni chez la famille de son onlce. Ce soir là, il a commencé avec diahrree et vomissement intense et le lendemain a été envoyé de retour à Bairo, où il est décédé
Boffa 23/02/2012 Jeune pêcheur de 15 ans, retourné à Boffa dans une embarcation qui venait des activités de pêche de khounyi
Bokké 22/04/2012Jeune pêcheur de 25 ans, retourné à Boké dans une embarcation qui venait venait des activités de pêche de khounyi. Est décédé.
Conakry 29/05/2012 Jeune de 25 ans, commercant de vetement était parti au marché de Kabak ou il a contracté le choléra
Kindia 24/07/2012Une femme ménagère de Colanté qui est aller à Conakry pour rendre visite a une personne de sa famille malade de choléra. Elle est décédé.
Fria 28/07/2012 Hommes de 29 ans, mécanitienCoyah 01/08/2012 Homme de 25 ans, boucher
Kerouané 30/08/2012 Homme cultivateur de 65 ans. Décédè. L'origine de la maladie n'a pas été identifiéKankan 0/08/2012 Chauffeur de taxi de 28 ans, venait de Conakry pour Kankan.
Mamou Ressortissant de Mamou qui réside a Conakry, était aller a Niagara (sous-préfecture de Mamou) chez sa famille pour leur aporter des aliments. A comencé les symptomes là bas. Mort en cours de route car le centre de santé n'avait pas les moyes pour la prise en charge
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 18
Pref_sanitaire Cas Déces Cas DécèsDurée
épidémique TIC / 10 000 hab
Létalité
(n) (n) (%) (%) (n. sem) Com.Conakry 4617 24 63,9 18,8 24 28,1 0,5Kankan 53 5 0,7 3,9 3 1,3 9,4Kérouané 90 6 1,2 4,7 9 3,9 6,7Mamou 123 11 1,7 8,6 15 3,5 8,9Kindia 121 4 1,7 3,1 9 2,8 3,3Coyah 668 11 9,2 8,6 17 52,2 1,6Dubréka 354 7 4,9 5,5 16 17,9 2,0Forécariah 342 29 4,7 22,7 34 11,6 8,5Boké 210 8 2,9 6,3 20 4,8 3,8Boffa 281 11 3,9 8,6 25 12,0 3,9Fria 355 10 4,9 7,8 11 28,9 2,8
7227 128 100 100 6,04 1,77
Cas Décès
(%) (%) 2,8 4,81,4 3,41,7 5,14,5 4,80,0 0,02,9 1,00,8 0,75,9 5,56,7 10,90,3 0,0
15,3 19,85,3 10,9
52,2 33,1
100 100
TIC / 10 000 hab
10,921,214,838,60,0
11,35,0
29,246,02,7
65,829,8
66,9
35,37
Durée
épidémique
(n. sem) 171316240
118
17448
4116
21
Létalité
2,23,23,81,40,00,51,11,22,10,0
1,72,7
0,8
1,30
District
BoBontheMoyambaPujehunKailahunKenemaKonoBombaliKambiaKoinaduguPort LokoTonkoliliWestern Area
Total
Cas Déces
(n) (n) 638 14312 10391 15
1020 140 0
647 3186 2
1326 161510 32
70 0 3450 58
1200 32 11745 97
22495 293
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 19
2012 : Profil épidémiologique
Guinée Sierra Léone
Démarrage littorale S5
Diffusion initiale : …mai
Boké-Boffa S7
Capitale : S22 # S30-35
• Amplification
• Facteur météorologique
• Hétérogénéité spatiale
• # S22-S29 : Préf. Voisines
Extension Guinée Bissau
Saison sèche
• Date – augmenation AWD ?
Démarrage littorale S2
Diffusion initiale : …mai
Frontière Libéria S7
Capitale : S24 # S30-35
• Amplification
• Facteur météorologique
• Hétérogénéité spatiale
Extension Libéria
Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 20