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CBGP
Thématiques de recherche :•Caractérisation de la biodiversité.•Biologie des bio-agresseurs et de leurs antagonistes.•Origine, évolution et conséquences des invasions biologiques.•Caractérisation des réservoirs des maladies émergentes.•Compréhension des règles d’assemblage des communautés.
► Taxonomie systématique et phylogénie ► Génétique des populations et phylogéographie ► Biologie de l’adaptation : génétique, génomique et traits d’histoire de vie ► Écologie des populations et des communautés
Groupes de réflexion
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Projets génomique/transcriptomique
Projets obtenus ou prévus en 2014 : 12 pour du séquençage de génomes, 13 pour du transcriptome, 4 pour des profils d’expression, 17 pour du génotypage par séquençage, 14 pour des amplicons, 8 pour de la capture 5 pour des séquençages de grands fragments.
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BioinformatiqueDéveloppement de logiciels
– Génétique des populations– Analyse bioinformatique
Analyse de séquences_ génomique_transcriptomique
Infrastructure informatiqueCalcul : Cluster de 400 cœurs
Stockage : 40 To
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Transcriptomique
Comparaison de deux populations de la processionnaire du pin (ThaumetopoeaPityocampa).
Bernhard Gschloessl a,*, Heiko Vogel b, Christian Burban c, David Heckel b, Réjane Streiff a, Carole Kerdelhué
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transcriptomique
ModèlesPyraleProcessionnaire du
pain
Données Illumina :
Outils d’assemblageOasesTrinity