Virus à ARN + : stratégie de réplication
Caractéristiques spécifiques• polyprotéine• protéase• protéines non-structurales
Virus à ARN - : Organisation du génome
3’ 5’
Enveloppeglycoprotéine
Matrice PolymérasePolymérase
Nucléocapside
5’ 3’
MN P G L
Transcription discontinueARNm sous-génomiques
RageRougeoleOreillonsVirus de la stomatide vésiculaire (VSV)EbolaMarburg
+
-
Enzymes structurales P,L
Nucléocapside (N, NC, NP)
traduction
modificationpost-traductionelle
morphogenèse
réplication: ARN-
traduction
ARN-
2°) transcription discontinue
Virus à ARN - : stratégie de la réplication
3°) traduction
Membrane cellulaire
1°) dissociation de N de ARN
ARNm
4°) réplication : ARN+Modification de la
fonction de laréplicase
5°) traduction (massive) morphogenèse
-
Virus à ARN - : stratégie de la réplication
Caractéristiques spécifiques• enzymes structurales (polymérases)• transcription discontinue• protéine N
Rétrovirus : Organisation du génome
Transcription : épissage alternatifRNAm sous-génomiques
Gag-PolVifVprVpu, EnvTatTevRev, NefNef
Virus à ARN -Enzymes structurales
Virus à ARN +Polyprotéine & Protéase
Protéase IntégraseTranscriptase
inverseM C NC
ARNm (+)
HIVMLVRSV
1°) rétrotranscription
6°) modification post-
traductionnelle
7°) morphogenèse
3°) transcription
ARNmmultiépissés
Maturation de lapolyprotéine
4°) épissage alternatif
Membrane cellulaire
3’5’5’
Membrane nucléaire
2°) intégration
3’5’5’
ADN (-)
ARNmmonoépissés
ARNmnon-épissés
Transcriptaseinverse
Intégrase
ARN polymérase II
Protéase
5°) changement du cadre de
lecture
Env Gag-Pol GagTatRevNef
Rétrovirus : stratégie de la réplication
Rétrovirus : stratégie de réplication
Caractéristiques spécifiques• enzymes structurales
• Transcriptase inverse• Intégrase• Protéase
• intégration dans le génome de l’hôte• épissage alternatif (3 cadres de lecture)• polyprotéine• changement du cadre de lecture
Virus ARN +Virus ARN --enzymes structurales - +-réplicase virale + +-helicase + --protéine N - +-modification de lafonction
de la réplicase par N - +-ARNm taile génomique taile sous-génomique
(ou sous-génomique) (ou génome ségmenté)1 ARNm = plusieurs protéines1 ARNm = 1 protéine
- polyprotéine + -- protéase(s) + -
ARN génomique subi 1°) traduction 1°) ARNm2°) ARN- (antigénomique) 2°) ARN+ (antigénomique)
réplicase (P,L)(1-3 sous-unité)protéine N(Nucléocapside)Virus ARN + et -
-sb
Un 16-20 Uneprotéine
Transcriptase
- + rhabdoviridae virus de la stomatite vésiculaire (VSV),rage,
" Un " + - + filoviridae Ebola, Marburg
" Un " + - + paramyxoviridae rougeole, oreillons, parainf luenza
" 7-8 segments 14 " + ARNmcellulaire
+ orthomyxoviridae grippe
+/- sb 3 segments 13-21 " + " + bunyaviridae Fièvre hémorragique, Hantavirus
" 2 segments“circ”
10-14 " + " + arenaviridae Lassa, Machupo, virus de la Chorioméningitelymphocytaire (LCMV)
db 8-12segments
22-27 " + - - reoviridae rotavirus, maladie fébrile
" 2 segments 7 " + - - birnaviridae "bursal disease of chickens"
Soulignements : hépatites; maladies infantiles
polarité
ARNgénomique
taille(kb)
ARNm Enzymesdans levirion
amorce enveloppe Nom de famille
+sb
Un 7.2-8.4
Ta ille degénome
- Protéine - picornaviridae Entero-: poliomyélite, Cardio-Hepato-: hépatite A, Rhino-
" Un " - " + f laviviridae hépatite C, f ièvres hémorragiques: f ièvrejaune, virus de la dengue, encéphalite deSt.Louis
" Un 10-12 Subgénomique
- - + alphaviridae rubéole , virus de Sindbis (SV),virus de la foret de Semliki (SFV)
" Un " - - + coronaviridae "common cold pneumonia"
" Un " - - caliciviridae hépatite E, gastroentérite
Familles de virus à ARN humains et animaux
Pandémie de l'influenza 1918-1919Un des évènements les plus mortels dans l'histoire
Millions de mortsPandémie d' influenza (1918-1919) 20-40La mort noire (la peste) (1348-1350) 20-252e guerre mondiale (1937-1945) 16Pandémie du SID A (jusqu'à 1997) 121re guerre mondiale (1914-1918, morts militaires) 9
La virus de la grippe est un virus à ARN- avec un génome segmenté
Enzymes structurales :Polymérases PA, PB1, PB2
Protéine « N » (=NP)
(Hémagglutinine)
(Neuraminidase)
L’acide sialique est le récepteur du virus de la grippeTropisme viral au niveau de l’entrée
Liaison 2’-6’ : trachée de l’hommeLiaison 2’-3’ : les oiseauxLiaison 2’-3’ & 2’-6’ : cochonMembrane cellulaire
Tropisme du virus de la grippeSouches humaines : préférence de hémagglutinine : 2’-6’Souches aviaires (H5) : préférence de hémagglutinine : 2’-3’
HA