Jean-François GHIGLIONE
Chargé de Recherche – CR1 CNRS
Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-mer
Laboratoire d’Océanographie Microbienne U.M.R. CNRS 7621
Les bactéries et le pétrole
PLAN DU COURS (de la déprime…aux solutions)
I. Généralités sur les pétroles
1. Place du pétrole dans les sociétés
2. Les problèmes écologiques liés au pétrole
3. Composition des pétroles et devenir en milieu marin
II. Intervention de l’homme dans la dépollution
1. Elimination physique des pétroles
2. Compréhension de l’écosystème : vers la bioremédiation
3. Exemples d’applications
III. Recherche de biomarqueurs des pétroles
1. Isolement
2. Génétique, génomique et protéomique
3. Biocapteur
1859: Premières découvertes de pétrole en
Pennsylvanie (États-Unis) (Edwin Drake et George Bissell)
Guerre Irak-Iran
Prix x2
Place du pétrole dans les sociétés
Place du pétrole dans les sociétés
A quoi sert le pétrole ?
78%
Place du pétrole dans les sociétés
Le pétrole est partout:
il intervient directement ou indirectement
dans la production de 95 % des biens industriels
Un ordinateur : 24 kilos accompagné d'un écran 17 pouces (fabrication et transport d’Asie):
612 litres de pétrole
Un jean (culture du coton en Inde, transport, tissage en Tunisie, fabrication) :
25 litres
Un pneu "classique ’’ de voiture 7,25 kg (gomme, acier, vulcanisation) :
27 litres et jusqu’à 102 l. pour un poids lourd.
Un kilomètre d'autoroute (enrobé à 5% de bitume et fabrication à chaud):
59.800 litres de pétrole par km.
Un gobelet en plastique = 3,2 g de pétrole
4 % de la production pétrolière mondiale est utilisée pour fabriquer du plastique.
Un yaourt: 40 g de pétrole par kilo.
Combien de pétrole dans…
Place du pétrole dans les sociétés
Pourquoi le pétrole ?
Il ne coûte pas cher…
Comparaison prix
du pétrole/café (1 gallon = 3,78 litres)
Amélioration du
pouvoir d’achat
Place du pétrole dans les sociétés
Pourquoi le pétrole: il ne coûte pas cher…
… et équivalence énergétique (travail homme/pétrole)
Energie fournie par un organisme humain:
2,5 kWh par jour pour 2000 cal. d’alimentation
Energie fournie par 1L d’essence:
10 kWh et ~eq. 4kWh d’énergie mécanique (moteur)
Energie bon marché «inépuisable» remplace le labeur humain dans les manufactures
Permet de créer une vaste quantité de biens de consommation
Amélioration des conditions de vie: doublement de l’espérance de vie
Développement du modèle industriel au détriment du modèle agricole (apparition
de mégapoles, système de transport individuel très énergivore, etc.)
Frénésie de production et de consommation actuelle…
Place du pétrole dans les sociétés
Le pétrole est partout: explique l’extraordinaire croissance de sa
consommation
Les 30
Glorieuses
x3
L’accroissement de la
population n’explique pas
tout…
en 1 siècle:
- population x4
- consommation d ’énergie x10
Place du pétrole dans les sociétés
Le pétrole est un élément déterminant du prix
de plusieurs matières premières et denrées
Pétrole
Métaux
Que représente
le pétrole
dans le mix énergétique mondial ?
Place du pétrole dans les sociétés
Place du pétrole dans les sociétés
Evolution du prix du baril
Relation avec les conflits mondiaux – récession économiques Périodes de récession
économique
a seconde raison tient à son prix bas
Baisse
production
OPEP
40
20
60
80
100 Evolution du prix du baril en $ (eq.159 l)
Place du pétrole dans les sociétés
Qui produit le pétrole ?
Place du pétrole dans les sociétés
Pays producteurs
Pays consommateurs
Nord
Prod: 31 MdsB/j
Conso: 48 MdsB/j
S Prod: 51 MdsB/j
Conso: 32 MdsB/J
Place du pétrole dans les sociétés
A qui profite la manne pétrolière ?
Mais où passe donc la manne pétrolière ?
Majoritairement les pays du Nord
Les Etats, lorsque
l’exploitation du pétrole
est nationalisé
Dans tous les cas, l’aspect redistributif
aux populations est faible
Les problèmes écologiques liés au pétrole
Les problèmes écologiques liés au pétrole
1-Réchauffement climatique
Les problèmes écologiques liés au pétrole
1-Réchauffement climatique
Il faudrait ne pas dépasser 2°C d’augmentation de température soit environ 450 ppm do CO²;
nous en sommes déjà à 491 ppm et une augmentation de +0,6° depuis 1950.
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
Tous les pays producteurs ont atteint le peak-oil
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
Courbe de Hubbert pour le pétrole
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
Outre la dégradation des
paysages, les procédés
d’extraction des schistes
bitumineux consomment
3 à 4 fois plus d’eau que celle
utilisée pour le pétrole
classique ainsi que des
produits chimiques.
Le tout en rejetant 3 à 5 fois
plus de gaz à effet de serre
que pour les hydrocarbures
traditionnels
car ils utilisent beaucoup
d’énergie pour le
chauffage des schistes.
Schistes bitumineux en Alberta
Les problèmes écologiques liés au pétrole
2-L’épuisement des ressources…
En tout état de cause, la fin physique du pétrole sera précédée
par la fin du pétrole bon marché.
Prix en augmentation
Conflits et récessions économiques
1: Début de l’ère industrielle
4 : Eruptions de violences au Moyen-Orient
5: Pic de la production de pétrole
6: Plus de 50% du pétrole provient des pays de l’OPEP
7: Pannes électriques dans le monde
8: La production mondiale d’énergie chute au niveau de 1930
2: Pic absolu de tous les temps de la production d’énergie par tête 3: Fin du pétrole bon marché
Possibilités énergétiques futures
Actuel 100 ans 200 ans
Pétrole
Charbon
Gaz
Fission
Fusion
EnR
Pile Hydrogène
Air comprimé
Hydrates CH4 ?
?
Non conventionnel
Non conventionnel
Possibilités énergétiques futures
Mais ce n’est pas une fatalité.
Solutions simples mais plus compliqué à mettre en oeuvre
Transition énergétique Economie d’énergie
Les problèmes écologiques liés au pétrole
3-Les pollutions pétrolières
Les problèmes écologiques liés au pétrole
Principaux accidents pétroliers depuis 1967
2010
Plateforme BP Golfe du Mexique ~700 000 tonnes
3-Les pollutions pétrolières
Les problèmes écologiques liés au pétrole
Naufrage de l'Erika, France (1999)
Accidents pétroliers
Exemple: 883000 tonnes/an
en Méditerranée
= plus de 10 accidents du Prestige/an !
Déballastage, dégazage,…
Rejets de raffineries off-shore ou côtières
Lessivage des sols contaminés par les
hydrocarbures
volontaire
volontaire volontaire
accidentel
3-Les pollutions pétrolières
Composition des pétroles
et devenir en milieu marin
•Le pétrole est un « cocktail » varié de composés chimiques comportant principalement des atomes de carbone et d’hydrogènes appelés hydrocarbures.
•Il n’existe pas un pétrole brut, mais des pétroles bruts de compositions différentes selon l’endroit d’où ils proviennent (Brent de mer du Nord, pétrole lourd du Vénézuéla, pétrole léger d’Arabie ou d’Iran, etc…).
•Lors d’une pollution, cette composition est très importante à connaître car elle détermine le comportement du pétrole dans le milieu marin.
65 à 95%
10 à 40%
10 à 40%
30 à 50%
20 à 40%
0 à 10%
5 à 25%
Composition des pétroles
Composition des pétroles
200
composés
2000
composés
Des pétroles de complexité différente à la pompe…
Devenir des pétroles en milieu marin
Hydrocarbures hydrosolubles
= les plus dangereux pour la faune et la
flore locale Absorption par les
organismes
O2 + UV -> Photo-oxydation Concerne surtout les composés aromatiques (photosensibles)
Production de composés solubles dans l’eau (acides, alcools,etc…) =
pollution secondaire
Perte de contrôle de la pollution
Toxicité pour le
plancton et les
animaux en
contact
Hydrocarbures à faible poids moléculaire
Pollution atmosphérique
Toxicité pour les oiseaux
et les bénévoles
Résidus goudronneux
constitués des pétroles les plus lourds
Pollution des sédiments Persistance
Toxicité à long
terme pour la faune
non benthique
(fixée, crustacés,
etc...)
Formation de résidus goudronneux difficilement dégradables
Pollution des plages
Toxicité pour toute
la faune et la flore
(ingestion par les
poisons, diffusion par
contact)
Devenir des pétroles en milieu marin
La biodégradation = épuration naturelle effectuée par des organismes vivants
Inconvénient: procédé lent Avantages: suppression définitive de la pollution (conversion en biomasse) sans conséquences dommageables pour l’environnement et coûts plus faibles que pour les traitements traditionnels
PLAN DU COURS (de la déprime…aux solutions)
II. Intervention de l’homme dans la dépollution
1. Elimination physique des pétroles
2. Compréhension de l’écosystème : vers la bioremédiation
3. Exemple d’application: Golfe du Mexique
III. Recherche de biomarqueurs des pétroles
1. Isolement
2. Génétique, génomique et protéomique
3. Biocapteur
I. Généralités sur les pétroles
1. Place du pétrole dans les sociétés
2. Les problèmes écologiques liés au pétrole
3. Composition des pétroles et devenir en milieu marin
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 1. Elimination physique des pétroles a. Confinement, pompage, stockage et traitement des polluants
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 1. Elimination physique des pétroles b. Utilisation de dispersants
Le pétrole ne se mélange pas dans l’eau. Le surfactant fait une interface eau/pétrole => dispersion du pétrole en fines gouttes dans la colonne d’eau (moins visible!!!)
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 1. Elimination physique des pétroles c. Nettoyage des plages
Nettoyage
manuel du bord
de mer
Associés ou non au décapage à haute pression + surfactants
Latouche Island, Alaska après la catastrophe du Exxon Valdez (Photo researchers, Inc)
Dispersion
Evaporation
Atmosphère
Océan
Sédiment
Émulsification
Dissolution
Absorption
MOP
Agrégation MOD
Photo-oxydation
Bactéries
Poissons
Phytoplancton
Zooplancton
Protozoaires
Virus
BOUCLE MICROBIENNE
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles a. Nécessaire compréhension du fonctionnement de l’écosystème
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles b. Les organismes hydrocarbonoclastes
• 79 genres bactériens (plusieurs centaines d’espèces) • 9 cyanobactéries • 103 champignons • 14 algues
(Prince et al., 2005)
Les bactéries aérobies qui dégradent les hydrocarbures sont considérées comme des acteurs majeurs de la
dépollution de l’environnement marin.
Bactéries qui dégradent les hydrocarbures saturés (n-alcanes)
Bactéries qui dégradent les hydrocarbures aromatiques
polycycliques (HAP)
Bactéries ne dégradant pas les hydrocarbures
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles b. Les organismes hydrocarbonoclastes
Évolution temporelle: principe de dominance et de sélection des espèces
Hydrocarbures aliphatiques de faible poids moléculaire
Hydrocarbures aliphatiques de haut poids moléculaire
Hydrocarbures aromatiques de faible poids moléculaire
Hydrocarbures aromatiques de haut poids moléculaire
Fraction polaire
Souches dégradant les alcanes
Souches dégradant les aromatiques
Importance de la diversité bactérienne dans la biodégradation des hydrocarbures pétroliers
Équipements enzymatiques
complémentaires (co-métabolisme)
Pé
tro
le
Ba
cté
rie
s
Sels nutritifs
Virus
Autres facteurs: Température Salinité Ressources en O2…
Prédation
Etat du consortium bactérien
Agents tensio-actifs
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles c. Facteurs influençant la biodégradation
« Top-down »
« Bottom-up »
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles d. Facteurs influençant la biodégradation
Problème d’accessibilité des hydrocarbures
3 modes décrits pour l’assimilation des composés:
Interaction directe avec les composés
dissous dans la phase aqueuse
Contact des bactéries avec des gouttelettes
« pseudo-solubilisation » à l’aide de
surfactants
Biodisponibilité ?
Selon les propriétés membranaires
Surfactants industriels ou naturels
Microorganisme Biosurfactant Arthrobacter RAG-1 Hétéropolysaccharides
Arthrobacter MIS38 Peptidolipides
Arthrobacter sp. Lipides de tréhalose, saccharose ou
fructose
Bacillus licheniformis JF-2 Peptidolipides
Bacillus licheniformis 86 Peptidolipides
Bacillus subtilis Surfactine
Bacillus sp. AB-2 Rhamnolipides
Candida antarctica Lipide à mannosylerthritol
Candida tropicalis Acides gras
Clostridium pasteurianum Lipides neutres
Corynebacterium insidiosum Phospholipides
Corynebacterium lepus Acides gras
Nocardia erythropolis Lipides neutres
Ochrobactrum anthropii Protéine
Penicillium spiculisporum Acide spiculosporique
Pseudomonas aeruginosa Rhamnolipide
Pseudomonas fluorescens Peptidolipide
Phaffia rhodozyma Lipide glucidique
Rhodococcus erythropolis Trehalose dicorynomycolate
Rhodococcus sp. ST-5 Glycolipide
Rhodococcus sp. 33 Polysaccharide
Corynebacterium insidiosum Phospholipides
Corynebacterium lepus Acides gras
Nocardia erythropolis Lipides neutres
Ochrobactrum anthropii Protéine
Penicillium spiculisporum Acide spiculosporique
Pseudomonas aeruginosa Rhamnolipide
Pseudomonas fluorescens Peptidolipide
Phaffia rhodozyma Lipide glucidique
Rhodococcus erythropolis Trehalose dicorynomycolate
Rhodococcus sp. ST-5 Glycolipide
Rhodococcus sp. 33 Polysaccharide
Exemples de micro-organismes producteurs de surfactant (Banat, I. M. 2000).
« Bottom-up »
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles d. Facteurs influençant la biodégradation
Problème d’accessibilité des hydrocarbures
« Bottom-up »
Propriétés avantageuses des surfactants: -Augmentent la solubilisation des hydrocarbures - Facilitent le contact de la cellule avec l’hydrocarbure grâce à l’enrobage : - augmentent l’assimilation - protègent du contact direct toxique
Inconvénients des surfactants: - En augmentant la solubilisation des hydrocarbures : - passage dans la colonne d’eau de composés supplémentaires - risque d’augmentation de la toxicité (surfactant souvent toxiques!!!) - L’enrobage des hydrocarbures par le surfactant ne convient qu’aux organismes utilisant ce mode d’assimilation restrictif - Risque de piège des hydrocarbures dans des micelles baisse de la biodisponibilité
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles e. Bioremédiation
Bio-addition (seeding)
Bactérie hydrocarbonoclaste
Bio-stimulation feeding
Nutriments
Émulsifiant
Pas d’activation de la dégradation
Disparition des bactéries apportées
Apport de bactéries dégradant les hydrocarbures
Pétrole
Population autochtone
Pétrole
Apport de
bactéries
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles e. Bioremédiation (bioaddition = seeding)
Apport
d’éléments
nutritifs et/ou
d’agents
tensio-actifs
Population autochtone
Stimulation de la population
dégradation de la pollution
Stimulation de la population microbienne autochtone
dégradant les hydrocarbures
N P
P N
Pétrole
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles e. Bioremédiation (biostimulation = feeding)
Addition : l’Inipol EAP22 et le Customblen
- Sources d’azote et de phosphore - Formulation en émulsion discutable - Apport sous forme d’épandages périodiques
Utilisation de l’Inipol EAP22 avec succès dans le cas de l’Exxon Valdez : dépollution significativement meilleure sur les zones d’épandage mais au bout de 8 mois… !!
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles e. Bioremédiation (biostimulation = feeding)
Ecart important entre les observations au laboratoire et la réalité du terrain
Manque de connaissances sur l’écologie des microorganismes et sur leurs capacités métaboliques
Echec de la bioaddition :
Réussite de la biostimulation:
Utilité des compléments nutritifs
Lenteur des biodégradations
-Manque de connaissances du fonctionnement du système
II. Intervention de l’homme dans la dépollution 2. Elimination biologique des pétroles e. Bioremédiation (biostimulation = feeding)
-Manque de connaissances des systèmes de dégradation
-Pollution par le pétrole (un des plus lourd du Golfe du Mexique) Il est chargé en « asphalt-like substances » ce qui le rend particulièrement collant et moins évaporant , moins accessible, moins biodégradable pour les µO et enfin moins inflammable que les autres pétroles. mais aussi par des gaz toxiques (méthane, ethane, propane,etc..)
Le 20 avril 2010, un Geyser d’eau et
de gaz (très forte teneur en
méthane) provoque l’explosion de la
plate-forme pétrolière Deepwater
Horizon exploitée par BP
Barrages
flottants,
boudins,
dispersants,
dilution,
écrémage,
écopage
La pollution visible
La pollution invisible
Le méthane se dissout et stagne selon des strates Concentrations 20 à 50 plus importantes que la
valeur normale du golf du Mexique
500 million de $ débloqués par BP mais très peu pour la recherche.
Essentiellement fonds pour la recherche par la National Science Foundation.
Une couche de 35Km de long à 1100m de profondeur -> peu de dégradation durant plusieurs mois
= persistance du pétrole polluant (Camilli et al., 2010)
Dispersion
Evaporation
Atmosphère
Océan
Sédiment
Émulsification
Dissolution
Absorption
MOP
Agrégation MOD
Photo-oxydation
Bactéries
Poissons
Phytoplancton
Zooplancton
Protozoaires
Virus
BOUCLE MICROBIENNE
PLAN DU COURS (de la déprime…aux solutions)
I. Généralités sur les pétroles
1. Pollution par les pétroles: état des lieux
2. Origine et composition des pétroles
3. Devenir des pétroles dans la colonne d’eau
II. Intervention de l’homme dans la dépollution
1. Elimination physique des pétroles
2. Compréhension de l’écosystème : vers la bioremédiation
3. Exemples d’applications
III. Recherche de biomarqueurs des pétroles
1. Isolement
2. Génétique, génomique et protéomique
3. Biocapteur
-Do Bacteria care ? In most coastal systems, are bacterial communities influenced by petroleum ?
-In oil spill conditions, how much petroleum influence the microbial loop? How human can help ?
-Who are the uncultured hydrocarbonoclastic bacteria ?
-Need of new (genomic) tools for environmental quality measurement?
SOME QUESTIONS YOU MAY ASK…
Marseille Bay (France) Program EC2CO: IBISCUS
Two seasons:
June 2009
January 2010
Surface microlayer sampling
Terminos Lagoon (Mexico) Program EC2CO: JEST
Two seasons:
June 2009
October 2009
40 60 80 100
Similarity
Saumaty (Marseille Bay) - POLLUTED
In all harbours, bacterial
community structure
changed a lot from inside the
harbour compared to the
coastal waters,
PETROLEUM: DO BACTERIA CARE ?
YES, but very limited to the zone of waste (~400m around !)
And much more
PolyAromatic Hydrocarbon
PAH-degraders found in
the harbours (Q-PCR and
MPN)
0,0E+00
5,0E+03
1,0E+04
1,5E+04
SO
FC
O…
Co
rtio
u…
Co
rtio
u…
Co
rtio
u…
Co
rtio
u…
Co
rtio
u…
Saum
at…
Saum
at…
Saum
at…
Saum
at…
Saum
at…
Saum
at…
Vie
ux…
Vie
ux…
Vie
ux…
Vie
ux…
Vie
ux…
Vie
ux…
Port
de
…P
ort
de
…P
ort
de
…P
ort
de
…P
ort
de
…P
ort
de
…
MP
N.m
l-1
[Oil]
in relation to a rapid decrease of
petroleum concentrations
-Do Bacteria care ? In most coastal systems, are bacterial communities influenced by petroleum ?
-In oil spill conditions, how much petroleum influence the microbial loop? How human can help ?
-Who are the uncultured hydrocarbonoclastic bacteria ?
-Need of new (genomic) tools for environmental quality measurement?
SOME QUESTIONS YOU MAY ASK…
Viruses
Ciliates and flagellates
Microbial loop
BACTERIA
Sediments
Zooplankton
Phytoplankton
Organic matter
High trophic levels
Linear Trophic Chain
UV Petroleum
Carbon source
Toxicity
Two sites in South of Greece European project COMMODE
Elefsina Bay Anavissos Bay
Chronically vs. pristine polluted sites
Mesocosms 75L
-Influence of pollution history -Human can help by biostimulation:
nutrient and emulsifier addition
Banyuls Bay European project MICSIPE
-Pure top-down control under polluted conditions (nutrients non limitant with
constant N/P=25)
Banyuls-sur-mer Bay
Pristine
Mesocosms 400L
Initial bacterial community
Addition of oil : Rapid decrease of
bacterial OTUs (1-2 days) Higher decrease in the pristine site
Temporal changes (14 days)
Top-down control Predation
Keep maximum bacterial abundance≤107 cells.mL-1
Grazing experiments: predation dominated by virus (100 time more than flagellates)
« viruses kill the winners (oil degraders) »
-Characterized by higher oil-degradation rates (even higher in the chronically polluted site: history of the sites matters)
-Consumption of large amount of nutrients (under non-limitant nutrient conditions, increase of oil-degradation by ~10 times and much more rapid degradation)
Second bacterial consortium able to degrade mainly linear alcane
Bottom-up control Biostimulation
Viral and HNF growth began when bacterial abundance
reached a maximum: Prey-predation curve
Third consortium able to degrade
more recalcitrant PAH
-Do Bacteria care ? In most coastal systems, are bacterial communities influenced by petroleum ?
-In oil spill conditions, how much petroleum influence the microbial loop? How human can help ?
-Who are the uncultured hydrocarbonoclastic bacteria ?
-Need of new (genomic) tools for environmental quality measurement?
SOME QUESTIONS YOU MAY ASK…
Hydrocarbonoclastic bacteria on culture media:
Stable Isotope Probing: Diversity Fonction (Boschker & Middelburg, 2002)
12C cells
Bacteria
Addition of 13C-PAH
DNA extraction
Density gradient
Identification
ADN Light
ADN
Heavy
454 Pyrosequencing
13C cells Results for 13C-Phe: some
unknown species, but mainly cultured species
(Alcanivorax, Marinobacter, Cycloclasticus…)
mm+HC
-Do Bacteria care ? In most coastal systems, are bacterial communities influenced by petroleum ?
-In oil spill conditions, how much petroleum influence the microbial loop? How human can help ?
-Who are the uncultured hydrocarbonoclastic bacteria ?
-Need of new (genomic) tools for environmental quality measurement?
II. Recherche de biomarqueurs de pétrole
Outils de la bio-surveillance de pollution marine
Bio-essais Bio-indicateurs Bio-marqueurs
Test biologique
diagnostic environnemental
Réponse biologique en fonction
de doses toxiques
en comparaison avec un témoin
Test Daphnie (USEPA) ou
Microtox (NF T90-920)
-Fixer les seuils de toxicité (dose
létale, sub-létale,…)
-Surveillance et réglementation
des déversements
Espèces sentinelles dont
la sensibilité aux toxiques
est > à celle de l’homme
Mise en évidence de la
qualité écologique des
écosystèmes
BQI
(indice de qualité écologique)
Etat écologique
Mise en évidence
d’exposition présente ou
passée à des polluants
Changements au niveau
moléculaire, biochimiques,
cellulaire, physiologique
Approche multimarqueurs (différents organismes et niveaux
d’organisation biologique)
= Biosurveillance, Biodisponibilité
Promoteur Tn5::lux CDABE
ARNm
Lumière
Analyte (HCP)
Protéine
reporteur
Bio-élément
bactérien
Marinobacter hydrocarbonoclasticus sp. 17
(Gauthier et al. 1992)
Ubiquist in polluted zones, facultative aerobic denitrifier, extreme
halotolerance (0.08 to 3.5M NaCl), able to degrade broad range of
linear alcanes C12 à C40, and some PAHs
3.9Mbases, GC%= 57.40
Collection of 1000 mutants with luxCDABE or gfp
2 mutant strains emitting light in presence of hexadecane
= new biomarkers
Multi-biomarkers (Pseudomonas stutzeri nah-lux, Ostreococcus
tauri luc….)
Daniella BOTTJER Elisabeth MIRANDA-TELLO
Caroline SAURET Arturo RODRIGUEZ-BLANCO
Marina AGAB Chloé DUMAS Marc AUFFREY Léa DENKWITZ